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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2026-06-10 |
RENAL-CHIP: Rejection Evaluation via Non-Invasive Analysis of Circulating Podocytes With Herringbone-Chip Isolation Platform
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520426
PMID:41849694
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研究论文 | 提出一种利用磁性鱼骨微流控芯片从血液中分离循环足细胞,实现非侵入性监测肾移植排斥反应的方法 | 首次将供体来源的循环足细胞作为急性排斥反应的血液标志物,并开发磁性可逆鱼骨微流控芯片实现高效捕获与释放 | 样本量较小(65名参与者),且仅验证了活检确诊排斥反应患者;循环足细胞分离依赖EpCAM抗体,可能遗漏其他表型细胞 | 开发一种非侵入性、精准的肾移植排斥反应诊断方法 | 肾移植受者外周血中的循环足细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, 微流控芯片 | NA | 图像, 基因表达数据 | 65名参与者,其中移植排斥反应患者提供1 mL外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 662 | 2026-06-10 |
Deep single-cell decoding of human pancreatic islets reveals T2D β-cell gene expression defects
2026-Jun, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00744-w
PMID:41986506
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research paper | 对人类胰岛进行单细胞转录组深度解码,揭示2型糖尿病β细胞基因表达缺陷 | 首次在单细胞水平上对非糖尿病、前驱糖尿病和2型糖尿病患者的大规模胰岛细胞进行转录组分析,鉴定出14种细胞类型,并发现T2D相关基因与β细胞衰老亚群增加有关 | 样本量相对有限(48个供体),功能验证主要基于多模态方法但可能不足以完全确认因果关系 | 研究人类胰岛细胞在2型糖尿病中的特异性表达变化及其对病理生理的贡献 | 非糖尿病、前驱糖尿病和2型糖尿病患者的胰岛细胞 | machine learning | type 2 diabetes | single-cell RNA-seq | NA | gene expression data | 48个供体(非糖尿病、前驱糖尿病和2型糖尿病),总共245,878个细胞 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 663 | 2026-06-10 |
Integrated multi-dimensional analyses reveal a BTN3A2-centered diagnostic risk score and a monocyte-T cell axis as central drivers of dermatomyositis
2026-Jun, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-026-08143-6
PMID:42062698
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research paper | 通过整合多组学数据构建了以BTN3A2为中心的皮肌炎诊断风险模型,并揭示了单核细胞-T细胞轴在疾病发病机制中的核心作用 | 首次将BTN3A2同时作为诊断标志物和因果相关基因,结合多组学数据构建了高精度诊断风险模型,并发现单核细胞来源的LGALS9-CD44/CD45信号轴是连接遗传风险与免疫功能障碍的关键机制 | 研究主要基于公开数据集,缺乏独立的前瞻性队列验证;单细胞RNA-seq分析仅来自一个数据集,样本量可能有限;因果推断仍依赖孟德尔随机化,需要进一步功能实验验证 | 构建高精度皮肌炎诊断风险模型,识别因果相关基因,并揭示细胞类型特异性免疫回路 | 皮肌炎患者的外周血和组织样本 | machine learning | dermatomyositis | RNA-seq, single-cell RNA-seq | LASSO | transcriptomic data | 三个批量转录组数据集和一个单细胞RNA-seq数据集(GSE190684) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 664 | 2026-06-10 |
The role of CD34-high endothelial cells and FGF2 in vasa vasorum angiogenesis of Takayasu arteritis
2026-Jun, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-026-08140-9
PMID:42067750
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研究论文 | 探究CD34高表达内皮细胞和FGF2在多发性大动脉炎血管滋养管新生中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序发现多发性大动脉炎患者主动脉壁中CD34高表达内皮细胞显著扩增,并揭示FGF2-FGFR1轴可能介导血管滋养管病理性新生 | 样本量较小(仅3例TAK患者和3例对照),需要更大样本验证 | 研究CD34高表达内皮细胞和FGF2信号在多发性大动脉炎血管滋养管新生和炎症进展中的作用 | 多发性大动脉炎患者主动脉组织及血清 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 细胞因子微球阵列 | NA | 基因表达数据, 图像 | 3例TAK患者和3例对照的主动脉组织,48例TAK患者和24例健康对照的血清 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 665 | 2026-06-10 |
IL4I1+ macrophages drive hepatocellular carcinoma progression by responding to biomechanical cues
2026-Jun, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101782
PMID:42096911
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学,鉴定出IL4I1+巨噬细胞是对生物力学信号响应的亚群,并促进肝癌进展 | 首次揭示IL4I1+巨噬细胞作为生物力学感应亚群,将力学信号转化为免疫抑制和促肿瘤信号的分子机制 | 未提及具体局限性 | 探索肝癌微环境中生物力学变化对巨噬细胞亚群的影响及其促癌机制 | IL4I1+巨噬细胞 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、原子力显微镜 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 3-6个独立实验样本(具体未详述) | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 666 | 2026-06-10 |
Polyclonal selection of immune checkpoint mutations in thyroid autoimmunity
2026-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10493-9
PMID:41981327
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研究论文 | 本研究通过全外显子和靶向NanoSeq测序,在自身免疫性甲状腺疾病中发现B细胞克隆获得免疫检查点基因TNFRSF14和CD274的功能缺失突变,支持体细胞突变使自身反应性淋巴细胞逃避免疫耐受的假说 | 首次利用高精度单分子DNA测序技术NanoSeq系统检测自身免疫疾病中的体细胞驱动突变,发现多克隆B细胞同时获得免疫检查点基因突变 | 每个突变克隆占细胞比例很小(通常<1%),功能验证限于部分克隆,样本量未明确说明 | 验证体细胞突变使自身反应性淋巴细胞逃避免疫耐受检查点的假说 | 自身免疫性甲状腺疾病患者的B细胞克隆 | digital pathology | 自身免疫性甲状腺疾病 | NanoSeq | NA | DNA序列 | 未明确说明具体样本数 | Illumina | 全外显子测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 667 | 2026-06-10 |
Epigenetic reprogramming of T cell metabolism restores function and enhances anti-tumor immunity in lung cancer
2026-Jun, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02515-5
PMID:42120791
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研究论文 | 该研究通过表观遗传药物筛选发现BET抑制剂能重编程T细胞代谢,恢复其在肺癌中的功能并增强抗肿瘤免疫 | 首次发现BET抑制剂通过激活多胺生物合成途径和MYC-ODC轴,重新编程T细胞代谢,逆转T细胞耗竭状态,为癌症免疫治疗提供新策略 | 研究主要基于肺癌恶性胸腔积液样本,尚需在其他癌症类型和更大样本量中验证;BET抑制剂的长期安全性和有效性也需进一步评估 | 探索表观遗传药物逆转T细胞耗竭、增强抗肿瘤免疫的机制 | 肺癌患者恶性胸腔积液中的原发性耗竭T细胞 | 表观遗传学, 免疫学, 癌症生物学 | 肺癌 | 表观遗传药物筛选, 转录组学, 代谢组学, ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 染色质可及性数据, 单细胞转录组数据 | 肺癌患者恶性胸腔积液样本,具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 668 | 2026-06-10 |
Shared diagnostic biomarkers in metabolic syndrome and coronary artery disease identified by integrated bioinformatics and machine learning
2026-Jun-01, Endocrine connections
IF:2.6Q3
DOI:10.1530/EC-26-0240
PMID:42160392
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研究论文 | 通过综合生物信息学和机器学习方法,识别代谢综合征与冠状动脉疾病的共享诊断生物标志物 | 首次利用集成生物信息学方法(差异表达基因分析、WGCNA、机器学习算法)结合单细胞分析,筛选出ADRB2和KDM6A作为代谢综合征和冠状动脉疾病的共享诊断生物标志物 | 研究主要基于公共数据库的微阵列数据集,样本量有限,且筛选出的生物标志物仍需在更大规模临床队列中验证 | 识别代谢综合征和冠状动脉疾病的共享诊断生物标志物 | 代谢综合征和冠状动脉疾病患者 | 机器学习 | 心血管疾病 | 微阵列、RT-qPCR | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、机器学习算法 | 基因表达数据 | 5个微阵列数据集(具体样本数量未说明) | NA | NA | NA | NA |
| 669 | 2026-06-10 |
Single-cell profiling reveals peripheral blood immune landscape remodelling in breast cancer lymph node metastasis
2026-Jun, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70686
PMID:42261224
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研究论文 | 单细胞图谱揭示乳腺癌淋巴结转移中外周血免疫景观重塑 | 首次通过单细胞RNA/T细胞受体测序揭示乳腺癌淋巴结转移阳性和阴性患者外周血免疫景观的差异,并发现LGALS9-HAVCR2检查点互作在转移中起关键作用 | 样本量较小,仅6例患者的外周血单核细胞进行单细胞测序,额外14例乳腺癌组织数据用于验证 | 研究乳腺癌淋巴结转移中全身免疫环境的变化及其在促进转移中的作用 | 乳腺癌淋巴结转移阳性和阴性患者的外周血免疫细胞及其在肿瘤微环境中的功能 | 机器学习和数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞基因表达数据和T细胞受体序列数据 | 6例乳腺癌患者的外周血单核细胞(3例淋巴结转移阳性,3例阴性)及14例乳腺癌组织数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 和单细胞T细胞受体测序 |
| 670 | 2026-06-10 |
NEDD8 Promotes the Progression and Inflammation of Keratoconus by Increasing the Expression of YAP1
2026-Jun-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.6.14
PMID:42262027
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,发现NEDD8通过调控Hippo-YAP信号通路促进圆锥角膜的进展和炎症 | 首次揭示NEDD8在圆锥角膜中通过调控Hippo-YAP通路介导机械信号传导的分子机制,并证实其作为潜在治疗靶点的价值 | NA | 阐明NEDD8在Hippo-YAP信号通路中的调控作用及其对圆锥角膜病理的影响 | 圆锥角膜患者中央角膜组织及HTK细胞 | 数字病理学 | 圆锥角膜 | 单细胞RNA测序、机械拉伸实验、功能获得/缺失实验、配体-受体互作分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 单细胞转录组测序平台 |
| 671 | 2026-06-09 |
Inhibition of soluble epoxide hydrolase ameliorates renal injury in IgA nephropathy by restoring epoxyeicosatrienoic acids
2026-Jun-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.116200
PMID:42256278
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research paper | 本研究通过血浆氧化脂质谱分析和肾脏单细胞RNA测序,揭示了可溶性环氧化物水解酶抑制通过恢复环氧二十碳三烯酸改善IgA肾病肾损伤的机制 | 首次在IgA肾病中发现sEH-EET轴失调,并验证sEH抑制剂作为潜在治疗靶点 | 主要基于动物模型和体外细胞实验,缺乏大规模临床样本验证 | 探究脂质代谢异常在IgA肾病中的作用及sEH抑制剂的治疗效果 | IgA肾病患者血浆样本、小鼠模型及人肾小球系膜细胞 | machine learning | IgA肾病 | 单细胞RNA测序, 血浆氧化脂质谱分析 | NA | 基因表达数据, 脂质组学数据 | IgA肾病患者血浆样本及小鼠模型样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 672 | 2026-06-09 |
Single-cell transcriptomics profiling elucidates RBP-driven metastatic signaling pathways in ER+ breast cancer
2026-Jun-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.116155
PMID:42256294
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研究论文 | 通过单细胞转录组图谱揭示RNA结合蛋白驱动的ER+乳腺癌转移信号通路 | 首次构建了涵盖正常组织、原发肿瘤和转移灶的ER+乳腺癌单细胞转录组图谱,系统鉴定了RNA结合蛋白在恶性进展中的渐进性上调及其与细胞骨架重塑、胞外基质相互作用和应激适应的关联 | 未提及具体局限性 | 探究RNA结合蛋白在雌激素受体阳性乳腺癌进展和转移中的作用机制 | 39个样本(正常组织、原发肿瘤和转移灶)中的198,286个细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 39个样本,198,286个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 673 | 2026-06-09 |
Identification of an immediate-early gene-activated fibroblast state in frozen shoulder capsular fibrosis
2026-Jun-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.116183
PMID:42256302
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研究论文 | 整合空间转录组学、假时间推断和验证,全面解析人类肩关节囊中的成纤维细胞异质性,并鉴定出立即早期基因激活的成纤维细胞状态与肩周炎纤维化重塑相关 | 首次鉴定出FOSJUNEGR1立即早期基因激活的成纤维细胞亚群作为压力响应过渡状态,连接稳态和促纤维化状态,并揭示成纤维细胞状态可塑性在肩周炎发病机制中的关键作用 | 未在摘要中提及明显局限,可能包括样本量有限或缺乏功能性验证 | 研究肩周炎关节囊纤维化过程中成纤维细胞的细胞程序 | 人类肩关节囊组织 | 数字病理学 | 肩周炎 | 空间转录组学 | 假时间推断 | 空间转录组数据 | 人类肩关节囊样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 674 | 2026-06-09 |
[Expression of CREPT in vascular endothelial cells and its angiogenic mechanism in glioma]
2026-Jun-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
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研究论文 | 研究CREPT在胶质瘤血管内皮细胞中的表达及其促进血管生成的机制 | 首次发现CREPT在胶质瘤血管内皮细胞中特异性表达,并通过VEGFA-VEGFR2信号通路调控血管生成,为抗血管生成治疗提供新靶点 | 未提及CREPT在其他类型肿瘤或正常组织中的表达模式,以及体内实验验证的缺乏 | 探究CREPT在胶质瘤血管内皮细胞中的表达模式及其调控血管生成的机制 | 胶质瘤血管内皮细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞测序, 免疫组织化学, 免疫荧光染色, 基因集富集分析, 管形成实验, Western blot | NA | 图像, 文本 | 人胶质瘤样本的单细胞测序数据,临床样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于人胶质瘤样本的单细胞测序数据进行分析 |
| 675 | 2026-06-09 |
Quantitative RNA spatial profiling using single-molecule RNA FISH on plant tissue cryosections
2026-Jun-08, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101943
PMID:42252663
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研究论文 | 提出一种优化的单分子RNA荧光原位杂交方法(cryo-smFISH),用于植物组织冰冻切片中单个mRNA分子的可视化和定量 | 开发了适用于植物组织冰冻切片的稳健smFISH方案,结合深度学习算法实现细胞核和细胞质中RNA丰度的精确定位,并可与免疫荧光联合使用 | 标题和摘要未提及明显局限性 | 开发简单且稳健的smFISH方法,用于植物组织冰冻切片中RNA的空间定量分析 | 植物组织冰冻切片中的单个mRNA分子 | 数字病理学 | NA | 单分子RNA荧光原位杂交 (smFISH) | 深度学习算法 | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 676 | 2026-06-09 |
Spatial Transcriptomics Open a New Era of Pan-Cancer Analysis
2026-Jun-07, Cancer investigation
IF:1.8Q3
DOI:10.1080/07357907.2026.2681845
PMID:42252208
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综述 | 综述空间转录组学在泛癌分析中的关键进展及其对临床转化的启示 | 首次系统总结空间转录组学在解码跨癌症空间生态系统保守性与差异性、绘制驱动基因异质性图谱、追踪转移演化及建立新型空间分子分类中的突破性应用 | 多癌症数据集整合困难及临床转化效率不足仍是当前挑战 | 探讨空间转录组学在推动泛癌精准诊断和治疗分层中的潜力 | 泛癌(多种癌症类型) | 数字病理学 | 泛癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 677 | 2026-06-09 |
Emerging applications of long-read sequencing in hematological malignancies: highlights from the 2025 ASH annual meeting
2026-Jun-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-026-00942-y
PMID:42252388
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综述 | 综述长读长测序在血液恶性肿瘤中的新兴应用,重点介绍2025年美国血液学会年会的进展 | 全面总结了长读长测序在血液恶性肿瘤中的最新应用,包括快速全基因组测序、自适应采样、全长RNA测序和单细胞RNA测序等新技术在亚型分类、结构变异检测和融合转录本解析方面的突破 | 长读长测序的成本和准确性仍然是其在常规临床诊断中广泛应用的障碍 | 评估长读长测序技术在血液恶性肿瘤诊断和精准治疗中的潜力 | 血液恶性肿瘤 | 机器学习 | 血液恶性肿瘤 | 长读长测序, 全基因组测序, 全长RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 长读长测序 | NA | NA |
| 678 | 2026-06-09 |
Multi-omic profiling identifies TREM2+ lipid-laden macrophages as inflammatory drivers and therapeutic targets of colorectal cancer liver metastasis
2026-Jun-06, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218657
PMID:42250756
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研究论文 | 通过多组学分析鉴定TREM2+脂质负载巨噬细胞作为结直肠癌肝转移的炎症驱动因子和潜在治疗靶点 | 首次整合CyTOF、单细胞和空间转录组学、脂质组学等多组学技术,发现并表征了促进结直肠癌肝转移免疫逃逸和微环境重塑的TREM2+脂质负载巨噬细胞亚群,并验证了其炎症信号通路及靶向治疗潜力 | 未提及具体限制,该研究仍需在更大队列和临床环境中进一步验证TREM2靶向治疗的有效性和安全性 | 阐明结直肠癌肝转移中肿瘤相关巨噬细胞的特定亚群及其在免疫抑制和肿瘤进展中的作用 | 结直肠癌肝转移的肿瘤相关巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 结直肠癌 | CyTOF, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 脂质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据, 脂质组数据, CyTOF数据 | 小鼠模型及离体器官型肿瘤模型,具体样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 679 | 2026-06-09 |
Charting the human-specific properties of gene expression networks in the infant prefrontal cortex
2026-Jun-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea3316
PMID:42234754
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研究论文 | 通过比较新生儿黑猩猩、人类和恒河猴的脑样本,利用单细胞转录组学和表观基因组学,揭示了人类婴儿前额叶皮层基因表达网络中的人类特异性特性 | 首次利用稀有新生儿黑猩猩样本进行跨物种比较,识别出人类婴儿特异性转录程序,并发现其与自闭症和帕金森病风险基因的关联 | NA | 探究人类婴儿期是否具有特异性转录程序,以及这些程序与神经疾病易感性的关系 | 人类、黑猩猩和恒河猴婴儿的前额叶皮层样本 | 数字病理学 | 自闭症, 帕金森病 | 单细胞转录组学, 单细胞表观基因组学 | NA | 单细胞转录组与表观基因组数据 | 稀有新生儿黑猩猩、年龄匹配的人类和恒河猴脑样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | NA |
| 680 | 2026-06-09 |
Single-cell transcriptomics reveals the hemocyte atlas and molecular mechanisms underlying the growth-immunity trade-off in Litopenaeus vannamei
2026-Jun-05, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111494
PMID:42250742
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研究论文 | 使用单细胞转录组学揭示凡纳滨对虾血细胞图谱及生长-免疫权衡的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析(WGCNA)系统比较快速生长组和缓慢生长组的血细胞图谱,揭示了生长-免疫权衡的细胞和分子基础,并识别了上游调控网络 | 未提及 | 阐明凡纳滨对虾个体生长异质性的细胞和分子调控机制,特别是生长-免疫权衡的机制 | 凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)的快速生长组和缓慢生长组 | 单细胞转录组学 | 无 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、加权基因共表达网络分析(WGCNA) | NA | 单细胞转录组数据 | 快速生长组和缓慢生长组样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |