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当前共找到 1083 篇文献,本页显示第 281 - 300 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
281 2026-08-20
Integrated single cell and spatial transcriptomics reveals the cellular and molecular mechanisms underlying UCMSCs treatment of ovarian aging in tree shrews
2026-Jun-11, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学技术,揭示了脐带间充质干细胞治疗树鼩卵巢衰老的细胞和分子调控机制 首次整合单细胞和空间转录组学,系统解析了UCMSCs治疗卵巢衰老的细胞空间图谱和分子机制,并发现UBB作为潜在治疗靶点 UCMSCs治疗未能完全恢复年轻组水平,且研究仅在树鼩模型中进行 阐明UCMSCs治疗卵巢衰老的细胞和分子调控机制,探索潜在治疗靶点 老年雌性树鼩的卵巢和外周血 数字病理学 卵巢衰老 单细胞RNA测序、空间转录组学、HE染色、ELISA、免疫组化、免疫荧光 NA 基因表达数据、图像、文本 老年雌性树鼩(具体数量不详),分为治疗组和年轻对照组 10x Genomics 单细胞RNA-seq、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium Single Cell 3'、10x Visium
282 2026-08-20
Single-cell RNA sequencing reveals chemotherapy-induced apoptosis in acute myeloid leukemia via B cell depletion and M2 to M1 macrophage repolarization
2026-Jun-11, Human genomics IF:3.8Q2
研究论文 该研究利用单细胞RNA测序技术探讨了急性髓系白血病化疗过程中免疫微环境的动态变化,揭示了化疗通过B细胞耗竭和M2到M1巨噬细胞重极化诱导细胞凋亡的机制 首次通过单细胞RNA测序揭示了化疗期间AML免疫微环境中B细胞和肿瘤相关巨噬细胞的动态变化,并识别出MCM7和SPINK2作为化疗期间的潜在靶向基因 样本量较小,且研究基于转录组数据,未进行功能验证实验 探究急性髓系白血病化疗期间免疫微环境的动态变化,以揭示化疗耐药机制 急性髓系白血病患者骨髓样本 数字病理学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 未指定 基因表达数据 6个骨髓样本 未指定 单细胞RNA测序 未指定 未指定
283 2026-08-20
Constitutive interferon epsilon expression shapes antiviral epithelial states in the female reproductive tract and intestine
2026-06-10, mBio IF:5.1Q1
研究论文 本研究利用小鼠模型和单细胞RNA测序技术,揭示了干扰素ε在女性生殖道和肠道黏膜表面的组成型表达及其在抗病毒防御中的作用。 首次系统阐明IFNε在肠道中的表达模式和功能,发现其在小肠绒毛顶端肠上皮细胞中高表达,维持炎症性肠上皮亚群和III型干扰素表达,并证明其缺失增加肠道病毒感染易感性。 研究主要基于小鼠模型,人类相关验证有限,且未深入探讨IFNε在人类肠道中的具体作用。 明确IFNε在不同黏膜表面(女性生殖道和肠道)的表达特征及其在抗病毒免疫中的功能。 小鼠和人类女性生殖道及肠道来源的细胞。 免疫学 感染性疾病 单细胞RNA测序 小鼠模型 基因表达数据 小鼠和人类细胞样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
284 2026-08-20
Multi-omics Integration of Single-cell and Spatial Transcriptomics with Tissue and Urine Proteomics Identifies TRIM28 as a Translationally Relevant Candidate Regulator in Acute Kidney Injury
2026-Jun-10, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 构建跨尺度多组学图谱,整合单细胞、空间转录组及组织和尿液蛋白质组,识别出TRIM28作为急性肾损伤的候选调节因子,并提名HY-N10592作为潜在化合物工具 首次整合人类单细胞、空间转录组与小鼠肾组织蛋白质组及临床尿液蛋白质组的跨尺度多组学方法,通过随机森林排序候选因子并结合结构虚拟筛选和CETSA验证药物靶点结合 未进行体内药效学评估,HY-N10592的治疗潜力需进一步动物模型验证;尿液蛋白检测的临床样本量及特异性未详述 整合多组学数据以识别连接肾损伤机制和尿液可检测信号的候选调节因子,并探索治疗靶向性 急性肾损伤患者样本、小鼠肾缺血再灌注损伤模型、HK-2细胞缺氧/复氧模型 数字病理学 急性肾损伤 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、随机森林模型、结构虚拟筛选、分子对接、分子动力学模拟、CETSA 随机森林模型 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、尿液蛋白质组数据 人类样本数未明确,涉及小鼠RIRI模型及HK-2细胞模型 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、蛋白质组学 NA NA
285 2026-08-20
Integration of bulk and single-cell RNA-seq data identifies a cellular senescence-related prognostic signature in liver hepatocellular carcinoma
2026-Jun-10, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 整合bulk和单细胞RNA-seq数据,识别肝细胞癌中与细胞衰老相关的预后特征 首次整合bulk和单细胞RNA-seq数据构建基于细胞衰老相关基因的预后模型,并识别EEF1E1作为关键基因具有致癌潜能 未提及具体局限性 构建细胞衰老相关基因的预后特征,并探究其在肝细胞癌中的功能作用 肝细胞癌患者样本及细胞系 基因组学 肝细胞癌 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 TCGA、ICGC、TISCH数据集中的肝细胞癌样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
286 2026-08-20
RANBP1 promotes oral cancer progression through activating YAP1 and NDUFB3 derived from the database of single-cell sequencing
2026-Jun-10, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序数据库和功能实验揭示RANBP1通过激活YAP1和NDUFB3促进口腔癌进展的机制 首次利用单细胞转录组数据库识别RANBP1作为口腔癌恶性上皮细胞中的差异表达基因,并阐明其通过YAP1-NDUFB3轴调控氧化磷酸化和肿瘤侵袭性的新机制 研究中未涉及RANBP1在其他头颈癌类型中的验证,且未探讨肿瘤微环境中其他细胞类型(如免疫细胞、成纤维细胞)对RANBP1作用的影响 探索口腔鳞状细胞癌进展的分子机制,特别是通过单细胞测序识别关键基因并验证其功能 口腔鳞状细胞癌组织样本、细胞系、斑马鱼异种移植模型和NOD/SCID小鼠异种移植模型 数字病理学 口腔癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 10例口腔鳞状细胞癌患者的活检样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
287 2026-08-20
Multi-omic analysis reveals Wharton's jelly mesenchymal stem cells shift the pro-inflammatory phenotype of fibroblast subpopulation to induce skin rejuvenation
2026-Jun-10, Cell & bioscience
研究论文 本研究通过多组学分析揭示华通胶间充质干细胞通过改变成纤维细胞亚群的促炎表型来诱导皮肤年轻化 首次通过整合bulk RNA-seq、微阵列和单细胞转录组学等多组学方法,全面阐明WJMSCs改善皮肤衰老的机制,并发现其下调促炎成纤维细胞中富集的昼夜节律相关基因Dbp 摘要中未提及明确的局限性 探究WJMSCs对皮肤衰老的作用机制及其对成纤维细胞亚群的影响 人类皮肤成纤维细胞(HDFs)和裸鼠皮肤组织 数字病理学、机器学习 皮肤衰老 bulk RNA-seq、微阵列、单细胞转录组学 NA 基因表达数据、组织学图像、细胞学数据 体外HDFs和裸鼠模型,具体样本数未在摘要中提供 NA bulk RNA-seq、单细胞转录组学 NA NA
288 2026-08-20
SGMHA: semantic graph reconstruction with multi-head attention for gene regulatory network inference
2026-Jun-09, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 提出SGMHA,一种基于语义图重建和多头注意力机制的两阶段框架,用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络,并在乳腺癌转移研究中验证了其有效性 创新性地将表示学习与链接预测解耦,采用自监督图掩码自编码器(GraphMAE)重建随机掩码的表达值以缓解数据稀疏性,再结合多头注意力微调模块整合预训练表示和原始数据以推断有向调控链接 摘要中未提及明确局限性 提高从稀疏单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络的准确性和鲁棒性,并支持复杂疾病中的生物标志物发现 基因调控网络,从单细胞RNA测序数据推断 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序 图掩码自编码器(GraphMAE)和多头注意力(MHA) 基因表达数据 七个单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
289 2026-08-20
CMS4 epithelial-intrinsic glycosyltransferase GALNT5 promotes tumor aggressiveness and correlates with poor survival in colorectal cancer
2026-Jun-08, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,发现结直肠癌CMS4亚型肿瘤上皮细胞特有糖基转移酶GALNT5,其高表达与肿瘤侵袭性和不良生存相关 利用单细胞转录组学区分CMS4肿瘤上皮细胞与基质细胞,首次定义CMS4上皮内在糖基化程序,并鉴定GALNT5作为预后标志物和治疗候选靶点 未提及具体局限性 明确CMS4肿瘤上皮细胞内在的糖基转移酶表达谱,并评估GALNT5作为预后标志物的潜力 结直肠癌CMS4亚型肿瘤上皮细胞、CMS1-3上皮细胞、正常上皮、基质/免疫细胞、CRC细胞系及431例手术切除的结直肠癌标本 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序、免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据、组织微阵列图像 431例结直肠癌手术切除标本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 单细胞3'转录组测序
290 2026-08-20
The exploration to identify key molecules in the interaction between endothelial cells and mono-macrophages in atherosclerosis based on the single cell transcriptome
2026-Jun-05, BMC cardiovascular disorders IF:2.0Q3
研究论文 本研究基于单细胞转录组数据,探索动脉粥样硬化中内皮细胞与单核-巨噬细胞相互作用的关键分子 通过单细胞RNA测序分析,识别出与动脉粥样硬化相关的细胞亚群和信号通路,特别是MK(Midkine)通路及MDK-NCL配体-受体对,并通过体外共培养实验初步验证其表达变化 未提及明确的局限性 识别动脉粥样硬化中内皮细胞与单核-巨噬细胞相互作用的关键分子和信号通路,为冠状动脉疾病的防治提供候选靶点 钙化动脉粥样硬化核心斑块和患者匹配的近端邻近颈动脉组织中的内皮细胞和单核-巨噬细胞群体 单细胞转录组学 冠状动脉疾病、动脉粥样硬化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 公开数据集,具体样本数量未在标题和摘要中提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
291 2026-08-20
Linking childhood interstitial lung disease to IARS-related disorder: clinical and preliminary functional studies in four new cases
2026-Jun-03, Human genomics IF:3.8Q2
研究论文 本研究通过四个新病例的临床和初步功能研究,将儿童间质性肺病与IARS相关疾病联系起来,并确定IARS为chILD/PAP的新型致病基因 首次将IARS双等位基因突变与儿童间质性肺病及肺泡蛋白沉积症建立明确关联,并利用单细胞RNA测序揭示单核细胞/巨噬细胞谱系的潜在功能缺陷 研究样本量小(仅四例),且功能研究为初步探索,缺乏更深入的机制验证 阐明IARS双等位基因突变在儿童间质性肺病和肺泡蛋白沉积症中的致病作用及潜在免疫相关机制 四名表现为进行性chILD/PAP并伴有肺外表现的儿科患者 基因组学、单细胞测序 儿童间质性肺病、肺泡蛋白沉积症、IARS相关疾病 全外显子组测序、AlphaFold蛋白结构预测、PAS和ORO染色、western blotting、透射电子显微镜、单细胞RNA测序 AlphaFold 基因组测序数据、蛋白结构数据、染色图像、蛋白质表达数据、电子显微镜图像、单细胞转录组数据 4例儿科患者 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序用于外周血单核细胞分析
292 2026-08-20
Impaired early type I interferon responses to influenza virus infection in aged mice are associated with subsequent increased pulmonary inflammation
2026-Jun, GeroScience IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过年轻和老年小鼠感染流感病毒模型,发现老年小鼠早期I型干扰素反应受损,导致病毒载量增加和后期肺部炎症加剧 首次利用单细胞RNA测序揭示老年小鼠在流感感染后期多种免疫细胞中持续存在炎症相关基因高表达,并关联早期I型干扰素反应受损 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本;未探讨老年小鼠早期I型干扰素反应受损的分子机制 探究衰老对流感病毒感染早期固有免疫反应的影响及其与后期肺部炎症的关系 年轻(12周龄)和老年(70周龄)C57BL/6J小鼠,感染流感病毒PR8后的肺组织 免疫学 流感 qRT-PCR, 单细胞RNA测序 小鼠模型 基因表达数据, 组织病理图像 两组小鼠(年轻和老年),每组若干只(具体未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
293 2026-08-20
Spatial blueprint of colorectal cancer identifies Hypoxic CAF program that orchestrates Go-or-Grow decisions and predicts outcomes
2026-Jun, Investigational new drugs IF:3.0Q2
研究论文 本研究整合单细胞转录组和空间转录组数据,绘制结直肠癌的空间蓝图,识别出缺氧CAF程序,该程序调控肿瘤细胞的“生长或迁移”决策并预测患者预后 首次揭示结直肠癌中由缺氧CAF调控的“生长或迁移”空间开关机制,并鉴定HMGA2作为关键转录调控因子,为空间指导的结直肠癌干预提供新靶点 未在摘要中明确说明,但可能包含样本量有限、验证依赖特定队列及体外模型等局限 解析结直肠癌肿瘤微环境的空间组织及其功能影响,揭示驱动肿瘤进展的关键机制 结直肠癌患者肿瘤组织中的细胞(412,208个单细胞和76,627个空间点)及原代CAF培养物 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组测序,空间转录组测序,SCENIC网络推断,细胞间通讯分析,Seahorse代谢分析 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据,临床生存数据,代谢数据 32例患者的38个组织切片,包含412,208个单细胞和76,627个空间点 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 未在摘要中明确但常用配置为10x Chromium Single Cell 3'和10x Visium FFPE
294 2026-08-18
Diversity and Feature Selectivity of Primate Retinal Ganglion Cells
2026-Jun-30, Annual review of vision science IF:5.0Q1
综述 本文综述了灵长类视网膜神经节细胞的多样性及其特征选择性,重点关注宽场RGC类型及其在视觉信息处理中的作用。 通过整合单细胞测序等新技术,揭示了宽场RGC的转录组特征和分子标记,为理解其形态和生理功能提供了新视角。 对宽场RGC的功能理解仍有限,许多类型的作用尚未完全阐明。 总结灵长类视网膜宽场RGC的多样性,并强调整合方法在理解其视觉功能中的重要性。 灵长类视网膜的宽场神经节细胞,尤其是方向选择性细胞。 神经科学 NA 单细胞测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
295 2026-08-18
Cell-Type Deconvolution of Equine BALF RNA-Seq: A Critical Comparison with Matched Single-Cell Data
2026-06-30, Genes IF:2.8Q2
研究论文 该研究评估了计算解卷积方法在马的支气管肺泡灌洗液(BALF)批量RNA测序数据中恢复细胞组成和差异表达信号的能力,并与匹配的单细胞RNA测序数据进行比较。 首次在马的样本中评估计算解卷积方法的性能,并使用匹配的单细胞RNA测序数据作为参考,揭示了解卷积主要捕获mRNA衍生的细胞类型比例而非真实细胞计数,且在细胞类型特异性差异表达恢复方面存在局限性。 解卷积在估计细胞计数方面不可靠,且未能提供超出传统批量分析的显著生物学见解;细胞类型特异性差异表达恢复不一致,存在跨谱系信号泄漏。 评估计算解卷积方法在马BALF批量RNA测序数据中恢复细胞组成和差异表达信号的能力,并与单细胞RNA测序数据进行比较。 来自患有严重马哮喘(SEA)的马和正常对照组(CTL)的支气管肺泡灌洗液(BALF)样本。 机器学习 马哮喘 RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 批量RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 6匹SEA马和5匹CTL马的BALF样本 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
296 2026-08-18
Brain Spatial Genomics Atlases
2026-06-29, Genes IF:2.8Q2
综述 本文回顾了大脑空间基因组学图谱的现有资源及其生成技术,包括MERFISH、CosMx、Stereo-seq和Visium等方法,并讨论了这些技术如何克服单细胞RNA测序缺乏空间信息的局限,从而推动神经科学研究。 系统性地总结了多个物种(小鼠、人类、非人灵长类、斑马鱼)的大脑空间基因组学图谱,并整合了空间基因组学与单细胞测序技术,突出了其在细胞分辨率和亚细胞分辨率下的原位基因表达谱分析优势。 主要局限在于空间基因组学技术成本较高、通量有限,且对组织样本处理要求高,可能影响其在大规模研究中的广泛应用。 回顾大脑空间基因组学图谱的构建现状,并评估空间基因组学技术在揭示脑发育、功能和疾病分子机制中的作用。 大脑组织样本,涵盖多个物种(小鼠、人类、非人灵长类、斑马鱼) 基因组学 神经系统疾病 空间基因组学、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、空间转录组数据 不适用(综述文章,涉及多个物种的大脑海量数据) 10x Genomics, Vizgen, MGI, BGI 空间转录组学、单细胞RNA测序 10x Visium, MERFISH, CosMx, Stereo-seq 10x Visium Spatial Gene Expression, MERFISH (multiplexed error-robust FISH), CosMx (NanoString), Stereo-seq (MGI/BGI)
297 2026-08-18
A method utilizing chemical carcinogens and a Western diet to reliably induce advanced hepatocellular carcinoma in male and female mice
2026-Jun-09, Cancer & metabolism IF:6.0Q1
研究论文 本研究提出一种结合化学致癌物和西方饮食的新方法,可在雄性和雌性小鼠中可靠诱导晚期肝细胞癌。 新方法通过顺序给予低剂量二乙基亚硝胺、硫代乙酰胺和蔗糖水,在雄性和雌性小鼠中均实现了高发生率(雄性100%,雌性96%)的2-3期肝细胞癌诱导,且死亡率低,并验证了与人类肝细胞癌相似的基因和蛋白表达特征。 摘要未明确提及研究的局限性。 开发一种简单、可耐受且可靠的方法,利用化学致癌物和西方饮食在雄性和雌性小鼠中诱导晚期肝细胞癌。 小鼠(雄性和雌性),具体品系未在摘要中说明。 数字病理学 肝细胞癌 空间转录组学、蛋白质组学、Western blotting 动物模型 空间转录组数据、蛋白质组数据、蛋白质印记数据 约100只小鼠(具体数量未在摘要中说明) NA 空间转录组学 NA NA
298 2026-08-18
Decoding Occult Cervical Lymph Node Metastasis in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: From AI-Driven Multimodal Fusion to Clinical Translation
2026-06-04, Current oncology reports IF:4.7Q1
综述 本文综述了传统宏观方法在检测头颈部鳞状细胞癌隐匿性颈部淋巴结转移方面的局限性,并探讨了多组学技术和人工智能驱动的跨尺度多模态整合如何重塑对临床淋巴结阴性患者的精准诊断 提出了AI驱动的跨尺度多模态整合框架,包括生态位影像组学和跨模态融合网络,以实现非侵入性的“全景虚拟活检”,并支持更可靠的生存风险分层和个体化治疗策略 本文为综述,未提供原始实验数据,且所讨论的方法仍需进一步验证才能临床转化 评估传统方法在检测隐匿性颈部淋巴结转移中的不足,并探索多组学与AI结合以改善对cN0患者的精准诊断和风险分层 临床淋巴结阴性的头颈部鳞状细胞癌患者 医学影像分析 头颈部鳞状细胞癌 全基因组DNA甲基化、空间转录组学、影像组学 深度学习模型 影像学图像、组学数据(如甲基化、空间转录组) NA NA 空间转录组学 NA NA
299 2026-08-18
Vasculogenic Precedes Neurogenic Differentiation in Dental Pulp Stem Cells
2026-06, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和体内移植实验,揭示了人牙髓干细胞在血管生成、成牙本质细胞和神经源性分化过程中的异质性及分化顺序,发现血管生成先于神经源性分化。 首次通过单细胞RNA测序和体内时间进程研究,揭示DPSCs在分化过程中血管生成先于神经源性分化的顺序,并确认微环境线索足以诱导该分化序列。 摘要未提及研究的局限性。 探究人牙髓干细胞在血管生成、成牙本质和神经源性分化中的机制及分化顺序。 人牙髓干细胞(DPSCs)及其在体内移植后的分化行为。 单细胞转录组学、干细胞生物学 不适用 单细胞RNA测序 不适用 单细胞基因表达数据 体外分化实验:DPSCs诱导7天;体内移植实验:DPSC-GFP移植至免疫缺陷小鼠,7天和21天后分选测序,时间进程研究观察至5周。具体样本数量未提及。 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
300 2026-08-18
Curcumin Targets Crispld2 to Suppress Hepatic Stellate Cell Activation via PI3K/AKT Pathway Inhibition in Hepatic Fibrosis
2026-06, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver IF:6.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和体内外实验,揭示了姜黄素通过靶向Crispld2抑制PI3K/AKT通路从而减轻肝纤维化的机制 首次通过单细胞RNA测序结合扰动模型预测和伪时序分析,鉴定出Crispld2为姜黄素抗肝纤维化的关键靶基因,并阐明其通过PI3K/AKT通路介导的分子机制 未提及具体局限性 阐明姜黄素抑制肝星状细胞活化从而改善肝纤维化的分子机制 CCl4诱导的肝纤维化小鼠模型和TGF-β诱导的LX-2肝星状细胞 数字病理学 肝纤维化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型和LX-2细胞系(具体样本量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
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