单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1083 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-08-17 |
In situ graphene-seq: spatial transcriptomics and chronic electrophysiological characterization of tissue microenvironments
2026-Jun-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73883-7
PMID:42321181
|
研究论文 | 介绍了一种名为原位石墨烯测序的平台，该平台将慢性电生理记录与基于成像的空间转录组学（STARmap）相结合，用于组织微环境的多模态分析 | 创新性地将柔性网格纳米电子学与透明石墨烯/导电聚合物电极结合，实现长期单细胞级别的电生理记录与光学成像的无缝整合，并首次应用于空间转录组学，以同时获取细胞电活动和基因表达信息 | 未提及具体局限性，可能包括平台复杂性和技术整合的挑战 | 开发一种能够同时捕获细胞功能动态和分子身份的平台，以研究组织微环境如何塑造细胞行为和分子状态 | 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞和内皮细胞共培养体系 | 空间转录组学、电生理学、生物工程 | NA | 空间转录组学（STARmap）、电生理记录 | NA | 图像、电生理信号、基因表达数据 | 使用了人诱导多能干细胞来源的心肌细胞和内皮细胞共培养样本，未提及具体数量 | NA | 空间转录组学 | STARmap | STARmap技术结合柔性网格纳米电子学 |
| 302 | 2026-08-17 |
Infiltrating monocyte-derived macrophages does not survive long term in stroke brain despite their dominance in the acute ischemic core and myeloid derived IGF-1 play dichotomous roles in stroke recovery
2026-Jun-10, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01687-x
PMID:42271455
|
研究论文 | 本研究利用微胶质细胞特异性报告小鼠模型和单细胞RNA测序，解析了缺血性卒中后微胶质细胞与单核细胞来源巨噬细胞的不同时空动态和转录组特征，并揭示了髓系来源IGF-1在卒中恢复中的双重作用 | 首次利用TMEM119CreER-Ai14 tdTomato报告小鼠模型在卒中前标记微胶质细胞，清晰区分微胶质细胞与浸润单核细胞来源巨噬细胞（iMM），发现iMM在慢性期不长期存活，并鉴定出活化微胶质细胞和iMM的新标志物（如Gm21188），以及髓系IGF-1在卒中后促进T细胞浸润和影响功能恢复的新作用 | 研究基于特定小鼠模型和卒中模型，结果可能不适用于人类或其他卒中类型；iMM在卒中后30天内的长期存活观察时间有限；未深入探讨IGF-1调控T细胞浸润的具体分子机制 | 阐明卒中后微胶质细胞与单核细胞来源巨噬细胞在时空分布、转录组状态及功能上的差异，并探究髓系来源IGF-1在卒中恢复中的作用 | 卒中后大脑中的微胶质细胞和单核细胞来源巨噬细胞，以及CD8+ T细胞 | 神经科学，数字病理学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序，遗传谱系追踪，免疫组化，RNAscope | 小鼠模型（TMEM119CreER-Ai14 tdTomato报告小鼠，Cx3cr1ERT2 Igf1fl/fl） | 单细胞RNA测序数据，图像，基因表达数据 | 小鼠模型，未提及具体数量；涉及不同卒中后时间点（D7、D14、30天） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） |
| 303 | 2026-08-17 |
Multi-omics and machine learning integration of diverse cell death pathways optimize risk stratification and inform drug therapy in Wilms tumor
2026-Jun-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05326-0
PMID:42262677
|
研究论文 | 通过整合多种程序性细胞死亡通路和多组学机器学习方法，优化肾母细胞瘤的风险分层并指导药物治疗。 | 首次将12种不同的程序性细胞死亡模式与机器学习算法结合，构建了基于4个关键基因的风险分层模型，并利用单细胞RNA测序数据进行了外部验证。 | 仅使用了TARGET-WT转录组数据，缺乏其他独立队列的验证；单细胞数据仅用于验证hub基因表达，未深入分析细胞间异质性。 | 深入理解程序性细胞死亡基因在肾母细胞瘤进展和免疫调节中的作用，以优化风险分层和指导药物选择。 | 肾母细胞瘤（Wilms瘤）患者样本及相关的转录组和单细胞转录组数据。 | 机器学习 | 肾母细胞瘤 | 转录组测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习算法（如LASSO、随机森林等，具体未指定） | 转录组数据、单细胞转录组数据 | TARGET-WT队列（具体样本数未提供），以及GSE200256单细胞数据（具体细胞数未提供） | NA | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 304 | 2026-08-17 |
PSMD4 promotes malignant phenotypes and is associated with angiogenesis-related signaling and immune remodeling in hepatocellular carcinoma
2026-Jun-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05405-2
PMID:42262718
|
研究论文 | 本研究探讨PSMD4在肝细胞癌中的表达、预后价值及其在肿瘤进展、血管生成和免疫调节中的作用 | 首次系统评估PSMD4在HCC中的表达和功能，结合单细胞和空间转录组学揭示其细胞类型特异性和空间分布 | 主要基于公开数据库和体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 阐明PSMD4在肝细胞癌进展、血管生成和免疫调节中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 肝细胞癌患者样本、Huh7和HepG2细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组化, qRT-PCR, western blot | NA | 基因表达数据, 临床数据, 图像, 细胞实验数据 | TCGA-LIHC队列（训练集）, ICGC-LIRI队列（验证集）, 单细胞RNA-seq数据集GSE146409, 空间转录组数据HRA000437 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组化 | NA | NA |
| 305 | 2026-08-17 |
Multi-omics reveals fibroblast subtypes with distinct roles in inflammatory bowel disease
2026-Jun-09, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00853-w
PMID:42265813
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示炎症性肠病中成纤维细胞亚型的不同作用，并探讨其与免疫细胞间的相互作用及治疗反应预测价值 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学系统描绘IBD中成纤维细胞异质性，识别出与病理相关的ICAM1+炎症成纤维细胞和FAP+基质生成成纤维细胞亚型，并利用机器学习模型预测抗TNF治疗反应 | 研究主要基于转录组数据，功能验证有限；样本量和患者异质性可能影响结果的普适性 | 系统鉴定IBD中肠道成纤维细胞亚型，探索其与免疫细胞的通讯及作为治疗反应预测标志物的潜力 | 炎症性肠病患者的肠道组织及原代成纤维细胞 | 多组学、单细胞测序、空间转录组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫组化、蛋白质印迹、实时定量PCR、机器学习 | 逻辑回归、随机森林 | 单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据、bulk RNA-seq数据、组织图像 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 306 | 2026-08-17 |
privateST: a feasible framework for privacy-preserving spatial transcriptomics prediction from histopathology images
2026-Jun-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-55961-4
PMID:42236846
|
研究论文 | 提出一种名为privateST的同态加密优化框架，在保护隐私的同时实现从组织病理学图像预测空间转录组 | 首次实现了同态加密支持的安全空间转录组预测，通过图像下采样、辅助基因预测和多项式近似等技术克服了同态加密的计算限制 | 输入图像分辨率降低可能限制预测精度，且仅针对少量目标基因进行验证 | 开发一种可行的隐私保护框架，使跨机构共享组织病理学图像进行空间转录组预测成为可能 | 组织病理学图像及对应的空间转录组数据 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学、同态加密 | ResNet-18 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 307 | 2026-08-16 |
Single-cell reanalysis highlights the MIF-PTGDR axis as a candidate immunoregulatory program in hepatocellular carcinoma
2026-Jun-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05507-x
PMID:42364071
|
研究论文 | 通过重新分析公共单细胞RNA测序数据，识别肝细胞癌中与T细胞功能障碍相关的候选免疫调控程序，特别是MIF-PTGDR信号轴 | 利用公共scRNA-seq数据的再分析框架，首次突出MIF-PTGDR轴作为肝细胞癌中候选免疫调控程序，并详细描述了Treg亚群的转录特征 | 研究基于公共数据的再分析，缺乏实验验证，结论需进一步机制和转化研究确认 | 识别肝细胞癌中与T细胞功能障碍相关的细胞间信号网络和免疫调控信号轴 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的免疫细胞，包括CD8+ T细胞、调节性T细胞、巨噬细胞等 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未提供具体样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 308 | 2026-08-16 |
Integrated multi-omics profiling of treatment-naive cervix uteri premalignant lesions and cervical squamous cell carcinoma reveals ecosystem and drivers underlying cervical cancer progression
2026-Jun-09, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08960-2
PMID:42265073
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学，对同一患者来源的宫颈癌前病变和宫颈鳞状细胞癌进展过程中的组织进行多组学分析，揭示了宫颈癌进展的生态系统和驱动因素 | 首次在相同患者的连续宫颈病变样本中整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了恶性转化过程中细胞组成和基因网络的动态变化，并鉴定出具有临床意义的基因面板（CLDN1、ISG15、PTGDS）及ISG15介导的信号通路 | 需在更大的宫颈癌队列中验证基因面板和免疫治疗反应的发现，体外和体内实验未覆盖所有亚型 | 阐明宫颈癌前病变（PCT）向宫颈鳞状细胞癌（CSCC）进展的细胞生态系统和分子驱动因素，为诊断和治疗提供新靶点 | 人类宫颈组织样本，涵盖正常、癌前病变、原位癌和浸润性癌阶段 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间转录组图像 | 来自同一患者的多个宫颈组织样本（具体数量未在摘要中提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium空间转录组（FFPE） |
| 309 | 2026-08-16 |
High-resolution spatial transcriptomics identifies that insufficient radiofrequency ablation induces hepatocellular carcinoma progression via the CEBPD/CXCL2 axis
2026-Jun-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001714
PMID:42263221
|
研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学识别出射频消融不足通过CEBPD/CXCL2轴促进肝细胞癌进展 | 首次整合Visium HD空间转录组与单细胞RNA测序，绘制射频消融不足肝细胞癌的高分辨率空间图谱，并揭示CEBPD/CXCL2轴在肿瘤进展和免疫逃逸中的关键作用 | 样本量较小（6例），且未在更大队列中验证CXCR2抑制的疗效 | 系统表征射频消融不足肝细胞癌的空间结构和细胞互作，识别亚致死热应激促进免疫逃逸和复发的关键转录机制 | 射频消融不足后接受手术切除的6例肝细胞癌患者样本 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、体外热应激模型、共培养实验、原位小鼠模型 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据、图像数据 | 6例肝细胞癌患者样本 | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | Visium HD、10x Chromium | Visium HD空间转录组、10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 310 | 2026-08-16 |
Single cell and spatial atlas of macrophage and astrocyte interactions in glioblastoma
2026-Jun-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05289-2
PMID:42249233
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间图谱分析，揭示了胶质母细胞瘤中巨噬细胞与星形胶质样细胞的相互作用 | 首次整合单细胞和空间数据，描绘了胶质母细胞瘤中巨噬细胞与星形胶质样细胞的交互图谱，并识别出关键的APP-CD74信号网络 | 样本量较小，仅基于10例患者，且未进行功能验证实验 | 阐明胶质母细胞瘤中巨噬细胞与星形胶质样细胞之间的相互作用及其预后意义 | 10例胶质母细胞瘤患者的巨噬细胞和星形胶质样细胞亚群 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 单细胞转录组数据 | 10例胶质母细胞瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 311 | 2026-08-16 |
Tissueformer: extending single-cell foundation models to predict population-level phenotypes
2026-Jun-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06490-4
PMID:42243667
|
研究论文 | 介绍TissueFormer，一种基于Transformer的神经网络，从单细胞RNA谱中推断群体水平表型，同时保持单细胞分辨率，并应用于预测COVID-19严重程度和小鼠大脑皮层区域身份。 | 提出了TissueFormer，扩展单细胞基础模型以预测群体水平表型，通过保留单细胞分辨率并考虑样本内细胞组成，超越了传统的基于伪批量或细胞类型组成的方法。 | 摘要中未明确提及局限性。 | 开发一种方法，从单细胞RNA测序数据中推断样本级别的群体表型，以提高诊断准确性和组织注释能力。 | 单细胞RNA测序数据（血液样本）和空间转录组数据（小鼠大脑）。 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | Transformer | 基因表达数据（单细胞和空间） | 未明确提供 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 312 | 2026-08-14 |
Multiomics Reveals NDRG1-Driven Oral Squamous Cell Carcinoma Progression: Competitive Endogenous RNAs Regulation and Proangiogenic Microenvironment Remodelling
2026-Jun-27, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2026.109713
PMID:42364411
|
研究论文 | 整合多组学数据揭示NDRG1通过ceRNA调控轴驱动口腔鳞状细胞癌进展及促血管生成微环境重塑 | 首次系统阐明NDRG1通过MSTRG.47889/miR-1299/NDRG1 ceRNA轴促进肿瘤增殖和侵袭，并利用单细胞和空间转录组学揭示NDRG1高表达亚群在p-EMT和缺氧代谢生态位中的进化及与内皮细胞的协同作用 | 研究尚属初步，需要进一步验证NDRG1作为诊断和治疗靶点的临床应用潜力 | 阐明NDRG1在口腔鳞状细胞癌进化异质性和空间微环境重塑中的作用 | 口腔鳞状细胞癌组织及其细胞亚群 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | bulk转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、体内外功能实验 | NA | 转录组数据、单细胞表达数据、空间表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 313 | 2026-08-14 |
CD163+ macrophages coordinate erythroblastic Island formation and iron metabolism to enable glucocorticoid-induced erythropoiesis
2026-Jun-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-026-00936-w
PMID:42365354
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、ATAC-seq、ChIP-seq等多组学技术，揭示CD163+巨噬细胞通过协调成红细胞岛形成和铁代谢，介导糖皮质激素诱导的红细胞生成 | 首次揭示GC-CD163-EBI轴在红细胞生成中的调控作用，发现CD163+巨噬细胞而非CD163-巨噬细胞在骨髓中表现出增强的铁代谢，并证明CD163缺陷会破坏EBI结构和铁处理能力，从而减弱GC诱导的红细胞生成 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本仅限于自身免疫性溶血性贫血患者，可能限制结论的普适性；未深入探讨CD163信号通路的下游分子机制 | 阐明糖皮质激素促进红细胞生成的具体机制，特别是CD163+巨噬细胞在成红细胞岛形成和铁代谢中的作用 | CD163+巨噬细胞、成红细胞岛、红细胞生成过程，涉及自身免疫性溶血性贫血患者、CD163缺陷小鼠、Gypa-eGFP-cre小鼠、Epor-tdtomato-cre小鼠和Epor-eGFP-cre大鼠 | 单细胞组学、表观遗传学、免疫学 | 贫血（自身免疫性溶血性贫血） | 单细胞RNA测序、ATAC-seq、ChIP-seq、RNA-seq、qPCR、ELISA、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、染色质开放性数据、蛋白质数据 | 涉及自身免疫性溶血性贫血患者、CD163缺陷小鼠、Gypa-eGFP-cre小鼠、Epor-tdtomato-cre小鼠和Epor-eGFP-cre大鼠，具体样本数量未提供 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq, 批量RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium用于单细胞RNA测序和ATAC-seq，Illumina NovaSeq用于测序 |
| 314 | 2026-08-14 |
Integrated transcriptomic analysis reveals key regulatory mechanisms of HIPK2 in osteoarthritis and identifies potential therapeutic target drugs
2026-Jun-26, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000049323
PMID:42363474
|
研究论文 | 通过整合多个Bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集，分析HIPK2在骨关节炎中的表达模式及其转录组关联，并利用分子对接筛选潜在治疗药物 | 首次系统地整合多组学数据揭示HIPK2在骨关节炎中的表达特征及其与软骨细胞外基质相关通路失调的关联，并通过分子对接初步筛选出可能靶向HIPK2的候选化合物 | 研究结果具有假设生成性质，需要进一步的体外和体内实验验证 | 阐明HIPK2在骨关节炎中的表达模式和相关转录组机制，并筛选潜在靶向药物 | 骨关节炎患者样本中的软骨细胞，特别是纤维软骨细胞，以及HIPK2基因 | 转录组学, 机器学习 | 骨关节炎 | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 加权基因共表达网络分析, LASSO回归, 分子对接 | AUCell, GSVA, WGCNA, LASSO | 转录组数据（Bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq）, 分子结构数据 | 多个公开数据集，具体样本量未在摘要中明确 | NA | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 315 | 2026-08-14 |
Research on RARs in neurodegenerative diseases: A bibliometric analysis
2026-Jun-26, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000049472
PMID:42363496
|
研究论文 | 通过文献计量和可视化分析，系统综述了视黄酸受体（RARs）在神经退行性疾病（NDs）中的研究现状、热点与趋势，基于三个数据库的1094篇文章进行分析 | 首次对RARs在神经退行性疾病领域的研究进行系统的文献计量分析，结合VOSviewer、CiteSpace和R语言的bibliometric工具包，揭示了国际合作网络、研究热点演变及未来方向 | 依赖已发表的文献，可能遗漏未发表或非英文文献，且文献计量分析无法深入评估文章质量或机制细节 | 系统概述RARs在神经退行性疾病中的研究现状、关键主题、国际合作及未来趋势，以指导后续研究 | 神经退行性疾病（NDs）中涉及视黄酸受体（RARs）的相关研究文献 | 自然语言处理 | 神经退行性疾病 | NA | NA | 文本 | 1094篇文章（来自Web of Science Core Collection、Scopus和PubMed数据库） | NA | NA | NA | NA |
| 316 | 2026-08-14 |
Molecular and Cellular Hallmarks of Age-Related Vestibular Hair Cell Degeneration
2026-Jun-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76340
PMID:42360208
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析年轻和老年小鼠前庭毛细胞，揭示了与年龄相关的前庭功能障碍的分子和细胞特征 | 首次系统揭示老年前庭毛细胞中保守的细胞衰老标志，并发现毛束退化和机械转导功能下降先于毛细胞丢失，突出了毛束功能障碍是ARVD的关键驱动因素 | 研究基于小鼠模型，可能不完全适用于人类前庭老化过程，且尚未深入探讨不同前庭器官的特定差异 | 理解年龄相关前庭功能障碍的病因和分子机制，重点研究机械敏感毛细胞的老化过程 | 年轻和老年小鼠的前庭毛细胞 | 单细胞转录组学 | 年龄相关前庭功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及年轻和老年小鼠的前庭毛细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 317 | 2026-08-14 |
Correction: Molecular mechanisms of RACK1-driven metastasis in pancreatic ductal adenocarcinoma revealed by single-cell RNA sequencing
2026-Jun-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05467-2
PMID:42360598
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 318 | 2026-08-14 |
Inherent tissue homeostasis of the juvenile metaphysis provides a foundation for osteosarcoma development
2026-06-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74929-6
PMID:42363015
|
研究论文 | 本研究揭示了幼年干骺端组织稳态为骨肉瘤发生提供基础，p21和Hedgehog信号通路及p53失活在此过程中起关键作用 | 首次揭示幼年干骺端组织稳态与骨肉瘤发病年龄、解剖特异性和突变谱的关联，发现p21阳性成骨细胞的Hedgehog依赖性增殖机制 | 研究主要基于小鼠模型，人骨肉瘤样本验证有限，具体机制尚需进一步临床转化研究 | 探究骨肉瘤在幼年长骨干骺端优先发生的内在生物学基础 | 幼年小鼠胫骨骨骺成骨细胞、单细胞测序数据、p53和c-Myc突变模型 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确，涉及小鼠组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3' |
| 319 | 2026-08-14 |
IL4Rα blockade inhibits proliferation of malignant lymphocytes and the immunosuppressive tumor microenvironment of mycosis fungoides
2026-Jun-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-015022
PMID:42350047
|
研究论文 | 本研究分析IL4Rα阻断对蕈样肉芽肿（MF）中恶性淋巴细胞增殖及免疫抑制性肿瘤微环境的影响 | 首次结合单细胞转录组和机器学习分析，在晚期MF皮肤外植体中评估IL4Rα阻断（REGN668/度普利尤单抗）的分子机制，并揭示其对恶性淋巴细胞和多种免疫抑制途径的特异性抑制作用 | MF患者间存在广泛的遗传、转录和功能异质性，提示需要抑制多个驱动通路及个性化治疗策略 | 探究IL4Rα阻断在晚期MF皮肤肿瘤微环境中的治疗效果及分子机制 | 晚期蕈样肉芽肿患者的皮肤肿瘤微环境及恶性淋巴细胞 | 数字病理学 | 蕈样肉芽肿 | CITE-seq、单细胞转录组测序、机器学习分析、T细胞免疫组库分析、多色免疫荧光显微镜 | 机器学习 | 单细胞转录组数据、免疫组库数据、图像数据 | 晚期MF患者的皮肤外植体样本（具体数量未提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 320 | 2026-08-14 |
Integrative cross-sample alignment and spatially differential gene analysis for spatial transcriptomics
2026-06-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72862-2
PMID:42350375
|
研究论文 | 提出了CODA，一个用于空间转录组数据的整合性跨样本对齐和空间差异基因分析框架 | CODA结合了全局仿射对齐、基于Transformer的特征匹配和局部非线性细化，通过大形变微分同胚映射实现跨样本鲁棒比较，提高了对齐精度和计算效率 | 摘要未提及明确的局限性 | 解决空间转录组数据中跨样本对齐和空间差异基因分析的挑战 | 空间转录组样本，来自不同平台或相同平台 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | Transformer | 空间基因表达数据 | 摘要未提及具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |