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当前共找到 1083 篇文献,本页显示第 241 - 260 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
241 2026-08-27
CACNA2D1 promotes ovulation by regulating ovarian immune cell infiltration
2026-Jun-13, BMC veterinary research IF:2.3Q1
研究论文 本研究旨在探讨CACNA2D1在排卵过程中通过调节卵巢免疫细胞浸润所发挥的功能 首次在体内和体外模型中系统研究了CACNA2D1在排卵期间对卵巢免疫细胞浸润,特别是巨噬细胞募集的调控作用,并揭示了其通过钙信号依赖的趋化因子产生机制 研究主要基于小鼠模型,未能直接在人类或其他家畜物种中验证;且对CACNA2D1在非颗粒细胞类型中的潜在作用未作深入探讨 明确CACNA2D1在排卵过程中对卵巢免疫细胞浸润的调节功能及其分子机制 小鼠排卵模型及卵巢颗粒细胞 基因组学, 细胞生物学 NA 单细胞转录组分析, 药理学抑制, 转录组测序, 免疫细胞浸润评估, 钙信号检测, 蛋白印迹, 细胞迁移实验 NA 转录组数据, 图像(免疫组化/免疫荧光), 细胞迁移数据, 生物化学数据 小鼠模型;体外颗粒细胞实验(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于山羊排卵过程中的单细胞转录组分析,以识别CACNA2D1的表达模式
242 2026-08-27
CD49a+ NK cells promote M2 polarization and are associated with poor pathological response in NSCLC
2026-Jun-12, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析非小细胞肺癌肿瘤微环境中的NK细胞,发现CD49a+组织驻留NK细胞亚群与不良病理反应相关,并促进M2巨噬细胞极化。 首次在非小细胞肺癌中鉴定出CD49a+组织驻留NK细胞亚群,并揭示其通过CSF-1促进M2巨噬细胞极化及抑制三级淋巴结构形成的新机制。 研究基于手术标本,样本量有限,且未深入探讨CD49a+ NK细胞在体内的动态变化及与其他免疫细胞间更复杂的相互作用。 全面分析非小细胞肺癌肿瘤微环境中的NK细胞,鉴定组织驻留亚群,评估其临床意义并探究其免疫抑制功能及机制。 非小细胞肺癌手术标本中的NK细胞亚群,特别是CD49a+组织驻留NK细胞。 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 非小细胞肺癌手术标本,具体数量未在标题和摘要中提供。 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
243 2026-08-27
Subgroup-Specific Associations of GRIA Genes Encoding AMPA Glutamate Receptor Subunits with Patient Survival in Medulloblastoma
2026-06-11, Neuromolecular medicine IF:3.3Q2
研究论文 本研究分析髓母细胞瘤中编码AMPA谷氨酸受体亚基的GRIA1-4基因表达,发现其在不同分子亚型中与患者生存期存在亚型特异性关联 首次系统揭示GRIA基因在髓母细胞瘤不同分子亚型中的差异表达及其与预后的亚型特异性关联,特别是GRIA3和GRIA4在SHH亚型中与生存期的相反关联 研究主要基于公开数据集和细胞系,缺乏功能实验验证;需进一步在更大临床队列中确认预后关联 探究AMPA受体亚基编码基因GRIA1-4在髓母细胞瘤中的表达模式及其与患者生存期的关联 髓母细胞瘤肿瘤样本和细胞系 基因组学 髓母细胞瘤 单细胞RNA测序、定量逆转录聚合酶链反应 NA 基因表达数据(RNA-seq和qRT-PCR) 包含公开数据集中的髓母细胞瘤肿瘤样本和细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
244 2026-08-27
Integrative single-cell and spatial transcriptomics with machine learning identify a Luminal-inflam malignant program and reveal an RPN1-PERK UPR vulnerability in triple-negative breast cancer
2026-Jun-11, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 结合单细胞和空间转录组学与机器学习,识别三阴性乳腺癌中的Luminal_inflam恶性程序,并揭示RPN1-PERK未折叠蛋白反应脆弱性。 通过整合单细胞和空间转录组学、网络分析和机器学习,识别出特定的恶性上皮亚群Luminal_inflam,并构建12基因风险签名,揭示RPN1相关的蛋白质稳态脆弱性作为潜在治疗靶点。 研究结果需结合先前工作解释,RPN1耗竭诱导内质网应激依赖性凋亡并非全新机制,而是对现有观察的扩展。 表征三阴性乳腺癌中的恶性上皮程序并确定预后生物标志物,探索RPN1相关脆弱性的治疗潜力。 三阴性乳腺癌的恶性上皮细胞亚群,特别是Luminal_inflam亚群,以及MDA-MB-231细胞模型。 机器学习 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 机器学习模型(具体类型未指定) 单细胞转录组数据、空间转录组数据 未明确样本数量,涉及生存队列和细胞系模型 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
245 2026-08-27
Bulk and single-cell transcriptomics reveal prognostic signatures of phosphoinositide metabolism in lung adenocarcinoma
2026-Jun-10, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 综合运用批量转录组和单细胞转录组数据,识别肺腺癌中磷脂酰肌醇代谢相关的预后基因,并构建风险评估模型。 首次结合批量与单细胞转录组数据系统分析磷脂酰肌醇代谢基因在肺腺癌中的预后价值,并揭示其与肿瘤微环境、突变及药物敏感性的关联。 研究基于公开数据库,缺乏大规模临床验证,预后基因的功能机制需进一步实验验证。 探讨磷脂酰肌醇代谢与肺腺癌的关联,并识别预后生物标志物以提供治疗新见解。 肺腺癌患者及其肿瘤组织样本,包括临床样本中的基因表达数据。 转录组学 肺腺癌 批量RNA测序,单细胞RNA测序 机器学习模型,风险评分模型 基因表达数据,单细胞表达数据,临床数据 来自公共数据库的肺腺癌患者样本(具体数量未在摘要中说明) NA 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
246 2026-08-27
A prognostic model for breast cancer based on mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane (MAM) signature genes
2026-Jun-10, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 基于线粒体相关内质网膜(MAM)特征基因构建乳腺癌预后模型,并通过多组学数据及实验验证其预后价值与治疗相关性 首次基于MAM相关基因构建乳腺癌预后模型,并结合单细胞转录组和药物敏感性分析揭示其免疫治疗与化疗反应的预测潜力 模型基于公共数据库构建,缺乏前瞻性临床验证;实验验证仅限于细胞系,未在动物模型或患者样本中进一步证实 阐明MAM相关基因在乳腺癌中的预后价值及其对个性化治疗(尤其是免疫治疗和化疗)的指导意义 乳腺癌患者及乳腺癌细胞系 数字病理学 乳腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, 免疫印迹, LASSO回归 Cox回归模型, LASSO, 列线图 基因表达数据, 单细胞转录组, 临床数据, 蛋白表达数据 TCGA乳腺癌队列(具体数量未提供),GSE255068单细胞数据集,多个乳腺癌细胞系 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
247 2026-08-27
Tumor microenvironment-specific nanomedicine: from biology-driven to multi-omics-guided precision engineering
2026-Jun-10, Journal of hematology & oncology IF:29.5Q1
综述 本文综述了肿瘤微环境特异性纳米医学,提出从生物学驱动到多组学指导的精准工程框架 提出闭环的组学到设计框架,将空间分辨的生物学特征转化为可操作的纳米粒子工程参数 未提及具体实验验证,缺乏临床转化数据支持 探讨如何利用肿瘤微环境的多组学数据指导纳米医学的精准设计和翻译应用 肿瘤微环境中的细胞外基质、血管、免疫细胞及纳米粒子 机器学习 肿瘤 单细胞测序、空间转录组学、多组学分析 NA 空间转录组数据、单细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
248 2026-08-27
scKSFD: federated distillation model with knowledge sharing for cell type classification of clinical transcriptome data
2026-Jun-04, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 提出了一种具有知识共享的联邦蒸馏框架scKSFD,用于临床转录组数据的细胞类型分类,在保护隐私的同时实现跨机构协作。 通过参考数据集上的概率级软标签输出在预测空间进行知识聚合,避免了传统联邦学习中交换模型参数的隐私风险,并集成了分层代理采样以保留稀有细胞群体和概率级聚合以减轻批次效应。 未明确提及局限性。 开发一种隐私保护的联邦蒸馏框架,用于跨机构单细胞RNA测序数据的细胞类型分类,以平衡预测性能、鲁棒性和数据共享约束。 42个临床单细胞转录组数据集,以及一个多医院COVID-19案例研究。 机器学习 COVID-19 scRNA-seq 联邦蒸馏模型 转录组数据 42个临床单细胞转录组数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
249 2026-08-27
Matrix Stiffness Directs Early Injury and Ketogenesis Programs to Prime Kidney Repair
2026-Jun-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究绘制了急性肾损伤(AKI)中细胞外基质(ECM)重塑的动态图谱,并确定微纤维相关蛋白2(Mfap2)作为关键的修复介质。 首次结合组织工程、蛋白质组学和空间转录组学,系统解析了ECM力学信号通过非经典Hippo通路调控肾小管酮生成的机制,并提出了Mfap2-Esr2-Hmgcs2回路作为潜在治疗靶点。 研究主要基于动物模型,缺乏人类样本验证;部分机制(如Esr2转录抑制的细节)需进一步阐明。 阐明细胞外基质如何通过力学信号调控急性肾损伤后的修复过程,并探索潜在的治疗策略。 急性肾损伤小鼠模型以及其中的成纤维细胞、周细胞和肾小管细胞。 数字病理学 急性肾损伤 空间转录组学、蛋白质组学(DIA)、磷酸化蛋白质组学 NA 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据 未明确说明,但涉及多个AKI动物模型和不同实验条件。 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组平台
250 2026-08-25
The cell-type specific interaction based drug repurposing for psychiatric disorders
2026-Jun-30, Translational psychiatry IF:5.8Q1
研究论文 开发了基于细胞类型特异性相互作用的计算流程scPsyDrug,用于精神疾病的药物重定位,并在抑郁症、精神分裂症和帕金森病等疾病及焦虑小鼠模型中进行了验证 首次为精神疾病领域开发了专门的药物重定位计算工具,整合单细胞转录组、蛋白质相互作用、药物-靶点相互作用和精神疾病风险基因,构建细胞类型特异性相互作用网络,并成功预测新候选药物 依赖公开数据集的可用性和质量,可能限制在其他精神疾病中的适用性 开发并验证针对精神疾病的细胞类型特异性药物重定位计算方法 抑郁症、精神分裂症、帕金森病患者及Zbtb18焦虑小鼠模型 机器学习 抑郁症、精神分裂症、帕金森病、焦虑症 单细胞RNA测序、蛋白质-蛋白质相互作用分析 计算流程(scPsyDrug) 单细胞转录组数据、药物-靶点相互作用数据、蛋白质-蛋白质相互作用数据、风险基因数据 包含抑郁症、精神分裂症和帕金森病患者的单细胞RNA数据集,以及Zbtb18焦虑小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
251 2026-08-25
Protocol for spatially resolved pathology scores using optimal transport on spatial transcriptomics data
2026-Jun-19, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 介绍SPaSE协议,通过最优传输在空间转录组数据上计算病理评分,以量化疾病组织与健康组织的差异 提出SPaSE协议,利用最优传输将病理评分分配到每个空间转录组点,并建立支持向量回归模型连接基因表达与病理影响 未提及 开发并验证一种在空间转录组数据上量化组织病理的方法 人类和小鼠的空间转录组数据集 空间转录组学 不特定 空间转录组学 支持向量回归 空间转录组数据 多个数据集 NA 空间转录组学 NA NA
252 2026-08-25
Dissecting PCD-driven molecular landscapes in AML: a multi-omic framework for prognostication and therapeutic targeting
2026-Jun-15, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和多组学数据,研究急性髓系白血病中程序性细胞死亡驱动的分子特征,并开发预后模型PCDRScore及治疗靶向策略 首次基于程序性细胞死亡通路对AML进行亚型划分,并开发包含13个PCD相关基因的预后模型,该模型在多个验证队列中优于现有模型,并结合实验验证关键基因表达 探索性分析,治疗敏感性预测基于计算,未进行临床验证 阐明程序性细胞死亡在AML异质性中的作用,建立预后分层和治疗靶向框架 急性髓系白血病细胞和患者样本 机器学习和数字病理学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序及多组学分析 机器学习模型(包含13个PCD相关基因的预后模型) 基因表达数据、临床数据、体细胞突变数据 2680个AML样本,来自10个队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
253 2026-08-25
Molecular evidence for early deuterostome origins of ovarian cell types and neuroendocrine control of reproduction
2026-Jun-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用海星作为非脊索动物后口动物代表,通过单细胞RNA测序和3D成像揭示卵巢细胞类型及其空间组织,探讨卵巢细胞类型和神经内分泌调控的进化起源 首次在海星中定义棘皮动物卵巢细胞类型库,并发现与哺乳动物相似的卵原干细胞、颗粒样细胞和膜样细胞,提出卵巢内在神经内分泌系统可能调控卵子发生 基于单一非脊索动物物种,且结论依赖于推断的细胞类型相似性和信号相互作用,需要更多物种和功能验证 探究卵巢细胞类型及其信号相互作用的进化起源,特别是后口动物祖先的卵巢细胞类型和神经内分泌调控机制 海星(Patiria miniata)的卵巢细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和3D成像 NA 单细胞转录组数据、3D图像 海星卵巢细胞,具体数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
254 2026-08-25
Translational potential of GMP-grade human umbilical cord-derived mesenchymal stem cells (UC-MSCs) in traumatic spinal cord injury: a preclinical study in rat
2026-06-10, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究在大鼠创伤性脊髓损伤模型中评估了GMP级人脐带间充质干细胞(UC-MSCs)的疗效,发现高剂量治疗能显著改善运动功能、减轻病变、抑制炎症和调节免疫,并揭示了可能的修复机制,为临床转化提供了依据 首次使用GMP级UC-MSCs在大鼠SCI模型中系统评估不同剂量下的疗效,并结合scRNA-seq和sRNA-seq多组学分析揭示其多机制修复作用 研究仅在大鼠模型中进行,未涉及人体临床试验,且UC-MSCs的体内分布和长期安全性需进一步评估 评估GMP级人UC-MSCs对创伤性脊髓损伤的治疗效果及其潜在机制,以支持临床应用 50只Sprague-Dawley大鼠,T10级脊髓损伤模型 数字病理学 创伤性脊髓损伤 scRNA-seq, sRNA-seq, ELISA, 免疫荧光, MRI NA 单细胞转录组数据, 小型RNA测序数据, 图像数据, 生化数据 50只大鼠,分为5组(每组10只) NA 单细胞RNA测序, 小型RNA测序 NA NA
255 2026-08-25
CSF2 drives radiation-induced lung injury by eliciting PADI4-high pathogenic neutrophils
2026-06-10, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和多组学分析,揭示了CSF2驱动PADI4高表达致病性中性粒细胞在放射性肺损伤中的关键作用及潜在治疗靶点 首次识别PADI4为放射性肺损伤中中性粒细胞相关的核心分子,并阐明辐射损伤上皮细胞通过分泌CSF2诱导中性粒细胞PADI4高表达的机制,提出PADI4抑制作为新的治疗策略 研究主要基于小鼠模型,其结论需在人类样本中进一步验证;未深入探讨PADI4在中性粒细胞外的其他细胞类型中的作用 解码放射性肺损伤微环境中受损上皮细胞与中性粒细胞之间的相互作用,探究致病性中性粒细胞亚群的招募和功能特化机制 小鼠放射性肺损伤模型、辐射损伤的肺上皮细胞、HL-60中性粒细胞样细胞 数字病理学 放射性肺损伤 单细胞RNA测序、批量转录组测序、伪时间分析、免疫荧光、ELISA 伪时间算法 基因表达数据、组织图像 小鼠模型(数量未具体说明),体外共培养系统 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'端测序
256 2026-08-25
Single-cell T-cell landscape in atherosclerosis: implications for targeted therapy and beyond
2026-06-10, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
综述 本文综述了单细胞转录组技术在动脉粥样硬化免疫学中的最新发现,重点阐述了斑块T细胞亚群的异质性和可塑性,及其对靶向免疫治疗和精准医学的意义 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了动脉粥样硬化病变中先前未被识别的T细胞亚群,描述了细胞毒性谱系与调节性谱系之间的过渡状态,并展示了T细胞在血管层中的区室特异性分布 对T细胞谱系定向、可塑性和与血管微环境相互作用的全面理解仍存在挑战 总结单细胞转录组技术在动脉粥样硬化免疫学中的最新进展,为靶向免疫治疗和新型分子靶点的识别提供基础 小鼠和人类动脉粥样硬化病变中的T细胞亚群 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学 NA 转录组数据、空间表达数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
257 2026-08-25
C3+ cancer-associated fibroblast-derived GAS6 promotes cervical cancer metastasis via activation of AXL signaling pathway in a syngeneic orthotopic mouse model
2026-06-08, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 该研究建立了一种同基因原位小鼠宫颈癌模型,通过单细胞RNA测序揭示了C3+癌症相关成纤维细胞通过激活GAS6/AXL信号通路促进宫颈癌转移的机制 构建了能忠实再现宫颈癌转移级联过程的同基因原位小鼠模型,该模型保留了免疫健全的原发肿瘤微环境,并通过单细胞测序首次鉴定出与不良预后相关的C3+成纤维细胞亚群及其通过GAS6/AXL通路增强肿瘤侵袭性的作用 模型主要基于小鼠宫颈癌细胞系U14,可能不完全代表人类宫颈癌的异质性;且研究主要在动物水平进行,缺乏临床样本验证 建立一种能忠实再现宫颈癌转移级联的同基因原位小鼠模型,并定义肿瘤微环境中与转移相关的细胞相互作用 小鼠宫颈癌细胞系U14、免疫健全的C57BL/6小鼠、原发肿瘤和配对淋巴结转移肿瘤组织 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序 小鼠模型、细胞系模型 基因表达数据(单细胞RNA测序数据)、组织学图像 未提及具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
258 2026-08-25
An epithelial cell fate-driven predictive model for liver metastasis risk in primary colorectal cancer through single-cell and multi-omics integration
2026-06-08, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞和多组学整合,构建基于上皮细胞命运驱动的原发结直肠癌肝转移风险预测模型 首次基于上皮细胞命运基因特征建立结直肠癌肝转移风险分层模型(MDSCRLM),并整合多组学数据及功能验证 未明确提及,但可能包括样本量有限、外部验证仅基于45例患者等 建立基于分子亚型的结直肠癌肝转移风险预测模型,以促进精准治疗 原发结直肠癌组织的上皮细胞及其基因表达特征 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序、ATAC-seq、体细胞突变分析、拷贝数变异分析、肿瘤突变负荷分析、蛋白质组学 共识聚类 基因表达数据、染色质开放性数据、蛋白质数据 433例TCGA原发队列,81例ATAC-seq样本,45例临床验证队列 NA 单细胞RNA-seq, 批量ATAC-seq NA NA
259 2026-08-25
Single-cell analysis reveals an endothelial TP53-CXCL14 axis in breast cancer progression
2026-06-08, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 单细胞分析揭示乳腺癌进展中内皮TP53-CXCL14轴的作用 首次通过单细胞RNA测序鉴定内皮细胞为肿瘤微环境中CXCL14的主要细胞来源,并揭示突变型TP53通过抑制CXCL14转录促进乳腺癌进展的机制 未明确说明局限性 探究CXCL14在乳腺癌中的表达、预后价值及其调控机制,特别是TP53对内皮细胞CXCL14转录的影响 乳腺癌患者肿瘤微环境中的内皮细胞、HUVEC细胞系、MDA-231乳腺癌细胞系及异种移植小鼠模型 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序、ChIP-qPCR、双荧光素酶报告基因实验、免疫组化 NA 基因表达数据、图像、文本 未明确样本数量,涉及多个公共数据库及体外和体内实验 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
260 2026-08-25
Foxp1 controls Fezf2-dependent gene expression, mimetic mTEC diversity, and thymic central tolerance
2026-Jun-07, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究揭示了转录因子Foxp1在髓质胸腺上皮细胞中的表达及其对mTEC亚群多样性和胸腺中枢耐受的调控作用。 首次报道Foxp1在mTECs中的功能,发现其缺失导致神经内分泌mTEC和Ccl21a表达mTEC扩增,以及Aire mTEC、簇细胞和微皱褶mTEC的丧失,并通过调控Fezf2依赖性基因表达影响mTEC多样性和自身免疫。 研究主要在动物模型中进行,可能不完全代表人类胸腺的复杂情况;未探讨Foxp1在人类mTEC中的具体机制。 探究Foxp1在髓质胸腺上皮细胞发育和功能中的作用及其对胸腺中枢耐受的影响。 小鼠髓质胸腺上皮细胞亚群,包括Aire mTEC、簇细胞、微皱褶mTEC、神经内分泌mTEC和Ccl21a表达mTEC。 免疫学 自身免疫病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明样本数量,但涉及小鼠模型(可能为多个样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
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