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当前共找到 956 篇文献,本页显示第 321 - 340 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
321 2026-06-23
An Integrative Strategy Delineates Modular Metabolic Remodeling and Potential Therapeutic Targets Across Metabolic Diseases
2026-Jun-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过整合单细胞RNA测序数据构建跨代谢疾病的代谢图谱,揭示模块化代谢重塑并鉴定潜在治疗靶点 首次建立跨7种主要代谢疾病的单细胞代谢图谱,并开发整合分析策略将227条代谢通路组织为15个协同代谢模块,阐明模块特异性重塑的跨细胞类型调控回路 未明确提及,但可能包括数据来源异质性、功能验证不足等 探究不同代谢通路在代谢疾病中的临床相关性及机制 来自86名患者的562699个单细胞,涵盖七种主要代谢疾病 机器学习 代谢疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 86名患者的562699个单细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
322 2026-06-23
Condition-Associated Pattern Extraction and Recovery From Multi-Condition Single-Cell RNA-seq Data With CAPER
2026-Jun-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 CAPER是一个矩阵分解框架,用于从多条件单细胞RNA-seq数据中提取并恢复与条件相关的生物学信号 CAPER能够明确区分共同生物学状态与条件特异性变异,直接输出可解释且批次校正的表达矩阵,保留并分离目标信号,优于现有方法 文章未明确提及局限性 开发一种鲁棒且可解释的工具,从多条件单细胞RNA-seq数据中恢复生物学信号,支持疾病研究和功能基因组学发现 多条件单细胞RNA-seq数据中的生物学信号和条件特异性变异 机器学习 肺腺癌, 1型糖尿病 单细胞RNA测序 矩阵分解 基因表达数据 包括模拟数据及三个真实数据集:高信噪比的PBMC免疫刺激数据、混杂信噪比的LUAD肿瘤微环境数据、低信噪比的T1D复杂自身免疫疾病数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
323 2026-06-23
Longitudinal Single-Cell RNA-Sequencing Reveals Evolution of Micro- and Macro-states in Chronic Myeloid Leukemia
2026-Jun-22, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 利用纵向单细胞RNA测序揭示慢性髓系白血病微状态和宏状态的演变 通过整合单细胞与批量转录组数据,运用状态转换理论,从理论层面解释了为何单细胞层面的离散疾病表型不清晰,而聚合的宏状态层面能清晰显现,为理解疾病演变提供了新框架 主要基于慢性髓系白血病数据验证,在其他癌症和复杂疾病中的通用性有待进一步验证 探索单细胞RNA测序与批量转录组数据中慢性髓系白血病的信息内容,澄清离散疾病表态如何从噪声单细胞数据中涌现 慢性髓系白血病患者的单细胞转录组数据 机器学习 慢性髓系白血病 单细胞RNA测序 状态转换模型 基因表达数据 未明确说明样本量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
324 2026-06-23
Molecular heterogeneity in systemic sclerosis skin: insights from single-cell and spatial omics, and implications for disease stratification and cutaneous assessment
2026-Jun-22, The British journal of dermatology
综述 本文综述了单细胞和空间多组学技术揭示系统性硬化症皮肤分子异质性的研究,并探讨其对疾病分层和皮肤评估的意义 整合2021年至2025年间单细胞RNA测序和空间转录组学的研究成果,挑战了皮肤纤维化为统一过程的传统观点,提出不同细胞和空间程序可能贡献于临床上相似的皮肤受累模式 研究依赖于已发表文献,缺乏前瞻性队列验证;结论能否改善患者分层、治疗选择或皮肤结局评估取决于在更大规模临床特征明确的队列中的前瞻性验证 综合单细胞和空间多组学研究的发现,探讨分子异质性与临床表型的关系,以及其对皮肤评估、治疗反应异质性和患者亚组划分的意义 系统性硬化症患者的皮肤 数字病理学 系统性硬化症 单细胞RNA测序,空间转录组学 不适用 基因表达数据,空间转录组数据 不适用 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium单细胞测序平台,10x Visium空间转录组平台
325 2026-06-23
Immune subtyping of colorectal adenoma identifies a subtype with activated adaptive immunity ahead of progressing to cancer
2026-Jun-22, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过免疫分型鉴定结直肠腺瘤中具有活化适应性免疫的亚型,该亚型在进展为癌症前已存在 首次对结直肠腺瘤进行基于免疫基因的分子亚型分析,结合单细胞转录组数据揭示腺瘤中早期出现的TIGIT活化和CD8 T细胞耗竭特征 未提及具体限制 通过免疫分型表征结直肠腺瘤的免疫微环境,并评估其与癌症进展、基因表达特征及功能通路的关联 多个队列的结直肠腺瘤样本的转录组数据及单细胞转录组数据 机器学习 结直肠癌 RNA-seq 非负矩阵分解 基因表达数据 多个结直肠腺瘤队列样本 NA NA NA NA
326 2026-06-23
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing reveals a prognostic neuro-mimicry signature in papillary thyroid carcinoma
2026-Jun-22, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 联合批量与单细胞RNA测序揭示甲状腺乳头状癌中一种预后相关的神经拟态特征 首次在甲状腺乳头状癌中通过整合批量与单细胞RNA测序数据,鉴定出一个由8个离子通道基因构成、可预测淋巴结转移的预后特征,并证实该特征源于恶性甲状腺细胞而非免疫细胞,揭示了肿瘤内在的神经拟态机制 该发现尚需实验验证,且数据仅来源于公共数据库(TCGA和GSE184362),缺乏独立外部队列的验证 探索甲状腺乳头状癌中离子通道基因的神经拟态作用及其临床预后意义 521例甲状腺乳头状癌患者的转录组数据及7个整合肿瘤样本中的65,744个单细胞 机器学习 甲状腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO逻辑回归 基因表达数据, 单细胞转录组数据 521例患者(TCGA队列),7个肿瘤样本(65,744个单细胞) Illumina 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq TCGA RNA-seq数据(Illumina平台),GSE184362单细胞RNA-seq数据
327 2026-06-23
Integrated bioinformatics, single-cell analysis, and experimental validation identify quercetin as a potential therapeutic candidate for intervertebral disc degeneration
2026-Jun-22, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
research paper 整合生物信息学、单细胞分析和实验验证,确定槲皮素为椎间盘退变的潜在治疗候选药物 首次通过整合差异表达基因分析、WGCNA、PPI网络、LASSO回归及单细胞RNA测序,鉴定出ZEB2、COL6A2、CCND1、RAP1A和GATA3五个关键枢纽基因,并利用分子对接和体外实验验证了槲皮素对这些基因表达的逆转作用 未在体内模型中验证槲皮素的治疗效果;单细胞分析基于公开数据集,可能无法完全代表体内微环境;分子对接仅提供初步计算证据,未进行结合亲和力的实验测定 探索椎间盘退变的分子机制并筛选潜在治疗化合物 椎间盘退变患者的髓核组织样本及LPS诱导的髓核细胞 machine learning, digital pathology 椎间盘退变 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接 WGCNA, LASSO回归, PPI网络分析 基因表达数据, 单细胞转录组数据 GSE70362数据集包含椎间盘退变和对照髓核样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
328 2026-06-23
Integrative single-cell profiling and explainable AI identify monocyte-metabolic signatures as diagnostic biomarkers and candidate therapeutic targets in tuberculosis
2026-Jun-22, Archives of microbiology IF:2.3Q3
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和可解释人工智能,发现并验证了结核病中单核细胞免疫代谢相关的6基因诊断标志物及潜在治疗靶点 首次结合单细胞RNA测序与大规模共识机器学习框架(113种算法组合),筛选出反映单核细胞免疫代谢重编程的6基因标志物,并通过可解释性分析(SHAP)和临床ELISA验证其诊断价值,同时利用网络药理学预测天然化合物靶向治疗潜力 临床验证队列规模较小,且ELISA检测仅评估了蛋白质水平,未深入探讨标志物在不同结核病亚型(如潜伏感染、活动性结核)的区分能力 开发基于宿主免疫代谢失调的可靠、可解释的诊断标志物及候选治疗靶点,以改进结核病的快速诊断和宿主导向治疗 结核病患者的外周血单核细胞及转录组公共数据 机器学习, 数字病理学 结核病 单细胞RNA测序, 酶联免疫吸附试验, 分子对接 glmBoost + 随机森林(RF)集成模型 基因表达数据, 转录组数据, 蛋白质表达数据 多个转录组公共队列及一个独立的初步临床队列(具体样本量未在摘要中明确说明) 未明确提及 单细胞RNA测序 未明确提及 NA
329 2026-06-23
Investigating the shared genetic architecture between selective immunoglobulin A deficiency and autoimmune diseases
2026-Jun-22, Human genetics IF:3.8Q2
研究论文 系统分析选择性免疫球蛋白A缺乏症与自身免疫性疾病的共享遗传结构 通过跨性状全基因组关联研究荟萃分析,首次系统揭示IgAD与10种常见自身免疫性疾病间的多效性位点和共享遗传基础,并利用单细胞RNA测序鉴定受影响的细胞类型 仅基于大规模GWAS汇总统计数据,缺乏原始个体级数据验证;分析限于欧洲血统人群,可能不适用于其他人群 探究选择性免疫球蛋白A缺乏症与自身免疫性疾病之间的共享遗传结构及潜在机制 选择性免疫球蛋白A缺乏症和10种常见自身免疫性疾病 机器学习 自身免疫性疾病 全基因组关联研究、单细胞RNA测序、孟德尔随机化 NA 遗传数据、单细胞转录组数据 大规模GWAS汇总统计数据,具体样本量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
330 2026-06-23
The Transcription Factor EGR2 Plays a Central Role in the Expansion and Function of TCRαβ+CD4-CD8- Double Negative T Cells in lpr Lupus Mice
2026-Jun-21, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 揭示转录因子EGR2在lpr狼疮小鼠中调控TCRαβ+CD4-CD8-双阴性T细胞扩增与功能中的核心作用 首次发现EGR2在调控狼疮小鼠中TCRβDNT细胞的扩增、异质性和功能方面起关键作用,并可能通过胸腺和外周阶段促进该类细胞生成 研究仅限于小鼠模型,且未明确EGR2在人类狼疮中的直接作用机制 探究转录因子EGR2在狼疮小鼠中TCRαβ+CD4-CD8-双阴性T细胞扩增和功能中的角色 B6/lpr狼疮小鼠及条件性敲除Egr2的淋巴细胞(CD2-CreEgr2B6/lpr)模型 免疫学 狼疮 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 B6/lpr小鼠两组(Egr2条件敲除组和对照组),涉及胸腺和脾脏样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
331 2026-06-23
Mitochondrial DNA heteroplasmy drives cortical neuronal disturbances in human organoids harbouring the common m.3243A>G mutation
2026-Jun-21, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过人类iPSC衍生的大脑类器官切片模型,研究常见m.3243A>G线粒体DNA异质性对皮质神经元的影响 首次利用人类iPSC源性大脑类器官模型模拟m.3243A>G突变的线粒体疾病,揭示异质性依赖性转录变化及深层层神经元的脆弱性 未提及具体限制 阐明异质性m.3243A>G突变如何引发皮质神经元功能障碍,为线粒体疾病机制提供见解并探索治疗策略 人类iPSC来源的大脑类器官切片模型,以及一位MELAS患者的脑尸检样本 机器学习 线粒体脑肌病伴乳酸中毒及卒中样发作(MELAS型) 单细胞RNA测序,iPSC衍生类器官培养 NA 单细胞转录组数据 人类iPSC源性大脑类器官切片模型,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
332 2026-06-23
Identification of macrophage-enriched genes in ovarian cancer by single-cell RNA sequencing and establishment of a prognosis model
2026-Jun-21, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序鉴定卵巢癌中巨噬细胞富集的基因并建立预后模型 首次利用单细胞RNA测序结合hdWGCNA和LASSO回归构建七基因预后模型,揭示肿瘤相关巨噬细胞的异质性和促转移机制 模型验证仅在GEO数据集中进行,缺乏独立临床队列的外部验证;基因功能依赖生物信息学推断,需进一步实验验证 开发卵巢癌预后模型并探究肿瘤微环境中巨噬细胞的免疫调节作用 卵巢癌患者的肿瘤组织和正常组织中的免疫细胞,特别是肿瘤相关巨噬细胞 机器学习和数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 Cox回归和LASSO回归 单细胞转录组数据和基因表达数据 卵巢癌和正常组织样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
333 2026-06-23
Foxe1 deficiency impairs thyroid fate while supporting lung differentiation
2026-Jun-21, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 通过小鼠干细胞系、单细胞RNA测序和染色质可及性分析,揭示Foxe1基因缺失破坏甲状腺分化而促进肺命运的决定 首次证明Foxe1缺失导致Nkx2-1+前肠祖细胞从甲状腺命运转向肺命运,且无需额外染色质重塑 研究仅基于体外小鼠干细胞模型,尚未在体内验证 探索Foxe1在甲状腺与肺谱系分化中的调控机制 小鼠干细胞系及分化形成的类器官 数字病理学 甲状腺疾病 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序 NA 转录组和染色质可及性数据 多个小鼠干细胞系和类器官样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
334 2026-06-23
Integrating MRI radiomics and transcriptomics to predict IDH mutation status and prognosis in glioma
2026-Jun-21, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 整合MRI影像组学和转录组学预测胶质瘤IDH突变状态和预后 结合MRI影像组学特征与转录组学分析,识别与IDH突变相关的关键基因,并通过单细胞RNA测序和空间转录组学验证这些基因在特定细胞亚群中的表达及其与免疫浸润细胞的相关性 样本量较小,且验证集为外部数据集,可能需要更多多中心数据进一步验证 研究MRI影像组学特征与IDH突变相关基因的关联,以预测胶质瘤IDH突变状态和预后 胶质瘤患者 数字病理学 胶质瘤 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, Western blotting LASSO回归 图像, 文本 来自TCIA的61个MRI文件(训练集和验证集7:3)和66名经病理确认的胶质瘤患者作为外部验证集 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
335 2026-06-23
The Heterogeneity of B Cells Potentially Contributes to Metastasis of Clear Cell Renal Cell Carcinomas
2026-Jun-21, Cancer investigation IF:1.8Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序和免疫荧光成像分析,揭示B细胞异质性在透明细胞肾细胞癌转移中的潜在作用 首次通过单细胞RNA测序分类B细胞亚群,发现B细胞(HLA-DRA)亚群与ccRCC转移显著相关,并鉴定出六个与不良预后相关的上调基因 未提及具体限制 探索免疫异质性对ccRCC临床结果的影响,特别是B细胞亚群在转移中的作用 透明细胞肾细胞癌(ccRCC) 机器学习 肾细胞癌 单细胞RNA测序,免疫荧光成像 NA 单细胞转录组数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
336 2026-06-23
Integrative multi-omics analysis and machine learning identify M2 macrophage-induced ferroptosis resistance in glioblastoma
2026-Jun-20, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 整合多组学数据与机器学习,揭示M2型巨噬细胞诱导胶质母细胞瘤铁死亡抵抗的机制 首次发现M2型巨噬细胞通过NCOA4-FTH1通路赋予胶质母细胞瘤铁死亡抵抗,揭示了免疫微环境与程序性细胞死亡之间的关键串扰 未提及明确局限性 探究肿瘤相关巨噬细胞与铁死亡在胶质母细胞瘤进展中的功能相互作用 胶质母细胞瘤细胞及肿瘤相关巨噬细胞 机器学习教育 胶质母细胞瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 机器学习模型(28基因预后特征) 转录组数据 公共队列数据 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
337 2026-06-23
Targeting Gli1+ Cells for Oral Tissue Regeneration and Disease Treatment
2026-Jun-20, Stem cell reviews and reports IF:4.5Q2
综述 总结Gli1细胞在口腔组织再生和疾病治疗中的作用及机制 整合了谱系追踪和单细胞RNA测序技术的新发现,将Gli1细胞从简单的通路效应物重新定义为异质性间充质干细胞亚群,并系统探讨其在口腔再生医学中的治疗潜力 作为综述,可能缺乏原始实验数据支持,部分结论依赖于现有研究的整合,且未能提供具体的临床转化方案 总结Gli1细胞在口腔组织发育、稳态维持、损伤修复和疾病进展中的作用,为基于Gli1细胞的再生治疗提供理论依据 Gli1阳性细胞及其在口腔组织中的功能和调控机制 数字病理学 口腔疾病 谱系追踪技术, 单细胞RNA测序 NA 文本数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于分析口腔组织中Gli1细胞的异质性
338 2026-06-23
Single-cell and multi-omics integration delineates the landscape of gene-wise intratumor heterogeneity and identifies prognostic biomarkers for immunotherapy in non-small cell lung cancer
2026-Jun-20, Cancer immunology, immunotherapy : CII
research paper 利用单细胞和多组学整合分析,描绘非小细胞肺癌中基因层面瘤内异质性的景观,并识别免疫治疗预后生物标志物 首次通过多区域单细胞RNA测序数据与计算框架结合,系统刻画非小细胞肺癌中基因层面的瘤内异质性景观,并构建基于低异质性基因的LITHrisk评分,有效预测免疫治疗预后和反应 未明确指出,但可能包括样本量有限、需在更大队列中验证、计算框架的稳健性需进一步评估 探究非小细胞肺癌中基因层面瘤内异质性,并开发基于低异质性基因的预后生物标志物以提升免疫治疗预测可靠性 非小细胞肺癌肿瘤组织及细胞 machine learning lung cancer scRNA-seq, RNA-seq CNN, LSTM, GAN NA NA NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
339 2026-06-23
Dual blockade of PD-1 and NKG2A prevents NK cell senescence and reprograms the immunosuppressive microenvironment in pancreatic cancer
2026-Jun-20, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究揭示PD-1和NKG2A双重阻断可预防胰腺癌中NK细胞衰老并重编程免疫抑制微环境 首次发现ICB诱导的IFN-γ信号上调肿瘤细胞H2-T23,与NK细胞NKG2A相互作用通过p38 MAPK和STAT1/3通路诱导NK细胞衰老,并证明PD-1和NKG2A双重阻断能有效预防衰老、恢复NK功能并增强抗肿瘤免疫 未在文中详细说明局限性,但可能涉及临床转化验证不足或样本规模有限 探究胰腺导管腺癌中免疫检查点阻断疗效有限的原因及克服耐药的新策略 胰腺导管腺癌细胞、NK细胞、CD8 T细胞 机器学习 胰腺癌 单细胞测序 NA 单细胞测序数据 九种癌症类型的单细胞测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
340 2026-06-23
Comprehensive investigation of hypoxia-associated genes and their predictive significance in osteosarcoma
2026-Jun-20, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 对骨肉瘤中低氧相关基因进行综合研究并探讨其预测意义 开发了一个称为细胞低氧预测框架的数据驱动建模框架,整合单细胞转录组谱与低氧基因特征,并发现低氧细胞主要局限于肿瘤核心区域以及一个具有高侵袭潜能的低氧亚群 未明确说明,但可能涉及样本量有限或缺乏外部验证 探究低氧对骨肉瘤侵袭的影响并识别可靠的基因特征以预测预后 骨肉瘤细胞中的低氧状态及相关基因 数字病理学 骨肉瘤 单细胞转录组测序 预测模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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