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当前共找到 1083 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-07-30 |
Identifying clinically relevant cell state interactions in the tumor microenvironment of IDH-mutant gliomas using CSI-TME
2026-Jun, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-026-00201-0
PMID:41807578
|
研究论文 | 提出了CSI-TME计算框架，用于从批量转录组数据推断IDH突变胶质瘤肿瘤微环境中的细胞状态相互作用 | 将基因相互作用概念（如合成致死）扩展到细胞状态，直接利用大规模批量转录组数据集推断预后相关的细胞状态互作 | 缺乏具有临床信息的单细胞RNA测序队列，且批量RNA测序队列缺少细胞背景 | 系统表征IDH突变胶质瘤肿瘤微环境中的功能细胞状态相互作用 | IDH突变胶质瘤患者肿瘤微环境中的恶性细胞和免疫细胞状态 | 机器学习 | 胶质瘤 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | 批量转录组数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 多个批量转录组数据集队列 | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq、spatial transcriptomics | NA | NA |
| 382 | 2026-07-28 |
CXCL8 producing macrophages shape gastric cancer outcomes
2026-Jun-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05452-9
PMID:42307886
|
研究论文 | 构建基于六种趋化因子的预后模型，揭示CXCL8阳性巨噬细胞在胃癌肿瘤微环境中的关键作用 | 首次通过整合转录组数据与单细胞RNA测序，建立趋化因子相关预后模型，并明确CXCL8阳性巨噬细胞作为肿瘤微环境通信枢纽的促肿瘤表型 | 预后模型的C-index仅为0.680，预测准确性有限；未在独立大样本队列中验证CXCL8-巨噬细胞轴的治疗靶向潜力 | 开发基于趋化因子的胃癌预后标志物并阐明其细胞机制 | 胃癌患者肿瘤组织的转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 胃癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归 | 转录组数据，单细胞转录组数据 | TCGA和GEO队列的胃癌患者样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 383 | 2026-07-28 |
GATHeR: graph-based accurate tool for immunoglobulin heavy- and light-chain reconstruction
2026-Jun-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74272-w
PMID:42270654
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研究论文 | 提出GATHeR工具，从单细胞RNA测序数据中准确重建免疫球蛋白重链和轻链序列，并扩展到恒定区，提高对亚型、亚类和等位基因的分辨率 | 首次实现了从scRNA-seq数据中准确重建全长配对的BCR序列，并扩展到恒定区，包括跨膜片段和胞质尾区，从而区分表面BCR与分泌抗体，同时支持检测剪接变异 | 未明确说明局限性，但可能受限于scRNA-seq中免疫球蛋白转录本稀疏的问题，尤其在初始和记忆B细胞中 | 开发一种准确、开放获取的工具，用于从单细胞RNA测序数据中恢复全长配对的B细胞受体序列，并扩展分析能力至恒定区、亚型、亚类和等位基因水平 | B细胞受体重链和轻链序列，特别是初始和记忆B细胞中的免疫球蛋白转录本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 序列数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 支持Smart-seq2/3和10x Genomics文库 |
| 384 | 2026-07-28 |
Development and validation of a cuproptosis-immune prognostic signature for risk stratification and personalized therapy in cutaneous melanoma
2026-Jun-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05396-0
PMID:42262432
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研究论文 | 开发并验证了一种铜死亡-免疫相关预后标志，用于皮肤黑色素瘤的风险分层和个性化治疗 | 首次将铜死亡与免疫相关基因结合构建预后模型，并利用单细胞RNA测序验证关键基因XCL2的功能 | 研究基于TCGA和GTEx数据库，缺乏独立外部验证队列；功能实验仅针对XCL2基因，其他模型基因的机制尚待探索 | 构建铜死亡-免疫相关基因特征以预测皮肤黑色素瘤预后并指导治疗 | 皮肤黑色素瘤患者 | 机器学习 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型, LASSO回归模型 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | TCGA数据库中的SKCM样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序用于分析模型基因的细胞分布 |
| 385 | 2026-07-28 |
Mycobacterium tuberculosis IDH-PPARγ interaction suppresses GPX4 to drive macrophage ferroptosis and sustain persistent infection
2026-Jun-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74032-w
PMID:42259813
|
研究论文 | 结核分枝杆菌通过IDH-PPARγ相互作用抑制GPX4，诱导巨噬细胞铁死亡并维持持续感染 | 首次揭示结核分枝杆菌通过IDH与PPARγ相互作用来抑制GPX4表达，从而诱导巨噬细胞铁死亡的新机制 | NA | 探究结核分枝杆菌如何操纵巨噬细胞脂质代谢诱导脂质过氧化和铁死亡以维持细菌持续感染 | 结核分枝杆菌感染的巨噬细胞和小鼠模型 | NA | 结核病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 386 | 2026-07-28 |
Integrative genomic analysis of 21 orofacial diseases identifies shared genetic architecture with systemic diseases
2026-Jun-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73925-0
PMID:42243103
|
研究论文 | 通过对UK Biobank中21种口面疾病的整合基因组分析，识别了48个新位点和160个推定因果基因，揭示了口面疾病与全身性疾病之间的共享遗传结构 | 首次对多种口面疾病进行系统性的多组学整合分析（全基因组、转录组、罕见变异关联研究和孟德尔随机化），并利用CRISPR-Cas9和单细胞RNA测序验证了关键基因的功能机制 | 主要基于UK Biobank人群数据，可能限制了结果向其他人群的泛化性；部分因果关系证据尚不充分 | 解析口面疾病的遗传结构及其与全身性疾病的因果关系 | 21种口面疾病（包括牙周炎、龋齿、干燥综合征等）及多种全身性疾病（如肺癌、中风） | 机器学习 | 全身性疾病 | 全基因组关联研究（GWAS）、转录组关联研究（TWAS）、罕见变异关联研究、孟德尔随机化、CRISPR-Cas9编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因型数据、转录组数据 | UK Biobank数据集（具体样本量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 387 | 2026-07-27 |
Generation of Blood Vascular Endothelial-Neural 3D Organoids by Serial Induction of Differentiation on Human iPSC-Derived Embryoid Bodies
2026-Jun-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15131192
PMID:42439668
|
研究论文 | 通过系列诱导分化在人iPSC来源的拟胚体上生成包含血管内皮细胞和神经细胞的3D类器官 | 首次在体外构建同时含有血管内皮细胞和神经细胞的3D脑类器官，无需移植或外源添加内皮细胞，且能模拟血管生成与神经发生的发育相互作用 | 未提及，但从内容推断可能缺乏对类器官长期稳定性和功能验证的详细讨论 | 构建模拟人脑神经和血管内皮细胞发育的3D类器官，用于研究脑发育和神经感染性疾病 | 人iPSC来源的拟胚体及其分化形成的3D类器官 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序、RNA测序、siRNA处理 | 3D类器官模型 | 基因表达数据 | NA（基于iPSC来源的类器官，未提及具体样本数量） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 388 | 2026-07-27 |
Immunothrombotic Cell-Cell Communication Networks in Coronary Atherosclerosis: Critical Insights from Single-Cell and Spatial Systems Biology
2026-Jun-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27135900
PMID:42450168
|
综述 | 批判性评估整合单细胞RNA测序、空间转录组学和配体-受体建模的研究，以表征冠状动脉疾病中驱动免疫血栓形成的细胞间通讯网络 | 强调免疫血栓形成应被解释为空间组织化细胞网络的涌现特性，而非统一的炎症状态，并聚焦于离散细胞生态位中的细胞间通讯 | 转录状态是否为因果驱动因素或附带现象尚不明确；许多见解来自小鼠模型或解离组织，存在转化相关性和空间背景丢失的问题；细胞间通讯的计算推断仍是间接的，需要功能验证 | 研究冠状动脉疾病中免疫血栓形成的细胞间通讯网络 | 冠状动脉疾病相关的细胞间通讯网络 | 机器学习 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，配体-受体建模 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 389 | 2026-07-27 |
Glutathione metabolism-linked ferroptosis in human seminoma: a spatial multi-omics mapping study
2026-Jun-29, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104284
PMID:42385389
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研究论文 | 通过空间多组学分析揭示人精原细胞瘤中谷胱甘肽代谢与铁死亡的关系 | 首次整合空间转录组学和空间代谢组学技术，系统描绘精原细胞瘤的分子异质性和代谢重编程，并验证谷胱甘肽代谢作为铁死亡关键调控通路 | 仅使用4例患者的冷冻组织样本，且功能验证仅在单一细胞系和异种移植小鼠中进行 | 阐明精原细胞瘤的分子机制，探索靶向谷胱甘肽代谢诱导铁死亡的治疗策略 | 精原细胞瘤的新鲜冷冻组织及TCam-2细胞系 | 空间多组学 | 睾丸癌（精原细胞瘤） | 空间转录组学、空间代谢组学、RNA-seq | NA | 基因表达数据及代谢物数据 | 4例患者的新鲜冷冻精原细胞瘤组织 | MA | 空间转录组学、空间代谢组学 | NA | NA |
| 390 | 2026-07-27 |
Co-Option and Conflict: The Deep Evolutionary History of ZP-Domain Proteins from ECMs to Species Barriers
2026-Jun-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27135866
PMID:42450137
|
综述 | 探讨ZP结构域蛋白从细胞外基质到物种隔离的深层进化历史 | 系统综合了ZP结构域蛋白在从后生动物早期到脊椎动物中的进化轨迹，强调了其模块化进化和功能转变，揭示了ZP结构域蛋白作为后生动物胞外基质的基础元件，通过基因复制、新功能化和选择适应生殖模式演化 | 主要空白包括脊椎动物和无脊椎动物ZP基因之间未解决的直系同源关系、糖链与蛋白主链在精子识别中的相对贡献，以及昆虫中缺乏典型ZP结构域蛋白功能证据 | 阐明ZP结构域蛋白在从细胞外基质到物种隔离过程中的深层进化历史及其功能转变 | 后生动物中ZP结构域蛋白的进化及其功能，包括脊椎动物和无脊椎动物（如鲍鱼、昆虫） | 进化生物学 | NA | 系统发育分析 | NA | 序列数据 | 97个后生动物物种 | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2026-07-27 |
Integrating Single-Cell, Bulk, and Spatial Transcriptomics Unveils a Novel Ribosome Biogenesis-Related Prognostic Model and Defines RPS19BP1 as a Pro-Oncogenic Regulator in Lung Adenocarcinoma
2026-Jun-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27135864
PMID:42450135
|
研究论文 | 整合单细胞、批量与空间转录组学数据，构建核糖体生物合成相关预后模型并验证RPS19BP1在肺腺癌中的促癌调控作用 | 首次通过多组学整合分析建立核糖体生物合成相关基因的预后风险模型，并揭示RPS19BP1在肺腺癌中的促癌功能及与肿瘤免疫微环境的相关性 | 基于回顾性队列验证，缺乏前瞻性研究确认；计算推断的免疫治疗反应需进一步实验验证 | 构建肺腺癌核糖体生物合成相关预后模型并探索其与肿瘤免疫微环境的关联 | 肺腺癌患者样本及LUAD细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Cox回归, LASSO回归, 多元Cox分析 | 基因表达数据 | TCGA、GSE68571、GSE8894三个队列 | Illumina | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 392 | 2026-07-27 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Lactylation Modifications in Neuroblastoma and the Construction of a Prognostic Model
2026-Jun-29, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31132280
PMID:42451648
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示神经母细胞瘤中乳酸化修饰的预后意义，并构建了一个14基因预后模型 | 首次利用单细胞RNA测序数据系统分析神经母细胞瘤中乳酸化修饰的活性，并基于差异表达基因构建了具有临床实用性的预后模型 | 未在更大规模或不同人群的独立外部队列中验证模型的泛化能力，且模型基因的功能机制尚未通过实验验证 | 探究乳酸化相关基因在神经母细胞瘤中的预后意义，并构建预后模型以改善患者风险分层和指导靶向治疗 | 神经母细胞瘤肿瘤细胞 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | Cox回归和LASSO回归 | 单细胞RNA测序数据及基因表达矩阵 | 训练队列（GSE49710的349例）、内部验证队列（GSE49710的149例）和外部验证队列（E-MTAB-8248的223例），涉及共计721例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 393 | 2026-07-27 |
Integrating Multi-View Features via Deep Generalized Canonical Correlation Analysis for Single-Cell Clustering
2026-Jun-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27135819
PMID:42450091
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研究论文 | 提出深度广义典型相关分析框架融合PCA、UMAP和PHATE多视图特征，用于单细胞聚类 | 通过深度自编码器扩展广义典型相关分析，将三种降维方法的互补特征（全局线性结构、拓扑局部邻域、细胞分化渐变轨迹）投影到统一子空间并进行聚类 | 仅在两个模拟和三个真实单细胞数据集上验证，未探讨更大规模或不同类型数据的适用性 | 融合多视图特征提高单细胞RNA测序数据的聚类精度，并增强生物学可解释性 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度自编码器、广义典型相关分析 | 单细胞基因表达数据 | 两个模拟数据集和三个真实单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 394 | 2026-07-27 |
Recent Advances in Histone Methylation in Plant Adaptation to Salinity
2026-Jun-26, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15131970
PMID:42452177
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综述 | 总结组蛋白甲基化在植物适应盐胁迫中的最新进展，包括动态变化、应激记忆和技术应用 | 结合单细胞表观基因组学、CUT&RUN、CUT&Tag和空间转录组学等前沿技术，评估其未来研究重点，并探索CRISPR/dCas9表观基因组编辑和表观遗传育种在提高作物耐盐性中的应用 | 主要基于现有文献综述，未提供新的实验数据或系统性验证 | 综述组蛋白甲基化在植物盐胁迫适应中的分子机制及最新技术进展 | 植物中组蛋白甲基化修饰（如H3K4me3、H3K36me3、H3K9me2、H3K27me3）及其相关调控蛋白 | 机器学习 | NA | 单细胞表观基因组学, CUT&RUN, CUT&Tag, 空间转录组学, CRISPR/dCas9表观基因组编辑 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞表观基因组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 395 | 2026-07-27 |
FOXP2+ Chief Cells and CXCL14+ Fibroblasts Drive Fibrotic Remodeling in Carotid Body Tumors
2026-Jun-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27135750
PMID:42450023
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了FOXP2+主细胞和CXCL14+成纤维细胞在颈动脉体瘤纤维化重塑中的驱动作用 | 首次构建了颈动脉体瘤纤维化的高分辨率单细胞图谱，识别出FOXP2+主细胞作为基质重塑的启动者，CXCL14+成纤维细胞作为主要的细胞外基质产生效应细胞 | 样本量较小（仅三个纤维化和三个非纤维化样本），且未进行功能验证实验以确认FOXP2和CXCL14的治疗潜力 | 探究颈动脉体瘤纤维化进展的细胞机制 | 颈动脉体瘤组织样本中的细胞 | 单细胞组学 | 颈动脉体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例样本（3例纤维化颈动脉体瘤，3例非纤维化颈动脉体瘤），共64,944个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 396 | 2026-07-27 |
Statistical Methods for Detecting Nonlinear Relationships in Gene Expression and Omics Data: A Review
2026-Jun-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27135700
PMID:42449972
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综述 | 综述检测基因表达和组学数据中非线性关系的统计方法 | 将非线性方法系统归类为信息论、基于秩、基于核、基于距离、基于Copula和基于聚类六大类，并比较其统计行为、优缺点和典型失效模式 | 未提供定量性能基准测试，且依赖已发表文献的比较可能因实验条件不同而不一致 | 为组学数据中非线性依赖关系的分析方法选择提供基于场景的指导 | 检测非线性关系的统计方法及其在转录组学、网络推断和功能基因组学中的应用 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 397 | 2026-07-27 |
Tumor Microenvironment Hijacks and Accelerates a Physiological Myeloid Senescence Signature Associated with Pan-Cancer Immunosuppression and Prognostic Stratification
2026-Jun-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27135688
PMID:42449961
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研究论文 | 通过整合生理性衰老组织和泛癌单细胞数据集，揭示肿瘤微环境劫持并加速生理性髓系衰老信号，该信号与泛癌免疫抑制和预后分层相关 | 首次系统整合17个生理性衰老组织的转录组谱与泛癌单细胞数据集，发现恶性细胞通过MIF-CD74信号轴触发核心髓系亚群Mac_DAB2的衰老，并基于共享的髓系分化程序定义了髓系衰老相关基因（MSAG）特征 | NA | 阐明肿瘤微环境驱动髓系衰老的机制，并建立泛癌预后工具 | 生理性衰老组织（17种）和泛癌单细胞数据集（9种癌症类型，206个样本）中的髓系细胞 | 机器学习 | 泛癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 集成机器学习框架（117种算法） | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 206个样本，涵盖9种癌症类型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 398 | 2026-07-27 |
Effect of Anti-Müllerian Hormone on Oocytes In Vitro Maturation in Sheep
2026-Jun-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27135701
PMID:42449976
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研究论文 | 探究抗苗勒氏管激素（AMH）对绵羊卵母细胞体外成熟的影响及其分子机制 | 首次利用Smart-seq2单细胞RNA测序揭示AMH调控绵羊卵母细胞成熟的潜在信号通路，包括p53、MAPK、PI3K-Akt和TGF-beta等 | 仅基于两个时间点（12小时和24小时）的转录组数据，未涉及其他关键生物学过程 | 阐明AMH在绵羊卵母细胞体外成熟中的调控作用 | 绵羊卵母细胞 | 机器学习 | 其他 | Smart-seq2单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 共检测到741个差异表达基因（FSH_12h与AMH_12h组）和746个差异表达基因（FSH_24h与A+F组） | Illumina | 单细胞RNA测序 | Smart-seq2 | Smart-seq2单细胞RNA测序平台 |
| 399 | 2026-07-27 |
Efficient Synthesis of Glucovanillin and Elucidation of Its Molecular Mechanisms in Ameliorating T2DM via Core Target Modulation and α-Glucosidase Inhibition
2026-Jun-24, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31132228
PMID:42451599
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研究论文 | 本研究关注UGT109A1介导的葡糖香兰素的合成及其通过核心靶点调控和α-葡萄糖苷酶抑制改善2型糖尿病的分子机制 | 首次通过UGT109A1合成葡糖香兰素，并整合网络药理学、机器学习算法和单细胞转录组学揭示其抗2型糖尿病的双重机制 | 未明确提及研究局限性 | 探究葡糖香兰素对2型糖尿病的改善作用及其分子机制 | 葡糖香兰素、核心靶点SLC5A1和ADK、α-葡萄糖苷酶 | 机器学习 | 2型糖尿病 | UGT109A1介导的糖基化 | LASSO、SVM-RFE | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 140个潜在靶点，7个关键靶点 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 400 | 2026-07-27 |
Comparative Study of Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Data from Metastatic Bone Marrow Neuroblastoma Samples
2026-Jun-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15131139
PMID:42439616
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和 bulk RNA测序分析转移性骨髓神经母细胞瘤样本的细胞异质性 | 首次在单细胞分辨率下比较转移性骨髓神经母细胞瘤的单细胞与 bulk RNA测序数据，鉴定出新的肿瘤细胞抗原候选物CNTFR和CHRNA3 | 研究仅基于初诊时的转移性骨髓样本，可能无法反映疾病进展或治疗后的变化 | 探究神经母细胞瘤骨髓转移的细胞异质性和免疫微环境调控 | 转移性骨髓神经母细胞瘤样本 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | 转录组数据 | 初诊时的转移性骨髓样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |