单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 956 篇文献,本页显示第 261 - 280 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
261 2026-06-26
Temporal single-cell transcriptional dynamics of murine pancreatic islet remodeling during hyperglycaemia progression
2026-Jun-01, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 通过纵向单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,构建了小鼠胰岛在高血糖进展过程中的高分辨率转录组图谱,揭示了胰岛细胞的动态重塑机制 首次在单细胞分辨率下纵向解析了高脂饮食诱导胰岛素抵抗过程中小鼠胰岛内分泌和非内分泌细胞的全面转录组动态变化,发现了CCL27a趋化因子信号在β细胞与M1巨噬细胞相互作用中的新角色 未提及具体限制 探究肥胖诱导胰岛素抵抗过程中胰腺胰岛的细胞重塑和转录组动态变化 高脂饮食喂养8、16、24周的C57BL/6小鼠胰岛细胞 单细胞组学 2型糖尿病 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 NA 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据 高脂饮食组和常规饮食对照组小鼠,每个时间点多个样本 10x Genomics 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞测序平台
262 2026-06-26
scTACL: a multitask topology-aware contrastive learning approach for single-cell transcriptomics analysis
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 开发了一种名为scTACL的拓扑感知对比学习方法,用于单细胞转录组学分析,以提升数据填补、聚类、批次效应校正和细胞-细胞相互作用等任务的表现 首次将拓扑感知对比学习与ZINB分布结合,无需空间位置信息即可有效区分上皮和间充质区域,并通过细胞间通讯分析识别到关键信号通路 NA 开发新型计算方法以应对单细胞RNA测序数据中的噪声和缺失事件,提高下游分析准确性 单细胞RNA测序数据及空间转录组数据中的细胞群体 机器学习 肺癌, 肝癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 对比学习 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
263 2026-06-26
Synergistic Interaction Between MALAT1/miR-30b-5p/BAFF Axis and Inflammatory Cytokines Underlies Rituximab-Refractory NMOSD
2026-06, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 该研究探索了MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴在单核细胞中的激活如何导致NMOSD疾病发作和利妥昔单抗难治性复发 首次揭示MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴在利妥昔单抗难治性NMOSD中的作用机制,并发现单核细胞特异性MALAT1上调与血清BAFF升高相关 样本量较小,特别是单细胞RNA测序样本仅6例,且研究主要基于体外细胞实验,未在动物模型中验证 探索利妥昔单抗难治性NMOSD的免疫失调机制,特别是MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴的作用 NMOSD患者(包括初发、利妥昔单抗缓解和利妥昔单抗难治性复发患者)的外周血单核细胞和血清,以及THP-1细胞 机器学习 视神经脊髓炎谱系疾病 qPCR, ELISA, Western Blot, 双荧光素酶报告基因检测, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 蛋白质表达数据 PBMCs初发10例,血清初发23例,利妥昔单抗治疗缓解26例,利妥昔单抗难治性复发13例,健康对照15例;单细胞RNA测序6例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
264 2026-06-26
scMagnifier: Resolving fine-grained cell subtypes via GRN-informed perturbations and consensus clustering
2026-Jun, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出scMagnifier框架,通过基因调控网络引导的扰动与共识聚类,解析单细胞RNA测序数据中的精细细胞亚型 创新性地结合基因调控网络(GRN)引导的计算机扰动与共识聚类,通过扰动效应传播放大微弱转录差异,并引入扰动感知可视化(rpcUMAP)用于亚型分离与最优聚类数选择 文中未明确提及局限性 提高单细胞RNA测序数据中精细细胞亚型的分辨率和准确性 卵巢癌细胞亚型及其空间组织结构 机器学习 卵巢癌 单细胞RNA测序 共识聚类模型 单细胞转录组数据、空间转录组数据 未提及具体样本量 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
265 2026-06-26
Skin eQTL-Cerebrospinal Fluid Metabolites-Keloid Axis: An Integrative Multi-Omics Mediation Mendelian Randomization Study
2026-Jun, Chemical biology & drug design IF:3.2Q3
研究论文 整合皮肤eQTL、脑脊液代谢物与瘢痕疙瘩GWAS数据,通过孟德尔随机化框架鉴定因果中介通路,并利用体外实验验证基因与代谢物的功能角色 首次通过多组学中介孟德尔随机化分析,将皮肤基因表达、脑脊液代谢物与瘢痕疙瘩风险联系起来,发现PARP14和ALDH2为上游调控基因,并揭示SOPC和鞘磷脂通过纤维细胞增殖促进疾病发展的新机制 未明确说明研究局限性 揭示遗传变异、分子表型与瘢痕疙瘩易感性之间的机制联系,鉴定因果中介通路 皮肤基因表达(GTEx v8)、338个脑脊液代谢物、两个欧洲人群瘢痕疙瘩GWAS数据集 机器学习 皮肤瘢痕疙瘩 孟德尔随机化、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、体外细胞实验 NA 基因表达数据、代谢物数据、GWAS统计摘要 GTEx v8皮肤eQTL数据(样本量未明确)、两个独立欧洲瘢痕疙瘩GWAS数据集(样本量未明确) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
266 2026-06-26
Anti-PD-1 Nanobody-Armored MSLN CAR-T Therapy for Malignant Mesothelioma: Preclinical and Clinical Studies
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 开发了抗PD-1纳米抗体装甲的MSLN CAR-T细胞(NAC-T),并在恶性间皮瘤的临床前和临床研究中验证了其疗效 首次将抗PD-1纳米抗体与MSLN CAR-T细胞结合,并在人临床试验中验证安全性和有效性 样本量较小(11名患者),且未提供长期随访数据或随机对照比较 评估NAC-T细胞治疗恶性间皮瘤的安全性和抗肿瘤活性 恶性间皮瘤患者 NA 恶性间皮瘤 CAR-T细胞技术,单细胞测序 NA 单细胞测序数据 11名恶性间皮瘤患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
267 2026-06-26
Arginase-1 Expressing Macrophages Interact with Myofibroblasts to Regulate Insulin-Like Growth Factor-1-Dependent Tubule Repair
2026-Jun-01, Kidney360 IF:3.2Q1
研究论文 本文揭示了精氨酸酶-1表达巨噬细胞与肌成纤维细胞相互作用,通过调节胰岛素样生长因子-1依赖的肾小管修复机制 首次发现Arg1表达巨噬细胞通过诱导肌成纤维细胞和内皮细胞表达IGF1,而非自身产生,来促进肾小管上皮细胞增殖 未明确巨噬细胞与肌成纤维细胞间具体的信号分子机制 探究Arg1表达巨噬细胞促进肾小管修复的分子机制 小鼠缺血再灌注损伤模型中的肾脏细胞,包括巨噬细胞、肌成纤维细胞、内皮细胞和肾小管上皮细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序,定量PCR NA 基因表达数据 小鼠肾脏样本(野生型和Arg1mko小鼠)及人类肾脏活检样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
268 2026-06-26
1 Hz Low-Frequency Repetitive Transcranial Magnetic Stimulation Ameliorates Epilepsy by Suppressing Interferon-γ Signaling-Dependent Microglial Synaptic Phagocytosis in Mice
2026-06, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 研究1 Hz低频重复经颅磁刺激通过抑制干扰素-γ信号依赖的小胶质细胞突触吞噬作用改善小鼠癫痫 首次揭示1 Hz LF-rTMS通过激活IFN-γ/STAT2信号通路并下调CADM1/2/3表达,抑制小胶质细胞突触吞噬,从而减轻癫痫发作和认知障碍的新机制 基于小鼠模型,临床相关性仅通过人脑组织snRNA-seq初步验证,缺少人体临床试验证据 探究低频重复经颅磁刺激对颞叶癫痫中活化小胶质细胞的影响及其分子机制和临床潜力 红藻氨酸诱导的颞叶癫痫小鼠模型和人类海马硬化组织样本 机器学习 癫痫 单细胞核RNA测序 NA 基因表达数据 红藻氨酸诱导的颞叶癫痫小鼠及人类海马硬化组织样本 NA 单细胞核RNA测序 NA NA
269 2026-06-26
Integrative Drug-Target Causal Analysis, Single-Cell Sequencing and In-Vivo Validation for Dissecting Molecular Mechanisms Underlying Focal Epilepsy
2026-06, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 结合单细胞测序与孟德尔随机化分析,鉴定局灶性癫痫的潜在药物靶点 首次整合单细胞表达数据、eQTL遗传数据和孟德尔随机化方法,系统解析局灶性癫痫的分子机制,并利用分子对接和动物模型进行验证 研究主要基于欧洲人群的遗传数据,可能限制结果的普适性;未进行多组织或不同亚型的进一步分析 识别并验证局灶性癫痫的新药物靶点 局灶性癫痫患者及颞叶癫痫动物模型 自然语言处理 局灶性癫痫 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、共定位分析、分子对接 NA 基因表达数据、遗传变异数据 FinnGen和UK Biobank队列数据,包含局灶性癫痫病例和对照 NA 单细胞RNA测序 NA 来自GSE190452数据集的单细胞表达数据
270 2026-06-26
Inflammatory Neovascularization and Vascular Remodeling Associated With Carotid Plaque Destabilization
2026-06, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析颈动脉斑块不同区域中促进病理性新生血管和血管重塑的特定细胞亚群 首次系统分析颈动脉斑块动脉粥样硬化核心区和近端邻近区中血管新生和重塑的细胞异质性 NA 阐明颈动脉斑块不同区域中介导病理性新生血管和血管重塑的特定细胞亚群 颈动脉斑块的动脉粥样硬化核心区与近端邻近区 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
271 2026-06-26
Persistent interferon signaling and clonal expansion mark early events in DNA methylation damage-induced liver cancer
2026-Jun, NAR cancer IF:3.4Q2
研究论文 通过纵向研究揭示早期NDMA暴露通过持续干扰素信号和克隆扩增促进DNA甲基化损伤诱导的肝癌发生 首次在体内证明早期生命阶段的急性NDMA暴露可通过持续的DNA损伤信号、慢性干扰素激活和克隆扩增共同驱动MGMT依赖性肝癌发生,并定义了机制性生物标志物和潜在干预靶点 研究仅在小鼠模型中进行,人类外推到肝癌发生过程仍需验证;NDMA暴露剂量和时间窗口可能不完全模拟真实人类暴露场景 阐明早期环境诱变剂暴露如何促进潜伏性肝肿瘤发生的分子机制 野生型和MGMT缺陷小鼠的肝脏组织 机器学习 肝癌 转录组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学、组织病理学 NA 转录组数据、磷酸化蛋白质组数据、空间转录组数据、组织病理图像 小鼠在出生后第8天和第15天腹腔注射NDMA,随访至暴露后10个月 NA 空间转录组学 NA NA
272 2026-06-26
Incorporating WGCNA and Machine Learning to Identify ADAP2 as a Critical Efferocytosis-Related Gene in Sepsis
2026-Jun-01, Pathogens (Basel, Switzerland)
research paper 整合WGCNA与机器学习方法识别ADAP2为脓毒症中关键胞葬作用相关基因 首次通过整合WGCNA与五种共识机器学习算法,从多维度转录组数据中筛选并验证ADAP2作为脓毒症核心胞葬相关基因,并揭示其在单核/巨噬细胞亚群中的动态表达模式 需要进行前瞻性验证和功能研究以确认临床价值 识别脓毒症中具有预后价值的胞葬作用相关生物标志物 脓毒症患者的全转录组数据和单细胞RNA-seq数据,以及脓毒症患者外周血单核细胞和盲肠结扎穿刺诱导的脓毒症小鼠 machine learning sepsis RNA-seq, qPCR, single-cell RNA-seq WGCNA, consensus machine learning algorithms 转录组数据(bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq) 两个独立队列(GSE205672和GSE133822)及两个单细胞数据集(GSE167363和GSE175453) NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
273 2026-06-25
Potential targets of baicalein in macrophages revealed by bulk and single cell RNA sequencing analysis
2026-Jun-24, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析揭示黄芩素在巨噬细胞中的潜在靶点及其在炎症条件下的系统性免疫调节作用 首次整合网络药理学、分子对接、巨噬细胞批量RNA测序和脓毒症患者外周血单细胞RNA测序,鉴定黄芩素在巨噬细胞中的核心靶点并揭示其多细胞免疫调节机制 未见明确提及局限性 探究黄芩素在巨噬细胞中的分子靶点及其在过度炎症条件下对外周血免疫细胞的系统性免疫调节作用 巨噬细胞和脓毒症患者外周血免疫细胞 机器学习 脓毒症, 非酒精性脂肪肝 RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA RNA测序数据 脓毒症患者外周血样本(单细胞RNA测序),RAW264.7巨噬细胞(批量RNA测序) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
274 2026-06-25
Identification and validation of SPP1 as a prognostic biomarker in interstitial lung disease subtypes by single-cell sequencing
2026-Jun-24, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 通过单细胞测序鉴定并验证SPP1作为间质性肺疾病亚型预后生物标志物 首次利用单细胞RNA测序在特发性肺纤维化(IPF)患者肺组织中鉴定出SPP1,并在多个ILD队列中验证其血清水平与预后的关联 样本量有限,仅纳入3例IPF患者和3例对照进行单细胞测序;验证队列样本量也相对较小 探索间质性肺疾病(ILD)亚型的预后生物标志物 特发性肺纤维化(IPF)患者、特发性炎症性肌病相关ILD(IIM-ILD)患者及健康对照 机器学习和数字病理 肺间质性疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) Cox比例风险模型 基因表达数据和血清水平数据 3例IPF患者和3例对照用于单细胞测序;验证队列包括74例IPF患者、92例IIM-ILD患者和56例健康对照 NA 单细胞RNA测序 NA 对IPF患者的肺组织进行单细胞RNA测序
275 2026-06-25
Macrophage-fibroblast signaling networks identified by single-cell RNA sequencing in juvenile systemic sclerosis
2026-Jun-23, JCI insight IF:6.3Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
276 2026-06-25
Pathogenic Rewiring of IL6 Signaling Fuels Macrophage Immunometabolic reprogramming in COPD
2026-Jun-23, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 通过整合单细胞转录组学与机制研究,揭示IL6/STAT3/SREBP2轴驱动慢性阻塞性肺疾病中巨噬细胞免疫代谢重编程的致病机制 首次发现IL6信号通路在COPD中从促胆固醇流出功能转变为致病性重编程,并明确STAT3直接反式激活SREBP2驱动胆固醇合成促进炎症的线性通路 NA 阐明IL6信号通路在COPD肺巨噬细胞中的功能性角色及其免疫代谢重编程机制 人类COPD肺组织、小鼠COPD模型、巨噬细胞 机器学习教育 慢性阻塞性肺疾病 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 人类COPD肺样本和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
277 2026-06-25
CycleVI: Isolating cell cycle variation with an interpretable deep generative model
2026-Jun-23, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 CycleVI是一个可解释的深度生成模型,用于从单细胞RNA测序数据中分离细胞周期变异,以揭示其他生物信号 利用分区潜在表示和专用的圆形子空间,将细胞周期驱动的变异与其他信号分离,提供可解释的细胞周期相位推断 无相关信息 从单细胞RNA测序数据中准确推断细胞周期相位,并分离细胞周期相关的变异,以增强对增殖系统中细胞异质性的分析 单细胞RNA测序数据中的细胞周期相位推断和变异分离 机器学习 NA RNA-seq 深度生成模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
278 2026-06-25
A MYCN-GAL-SREBP1 Lipogenic Axis Drives Proliferation in Silent Corticotroph Adenomas
2026-Jun-23, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 整合批量及单细胞RNA测序数据,揭示MYCN-GAL-SREBP1脂质合成轴驱动静默性促肾上腺皮质激素腺瘤增殖的机制 首次发现MYCN-GAL-SREBP1脂质合成轴在静默性促肾上腺皮质激素腺瘤中的驱动作用,并证明SREBP1是潜在可药靶向的治疗弱点 未提及具体局限性 阐明静默性促肾上腺皮质激素腺瘤增殖的分子机制,特别是脂质代谢及其调控通路的作用 静默性促肾上腺皮质激素腺瘤、功能性促肾上腺皮质激素腺瘤和正常垂体组织 数字病理学 垂体神经内分泌肿瘤 RNA-seq, 脂质组学, 荧光素酶报告基因实验 NA 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 脂质组学数据 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
279 2026-06-25
PTPN1 synergistically promotes hepatocellular carcinoma progression by inhibiting the expression of STAT5 in CD8+ T cells and enhancing the activity of the PI3K-AKT pathway
2026-Jun-23, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 该文章探究了PTPN1在肝细胞癌中通过抑制CD8+ T细胞中STAT5的表达并增强PI3K-AKT通路活性从而协同促进肿瘤进展的机制 首次将PTPN1作为免疫检查点研究其在肝细胞癌中对CD8+ T细胞和肿瘤细胞的双重作用机制,揭示其通过JAK2-STAT5轴抑制T细胞增殖同时激活PI3K-AKT通路促进癌细胞进展 该研究的局限性未在摘要中明确说明 阐明PTPN1对肝细胞癌患者预后、肿瘤微环境以及肝癌细胞生物学行为的影响,评估其作为免疫治疗靶点的临床潜力 肝细胞癌患者肿瘤组织、CD8+ T细胞、肝癌细胞系 机器学习 肝细胞癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
280 2026-06-25
Corrigendum to "Single-cell RNA sequencing reveals depot-specific characteristics of adipose progenitor cells in ducks" [Poultry Science, Volume 105/Issue 7, July 2026, 107004]
2026-Jun-23, Poultry science IF:3.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
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