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当前共找到 956 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-06-23 |
Resolving sensitivity, specificity and signal contamination in Xenium spatial transcriptomics
2026-Jun, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03089-8
PMID:42062553
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研究论文 | 对Xenium空间转录组技术的敏感性、特异性和信号污染进行系统分析，并介绍一种信号净化方法SPLIT | 首次全面分析Xenium数据的技术噪声来源和性能特点，提出SPLIT方法解决信号污染问题并揭示T细胞耗竭特征与恶性细胞共定位的关联 | 文本未明确说明局限性，但可能包括数据集仅涵盖乳腺和肺肿瘤样本，以及方法仍需在更广泛组织类型中验证 | 评估Xenium空间转录组技术的性能特征并开发信号净化方法 | Xenium平台生成的40多个乳腺和肺肿瘤组织切片的空间转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌、肺癌 | 空间转录组学、单核RNA测序 | 不适用 | 空间基因表达数据 | 超过40个乳腺癌和肺癌组织切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组平台，使用多种基因组合 |
| 382 | 2026-06-23 |
Predicting gene-specific regulation with transcriptomic and epigenetic single-cell data
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag299
PMID:42143610
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研究论文 | 提出MetaFR方法，利用单细胞ATAC-seq和RNA-seq数据预测基因特异性调控 | MetaFR通过高效回归树学习基因特异性模型，将染色质开放性与基因表达关联，并在元细胞级别实现优于单细胞级别的预测性能 | 具体局限性未在标题和摘要中提及 | 利用单细胞表观遗传和转录组数据预测基因表达调控 | 单细胞ATAC-seq和RNA-seq数据中的基因调控关系 | 机器学习 | 未指定疾病 | 单细胞ATAC-seq，单细胞RNA-seq | 回归树 | 单细胞数据 | 未具体说明样本数量 | NA | 单细胞ATAC-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 383 | 2026-06-23 |
Genomics-informed approach identifies which cell types regulate the metabolome
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag330
PMID:42213079
|
研究论文 | 利用基因组学方法整合大规模代谢物数量性状位点数据集和单细胞RNA测序资源，识别调控代谢组的细胞类型 | 整合了最大的代谢物数量性状位点数据集（TOPMed和UK Biobank）和最全面的单细胞RNA测序资源（Tabula Sapiens），采用多基因方法揭示新型代谢物-细胞类型关联，如苯丙酸与β细胞的关联 | NA | 确定调控代谢物水平的细胞类型 | 人体代谢物和细胞类型 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 384 | 2026-06-05 |
Network methods for diagonal integration of unpaired single-cell multiomics data: a review
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag353
PMID:42234838
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综述 | 综述了用于非配对单细胞多组学数据对角集成的网络方法，涵盖从转录组学骨架构建到跨模态整合的完整计算流程 | 首次聚焦于非配对单细胞蛋白质组学数据的对角集成挑战，系统总结了生成式蛋白质组翻译、归纳先验嵌入和基于扰动的因果基准测试三大未来发展方向 | 未提供新的软件或算法实现，基准资源表仅作为补充材料提供 | 综述用于非配对单细胞多组学数据（特别是scMS与单细胞转录组）对角集成的网络方法 | 非配对的单细胞转录组与蛋白质组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞质谱法 | 图神经网络, 生成模型, 概率图模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 385 | 2026-06-23 |
Basal gland localization and focal distribution of OLFM4-expressing cells in increasing severity of gastric intestinal metaplasia
2026-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.14.725297
PMID:42239144
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研究论文 | 本研究通过多重免疫荧光和全切片图像分析，评估OLFM4表达细胞在胃肠化生加重过程中的基底腺定位和局灶分布 | 首次系统描绘OLFM4表达细胞在胃黏膜肠化生组织中的空间分布特征，揭示其从腺体基底到表面的表达梯度以及与化生严重程度的强相关性 | 样本量相对有限（100个组织活检），且未进行功能性验证实验来证实OLFM4阳性细胞的干细胞特性 | 探究胃黏膜肠化生高风险的分子标志物及其在组织中的空间分布特征 | 胃黏膜肠化生、不典型增生和腺癌患者组织活检样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 多重免疫荧光 | NA | 图像 | 100个组织活检样本（包括对照组胃组织、胃黏膜肠化生、不典型增生和腺癌） | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2026-06-23 |
Integrated Analysis of Macrophage-Associated Necroptosis in Alopecia Areata
2026-Jun, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70305
PMID:42325069
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研究论文 | 通过整合转录组学和组织学分析，研究斑秃中巨噬细胞相关的坏死性凋亡特征 | 首次结合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq揭示斑秃中巨噬细胞亚群（IL4I1 macrophages_1）与坏死性凋亡信号的特异性关联，并发现TGFβ、ITGB2和GAS6信号通路在巨噬细胞-成纤维细胞通讯中的作用 | 样本量有限且主要来自公共数据库，缺乏功能性验证实验 | 探究坏死性凋亡在斑秃发病机制中的作用 | 斑秃患者和健康对照的头皮样本 | 生物信息学 | 斑秃 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 图像 | 191个头皮样本（来自斑秃患者和健康对照） | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 387 | 2026-06-22 |
Magnesium sulfate attenuates sepsis-induced myocardial injury through macrophage Fxyd2/NF-κB signaling: Integrated evidence from a propensity-matched cohort, single-cell atlas, and mechanistic validation
2026-Jun-16, Toxicology and applied pharmacology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.taap.2026.117918
PMID:42303054
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研究论文 | 整合倾向性匹配队列、单细胞图谱和机制验证，揭示硫酸镁通过巨噬细胞Fxyd2/NF-κB信号减轻脓毒症心肌损伤 | 首次通过多层级证据（临床队列、单细胞转录组和体外机制验证）阐明硫酸镁通过巨噬细胞Fxyd2/NF-κB轴发挥免疫调节作用，而非营养补充效应，为脓毒症心肌损伤提供靶向治疗新策略 | 研究基于回顾性数据库和动物模型，需前瞻性随机对照试验进一步验证；单细胞数据来自小鼠，人类巨噬细胞亚群的保守性需确认 | 探究硫酸镁对脓毒症心肌损伤的靶向治疗作用及其分子机制 | 脓毒症心肌损伤患者（MIMIC-IV数据库）、小鼠心脏组织及巨噬细胞-心肌细胞共培养模型 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病, 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹法, RT-qPCR, 焦亡检测 | Cox比例风险模型 | 临床数据, 单细胞转录组数据, 蛋白表达数据 | 2219例脓毒症心肌损伤患者（倾向性匹配后992例） | Illumina | 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 388 | 2026-06-22 |
Covalent Photo-Aptamer Tagging (CPAT) for Single-Cell Multiplexing and Chemical Transcriptomic Screens
2026-Jun-16, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.6c02091
PMID:42300017
|
研究论文 | 提出共价光适配体标记（CPAT）策略，用于单细胞多路复用和化学转录组筛选 | 通过二氮丙啶介导的卡宾插入，将瞬时分子识别转化为永久共价锚定，实现动力学锁定机制 | 未在摘要中提及明确局限性 | 开发高保真的单细胞样本多路复用方法，减少信号串扰和数据损耗 | 单细胞RNA测序中的样本多路复用及药物扰动下的化学转录组筛选 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未在摘要中说明具体样本量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 389 | 2026-06-21 |
Blood IL-6 is a critical trigger of depressive symptoms in a mouse model for human atopic dermatitis
2026-Jun-20, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-026-04211-2
PMID:42321187
|
研究论文 | 探究特应性皮炎小鼠模型中血液IL-6如何触发抑郁样行为 | 首次发现外周血IL-6和sIL-6Rα通过破坏血脑屏障并激活海马IL-6Rβ信号抑制未成熟神经元生成，从而驱动特应性皮炎相关抑郁症状 | 研究仅在NC/Tnd小鼠模型中进行，未在人类受试者中验证临床相关性 | 阐明特应性皮炎导致抑郁的分子机制，特别是IL-6在海马神经发生中的角色 | NC/Tnd自发特应性皮炎小鼠及IL-6缺陷小鼠 | 自然语言处理 | 特应性皮炎、抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NC/Tnd小鼠、IL-6缺陷小鼠以及联体共生小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 390 | 2026-06-21 |
Glucocorticoid and mitophagy signaling-based molecular subtyping reveals HMGA1 as a prognostic and immunotherapy biomarker in lung adenocarcinoma
2026-Jun-20, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01561-4
PMID:42321301
|
研究论文 | 本研究整合批量转录组和空间转录组数据，基于糖皮质激素与线粒体自噬信号通路对肺腺癌进行分子分型，并发现HMGA1作为预后和免疫治疗生物标志物 | 首次将糖皮质激素与线粒体自噬信号通路结合进行肺腺癌分子分型，并通过空间转录组学验证HMGA1在肿瘤上皮细胞中的富集及其与不良预后的关联 | 基于公开数据库的分析可能需要更多独立队列进行验证，功能性实验主要在体外和动物模型中进行，临床转化尚需进一步研究 | 探索肺腺癌的分子异质性并识别新的预后和免疫治疗生物标志物 | 肺腺癌患者的肿瘤组织和细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序，空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据，空间转录组数据 | TCGA和多个多中心队列的批量转录组数据，空间转录组样本用于原位验证 | NA | 批量RNA测序，空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 391 | 2026-06-21 |
ChatMDV: Reducing Technical Barriers in Bioinformatics Analysis using Large Language Models
2026-Jun-19, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag073
PMID:42319798
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研究论文 | 提出ChatMDV系统，通过自然语言界面与大型语言模型结合，降低生物信息学分析的技术门槛 | 将检索增强生成（RAG）流水线与大型语言模型集成到多维可视化工具MDV中，实现自然语言指令直接生成可执行Python代码和交互式可视化输出 | 未提及具体限制，可能依赖高质量语言表达和数据集兼容性 | 降低生物信息学可视化分析的技术壁垒，提升数据探索的可及性和可重复性 | 三个单细胞RNA测序数据集：PBMC3K、人类细胞图谱肺癌数据集和TAURUS纵向研究数据集 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大型语言模型 | 文本 | 三个单细胞RNA测序数据集 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 392 | 2026-06-21 |
Respiratory syncytial viral load drives ciliated cell dedifferentiation and suppresses antiviral immunity
2026-Jun-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aed4499
PMID:42319946
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析RSV感染人气道上皮细胞后病毒载量驱动的纤毛细胞去分化及抗病毒免疫抑制机制 | 揭示了RSV病毒载量依赖性地关闭纤毛细胞中纤毛形成、抗原呈递和先天免疫相关基因，并发现IRF1作为不被RSV抑制的抗病毒转录因子具有治疗潜力 | 未提及具体局限性 | 探究RSV如何重塑气道上皮细胞并逃避先天免疫的机制 | 成年原代人气道上皮细胞培养物及RSV感染后细胞 | 单细胞转录组学 | 呼吸道合胞病毒感染相关疾病 | 单细胞RNA测序、成像 | NA | 单细胞转录组数据、成像数据 | 成年原代人气道上皮细胞培养物，未明确样本量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 393 | 2026-06-21 |
Tumor-associated epilepsy at diagnosis in glioblastoma patients reveals an inflammatory molecular signature and is associated with better overall survival
2026-Jun-19, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag134
PMID:42320046
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研究论文 | 分析胶质母细胞瘤患者诊断期肿瘤相关癫痫的预后意义及其分子特征 | 首次揭示诊断期肿瘤相关癫痫是胶质母细胞瘤的独立预后良好标志，并明确其与炎症性分子亚型（RTK II亚型、分化的细胞状态和炎症微环境）的关联，同时发现癫痫状态可改变手术切除的预后效果 | 回顾性研究设计可能引入选择偏倚，且未能区分癫痫亚型（如局灶性 vs 全面性发作）对预后的影响 | 评估胶质母细胞瘤诊断期肿瘤相关癫痫的预后价值并解析其分子基础 | 1199例胶质母细胞瘤患者（回顾性测试集855例，前瞻性验证集344例） | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 甲基化测序、表观遗传学解卷积、空间转录组学 | 多变量Cox回归、倾向性评分匹配、交互作用模型 | 临床数据、基因表达数据、空间转录组数据 | 1199例患者（855例回顾性队列 + 344例前瞻性队列） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 394 | 2026-06-21 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal lactate-active epithelial-immune cell crosstalk that reprograms the immune microenvironment in colorectal cancer
2026-Jun-19, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102864
PMID:42320170
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研究论文 | 整合单细胞转录组学和空间转录组学揭示结直肠癌中乳酸活跃的上皮-免疫细胞交互作用及其对免疫微环境的重编程 | 首次通过单细胞和空间转录组学描绘结直肠癌肿瘤生态系统中的乳酸代谢景观，开发了基于四个核心基因的乳酸代谢评分（LMscore），并揭示了COX15作为乳酸代谢失调的关键调节因子及其与免疫抑制微环境形成的机制 | 未提及具体限制 | 阐明结直肠癌中乳酸代谢失调对免疫微环境的影响及开发预后和免疫治疗响应的生物标志物 | 结直肠癌肿瘤微环境中的上皮细胞、髓系细胞、成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量测序 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量测序数据 | 多个队列的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序和10x Visium空间转录组学 |
| 395 | 2026-06-21 |
Osr1-expressing mesoderm contributes to lymphatic vessel assembly and complexity in the mammalian kidney
2026-Jun-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117560
PMID:42320472
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研究论文 | 本研究通过小鼠遗传谱系追踪，揭示了肾脏淋巴管来源于Osr1中胚层和Tie2内皮细胞两个起源，并发现Osr1来源的淋巴管对网络形成和肾脏健康至关重要 | 首次发现Osr1中胚层是肾脏淋巴管的一个独特起源，不参与心脏、肠系膜和皮肤淋巴管生成，并证明其通过从头组装形成淋巴簇，对淋巴网络复杂性和肾小球数量有影响 | 结果主要基于小鼠模型，人类肾脏中Osr1中胚层来源淋巴管的功能和具体机制仍需进一步验证 | 探讨哺乳动物肾脏淋巴管的细胞起源及其对肾脏健康和疾病的影响 | 小鼠和人类的肾脏淋巴管系统 | 机器学习 | NA | 遗传谱系追踪、单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠（具体数量未提供）和人类样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 396 | 2026-06-21 |
In situ graphene-seq: spatial transcriptomics and chronic electrophysiological characterization of tissue microenvironments
2026-Jun-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73883-7
PMID:42321181
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研究论文 | 介绍一种整合慢性电生理记录与空间转录组的原位石墨烯测序平台 | 首次将可拉伸网状纳米电子学与石墨烯/聚(3,4-乙撑二氧噻吩)聚苯乙烯磺酸盐透明电极结合，实现长期单细胞级电生理记录与成像式空间转录组学的无缝集成 | NA | 开发能够同时捕获组织微环境中细胞功能动态与分子身份的多模态分析平台 | 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞与内皮细胞共培养体系 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学、原位测序、电生理学 | NA | 图像、电生理信号、基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学、电生理学 | 原位石墨烯测序平台 | 可拉伸网状纳米电子学与石墨烯/聚(3,4-乙撑二氧噻吩)聚苯乙烯磺酸盐透明电极结合，整合电生理记录与高吞吐量成像式原位测序 |
| 397 | 2026-06-21 |
Single-cell RNA sequencing profiles drug activity within spatially engineered 3D cultures
2026-Jun-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74587-8
PMID:42321208
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研究论文 | 提出一种基于转染的逐层构建方法，利用DNA条码编码细胞空间位置，实现空间编码三维培养物的单细胞RNA测序，揭示药物活性和基因表达的空间异质性 | 首次将DNA条码空间编码技术与单细胞RNA测序结合，实现三维细胞培养物的多重空间转录组分析，并融合成像技术定位细胞和测量组织弹性 | 方法依赖于转染构建，可能影响细胞生理状态；空间编码分辨率受限于层厚；仅验证HeLa模型，泛化性需更多研究 | 开发一种能够对三维细胞培养物进行空间转录组分析的方法，以揭示基因表达和药物响应的空间异质性 | 工程化三维球体（HeLa细胞模型） | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于转染的DNA条码空间编码方法 |
| 398 | 2026-06-21 |
Regenerative repair is connected to early and specific structural, immune, and metabolic MSC signatures in adult mammals
2026-Jun-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-58327-y
PMID:42321307
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析成年小鼠组织损伤后早期修复过程中间充质干细胞/基质细胞的异质性，发现再生修复与非再生修复间存在特定的结构、免疫和代谢特征差异 | 首次在具有相同发育阶段和遗传背景的成年哺乳动物模型中系统比较再生与非再生修复的早期MSC异质性变化，并提出SIM（结构、免疫、代谢）整合框架来诠释MSC的协调性组织修复功能 | 基于小鼠模型的研究结果可能需在更大规模或人类样本中验证，SIM框架的普适性和因果机制仍需进一步探索 | 研究成年哺乳动物组织再生修复与非再生修复早期过程中间充质干细胞/基质细胞的异质性变化及其对修复结果的调控作用 | 成年小鼠的间充质干细胞/基质细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠组织损伤模型的早期修复阶段样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 399 | 2026-06-21 |
Development and validation of a four-gene prognostic signature derived from disulfidptosis- and cuproptosis-related genes in oral squamous cell carcinoma
2026-Jun-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05478-z
PMID:42321590
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研究论文 | 基于二硫下垂和铜下垂相关基因构建并验证口腔鳞状细胞癌的四基因预后特征 | 首次结合二硫下垂和铜下垂两种新型细胞死亡通路构建口腔鳞状细胞癌的预后模型，并通过多数据集验证及单细胞转录组分析揭示基因表达的细胞类型特异性 | 部分验证数据集（GSE42743）未达到统计显著性，且模型C指数中等（0.669），提示可能需纳入更多样本或分子特征以提升预测效能 | 开发并验证一种基于二硫下垂和铜下垂相关基因的口腔鳞状细胞癌预后标志物 | 口腔鳞状细胞癌患者肿瘤组织样本及CAL-27和SCC-9细胞系 | 数字病理学, 机器学习 | 口腔癌（口腔鳞状细胞癌） | 基因表达芯片, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, ELISA | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 训练集268例（TCGA口腔HNSC）、验证集GSE41613（97例）、GSE65858（270例）、GSE42743（55例）；单细胞数据5902个细胞 | NA | 基因表达芯片, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 400 | 2026-06-21 |
Exploring the immune landscape and immunotherapy relevance of ER stress-related lncRNAs in melanoma through multi-omics and explainable machine learning
2026-Jun-19, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16356-w
PMID:42321658
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研究论文 | 通过多组学分析和可解释机器学习，探索内质网应激相关长链非编码RNA（ERlncRNA）在黑色素瘤中的免疫景观及免疫治疗相关性 | 首次结合批量转录组分析、单细胞RNA测序、可解释机器学习（SHAP）及实验验证，系统研究ERlncRNA在黑色素瘤中的预后意义和生物学功能 | 外部验证队列可能不够多样化，且功能实验仅针对部分代表性ERlncRNA，需要更广泛的验证 | 阐明ERlncRNA在黑色素瘤中的预后价值、免疫调节作用及潜在治疗分层意义 | 黑色素瘤患者及其肿瘤组织样本、黑色素瘤细胞系 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 批量转录组分析，单细胞RNA测序，可解释机器学习，western blot | SHAP | 转录组数据，临床数据 | TCGA、GTEx、GEO数据库中的黑色素瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |