单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202606-202606] [清除筛选条件]
当前共找到 1083 篇文献,本页显示第 441 - 460 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
441 2026-07-15
Network toxicology and single-cell transcriptomics nominate candidate pyrethroid-associated targets and pathways in clear cell renal cell carcinoma
2026-Jun, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 整合网络毒理学和单细胞转录组学,识别拟除虫菊酯类杀虫剂在透明细胞肾细胞癌中的潜在靶点和通路 首次将网络毒理学、单细胞测序分析和分子对接相结合,系统研究六种常见家用拟除虫菊酯杀虫剂活性成分在透明细胞肾细胞癌发展中的核心靶点和信号通路 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内模型验证和临床样本的进一步确认 阐明拟除虫菊酯类杀虫剂与透明细胞肾细胞癌之间的分子机制 六种常见家用拟除虫菊酯杀虫剂活性成分 计算机视觉 肾细胞癌 网络毒理学,单细胞转录组学,分子对接 机器学习算法 基因表达数据,单细胞转录组数据 GSE36895数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
442 2026-07-15
Multimodal characterisation of spontaneous Merkel cell carcinoma in the endangered Caucasian squirrel (Sciurus anomalus pallescens): integrating spatial transcriptomics, imaging mass cytometry and metagenomic sequencing
2026-Jun, Journal of veterinary research IF:1.3Q2
研究论文 通过对濒危高加索松鼠的自发性Merkel细胞癌进行空间转录组学、成像质谱流式细胞术和宏基因组测序综合分析,揭示了肿瘤的分子特征和微环境 首次对非家养野生动物自发性Merkel细胞癌进行多模态整合分析,包括空间转录组学和成像质谱流式细胞术的高分辨率肿瘤表征 仅基于单个病例,缺乏跨物种比较,且未发现Merkel细胞多瘤病毒证据 探讨濒危高加索松鼠自发性Merkel细胞癌的分子和组织学特征 一只濒危高加索松鼠(Sciurus anomalus pallescens)的皮肤结节 数字病理学 皮肤癌(Merkel细胞癌) 空间转录组学, 成像质谱流式细胞术, 宏基因组测序 NA 空间转录组数据, 质谱成像数据, 宏基因组序列 1个皮肤结节样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组平台
443 2026-07-13
Single-cell profiling reveals CCL5Hi GZMAHi effector memory CD8 T cell association to oligoarticular JIA
2026-Jun-03, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 通过单细胞分析揭示CCL5Hi GZMAHi效应记忆CD8 T细胞与少关节型幼年特发性关节炎(oligo JIA)的关联 首次在单细胞水平上揭示了oligo JIA患者滑液中活化的效应记忆CD8+ T细胞(CD8+TEM)的克隆扩增和细胞毒性特征,并发现这些细胞表达CCL5、GZMA和GNLY,且与葡萄膜炎相关的MAIT细胞克隆扩增和转录重编程 发现队列样本量较小,仅包含3例初治新发oligo JIA患者、4例葡萄膜炎发作患者和4例健康对照;验证队列样本量有限 表征oligo JIA及其关节外表现(葡萄膜炎)的免疫病理机制,鉴定致病细胞群和调控机制 少关节型幼年特发性关节炎(oligo JIA)患者及其葡萄膜炎并发症 单细胞基因组学 幼年特发性关节炎 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序,质谱流式细胞术(CyTOF) NA 单细胞转录组和TCR测序数据,质谱流式细胞术数据 发现队列:14个样本(3例oligo JIA患者的PBMC和配对SF,4例葡萄膜炎患者的PBMC,4例健康对照的PBMC);验证队列:13例oligo JIA患者、8例葡萄膜炎患者和6例健康对照 NA 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序,质谱流式细胞术 NA NA
444 2026-07-13
Defective HNF1A hinders GLI3 processing favoring duodenal versus pancreatic fate, thus leading to intestinal elongation in vivo
2026-06-01, Genes & development IF:7.5Q1
研究论文 揭示HNF1A缺陷通过阻碍GLI3加工促使后肠向十二指肠而非胰腺命运分化,导致体内肠道伸长 首次阐明HNF1A与Hedgehog信号之间的自调节环路,解释其在后肠细胞命运决定中的作用 主要基于体外分化模型和转基因小鼠,缺乏人类疾病直接验证 探索Hedgehog信号控制后肠细胞谱系分离的分子机制 人类诱导多能干细胞分化模型和小鼠转基因模型 分子生物学、发育生物学 糖尿病、胰腺发育相关疾病 批量转录组学、单细胞转录组学、显微镜、生理学、遗传细胞追踪 NA 转录组数据、图像数据 人类诱导多能干细胞和转基因小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA NA
445 2026-07-13
A Dynamic Change of Microglial States Occurs During the Transition From Photoreceptor Degeneration to Regeneration in Zebrafish pde6c Mutants
2026-06, Glia IF:5.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示了斑马鱼pde6c突变体中视网膜小胶质细胞从感光细胞退行到再生过程中的动态状态变化 首次描绘了斑马鱼视网膜小胶质细胞在慢性感光细胞退行和Müller胶质细胞介导的神经元再生过程中的转录组异质性和动态变化,并发现了退行反应簇表达神经保护和组织修复基因 未提及研究的方法学局限性或适用范围限制;可能仅限于斑马鱼模型,未在人类或其他哺乳动物中进行验证 理解小胶质细胞功能状态在神经元退行和再生过程中的调控机制 斑马鱼pde6c突变体视网膜中的小胶质细胞 数字病理学 视网膜退行性疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 野生型同胞和pde6c突变体的视网膜样本,分别于5 dpf(感光细胞退行起始)和4 wpf(Müller胶质细胞介导的再生阶段)采集 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
446 2026-07-10
IL-17-driven tumor cell-intrinsic inflammatory programming creates an immunotherapy-permissive microenvironment
2026-Jun-30, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究揭示了IL-17驱动的肿瘤细胞内在炎症编程可创造免疫治疗允许的微环境,尤其在卵巢透明细胞癌中 首次阐明IL-17通过激活NF-κB依赖性炎症程序增强肿瘤免疫微环境对免疫检查点抑制剂的敏感性 主要基于小鼠模型和有限的人类样本,IL-17响应性肿瘤细胞炎症编程的临床转化潜力需进一步验证 探索IL-17驱动的肿瘤细胞内在炎症编程在卵巢透明细胞癌免疫治疗响应中的作用机制 卵巢透明细胞癌患者样本及同源小鼠模型 机器学习 卵巢癌 单细胞RNA测序、免疫组化、转录组分析 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据 180例人类样本及小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序平台
447 2026-07-10
Advancements in diagnosis and treatments of acute leukemia
2026-Jun-30, Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
评论 总结急性白血病在微小残留病灶指导的精准分层、靶向治疗、细胞免疫治疗和异基因造血干细胞移植方面的里程碑式进展,并讨论未解决的临床瓶颈和未来方向 将MRD从预后指标升级为风险分层的核心决策因素,并系统总结LSC导向的MRD检测、单细胞测序等技术创新在提高监测灵敏度方面的作用 仍面临抗原逃逸、CAR-T细胞持久性、移植物抗宿主病和治疗可及性等挑战 总结急性白血病诊断和治疗的最新进展,提出未来改善治愈率和长期生存的方向 急性白血病患者,包括复发/难治性和老年患者 自然语言处理 急性白血病 单细胞测序, 数字PCR NA 文本 NA NA NA NA NA
448 2026-07-10
Diosgenin alleviates radiation nephropathy by suppressing renal mTORC1 signalling with concomitant effects on the gut and liver
2026-Jun-29, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 该研究通过整合单细胞转录组学、网络药理学和体内验证,揭示薯蓣皂苷通过抑制mTORC1信号通路减轻放射性肾病的机制,并伴随对肠道和肝脏的调节作用 首次利用单细胞转录组学解析放射性肾病中肾小管细胞和免疫细胞的mTORC1激活模式,并结合网络药理学和分子动力学模拟阐明薯蓣皂苷与mTOR的高亲和力结合,建立多组学框架揭示药物对肠道-肝脏轴的协同效应 未提及具体局限性,但可能包括小鼠模型与人类差异、辐射暴露方式的临床可比性以及长期疗效和安全性数据缺失 阐明薯蓣皂苷减轻放射性肾病的分子机制及其对肠道和肝脏的系统性影响 全身照射小鼠模型 数字病理学 放射性疾病(放射性肾病) 单细胞转录组学(scRNA-seq)、网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、体内验证 mTORC1信号通路靶点分析 基因表达数据、蛋白质结构数据、组织病理学数据 小鼠模型,具体样本量未在摘要中明确给出 NA 单细胞RNA测序 NA NA
449 2026-07-10
Comparative Transcriptional Profiling of Key Macrophage and Fibroblast Subpopulations in Rheumatoid Arthritis-Associated Lung Disease
2026-Jun-22, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 利用Flex单细胞RNA测序比较类风湿关节炎相关肺病中关键巨噬细胞和成纤维细胞亚群的转录谱 首次使用探针基础的Flex单细胞RNA测序对固定肺组织标本进行转录组分析,比较RA-ILD与RA肺结节中巨噬细胞和成纤维细胞的基因表达差异,并揭示与IPF的转录重叠 标题和摘要未明确提及研究局限性,样本量较小(对照组4例,RA-ILD组9例,RA结节组3例) 通过转录组分析评估不同类风湿肺病中细胞特异性基因表达和通路激活,比较RA-ILD与RA肺结节及IPF的差异 固定肺组织标本中的巨噬细胞和成纤维细胞亚群 数字病理学 类风湿关节炎、间质性肺病、肺结节、特发性肺纤维化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 4名无疾病对照、9名RA-ILD患者、3名RA结节患者的肺标本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium Flex 探针基础的Flex单细胞RNA测序(scRNA-seq)处理固定肺组织标本
450 2026-07-10
Pathway-centric visualization of cell-cell communication in single-cell transcriptomics data
2026-06-20, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 开发了scVizComm,一个用于交互式可视化单细胞转录组数据中细胞间通信的Web门户 提供了一个非编程的交互式可视化平台,并能够整合分子通路信息以优先分析细胞间通信中的下游受体信号 依赖于预计算的结果,可能无法实时分析新数据集 实现单细胞转录组数据中细胞间通信的途径中心化可视化 人类肾脏和心脏单核转录组数据,以及小鼠前脑数据 数字病理学 纤维化相关疾病 单核RNA测序 NA 基因表达数据 人类肾脏和心脏组织样本,以及小鼠前脑样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单核RNA测序数据
451 2026-07-10
JMJD3-driven epigenetic reprogramming of p16INK4a-positive cells promotes tendon regeneration
2026-06-11, Bone research IF:14.3Q1
研究论文 研究表明损伤诱导的p16阳性细胞通过JMJD3驱动的表观遗传重编程促进肌腱再生 首次揭示p16阳性细胞在肌腱再生中的有益作用及其依赖JMJD3的表观遗传机制,挑战了p16仅为衰老标志的传统认知 主要基于小鼠模型,缺乏人体组织验证;具体信号通路上下游调控细节未完全阐明 阐明p16阳性细胞在肌腱再生中的细胞身份和功能贡献 小鼠跟腱损伤模型中的p16阳性细胞 数字病理学 肌腱损伤 单细胞RNA测序, 原位免疫染色, 组蛋白去甲基化酶活性分析 NA 基因表达数据, 组织图像 小鼠跟腱损伤模型(具体样本量未明确提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
452 2026-07-10
circVDJ-seq for T cell clonotype detection in single-cell and spatial multi-omics
2026-06-10, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 介绍circVDJ-seq技术,用于从3'导向的单细胞和空间多组学工作流程中简化且高效地检测T细胞克隆型 circVDJ-seq提供了一种简化且经济高效的T细胞受体分析方法,可从单细胞RNA测序、ATAC+RNA多组学和空间转录组学等3'导向工作流中获取VDJ信息,无需特殊测序设备 NA 开发并验证一种可兼容多种3'导向单细胞和空间组学技术的T细胞克隆型检测方法 新鲜切除的神经母细胞瘤组织和受肺炎或COVID-19影响的死后淋巴结组织中的T细胞 machine learning 肿瘤学, 传染病学 circVDJ-seq NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、多组学数据 新鲜切除的神经母细胞瘤组织样本和死后淋巴结样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 多组学 10x Chromium NA
453 2026-07-10
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity and immune microenvironment in lymphatic metastasis of head and neck squamous cell carcinoma
2026-06, Genes and immunity IF:5.0Q2
研究论文 通过单细胞转录组学分析揭示了头颈部鳞状细胞癌淋巴转移中的异质性和免疫微环境 首次对头颈部鳞状细胞癌的淋巴结转移组织和正常淋巴结组织进行单细胞RNA测序比较分析,识别出与肿瘤发生和转移相关的特定细胞亚群,并构建了基于INHBA、SFRP2、SPP1和IFI27表达的预后模型 样本量较小(7个转移组织和5个非转移组织),可能限制了发现的普适性和统计效力 探究头颈部鳞状细胞癌淋巴转移过程中的细胞异质性和免疫微环境特征 头颈部鳞状细胞癌患者的淋巴结转移组织和正常淋巴结组织 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 7个淋巴结转移组织样本和5个非转移组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
454 2026-07-10
Single-cell mapping of peripheral immune dynamics in pregnant women after Moderna mRNA COVID-19 vaccination
2026-06, Genes and immunity IF:5.0Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序描绘孕妇接种Moderna mRNA COVID-19疫苗后外周免疫动态变化 首次在单细胞水平纵向解析孕妇接种mRNA疫苗后的免疫动态,发现妊娠驱动的免疫调节适应性,包括适度的先天性免疫激活、协调的T细胞反应和延迟的B细胞应答 样本量有限(仅3名孕妇),限制了对普遍性的推断 阐明孕妇接种mRNA COVID-19疫苗后外周免疫反应的动态变化及妊娠相关的免疫调节机制 孕妇的外周血单核细胞(PBMCs) 单细胞测序 COVID-19, 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 3名孕妇,每个样本在4个时间点采集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
455 2026-07-09
Immunomodulatory strategies and targeted delivery systems in atherosclerosis therapy
2026-Jun, Expert opinion on drug delivery IF:5.0Q1
综述 综述了动脉粥样硬化免疫病理学及靶向纳米药物的研究进展 从广谱免疫抑制转向亚群特异性精准干预,并采用智能仿生纳米递送系统实现时空精准调控 斑块穿透性不足、肝脏纳米载体蓄积以及系统性免疫抑制风险等挑战尚未解决 探讨动脉粥样硬化的免疫调节策略及靶向递送系统 动脉粥样硬化免疫病理机制和纳米药物递送平台 自然语言处理 心血管疾病 NA NA 文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
456 2026-07-08
Transcriptomic-based molecular classification of ampullary adenocarcinoma
2026-Jun-30, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 通过整合批量RNA测序、单细胞RNA测序和临床病理数据,对壶腹部腺癌进行基于转录组的分子分型,并提出了新型分子分类系统AMS 首次提出基于转录组的壶腹部腺癌分子分类系统AMS,将患者分为预后不同的两个亚型,并鉴定MUC16作为潜在生物标志物和治疗靶点 信息不足,无法提取具体局限性 建立壶腹部腺癌的分子分类框架,揭示肿瘤微环境异质性,并推动精准肿瘤学发展 壶腹部腺癌患者肿瘤样本、细胞系及异种移植模型 机器学习和数字病理学 壶腹部腺癌 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、临床数据 NA NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
457 2026-07-08
An Integrated Approach Reveals the Pre-Osteoblast-Driven Metrnl Synergizes With Circadian Genes to Inhibit Osteogenesis
2026-Jun-24, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 通过整合临床样本、蛋白质组学、单细胞RNA测序和基因敲除小鼠模型,揭示Metrnl通过Rack1-PKCα-Bmal1-Cry2信号轴抑制骨形成的机制 首次发现Metrnl作为骨形成负调控因子,阐明其通过细胞内Rack1相互作用影响昼夜节律基因表达调控成骨分化的全新机制 未提供具体局限性描述,但推论在于研究的样本量有限(每组6只小鼠),临床关联仅基于绝经后女性骨髓样本,可能需更广泛的验证 系统研究Metrnl在骨骼生物学中的表达谱、生理功能和分子机制,为骨质疏松促合成疗法提供新靶点 绝经后骨质疏松女性骨髓标本、小鼠(全身敲除和条件性敲除模型)及成骨前体细胞 机器学习 骨质疏松症 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, Micro-CT, 骨组织形态计量学, 免疫共沉淀, 转录活性测定 NA 基因表达数据, 蛋白质互作数据, 影像数据 临床骨髓标本(未明确数量)、小鼠每组6只 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
458 2026-07-08
Identification of the Mitochondrial Gene NME6 as an Immune Modulator in Heart Failure
2026-Jun-24, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 本研究通过功能富集分析、单细胞RNA测序及小鼠模型,发现线粒体基因NME6作为免疫调节因子在心力衰竭中起关键作用 首次鉴定NME6作为心力衰竭中连接线粒体功能与免疫调节的关键基因,并证实其敲低可改善心功能及免疫细胞亚群比例 研究主要基于小鼠模型和公开数据集,缺乏大规模临床验证及NME6具体分子机制的深入解析 探索心力衰竭中与线粒体功能障碍和免疫失调相关的关键基因及分子机制 心力衰竭相关差异表达基因,特别是线粒体基因NME6 机器学习 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 GSE145154单细胞RNA测序数据集及横向主动脉缩窄诱导的心力衰竭小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
459 2026-07-08
The macrophage PELI1-JAK2/STAT3-secretome axis: a potential target for ameliorating septic inflammation and coagulation dysfunction
2026-06-23, Acta biochimica et biophysica Sinica IF:3.3Q1
研究论文 研究巨噬细胞PELI1通过JAK2/STAT3信号通路调控分泌组在脓毒症炎症和凝血功能障碍中的作用 首次揭示PELI1通过JAK2/STAT3通路调控巨噬细胞分泌组,从而影响脓毒症炎症和凝血功能障碍,并验证了PELI1-分泌组轴作为潜在治疗靶点的可能性 主要基于小鼠模型和体外实验,结论向临床转化需进一步验证 探究巨噬细胞PELI1在脓毒症诱导的炎症和凝血功能障碍中的调控机制 脓毒症患者单核细胞、小鼠脓毒症模型、RAW264.7巨噬细胞 机器学 脓毒症 单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blotting、ELISA、H&E染色、免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据 公开脓毒症患者单细胞RNA-seq数据集及小鼠模型(具体样本量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
460 2026-07-08
Targeting fibrillin-1 disrupts the fibrogenic niche formation and ameliorates kidney fibrosis
2026-Jun-22, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究揭示了纤维蛋白-1(FBN1)在肾纤维化微环境中的核心作用,并通过破坏FBN1-EGFR相互作用找到潜在治疗策略 首次阐明FBN1作为纤维化微环境核心结构成分,通过结合成纤维细胞EGFR激活MAPK信号促进肾纤维化,并发现fucosterol能有效阻断该相互作用 未说明 阐明FBN1在肾纤维化微环境中调控成纤维细胞增殖和激活的机制,并评估靶向破坏FBN1-EGFR相互作用作为治疗策略 肾纤维化小鼠模型、去细胞化肾支架、NRK-49F细胞、原代肾成纤维细胞 计算机视觉 肾脏疾病 空间转录组学、免疫共沉淀、RNA测序、基因敲除模型、高通量筛选 NA 空间转录组数据、测序数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
回到顶部