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当前共找到 987 篇文献,本页显示第 141 - 160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
141 2026-08-25
Combination scRNA-seq with GWAS identifies genetic risk factors in IgA nephropathy: An observational study
2026-May-15, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 该研究结合单细胞RNA测序与全基因组关联分析,识别IgA肾病中的遗传风险因素,重点关注巨噬细胞亚群。 创新性地将scRNA-seq与GWAS的孟德尔随机化分析相结合,并辅以分子对接,以优先排序与IgA肾病风险相关的巨噬细胞相关基因。 研究结果基于计算预测,缺乏因果关系或治疗效果的确定性证据。 识别IgA肾病中与巨噬细胞相关的遗传风险因素,并探讨潜在的治疗靶点。 IgA肾病和慢性肾病的肾脏样本,以及公开的GWAS数据。 机器学习 自身免疫性肾病 单细胞RNA测序,全基因组关联分析,孟德尔随机化,批量RNA测序,分子对接 NA 基因表达数据,遗传变异数据 IgA肾病和CKD肾脏样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
142 2026-08-23
Triggering Receptor Expressed on Myeloid Cells 2+ Macrophages Promote Pancreatic Regeneration Through Cholesterol-Metabolism Reprogramming and Hedgehog Signaling Activation Following Acute Pancreatitis
2026-May-27, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本文研究了急性胰腺炎后骨髓细胞上表达的触发受体2阳性巨噬细胞通过胆固醇代谢重编程和Hedgehog信号激活促进胰腺再生的机制。 首次揭示单核细胞来源的TREM2+巨噬细胞在急性胰腺炎后的胰腺再生中发挥关键作用,并阐明其通过胆固醇代谢重编程和Hedgehog信号通路促进修复的机制。 研究中主要依赖小鼠模型,未在人类急性胰腺炎组织中进行功能验证,可能限制临床转化。 探讨TREM2+巨噬细胞在急性胰腺炎后胰腺再生中的作用及其分子机制。 急性胰腺炎小鼠模型及人类急性胰腺炎组织和血清样本。 数字病理学 胰腺炎 单细胞RNA测序、免疫组化、谱系追踪、转录组分析 基因敲除小鼠模型(LysMCreTrem2fl/fl) 基因表达数据、免疫组化图像、临床血清数据 小鼠模型及急性胰腺炎临床队列(具体样本量未在摘要中提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
143 2026-08-23
Spatial transcriptomics reveals influence of microenvironment on intrinsic fates in melanoma therapy resistance
2026-May-23, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 利用空间转录组学和单细胞RNA测序揭示黑色素瘤治疗耐药性中微环境对细胞内在命运的影响 首次通过单细胞分辨率的空间转录组学在异种移植模型中揭示内在决定和外在影响的耐药命运共存,并识别出微环境对耐药命运选择的影响 未提及 探究黑色素瘤治疗耐药性如何受细胞内在状态和肿瘤微环境的共同影响 黑色素瘤细胞系和患者样本以及异种移植模型 空间转录组学 黑色素瘤 空间转录组学、单细胞RNA测序、共识非负矩阵分解 NA 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 未提及具体样本量 NA 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA NA
144 2026-08-23
DGAT: a dual-graph attention network for inferring spatial protein landscapes from transcriptomics
2026-May-21, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发了一种名为DGAT的双图注意力网络,用于从空间转录组数据推断空间蛋白景观。 提出了一种新的深度学习框架,利用图注意力网络构建异构整合转录组、蛋白质组和空间信息,从空间转录组数据中高精度推断蛋白表达。 由于摘要中未提及,此处无法提供具体限制,为NA。 从空间转录组数据中推断空间蛋白表达,以桥接转录组和蛋白质组之间的差距。 空间转录组和蛋白质组数据集,包括公共和内部数据集。 深度学习 NA 空间转录组测序 图注意力网络 基因表达数据,空间信息 NA NA 空间转录组学 NA NA
145 2026-08-23
Pancreatic tumor microenvironment reprogramming via alloantigen-expressing virotherapy elicits tumor rejection and improves immunotherapy response
2026-May-12, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究开发了一种表达同种异体抗原的溶瘤病毒疗法,用于重编程胰腺导管腺癌的肿瘤微环境,增强免疫治疗效果并诱导持久抗肿瘤免疫 首次利用溶瘤病毒载体表达同种异体抗原(H-2Kb或H-2Kk)来触发急性移植排斥机制,从而将免疫冷肿瘤转变为热肿瘤,并增强免疫检查点抑制剂的疗效 本研究主要基于小鼠模型,未涉及人类临床样本和长期安全性评估,且需进一步探索最佳联合方案及潜在副作用 探索通过表达同种异体抗原的溶瘤病毒治疗重编程胰腺癌肿瘤微环境,提高免疫治疗敏感性并建立持久抗肿瘤免疫 胰腺导管腺癌细胞系和小鼠模型(免疫活性PDAC模型) 肿瘤免疫治疗、病毒疗法、数字病理学 胰腺癌 溶瘤病毒构建、多重免疫组化、流式细胞术、空间转录组学 小鼠异种移植模型和同种移植模型 组织病理图像、基因表达数据、生存数据 两个免疫活性PDAC小鼠模型,具体样本数量未明确 NA 空间转录组学 NA 空间转录组学分析肿瘤微环境的区室特异性免疫激活和上皮代谢重编程
146 2026-08-23
Integrated Plasma Proteomics and Functional Analyses Reveal Hepatic CDHR2 as a Potential Therapeutic Target in MASLD
2026-05, Diabetes, obesity & metabolism
研究论文 本研究整合血浆蛋白质组学与功能分析,发现肝脏CDHR2作为MASLD潜在治疗靶点 首次通过整合UK Biobank血浆蛋白质组学、孟德尔随机化及体外功能验证,识别并验证CDHR2为MASLD的新型致病蛋白和治疗靶点 基于UK Biobank的观察性数据,功能验证仅在体外细胞模型中进行,缺乏体内动物实验验证 识别并功能验证与MASLD相关的蛋白质靶点,为疾病治疗提供新方向 MASLD患者(UK Biobank参与者)及体外培养的原代肝细胞、HepG2和AML12细胞 蛋白质组学、功能基因组学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 血浆蛋白质组学、孟德尔随机化、RNA-seq、免疫染色、基因沉默和过表达 NA 蛋白质组学数据、临床影像数据、基因表达数据、细胞实验数据 UK Biobank中具有cT1和血浆蛋白质组数据的MASLD参与者,具体数量未提供 NA 血浆蛋白质组学、RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
147 2026-08-23
Single-Cell RNA-seq Analysis Reveals Distinct Tumor and Immunosuppressive T-Cell Phenotypes in Patients with CLL Treated with Ibrutinib
2026-May-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序分析揭示接受ibrutinib治疗的慢性淋巴细胞白血病患者中肿瘤和免疫抑制性T细胞的不同表型 首次在单细胞水平描绘ibrutinib敏感和耐药CLL患者外周血单个核细胞的转录异质性,特别是T细胞耗竭和单核细胞极化与耐药性的关联 样本量有限,且未进行功能验证或纵向追踪;结果可能受个体间异质性影响 理解ibrutinib敏感和耐药CLL细胞及免疫微环境的差异,以识别控制BTKi治疗期间残留疾病的治疗策略 接受ibrutinib治疗的CLL患者的外周血单个核细胞 单细胞转录组学 慢性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 若干CLL患者样本(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA-seq NA NA
148 2026-08-23
HELIX: a scalable model for predicting context-dependent regulation of RNA splicing and isoform usage
2026-05, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 开发了HELIX,一种分层深度学习框架,用于预测组织特异性和条件特异性的剪接模式及转录本异构体使用 整合了前体mRNA序列和RNA结合蛋白表达谱,同时利用短读长和长读长RNA测序数据进行训练,提高了预测准确性,并能通过迁移学习适应单细胞RNA测序数据 未明确说明局限性 预测上下文依赖性剪接调控和异构体使用,以理解疾病发病机制和器官发育 剪接模式、异构体使用、组织特异性剪接数量性状位点、患者特异性剪接失调、细胞类型特异性异构体 机器学习 结肠癌 RNA-seq、长读长测序、单细胞RNA-seq 分层深度学习模型 序列数据、表达谱数据 未明确说明 NA RNA-seq, 长读长RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
149 2026-08-21
Integrated transcriptomic analysis identifies liver aging-driven fibrosis signatures and reveals therapeutic strategies based on medicine-food homology
2026-May-26, NPJ science of food IF:6.3Q1
研究论文 通过整合纵向转录组学、单细胞RNA测序和机器学习方法,识别肝脏衰老驱动的纤维化特征,并筛选药食同源草药作为治疗策略 首次结合纵向转录组学、单细胞RNA测序和机器学习算法建立衰老基因评分(AGS)和五基因生物标志物面板,并利用网络药理学和分子对接筛选药食同源草药,发现金荞麦和黄芪的活性成分MOL000098与纤维化靶点COL3A1的强结合 研究主要基于生物信息学分析和体外功能实验,缺乏体内动物模型验证以及临床样本的进一步确认 系统性表征肝脏衰老驱动的纤维化过程,并探索基于药食同源的抗衰老和抗纤维化干预策略 肝脏衰老相关的基因表达数据、单细胞RNA测序数据、肝细胞和巨噬细胞、纤维化相关靶点和药食同源草药成分 机器学习 肝脏纤维化 转录组学、单细胞RNA测序、分子对接 Boruta和LASSO算法、网络药理学 转录组数据、单细胞RNA测序数据、分子结构数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
150 2026-08-21
AI-driven multi-omics drug repurposing nominates AZD7762 as a multitarget inhibitor of IL22RA1 and FAM221A in esophageal squamous cell carcinoma
2026-May-26, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究开发了一种AI驱动的多组学管线,将预后建模与多靶点药物重定位相结合,用于食管鳞状细胞癌,并提名AZD7762作为IL22RA1和FAM221A的多靶点抑制剂 创新性地将孟德尔随机化、转录组数据、单细胞RNA测序和机器学习药物预测整合到多组学流程中,以识别预后基因和药物靶点,并提出多靶点药物重定位策略 未提及具体局限性,但可能包括需要进一步临床验证和机制研究 开发AI驱动的多组学管道,以识别食管鳞状细胞癌的预后基因和多靶点药物重定位候选药物,提供精准肿瘤学策略 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者样本及相关细胞系 多组学、机器学习、数字病理学 食管鳞状细胞癌 RNA测序、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、药物敏感性预测、分子对接 Cox回归、非负矩阵分解、Lasso Cox、SHAP解释、机器学习 转录组数据、单细胞RNA测序数据、药物敏感性数据 未提供具体样本数量,但涉及肿瘤样本和细胞系 NA NA NA NA
151 2026-08-21
Epithelial CD155-TIGIT/CD226 signaling links CD8⁺ T-cell exhaustion to frequent exacerbations in COPD
2026-May-21, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究探讨了COPD中上皮细胞CD155与TIGIT/CD226信号通路如何导致CD8⁺ T细胞耗竭,并增加频繁急性加重风险 首次整合单细胞RNA测序与多组织样本分析,揭示TIGIT-CD155/CD226通路在COPD免疫检查点失调中的关键作用,并证明TIGIT敲低可逆转T细胞耗竭状态 横断面观察设计,未能追踪时间动态;样本来源有限,可能限制结论的普遍性 确定TIGIT通路激活是否促进COPD中CD8⁺ T细胞耗竭及频繁急性加重易感性 COPD患者和健康对照的外周血、支气管肺泡灌洗液和肺组织 免疫学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化、功能实验(细胞因子检测、凋亡、慢病毒TIGIT敲低) NA 基因表达数据、细胞表型数据、组织图像 NA(涉及人类肺组织单细胞数据及多组患者样本) NA 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化 NA NA
152 2026-08-21
A mitochondrial ROS-dependent antiviral response promotes β cell resilience and is diminished in donors with type 1 diabetes
2026-May-20, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过体内外成像和遗传分析,探究了IFN-α诱导的人类β细胞线粒体ROS产生及其在抗病毒反应和1型糖尿病发病中的作用 首次发现人类β细胞亚群对IFN-α反应产生线粒体ROS,并鉴定出相关基因签名,揭示ROS在抗病毒反应中的关键作用及其在T1D中减弱的现象 未明确说明局限性,但可能包括样本量有限或仅基于体外和离体实验,缺乏体内验证 研究IFN-α对人类β细胞生理的影响,特别是线粒体ROS在抗病毒反应和T1D发病机制中的作用 人类胰岛β细胞、供体胰岛、β细胞系 病理学 1型糖尿病 RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术、成像、遗传分析 NA 图像、基因表达数据、测序数据 来自多个供体的人胰岛样本及β细胞系 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
153 2026-08-21
Niacin promotes motor function recovery after spinal cord injury via Hcar2-dependent microglia immunometabolic regulation
2026-05, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究探讨了烟酸通过Hcar2依赖性小胶质细胞免疫代谢调控促进脊髓损伤后运动功能恢复的机制 首次揭示Hcar2在脊髓损伤后小胶质细胞中的富集表达及其作为代谢检查点的作用,并证明烟酸可通过Hcar2将小胶质细胞代谢从糖酵解重编程为氧化磷酸化,促进抗炎表型转化,从而改善运动功能恢复 研究主要基于小鼠模型和体外实验,缺乏人体临床试验验证;未完全阐明Hcar2调控免疫代谢的详细分子机制 探究Hcar2在脊髓损伤中的作用及其作为治疗靶点的潜力,评估烟酸激活Hcar2对运动功能恢复的保护效果 脊髓损伤小鼠模型、Hcar2基因敲除小鼠、LPS诱导的BV2小胶质细胞模型 神经科学 脊髓损伤 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫荧光染色、Western blotting、实时聚合酶链反应 基因敲除小鼠模型、细胞模型 转录组数据、图像、基因表达数据 小鼠和恒河猴的单细胞RNA测序数据集;小鼠模型和BV2细胞模型(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
154 2026-08-21
Excitatory neurons and astrocytes-specific dysregulation and aberrant interactions are vulnerable to FCDI as suggested by single-cell spatial transcriptomics
2026-05, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究利用单核RNA测序和空间转录组学技术,构建了局灶性皮质发育不良I型(FCDI)患者致痫皮层的单细胞空间转录组图谱,揭示了兴奋性神经元和星形胶质细胞的特异性失调及异常细胞互作,为FCDI发病机制提供了新见解。 首次通过单细胞空间转录组学整合分析,鉴定FCDI中兴奋性神经元和星形胶质细胞的特异性变化,构建了TF-枢纽基因调控网络,并发现CBLN2highEx-1亚群与神经元过度兴奋相关。 样本量较小(3例FCDI患者和3例对照),需要扩大样本量以验证结果的普适性;研究基于组织样本,未能完全排除个体差异的影响。 探索FCDI的分子机制,特别是兴奋性神经元和星形胶质细胞的失调及其相互作用,寻找潜在的治疗靶点。 FCDI患者的致痫皮层组织和相对正常的皮层组织(对照)。 数字病理学,空间转录组学 局灶性皮质发育不良I型,癫痫 单核RNA测序(snRNA-seq),空间转录组学(spatial transcriptomics),Western blot,免疫荧光 NA 基因表达数据(单细胞和空间),蛋白质表达数据 6个样本(3个FCDI患者致痫皮层组织,3个相对正常皮层组织作为对照) 10x Genomics 单核RNA-seq,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium单核RNA测序和10x Visium空间转录组学平台进行多组学整合分析
155 2026-08-21
Integrated Bulk and Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Transcriptional Activation of PTGS2 by FOS in Progression From T2DM to T2DM-Associated NAFLD
2026-May, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究整合批量与单细胞RNA测序分析,揭示了FOS介导的PTGS2转录激活在2型糖尿病向非酒精性脂肪肝进展中的作用机制 首次通过整合批量转录组和单细胞转录组数据,结合转录因子预测和双荧光素酶实验,证实FOS直接结合PTGS2启动子并驱动其转录,从而促进T2DM向NAFLD的进展 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限、体外实验与体内环境的差异等 阐明2型糖尿病向相关非酒精性脂肪肝进展过程中FOS介导PTGS2激活的分子调控机制 T2DM相关NAFLD患者的转录组数据、单细胞转录组数据及体外细胞模型 转录组学 2型糖尿病、非酒精性脂肪肝 批量RNA测序、单细胞RNA测序、双荧光素酶报告基因实验 LASSO回归、随机森林 转录组数据、单细胞转录组数据 未明确说明样本数量,涉及GEO批量数据、患者转录组及细胞实验 NA 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
156 2026-08-20
Clinical outcomes and spatial transcriptomic profiles of CD19/20 CAR-T therapy in relapsed or refractory B-cell non-Hodgkin's lymphoma
2026-May-17, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究评估了CD19/20双特异性CAR-T细胞治疗复发或难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤的临床疗效,并结合空间转录组学分析揭示治疗反应相关的肿瘤内源性和微环境因素 首次将空间分辨的单细胞转录组学应用于CD19/20双特异性CAR-T细胞治疗,以识别与临床反应相关的肿瘤内源性和微环境特征 空间转录组分析仅基于少数患者(5例)的预处理活检样本,可能限制了结果的普遍性 评估CD19/20双特异性CAR-T细胞治疗复发或难治性B-NHL的疗效和安全性,并利用空间转录组学探索治疗反应的预测因素 复发或难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者,包括弥漫大B细胞淋巴瘤等亚型 数字病理学, 机器学习 B细胞非霍奇金淋巴瘤 CAR-T细胞治疗, 空间单细胞转录组学 NA 空间转录组数据, 临床数据 32名患者接受治疗,其中31名可评估疗效;5名患者进行了空间转录组分析 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
157 2026-08-20
DeSpotX: Identifiability-Based Decontamination for Spatial Transcriptomics
2026-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
research paper 该研究提出了DeSpotX,一种利用锚定基因和空间信息进行可识别性去污的深度生成模型,用于处理空间转录组数据中的转录本污染问题 通过引入锚定基因使去污分解具有可识别性,并利用空间信息进行局部污染估计,同时采用学习到的扩散先验防止过度校正 文中未明确提及限制,但根据内容推测可能涉及对细胞簇注释准确性的一定依赖 解决空间转录组数据中转录本污染导致的分解不明确问题,提高下游生物分析的准确性 空间转录组数据中的基因表达,包括模拟和真实组织样本 生物信息学 不适用 空间转录组测序 深度生成模型 基因表达计数数据 五个人类数据集和四个空间转录组平台,具体样本数量未给出 NA 空间转录组学 NA NA
158 2026-08-19
Single-cell transcriptomic profiling of patient-derived pancreatic ductal adenocarcinoma primary cell cultures
2026-May-18, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术对41个患者来源的胰腺导管腺癌原代细胞培养物进行转录组分析,揭示肿瘤内和肿瘤间的转录异质性 采用基于SPLiT-seq的Evercode™技术,无需液滴微流控即可实现多样本高通量单细胞转录组分析,提供了大规模PDAC患者来源细胞系的功能注释资源 摘要中未提及局限性信息 表征胰腺导管腺癌的细胞异质性,支持开发单细胞分析计算工具,并指导针对肿瘤细胞亚群的功能研究 41个患者来源的胰腺导管腺癌原代细胞培养物 单细胞转录组学 胰腺导管腺癌 单细胞RNA测序(SPLiT-seq) NA 单细胞转录组数据 41个患者来源的原代细胞培养物 Parse Biosciences 单细胞RNA-seq Evercode™ 基于Split Pool Ligation-based Transcriptome sequencing (SPLiT-seq)的Evercode™技术
159 2026-08-19
Breast Cancer Milieu Maneuvers Cancer-Associated Macrophages to Synergize Neoplastic Repertoires
2026-May-14, Cancers IF:4.5Q1
综述 该综述探讨乳腺癌微环境如何调控肿瘤相关巨噬细胞极化至M2亚型,以协同促进肿瘤恶性特征 结合单细胞测序、空间和计算技术的最新进展,细化了对肿瘤相关巨噬细胞异质性的理解,并强调临床试验中存在的治疗特异性低、信号补偿及小鼠与人类巨噬细胞生物学差异等局限 临床转化受限,主要由于治疗特异性低、补偿性信号以及小鼠和人类巨噬细胞生物学的差异 阐明促进M2亚型富集的分子线索,并为未来治疗策略提供建议 乳腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞及其M1/M2亚型 癌症生物学 乳腺癌 NA NA NA NA NA NA NA NA
160 2026-08-19
Low-dose radiotherapy synergizes with PD-1 blockade to achieve durable survival in advanced NSCLC through antitumor neutrophil programming
2026-May-07, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究开发了一种名为TRIDENT的三联疗法,结合免疫调节性低剂量放疗、免疫原性高剂量放疗和PD-1阻断,在晚期非小细胞肺癌中实现持久生存,并通过抗肿瘤中性粒细胞编程发挥协同作用。 首次提出TRIDENT三联疗法,结合低剂量放疗、高剂量放疗和PD-1阻断,并揭示TNF-α⁺中性粒细胞在抗肿瘤免疫中的新机制。 纳入患者数量有限,且受试者均为PD-L1阳性患者,结果需在更大规模的随机对照试验中进一步验证。 优化放疗与免疫治疗的联合策略,以提高晚期非小细胞肺癌患者的总体生存率。 晚期非小细胞肺癌患者,包括治疗初治、PD-L1阳性患者,以及独立的真实世界队列。 数字病理学 肺癌 空间转录组学 NA 组织图像和基因表达数据 29名患者的I期试验和97名患者的真实世界队列 NA 空间转录组学 NA NA
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