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当前共找到 1083 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-06-23 |
Esr1-dependent signaling and transcriptional maturation in the medial preoptic area of the hypothalamus shape the development of mating behavior during adolescence
2026-Jun-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.106347
PMID:42318880
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和原位杂交技术，研究了青春期小鼠下丘脑内侧视前区Esr1依赖性信号和转录成熟对交配行为发育的影响 | 首次揭示雌激素受体1在青春期内侧视前区GABA能神经元转录成熟中的关键作用，以及其性别特异性基因调控网络 | NA | 探究青春期小鼠内侧视前区转录动态及其对交配行为发育的影响 | 青春期雄性及雌性小鼠的内侧视前区 | 机器学习和数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，原位杂交图像 | 雌雄小鼠，涵盖整个青春期发育阶段 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 622 | 2026-06-23 |
Challenging the control through a single-cell perspective on normal adjacent tissue in colorectal cancer
2026-Jun-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115671
PMID:42325264
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研究论文 | 通过单细胞视角挑战结直肠癌中正常邻近组织作为对照的常规做法 | 首次系统揭示结直肠癌正常邻近组织在细胞组成和基因表达上与健康组织的显著差异，并发现其中存在肿瘤相关拷贝数变异，开发了逆转肿瘤相关基因表达模式的药理学策略 | 未明确说明研究局限，推测可能包括样本量有限或缺乏验证队列 | 探究结直肠癌正常邻近组织（NAT）的细胞组成和分子特征，评估其作为标准对照的可靠性 | 结直肠癌组织、对应的正常邻近组织（NAT）和健康结直肠活检样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 包含结直肠癌组织、NAT和健康结直肠活检样本的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 623 | 2026-06-23 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the T lymphocyte microenvironment and identifies HOPX as a hub gene in membranous nephropathy
2026-Jun-17, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150273
PMID:42309401
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示膜性肾病中T淋巴细胞微环境并鉴定HOPX为关键基因 | 首次利用单细胞RNA测序结合多种机器学习算法，鉴定HOPX作为膜性肾病的核心枢纽基因，并阐明淋巴细胞功能障碍在疾病进展中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 探究膜性肾病中免疫细胞亚群和关键免疫反应基因，特别是T淋巴细胞微环境的异质性 | 膜性肾病患者及健康对照者的外周血样本和公共数据库数据 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | CNN, LSTM, GAN | 图像, 文本, 视频 | 53例膜性肾病患者和健康对照者的临床血样 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 624 | 2026-06-23 |
Assessing the use of foundation model embeddings to improve drug response predictions using scRNA-Seq expression data
2026-Jun-17, Bioorganic & medicinal chemistry
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.bmc.2026.118732
PMID:42322669
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研究论文 | 评估使用基础模型嵌入结合单细胞RNA-Seq表达数据以改善癌症药物反应预测 | 首次系统评估单细胞RNA-Seq基础模型嵌入（如scGPT-癌症模型）对深度学习模型DeepCDR在癌症药物反应预测中的改进效果，发现插值预测显著提升 | 药物外推预测效果差（即使结构相似药物），表明需要更大数据集或更早数据融合；细胞系外推改进效果小且不稳定 | 评估基础模型嵌入整合到DeepCDR后能否提升癌症药物反应预测性能 | 癌症细胞系的单细胞RNA-Seq表达数据与药物结构数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型（DeepCDR）、基础模型（scGPT-癌症模型） | 基因表达数据 | 未明确提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2026-06-23 |
Viral load-driven systemic immune exhaustion is an enabler of antibody breadth in HIV infection
2026-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.05.730519
PMID:42327147
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、单细胞蛋白质组学及血浆中和试验，研究HIV感染中抗体广度与病毒载量驱动的系统性免疫耗竭的关系 | 揭示了早期感染中病毒载量驱动的免疫激活与后期免疫耗竭如何促进HIV抗体广度的出现，提出抗体广度反映病毒控制失败而非成功抗病毒应答的新观点 | 未提及具体局限性 | 确定HIV感染中影响抗体广度的系统免疫相关因素 | 肯尼亚队列中未接受治疗的HIV感染女性 | 机器学习 | HIV感染 | 单细胞RNA测序，单细胞蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质组数据，血浆中和数据 | 肯尼亚纵向队列中的未治疗HIV感染女性，具体样本量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，单细胞蛋白质组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 626 | 2026-06-23 |
Single-cell and spatial analyses reveal endothelial-macrophage inflammatory crosstalk in dry age-related macular degeneration
2026-Jun-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08393-7
PMID:42304501
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研究论文 | 通过单细胞和空间分析揭示干性年龄相关性黄斑变性中内皮细胞与巨噬细胞的炎症交互作用 | 首次系统性描述干性AMD中RPE-脉络膜区域的免疫重塑，并鉴定出内皮细胞通过TNFSF10-TNFRSF10B-NF-κB通路调控巨噬细胞激活的新机制 | 未提及具体局限性 | 探究干性年龄相关性黄斑变性中细胞交互作用和巨噬细胞激活的调控机制 | 光氧化损伤小鼠模型和人干性AMD样本 | 机器学习 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 光氧化损伤小鼠模型和人干性AMD样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 627 | 2026-06-23 |
Deciphering transcriptome alterations in bone marrow immune cells at single-cell resolution under denosumab treatment
2026-Jun-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116663
PMID:41997054
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research paper | 利用单细胞RNA测序技术揭示了地诺单抗治疗下骨髓免疫细胞转录组变化，包括Mmp8hi mNeu中性粒细胞扩增和淋巴细胞组成改变 | 首次在单细胞分辨率下系统分析地诺单抗对骨髓骨免疫微环境的转录组影响，发现Mmp8hi mNeu中性粒细胞亚群通过THBS1-CD36信号通路与巨噬细胞互作并调节其极化，为理解地诺单抗的免疫调节作用提供新见解 | 研究基于小鼠模型，未在人类样本中验证；仅关注短期治疗效应（4周），长期影响未知 | 评估抗RANKL抗体治疗对骨髓骨免疫微环境的影响 | 成年雌性小鼠的骨髓免疫细胞 | machine learning | osteoporosis | scRNA-seq | NA | gene expression data | 10只小鼠（治疗组和对照组各5只）的骨髓细胞 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' v3 chemistry |
| 628 | 2026-06-23 |
Transcriptomics and single cell sequencing revealed the important role of PPAR signaling pathway in zebrafish liver fibrosis induced by thioacetamide
2026-Jun-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2026.128145
PMID:41997351
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研究论文 | 通过转录组和单细胞测序揭示PPAR信号通路在硫代乙酰胺诱导的斑马鱼肝纤维化中的重要作用 | 首次通过斑马鱼模型结合转录组和单细胞测序技术系统揭示PPAR信号通路在硫代乙酰胺诱导肝纤维化中的调控机制 | 未提及具体局限性 | 探究硫代乙酰胺诱导斑马鱼肝纤维化的分子机制，特别是PPAR信号通路的作用 | 硫代乙酰胺暴露的斑马鱼肝脏组织及细胞 | NA | 肝纤维化 | 转录组测序， 单细胞测序 | NA | 基因表达数据， 单细胞转录组数据 | 斑马鱼肝脏组织样本（具体数量未提及） | NA | bulk RNA-seq， 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 629 | 2026-06-23 |
Somatic variant detection in normal tissues from single-cell sequencing data
2026-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.10.731451
PMID:42327286
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研究论文 | 本文评估了从单细胞测序数据中检测正常组织体细胞变异的可行性，利用细胞系混合样本比较了Monopogen和SComatic等工具的性能 | 首次系统评估在正常组织中利用单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据检测罕见体细胞变异的可行性，并展示了Monopogen在低细胞频率下的高准确性 | 主要基于细胞系混合样本，未涉及真实正常组织；单细胞数据基因组覆盖度低于批量测序，可能遗漏某些变异 | 评估通过广泛使用的单细胞测序数据（snRNA-seq和snATAC-seq）在正常组织中可靠检测体细胞突变的可行性 | 由SMaHT联盟制备的六种HapMap样本的细胞系混合样本 | 数字病理学、机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、PacBio长读长全基因组测序 | Monopogen、SComatic | 序列数据 | 六种细胞系混合样本，包含约12k个snRNA-seq细胞和11k个snATAC-seq细胞 | 10x Genomics、PacBio | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、全基因组测序 | 10x Chromium 5'、PacBio Sequel | 10x Genomics 5' snRNA-seq（平均每细胞36k读数）和snATAC-seq（每细胞14k中位高质量片段）；PacBio长读长全基因组测序（109×覆盖度） |
| 630 | 2026-06-23 |
The Logic of Thalamic Inputs onto the Molecular Taxonomy of Cortical Neurons Reveals a Visual Hierarchy
2026-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.12.731929
PMID:42327034
|
研究论文 | 结合顺行跨突触示踪剂和空间转录组学，揭示了丘脑输入如何投射到小鼠视觉皮层神经元的分子分类上，并构建了视觉层次结构 | 首次揭示了跨突触示踪与空间转录组学结合方法，发现了由细胞类型组成和GABA能/谷氨酸能神经元比例定义的上下行丘脑输入“签名”，并基于此建立了独立于皮层区域分子和细胞相似性的视觉层次框架 | 未提及局限性 | 探究丘脑输入如何映射到皮层神经元的分子分类上，并揭示视觉皮层层次结构 | 小鼠视觉皮层神经元的分子和空间身份 | 数字病理学 | 无特定疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 631 | 2026-06-23 |
Spatially resolved T cell receptor tracking reveals γδT cell localization to tumor-rich regions in high-risk neuroblastoma: A Report from the Children's Oncology Group
2026-Jun-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.06.10.26354144
PMID:42326820
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研究论文 | 通过空间转录组学和T细胞受体追踪，揭示高风险神经母细胞瘤中γδT细胞在肿瘤富集区域的定位 | 首次结合空间转录组学与TCR测序，在单细胞分辨率下揭示高风险神经母细胞瘤中T细胞受体克隆型的空间分布及其与肿瘤细胞的相互作用，特别是γδT细胞在肿瘤富集区域的独特分布模式 | 样本量较小（仅5例患者有配对治疗前后肿瘤样本），未提及功能验证或因果机制研究 | 探究高风险神经母细胞瘤中T细胞及其受体的空间组织如何影响克隆型特异性T细胞状态，以及γδT细胞在肿瘤免疫相互作用中的潜在角色 | 高风险神经母细胞瘤患者 | 空间转录组学, 免疫组库测序, 数字病理学 | 高风险神经母细胞瘤 | 空间转录组学, T细胞受体测序, 批量TCR测序 | NA | 转录组数据, T细胞受体序列数据 | 37例患者的外周血和肿瘤样本，其中5例有配对治疗前后肿瘤样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 632 | 2026-06-23 |
A multi-omics map of diabetic nephropathy reveals c-Jun as a driver of tubular injury and metabolic stress
2026-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.09.731164
PMID:42327115
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研究论文 | 整合多组学数据绘制糖尿病肾病图谱，揭示c-Jun作为肾小管损伤和代谢应激的关键驱动因子 | 首次通过单细胞多重蛋白成像、空间转录组学、单核和单细胞RNA测序及染色质可及性分析的多模态整合，系统绘制人类糖尿病肾病的细胞类型、空间分布及免疫-纤维化相互作用图谱，并明确c-Jun在肾小管损伤和纤维化中的核心调控作用 | 未提及 | 阐明糖尿病肾病中驱动肾小管损伤和纤维化的分子机制 | 人类糖尿病肾病样本及糖尿病小鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞多重蛋白成像, 空间转录组学, 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析 | NA | 图像, 文本 | 人类糖尿病肾病样本及糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 633 | 2026-06-23 |
Biological Aging of the Cardiopulmonary System
2026-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.09.731192
PMID:42327130
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研究论文 | 通过整合生理力学与单细胞转录组学，绘制小鼠成年生命周期的心肺老化图谱，并建立基于生理学的生物学老化评分体系 | 首次将肺动脉、右心室和肺的力学特性与单细胞转录组学整合，提出基于生理学的生物学老化评分替代实际年龄来锚定基因表达变化，揭示心肺老化的阶段依赖性及生物力学-代谢-免疫失耦联机制 | 研究对象仅限小鼠，结果在人类中的可转化性需进一步验证 | 量化心肺系统的生物学老化，并解析其潜在分子机制 | 成年小鼠的心肺系统，包括肺动脉、右心室和肺组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 主成分分析 | 转录组数据和生理力学数据 | 覆盖小鼠成年全生命周期的多个时间点样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于肺动脉单细胞转录组分析 |
| 634 | 2026-06-23 |
Emulating the gingival-tooth interface during bacterial, fungal, and viral infection in a microphysiological model of the human oral cavity
2026-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.11.731421
PMID:42327339
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研究论文 | 本文提出了一个生物工程口腔微生理系统，包含血管化人类牙龈组织与牙齿类似物，用于模拟细菌、真菌和病毒感染时牙龈-牙齿界面的相互作用 | 首次构建包含血管化牙龈组织和牙齿类似物的口腔微生理系统，可同时模拟跨微生物界生物膜形成、真菌诱导的上皮-间质转化及SARS-CoV-2感染，并整合人类唾液流以模拟低唾液分泌对真菌感染致病性的影响 | NA | 建立体外口腔微生理模型用于研究宿主-微生物相互作用 | 人类牙龈组织与牙齿类似物 | 数字病理学 | 口腔感染 | 单细胞RNA测序、全局代谢组学分析 | NA | 图像 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 635 | 2026-06-23 |
Zero-shot reconstruction of mutant spatial transcriptomes
2026-Jun-12, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2026.101521
PMID:42328206
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研究论文 | 提出ZENomix零样本框架，无需训练数据即可预测突变体空间转录组 | 首次实现零样本学习预测突变体空间转录组，无需已有空间图谱作为训练数据 | 未提及具体局限性 | 开发无需训练数据的零样本方法预测突变体空间转录组 | 阿尔茨海默病模型小鼠、阿尔茨海默病人脑组织、Nodal信号缺陷突变体斑马鱼胚胎 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, 空间转录组学 | 零样本学习模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多种突变体样本（阿尔茨海默病小鼠、人脑、斑马鱼胚胎） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 636 | 2026-06-23 |
In silico virtual knockout identifies PXDNL as a fibroblast-specific driver of sarcopenia and GABA as a potential modulator
2026-Jun-11, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153738
PMID:41996735
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研究论文 | 通过计算虚拟基因敲除结合多组学和单细胞RNA-seq，鉴定出PXDNL是肌肉减少症的成纤维细胞特异性驱动因子，并验证GABA作为潜在调节剂 | 首次整合虚拟基因敲除（scTenifoldKnk）与多组学分析，发现成纤维细胞特异性的PXDNL-ECM轴是肌肉减少症的因果机制，并利用药物重定位和分子对接确认GABA为可重用的治疗候选药物 | 未提及具体限制 | 鉴定肌肉减少症的成纤维细胞特异性驱动因子并发现可转化的治疗靶点 | 人类肌肉活检样本（238个活检、5个GEO队列、10个单细胞样本、12,847个细胞） | 机器学习 | 肌肉减少症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 虚拟基因敲除, 分子对接, 酶活性测定 | WGCNA, scTenifoldKnk, 机器学习（plsRglm等113种算法） | 基因表达数据 | 238个活检样本（多组学）、10个单细胞RNA-seq样本（12,847个细胞） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 637 | 2026-06-23 |
Conserved Cell Type Signatures Across the Brainstem and Spinal Cord in the Mouse Central Nervous System
2026-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.09.728039
PMID:42327133
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研究论文 | 整合单核多组学测序和空间转录组学，绘制成年小鼠脑干和脊髓中保守的细胞类型特征图谱 | 首次在脑干和脊髓之间系统揭示保守的细胞类型核心特征，发现细胞类型和位置身份在很大程度上正交，并揭示不同神经元类别中区域影响的差异性 | NA | 研究中枢神经系统中细胞类型在脑干和脊髓之间的组织方式和保守特征 | 成年小鼠的脑干和脊髓组织 | 机器学习 | NA | 单核多组学测序（RNA+ATAC），空间转录组学 | NA | 基因表达数据，染色质可及性数据，空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞多组学，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium 单核多组学（RNA+ATAC），10x Visium 空间转录组 |
| 638 | 2026-06-23 |
Spatial Transcriptomics reveals a T cell-mediated microglial activation axis of neurodegeneration following immune checkpoint inhibition
2026-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.10.730982
PMID:42327312
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示免疫检查点抑制剂治疗后T细胞介导的小胶质细胞激活轴导致神经退行性变 | 首次利用MERFISH空间转录组学技术以单细胞分辨率揭示免疫检查点抑制剂引起脑功能障碍的细胞特异性分子机制和空间模式，并证明T细胞-小胶质细胞互作轴是驱动神经免疫稳态失调的关键机制 | 主要基于小鼠模型，人类数据仅来自尸检脑组织的免疫荧光分析，且未详细说明样本量和统计效力 | 阐明免疫检查点抑制剂治疗引发脑部免疫相关不良事件的空间模式和细胞特异性分子机制 | 同基因小鼠黑色素瘤模型的海马区以及接受免疫检查点抑制剂治疗患者的死后脑组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间单细胞基因表达数据、批量RNA测序数据 | 未明确说明样本量 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | 多路复用错误鲁棒荧光原位杂交（MERFISH）技术 |
| 639 | 2026-06-23 |
Distinct fibroblast and perivascular senotypes define spatial niches that regulate fibrosis
2026-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.08.730636
PMID:42327137
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学分析，发现纤维化相关衰老细胞包含功能上分化的衰老类型，它们被组织成不同的空间微环境，这些微环境通过调节细胞外基质产生、免疫信号和血管重塑来影响纤维化进程 | 首次揭示了纤维化中衰老细胞的功能异质性及其空间组织规律，鉴定出成纤维细胞和血管周围细胞两种功能不同的衰老类型，并证明血管周围衰老在血管重塑与纤维化结果之间起桥梁作用 | 研究主要基于小鼠模型，虽然通过公共数据集验证了人类纤维化疾病中的保守性，但直接的人类组织验证和功能实验仍需进一步开展 | 阐明纤维化相关衰老细胞的异质性及其空间分布对纤维化进程的调控机制 | 小鼠纤维化模型中的基质细胞、免疫细胞和血管细胞，以及公共数据集中的人类纤维化组织 | 数字病理学 | 纤维化疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 层次因子分解模型 | 基因表达数据，空间转录组数据 | 小鼠纤维化模型组织样本，以及多个公共人类纤维化数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium空间转录组学 |
| 640 | 2026-06-23 |
Robust semi-supervised scRNA-seq integration from virtual adversarial learning
2026-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.07.730754
PMID:42327300
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