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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-07-01 |
Cellular profiling identifies an early profibrotic alveolar type 2 cell signature in lung fibrosis
2026-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1093/ajrccm/aamag044
PMID:41738207
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research paper | 研究揭示了端粒功能障碍通过p53信号通路驱动肺泡2型细胞转分化和衰老,导致肺纤维化的机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出肺纤维化早期促纤维化肺泡2型细胞特征,并发现p53信号促进AT2细胞转分化 | 研究基于小鼠模型,其与人类IPF的直接相关性需进一步验证 | 探讨AT2细胞端粒功能障碍(TRF1缺失)驱动肺重构的分子机制及其在IPF中的意义 | SPC-creTRF1flox/flox小鼠及IPF患者肺泡2型细胞 | machine learning | lung cancer | single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data | SPC-creTRF1flox/flox小鼠和IPF患者肺组织样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 502 | 2026-06-30 |
Identification of Centrosome Duplication-Related Biomarkers in Hypertrophic Cardiomyopathy Through Integrative Multi-Omics, Single-Cell Transcriptomics, and Experimental Validation
2026-06-16, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.047416
PMID:42261922
|
研究论文 | 通过整合多组学、单细胞转录组学及实验验证,鉴定肥厚型心肌病中心体复制相关生物标志物 | 首次通过整合多组学和机器学习方法,系统鉴定与HCM相关的心体复制基因,并发现VPS8作为连接内体-溶酶体稳态与免疫重塑的关键调控因子 | 未提及具体局限性 | 探究中心体复制相关基因在肥厚型心肌病发病机制中的潜在作用及生物标志物 | 肥厚型心肌病相关基因HBEGF和VPS8,重点关注VPS8在心肌细胞中的功能 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、多组学分析、机器学习和体外功能实验 | 多个机器学习模型(包括差异表达分析、加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化) | 转录组数据和单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 503 | 2026-06-30 |
Integrated multi-technology exploration of the mechanism by which Badushengji San regulates core targets in diabetic foot ulcer
2026-Jun-16, Molecular genetics and genomics : MGG
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00438-026-02469-1
PMID:42298176
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研究论文 | 本研究整合多组学技术探索拫毒生肌散调节糖尿病足溃疡核心靶点的机制 | 首次通过整合转录组、单细胞测序和多种机器学习算法,鉴定糖尿病足溃疡生物标志物并揭示拫毒生肌散的潜在调控机制 | 研究仅基于公共数据库分析和体外实验,缺乏体内机制验证 | 鉴定糖尿病足溃疡潜在生物标志物,并初步探索拫毒生肌散的治疗机制 | 糖尿病足溃疡及拫毒生肌散 | 机器学习 | 糖尿病足溃疡 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, SVM-RFE, Boruta | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 三个公共数据集(GSE199939, GSE134431, GSE165816) | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 504 | 2026-06-30 |
Human vein-to-artery endothelial cell fate transition is driven by VEGF/ERK activation and PI3K inhibition
2026-Jun-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205490
PMID:42290237
|
研究论文 | 开发了一种人类多能干细胞分化方案,模拟静脉到动脉的内皮细胞命运转变,并揭示VEGF激活与PI3K抑制是该过程的关键驱动信号 | 首次建立人类静脉到动脉内皮细胞转变的体外分化模型,利用单细胞RNA测序数据对比验证其与胚胎发育中血管生成源动脉内皮细胞的相似性,并明确VEGF/ERK激活和PI3K抑制为最小必需信号 | 未提及该方案的长期稳定性或体内功能验证,可能缺乏与体内复杂微环境的全面对比 | 模拟人类胚胎发育中静脉到动脉内皮细胞的转变过程,明确其关键信号通路 | 人类多能干细胞分化的内皮细胞(静脉和动脉表型)以及公共数据库中人类胚胎单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,分化方案建模 | NA | 转录组数据 | 人类多能干细胞分化模型(未明确样本数)及公共单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 505 | 2026-06-30 |
Beyond suppression: the plasticity, dysfunction, and therapeutic reprogramming of regulatory T cells in inflammatory bowel disease
2026-Jun-08, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag067
PMID:42203202
|
综述 | 系统阐述炎症性肠病中调节性T细胞的生物学特征、功能缺陷及新兴治疗策略 | 提出以谱系缺陷性外Treg和耗竭性效应Treg的关键区分为核心的概念框架,并结合多组学洞察重新定义IBD中Treg功能衰竭 | 未对具体治疗策略的临床效果和安全性进行量化比较或荟萃分析 | 阐明IBD中Treg的可塑性、功能障碍及其治疗重编程机制 | 调节性T细胞 | 机器学习 | 炎症性肠病 | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | 单细胞数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞多组学、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 506 | 2026-06-30 |
Modeling the role of urokinase-type plasminogen activator, uPA, and circulating cancer-associated fibroblasts (cCAFs) in breast cancer cell extravasation
2026-06-03, Clinical & experimental metastasis
IF:4.2Q2
DOI:10.1007/s10585-026-10411-3
PMID:42234219
|
研究论文 | 研究尿激酶型纤溶酶原激活剂(uPA)和循环肿瘤相关成纤维细胞(cCAFs)在乳腺癌细胞外渗过程中的作用 | 首次揭示CAFs通过上调乳腺癌细胞中PLAU/uPA表达促进肿瘤细胞从毛细血管后微静脉外渗至肺实质的机制 | 仅使用小鼠尾静脉模型和三阴性乳腺癌细胞系,未在患者样本中验证uPA/PLAU的临床相关性 | 阐明循环肿瘤相关成纤维细胞如何辅助乳腺癌细胞从血管外渗到肺实质 | 三阴性乳腺癌MDA-MB231细胞、CAF23成纤维细胞、HUVEC内皮细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、siRNA敲低 | NA | 基因表达数据、体外结合实验数据 | 小鼠尾静脉注射模型(未明确样本量) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 未在摘要中明确提及具体平台配置 |
| 507 | 2026-06-30 |
Multi-Scale Genetic and Transcriptomic Analyses Identify Druggable Targets for Epilepsy
2026-Jun, Current medical science
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11596-026-00194-9
PMID:42012806
|
研究论文 | 通过整合GWAS、eQTL和单细胞转录组数据,识别癫痫的因果基因及可药物化靶点 | 首次结合大脑bulk和单细胞eQTL数据与GWAS进行孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析,识别FGFR3驱动的FGF信号通路为癫痫的关键分子轴 | 研究基于脑组织表达数据,未涵盖其他组织或细胞类型的调控影响 | 利用多尺度遗传和转录组学分析,识别癫痫的可药物化靶点 | 癫痫因果基因(FGFR3、PM20D1、ZNF564、HAGH、CAPN15、CCDC117、DARS1-AS1)及候选化合物Ro-4396686 | 机器学习 | 癫痫 | GWAS, eQTL, scRNA-seq, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位 | NA | 遗传数据, 转录组数据 | 多组公共数据库样本(GWAS、eQTL)及独立RNA-seq队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 508 | 2026-06-30 |
High-throughput generation of patient-derived cancer stem cells for precision medicine using a microwell-chip platform
2026-Jun, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-026-01957-1
PMID:42129300
|
研究论文 | 利用微孔芯片平台从有限乳腺癌临床样本中高通量生成患者来源的肿瘤干细胞,用于精准医疗 | 开发了一种微孔细胞芯片培养平台,能够从少量临床样本(如穿刺活检)中快速、高通量生成均匀的微肿瘤球,并在8天内实现功能性肿瘤干细胞富集和个性化药物测试 | 未明确提及,但可能涉及样本大小限制或临床转化的进一步验证 | 实现从有限临床样本中高通量分离功能性肿瘤干细胞,以推动精准肿瘤学中基于肿瘤干细胞的药物评估 | 乳腺癌患者来源的肿瘤干细胞和微肿瘤球 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 16名乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 509 | 2026-06-30 |
Circulating B7H6 is associated with reduced NKp30 receptor expression and improved lung transplant recipient survival
2026-06-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1093/ajrcmb/aanag017
PMID:41738213
|
研究论文 | 研究循环B7H6与NKp30受体表达降低及肺移植受者生存率改善的关联 | 首次发现囊性纤维化患者中NKp30受体特异性下调,并揭示可溶性B7H6在肺移植结果中的保护性作用 | 样本量较小,未明确NKp30下调的分子机制 | 探究自然杀伤细胞受体在肺移植受者预后中的作用 | 肺移植受者(囊性纤维化和慢性阻塞性肺疾病患者)及健康供者 | 自然语言处理 | 肺移植排斥、囊性纤维化 | 光谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 血浆、外周血单个核细胞 | 6名囊性纤维化受者、6名慢性阻塞性肺疾病受者、7名健康供者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 510 | 2026-06-30 |
Benchmarking plant single cell RNA-sequencing sample processing strategies
2026-Jun, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00800-5
PMID:42106556
|
研究论文 | 系统比较了植物单细胞RNA测序的样本处理策略,包括原生质体富集技术和scRNA-seq平台 | 首次全面评估了多种原生质体富集技术(传统流式、成像流式、磁珠分选)与不同scRNA-seq平台(10x Chromium、BD Rhapsody)在植物单细胞研究中的表现,并揭示了计算算法对双细胞识别的误判问题 | 研究仅以拟南芥根为模型,未涵盖其他植物组织或物种,且未评估其他scRNA-seq平台(如Smart-seq2) | 优化植物单细胞RNA测序的样本处理流程,提高数据质量 | 拟南芥根细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 拟南芥根样本,具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, BD Rhapsody | 10x Chromium Single Cell 3', BD Rhapsody Single-Cell Analysis System |
| 511 | 2026-06-30 |
Design of Single-Atom Nanozymes for Precision Treatment of Erectile Dysfunction with Integrated Single-Cell RNA Sequencing and Machine Learning
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524169
PMID:41980199
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序和机器学习设计单原子纳米酶用于糖尿病勃起功能障碍的精准治疗 | 提出将单细胞RNA测序与机器学习相结合的数据驱动框架,用于设计具有特定酶模拟活性的单原子纳米酶,实现疾病特异性治疗 | 仅基于已发表研究构建纳米酶数据库,可能未涵盖所有潜在纳米酶类型,且Fe-DMOF的临床转化尚需进一步验证 | 开发一种集成单细胞RNA测序和机器学习的框架,设计用于精准治疗糖尿病勃起功能障碍的纳米酶 | 糖尿病勃起功能障碍患者的海绵体组织样本和细胞 | 数字病理学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 512 | 2026-06-29 |
POLK and KCNK17 as novel candidate genes for type 2 diabetes via stress response and ion channel regulation
2026-Jun, Journal of endocrinological investigation
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s40618-026-02825-3
PMID:41793632
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,识别2型糖尿病β细胞功能障碍的新候选基因KCNK17和POLK | 首次整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法,从β细胞特异性角度鉴定出POLK和KCNK17作为2型糖尿病的候选致病基因,并揭示了离子转运与应激反应的不同细胞程序 | 未提及明显局限性,但可能受样本量较小(仅17例患者及17例对照)和外部验证仅依赖有限数据集(高糖处理的β细胞系和棕榈酸盐处理的人胰岛RNA-seq数据)的影响 | 识别2型糖尿病β细胞功能障碍的细胞类型特异性致病基因 | 17例2型糖尿病患者和17例健康对照的胰岛单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | 随机森林, XGBoost, SVM, L2正则化逻辑回归 | 单细胞基因表达数据, 全基因组关联研究汇总统计, 表达数量性状位点数据 | 17例2型糖尿病患者和17例健康对照的胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 513 | 2026-06-28 |
Sequential involvement of hypoxia and anti-PD-1 treatment in shaping tumor-regional CD39+CD8+ T cells highlights immunotherapy-resistant features in NSCLC
2026-Jun-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-014940
PMID:42350041
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧和抗PD-1治疗顺序影响非小细胞肺癌中CD39+CD8+ T细胞的区域分布,并与免疫治疗耐药相关 | 首次阐明缺氧和抗PD-1治疗先后塑造肿瘤区域CD39+CD8+ T细胞动态变化,并指出其缺失导致PD-1阻断后功能恢复受损 | 未说明具体样本量及临床验证范围,需进一步验证 | 探索CD39+CD8+ T细胞在非小细胞肺癌抗PD-1治疗中的分布、动态变化及其与耐药的关系 | 非小细胞肺癌(NSCLC)患者肿瘤微环境中的CD39+CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 流式细胞术, 多重免疫组化, 单细胞RNA测序, 功能性研究 | NA | 图像, 文本, 测序数据 | 独立NSCLC队列(具体数量未在摘要中给定) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 514 | 2026-06-26 |
Epigenetic-Genetic Crosstalk at the Cancer-Diabetes Interface: Convergent Molecular Pathways, Multi-Omics Biomarkers, and Dual Therapeutic Targets
2026-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202602229R
PMID:42313898
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综述 | 该综述系统探讨了癌症与糖尿病之间的表观遗传-遗传互作,揭示了常见的分子通路、多组学生物标志物及双重治疗靶点 | 从表观遗传与遗传互作的新视角,整合多组学技术(如单细胞测序和人工智能),深入分析癌症与糖尿病的共同分子机制,并提出双重治疗靶点的概念 | 未提及具体局限性,但综述性质意味着可能缺乏原始实验数据验证 | 揭示癌症与糖尿病共有的分子通路和生物标志物,为两者共同治疗策略提供理论基础 | 癌症与糖尿病的分子通路、表观遗传修饰(DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA失调)及相关风险因素(肥胖、慢性炎症、氧化应激) | 机器学习, 数字病理学 | 癌症, 糖尿病 | 多组学技术, 单细胞测序 | na | 多组学数据 | na | na | 单细胞RNA测序 | na | na |
| 515 | 2026-06-26 |
Integrating Machine Learning and Single-Cell Analysis to Reveal the Diagnostic and Therapeutic Value of Regulated Cell Death Mechanisms in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202504703R
PMID:42338358
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研究论文 | 结合机器学习和单细胞分析,揭示调控细胞死亡机制在肝细胞癌中的诊断和治疗价值 | 构建了一个基于调控细胞死亡相关基因的预后模型RCDI,并通过单细胞RNA测序验证其与肿瘤微环境异质性和免疫检查点分子的关联 | NA | 开发有效的预后模型,以准确预测肝细胞癌患者预后并指导靶向治疗决策 | 肝细胞癌患者的多队列转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多队列数据(TCGA, GSE14520, ICGC)和单细胞数据(GSE149614) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 516 | 2026-06-26 |
Macrophage-Mediated Mechanisms of Vascular Remodeling in Arteriovenous Malformations
2026-Jun-25, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323163
PMID:42345097
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在动静脉畸形中通过介导血管重塑的机制,并探讨了其潜在的研究方向 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了动静脉畸形组织中巨噬细胞的异质性及其对内皮细胞信号通路的直接调控作用,为理解巨噬细胞在动静脉畸形病理生理学中的作用提供了新的视角 | 目前对巨噬细胞如何具体参与动静脉畸形起始和进展的机制理解仍不充分,现有证据主要基于临床样本和动物模型,尚缺乏完整的机制解析 | 阐明巨噬细胞在动静脉畸形血管重塑中的介导机制,并指出未来研究方向 | 动静脉畸形病理组织中的巨噬细胞及其与内皮细胞的相互作用 | 机器学习 | 动静脉畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床动静脉畸形样本(具体数量未在摘要中提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 517 | 2026-06-26 |
A cell atlas of the developing human outflow tract of the heart and its adult aortic valve derivatives
2026-Jun-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.107748
PMID:42345287
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研究论文 | 对心脏流出道(OFT)发育过程及其成年主动脉瓣衍生物进行单细胞和空间转录组分析 | 首次在胚胎和胎儿两个时间点以及成年主动脉瓣中提供OFT的全面转录组数据,并利用空间转录组学确定细胞群分布,发现胚胎特征在成人细胞中持续存在,可用于追溯大时间尺度细胞间的关系 | 文中未明确提及研究的局限性 | 定义人类心脏流出道发育及其成年衍生物的细胞和分子特征,以理解先天性心脏缺陷并推动再生医学发展 | 人类心脏流出道(胚胎期和胎儿期)及其成年主动脉瓣衍生物 | 数字病理学 | 先天性心脏缺陷 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 单细胞调控网络推断模型(如SCENIC) | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 人类胚胎期、胎儿期心脏流出道组织样本及成年主动脉瓣样本,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 518 | 2026-06-26 |
Plant Phosphatidylinositol Signalling Network in Cotton Resistance to Verticillium Wilt
2026-Jun-25, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70701
PMID:42347818
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综述 | 本文综述了磷脂酰肌醇信号网络在棉花抗黄萎病中的作用机制 | 系统揭示了棉花中保守的磷脂酰肌醇信号通路如何形成调控网络赋予抗病性,并强调了棉花特有的调控节点如GhPIP5K9a和GhPLDδ酶的作用 | 未提及具体局限性,但可能因主要基于模式植物拟南芥的比较研究,棉花中特定调控节点的功能验证尚不充分 | 阐明磷脂酰肌醇信号通路在棉花抗黄萎病中的调控网络 | 棉花以及模式植物拟南芥 | 机器学习 | 棉花黄萎病 | 磷酸化蛋白质组学、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 519 | 2026-06-26 |
Single-cell RNA sequencing: a powerful tool to study heterogeneity in papillary and anaplastic thyroid carcinoma
2026-Jun-24, European thyroid journal
IF:3.5Q2
DOI:10.1530/ETJ-25-0141
PMID:42340813
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综述 | 综述单细胞RNA测序技术在研究甲状腺乳头状癌和未分化癌异质性中的应用 | 阐述了单细胞RNA测序如何深入揭示甲状腺癌肿瘤内和肿瘤间的细胞异质性,包括癌细胞表型异质性及肿瘤微环境中基质和免疫细胞的变化 | 未明确提及局限性 | 探讨单细胞RNA测序技术在研究甲状腺癌异质性方面的见解 | 甲状腺乳头状癌和未分化癌 | 单细胞转录组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 520 | 2026-06-26 |
Annexin A2 as a Therapeutic Target of Artemisiae Scopariae Herba-derived Quercetin in Preventing Malignant Progression from Primary Sclerosing Cholangitis to Cholangiocarcinoma: An Integrative Study
2026-Jun-24, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.122080
PMID:42341858
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研究论文 | 综合多组学方法揭示茵陈蒿来源槲皮素通过靶向Annexin A2阻止原发性硬化性胆管炎向胆管癌恶性转化的机制 | 首次整合质谱分析、转录组学、机器学习和表面等离子共振技术,系统鉴定茵陈蒿活性成分槲皮素及其靶点ANXA2在胆管癌预防中的作用 | NA | 阐明茵陈蒿在阻止原发性硬化性胆管炎向胆管癌恶性转化中的活性成分和保护机制 | 茵陈蒿活性成分、胆管癌细胞、原发性硬化性胆管炎和胆管癌患者样本 | 机器学习 | 胆管癌 | 质谱分析、转录组分析、单细胞转录组学、表面等离子共振 | 机器学习模型 | 转录组数据、质谱数据、临床样本数据 | 公共数据集及临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |