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当前共找到 1083 篇文献,本页显示第 361 - 380 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
361 2026-08-08
SMURF: soft-segmentation for single-cell reconstruction and topological analysis of spatial transcriptomic data
2026-Jun-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出SMURF,一种基于深度学习的软分割算法,用于空间转录组数据中mRNA到单细胞的分配和组织结构的拓扑分析 首次将软分割与流形展开结合,通过深度学习实现跨平台mRNA到单细胞的精确分配,并支持复杂组织架构的拓扑分析 依赖捕获点与细胞核的邻近性,可能受组织切片质量影响,且未在超大规模数据集上全面验证 开发高分辨率空间转录组数据分析方法,以准确分配转录本并揭示组织内的细胞类型组织和基因表达梯度 小鼠回肠组织以及多种组织类型和空间转录组技术下的细胞 计算生物学、空间转录组学 不适用 空间转录组学、深度学习 深度神经网络(软分割模型) 空间转录组数据 超过400,000个小鼠回肠细胞(使用Visium HD数据) 10x Genomics 空间转录组学 Visium HD Visium HD平台
362 2026-08-08
Spatial transcriptomics identifies immune-stromal niches associated with cancer in adult dermatomyositis
2026-Jun-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过空间和单细胞转录组学分析,揭示了成人皮肌炎皮肤病变中与癌症相关的独特免疫和基质微环境 首次通过空间转录组学与单细胞转录组学整合分析,识别出与癌症相关的皮肌炎皮肤病变中独特的免疫和基质微环境,并发现非癌症相关的皮肌炎皮肤具有特定的细胞互作对(如mregDC和活化Treg)及IFNβ表达 摘要中未提及局限性信息 通过空间和单细胞转录组学分析,阐明成人皮肌炎皮肤病变中与癌症相关的免疫和基质微环境特征 成人皮肌炎(DM)和皮肤红斑狼疮(CLE)患者的皮肤病变组织 数字病理学 皮肌炎 空间转录组学、单细胞转录组学 NA 空间转录组数据、单细胞转录组数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
363 2026-08-08
Neutrophil-derived S100A8/A9 impairs megakaryocyte maturation in immune thrombocytopenia
2026-Jun-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组学揭示中性粒细胞来源的S100A8/A9通过TLR4-JNK/c-Jun信号通路抑制巨核细胞成熟,参与免疫性血小板减少症(ITP)的发病机制 首次在ITP骨髓中鉴定出中性粒细胞-巨核细胞轴,并揭示S100A8/A9-TLR4-JNK/c-Jun信号通路通过抑制GATA1来阻碍巨核细胞成熟,为ITP治疗提供了新的靶点 研究未明确S100A8/A9调控GATA1的具体分子机制,且tasquinimod的临床疗效需进一步验证 探究免疫性血小板减少症中炎症介质损害血小板生成的机制,并评估靶向S100A8/A9-TLR4信号的治疗潜力 ITP患者的骨髓组织、CD34+来源的巨核细胞培养物、以及活动性和被动性ITP小鼠模型 免疫学 免疫性血小板减少症 单细胞转录组学、空间转录组学、流式细胞术、细胞培养 小鼠模型(活动性和被动性ITP模型) 转录组数据、图像数据 未明确报告具体的样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 未提供具体配置
364 2026-08-08
Mitochondrial DNA heteroplasmy drives cortical neuronal disturbances in human organoids harbouring the common m.3243A>G mutation
2026-Jun-21, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究利用人类诱导多能干细胞衍生的脑类器官切片模型,揭示了线粒体DNA异质性m.3243A>G突变对皮质神经元转录和细胞过程的影响,特别是导致深层神经元损伤。 首次在人类脑类器官模型中研究m.3243A>G突变对皮质神经元的影响,并结合单细胞RNA测序揭示异质性依赖的转录变化。 未提及具体局限性。 探索m.3243A>G突变在人类皮质神经元中的致病机制,为线粒体疾病提供治疗策略。 人类诱导多能干细胞衍生的脑类器官切片模型,包含皮质结构和线粒体病理。 神经科学 线粒体脑肌病伴乳酸酸中毒和卒中样发作(MELAS) 单细胞RNA测序 类器官模型 基因表达数据 未明确提及样本数量,可能涉及多个类器官样本。 未提及 单细胞RNA测序 未提及 未提及
365 2026-08-08
Divergent 3D genome architecture of male germ cells across vertebrates
2026-Jun-20, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 整合FACS、Hi-C和单细胞RNA测序技术,研究真兽类、有袋类和爬行类雄性生殖细胞的3D基因组结构,揭示其进化可塑性及与减数分裂性染色体失活的关系 首次跨约3.5亿年进化距离比较脊椎动物雄性生殖细胞的3D基因组结构,揭示谱系特异的染色质折叠模式并发现与基因组大小和染色体形态的关联 未涉及无脊椎动物或更广泛的物种样本,且对3D基因组调控机制的详细分子机制探索有限 探究脊椎动物雄性生殖细胞3D基因组结构的进化可塑性及其与基因调控和减数分裂性染色体失活的关系 真兽类、有袋类和爬行类的雄性生殖细胞 基因组学 不适用 流式细胞分选、Hi-C、单细胞RNA测序 不适用 测序数据、基因表达数据 涵盖多个物种的生殖细胞样本(具体数量未在摘要中提供) 不适用 Hi-C、单细胞RNA测序 不适用 不适用
366 2026-08-08
Tubular epithelial cells promote macrophage pyroptosis through PANX1-extracellular ATP-P2X7 signaling in aldosterone-dependent renal injury
2026-Jun-05, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究探讨了肾小管上皮细胞通过PANX1-eATP-P2X7信号通路促进巨噬细胞焦亡在醛固酮依赖性肾损伤中的作用 首次阐明醛固酮/盐皮质激素受体通过PANX1-eATP-P2X7信号通路调控肾小管上皮细胞与巨噬细胞间串扰,促进巨噬细胞焦亡,为高血压肾损伤提供新机制 本研究主要基于小鼠模型和体外细胞共培养,未在人类样本中验证,且未探讨其他信号通路可能参与的机制 阐明醛固酮/盐皮质激素受体诱导的PANX1-eATP-P2X7信号激活在高血压肾损伤中促进巨噬细胞焦亡的机制 高血压小鼠模型(DOCA-salt诱导)和原代小鼠肾小管上皮细胞与骨髓来源巨噬细胞共培养模型 数字病理学 高血压肾损伤 scRNA-seq, 荧光素酶报告基因检测, 腺相关病毒转染 NA 基因表达数据,图像 DOCA-salt小鼠模型及原代细胞共培养样本,具体数量未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
367 2026-08-08
An integrated machine learning and mendelian randomization approach identifies SERPING1 as a prognostic biomarker associated with CD8 + T-cell infiltration in DLBCL
2026-Jun-03, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 结合机器学习和孟德尔随机化方法,确定SERPING1为与DLBCL中CD8+T细胞浸润相关的预后生物标志物 首次整合多组学数据、多种机器学习算法和孟德尔随机化,鉴定出SERPING1作为DLBCL的预后生物标志物,并揭示其通过补体系统失衡调控肿瘤微环境中的CD8+T细胞浸润 研究依赖公共数据库,缺乏体外或体内实验验证,且样本量有限 阐明DLBCL恶性行为的分子机制,识别新的预后标志物和治疗靶点,以改善患者预后 弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者样本及CD8+T细胞相关基因 机器学习 弥漫大B细胞淋巴瘤 多组学整合、机器学习、孟德尔随机化、单细胞RNA测序、分子对接 LASSO、LDA、WGCNA、CIBERSORT、CellChat 基因表达数据(微阵列和RNA-seq)、单细胞转录组数据 6个GEO数据集(GSE56315, GSE25638, GSE12453, GSE12195, GSE32018, GSE83632)和TCGA-DLBC RNA-seq数据 NA NA NA NA
368 2026-08-08
Vascular SMC-like CAF-derived THBS1 drives tumor-associated neutrophil recruitment to orchestrate an immunosuppressive microenvironment in gastric cancer
2026-Jun-03, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了胃癌中血管平滑肌样癌相关成纤维细胞分泌的THBS1通过招募肿瘤相关中性粒细胞,构建免疫抑制微环境并促进肿瘤进展的机制 首次阐明SMC样CAF来源的THBS1通过自分泌方式促进趋化因子分泌,进而招募TANs并驱动胃癌恶性进展的分子机制 摘要未明确提及研究局限性,可能包括样本量有限或未涉及临床免疫治疗疗效验证 探讨THBS1在胃癌中通过TANs招募塑造免疫抑制微环境并促进肿瘤进展的作用机制 胃癌组织样本、患者来源异种移植模型和裸鼠异种移植模型中的CAFs与TANs 肿瘤免疫学 胃癌 单细胞RNA测序、免疫组化、多重免疫荧光、患者来源异种移植模型 NA 单细胞转录组数据、组织病理图像 摘要未明确提及具体样本量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序平台用于分析胃癌组织中CAF亚群和TANs的转录组特征
369 2026-08-08
Chronic liver diseases aggravate radiation-induced intestinal injury through taurocholic acid dysregulation
2026-Jun-02, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨慢性肝病通过牛磺胆酸失调加重放射性肠损伤的机制,并提出潜在治疗策略 首次揭示慢性肝病通过胆汁酸介导的肝肠信号加重放射性肠损伤,并阐明牛磺胆酸通过三种协同机制破坏肠道稳态的分子机制 未提及具体局限性 研究慢性肝病对放射性肠损伤的影响及其潜在机制,并提出治疗策略 小鼠模型、细胞系、肠道类器官、肠道隐窝、肠道微生物 数字病理学 肝病 单细胞RNA测序、16S rRNA基因测序、非靶向代谢组学 NA 基因表达数据、微生物组数据、代谢组数据 小鼠模型(数量未提及) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序、16S rRNA基因测序 10x Chromium, Illumina测序平台 10x Chromium Single Cell 3';Illumina测序平台
370 2026-08-08
Radiotherapy synergizes with CD24 blockade to initiate macrophage-driven systemic antitumor immunity in non-small cell lung cancer
2026-Jun-02, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1
研究论文 本研究探讨了放疗与CD24阻断联合治疗非小细胞肺癌,通过巨噬细胞驱动系统性抗肿瘤免疫的机制 首次揭示CD24作为先天免疫检查点在放疗诱导的系统性抗肿瘤免疫中的关键抑制作用,并阐明CCL2-CCR2轴介导的巨噬细胞重编程机制 研究基于小鼠模型,尚未在人体中验证,且未涉及临床样本的验证 探究CD24在放疗诱导的抗肿瘤免疫反应中的作用及其作为治疗靶点的潜力 非小细胞肺癌小鼠模型(双侧、原位及转移性模型)及巨噬细胞、CD8+ T细胞等免疫细胞 免疫学 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序 小鼠肿瘤模型(双侧、原位、转移性) 基因表达数据 未明确 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
371 2026-08-08
Integrative multi-omics analysis identifies a circadian rhythm-associated gene signature for prognosis and therapeutic stratification in lung adenocarcinoma
2026-Jun-01, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过整合多组学数据,构建了基于昼夜节律相关基因的预后特征,用于肺腺癌的风险分层和治疗策略指导。 利用十种机器学习算法构建了10基因昼夜节律相关预后特征(CRGPS),并结合单细胞RNA测序分析揭示基因在细胞水平的表达及细胞间通讯。 基于计算机预测的免疫谱和药物敏感性结果需前瞻性验证。 开发稳健的昼夜节律相关基因特征,以改善肺腺癌的风险分层和个性化治疗策略。 肺腺癌(LUAD)患者,涉及TCGA和GEO数据库中的900多名患者。 机器学习 肺癌 多组学分析, 单细胞RNA测序 机器学习算法 多组学数据, 单细胞RNA测序数据 超过900名肺腺癌患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
372 2026-08-03
AI-driven discovery of GPNMB CAR T cells as a multi-cancer therapy
2026-Jun-25, Cell IF:45.5Q1
研究论文 开发了一种基于人工智能的CAR T细胞靶点发现方法,通过整合单细胞RNA测序数据,识别出GPNMB作为多癌种治疗靶点,并验证了其疗效 首次将人工智能驱动的方法(包括单细胞数据整合和大型语言模型)应用于CAR T细胞靶点发现,并成功识别出GPNMB作为多癌种治疗靶点 未提供具体局限性信息 开发一种人工智能驱动的CAR T细胞靶点发现流程,以解决靶点识别这一主要瓶颈,并验证新靶点的治疗潜力 人类皮肤癌和健康组织的单细胞RNA测序数据,以及单核细胞白血病、黑色素瘤和结直肠腺癌的小鼠模型 机器学习 皮肤癌、白血病、黑色素瘤、结直肠癌 单细胞RNA测序 大型语言模型 单细胞基因表达数据 人类皮肤癌和健康组织样本,以及多种小鼠肿瘤模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
373 2026-08-03
Aging reprograms microglia toward an inflammasome-linked response to traumatic brain injury
2026-06-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
评论 该文章评论了Lu等人的研究,该研究结合单细胞转录组学、代谢组学和染色质分析,揭示了衰老如何将小胶质细胞重编程为与炎症小体相关的反应,并确定了可药物干预的靶点 将年龄从临床风险因素转化为一组可药物干预的小胶质细胞靶点,通过连接NLRP3炎症小体主导性、ELF1驱动的转录和糖酵解重编程与保护性Lyz2+反应的丧失 主要基于小鼠模型,人类验证有限 理解衰老如何加剧创伤性脑损伤的脆弱性,并确定可药物干预的靶点 小鼠模型和人类创伤性脑损伤组织中的小胶质细胞 转录组学 创伤性脑损伤 单细胞转录组学、代谢组学、染色质分析 NA 单细胞转录组数据、代谢组数据、染色质数据 小鼠模型和人类创伤性脑损伤组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
374 2026-08-03
Bidirectional integrin β1 activation synergizes neurovascular coupling and enhances bone regeneration
2026-Jun-12, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发了一种功能性支架(PTPG),通过双向激活整合素β1协同神经血管耦合,促进大段骨缺损的修复和骨再生 利用REDV-IKVAV肽与Talin1质粒同时激活整合素β1的“由外向内”和“由内向外”信号通路,实现血管生成、神经发生和成骨的协同调控 未在长期动物模型中评估支架的降解和长期安全性,且对信号通路的具体分子机制探讨尚浅 开发一种能同时促进血管生成、神经发生和成骨的功能支架,以重建大段骨缺损 大鼠股骨大段骨缺损模型中的内皮细胞、施万细胞和骨组织 组织工程与再生医学 大段骨缺损 单细胞RNA测序 支架材料(非深度模型) 单细胞转录组数据 未明确,通常涉及实验组和对照组,具体样本量未在摘要中提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
375 2026-08-02
Fusobacterium nucleatum in oral squamous cell carcinoma: molecular mechanisms, tumor microenvironment and translational implications
2026-Jun-06, Archives of microbiology IF:2.3Q3
综述 本文综述了具核梭杆菌在口腔鳞状细胞癌中的作用机制、肿瘤微环境相互作用及其转化应用前景 重点探讨了FadA和Fap2相关信号、β-catenin、NF-κB和STAT3介导的通路,以及空间转录组学、单细胞测序和多组学整合在宿主-微生物表征中的应用 现有研究结果异质性高且依赖具体背景,数据因肿瘤部位、HPV状态、微生物负荷、宿主免疫组成和研究方法差异而变化,多数生物标志物和治疗策略仍处于早期实验阶段 评估具核梭杆菌在口腔鳞状细胞癌中的分子和细胞相互作用,并探讨其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 具核梭杆菌在口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的分子和细胞相互作用 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 空间转录组学、单细胞测序、多组学整合 NA NA NA NA 空间转录组学、单细胞测序 NA NA
376 2026-08-01
Transcriptomic Insights into Micro- and Nanoplastic Toxicity in Zebrafish: A Narrative Review
2026-Jun-29, Toxics IF:3.9Q1
综述 本文是关于微塑料和纳米塑料对斑马鱼毒性的叙述性综述,基于转录组学证据进行总结 通过按器官系统分类,重点总结高通量方法(如RNA测序和单细胞RNA测序)揭示的微塑料和纳米塑料诱导毒性的基因表达证据 未提及 总结微塑料和纳米塑料暴露对斑马鱼各器官系统影响的转录组学证据,以理解其毒性机制 斑马鱼 转录组学 生态毒理学 RNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
377 2026-08-01
Short-Chain Fatty Acids: Bridging Gut Microbiota and Systemic Aging-Mechanisms, Interventions, and Current Challenges
2026-Jun-23, Metabolites IF:3.4Q2
综述 本文从系统角度阐述了短链脂肪酸与衰老之间的内在联系,分析了其通过关键信号通路调节衰老的机制,并总结了其在衰老相关疾病中的治疗潜力和多样化干预策略。 从全身性视角阐明SCFAs连接肠道微生物与系统性衰老的机制,并提出利用单细胞测序和器官模型等新技术探索衰老细胞命运调控。 SCFAs调节衰老的详细分子机制尚不清楚,且缺乏针对不同衰老阶段和器官损伤的精确干预方案。 阐明短链脂肪酸与衰老的关系,分析其调节机制,并总结其在衰老相关疾病中的治疗潜力和干预策略。 短链脂肪酸(SCFAs)、肠道微生物、衰老及相关器官(如骨骼肌、心脏) 微生物组学 老年性疾病 NA NA NA NA NA NA NA NA
378 2026-08-01
scPASU: A computational protocol for quantifying polyadenylation site usage and alternative polyadenylation from 3' scRNA-seq data
2026-Jun-19, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 介绍了scPASU,一个用于从3'单细胞RNA测序数据量化多聚腺苷酸化位点使用和选择性多聚腺苷酸化的Snakemake工作流程 提出了一个可配置的、支持多聚腺苷酸化位点发现的计算协议,适用于不同生物体和样本参数 未在摘要中提及具体限制 提供一种计算协议,用于从3' scRNA-seq数据中量化多聚腺苷酸化位点使用和选择性多聚腺苷酸化 3'单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 3'单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
379 2026-08-01
LMTK3 regulates breast cancer angiogenesis via a context-dependent mesenchymal-epithelial transition program
2026-Jun, Cancer gene therapy IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能验证,揭示LMTK3通过情境依赖的上皮-间质转化程序调控乳腺癌血管生成,在间质样三阴性乳腺癌中促进部分EMT状态和血管生成,而在腔样细胞中抑制血管生成表型 首次发现LMTK3作为情境依赖的血管生成驱动因子,通过MET程序调控肿瘤血管生成,并揭示了辛普森悖论现象,即LMTK3在不同乳腺癌亚型中的作用相反 摘要中未提及明确的局限性 探究LMTK3在乳腺癌肿瘤血管生成微环境中的具体作用及其分子机制 乳腺癌细胞,包括间质样三阴性乳腺癌细胞和腔样乳腺癌细胞 癌症生物学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未提及具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
380 2026-07-31
Single-Cell Profiling Identifies the SPDEF/GAS5 Axis as a Potential Driver of Tamoxifen Resistance in Estrogen Receptor-Positive Breast Cancer
2026-Jun, Cureus
研究论文 通过单细胞RNA测序数据整合分析,识别出SPDEF/GAS5轴作为雌激素受体阳性乳腺癌他莫昔芬耐药的潜在驱动因素 首次在单细胞水平揭示SPDEF调控GAS5+肿瘤细胞亚群驱动他莫昔芬耐药的机制,并发现该亚群具有代谢重编程特征 样本量较小(仅3例耐药复发肿瘤),缺乏体外功能验证实验,公共数据可能存在批次效应 阐明ER+乳腺癌他莫昔芬耐药的细胞和分子机制 16例ER+乳腺癌标本(13例初治原发肿瘤和3例他莫昔芬耐药复发肿瘤)的恶性上皮细胞亚群 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序 Monocle2, SCENIC, InferCNV 基因表达矩阵 16例乳腺癌组织样本(13例原发+3例复发) NA 单细胞RNA测序 NA 公共数据库单细胞RNA测序数据
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