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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-05 |
NINJ1-mediated macrophage ferroptosis impairs diabetic wound healing attenuated by Ruan Jian Qing Mai formula
2026-Jun, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157955
PMID:41930812
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研究论文 | 本研究揭示了NINJ1介导的巨噬细胞铁死亡在糖尿病足溃疡愈合障碍中的作用,并验证了软坚清脉方通过靶向NINJ1-STAT3-铁死亡通路促进伤口修复的机制 | 首次阐明NINJ1-铁死亡-炎症正反馈环路在糖尿病伤口巨噬细胞中的作用,并发现软坚清脉方通过抑制该通路恢复巨噬细胞促血管生成功能 | 未明确说明局限性 | 探讨巨噬细胞铁死亡在糖尿病足溃疡发病机制中的作用,并评估软坚清脉方的治疗效果及其分子机制 | 人类伤口组织样本、链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠模型、高糖和脂多糖刺激的巨噬细胞 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序、高效液相色谱-质谱联用、Western blot、qPCR、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、化学组分数据 | 人类伤口组织(具体数量未提及)、糖尿病小鼠模型(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 22 | 2026-05-05 |
Amygdalin alleviates MAFLD via inhibiting cytoplasmic calcium ion overload-induced liver sinusoidal endothelial cell defenestration
2026-Jun, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158135
PMID:41962269
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研究论文 | 本研究发现苦杏仁苷通过抑制肝窦内皮细胞去窗孔化缓解代谢相关脂肪性肝病 | 首次鉴定出桃仁中缓解MAFLD的关键活性成分是苦杏仁苷,并阐明其通过抑制细胞质钙离子过载来恢复肝窦内皮细胞窗孔化的机制 | 未提及具体局限性 | 鉴定桃仁中缓解MAFLD的关键活性成分并阐明其作用机制 | 高脂饮食诱导的MAFLD小鼠模型和原代肝窦内皮细胞 | 生物医学 | 代谢相关脂肪性肝病 | 质谱分析, 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学, 扫描电子显微镜 | NA | 图像, 文本, 组学数据 | 高脂饮食诱导的MAFLD小鼠模型及原代肝窦内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学 | NA | NA |
| 23 | 2026-05-05 |
Deacetylation of PRDX1 contributes to alleviating acute liver injury through Dihydromyricetin-mediated SIRT1 upregulation
2026-Jun, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158160
PMID:41966029
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研究论文 | 本文揭示了二氢杨梅素通过上调SIRT1去乙酰化PRDX1缓解急性肝损伤的分子机制 | 首次通过定量乙酰化组学和单细胞RNA测序整合分析,发现DMY通过SIRT1-PRDX1轴调控巨噬细胞氧化应激向炎症反应转变的免疫调节机制 | 研究局限于小鼠模型和体外细胞实验,缺乏人类ALI临床样本的直接验证 | 阐明二氢杨梅素对急性肝损伤的保护作用及其乙酰化修饰相关的免疫调节机制 | 小鼠急性肝损伤模型及巨噬细胞系 | 自然语言处理 | 急性肝损伤 | 单细胞RNA测序, 定量乙酰化组学, 腺相关病毒介导的基因调控 | NA | 转录组数据, 乙酰化组数据 | D-半乳糖胺/脂多糖诱导的急性肝损伤小鼠模型(具体样本量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 24 | 2026-05-05 |
Single-cell transcriptomics reveals the ameliorative effect of gastrodin on cholestatic liver fibrosis
2026-Jun, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158165
PMID:41999704
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研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示天麻素对胆汁淤积性肝纤维化的改善作用及多细胞机制 | 首次通过单核RNA测序整合分析,发现天麻素通过调节肝细胞磺基转移酶、减少库普弗细胞炎症因子及调控肝星状细胞异质性(尤其是新的Serpina阳性亚群)来缓解胆汁淤积性肝纤维化 | 未提及明显局限性,但可能包括小鼠模型与人类的差异、长期疗效和安全性需进一步验证 | 探究天麻素治疗胆汁淤积性肝纤维化的治疗潜力及潜在机制 | 两种小鼠模型(DDC饮食模型和胆管结扎模型)的肝脏组织 | 数字病理学 | 胆汁淤积性肝纤维化 | 单核RNA测序 | NA | 测序数据 | 两种小鼠模型(DDC和BDL)的肝脏样本,具体数量未提及 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-05-05 |
Targeting astrocytic Nrf2 by Trilobatin alleviates lipopolysaccharide-induced depressive-like behaviors and cognitive impairment in mice: Mechanistic insights into gut microbiota and metabolites modulation
2026-Jun, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158118
PMID:41931990
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research paper | 研究三叶苷通过激活星形胶质细胞Nrf2改善脂多糖诱导的小鼠抑郁样行为和认知障碍,并揭示其通过调节肠道微生物群和代谢产物发挥作用的机制 | 首次发现三叶苷直接结合Nrf2并激活Nrf2-ARE通路,通过重塑肠道微生物群(特别是增加阿克曼菌丰度)和代谢产物(短链脂肪酸)来改善抑郁和认知缺陷,并利用单细胞测序、表面等离子共振和基因敲除技术鉴定了主要分子靶点 | 未提及具体局限性 | 研究三叶苷对抑郁样行为和认知障碍的影响,及肠道微生物群和代谢产物的作用 | 脂多糖诱导的抑郁样行为和记忆障碍小鼠模型 | machine learning | major depressive disorder, Alzheimer's disease | 16S rRNA sequencing, fecal microbiota transplantation, single-cell sequencing, surface plasmon resonance, gene knockout | NA | sequencing data | 未明确说明样本数量 | Illumina | 16S rRNA sequencing, single-cell sequencing | Illumina NovaSeq | 16S rRNA基因测序采用Illumina NovaSeq平台,单细胞测序产品未明确 |
| 26 | 2026-05-05 |
Multi-omics and machine learning reveal a critical mediator of PRKCA in quercetin-mediated protection against Sarcopenia
2026-Jun, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158121
PMID:41936173
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研究论文 | 本研究通过多组学和机器学习相结合的方法,揭示了槲皮素通过PRKCA-ERK信号通路在预防肌少症中的关键作用 | 首次整合NHANES人群数据、多组学分析和实验验证,系统阐明槲皮素通过PRKCA-ERK通路调节肌肉分化的分子机制,并利用机器学习识别槲皮素为肌少症的关键预测因子 | 未提及显著局限性 | 探究槲皮素及其调控的分子通路在肌少症预防中的作用机制 | 槲皮素、PRKCA基因、肌肉细胞分化 | 机器学习 | 肌少症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化 | LASSO, CatBoost, SHAP | 转录组数据, 基因组关联研究数据, 定量性状位点数据 | NHANES 2017-2018数据, 具体样本量未明确 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-05-05 |
Shared and Distinct Genetic Factors Underlying Bile Acid Regulation and Intrahepatic Cholestasis of Pregnancy
2026-Jun, Genetic epidemiology
IF:1.7Q3
DOI:10.1002/gepi.70040
PMID:42076915
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研究论文 | 通过对中国孕妇队列进行全基因组关联研究,揭示了胆酸调节和妊娠期肝内胆汁淤积症的共享和独特遗传因素 | 首次在东亚人群中通过GWAS发现CYP7A1和SLC39A9基因座与总胆酸水平及ICP显著关联,并整合单细胞RNA测序数据揭示肝细胞和中性粒细胞中的细胞特异性基因富集 | NA | 探究总胆酸水平和妊娠期肝内胆汁淤积症的遗传基础 | 中国孕妇队列中的13,357名孕妇 | 机器学习 | 妊娠期肝内胆汁淤积症 | 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 13,357名中国孕妇 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2026-05-05 |
An m6A-programmed cell death signature predicts prognosis and identifies STK25 as a therapeutic target in colon adenocarcinoma
2026-Jun, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2026.15610
PMID:42077215
|
研究论文 | 基于m6A编程性细胞死亡特征构建结肠腺癌预后模型并识别治疗靶点STK25 | 首次整合m6A修饰与编程性细胞死亡(PCD)通路,构建21基因预后模型(MCDI),并发现STK25作为连接m6A修饰与凋亡调控的新治疗靶点 | 研究主要依赖公开数据集和体外实验,缺乏大规模临床验证和体内功能实验 | 开发基于m6A-PCD的预后模型并识别结肠腺癌潜在治疗靶点 | 结肠腺癌患者肿瘤样本及细胞系 | 机器学习 | 结肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 逆转录定量PCR, m6A甲基化RNA免疫沉淀, RNA免疫沉淀 | Cox比例风险模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 公开数据集GSE132465和GSE205506,以及临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-05-04 |
Targeted inhibition of microglial C5aR1 by PMX205 mitigates post-ischemic stroke neuroinflammation and promotes functional recovery
2026-Jun-01, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和功能实验,发现PMX205靶向抑制小胶质细胞C5aR1可减轻缺血性脑卒中后神经炎症并促进功能恢复 | 首次利用单细胞RNA测序识别缺血性脑卒中后小胶质细胞中C5aR1的关键调控作用,并通过PMX205靶向抑制验证其治疗潜力 | NA | 识别缺血性脑卒中小胶质细胞中的关键调节因子,并将其转化为临床治疗靶点 | 小胶质细胞C5aR1在缺血性脑卒中的表达及功能 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,定量免疫印迹,分子对接,ELISA,TTC染色,TUNEL/Nissl染色 | NA | 基因表达数据,图像 | 公共单细胞RNA测序数据集,两种小鼠模型(永久性局灶性缺血和短暂缺血再灌注损伤) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-05-04 |
Exploring the toxicological impact of perfluorooctanoic acid and perfluorooctane sulfonate on glioblastoma through network toxicology, machine learning, and multi-dimensional bioinformatics analysis
2026-Jun-01, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 结合网络毒理学、机器学习和多维生物信息学分析,探究全氟辛酸(PFOA)和全氟辛烷磺酸(PFOS)对胶质母细胞瘤(GBM)的毒性影响及其分子机制 | 首次联合网络毒理学、机器学习、免疫浸润分析、单细胞RNA测序、分子对接、孟德尔随机化和分子动力学模拟等多维度方法,系统揭示PFOA/PFOS暴露与GBM之间的潜在毒性靶点和机制,并提出了新的不良结局通路框架 | 研究主要基于计算分析和公共数据库,缺乏体外或体内实验验证,且MR分析中ODC1与GBM风险的关联需要进一步在更大样本中确认 | 探索PFOA和PFOS对胶质母细胞瘤的潜在毒性靶点和分子机制 | PFOA和PFOS两种化学物质、GBM相关基因表达数据、免疫细胞浸润数据、单细胞RNA测序数据 | 计算生物学、机器学习和生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 网络毒理学、机器学习、免疫浸润分析、单细胞RNA测序、分子对接、孟德尔随机化、分子动力学模拟 | 机器学习模型(具体类型未明确) | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、分子对接数据、分子动力学模拟数据 | 3个外部独立数据集用于验证,具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-05-04 |
Multi-omic and functional analyses identified an endoplasmic reticulum stress-driven TIMD4⁺ IL1β⁺ macrophage subpopulation contributes to osteoarthritis progression
2026-Jun, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156442
PMID:41875622
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研究论文 | 通过多组学与功能分析鉴定了一种内质网应激驱动的TIMD4⁺ IL1β⁺巨噬细胞亚群,该亚群促进骨关节炎进展 | 首次通过整合单细胞RNA测序和空间多组学技术,在滑膜和髌下脂肪垫中发现了特定的TIMD4⁺ IL1β⁺巨噬细胞亚群,并揭示内质网应激驱动其激活,促进骨关节炎进展 | 尚未在更大样本量或不同物种中验证该亚群的普遍性,且体内干预实验仅使用小鼠模型 | 探索滑膜和髌下脂肪垫在骨关节炎进展中的作用及细胞机制 | 人类滑膜和髌下脂肪垫组织,以及骨关节炎小鼠模型 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 空间多组学测序 | NA | 测序数据, 图像 | 人类滑膜和髌下脂肪垫样本,骨关节炎小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 32 | 2026-05-02 |
Aquaporin 4 knockdown alleviates traumatic brain edema and reduces neuronal axonal growth cone collapse via the RhoA/ROCK pathway
2026-06-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107390
PMID:41967652
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研究论文 | 通过调控AQP4表达,探讨其对创伤性脑损伤后脑水肿及神经修复的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示AQP4敲低通过减少星形胶质细胞分泌Sema3A,经RhoA/ROCK通路减轻神经元轴突生长锥塌陷,从而发挥神经保护作用 | NA | 阐明AQP4过表达引起的水肿对神经元修复的影响机制,并评估其作为临床治疗靶点的潜力 | 创伤性脑损伤小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 创伤性脑损伤 | scRNA-seq, DTI-MRI | NA | 单细胞转录组数据, 磁共振成像数据 | 创伤性脑损伤小鼠,样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2026-05-02 |
Tet2 deficiency alters CD4+ T cell function and promotes T cell lymphoma with a TFH cell immunophenotype
2026-Jun-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250194
PMID:42047684
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研究论文 | Tet2缺失改变CD4+ T细胞功能并促进具有TFH细胞免疫表型的T细胞淋巴瘤发生 | 首次揭示了Tet2缺失通过表观遗传改变导致TFH样淋巴瘤转化的机制,并发现ICOS(L)-PI3K信号通路在其中的关键作用 | NA | 探究Tet2突变如何通过表观遗传失调启动恶性T细胞转化 | Tet2基因敲除的CD4+ T细胞及小鼠T细胞淋巴瘤模型 | 机器学习 | T细胞淋巴瘤 | scRNA-seq, 转录组学, 表观遗传学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | Tet2缺失小鼠及人类CD4+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-05-02 |
Screening of metabolic-related biomarkers linking intervertebral disc degeneration and type 2 diabetes based on comprehensive bioinformatics analysis and machine learning
2026-Jun, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2026.102593
PMID:42064579
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研究论文 | 基于生物信息学分析和机器学习筛选椎间盘退变与2型糖尿病相关的代谢生物标志物 | 首次综合运用多种机器学习算法(Boruta、随机森林、支持向量机、XGBoost)和单细胞测序技术鉴定IVDD与T2D的共同生物标志物AMBP,并验证其与BCAA代谢及免疫细胞浸润的相关性 | 缺少对AMBP在两种疾病中直接因果机制的深入实验验证,且因数据库限制可能有数据偏差 | 识别椎间盘退变(IVDD)和2型糖尿病(T2D)的共同生物标志物并评估其诊断价值 | 椎间盘退变组织和2型糖尿病患者样本 | 机器学习, 生物信息学 | 椎间盘退变, 2型糖尿病 | 差异表达分析, 机器学习(Boruta、RF、SVM、XGBoost), CYBERSORT免疫浸润分析, 单细胞测序, 临床样本验证 | Boruta, 随机森林, 支持向量机, XGBoost | 基因表达数据(GEO数据库), 单细胞RNA测序数据 | 两个GEO数据集(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-05-01 |
HOX code-based stratification reveals RUNX1T1-HDAC reprogramming as a targetable driver of lineage plasticity across cancers
2026-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218465
PMID:41912135
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研究论文 | 通过分析80,000多个RNA-seq样本的HOX基因表达,发现HOX代码能够跨癌种区分谱系受限和谱系可塑性状态,并揭示RUNX1T1-HDAC轴作为可治疗靶点 | 首次建立基于HOX代码的跨癌种谱系可塑性分类框架,发现RUNX1T1作为跨谱系可塑性调节因子,并验证HDAC3抑制可作为治疗策略 | 未明确提及,但可能包括机制验证主要基于前列腺癌模型,以及临床验证样本范围的潜在限制 | 探索HOX代码作为跨癌种谱系可塑性生物标志物的可行性,并鉴定潜在治疗靶点 | 前列腺癌、肺癌和急性髓系白血病的谱系可塑性亚型及相关细胞模型 | 机器学习 | 前列腺癌、肺癌、急性髓系白血病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CUT&RUN, 共免疫沉淀, 脂质纳米颗粒 | 人工智能结构建模 | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 染色质图谱数据 | 超过80,000个RNA-seq样本,涵盖23种癌症类型的114个亚型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-04-30 |
T cells in antibody-associated CNS autoimmunity: a mechanistic approach across autoimmune encephalitis and paraneoplastic disorders
2026-Jun-01, Current opinion in neurology
IF:4.1Q2
DOI:10.1097/WCO.0000000000001492
PMID:41982079
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综述 | 本文综述了T细胞在抗体相关中枢神经系统自身免疫性疾病(包括自身免疫性脑炎、副肿瘤神经综合征和胶质细胞抗体介导的疾病)中的作用机制,重点关注循环衰竭型辅助T细胞记忆、鞘内T-B细胞协作和实质组织驻留细胞毒性三个维度 | 从T细胞免疫的三个新兴维度(循环衰竭型辅助T细胞记忆、鞘内T-B协作、实质组织驻留细胞毒性)系统解析传统抗体分类的自身免疫性疾病的临床病理特征,为理解临床悖论和治疗策略提供新框架 | 未提供具体的实验数据或临床试验结果,主要基于现有文献综述 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2026-04-29 |
Extracellular vesicle-mediated transcellular mitophagy as a modulatory target for moderate hyperoxia-induced alveolar developmental arrest in bronchopulmonary dysplasia
2026-Jun, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 揭示中度高氧诱导支气管肺发育不良中成纤维细胞通过细胞外囊泡介导的线粒体自噬传递导致肺泡发育停滞的机制 | 首次阐明成纤维细胞通过富含外线粒体膜蛋白VDAC1的细胞外囊泡抑制肺泡上皮细胞线粒体自噬,从而在BPD中发挥关键作用 | NA | 探究中度高氧下成纤维细胞如何参与肺泡发育停滞的机制,为支气管肺发育不良寻找治疗靶点 | 中度高氧诱导的支气管肺发育不良小鼠模型中的成纤维细胞和II型肺泡上皮细胞 | 数字病理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 细胞外囊泡分析 | NA | 基因表达数据, 图像 | 中度高氧(60%氧气)暴露的BPD小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-04-28 |
Spatial Robustness of Prostate Cancer Biomarkers Evaluated by Spatial Transcriptomics
2026-Jun, The Prostate
DOI:10.1002/pros.70164
PMID:41911496
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研究论文 | 利用空间转录组学评估两种患者前列腺癌组织切片中四种预后生物标志物基因的空间稳健性 | 首次通过空间转录组学评估多个预后生物标志物面板(Oncotype DX、Prolaris、Decipher和ProClass)在高度异质的前列腺癌组织中的空间表达模式,并提出“空间稳健”面板概念 | 仅分析两名患者共37个组织切片,样本量小;低丰度基因可能受当前技术限制影响,难以进行稳健空间分析 | 探究空间转录组学在验证和优化前列腺癌预后生物标志物面板中的潜在用途,评估生物标志物基因的空间变异性 | 两名患有局部高等级前列腺癌患者的37个组织切片 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | 加权基因共表达网络分析 | 空间基因表达数据 | 37个组织切片(来自2名患者) | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium Spatial Platform | Visium空间平台 |
| 39 | 2026-04-27 |
Efferocytosis-related biomarkers and immune infiltration in pancreatic ductal adenocarcinoma based on single-cell sequencing and machine learning: a comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation
2026-Jun-11, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153751
PMID:41966742
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研究论文 | 基于单细胞测序和机器学习整合生物信息学分析与实验验证,揭示胞葬作用相关生物标志物在胰腺导管腺癌中的免疫浸润特征 | 首次通过单细胞转录组学与机器学习结合,系统解析胰腺导管腺癌中巨噬细胞胞葬作用的异质性,并构建包含六基因(CD36、ITGAV、PANX1、PPARG、S100A4、THBS1)的风险预测模型 | 研究主要依赖公开数据集,样本量有限且缺乏多中心独立外部验证;THBS1基因功能验证仅在体外进行,未涉及体内动物模型或临床前瞻性队列验证 | 探索胞葬作用相关基因在胰腺导管腺癌中的表达模式、预后预测价值及肿瘤微环境重塑机制 | 胰腺导管腺癌患者组织样本及细胞系(如用于THBS1敲降实验的PDAC细胞) | 机器学习, 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 实时荧光定量PCR, 蛋白质印迹法 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA-PDAC和GTEx数据集(具体样本数未明确)、GEO数据集(如单细胞数据集)、6基因模型构建基于训练组及验证组(样本量未具体说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-04-27 |
In silico virtual knockout identifies PXDNL as a fibroblast-specific driver of sarcopenia and GABA as a potential modulator
2026-Jun-11, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153738
PMID:41996735
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研究论文 | 通过虚拟基因敲除和单细胞RNA测序分析,确定PXDNL是肌肉减少症成纤维细胞特异的驱动因子,并发现GABA作为潜在调节剂 | 首次利用计算机模拟虚拟基因敲除与多组学数据结合,识别出成纤维细胞特异的肌肉减少症驱动基因PXDNL,并验证了GABA作为可重靶向药物的治疗潜力 | 研究主要基于计算机模拟和体外实验,缺乏体内动物模型验证,且样本量相对较小 | 识别肌肉减少症的因果机制和可转化的治疗靶点 | 肌肉减少症中成纤维细胞特异基因PXDNL及其调控的细胞外基质基因 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 虚拟基因敲除, 分子对接 | WGCNA, scTenifoldKnk, plsRglm | 基因表达数据 | 238份活检样本(来自5个GEO队列)和10份单细胞样本(12,847个细胞) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |