单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 987 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-08-30 |
Exploring fibroblast activation protein as an early biomarker in chronic lung allograft dysfunction
2026-May, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01738-2025
PMID:41412718
|
研究论文 | 探索成纤维细胞活化蛋白作为慢性肺同种异体移植功能障碍的早期生物标志物 | 首次在慢性肺同种异体移植功能障碍中评估FAP表达，并利用单细胞RNA测序和免疫组化相结合的方法，确定了FAP阳性面积的最佳阈值用于早期风险分层 | FAP的鉴别能力中等，需要在多中心队列中进行前瞻性验证 | 评估FAP表达在慢性肺同种异体移植功能障碍中是否升高，并探究其作为早期诊断标志物的潜力 | 两个小鼠原位肺移植模型和人类肺组织样本（五个对照和五个慢性肺同种异体移植功能障碍患者）及240名肺移植受者的经支气管活检 | 数字病理学 | 慢性肺同种异体移植功能障碍 | 单细胞RNA测序、免疫组化 | Cox比例风险模型、Kaplan-Meier分析 | 基因表达数据、组织图像 | 小鼠模型两个，人类肺组织十个样本，240名肺移植受者（62例有慢性肺同种异体移植功能障碍，178例无） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2026-08-27 |
GraphTME: graph-based framework for predicting immunotherapy response by interpreting tumour microenvironment interactions using spatial transcriptomics
2026-May-29, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00735-x
PMID:42215484
|
研究论文 | 提出GraphTME框架，利用空间转录组数据建模肿瘤微环境中的配体-受体信号，预测免疫检查点抑制剂治疗反应 | 首次将空间转录组数据中的单细胞水平细胞间相互作用定量建模为多关系有向图，并用于预测免疫治疗反应，提供空间分辨且生物学可解释的生物标志物 | 未提及 | 开发一种基于空间转录组数据的框架，以预测免疫检查点抑制剂治疗反应并解释肿瘤微环境中的细胞相互作用 | 非小细胞肺癌（NSCLC）患者，特别是其CD8 T细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 空间转录组学 | 图神经网络（Graph Neural Network） | 空间转录组数据（MERFISH），单细胞RNA测序数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | NA |
| 123 | 2026-08-27 |
Sigma-1R-CD36 axis in myeloid cells contributes to the alleviation of depression-like behaviors
2026-05-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08297-6
PMID:42192440
|
研究论文 | 本研究探讨了髓系细胞中Sigma-1受体（Sigma-1R）与CD36的相互作用，及其通过TRIM28介导的泛素化降解减轻抑郁症样行为的机制 | 首次揭示髓系细胞中Sigma-1R-CD36轴在抑郁症中的作用，并阐明Sigma-1R通过TRIM28依赖的K48连接泛素化促进CD36蛋白酶体降解的新机制 | 未提及具体局限性，但可推测样本量和人群异质性可能影响结果，且机制研究主要基于小鼠模型 | 探讨髓系细胞中Sigma-1R和CD36在抑郁症中的作用，评估其作为调节外周炎症和改善抑郁表型的潜在治疗靶点 | 抑郁症患者外周血单核细胞（PBMC）转录组数据、慢性束缚应激（CRS）小鼠模型及体外细胞实验 | 机器学习 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、共免疫沉淀、泛素化/蛋白酶体降解实验、流式细胞术 | 未提及 | 转录组数据、图像（流式细胞术）、分子生物学数据 | 五个PBMC转录组队列（n=1388）、单细胞RNA测序（MDD: n=8, HC: n=8）、CRS小鼠实验 | 未提及 | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | 未提及 | 未提及 |
| 124 | 2026-08-27 |
Identifying potential ligand-receptor interactions by integrating LSTM network and the attention mechanism for cell-cell communication prediction
2026-05-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08033-0
PMID:42185831
|
研究论文 | 开发了CellAL，一种基于深度学习的框架，通过整合LSTM网络和注意力机制，直接从蛋白质序列预测配体-受体相互作用，并推断细胞间通讯。 | 引入注意力机制的LSTM网络以捕捉蛋白质序列的长程依赖性，克服对静态数据库的依赖，并实现直接从序列预测新型配体-受体相互作用。 | 可能受到训练数据集规模和质量的影响，且未在更广泛的生物场景中进行验证。 | 开发能直接从蛋白质序列数据预测潜在配体-受体相互作用及推断细胞通讯的稳健计算框架。 | 配体-受体相互作用和细胞间通讯，基于scRNA-seq数据。 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 深度学习，scRNA-seq | LSTM，注意力机制 | 蛋白质序列数据，单细胞RNA测序数据 | 四个标准数据集和人类黑色素瘤scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2026-08-27 |
CR1(+) tumor-associated macrophages orchestrate an immunosuppressive niche in hepatocellular carcinoma: a genetic and multi-omics dissection
2026-05-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08301-z
PMID:42185899
|
研究论文 | 通过遗传与多组学分析，揭示CR1阳性肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌中构建免疫抑制微环境的作用。 | 首次整合遗传、空间和功能证据，证明CR1+ TAM是肝细胞癌中临床相关的免疫调节轴，扩展了对补体相关免疫抑制的理解。 | 未提供具体局限性信息。 | 评估CR1在肝细胞癌免疫抑制微环境中的调节作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力。 | 肝细胞癌肿瘤相关巨噬细胞及其与CD8+ T细胞的相互作用。 | 多组学、遗传学 | 肝细胞癌 | 孟德尔随机化、代谢物中介分析、批量转录组、单细胞RNA测序、空间转录组、功能实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、临床样本数据 | 包括TCGA-HCC队列、21个样本的53474个单细胞、2个空间HCC切片、30对配对临床样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组、批量RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2026-08-27 |
Spatial and single-cell transcriptomic profiling reveals interplay between SRGN-associated epithelial programs and C1QC+ macrophages in early LUAD progression
2026-05-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08241-8
PMID:42177544
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组分析，揭示了早期肺腺癌进展中SRGN相关上皮程序与C1QC+巨噬细胞之间的相互作用。 | 首次整合单细胞和空间转录组学方法，系统描绘了从癌前病变到浸润性腺癌的演变轨迹，并发现了SRGN+恶性细胞与C1QC+巨噬细胞在空间上的共定位及特异性受体-配体介导的相互作用。 | 研究主要基于组织样本和动物模型，可能无法完全反映人类体内复杂的肿瘤微环境；且需要进一步的功能实验验证所发现的分子相互作用的因果性。 | 阐明早期肺腺癌从癌前病变到浸润性癌的分子和细胞机制，为早期诊断和治疗提供潜在靶点。 | 早期肺腺癌的四个组织学阶段（非典型腺瘤样增生、原位腺癌、微浸润性腺癌、浸润性腺癌）的细胞群体。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组分析 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 人类肺腺癌四个阶段的组织样本及A/J小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组 | NA | NA |
| 127 | 2026-08-27 |
Targeted suppression of SPP1 inhibits tumor invasion and metastasis in NRF2 hyperactivated cisplatin resistant HNSCC
2026-05-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08292-x
PMID:42174609
|
研究论文 | 本研究探讨靶向抑制SPP1对NRF2过度激活的顺铂耐药头颈鳞状细胞癌的肿瘤侵袭和转移的抑制作用 | 首次揭示SPP1在NRF2过度激活的顺铂耐药HNSCC中的促肿瘤作用，并通过空间转录组学发现SPP1与整合素和CD44受体的潜在机制交互 | 基于细胞系和小鼠模型，临床验证尚需进一步研究 | 评估靶向SPP1是否能抑制肿瘤侵袭和转移，并提高顺铂敏感性，以改善HNSCC患者预后 | 人HNSCC细胞系、小鼠模型及HNSCC患者样本 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 蛋白质印迹、细胞侵袭实验、功能蛋白质组学、高分辨率空间转录组学 | NA | 蛋白质表达数据、基因表达数据、空间转录组数据 | 多种HNSCC细胞系、小鼠模型及患者样本（具体数量未提供） | NA | 空间转录组学 | NA | 高分辨率空间转录组学平台（具体型号未提供） |
| 128 | 2026-08-27 |
Targeting C5AR1 disrupts complement-driven G0-phase maintenance and overcomes metabolic drug resistance in glioma
2026-05-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07782-2
PMID:42174621
|
研究论文 | 本研究揭示了C5AR1通过补体信号维持胶质瘤细胞G0期静息状态，并促进代谢药物抵抗的机制，靶向该轴可克服化疗耐药。 | 首次阐明C5AR1将细胞外补体激活与细胞内G0期维持及代谢适应性相连接，并提出靶向C3-C5-C5AR1轴作为克服胶质母细胞瘤化疗耐药的新策略。 | 研究主要基于体外细胞系和异种移植模型，可能未完全模拟人类肿瘤微环境；临床转化需进一步验证。 | 探究补体信号调控胶质瘤细胞静息和代谢药物抵抗的分子机制，并评估靶向C5AR1的治疗潜力。 | 胶质瘤细胞系、异种移植模型及TCGA、CGGA、GEO多组学数据集。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 多组学分析、单细胞转录组学、流式细胞术、免疫荧光、线粒体染色、ELISA | 细胞系和异种移植模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、实验图像和定量数据 | TCGA、CGGA和GEO数据集（具体样本数未在摘要中提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 129 | 2026-08-27 |
Expanding canonical cortical cell type markers in the era of single-cell transcriptomics
2026-May-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-51501-2
PMID:42168596
|
研究论文 | 利用近50万个单核和单细胞转录组数据，系统评估了大脑皮层经典细胞类型标志物的表达保真度和背景表达，并开发了统计框架拓展了主要细胞类型的标志物列表 | 首次在大规模跨研究数据中定量评估经典标志物的表达保真度和背景表达，并开发了基于伪批量分析的统计框架来识别高保真、低背景且跨区域一致的标志物，同时提供了交互式分析界面 | 未明确提及，但对标志物表达的区域变异性分析可能受限于研究间的批次效应和不同数据源的质量差异 | 量化并拓展大脑皮层细胞类型的经典标志物，以改进单细胞表达数据中的细胞类型注释和靶点验证 | 人类大脑皮层细胞，涵盖六种主要脑细胞类型（如神经元、星形胶质细胞等） | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单核RNA测序和单细胞RNA测序 | 统计框架（伪批量分析） | 单细胞表达数据（基因表达矩阵） | 近500,000个高质量单核和单细胞转录组，来自19项研究 | 不适用 | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 130 | 2026-08-27 |
Pan-cancer analysis of single-cell profiles with polygenic signals reveals genetic influences on tumor immunity across cancers
2026-05-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10158-3
PMID:42168330
|
研究论文 | 本研究提出一种多基因分析框架，整合单细胞RNA测序和全基因组关联研究统计数据，分析14种癌症类型，揭示种系遗传变异对肿瘤免疫微环境的影响 | 开发了整合单细胞转录组和GWAS数据的新型多基因分析框架，并构建了基于深度学习的免疫治疗反应预测模型 | 未明确提及局限性 | 揭示种系遗传变异如何影响不同癌症类型的肿瘤免疫微环境，并评估其作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 | 14种癌症类型的肿瘤微环境中的免疫细胞（T细胞、B细胞、髓系细胞）及相关基因 | 机器学习 | 泛癌种（包括黑色素瘤和乳腺癌） | 单细胞RNA测序、全基因组关联研究分析 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据、GWAS统计数据、组织及血液样本数据 | 涉及14种癌症类型，具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2026-08-27 |
Integrating machine learning and structural analysis to decipher benzo[a]pyrene-induced bladder cancer networks
2026-May-21, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05207-6
PMID:42168757
|
研究论文 | 该研究通过整合机器学习与结构分析，系统解析了苯并[a]芘诱导膀胱癌的分子网络，并识别出关键基因和治疗靶点 | 创新性地整合网络毒理学、机器学习、分子对接、分子动力学和单细胞转录组学，通过SHAP分析优先识别关键基因，并利用单细胞数据揭示肿瘤微环境中细胞类型特异性表达 | 摘要中未明确提及局限性 | 识别苯并[a]芘诱导膀胱癌中的关键差异表达基因及其分子机制，为潜在治疗靶点提供见解 | 苯并[a]芘相关的膀胱癌差异表达基因，以及GSK3B、SKP2、AURKB等关键基因 | 机器学习、结构分析 | 膀胱癌 | 网络毒理学、机器学习、分子对接、分子动力学、单细胞转录组学 | 机器学习模型（具体类型未提及，SHAP用于解释） | 基因表达数据、单细胞转录组数据、结构数据 | 来自GEO数据集的样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 132 | 2026-08-27 |
Single-cell analysis reveals corticosteroid-associated impairment of tumor-infiltrating NK cells in glioblastoma patients
2026-May-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-52528-1
PMID:42168437
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，发现围手术期地塞米松治疗与胶质母细胞瘤患者肿瘤浸润NK细胞的转录特征改变及效应功能受损相关 | 首次在单细胞水平揭示皮质类固醇（地塞米松）对胶质母细胞瘤患者肿瘤浸润NK细胞的特异性影响，包括CD56亚群富集和细胞毒性程序抑制 | 样本量较小（仅5例胶质母细胞瘤患者），且为回顾性分析公开数据集，需要更大队列验证 | 探究围手术期皮质类固醇治疗对胶质母细胞瘤患者肿瘤浸润NK细胞的影响 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤浸润的CD45⁺细胞（包括NK细胞亚群） | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5例IDH野生型胶质母细胞瘤样本（2例地塞米松治疗，3例未治疗）和2例非肿瘤脑样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2026-08-27 |
Quantitative coupling of clonal CNV evolution and spatially restricted malignant states identifies MFGE8 as a candidate late-state-associated target in breast cancer
2026-05-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08308-6
PMID:42169126
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了乳腺癌中CNV定义的克隆进化与转录状态转变的定量耦合，并确定了MFGE8作为晚期状态相关的候选治疗靶点 | 首次将CNV推断、分支轨迹分析和空间生态位映射相结合，定量揭示了克隆进化与恶性状态转变的耦合关系，并通过结构虚拟筛选和功能验证优先确定了MFGE8作为晚期状态相关靶点 | 未明确说明研究限制，但可能包括样本量有限、体外验证与体内效果的差异，以及计算预测的靶点需要进一步临床试验验证 | 探究乳腺癌进展中基因组不稳定性如何与转录状态转变和空间生态位组织定量耦合，并识别晚期状态相关的治疗靶点 | 乳腺癌恶性上皮细胞，涵盖ER阳性、HER2阳性和三阴性肿瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、CNV推断、结构虚拟筛选 | 分支轨迹分析、转录因子调控网络建模、细胞通讯推断 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确说明样本数量，但可能涉及多种乳腺癌亚型的肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序和10x Visium空间转录组学（FFPE或新鲜冷冻） |
| 134 | 2026-08-27 |
scRNA-seq analysis shows neutrophil extracellular traps as drivers of obstruction-induced intestinal damage in rats
2026-May-15, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10288-8
PMID:42141151
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和体内药理学调节，揭示中性粒细胞胞外陷阱（NETs）在大鼠肠梗阻引起的肠道损伤中的驱动作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合体内药理学调节，揭示NETs的形成动态及其在肠梗阻中导致屏障功能障碍的机制，并识别出独特的NETs相关中性粒细胞亚群（Neu_NETs） | 研究基于大鼠模型，其结果可能不完全适用于人类；此外，样本量仅限单一性别（雄性大鼠） | 阐明肠梗阻中NETs的形成动态及其对肠道屏障功能障碍的贡献，探索针对NETs的治疗策略 | 雄性大鼠的肠道细胞，特别是中性粒细胞 | 单细胞转录组学 | 肠梗阻 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据（单细胞） | 23,320个肠道细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2026-08-27 |
Lignature provides a curated resource of ligand-induced transcriptomic signatures for signaling inference
2026-05-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281287.125
PMID:41951436
|
研究论文 | 开发了一个名为Lignature的精选数据库，包含362个人类配体的细胞内转录组签名，用于推断配体活性并改善配体-受体相互作用的预测 | 显著扩展了具有可用细胞内响应签名的配体数量，提供基因和通路两种水平的签名，并开发了基于回归的框架来建模多配体组合调控 | 摘要未提及具体限制 | 建立全面的配体诱导转录组签名资源，以支持配体信号推断和研究配体-受体相互作用 | 人类配体及其诱导的转录组响应 | 机器学习 | NA | 转录组学 | 回归模型 | 基因表达数据 | 362个人类配体 | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2026-08-27 |
Robust identification of cell-cell communication heterogeneity in single cells
2026-May-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.29.721691
PMID:42146454
|
研究论文 | 介绍scRICH框架，整合数学建模与机器学习，从单细胞和空间转录组数据中鲁棒识别细胞间通讯异质性，并验证其在角质细胞器官oid中的预测。 | 提出scRICH，它独特地结合机制性多尺度数学建模与学习策略，捕获细胞类型内通讯行为异质性，通过RNA剪接动态信息关联细胞通讯与命运决定，并构建多层调控网络连接细胞间互作和细胞内响应。 | 摘要未提及局限性。 | 开发并验证scRICH方法，以从单细胞和空间转录组数据中捕获细胞间通讯的复杂性和异质性，并关联细胞命运决定。 | 单细胞转录组和空间转录组数据，以及皮肤等效器官oid中的角质细胞。 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | 机制性数学模型与学习策略的结合 | 单细胞转录组数据和空间转录组数据 | 皮肤等效器官oid中的角质细胞（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 137 | 2026-08-27 |
Multimodal transcriptomics identifies metallothionein as a novel pathway in primary sclerosing cholangitis
2026-May-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001432
PMID:40560681
|
研究论文 | 结合空间转录组学和单核转录组学分析原发性硬化性胆管炎肝脏样本，发现金属硫蛋白是新的疾病通路 | 首次综合空间和单核转录组学技术，在最大规模的PSC肝脏外植体样本中鉴定出金属硫蛋白作为新通路，并定位到特定肝细胞亚型 | 摘要未明确提及局限性 | 定位原发性硬化性胆管炎（PSC）中潜在的疾病通路至特定肝脏微解剖区域 | 23例PSC和7例疾病对照（4例MASH，3例ALD）的肝脏外植体样本 | 转录组学 | 原发性硬化性胆管炎 | 空间转录组学、单核RNA测序（snRNA-seq）、免疫组化 | NA | 空间转录组数据、单核转录组数据、免疫组化图像 | 23例PSC和7例疾病对照肝脏外植体；其中16例用于snRNA-seq（12例PSC，2例MASH，2例ALD）；共76,664个空间斑点，91,891个细胞核 | NA | 空间转录组学、单核RNA测序 | NA | NA |
| 138 | 2026-08-27 |
Dynamics of Spinal Fluid Immune Cell Alterations Following Cladribine Tablet Treatment in Multiple Sclerosis
2026-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200565
PMID:41990287
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了克拉屈滨片治疗多发性硬化症患者脑脊液和血液中免疫细胞动态变化，揭示了治疗对细胞组成和克隆性的影响 | 首次在临床试验框架下，结合脑脊液和血液的单细胞转录组及T/B细胞受体库分析，揭示克拉屈滨治疗对脑脊液隔室免疫细胞的独特动态影响，包括早期CD4 Treg细胞增加和晚期克隆性CD8 T细胞减少 | 样本量较小（13名患者，34份样本），且来自单一试验中心，可能限制结果的普遍性 | 探讨克拉屈滨片治疗对多发性硬化症患者脑脊液和血液中免疫细胞组成、表型及克隆性的影响，以理解其作用机制 | 多发性硬化症患者治疗前后的脑脊液和血液免疫细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组和免疫受体库数据 | 13名患者的34份脑脊液和血液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞5'端转录组和V(D)J测序 |
| 139 | 2026-08-27 |
Interpretable MRI-based Multiparametric Radiomics for Preoperative Prediction of CMS4 Colorectal Cancer
2026-May, Radiology
IF:12.1Q1
DOI:10.1148/radiol.251719
PMID:42153825
|
研究论文 | 本研究评估了基于MRI的放射组学机器学习方法在预测结直肠癌CMS4亚型中的表现，并探索了其生物学相关性和可解释性。 | 首次利用多参数MRI放射组学特征结合机器学习预测CMS4状态，并通过转录组分析验证了特征的生物学相关性，优于深度学习模型。 | 未明确提及局限性。 | 评估放射组学机器学习方法预测结直肠癌CMS4状态的效能，并探索其生物学相关性和可解释性。 | 253例结直肠癌患者（中位年龄63岁，163名男性），包括MRI数据和病理组织样本。 | 机器学习, 医学影像 | 结直肠癌 | MRI, 放射组学, RNA测序 | 机器学习模型（具体未指定）, 深度学习模型（ResNet50, VGG16, DenseNet201） | 影像数据（T2WI, CE T1WI）, 转录组数据（bulk和单细胞RNA测序） | 253例患者 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2026-08-25 |
Preservation and clonal behavior of extrachromosomal DNA in patient-derived xenograft models of childhood cancers
2026-May-28, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01676-0
PMID:42210429
|
研究论文 | 本研究评估了患者来源异种移植（PDX）模型在儿童癌症中保留和克隆行为上对肿瘤来源的染色体外DNA（ecDNA）的再现能力 | 首次系统分析PDX模型中ecDNA的保存情况和克隆行为，结合单细胞多组学测序揭示了稀有ecDNA阳性细胞在PDX肿瘤发展中的优先驱动作用 | 样本来源和数量有限，且主要基于儿童实体瘤，结果可能不适用于其他癌症类型；ecDNA分析依赖于WGS和AmpliconArchitect，可能受测序深度和算法限制影响 | 探究PDX模型是否能忠实再现原发肿瘤的ecDNA序列组成、拷贝数及瘤内异质性 | 儿童实体瘤的PDX模型及其配对的原发肿瘤 | 基因组学 | 儿童癌症 | 全基因组测序，单细胞RNA和ATAC测序 | AmpliconArchitect算法 | 基因组测序数据，单细胞多组学数据 | 338个PDX模型和127个配对原发肿瘤 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |