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当前共找到 991 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-06-26 |
Integrated Network Pharmacology and Single-Cell Transcriptomics Reveal Transketolase as a Potential Target for the DanShen-DaHuang Herb Pair in Acute Kidney Injury
2026-May-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104435
PMID:42196413
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研究论文 | 整合网络药理学与单细胞转录组学揭示丹参-大黄药对在急性肾损伤中潜在靶点转酮醇酶 | 首次将网络药理学、WGCNA与多算法机器学习（LASSO、Boruta、随机森林等）结合，筛选出转酮醇酶（TKT）作为丹参-大黄药对治疗急性肾损伤的核心靶点，并通过单细胞RNA测序解析其与巨噬细胞M2极化的关联 | 研究基于计算预测和理论分析，缺乏实验验证；单细胞数据来自公开数据集，样本来源有限 | 探索丹参-大黄药对在急性肾损伤中的分子靶点及其作用机制 | 丹参-大黄药对作用于急性肾损伤的分子靶点及肾脏微环境中的巨噬细胞亚群 | 机器学习 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序，网络药理学，分子对接 | LASSO、Boruta、随机森林、GBM、XGBoost、决策树 | 基因表达数据 | 77,593个高质量细胞（来自GSE197266数据集） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 162 | 2026-06-26 |
NFE2L2-Associated Ferroptosis Resistance Reshapes the Tumor Immune Microenvironment and Guides Therapeutic Strategies in Prostate Cancer
2026-May-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104448
PMID:42196424
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据（包括大量RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学），分析了前列腺癌中NFE2L2相关的铁死亡抵抗如何重塑肿瘤免疫微环境，并提出了潜在治疗策略 | 首次综合应用大量RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学系统解析前列腺癌中铁死亡抵抗与免疫微环境之间的相互作用，并鉴定出16基因铁死亡特征预测生化复发，同时利用药物反应建模和分子对接优先筛选出RSL3、阿托伐醌和索拉非尼等具有铁死亡调节活性的药物 | 研究主要基于回顾性公共数据，铁死亡特征和治疗策略需在更大前瞻性队列中进行验证；虚拟敲除分析虽提示因果关系，但缺乏直接的体外或体内功能验证 | 阐明NFE2L2相关铁死亡抵抗在前列腺癌免疫逃逸中的作用，并探索通过靶向铁死亡调节剂重塑肿瘤免疫微环境以增强免疫检查点阻断治疗效果的可能性 | 前列腺腺癌（PRAD）的肿瘤样本（包括498个大量RNA-seq样本、68,322个单细胞RNA-seq细胞和19,483个空间转录组点） | 机器学习 | 前列腺癌 | 大量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学、药物响应建模、分子对接 | NA | 基因表达数据、图像（空间转录组） | 498例大量RNA-seq样本、68,322个单细胞RNA-seq细胞、19,483个空间转录组斑点 | NA | 大量RNA-seq， 单细胞RNA-seq， 空间转录组学 | NA | NA |
| 163 | 2026-06-26 |
A Multi-Omics Framework Reveals Tumor Heterogeneity and Predicts Therapeutic Targets in Renal Cell Carcinoma
2026-May-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104456
PMID:42196432
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研究论文 | 该研究开发了一个整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和临床数据的计算框架，用于识别与癌症进展相关的细胞亚群，并在肾细胞癌中揭示了肿瘤异质性和潜在的治疗靶点 | 开发了CPcellsubpopulation计算框架，整合多组学数据识别癌症进展相关细胞亚群，在肾细胞癌中发现保守代谢性癌细胞与不良预后相关，并揭示了NK细胞、浆细胞和巨噬细胞在晚期阶段的关联 | 未明确提及局限性 | 识别与癌症进展相关的细胞亚群，预测潜在相互作用和关键转录因子，并预测候选抗癌药物 | 九种癌症的细胞亚群，重点是肾细胞癌的肿瘤细胞和免疫细胞 | 机器学习 | 肾细胞癌 | scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据、临床数据、空间转录组数据 | 九种癌症数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 164 | 2026-06-26 |
Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomics Analyses Delineate a BAG3-Associated Macrophage Program with Microenvironmental and Prognostic Relevance in Hepatocellular Carcinoma
2026-May-11, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17050562
PMID:42195019
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学分析，揭示了肝细胞癌中BAG3相关巨噬细胞程序的微环境和预后意义 | 首次鉴定出BAG3肿瘤相关巨噬细胞亚群及其应激适应、蛋白质稳态和基质重塑程序，并利用空间转录组学揭示其空间分布和微环境相互作用 | 空间转录组学样本量较小且来自治疗暴露队列，验证数据集的重复性有待进一步评估 | 评估BAG3相关肿瘤相关巨噬细胞程序在肝细胞癌中的生物学和预后相关性 | 肝细胞癌肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 多个公开单细胞RNA测序数据集及一个小型治疗暴露队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 165 | 2026-06-26 |
SIRT1 in Cardiac Diseases: Molecular Mechanisms, Therapeutic Potential, and Future Directions
2026-May-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104216
PMID:42196199
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综述 | 综述SIRT1在心脏疾病中的分子机制、治疗潜力和未来研究方向 | 系统整合了SIRT1在多种心脏疾病中的多重保护机制概述，并指出了其双向调节作用及精准调控的必要性 | 挑战包括实现心脏特异性靶向、优化NAD可用性和将临床前发现转化为临床实践 | 总结SIRT1在心脏疾病中的保护作用机制及潜在治疗策略 | SIRT1蛋白 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2026-06-26 |
Unfolding Immune Dysregulation in COPD: Identification of a Three-Gene Signature and Functional Validation of TCF7 in Human Lung Tissue and T Lymphocytes
2026-May-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104231
PMID:42196213
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研究论文 | 通过机器学习和单细胞RNA测序鉴定COPD免疫失调的3个基因特征，并验证TCF7在肺组织和T淋巴细胞中的功能 | 首次结合机器学习和单细胞RNA测序识别COPD免疫失调的3个基因特征（CD79A、FCER1G、TCF7），并通过体外和离体实验验证TCF7在T细胞凋亡中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 揭示慢性阻塞性肺疾病免疫失调的分子机制并识别潜在生物标志物 | COPD患者的肺组织、T淋巴细胞、巨噬细胞以及Jurkat细胞系 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA-seq、单细胞RNA测序、qRT-PCR、ELISA、Western blotting、免疫荧光 | 机器学习模型 | 转录组数据、单细胞测序数据 | 公共转录组数据集和外部验证队列 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 167 | 2026-06-26 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling Uncovers a Metastasis-Associated MUCL3+ Signet-Ring Cell Subpopulation in Gastric Cancer
2026-May-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15100857
PMID:42193868
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析，揭示胃癌中与转移相关的MUCL3+印戒细胞亚群 | 首次在胃癌印戒细胞癌中鉴定出MUCL3标记的印戒细胞亚群，并揭示其与转移相关的分子特征 | 研究样本数量有限，功能验证仅涉及TFF1对胃癌细胞迁移的影响，缺乏更大规模的临床验证 | 比较胃癌印戒细胞癌与胃腺癌，鉴定特异性生物标志物并阐明印戒细胞癌侵袭行为的分子基础 | 胃癌印戒细胞癌和胃腺癌患者的原发肿瘤组织 | 单细胞转录组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 手术切除的原发性胃癌组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 168 | 2026-06-26 |
Integrated Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Identifies Macrophage Heterogeneity and Mitophagy-Related Biomarkers in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-May-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104201
PMID:42196184
|
研究论文 | 整合单细胞和批量RNA测序，识别特发性肺纤维化中巨噬细胞异质性和线粒体自噬相关生物标志物 | 首次整合单细胞与批量RNA测序分析，揭示巨噬细胞-线粒体自噬轴在特发性肺纤维化发病机制中的新框架 | 基于公共数据库和计算分析，缺乏独立外部验证队列 | 阐明特发性肺纤维化中巨噬细胞与线粒体自噬之间的关联，并筛选潜在生物标志物用于早期诊断和临床管理 | 巨噬细胞亚群（M2型巨噬细胞）和特发性肺纤维化患者样本 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、机器学 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2026-06-26 |
Regenerative potential of Schneiderian membrane-derived mesenchymal stem cells in sinus floor elevation model and calvarial defect model
2026-May-08, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B2400611
PMID:42343636
|
研究论文 | 本研究评估了上颌窦黏膜间充质干细胞在窦底提升和颅骨缺损模型中的骨再生潜力 | 首次在体内验证了SMMSCs的成骨能力，并通过单细胞RNA测序揭示了其分子特征 | 未在文中明确提及 | 评估施耐德膜对窦底提升的贡献并验证SMMSCs在颅骨缺损中的功能 | 上颌窦黏膜间充质干细胞（SMMSCs）和骨髓间充质干细胞（BMSCs） | 数字病理学 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 兔子（双侧窦底提升）和人类施耐德膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 170 | 2026-06-26 |
Multi-omics reveals CXCR4 drives immune escape in colorectal cancer via metabolic reprogramming and immune microenvironment remodeling
2026-May-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08795-x
PMID:42082463
|
research paper | 采用整合单细胞转录组学和代谢组学分析，揭示CXCR4通过代谢重编程和免疫微环境重塑驱动结直肠癌免疫逃逸的机制 | 发现CXCR4通过调节PI3K-Akt-SMAD4通路介导代谢重编程，并通过谷氨酰胺代谢-免疫微环境双轴调控促进免疫逃逸，靶向CXCR4可增强PD-1抑制剂疗效 | NA | 揭示CXCR4在结直肠癌免疫抑制微环境和谷氨酰胺代谢重编程中的关键作用 | 结直肠癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、CD8 T细胞 | machine learning | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、代谢组学、基因敲除、共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据、代谢组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 171 | 2026-06-26 |
Identifying batch-integrated domains from spatial transcriptomics via graph autoencoder with contrastive learning based on cross-modality and data augmentation
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag248
PMID:42184117
|
research paper | 提出GCAST框架，一种基于图对比自编码器的空间转录组学方法，通过跨模态对比学习和数据增强识别批次整合的组织域 | 首次将跨模态对比学习与图自编码器结合，利用组织学和基因权重特征增强生物学可解释性，并自动对齐多数据集实现批次效应校正 | NA | 开发一种统一的、生物学信息引导的框架，以整合多模态空间转录组数据，识别组织域并实现批次效应校正 | 空间转录组学数据及其对应的组织学图像 | computer vision, machine learning | NA | 空间转录组学 | 图对比自编码器 | 基因表达数据, 组织学图像 | NA | NA | spatial transcriptomics | NA | NA |
| 172 | 2026-06-26 |
AnnQ: reference-based quantification of cellular abnormality at single-cell resolution
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag278
PMID:42218718
|
研究论文 | AnnQ是一种基于参考的量化方法，能够在单细胞分辨率下评估细胞异常性 | 将细胞注释中的不确定性转化为量化指标，用于检测异常细胞状态，这是传统聚类和差异丰度分析无法实现的 | 未提及 | 提出一种利用参考数据集量化单细胞RNA测序中细胞异常性的方法 | 遗传扰动和耐药性数据集中的单细胞 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 173 | 2026-06-26 |
scTumorDrug: predicting cell-type-specific drug responses for heterogeneous tumors
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag337
PMID:42341215
|
研究论文 | 开发了scTumorDrug工具，整合单细胞RNA测序、批量RNA和药物响应数据，预测异质性肿瘤中细胞类型特异性药物反应 | 首次在来自小鼠模型和临床人类样本的真实肿瘤上直接验证细胞类型特异性药物反应预测，结合空间转录组学进行交叉验证 | 缺乏来自肿瘤亚群药物响应的直接实验验证，仅通过小鼠模型和空间转录组学间接验证 | 预测异质性肿瘤中细胞类型特异性药物反应，以实现精准医疗 | 细胞系、小鼠模型和临床人类样本中的肿瘤细胞 | 机器学习 | 膀胱肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞核RNA测序（snRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、药物响应数据 | 公开数据集（细胞系、小鼠模型、临床人类样本）及小鼠膀胱肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 174 | 2026-06-26 |
scDeepAPA: a deep learning framework for single-cell alternative polyadenylation identification
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag339
PMID:42341216
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研究论文 | 提出了scDeepAPA，一个针对单细胞RNA测序数据优化的深度学习框架，用于准确识别多聚腺苷酸化位点、定量异构体并解析APA事件的功能影响 | 首次将Mamba状态空间模型与双向LSTM和卷积特征提取相结合，专门针对单细胞RNA测序数据设计，无需依赖基因注释即可实现高精度APA识别 | NA | 开发适用于单细胞转录组学的多聚腺苷酸化位点检测与功能解读计算方法 | 人类和小鼠单细胞RNA测序数据，阿尔茨海默病小鼠脑组织数据，KRAS突变小细胞肺癌数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病, 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络, 双向LSTM, Mamba状态空间模型 | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2026-06-26 |
Tumor Electric Field Therapy Inhibits Epithelial-Mesenchymal Transition, Invasion, and Migration of Glioblastoma by Targeting the c-FOS/CXCL14 Axis
2026-May, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70926
PMID:42153722
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research paper | 本研究揭示了肿瘤电场疗法通过c-FOS/CXCL14轴抑制胶质母细胞瘤上皮-间充质转化、侵袭和迁移的机制 | 首次阐明肿瘤电场疗法通过c-FOS/CXCL14轴抑制胶质母细胞瘤上皮-间充质转化的新机制 | NA | 探究肿瘤电场疗法抑制胶质母细胞瘤上皮-间充质转化、侵袭和迁移的分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系（U87、U251、T98G）及原位裸鼠模型 | machine learning | lung cancer | RNA-seq, 单细胞测序, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 三个胶质母细胞瘤细胞系及原位裸鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 176 | 2026-06-26 |
Post-Stroke Depression Is Associated With Shared Neurodevelopmental Risk and Circuit Disruption
2026-May, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71502
PMID:42178876
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研究论文 | 该研究整合了跨疾病基因组学、发育性空间转录组学和因果神经影像学，揭示了卒中后抑郁（PSD）与共享的神经发育风险和回路破坏相关 | 首次将发育性遗传风险（E16.5小鼠胚胎脑）与卒中后抑郁的神经回路异常（DMN-SMN去耦联）直接关联，并识别HDAC9和PITX2为潜在通路靶点 | 样本量较小（16例PSD患者和14例对照），且依赖发育小鼠模型数据，未在人类发育组织中验证 | 阐明卒中后抑郁（PSD）的生物学基础，特别是遗传、发育和神经回路层面的机制 | 16例卒中后抑郁（PSD）患者和14例匹配对照 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 空间转录组学, fMRI | NA | 基因表达数据, 影像数据 | 16例PSD患者和14例匹配对照 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, 功能磁共振成像（fMRI） | NA | NA |
| 177 | 2026-06-26 |
COX2+/PDGFRα+ fibroblasts selectively localize near bile ducts and interact with immune cells in early liver fibrosis in mice
2026-May, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.70938
PMID:42178880
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠肝脏中PDGFRα阳性成纤维细胞的异质性，发现COX2+亚群在早期肝纤维化中优先定位于胆管周围并与免疫细胞相互作用 | 首次揭示COX2阳性PDGFRα阳性成纤维细胞亚群在早期肝纤维化中与免疫细胞的优先相互作用，并发现其定位于胆管周围的独特空间分布特征 | 仅基于小鼠模型研究，未在人类样本中验证；未深入探讨COX2阳性亚群在纤维化进展中的具体功能机制 | 阐明PDGFRα阳性成纤维细胞在早期肝纤维化中的细胞异质性及其与免疫细胞的相互作用机制 | 健康小鼠和胆管结扎诱导肝纤维化小鼠肝脏中的PDGFRα阳性成纤维细胞及免疫细胞 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肝脏样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2026-06-25 |
CCR5+ CD8+ T Cells Are Associated with Poor Response to PD-1 Blockade Therapy
2026-May-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114963
PMID:42278489
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研究论文 | 分析了非小细胞肺癌和黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据，发现CCR5+ CD8+ T细胞与PD-1阻断疗法的不良反应相关 | 首次系统揭示了CCR5+ CD8+ T细胞的转录组特征与PD-1/PD-L1阻断疗法低应答率之间的关联，并识别了CCL3/4-CCR5轴作为候选通路 | 基于公开数据集的分析，需要进一步的空间、功能和实验验证来确认CCL3/4-CCR5轴的作用机制 | 探究趋化因子受体表达与PD-1阻断疗法反应性之间的关联 | 非小细胞肺癌和黑色素瘤患者队列中的CD8+ T细胞，以及肝细胞癌和结直肠癌数据集的探索性分析 | 机器学习 | 非小细胞肺癌, 黑色素瘤, 肝细胞癌, 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 公开数据集中非小细胞肺癌和黑色素瘤患者样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2026-06-25 |
The role of the sex determination cascade in the development of caste polyphenisms
2026-May-29, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2026.101551
PMID:42217621
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综述 | 综述性决定级联在蜜蜂和蚂蚁等社会性昆虫的等级多态性发展中的作用 | 强调性决定通路与胰岛素和保幼激素信号等保守发育通路的整合，以及选择性剪接和时空基因表达在调控塑性表型中的关键作用 | 研究偏向蜜蜂和雌性，缺乏对无刺蜂、社会寄生蜂和雄性等代表性不足群体的比较进化发育框架，知识空白显著 | 理解性决定级联如何调控等级分化，以及发育可塑性如何驱动与社会复杂性相关的等级特异性特征的进化 | 蚂蚁和蜜蜂，特别是corbiculate蜜蜂 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 长读长转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 180 | 2026-06-25 |
CCL19+ fibroblasts define a proliferative niche in chronic lymphocytic leukemia
2026-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.15.623868
PMID:42244527
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了CCL19+成纤维细胞在慢性淋巴细胞白血病增殖中心中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序管道深入表征反应性和CLL淋巴结，发现CCL19+成纤维细胞形成特异性的增殖微环境，并识别出多个关键的配体-受体相互作用 | 未明确说明 | 深入表征慢性淋巴细胞白血病淋巴结的细胞组成和微环境特征，揭示增殖中心的功能机制 | 慢性淋巴细胞白血病患者的淋巴结和反应性淋巴结 | 自然语言处理 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序管道 |