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当前共找到 987 篇文献,本页显示第 161 - 180 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
161 2026-08-19
Hepatocyte-targeted Bap1 reduction in the liver primes an inflammatory transcriptional response
2026-05-06, G3 (Bethesda, Md.)
研究论文 利用AAV8介导的CRISPR/CAS9技术构建小鼠肝细胞特异性Bap1敲除模型,结合单细胞分辨率空间转录组学和免疫组化分析,发现Bap1缺失导致肝脏炎症转录反应和免疫细胞募集受损 首次在体内系统中研究肝细胞特异性Bap1敲除对肝脏生物学的影响,并结合空间转录组学与定量纹理分析揭示Bap1在免疫细胞招募中的关键作用 研究局限于小鼠模型,且未详细探讨Bap1缺失导致炎症反应的分子机制 探究Bap1在肝脏中的正常功能及其缺失对肝脏损伤反应和免疫环境的影响 小鼠肝细胞 数字病理学 肝细胞癌 CRISPR/CAS9基因编辑, 空间转录组学, RNA-seq, 免疫组化 NA 空间转录组数据, RNA测序数据, 免疫组化图像 小鼠肝脏样本(具体数量未提供) 10x Genomics 空间转录组学, bulk RNA-seq 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台,具体配置未提供
162 2026-08-19
Transformers for single-cell RNA sequencing: a survey
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
综述 对应用于单细胞RNA测序的Transformer模型进行全面综述,分析其在不同任务和基础模型中的构建、性能及未来方向 系统比较了针对特定任务和基础模型的Transformer,并从性能、计算效率、可解释性和可扩展性多个维度分析 未提及具体局限性 提供Transformer在scRNA-seq中应用的全面概览,推动该领域发展 Transformer模型在scRNA-seq数据分析中的应用 机器学习 NA 单细胞RNA测序 Transformer 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
163 2026-08-19
Tenofovir Alafenamide in the Treatment of Chronic Hepatitis B Virus Infection in the High-Replicative Low-Inflammatory Phase: A 48-Week Randomized Controlled Trial
2026-May, Journal of medical virology IF:6.8Q1
研究论文 这项研究评估了替诺福韦艾拉酚胺(TAF)在慢性乙型肝炎病毒感染高复制低炎症期患者中的安全性和疗效 首次在高复制低炎症期乙肝患者中进行TAF治疗的随机对照试验,并通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析外周免疫特征与治疗反应的关系 完全病毒学抑制率仍不理想,且免疫学分析样本量较小(每组仅3例) 评估TAF在慢性乙型肝炎高复制低炎症期患者中的安全性和疗效,并分析外周免疫学特征与治疗反应的关系 HBeAg阳性、肝功能正常(ALT正常)且HBV DNA升高的慢性乙型肝炎患者 数字病理学 慢性乙型肝炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 临床数据和外周血单核细胞(PBMC)单细胞转录组数据 59名患者(治疗组30人,对照组29人),其中6名患者(VR组3人,LLV组3人)进行了scRNA-seq分析 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
164 2026-08-18
Scientific highlights and perspectives from the International Inflammatory Breast Cancer Symposium 2025
2026-May-15, Cancer IF:6.1Q1
会议报告 总结2025年国际炎症性乳腺癌研讨会的主要议题,涵盖疾病生物学、分子和免疫谱分析、治疗策略及新兴技术。 强调空间转录组学、人工智能工具和液体活检等新兴技术在炎症性乳腺癌研究中的应用,并提出通过国际合作标准化诊疗。 未提及具体研究数据或实验验证,仅为会议观点总结。 概述炎症性乳腺癌研究进展,确定研究和临床护理的战略优先事项。 炎症性乳腺癌的生物学特征、治疗策略及新兴诊断技术。 数字病理学、机器学习 炎症性乳腺癌 空间转录组学、液体活检 NA 会议摘要、专家意见 NA NA 空间转录组学 NA NA
165 2026-08-18
Identification of Apically Localized Endogenous Dental Pulp Stem Cells
2026-05, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学和谱系追踪技术,鉴定了小鼠磨牙根尖处内源性Axin2+牙髓干细胞的定位、分化及损伤修复功能 首次通过单细胞转录组学和谱系追踪技术鉴定出位于牙根尖的Axin2+内源性牙髓干细胞,揭示了其在牙髓和牙本质再生中的角色 研究主要基于小鼠模型,人类牙髓干细胞的类似机制需要进一步验证 揭示牙髓干细胞在牙髓和牙本质再生中的原位作用和机制 小鼠磨牙的牙髓组织及牙髓干细胞 单细胞转录组学 牙髓损伤 单细胞RNA测序、谱系追踪 NA 单细胞转录组数据 小鼠磨牙牙髓组织(具体数量未提供) NA 单细胞RNA-seq NA NA
166 2026-08-18
Decoding Spatiotemporal Microenvironmental Changes in Oral Carcinogenesis
2026-05, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学时空分析揭示口腔黏膜癌变过程中微环境的动态重塑,发现IGFBP2阳性的口腔上皮祖细胞与调节性B细胞通过TGF-β信号通路相互作用,促进癌变进程 首次整合多组学时空数据解析口腔癌前病变阶段的微环境演变,发现IGFBP2阳性口腔上皮祖细胞与调节性B细胞在癌前阶段的空间关联及其通过TGF-β信号通路的相互作用,并提出肿瘤发生与进展的调控机制可能存在差异 研究主要基于口腔黏膜样本,可能无法完全代表其他解剖部位的癌变过程;癌症进展阶段调节性B细胞浸润停滞或下降的机制需进一步验证;临床应用价值需更多功能实验支持 揭示口腔黏膜癌变过程中微环境的时空动态变化,特别是癌前阶段的关键细胞类型及其相互作用机制 口腔黏膜癌变过程中的上皮祖细胞、调节性B细胞及其微环境 数字病理学, 机器学习 口腔癌 多组学分析, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 空间转录组数据, 细胞图像 涉及口腔黏膜癌变过程中多个阶段的样本(具体数量未在摘要中提供) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 10x Chromium 单细胞3'测序, 10x Visium 空间转录组学, Illumina NovaSeq 测序平台
167 2026-08-17
NSCLC brain metastases exhibit reduced HLA-I antigen presentation machinery and immune evasion independent of IFNγ signaling defects
2026-May-28, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究探讨非小细胞肺癌脑转移中HLA-I类抗原呈递机制的降低及其与免疫逃逸的关系,发现该降低独立于IFNγ信号缺陷。 首次在NSCLC脑转移中系统性地将HLA-I类APM下调与IFNγ信号缺陷区分开来,表明APM下调是脑转移的显著特征且与不良临床结果相关。 研究主要基于患者队列和细胞系,可能需要更多功能验证和临床干预研究来确认候选调控因子的转化意义。 评估NSCLC脑转移中IFNγ信号和HLA-I类APM的状态及其对免疫逃逸和患者生存的影响。 非小细胞肺癌患者的原发肿瘤、颅内和颅外转移灶,以及H2030和H2030-BrM3细胞系。 肿瘤免疫学 非小细胞肺癌脑转移 多重定量免疫荧光、全转录组分析、空间转录组学 NA 组织图像、转录组数据 两个患者队列,包括原发肿瘤、颅内和颅外转移样本;细胞系H2030和H2030-BrM3 NA 空间转录组学 NA NA
168 2026-08-17
RGS proteins: Potential regulators of mouse melanopsin's signaling phototransduction cascade across ipRGC subtypes
2026-May-19, Biophysical journal IF:3.2Q2
研究论文 该研究探讨了RGS蛋白作为潜在调节因子,在鼠标视网膜ipRGC亚型中介导黑视蛋白信号转导级联反应的机制。 首次揭示RGS蛋白在ipRGC亚型中的选择性表达可能调节黑视蛋白不同信号通路,为单一GPCR启动不同光转导级联提供机制解释。 主要基于异源表达和体外实验,需在体验证;未完全解析RGS对Gα信号衰减的定量效应。 本研究旨在揭示RGS蛋白在ipRGC亚型中对黑视蛋白信号转导的调节作用,解释单一GPCR如何在不同细胞类型中启动不同光转导级联 小鼠视网膜中的ipRGC亚型(特别是M1和M4),以及异源表达黑视蛋白的HEK293细胞 分子神经科学 NA 单细胞转录组测序、RNAscope原位杂交、异源表达、DREADD激活、电生理记录 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、电生理数据 小鼠视网膜组织;具体样本数量未提供 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
169 2026-08-17
Klf4-Tymp axis promotes inflammation-driven early tumorigenesis by enhancing kras mutation-induced acinar-to-ductal metaplasia through Pi3k/Akt and Mek/Erk pathways
2026-May-07, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和多组学分析,揭示了Klf4-Tymp轴通过激活Pi3k/Akt和Mek/Erk信号通路促进KRAS突变诱导的腺泡-导管化生及炎症相关的早期胰腺肿瘤发生 首次识别出与胰腺癌预后不良相关的S100A4+腺泡亚群和六个导管亚群,并发现Klf4-Tymp轴作为炎症与ADM之间的关键分子连接,通过双荧光素酶报告实验和体内外模型验证其调控机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本的验证有限;未深入探讨其他潜在调控因子或信号通路交叉作用 阐明胰腺肿瘤发生早期ADM的细胞异质性和调控因子,特别是Klf4-Tymp轴在炎症驱动的肿瘤发生中的作用 胰腺腺泡细胞和导管细胞,以及Kras突变和炎症条件下的ADM过程 单细胞测序,多组学分析 胰腺癌 单细胞RNA测序,ATAC-seq,RNA-seq,双荧光素酶报告实验,AAV介导的基因沉默,类器官模型 机器学习算法,伪时间分析 单细胞转录组数据,染色质开放性数据,基因表达数据 146个人类胰腺样本 NA 单细胞RNA测序,ATAC-seq NA NA
170 2026-08-16
Single-cell transcriptomics reveals anti-inflammatory effects of prednisolone on the hepatic niche in biliary atresia
2026-May-19, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示泼尼松龙在胆道闭锁中对肝脏微环境的抗炎作用机制 首次在胆道闭锁动物模型中利用单细胞RNA测序解析泼尼松龙对肝星状细胞和巨噬细胞亚群的调控作用,并识别出Nr3c1-Klf7和Fosl1-Hnf1b基因调控网络,以及具有不同致病潜力的肌成纤维细胞亚群 研究限于小鼠模型和特定时间点,未涉及人类长期临床效果,且未深入探讨泼尼松龙耐药性的分子机制 探究泼尼松龙在胆道闭锁中的治疗作用及其潜在的细胞和分子机制 恒河猴轮状病毒诱导的胆道闭锁小鼠模型的肝脏样本,以及胆道闭锁患者的肝脏组织 单细胞转录组学 胆道闭锁 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫组织化学 无特定模型(主要采用scRNA-seq数据分析) 单细胞转录组数据,组织图像 小鼠肝脏样本(第21天和第28天),胆道闭锁患者肝脏样本(数量未在摘要中明确提及) 未在摘要中明确提及 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 未在摘要中明确提及 未在摘要中明确提及
171 2026-08-16
Novel CRISPR-Cas9 BAP1 knockout pre-clinical tumor model recapitulates human melanoma tumorigenesis and immune evolution
2026-May-05, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究利用CRISPR-Cas9技术生成BAP1敲除的黑色素瘤细胞系,并在免疫健全小鼠中验证其能重现人类BAP1缺陷黑色素瘤的致瘤性和免疫逃逸特征。 首次建立了免疫健全的BAP1敲除黑色素瘤同系小鼠模型,该模型能够重现人类BAP1缺陷黑色素瘤的代谢重编程和免疫抑制特征。 目前尚无提及明显的局限性。 建立BAP1缺陷黑色素瘤的免疫健全临床前模型,以研究BAP1缺失驱动的肿瘤侵袭和免疫逃逸,并促进新免疫疗法的开发。 CRISPR-Cas9介导的BAP1敲除黑色素细胞肿瘤细胞系。 癌症研究 黑色素瘤 CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞转录组测序 CRISPR-Cas9 转录组数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
172 2026-08-14
Identifying Single-Cell Expression Quantitative Trait Loci Using a Bootstrap Penalized Hurdle Model
2026-May-29, Genes IF:2.8Q2
研究论文 提出了一种名为BPHurdle的统计框架,专门用于单细胞RNA测序数据的eQTL分析 采用hurdle模型框架,结合逻辑回归处理零膨胀和泊松回归评估多个SNP对基因表达的影响 摘要中未明确提及局限性 开发一种适用于单细胞RNA测序数据的eQTL分析方法,以识别细胞类型特异的调控变异 单细胞RNA测序数据中的基因表达和SNP数据 机器学习 NA scRNA-seq Hurdle模型(逻辑回归+泊松回归) 单细胞基因表达数据和基因型数据 模拟研究和真实数据案例研究(具体样本数量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
173 2026-08-14
Monocyte-Derived Macrophage Ferroptosis Amplifies Cholangitis in Primary Biliary Cholangitis via a Calpain/ACSL4 Axis
2026-May-27, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序及小鼠模型,揭示单核细胞来源的巨噬细胞通过钙蛋白酶/ACSL4轴发生铁死亡,从而放大原发性胆汁性胆管炎的胆管炎症 首次在原发性胆汁性胆管炎中定义单核细胞来源巨噬细胞的铁死亡程序,并识别钙蛋白酶/ACSL4轴作为调控和治疗靶点 摘要中未提及明确的局限性 探究单核细胞来源巨噬细胞是否通过铁死亡放大原发性胆汁性胆管炎的炎症,并评估钙蛋白酶/ACSL4轴作为治疗靶点 原发性胆汁性胆管炎患者肝脏样本、PBC样小鼠模型及骨髓来源巨噬细胞 数字病理学 原发性胆汁性胆管炎 单细胞RNA测序、多重免疫荧光 NA 单细胞转录组数据、图像 公开人类肝脏单细胞RNA测序数据集及PBC样小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
174 2026-08-14
HO-1-modified umbilical cord MSCs alleviate pulmonary arterial hypertension by reducing inflammation and endothelial dysfunction
2026-05-18, Stem cells translational medicine IF:5.4Q1
研究论文 评估过表达HO-1的脐带间充质干细胞对肺动脉高压的治疗效果,并探索其通过调节炎症和内皮功能障碍的潜在机制。 首次利用空间转录组学和单细胞RNA测序分析人肺动脉高压组织中HO-1的表达与定位,并验证HO-1修饰的MSCs在动物模型中的协同治疗效果。 缺乏对HO-1修饰MSCs长期安全性和临床转化潜力的评估。 评估HO-1修饰的脐带间充质干细胞在肺动脉高压中的治疗效率,并探讨其作用机制。 人肺动脉高压组织样本和大鼠、小鼠肺动脉高压模型(MCT诱导和SuHx)。 数字病理学 肺动脉高压 空间转录组学,单细胞RNA测序,RNA-seq NA 基因表达数据,组织图像 人肺动脉高压组织样本和多种动物模型(具体样本量未提供) 10x Genomics, Illumina 空间转录组学,单细胞RNA测序,RNA-seq 10x Visium, 10x Chromium, Illumina NovaSeq 空间转录组学使用10x Visium,单细胞RNA测序使用10x Chromium,RNA-seq使用Illumina NovaSeq测序平台
175 2026-08-13
Cell trajectory inference based on schrödinger problem and a mechanistic model of stochastic gene expression
2026-May-21, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 本文通过将薛定谔问题与随机基因表达的突发模型相结合,提出了一种基于突发性参考过程的细胞轨迹推断方法,以提高从时间标记的单细胞RNA测序数据中推断细胞分化轨迹的准确性 创新性地将突发性基因表达模型作为薛定谔问题的参考过程,替代传统的扩散过程,从而更准确地模拟真实基因动态,提升细胞轨迹推断的可靠性 研究主要基于模拟和假设条件,未在真实生物学数据上进行验证,且模型可能对参数选择敏感 旨在改进从时间标记的单细胞RNA测序数据中推断细胞分化轨迹的方法,通过引入更符合实际基因表达的参考模型提高推断精度 单细胞RNA测序数据中的细胞分化轨迹 机器学习 NA 单细胞RNA测序 Schrödinger桥模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
176 2026-08-13
Transcriptome graph transformer: a graph transformer-based unsupervised model for transcriptome data analysis
2026-May-21, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 该文介绍了一种基于图变换器的无监督模型TGT,用于整合基因表达和生物学网络信息进行转录组数据分析,并在多种疾病数据集上展现出优越性能 提出了一个无监督图变换器框架,能处理异质性基因-通路图,并通过掩码节点预测进行预训练,支持疾病分类、生物标志物发现和零样本聚类 摘要中未提及研究局限性 开发一种能整合生物学网络信息、处理高维异质性转录组数据的通用分析方法 多个转录组数据集,包括阿尔茨海默病、癌症、急性肾损伤和COVID-19相关数据,以及单细胞和空间转录组数据 机器学习 阿尔茨海默病, 癌症, 急性肾损伤, COVID-19 转录组测序(RNA-seq)、单细胞RNA-seq、空间转录组测序 图变换器(Graph Transformer) 基因表达数据、生物网络数据(STRING相互作用、通路注释) 未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组测序, 批量RNA-seq NA NA
177 2026-08-13
MTFR2 promotes VDAC1 oligomerization to reprogram BCAA metabolism in tumor cells to polarize TAMs in LUAD
2026-May-20, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 该研究揭示了MTFR2通过促进VDAC1寡聚化重编程肿瘤细胞BCAA代谢,进而极化肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)促进肺腺癌(LUAD)进展的机制 首次阐明MTFR2与VDAC1的β8链Leu125位点结合并促进其寡聚化,导致mtDNA释放激活TLR9-NF-κB通路,上调BCAT1,最终通过BCKAs-M2轴极化TAMs,形成正反馈循环促进LUAD进展 研究主要基于体外共培养、3D球体和类器官模型,缺乏体内动物模型验证;未探讨MTFR2在其他肿瘤类型中的潜在作用 阐明MTFR2在LUAD中通过调控BCAA代谢重编程影响TAMs极化的分子机制,并探索潜在的治疗靶点 肺腺癌(LUAD)肿瘤组织和细胞模型 肿瘤免疫学 肺腺癌 转录组学、代谢组学、蛋白质组学、单细胞测序、流式细胞术 共培养模型、3D球体模型、类器官模型 基因表达数据、蛋白质组数据、代谢组数据、单细胞测序数据、免疫组化图像 未明确说明(涉及LUAD组织样本和细胞模型) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
178 2026-08-13
From histology to spatial transcriptomics: establishing a lightweight single-patch baseline
2026-May-18, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本研究从组织学图像预测空间基因表达,建立了一个轻量级单贴片基线模型,并在人类肝脏和乳腺癌数据集上验证其性能 首次探讨了孤立组织贴片预测空间基因表达的可行性,并建立了标准化的轻量级基线,同时通过固定数据分割和种子设置,提供了可复现的参考框架 该基线仅使用单贴片输入,未利用空间上下文信息,且在独立数据集上的验证仅限于乳腺癌,可能不充分覆盖所有组织类型 建立单贴片基因表达预测的轻量级高效基准,以评估空间上下文整合的边际收益 人类肝脏和乳腺癌的空间转录组数据集,以及对应的苏木精-伊红(H&E)染色组织学图像 计算病理学 肝癌,乳腺癌 空间转录组学(Visium平台),组织学图像分析 卷积神经网络(EfficientNet-B0,ResNet,DenseNet) H&E组织学图像,空间基因表达数据 固定数据划分和种子的肝脏数据集,以及独立的乳腺癌数据集 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium平台用于空间转录组数据收集
179 2026-08-13
Identification of METTL3 and PRMT5 as an oncogenic pair for the prognosis and therapeutic targets of colorectal cancer subtype
2026-May-12, Clinical epigenetics IF:4.8Q1
研究论文 本文通过共表达网络分析,发现METTL3和PRMT5在结直肠癌中形成正反馈环,驱动肿瘤恶性进程,并作为预后标志物和治疗靶点 首次揭示METTL3和PRMT5之间的相互正反馈调控机制,并基于此进行患者分层和联合靶向治疗 研究主要基于细胞系和患者来源类器官,需更多临床样本验证,且具体分子机制仍待深入探索 建立METTL3共表达网络并识别结直肠癌的新型诊断和治疗靶点 结直肠癌患者、细胞系、患者来源类器官 数字病理学 结直肠癌 转录组测序、单细胞测序、空间转录组测序、共免疫沉淀、MeRIP、qRT-PCR NA 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据、蛋白质互作数据 涉及结直肠癌临床队列、细胞系和患者来源类器官,具体样本数量未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium单细胞3'、10x Visium空间转录组
180 2026-08-13
Immune landscape characterization of neurofibromas with atypical features in Neurofibromatosis1 reveals PD-1 and the Tim-3/Galectin-9 pathway as potential therapeutic targets
2026-05-03, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过免疫组化和单细胞RNA测序等技术,表征了神经纤维瘤病1型患者中具有非典型特征的神经纤维瘤和ANNUBP的免疫微环境,发现PD-1和Tim-3/Galectin-9通路可作为潜在治疗靶点 首次系统比较了非典型神经纤维瘤/ANNUBP与皮肤神经纤维瘤、丛状神经纤维瘤及恶性外周神经鞘瘤的免疫图谱,并发现PD-1和Tim-3/Galectin-9通路在非典型病变中的独特表达,提出免疫检查点分子作为免疫预防策略的新概念 样本量有限,且对于免疫微环境在控制肿瘤生长中的具体机制尚未完全阐明,需要进一步的功能验证 探索NF1相关非典型神经纤维瘤和ANNUBP的免疫微环境特征,寻找潜在的治疗靶点 NF1患者的非典型神经纤维瘤、ANNUBP、皮肤神经纤维瘤、丛状神经纤维瘤和恶性外周神经鞘瘤样本 数字病理学 神经纤维瘤病1型相关肿瘤 免疫组化、单细胞RNA测序、NanoString转录组分析、多重免疫荧光、靶向DNA测序 NA 组织切片图像和单细胞RNA测序数据 包含来自NF1患者的多种神经纤维瘤亚型样本,具体数量未在摘要中提及 NanoString, 10x Genomics 单细胞RNA测序 NanoString nCounter, 10x Chromium NanoString用于转录组分析,10x Chromium用于单细胞RNA测序
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