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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-06-25 |
Tumor-derived progranulin promotes macrophage cholesterol efflux and associated immunosuppressive features in oral squamous cell carcinoma
2026-Jun-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08422-5
PMID:42337741
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序等手段揭示了口腔鳞状细胞癌中肿瘤来源的颗粒蛋白前体通过调控巨噬细胞胆固醇外流促进免疫抑制特征的作用机制 | 首次鉴定出口腔鳞状细胞癌中高表达PGRN的恶性上皮细胞亚群,并阐明其通过SORT1-PPARγ-LXRα-ABCA1/ABCG1信号轴调控巨噬细胞胆固醇外流及免疫抑制表型 | 临床样本量较小(3例OSCC原发肿瘤),且免疫抑制特征的临床相关性尚需进一步验证 | 阐明口腔鳞状细胞癌中肿瘤来源的PGRN调控巨噬细胞胆固醇外流及相关免疫抑制特征的分子机制 | 口腔鳞状细胞癌原发肿瘤样本及头颈部鳞状细胞癌相关公共数据集中的巨噬细胞 | digital pathology | oral squamous cell carcinoma | scRNA-seq, genetic knockdown, pharmacologic inhibition, PPARγ signaling activation | NA | 单细胞转录组数据 | 3例OSCC原发肿瘤,77例HNSCC相关公共数据集样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 302 | 2026-06-25 |
Single-cell transcriptomics unveils pyroptosis-related immune microenvironment dynamics and prognostic modeling in esophageal squamous cell carcinoma
2026-Jun-23, Journal of cardiothoracic surgery
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13019-026-04474-2
PMID:42337781
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示食管鳞状细胞癌中焦亡相关的免疫微环境动态及预后模型构建 | 首次利用单细胞RNA测序整合7例食管癌组织和1例正常对照,系统解析了焦亡相关基因在食管癌免疫微环境中的动态变化,并构建了基于GSDMB和CYCS的双基因焦亡相关预后模型 | 预后模型在外部验证集GSE53625中表现有限,该模型应视为探索性预后特征而非经临床验证的预测工具 | 表征食管癌中焦亡相关的免疫机制并构建临床预测模型以改进预后评估 | 食管鳞状细胞癌组织及正常对照组织中的免疫细胞亚群 | 机器学习和数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 预后模型(基于GSDMB和CYCS的双基因模型) | 单细胞转录组数据和批量转录组数据 | 7例食管癌组织及1例正常对照组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 303 | 2026-06-25 |
Single-Cell Transcriptomic Landscape of Smoking-Related Periodontitis
2026-Jun-23, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70392
PMID:42338007
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术揭示吸烟相关牙周炎的细胞组成和分子微环境特征 | 首次在单细胞水平描绘吸烟相关牙周炎的细胞图谱,并发现CXCR6+调节性T细胞与衰老上皮细胞通过CXCL16-CXCR6轴及CD2-CD58相互作用的致病机制 | 样本数量较少(健康对照2例、牙周炎2例、吸烟相关牙周炎3例),后续需扩大样本量验证 | 阐明吸烟相关牙周炎的细胞组成和分子微环境特征 | 牙周组织样本(健康对照、牙周炎患者、吸烟相关牙周炎患者) | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康对照2例、牙周炎2例、吸烟相关牙周炎3例 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 304 | 2026-06-25 |
Single-Cell Transcriptomics in Triple-Negative Breast Cancer: Implications for Radionuclide Therapy in Precision Oncology
2026-Jun-23, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1177/10849785261458513
PMID:42338131
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研究论文 | 利用单细胞转录组学解析三阴性乳腺癌的异质性,并识别与放射性核素治疗相关的潜在分子靶点 | 首次将单细胞转录组学与孟德尔随机化分析结合,系统鉴定三阴性乳腺癌中放射性核素治疗相关的风险基因和保护基因,为精准肿瘤学提供新策略 | 研究仅基于公开数据集GSE155109,样本量有限,且缺乏体内实验验证,结果需进一步临床验证 | 阐明三阴性乳腺癌的基因表达特征和细胞异质性,为放射性核素治疗提供分子靶点和理论依据 | 三阴性乳腺癌肿瘤微环境中的细胞群体,包括内皮细胞、基质细胞和恶性细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、qRT-PCR | UMAP、扩散伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 公开数据集GSE155109,样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于GSE155109数据集的单细胞转录组分析,使用Scanpy进行质控和聚类 |
| 305 | 2026-06-25 |
Multi-omics analyses reveal BPA accelerates glioma progression via cell cycle dysregulation
2026-Jun-22, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2026.128624
PMID:42331244
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研究论文 | 通过多组学分析揭示双酚A通过细胞周期失调加速胶质瘤进展 | 首次整合多组学分析与实验验证,阐明环境内分泌干扰物BPA通过结合细胞周期相关蛋白促进胶质瘤恶性进展的新机制 | 未明确具体样本量及临床验证数据,部分靶点预测依赖计算模型 | 探究BPA对胶质瘤恶性进展的影响及其分子机制 | BPA的潜在靶点、胶质瘤相关基因、单细胞RNA测序数据 | 计算机视觉 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、分子对接、机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 306 | 2026-06-25 |
Hierarchical classification of immune cell transcriptomes at population-scale
2026-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.30.728980
PMID:42282793
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研究论文 | 提出了一种基于分层分类的免疫细胞转录组分析方法,应用于大规模人群研究 | 构建了独立的统一专家注释资源Suco和模块化分层分类器Compocyte,显著优于现有分类器,并能在大规模人群中识别新的免疫细胞亚型 | 依赖专家注释的准确性和可重复性,可能无法涵盖所有稀有细胞类型 | 实现大规模单细胞RNA测序数据的免疫细胞自动准确分类 | 从3965名患者中提取的1560万个白细胞 | 计算机视觉 | 肿瘤免疫、细胞因子释放综合征、转移性疾病 | 单细胞RNA测序 | 分层分类器 | 单细胞转录组数据 | 3965名患者的1560万个白细胞,来自50项研究(含3个新生成数据集) | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 307 | 2026-06-25 |
Protocol for identifying recirculating thymic regulatory T cells and characterizing the role of Eos in their function using scRNA-seq and TCR-seq
2026-Jun-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104620
PMID:42258356
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研究论文 | 提供一种使用单细胞RNA测序和TCR测序鉴定小鼠胸腺再循环调节性T细胞并表征Eos在其功能中作用的实验方案 | 首次提出基于单细胞RNA测序和TCR测序数据的精细分类方法,用于鉴定胸腺再循环调节性T细胞并揭示Eos转录因子在其中的功能作用 | 仅基于小鼠模型,缺乏人类样本验证;方案依赖特定实验设备和计算分析流程 | 建立鉴定胸腺再循环调节性T细胞并研究Eos在它们功能中作用的实验方案 | 小鼠胸腺中的再循环调节性T细胞及Eos转录因子 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序、TCR测序、流式细胞术、磁珠分选 | NA | 单细胞基因表达数据、TCR序列数据 | 小鼠胸腺细胞样本(具体数量未在摘要中提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒及TCR测序试剂盒 |
| 308 | 2026-06-25 |
Lamprey 3D single-cell transcriptomics reveals ancestral and specialized features of the vertebrate brain
2026-Jun-18, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aea2535
PMID:42313957
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研究论文 | 利用空间转录组学和单核RNA测序,构建了七鳃鳗大脑的三维分子图谱,揭示了脊椎动物大脑的祖先特征和特化特征 | 首次从三维分子层面解析了七鳃鳗大脑的细胞结构,并通过跨物种比较揭示了脊椎动物大脑的保守组织蓝图和谱系特异的神经元分化 | 未明确提及,可能包括样本数量、跨物种比较的深度或技术本身的局限性 | 阐明脊椎动物大脑进化的祖先特征和谱系特化的细胞机制 | 七鳃鳗大脑的细胞类型和空间组织 | 数字病理学,计算生物学 | NA | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 基因表达数据,空间位置数据 | 七鳃鳗大脑组织,14个脑区,209个细胞簇 | NA | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | NA |
| 309 | 2026-06-25 |
Transcriptional and functional profiling reveals unique activation of Adapter CAR T cells in acute myeloid leukemia
2026-Jun-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08461-y
PMID:42316369
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研究论文 | 本文通过功能分析和单细胞RNA测序系统研究了急性髓系白血病模型中适配体浓度对适配体CAR T细胞激活、转录状态和功能的影响,并鉴定出关键基因特征 | 首次系统揭示了适配体浓度如何调控适配体CAR T细胞的激活动力学、转录状态和代谢重编程,并识别出跨不同适配体和靶细胞的标志基因特征 | 未提及具体限制 | 阐明适配体浓度对适配体CAR T细胞反应的调控机制,为优化适配体剂量以增强可调控CAR T细胞疗法的安全性和有效性提供见解 | 适配体CAR T细胞和急性髓系白血病模型 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 310 | 2026-06-25 |
Single-cell transcriptome profiling of primordial germ cells reveals differences between right and left gonads in chickens
2026-Jun-10, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.107247
PMID:42335766
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示鸡胚胎左右性腺中原始生殖细胞的差异 | 首次在单细胞水平上揭示了鸡胚左右性腺原始生殖细胞在早期分化阶段的转录差异,并发现从DNA损伤/细胞周期程序到衰老相关程序的阶段性转变以及右侧特有的NOTCH信号相互作用 | 仅分析了两个发育时间点(HH29和HH34),缺乏更早或更晚时间点的动态变化数据;qPCR验证仅限于部分基因,缺乏功能验证实验 | 探究雌性鸡胚左右性腺中原始生殖细胞在早期性腺分化过程中的差异及其调控机制 | 雌性鸡胚左右性腺中的原始生殖细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序、qPCR | NA | 单细胞转录组数据 | HH29和HH34阶段的雌性鸡胚左右性腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 311 | 2026-06-25 |
Multi-Dimensional Transcriptomics Reveals the Prominent Role of Neuroinflammation in Alzheimer's Disease
2026-Jun-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115020
PMID:42278544
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综述文章 | 本文综述了多组学转录组学技术在揭示阿尔茨海默病神经炎症中的关键作用 | 系统性地整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,刻画了阿尔茨海默病神经炎症的细胞和分子图谱,揭示了微胶质细胞和星形胶质细胞的状态特异性转变及区域异质性 | 仅基于现有研究进行综述,未提出新实验数据 | 探讨阿尔茨海默病中神经炎症的机制,概述单细胞和空间组学平台的技术演进与比较能力 | 阿尔茨海默病动物模型和人类脑组织样本 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 312 | 2026-06-25 |
Identification of Polyamine Metabolism-Related Biomarkers in Psoriasis: A Study Based on Transcriptomics and Single-Cell Sequencing
2026-Jun, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70289
PMID:42223029
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research paper | 基于转录组学和单细胞测序技术鉴定银屑病中多胺代谢相关生物标志物 | 首次综合运用转录组学与单细胞RNA测序技术,结合多种机器学习算法和诊断列线图,系统鉴定出五个多胺代谢相关基因(PSME2、PSMB5、PSMC4、PSMB10和SMOX)作为银屑病的新型生物标志物,并深入揭示其在树突状细胞分化中的动态表达 | 研究主要基于公开数据集和体外实验验证,缺乏临床样本的进一步验证及多中心研究支持 | 鉴定银屑病中多胺代谢相关基因作为生物标志物并阐明其机制 | 银屑病患者的皮肤组织样本及相关细胞类型 | machine learning | psoriasis | RNA-seq, scRNA-seq | CNN | transcriptomics, single-cell sequencing data | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 313 | 2026-06-25 |
Exploring the potential targets and mechanisms of artemisinin in the treatment of diabetic kidney disease using network pharmacology and molecular docking
2026-Jun-01, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01894-0
PMID:42223693
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研究论文 | 利用网络药理学和分子对接技术探索青蒿素治疗糖尿病肾病(DKD)的潜在靶点与机制 | 首次通过网络药理学、转录组数据、三种机器学习算法及单细胞测序分析,识别出FLT1为青蒿素治疗DKD的关键靶点,并通过体外实验验证了青蒿素通过恢复FLT1表达缓解高糖诱导的肾小球内皮细胞损伤 | 研究仅限于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;FLT1的上下游信号通路机制尚未完全阐明 | 探讨青蒿素对DKD的潜在治疗作用及其分子机制 | 人肾小球内皮细胞(HRGECs)在高糖损伤模型下的反应 | 机器学习, 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 网络药理学, 分子对接, RNA-seq, 单细胞测序, Western blot, MTT, TUNEL, ELISA | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 64个共同靶点;人类肾小球内皮细胞(HRGECs) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 314 | 2026-06-25 |
The role of stem cells in pituitary tumour formation
2026-Jun-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-26-0171
PMID:42227347
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综述 | 总结干细胞在垂体肿瘤形成中的作用及当前研究证据 | 系统总结垂体干细胞和肿瘤干细胞样群体在垂体肿瘤生物学中的潜在作用,包括肿瘤起始、维持和进展,并提供了已发表的单细胞RNA测序研究的策划概述 | 研究证据主要来自有限的动物模型和体外实验,缺乏大规模临床验证 | 阐明垂体干细胞在垂体肿瘤形成中的作用及转化意义 | 垂体干细胞和肿瘤干细胞样群体 | 机器学学习 | 垂体肿瘤 | NA | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 315 | 2026-06-24 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2026-Jun, JACC. Basic to translational science
DOI:10.1016/j.jacbts.2026.101542
PMID:42090754
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学分析,揭示白细胞介素-1β在致心律失常性心肌病中的驱动作用,并验证抗IL1B中和抗体的治疗效果 | 首次在人类ACM样本中结合单核RNA测序与空间转录组学,鉴定出由纤维化、炎症和心肌细胞缺失共同构成的疾病相关空间生态位,并验证靶向IL1B的治疗潜力 | 尚未在人类临床试验中验证抗IL1B治疗的效果,且小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 | 阐明IL-1β在ACM疾病进展中的作用机制并评估靶向治疗潜力 | ACM患者心肌样本和Dsg2突变小鼠 | 数字病理学 | 致心律失常性心肌病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | ACM患者与对照供体的心肌样本 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单核RNA测序,10x Visium用于空间转录组分析 |
| 316 | 2026-06-23 |
Exploration of the Key Mechanism by Which Kaempferol Inhibits Glycolysis in Hepatocellular Carcinoma Cells via the AKT-mTOR Pathway
2026-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202600141RR
PMID:42322592
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研究论文 | 探究山奈酚通过AKT-mTOR通路抑制肝细胞癌糖酵解的关键机制 | 首次结合转录组学、单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,揭示山奈酚通过靶向AKT-mTOR通路下调CA9基因表达来调控糖酵解,从而抑制肝细胞癌进展 | 未明确说明山奈酚在体内模型中的效果及长期安全性 | 阐明山奈酚抑制肝细胞癌细胞糖酵解的分子机制 | 肝细胞癌MHCC97H和Huh7细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, Western blot, 分光光度法 | NA | 转录组数据 | 两种肝细胞癌细胞系(MHCC97H和Huh7) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 317 | 2026-06-23 |
TCF7L2 promotes abdominal aortic aneurysm through smooth muscle cell-mediated extracellular matrix remodeling
2026-Jun-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195681
PMID:42060473
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研究论文 | 研究转录因子7类似物2(TCF7L2)在腹主动脉瘤发病机制中的作用,通过平滑肌细胞介导的细胞外基质重塑促进动脉瘤形成 | 首次整合汇总数据孟德尔随机化与单细胞RNA测序,确定TCF7L2在血管平滑肌细胞中富集并与腹主动脉瘤有因果关系,并揭示了其通过调节MMP14、TIMP3和ITGB1表达驱动细胞外基质重塑的新机制 | 未明确提及,但可能包括仅在动物模型中验证和缺乏直接人体干预数据 | 阐明TCF7L2在腹主动脉瘤发病中的角色和机制,探索潜在治疗靶点 | 人及小鼠主动脉组织、血管平滑肌细胞 | 机器学习 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序、汇总数据孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据、文本 | 三个不同的腹主动脉瘤小鼠模型(血管紧张素II输注、β-氨基丙腈/血管紧张素II联合给药及弹性蛋白酶诱导) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2026-06-23 |
SpaVGMC: A Unified Representation Learning Framework via Structural and Semantic Alignment in Spatial Transcriptomics
2026-Jun-22, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.6c01121
PMID:42253102
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研究论文 | 提出SpaVGMC,一种通过结构和语义对齐进行统一表示学习的空间转录组学框架 | 首次将结构化变分表示学习、结构信息对齐和语义对齐统一在一个框架中,同时建模局部空间依赖和全局转录组织结构,无需数据增强即可实现分布感知的对比学习 | 未明确提及局限性 | 提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性,解决局部过度平滑、拓扑保真度受损和全局语义结构建模不足的问题 | 空间转录组学数据集中的组织切片及空间域 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 结构化变分自编码器、图神经网络、对比学习模型 | 空间基因表达数据 | 多个空间转录组学数据集(具体数量未提供) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 319 | 2026-06-23 |
A multi-tissue single-cell atlas of moso bamboo (Phyllostachys edulis) reveals cellular heterogeneity and lineage trajectories
2026-Jun-22, Tree physiology
IF:3.5Q1
DOI:10.1093/treephys/tpag086
PMID:42324763
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研究论文 | 对毛竹幼苗进行单细胞RNA测序,构建了包含31658个高质量转录组的细胞图谱,揭示了不同组织的细胞异质性和谱系发育轨迹 | 首次系统构建毛竹多组织单细胞转录组图谱,揭示根、茎、叶发育轨迹差异及关键调控因子 | 仅分析了幼苗阶段,未涵盖成年竹子的发育过程;功能验证实验需要进一步开展 | 阐明毛竹快速生长和适应环境的细胞基础 | 毛竹(Phyllostachys edulis)幼苗 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 毛竹幼苗,31658个高质量单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 320 | 2026-06-23 |
Spatiotemporal Dynamics of NK Cell Immune Checkpoints Tim-3 and Lag-3 in Human Pregnancy: An Integrated Peripheral and Decidual Compartment Analysis
2026-Jun-22, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioag126
PMID:42324764
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研究论文 | 本研究综合外周血和蜕膜组织分析,探讨免疫检查点Tim-3和Lag-3在人类妊娠中的时空动态变化及其在复发性流产中的作用 | 首次整合外周血和蜕膜组织,揭示妊娠期Tim-3和Lag-3在NK细胞亚群中的时空特异性表达模式,并发现可溶性Tim-3与膜结合Tim-3的负相关关系 | 样本量有限,未明确提及具体数量;未深入探讨Tim-3和Lag-3的功能机制 | 阐明免疫检查点Tim-3和Lag-3在母胎免疫调节中的时空动态变化 | 人类妊娠期外周血和蜕膜组织中的NK细胞和T细胞 | 数字病理学 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括正常妊娠和复发性流产患者的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |