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当前共找到 1083 篇文献,本页显示第 341 - 360 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
341 2026-08-13
Identification MYD88 as a candidate molecule of sodium overload-induced cell death in myocardial ischemia-reperfusion injury
2026-Jun-05, Journal of cardiothoracic surgery IF:1.5Q3
研究论文 本研究通过加权基因共表达网络分析和机器学习方法,结合单细胞RNA测序和体内实验,识别出MYD88作为心肌缺血再灌注损伤中钠超载诱导细胞死亡的候选分子 首次将WGCNA与多种机器学习算法整合,结合单细胞测序,揭示MYD88在心肌缺血再灌注损伤中钠超载引发的细胞死亡中的关键作用,为理解该病理机制提供新视角 仅基于GEO数据库的转录组数据和单一体内模型,未进行功能验证或机制深入探究,样本量有限,且未评估MYD88在其他细胞类型或人类样本中的表达 识别与心肌缺血再灌注损伤中钠超载相关的关键分子,并探索其潜在机制 心肌缺血再灌注损伤相关转录组数据、单细胞RNA测序数据以及小鼠心肌缺血再灌注损伤模型 生物信息学 心肌缺血再灌注损伤 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、机器学习(LASSO、随机森林、支持向量机)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) 机器学习模型(LASSO、随机森林、支持向量机) 转录组数据、单细胞RNA测序数据 GEO数据集(具体样本数未提供)及小鼠模型(数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
342 2026-08-13
Emerging landscape of oncogenic signaling pathways in cervical cancer
2026-Jun-04, Discover oncology IF:2.8Q2
综述 本文综述了宫颈癌中致癌信号通路的研究进展,重点讨论了TGF/SMAD、Wnt/β-catenin、AKT/mTOR和Notch信号通路在肿瘤进展中的作用,以及泛素化在宫颈癌调控中的关键角色。 整合了多组学和单细胞测序技术,结合多尺度计算研究,提出了对宫颈癌侵袭性的新理解,并强调其在临床试验设计中的应用潜力。 未提供具体的实验数据或样本信息,缺乏对信号通路相互作用的深入分析。 综述宫颈癌中关键致癌信号通路的研究现状,并探讨多组学和单细胞测序技术如何推动临床决策。 宫颈癌中的致癌信号通路(TGF/SMAD、Wnt/β-catenin、AKT/mTOR、Notch)及泛素化过程。 数字病理学 宫颈癌 NA NA 文本 NA NA NA NA NA
343 2026-08-13
CIITA/PRMT5 promote CD4+Gzma+ T cell activation via H3R2me2-mediated endothelial expression of MHC class II in smoking-induced atherosclerosis
2026-Jun-03, BMC medicine IF:7.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了吸烟通过CIITA/PRMT5介导的内皮细胞MHC II表达激活CD4+Gzma+ T细胞,进而促进动脉粥样硬化进展的免疫机制 首次阐明CIITA与PRMT5相互作用通过H3R2对称二甲基化修饰调控内皮细胞MHC II表达,进而激活CD4+Gzma+ T细胞在吸烟相关动脉粥样硬化中的作用 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需进一步在人类样本中验证;具体信号通路细节及临床干预效果需深入探索 探究吸烟诱导动脉粥样硬化进展中CD4+Gzma+ T细胞活化的免疫机制及潜在治疗靶点 ApoE敲除小鼠、小鼠动脉内皮细胞、人冠状动脉内皮细胞、CD4+Gzma+ T细胞 免疫学 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、质谱分析、免疫共沉淀、基因敲除/敲低 NA 单细胞转录组数据、蛋白质互作数据 小鼠模型及体外培养细胞,具体数量未在摘要中提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'转录组测序
344 2026-08-12
Nur77 agonism invigorates Natural Killer cell immunity against hepatocellular carcinoma
2026-Jun-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究通过空间和单细胞转录组学揭示了Nur77在NK细胞介导的肝细胞癌免疫中的作用,并证明其激动剂可增强NK细胞的抗肿瘤功能 首次揭示Nur77在NK细胞抗肝细胞癌免疫中的关键作用,并证明Nur77激动剂可增强NK细胞的抗肿瘤功能,为改善NK细胞免疫治疗提供了新策略 摘要未提及研究的局限性 探究Nur77在NK细胞抗肝细胞癌免疫中的作用及其潜在治疗价值 自然杀伤细胞(NK细胞)和肝细胞癌(HCC) 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、功能实验 NA 基因表达数据、组织图像 人类和小鼠肝细胞癌肿瘤样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium单细胞3'文库、10x Visium空间转录组
345 2026-08-12
Chromogenic in situ HCR as a targeted translational interface for routine molecular histology
2026-Jun-08, Histochemistry and cell biology IF:2.1Q2
评论 本文评论了显色原位HCR作为一种靶向分子组织学方法在常规组织学中的应用,并讨论其与空间转录组学的关系及潜在价值。 将显色原位HCR定位为靶向分子组织学方法,而非高维空间转录组学的替代品,强调其在验证和情境化预定义转录本中的应用。 显色原位HCR在成本、探针合成、优化和试剂可用性方面存在挑战,且其价值限于狭义的标记定义应用,不适用于复杂多基因空间细胞状态重建。 探讨显色原位HCR作为常规分子组织学的靶向界面,并为其实际应用提供建议。 显色原位HCR技术及其在常规组织学中的应用。 数字病理学 NA 原位杂交链式反应(HCR) NA 图像 NA NA 靶向RNA检测 NA NA
346 2026-08-12
Hypomethylation of FAM83A in lung adenocarcinoma mirrors an epigenetic signature of airway cell differentiation states
2026-Jun-07, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究探讨了肺腺癌中FAM83A基因的DNA低甲基化现象,并发现其表达与气道上皮细胞的分化状态相关,而非单纯的表观遗传异常。 首次揭示FAM83A在肺腺癌中的激活并非源于异常的DNA去甲基化过程,而是反映了肿瘤细胞向气道分化程序的转变,这与癌症生殖系基因MAGEA1的异常激活机制不同。 未明确提供样本量及具体平台信息,可能影响结果的普遍性。 阐明肺腺癌中FAM83A基因低甲基化及其表达上调的细胞起源,区分其究竟是表观遗传异常还是细胞分化重编程的结果。 正常肺组织、肺腺癌细胞系和组织样本,以及原代和永生化人肺基底细胞。 表观遗传学、癌症生物学 肺腺癌 单细胞RNA测序、RT-qPCR、亚硫酸盐测序、转录组分析 NA 转录组数据、甲基化数据、基因表达数据 未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
347 2026-08-12
NOTCH3 regulates myofibroblastic CAF differentiation via the P62-ROS signaling axis to promote bladder cancer progression
2026-Jun-06, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 本研究整合患者来源的癌相关成纤维细胞、批量与单细胞转录组学、空间转录组学及多队列临床数据,系统解析了NOTCH3通过P62-ROS信号轴调控肌成纤维细胞分化以促进膀胱癌进展的机制 首次揭示NOTCH3通过招募HSPA8促进P62的K48连接泛素化降解,抑制P62-NRF2抗氧化通路,维持细胞内ROS积累,从而驱动肌成纤维细胞分化,并整合上游TGF-β信号与氧化还原和蛋白稳态控制 摘要未提及研究的局限性 阐明癌相关成纤维细胞促进膀胱癌恶性进展的分子机制,并评估NOTCH3作为潜在治疗靶点的价值 膀胱癌患者来源的癌相关成纤维细胞和正常成纤维细胞,以及皮下和原位膀胱癌小鼠模型 癌症生物学 膀胱癌 批量RNA测序、单细胞转录组学、空间转录组学、免疫组化、多重免疫荧光、PCR、免疫印迹、免疫荧光 NA 转录组数据、组织图像、细胞实验数据、小鼠模型数据 多队列临床数据集及患者来源的成纤维细胞和小鼠模型(具体数量未提及) NA 单细胞转录组学、空间转录组学、批量RNA测序 NA NA
348 2026-08-12
Pan-cancer single-cell and spatial transcriptomics analyses delineate response-associated heterogeneity and therapeutic targets of tumor-infiltrating B cells following immune checkpoint blockade
2026-Jun-05, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 通过泛癌单细胞与空间转录组学分析,描绘了肿瘤浸润B细胞在免疫检查点阻断治疗中的反应相关异质性和治疗靶点 首次构建了泛癌ICB反应B细胞图谱,整合了单细胞和空间转录组数据,并利用Geneformer模型进行全基因计算机模拟扰动以识别关键候选基因 未提及具体局限性 揭示肿瘤浸润B细胞在免疫检查点阻断治疗中的生物学功能、空间生态位和交叉对话的异质性,并识别潜在的临床生物标志物和治疗靶点 肿瘤浸润B细胞及其亚群 单细胞转录组学、空间转录组学 泛癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、NMF分析、拟时间轨迹分析、Geneformer模型 Geneformer 单细胞转录组数据、空间转录组数据、TCGA数据 688个单细胞转录组,涵盖24种癌症类型,共241,645个细胞 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
349 2026-08-12
Upregulation of ADAM19 in dendritic cells is associated with immune features and lower C-peptide levels in type 1 diabetes mellitus
2026-Jun-05, Diabetology & metabolic syndrome IF:3.4Q2
研究论文 该研究探讨了1型糖尿病中树突状细胞ADAM19表达与免疫特征及C肽水平的关联 首次揭示ADAM19在T1DM DCs中的表达上调与免疫失调和β细胞功能障碍相关,并评估其作为生物标志物的潜力 研究主要基于公共数据集和有限样本,需进一步验证ADAM19作为生物标志物的诊断和治疗应用 探究T1DM中DCs内ADAM19表达与免疫特征的关系,并评估其作为候选生物标志物的可能性 外周血单个核细胞和胰腺组织中的树突状细胞以及T1DM患者和健康对照样本 数字病理学 1型糖尿病 RNA测序 偏最小二乘判别分析 基因表达数据 总共涉及多个数据集,包括129个PBMC样本(75例T1DM,54例对照)、20个内部PBMC样本(13例T1DM,7例对照)、117个scRNA-seq样本(55例T1DM,62例对照)以及44个PBMC验证样本(29例T1DM,15例对照) NA 批量RNA测序,单细胞RNA测序 NA NA
350 2026-08-12
MMP9 Genotype and Systemic T-Cell Subsets Correlate With Structural and Functional Outcomes in Neovascular Age-Related Macular Degeneration
2026-06-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究探讨了MMP9基因型与系统性T细胞亚群对新生血管性年龄相关性黄斑变性结构和功能治疗结果的影响 首次将MMP9基因型与T细胞亚群频率结合,分析其在nvAMD治疗结果中的关联,并利用单细胞RNA测序和深度学习的OCT图像分析 样本量较小,特别是免疫表型分析仅涉及9名患者,可能限制统计效力 评估MMP9基因型和T细胞亚群频率对nvAMD结构和功能治疗结果的影响 新生血管性年龄相关性黄斑变性(nvAMD)患者 数字病理学 新生血管性年龄相关性黄斑变性 单细胞RNA测序、ELISA、流式细胞术、基因分型、深度学习OCT图像分析 深度学习 RNA测序数据、图像、免疫表型数据 38名nvAMD患者,其中9名进行了高维免疫表型分析 NA 单细胞RNA测序、流式细胞术 NA NA
351 2026-08-11
Lipa regulates myeloid differentiation and is essential for intra-plaque macrophage accumulation during atherogenesis
2026-Jun-29, Journal of lipid research IF:5.0Q1
研究论文 该研究探讨了溶酶体酸性脂肪酶在动脉粥样硬化过程中对髓系分化和斑块内巨噬细胞积聚的调节作用 首次揭示巨噬细胞特异性LIPA在动脉粥样硬化中的保护作用,通过调节单核细胞发育和CD36表达影响泡沫细胞形成,为动脉粥样硬化治疗提供新靶点 研究可能未完全模拟人类LIPA缺陷的复杂性,且小鼠模型与人类病理生理差异可能限制直接转化 阐明巨噬细胞中LIPA对动脉粥样硬化发展的功能重要性及其机制 Lipa缺陷小鼠(LipaApoe和LipaApoe)及其骨髓移植小鼠 病理学 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序 小鼠基因敲除模型,单细胞RNA测序 单细胞转录组数据,流式细胞术数据 多种基因型小鼠,包括LipaApoe和LipaApoe,具体数量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
352 2026-08-11
PDAP1 reprograms fatty acid metabolism and drives malignant transformation via HSPA8-Mediated ERK/MAPK activation in hepatocellular carcinoma
2026-06, Metabolism: clinical and experimental
研究论文 本研究揭示了PDAP1通过稳定HSPA8 mRNA激活ERK/MAPK通路,重编程脂肪酸代谢,从而促进肝细胞癌进展和转移的分子机制 首次阐明PDAP1作为RNA结合蛋白在肝细胞癌脂肪酸代谢重编程中的具体作用,并揭示其通过HSPA8介导的ERK/MAPK信号通路调控SREBP1和PPARα表达的新机制 摘要中未提及研究的局限性 探讨PDAP1在肝细胞癌脂肪酸代谢重编程和恶性转化中的功能及分子机制 肝细胞癌临床标本、肝癌细胞系及多种小鼠模型(皮下肿瘤、原位肝肿瘤、肺和肝转移模型) 癌症生物学,分子生物学 肝细胞癌 RNA测序(bulk和单细胞)、RNA免疫沉淀、RNA pull-down实验、脂质代谢相关实验、CCK-8、集落形成、EdU、伤口愈合、transwell侵袭、流式细胞术 NA 基因表达数据、临床数据、测序数据 未明确样本数量,涉及临床标本和多种小鼠模型 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
353 2026-08-11
Single-cell profiling reveals peripheral blood immune landscape remodelling in breast cancer lymph node metastasis
2026-06, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序分析乳腺癌淋巴结转移患者外周血免疫细胞图谱,揭示了与转移相关的免疫微环境重塑及LGALS9-HAVCR2信号轴的作用 首次系统描绘乳腺癌淋巴结转移中外周血免疫细胞亚群的变化,鉴定了新的促转移和抗转移免疫特征,并验证了LGALS9-HAVCR2轴在免疫抑制中的关键作用 样本量较小(仅6例PBMC样本),且需进一步在更大队列中验证发现的生物标志物和治疗靶点 阐明乳腺癌淋巴结转移相关的系统性免疫环境变化,寻找潜在的生物标志物和治疗靶点 乳腺癌患者的外周血单核细胞(PBMCs)及乳腺组织 单细胞转录组学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq) NA 单细胞转录组和T细胞受体序列数据 6例乳腺癌患者(淋巴结转移阳性3例,阴性3例)的PBMC,以及14例乳腺癌组织的单细胞数据 10x Genomics 单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 和 V(D)J 测序
354 2026-08-09
Stromal and endothelial transcriptional changes during progression from MGUS to myeloma and after treatment response
2026-Jun-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序技术,揭示从意义未明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)进展至多发性骨髓瘤(MM)及治疗应答过程中,骨髓微环境中非免疫细胞(内皮细胞和间充质干细胞)的转录组变化 首次在遗传工程小鼠模型中描绘MGUS向MM进展过程中内皮细胞和间充质干细胞的动态转录组变化,并识别出由干扰素驱动的协调程序,该程序在治疗后受到抑制 研究主要基于小鼠模型,患者样本验证仅用于确认干扰素特征,未涉及功能实验或临床结局关联 阐明多发性骨髓瘤进展过程中骨髓微环境非免疫细胞的转录组变化及治疗对其的影响 内皮细胞(EC)和间充质干细胞(MSC) 单细胞转录组学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 不适用 单细胞转录组数据 遗传工程小鼠模型(BIcγ1和MI模型)及患者样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'转录组测序
355 2026-08-09
MYDGF promotes pathological and physiological retinal angiogenesis via the Gαi1/3-Gab1-Akt-mTOR signaling
2026-Jun-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序及人类患者验证,发现髓系来源生长因子(MYDGF)通过Gαi1/3-Gab1-Akt-mTOR信号轴促进病理性及生理性视网膜血管生成 首次识别MYDGF作为视网膜血管动力学调控的关键因子,并阐明其通过Gαi1/3-Gab1-Akt-mTOR轴促进血管生成的新机制 未明确提及 探究视网膜新生血管(RNV)发生发展中的关键调控因子及机制 视网膜内皮细胞、新生小鼠、雄性小鼠、增殖性糖尿病视网膜病变患者样本 分子生物学 增殖性糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确提及具体样本量 未明确提及 单细胞RNA测序 未明确提及 NA
356 2026-08-09
Cluster replicability in single-cell and single-nucleus atlases of the mouse brain
2026-Jun-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 评估两个大型小鼠脑图谱中细胞集群的可重复性,通过转录组范围的邻居投票识别相互匹配的集群对。 首次对小鼠脑图谱中的细胞集群进行系统性的可重复性评估,利用转录组范围的邻居投票方法,并整合空间定位和基因表达协调性。 区分相近集群比区分一个集群与大多数其他集群更具挑战性,尤其是在使用标记基因时。 评估单细胞和单核RNA测序图谱中细胞集群的可重复性,为研究图谱定义的集群及其生物学意义提供更坚实的基础。 两个大型小鼠脑图谱中的细胞集群,来自多个物种的数据集。 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序、单核RNA测序 邻居投票 转录组数据 超过400万个细胞,超过5000个集群,来自两个小鼠脑图谱 NA 单细胞RNA测序、单核RNA测序 NA NA
357 2026-08-09
Interleukin-19 ameliorates drug-induced liver injury by limiting proinflammatory macrophage infiltration via SUMOylation of C/EBPβ
2026-Jun-18, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究探讨了白细胞介素-19(IL-19)通过促进C/EBPβ的SUMO化修饰来限制促炎巨噬细胞浸润,从而改善对乙酰氨基酚诱导的肝损伤,并揭示了其分子机制。 首次揭示了IL-19通过促进C/EBPβ的SUMO化修饰抑制促炎基因表达,从而限制S100A8/A9+促炎巨噬细胞浸润,改善药物性肝损伤的新机制。 研究主要基于小鼠模型,尚需在人体中验证;未深入探讨IL-19在其他类型肝损伤中的作用。 研究IL-19在对乙酰氨基酚诱导的肝损伤(AILI)中的作用及其分子机制,并评估其作为治疗靶点的潜力。 Il19缺陷小鼠、髓系细胞特异性Il20r2敲除小鼠以及肝巨噬细胞。 机器学习和数字病理学 药物性肝损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq),基因敲除,重组蛋白处理 单细胞转录组分析 基因表达数据(单细胞RNA测序数据) 使用Il19缺陷小鼠、髓系细胞特异性Il20r2敲除小鼠及野生型对照小鼠,具体样本量未在摘要中提及。 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 未提供。
358 2026-08-09
MGCL-ST: multi-view graph contrastive learning for spatial transcriptomics imputation
2026-Jun-04, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 提出MGCL-ST,一种多视图图对比学习方法,用于空间转录组数据的超分辨率插补,通过联合建模局部和全局空间图以及组织学特征来提高基因表达预测的准确性。 首次将多视图图对比学习应用于空间转录组插补,并整合病理学基础模型提取的组织学特征,以增强跨平台的插补性能和生物学解释性。 未明确提及,但可能受限于对高质量组织学图像的依赖以及不同平台间的可迁移性。 开发一种精确超分辨率的空间转录组插补方法,以解决空间数据稀疏性和分辨率不足的问题。 空间转录组数据,包括来自不同平台的未测量基因表达。 机器学习 肿瘤微环境分析(癌症相关) 空间转录组测序 图对比学习模型 空间基因表达数据和组织学图像 未明确说明样本数量,但评估涉及三个不同的空间转录组平台。 NA 空间转录组学 NA 具体平台未在标题和摘要中提供
359 2026-08-09
Tumor-infiltrating B cells inhibit nasopharyngeal carcinoma metastasis
2026-Jun-02, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光技术揭示了肿瘤浸润B细胞在鼻咽癌非转移组织中高度富集并形成完整三级淋巴结构,通过分泌IL-12和CXCL13等细胞因子抑制肿瘤转移的机制 首次阐明肿瘤浸润B细胞通过IL-12介导的EMT/血管拟态抑制和CXCL13介导的TLS形成双重通路协同抑制鼻咽癌转移,并验证了其在人源化小鼠模型中的抗肿瘤效果 未提及具体局限性,可能包括样本量有限或体外实验与体内环境的差异 探究鼻咽癌中肿瘤浸润B细胞的分布特征及其抗转移机制,评估其免疫治疗潜力 鼻咽癌组织中的肿瘤浸润B细胞及其微环境 数字病理学 鼻咽癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、免疫荧光图像 未明确提及具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
360 2026-08-08
Single-cell analyses identify the ginseng embryonic protoderm as a native compartment for high-efficiency ginsenoside production
2026-Jun-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 单细胞分析表明人参胚胎原表皮是高效生产人参皂苷的天然区室。 首次通过单细胞转录组和质谱成像揭示人参胚性愈伤组织原表皮具有与森林人参相当的人参皂苷积累能力,并发现组蛋白乙酰化和染色质可及性增强与这一能力相关。 研究主要在体外培养的胚性愈伤组织中进行,可能无法完全模拟天然人参的生长环境,且未深入探索长期稳定性。 探究人参胚性愈伤组织原表皮作为高效生产人参皂苷的天然生物区室的潜力。 人参胚性愈伤组织的原表皮细胞。 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组测序、质谱成像、表观遗传学分析 NA 单细胞转录组数据、质谱成像数据、表观遗传学数据 未明确说明样本数量,涉及人参胚胎愈伤组织。 NA 单细胞转录组测序、质谱成像、表观遗传学分析 NA NA
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