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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-06-26 |
Molecular characteristics and modifications of glioblastoma affecting the efficacy of immunotherapy
2026-Jun-24, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115888
PMID:42341896
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综述 | 本文综述了胶质母细胞瘤的分子和表观遗传特征,特别是表观遗传修饰如何影响免疫治疗效果 | 整合了DNA甲基化、组蛋白修饰和N6-甲基腺苷调控等表观遗传机制,并探讨了它们与肿瘤免疫逃逸和治疗反应的关联 | 主要基于现有文献总结,缺乏新的实验数据验证 | 探索胶质母细胞瘤的分子特征和表观遗传修饰对免疫疗法疗效的影响 | 胶质母细胞瘤的肿瘤微环境、免疫抑制细胞群以及相关基因突变 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 522 | 2026-06-26 |
Development of a gene signature related to phospholipid metabolism for prognosis and therapeutic Prediction in Osteosarcoma: Focus on VAC14
2026-Jun-24, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150290
PMID:42342054
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research paper | 本研究构建了一个基于磷脂代谢相关基因的预后模型,并验证了其在骨肉瘤预后和治疗预测中的价值,重点分析了VAC14的作用 | 首次识别并构建了基于磷脂代谢相关基因的预后风险模型,结合单细胞测序和代谢组学分析揭示了免疫微环境与磷脂代谢的关联,发现VAC14可能成为骨肉瘤新辅助治疗的潜在靶点 | NA | 识别骨肉瘤中磷脂代谢相关的特征基因,评估其预后价值和治疗潜力 | 骨肉瘤患者的转录组数据、临床数据和肿瘤样本 | machine learning | 骨肉瘤 | RNA-seq, single-cell sequencing, metabolomics | Cox回归,LASSO,SVM-RFE | 基因表达数据,单细胞测序数据,代谢组学数据 | 来自TARGET和GEO数据库的骨肉瘤患者数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 523 | 2026-06-26 |
HSP27 in autoimmune diseases: Context-dependent regulation and clinical potential
2026-Jun-24, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168330
PMID:42342167
|
综述 | 系统性回顾HSP27在自身免疫性疾病中的双向免疫调节机制及其作为疾病标志物和治疗靶点的临床潜力 | 提出“HSP27双重调控悖论”概念,并基于“细胞类型-微环境-疾病阶段”三维调控模型解析HSP27的背景依赖性调控作用 | 缺乏单细胞测序、空间组学和大规模临床队列研究的整合证据,现有研究多为临床前阶段 | 评估HSP27在自身免疫性疾病中的生物标志物和治疗靶点价值 | HSP27蛋白及其在自身免疫性疾病中的免疫调控机制 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 524 | 2026-06-26 |
Inter- and intratumoral heterogeneity of aldosterone-producing adenomas: recent advances and clinical implications
2026-Jun-24, Endocrine journal
IF:1.3Q4
DOI:10.1507/endocrj.EJ26-0125
PMID:42342353
|
综述 | 本文综述了醛固酮腺瘤在肿瘤间及肿瘤内的异质性研究进展及其临床意义 | 整合基因组、表观基因组、代谢组及单细胞组学数据,系统阐述突变驱动差异与细胞状态多样性之间的相互作用,为理解APA病理生理机制提供全面框架 | 未涉及异质性对治疗耐药性的直接影响,且主要基于现有文献总结,缺乏原始实验验证 | 总结APA肿瘤间和肿瘤内异质性的最新证据,探讨其对疾病分类、生物标志物开发和治疗策略的影响 | 醛固酮腺瘤(APA)组织及其细胞群体 | 机器学习 | 原发性醛固酮增多症、高血压 | 单细胞转录组学、单核转录组学、空间转录组学、基因组学、表观基因组学、代谢组学 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据、代谢物数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'试剂盒、10x Visium空间转录组学平台 |
| 525 | 2026-06-26 |
Targeting non-canonical antigens unlocks functional T-cell responses in renal cell carcinoma
2026-Jun-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-015100
PMID:42342407
|
研究论文 | 开发整合蛋白质组学方法,系统鉴定肾细胞癌中非经典抗原,并证明其能激活功能性T细胞反应 | 首次证明低突变负荷肾细胞癌中非经典抗原驱动免疫原性,发现人类内源性逆转录病毒和长链非编码RNA衍生的肿瘤特异性抗原在患者间共享 | 未明确说明 | 系统鉴定肾细胞癌中非经典肿瘤特异性抗原并评估其免疫治疗潜力 | 肾细胞癌样本中的非经典抗原和T细胞反应 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 免疫肽组学,外显子组测序,转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 测序数据,细胞实验数据,小鼠模型数据 | 患者肾细胞癌样本,患者来源肿瘤样细胞簇,小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 526 | 2026-06-26 |
Spatial immune atlas of breast cancer brain metastasis reveals CD163+ macrophage reprogramming associated with immune escape
2026-Jun-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014421
PMID:42342408
|
研究论文 | 通过整合高多重成像质谱流式、单细胞RNA测序和空间转录组数据,揭示了乳腺癌脑转移中CD163+巨噬细胞重编程与免疫逃逸相关的空间免疫图谱 | 首次在单细胞分辨率下整合成像质谱流式、单细胞RNA测序和空间转录组数据,系统构建了乳腺癌脑转移的空间免疫微环境图谱,并发现了CD163+巨噬细胞重编程与免疫逃逸之间的关联 | 样本量有限,仅包含20个原发肿瘤和40个脑转移组织的感兴趣区域;功能验证仅在体内动物模型中进行 | 阐明乳腺癌脑转移中免疫微环境的空间组织和分子回路 | 人类乳腺原发肿瘤组织和脑转移组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | IMC, scRNA-seq, 空间转录组 | NA | 图像, 文本 | 20个原发肿瘤感兴趣区域和40个脑转移感兴趣区域;10例乳腺癌和12例脑转移的单细胞RNA测序样本;7例乳腺癌和1例脑转移的空间转录组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 527 | 2026-06-26 |
From xylem atlases to developmental continuity in forestry
2026-Jun-24, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.06.001
PMID:42342457
|
研究论文 | 通过整合单细胞、单核和空间转录组学数据,在白杨木质部中重建发育连续性,揭示细胞状态与解剖背景的联系 | 提出将细胞解析图谱置于解剖学背景中解释,并关联发育连续性与实验验证的新原则 | 未明确提及研究局限性,可能包括样本量限制或模型物种的代表性不足 | 从细胞图谱中恢复木质部发育的连续性 | 白杨木质部 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学, 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 528 | 2026-06-26 |
Persistent hindrances to data re-use in single-cell genomics
2026-Jun-24, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-07582-9
PMID:42342707
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研究论文 | 评估公共单细胞RNA测序研究数据重用性的障碍 | 系统评估了10x Genomics单细胞RNA-seq数据在GEO中的可重用性,揭示了仅约40%的研究提供了可用的处理计数数据 | 研究仅聚焦于10x Genomics平台的数据,可能不适用于其他单细胞技术平台 | 评估公共单细胞RNA-seq研究数据的可重用性现状 | Gene Expression Omnibus数据库中公开的10x Genomics单细胞RNA-seq研究数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达计数矩阵数据、细胞类型注释数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台单细胞RNA测序 |
| 529 | 2026-06-26 |
High-resolution spatial transcriptomics of adult and pediatric human liver with Visium HD
2026-Jun-24, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-07597-2
PMID:42342734
|
研究论文 | 利用10x Genomics的Visium HD技术对成人和儿童人类肝脏进行高分辨率空间转录组学分析,构建细胞级别和空间分辨的肝脏图谱 | 首次应用Visium HD空间转录组学技术以2微米亚细胞分辨率对肝脏样本进行高分辨率空间基因表达图谱构建,避免了单细胞解离中的细胞类型偏差 | 未提及具体局限性,但可能涉及样本数量有限(仅3例供体)及技术可及性 | 构建高分辨率肝脏空间转录图谱以揭示细胞和结构异质性,为疾病特异性空间标志物和治疗靶点识别提供资源 | 来自2名成人和1名儿童供体的健康人类肝脏组织样本 | 空间转录组学 | NA | Visium HD空间转录组学 | 聚类分析 | 空间基因表达数据 | 3例人类肝脏供体样本(2名成人、1名儿童) | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 10x Genomics Visium HD技术,bin宽度为2微米,实现亚细胞分辨率 |
| 530 | 2026-06-26 |
Hypoimmunogenic iPSC-derived hepatic organoids featuring a functional vascular network
2026-Jun-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-58977-y
PMID:42342802
|
研究论文 | 本研究结合组织工程与低免疫原性iPSC技术,生成了包含功能性血管网络且低免疫原性的肝类器官 | 首次将低免疫原性iPSC技术与组织工程结合,构建出包含多种实质与非实质细胞(包括血管和窦状内皮细胞)的肝类器官,并验证其具有功能性血管网络 | 未提及具体研究局限性 | 为解决终末期肝病移植供体短缺和免疫排斥问题,开发一种即用型、低免疫原性的肝类器官 | 诱导多能干细胞(iPSC)衍生的肝细胞、胆管细胞、肝星状细胞、库普弗细胞以及血管和窦状内皮细胞 | 数字病理学 | 终末期肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 531 | 2026-06-26 |
ZFP36L1 and ZFP36L2 cooperatively regulate thymic epithelial cell function to prevent early-onset thymic involution
2026-Jun-24, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-026-01793-8
PMID:42342899
|
研究论文 | 该研究揭示了ZFP36L1和ZFP36L2两种RNA结合蛋白协同调节胸腺上皮细胞功能,防止早发性胸腺退化的机制 | 首次发现ZFP36L1和ZFP36L2在胸腺上皮细胞中具有协同作用,通过转录后调控维持胸腺微环境,防止过早胸腺退化 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证;具体分子机制如靶基因识别仍需进一步探索 | 阐明胸腺上皮细胞分化过程中RNA结合蛋白ZFP36L1和ZFP36L2的功能及分子机制 | 胸腺上皮细胞及其分化过程 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序,条件性基因敲除,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年小鼠胸腺组织样本(具体数量未在摘要中说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 532 | 2026-06-26 |
Elucidating the therapeutic targets and multi-target mechanisms of salvianolic acid A for diabetic nephropathy
2026-Jun-24, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-026-10246-z
PMID:42342966
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研究论文 | 本研究系统阐释了丹酚酸A通过多靶点机制治疗糖尿病肾病的分子靶点和药理作用 | 结合机器学习和孟德尔随机化方法鉴定核心靶点,并利用单细胞RNA测序揭示靶点在肾细胞类型中的特异性表达 | 目前仅通过体外高糖诱导足细胞损伤模型验证,缺乏体内动物实验和临床试验的进一步验证 | 阐明丹酚酸A治疗糖尿病肾病的潜在靶点和多靶点作用机制 | 丹酚酸A的潜在药物靶点和糖尿病肾病相关靶点 | 机器学习和生物信息学 | 糖尿病肾病 | R T - Q P C R | 人工智能 | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 |
| 533 | 2026-06-26 |
Stage-associated remodeling of CD169 macrophage states is linked to immune regulation in colitis-associated colorectal cancer
2026-Jun-24, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02463-9
PMID:42342977
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研究论文 | 通过遗传耗竭、单细胞转录组学和药理学干预,研究CD169巨噬细胞状态在结肠炎相关结直肠癌进展过程中的重塑及其免疫调节作用 | 首次揭示CD169巨噬细胞在结肠炎相关结直肠癌不同阶段的功能状态重塑,发现CD169-low和CD169-mid/high巨噬细胞具有相反的免疫调控作用,并提出CD169相关巨噬细胞作为炎症驱动结直肠癌的潜在治疗靶点 | NA | 研究CD169巨噬细胞状态在结肠炎相关结直肠癌进展中的动态变化及其免疫调节机制 | CD169相关巨噬细胞状态 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类结肠炎相关结直肠癌标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 534 | 2026-06-26 |
ACOT9, a mitochondrial metabolism-related gene, promotes ROS-associated epithelial remodeling in laryngeal squamous cell carcinoma
2026-Jun-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08470-x
PMID:42343374
|
研究论文 | 开发喉鳞状细胞癌线粒体代谢相关基因预后特征并验证ACOT9通过线粒体活性氧促进肿瘤进展的生物学功能 | 首次构建基于178种机器学习模型组合的线粒体代谢相关基因预后特征,并通过虚拟敲除分析揭示ACOT9调控LAMC2和KRT17的新机制 | 基于公开数据库分析,缺乏多中心大样本队列的外部验证;ACOT9具体分子调控机制尚未完全阐明 | 开发喉鳞状细胞癌的线粒体代谢相关基因预后特征并阐明ACOT9在肿瘤进展中的生物学作用 | 喉鳞状细胞癌患者的肿瘤组织标本和细胞系 | 数字病理学 | 喉癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,免疫组化,免疫荧光,qRT-PCR,蛋白免疫印迹,活性氧检测 | 机器学习组合模型(包括Cox比例风险模型、随机生存森林等) | 基因表达数据,单细胞转录组数据,病理图像,细胞实验数据 | TCGA-LSCC队列(具体样本数未提供),GSE65858独立验证集,GSE290927单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 535 | 2026-06-26 |
AF9-KLF2 gene regulatory circuit links histone lactylation to metabolic reprogramming and breast cancer progression
2026-Jun-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117429
PMID:42189684
|
研究论文 | 揭示了AF9-KLF2基因调控回路通过组蛋白乳酸化连接代谢重编程与乳腺癌进展 | 首次发现AF9作为组蛋白H3K9乳酸化的读取器,并通过与KLF2形成正反馈回路放大乳酸化效应,驱动肿瘤发生 | 未明确阐述该调控回路在其他乳腺癌亚型或非乳腺癌癌症中的普适性 | 阐明组蛋白乳酸化在乳腺癌进展中的转录调控机制 | 乳腺癌细胞系及肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | ChIP-seq, RNA-seq | NA | 基因表达数据, 染色质免疫沉淀数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 单细胞和空间转录组学分析 |
| 536 | 2026-06-26 |
A human corticospinal organoid-slice connectoid model informs enhancer strategies for post-injury axon regrowth
2026-Jun-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117399
PMID:42201810
|
研究论文 | 开发了一种人皮质脊髓类器官-切片连接体模型,用于研究轴突再生策略 | 首次构建三维人皮质脊髓运动类器官-切片连接体平台,模拟发育性轴突伸长程序及成熟后的限制,并利用单细胞转录组学等方法识别了影响轴突生长的转录变化 | 未详细说明 | 研究哺乳动物中枢神经系统中轴突生长停止的机制,并寻找促进损伤后轴突再生的修复策略 | 人皮质脊髓运动神经元和脊髓组织 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组学、计算分析、轴突再生测定、活细胞成像 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | 未提供具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 537 | 2026-06-26 |
Reversible loss of hematopoietic stem cells transplant potency by chronic Salmonella infection
2026-Jun-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117474
PMID:42224081
|
研究论文 | 慢性沙门氏菌感染导致造血干细胞移植潜力可逆性丧失 | 首次揭示慢性沙门氏菌感染会显著削弱骨髓中的干细胞和前体细胞,且这种功能丧失是可通过抗生素治疗逆转的 | 未提供 | 探究慢性沙门氏菌感染对造血干细胞移植潜力的影响 | 造血干细胞 | NA | 沙门氏菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 538 | 2026-06-26 |
A progenitor cell population contributes to prenatal injury repair and neonatal antimicrobial defense in the small intestine
2026-Jun-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117503
PMID:42241283
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序与小鼠及类器官模型,鉴定出胚胎和新生小鼠小肠中的哨兵祖细胞(SISPCs),并揭示其在产前损伤修复和新生儿抗菌防御中的关键作用 | 首次鉴定出以Lyz1为标志的小肠哨兵祖细胞(SISPCs),揭示其与潘氏细胞不同的动态时空分布和干性特征,并阐明其通过DUSP-p38信号轴在产前肠损伤修复中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类的推广需要进一步验证;干性潜能和SISPCs功能在不同肠段间的差异机制尚未完全阐明 | 阐明胚胎小肠上皮细胞的特化类型和功能,特别是哨兵祖细胞在发育过程中的作用 | 小鼠胚胎和新生小肠中的上皮祖细胞(SISPCs) | 机器学 | NA | 单细胞RNA测序、类器官模型 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎和新生小肠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 539 | 2026-06-26 |
Nerve-proximal tertiary lymphoid structures predict chemotherapy sensitivity in pancreatic cancer
2026-Jun-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117496
PMID:42241282
|
研究论文 | 本研究探讨胰腺癌化疗后神经重塑如何影响三级淋巴结构及预后,发现化疗增加神经密度和三级淋巴结构丰度,且神经旁三级淋巴结构(N-TLS)与肿瘤消退正相关,空间转录组学揭示施万细胞转录重编程与三级淋巴结构积累相关 | 首次揭示化疗诱导胰腺癌中神经重塑与三级淋巴结构成熟之间的空间组织神经-免疫轴,提出神经旁三级淋巴结构作为化疗反应的新型组织学生物标志物 | 样本量较小(86例未治疗和49例新辅助化疗患者),缺乏多中心独立验证;机制解析基于相关性分析,因果关系需进一步实验验证 | 阐明胰腺癌中神经重塑如何影响化疗后的三级淋巴结构形成及临床结局 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者组织样本,包括86例未经治疗和49例接受新辅助化疗的患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | NA | 图像, 转录组数据 | 135例胰腺癌患者组织样本(86例未治疗,49例新辅助化疗后) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台,可能用于FFPE组织切片 |
| 540 | 2026-06-26 |
Aging restricts maturation of CXCL13+ T follicular helper cells in human immunity
2026-Jun-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117423
PMID:42241286
|
研究论文 | 利用人扁桃体类器官、单细胞RNA测序和CRISPR技术,揭示衰老通过限制CXCL13+ Tfh细胞成熟导致体液免疫下降 | 首次在人类中揭示CXCL13+ Tfh细胞在衰老中的选择性丢失及其成熟阻滞机制,并鉴定BACH2和SOX4为年龄相关的分化调控因子 | 主要基于扁桃体类器官模型,可能不完全反映体内免疫微环境;未涉及其他淋巴器官或全身性免疫反应 | 探究人类衰老过程中Tfh细胞和B细胞对抗体反应下降的差异贡献,以及CXCL13+ Tfh细胞的调控机制 | 人类扁桃体组织及类器官、老年和年轻供体的Tfh细胞和B细胞 | 免疫学 | 老年相关疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR干扰, 类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据 | 多名老年和年轻供体的人扁桃体类器官 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |