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当前共找到 484 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-05-12 |
STAID: A Self-Refining Deep Learning Framework for Spatial Cell-Type Deconvolution with Biologically Informed Modeling
2026-May-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75607
PMID:42107049
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研究论文 | 提出STAID框架，通过迭代伪点优化与图信号处理，实现空间转录组数据中细胞类型组成的精确去卷积 | 将伪点生成与深度学习训练结合形成自强化循环，并利用图信号处理捕捉基因间高阶关系，显著提升空间细胞类型去卷积准确性 | 未明确说明局限性（但作为新方法可能依赖参考数据质量和计算资源需求较高） | 开发空间转录组数据中高分辨率细胞类型去卷积方法 | 空间转录组数据中的组织切片和细胞类型组成 | 机器学习, 数字病理学 | 乳腺癌, 克罗恩病 | 空间转录组学 | 深度学习框架（含图信号处理组件） | 空间转录组数据 | 包含乳腺癌临床切片、人类胚胎肢体数据集和克罗恩病样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2026-05-12 |
G6PC Downregulation Promotes Renal Calcium Oxalate Stone Formation via Lactate-Induced SNAIL1 K206 Lactylation and Epithelial-Mesenchymal Transition
2026-May-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75585
PMID:42107057
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研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示G6PC下调通过乳酸诱导的SNAIL1 K206乳酰化促进肾草酸钙结石形成和上皮-间质转化 | 首次阐明G6PC-乳酸-SNAIL1轴在肾结石形成中的作用，发现乳酸通过乳酰化修饰SNAIL1的K206位点激活TGF-β信号，连接代谢紊乱与上皮重塑 | NA | 研究肾草酸钙结石形成中肾小管上皮细胞的代谢重编程及其分子机制 | 小鼠肾结石模型的肾近端小管上皮细胞 | 机器学习和单细胞转录组学 | 肾结石 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肾结石模型样本（具体数量未提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 103 | 2026-05-12 |
Identification of PRRG1 as a possible molecular target of pancreatic cancer
2026-May-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08832-9
PMID:42108282
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研究论文 | 本研究探讨了PRRG1在胰腺癌中的表达模式、生物学功能和分子机制，发现其通过PI3K-Akt通路驱动肿瘤进展，低剂量华法林可抑制其促肿瘤作用 | 首次鉴定PRRG1为胰腺癌潜在分子靶点，并揭示KLF4转录因子调控其表达以及低剂量华法林的抑制效应 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量有限或缺乏临床验证 | 阐明PRRG1在胰腺癌发病中的角色及其作为治疗靶点的潜力 | 胰腺癌组织样本、胰腺癌细胞系（CFPAC-1和PATU-8988T）、皮下异种移植小鼠模型 | 分子生物学 | 胰腺癌 | RNA测序、单细胞测序、免疫组化、慢病毒转导 | NA | RNA-seq数据、单细胞测序数据 | 人胰腺癌组织样本和正常胰腺组织（具体数量未明确）、两种胰腺癌细胞系、小鼠模型 | NA | RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-05-12 |
Single-cell and bulk omics uncover fibroblast heterogeneity and HSPH1 as a key driver in Barrett's esophagus to esophageal adenocarcinoma progression
2026-May-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04319-x
PMID:42108450
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研究论文 | 本研究整合单细胞和批量组学数据，揭示了食管腺癌进展过程中成纤维细胞的异质性，并识别HSPH1为关键驱动因子 | 首次通过整合单细胞RNA测序与批量转录组数据，系统解析了从巴雷特食管到食管腺癌进展中成纤维细胞异质性及上皮-间质串扰，并利用多机器学习算法确立HSPH1为核心预后基因 | NA | 探究从巴雷特食管到食管腺癌进展的分子机制，识别诊断生物标志物和治疗靶点 | 食管腺癌及其癌前病变巴雷特食管中的成纤维细胞异质性和上皮-间质相互作用 | 机器学习, 数字病理学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 免疫组化, 体外实验 | 机器学习算法 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2026-05-12 |
anndataR improves interoperability between R and Python in single-cell transcriptomics
2026-May-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag288
PMID:42108549
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研究论文 | anndataR 软件包实现了单细胞转录组学数据在 R 和 Python 之间的互操作性 | 提供原生读写 H5AD 文件、与 SingleCellExperiment 或 Seurat 对象互相转换的功能，并确保语言间长期兼容性 | NA | 改善单细胞转录组学数据在 R 和 Python 之间的互操作性 | H5AD 格式的单细胞转录组学数据集 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学数据 | NA | NA | 单细胞 RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-05-12 |
Deciphering the immunological landscape of HR + metastatic breast cancer: insights from single-cell transcriptomics
2026-May-08, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-026-01384-2
PMID:42101520
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示激素受体阳性转移性乳腺癌的免疫微环境特征 | 首次专注于HR+乳腺癌卵巢转移的肿瘤微环境单细胞转录组分析，鉴定出与巨噬细胞功能相关的五个关键基因（GPR183、BHLHE41、CD83、SLC25A37和SELL） | 样本量较小，仅10例卵巢转移乳腺癌患者的临床样本用于体内验证 | 表征HR+乳腺癌肿瘤微环境，尤其是卵巢转移中的免疫细胞组成和关键基因 | HR+乳腺癌患者的原发肿瘤组织和配对的正常组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据、临床样本病理图像 | 10例HR+乳腺癌伴卵巢转移患者的原发肿瘤及配对正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2026-05-12 |
Persistence of alveolar fibroblast-derived ADAMTS4+ cells in a preclinical model of delayed pulmonary fibrosis resolution
2026-May-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72419-3
PMID:42103706
|
研究论文 | 通过谱系追踪和单细胞转录组学方法，研究肺泡成纤维细胞来源的ADAMTS4+细胞在迟发性肺纤维化消退过程中的持续存在及其机制 | 首次发现脂成纤维细胞向肌成纤维细胞的可逆转换在纤维化消退中起关键作用，并鉴定ADAMTS4+细胞为延迟消退的潜在治疗靶点 | 主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；结论可能受模型和样本量的影响 | 探究肺纤维化消退的机制，特别是脂成纤维细胞向肌成纤维细胞转化及其退行过程 | 老年小鼠的肺泡成纤维细胞和ADAMTS4+细胞，以及人类肺移植组织 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 谱系追踪、单细胞转录组学、组织学分析、外植模型 | 卷积神经网络 | 转录组数据、组织图像 | 老年小鼠（数量未明确）及人类肺移植组织样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 108 | 2026-05-12 |
A stem and progenitor cell-derived gene expression signature is prognostic for survival in myelofibrosis
2026-May-07, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030094
PMID:41481381
|
研究论文 | 通过分析骨髓纤维化患者的造血干祖细胞转录组特征，开发了一种24基因加权表达评分（MPN24），该评分能独立于现有风险分层模型预测患者总生存期 | 首次利用单细胞RNA测序数据指导构建基于bulk RNA-seq的预后模型，揭示了造血干祖细胞来源的基因表达特征在骨髓纤维化风险分层中的独立预后价值，并证明其能显著提升现有临床-基因组风险模型的预测能力 | 研究未明确MPN24评分在动态监测治疗反应或指导治疗决策中的应用价值，且样本均来自同一机构可能存在选择偏倚 | 探索造血干祖细胞转录组特征是否能改善骨髓纤维化的风险分层 | 骨髓纤维化患者的血液样本及Lin-CD34+造血干祖细胞 | 机器学习 | 骨髓纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, NanoString | 加权基因表达评分模型 | 基因表达数据 | 358例骨髓纤维化患者（训练+测试队列），两个独立验证队列共270例患者 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 109 | 2026-05-12 |
Hopx(+) optic nerve head-astrocytes counter neuronal stress and glaucoma damage
2026-May-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2515277123
PMID:42044330
|
研究论文 | 该研究发现视神经头内的Hopx阳性星形胶质细胞通过分泌细胞外囊泡增强视网膜神经节细胞存活，并在青光眼模型中发挥保护作用，其丢失与年龄相关视神经疾病有关 | 首次揭示Hopx阳性视神经头星形胶质细胞通过细胞外囊泡分泌因子与视网膜神经节细胞双向通讯，并证明其年龄相关丢失是视神经疾病的关键因素，提出替代视神经头相关因子的治疗范式转变 | 未提供明确的局限性说明，但可能包括动物模型与人类疾病的差异、细胞外囊泡临床应用转化复杂性等 | 探究视神经头星形胶质细胞在青光眼等视神经疾病中的作用机制及潜在治疗策略 | 年轻大鼠视神经头Hopx阳性星形胶质细胞及视网膜神经节细胞 | 机器学习 | 青光眼 | 单细胞RNA测序、细胞外囊泡蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据 | 大鼠模型，包括对照组和视神经挫伤组 | 10x Genomics, Broad Institute | 单细胞RNA测序, 细胞外囊泡蛋白质组学 | 10x Chromium, Broad Institute在线数据库 | 大鼠视神经头单细胞RNA测序与在线Broad研究所scRNA-seq数据库分析 |
| 110 | 2026-05-12 |
In Vitro Single-Cell Transcriptomic Profiling of Cultured Stem Cells From Apical Papilla and Dental Pulp Stem Cells: Unveiling Cellular Heterogeneity
2026-May-05, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2026.109577
PMID:42090950
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的转录组图谱，揭示细胞异质性 | 首次在单细胞水平上对培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞进行详细比较，鉴定出先前未描述的NOTCH3+/PDGFRB+前体样细胞亚群 | 基于培养细胞的转录组相似性构建的伪时间轨迹仅为假设生成模型，未经验证的谱系关系，需要功能性验证 | 通过单细胞RNA测序比较根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的细胞组成，鉴定其差异性再生行为背后的细胞亚群和相关标志物 | 来自3名人类供体的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3名人类供体的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 111 | 2026-05-12 |
Viral orchitis and male infertility: A comprehensive review of pathogenic mechanisms and outcomes
2026-May-05, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2026.104910
PMID:42107396
|
综述 | 全面综述病毒性睾丸炎导致男性不育的发病机制及最新治疗策略 | 系统整合病毒性睾丸炎从流行病学到分子机制的证据，并引入单细胞测序、多组学技术和睾丸类器官模型等新兴转化研究方法 | 当前抗病毒和抗炎药物疗效欠佳，且缺乏针对病毒介导睾丸损伤的特定治疗策略 | 阐明病毒性睾丸炎影响男性生育力的致病机理并展望未来干预方向 | 病毒性睾丸炎及相关男性不育的病理机制 | 自然语言处理 | 男性不育症 | 单细胞测序、多组学技术 | 睾丸类器官模型 | 文本 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 多组学技术 | 不适用 | 不适用 |
| 112 | 2026-05-12 |
InSituPREP enables 3D single-cell mapping of interaction-associated gene programs in the breast cancer tumor microenvironment
2026-May-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag406
PMID:42109251
|
研究论文 | 提出InSituPREP计算框架，用于在三维组织中单细胞分辨率下量化空间环境与转录状态的关系 | 首次实现三维肿瘤微环境中单细胞分辨率的邻近关联基因程序定量解析，并整合空间RNA速度分析揭示细胞间距离对转录轨迹的影响 | 当前仅应用于10例乳腺癌活检组织及299个癌症相关基因，样本量和基因覆盖有限；依赖Expansion Sequencing技术可能引入特定技术偏倚 | 建立计算框架量化三维组织中空间环境对单细胞转录状态的影响 | 10例乳腺癌活检组织中的细胞及其microenvironment相互作用 | 计算生物学 | 乳腺癌 | Expansion Sequencing, RNA速度分析, 线性建模 | 线性模型 | 基因表达数据 | 10例乳腺癌活检组织 | NA | 空间转录组学 | Expansion Sequencing | Expansion Sequencing技术用于三维空间基因表达谱分析 |
| 113 | 2026-05-12 |
An Advanced Single-Cell RNA Sequencing (scRNA-seq) Protocol Utilizing Custom-Designed Multiplexing
2026-May-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5678
PMID:42111707
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研究论文 | 介绍了一种利用定制设计多重标记技术的高级单细胞RNA测序协议，解决了商业小鼠标签在特定品系中的不兼容问题 | 开发基于生物素化抗体鸡尾酒和链霉亲和素结合寡核苷酸的稳健替代方案，实现可靠样本多重标记，并兼容多组学5'工作流程 | 未明确提及局限性 | 提出针对品系特异性或定制设计多重标记策略的实用解决方案，用于单细胞转录组学研究 | FVB/N小鼠肺组织样本 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | FVB/N小鼠肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞5'化学试剂盒 |
| 114 | 2026-05-12 |
Histone deacetylases and cell-cycle regulators orchestrate cell-identity transitions during Arabidopsis root regeneration
2026-05-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.03.013
PMID:41889170
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序、ATAC测序、成像和突变体分析，研究拟南芥根再生过程中细胞身份转变的轨迹 | 揭示了组蛋白去乙酰化酶和细胞周期调控因子协同调控植物细胞重编程顺序的机制，发现HDA9/HDA19抑制旧身份及应激反应，OBP1与SMRs调节分裂速率 | 未提及具体限制 | 阐明拟南芥根再生过程中细胞重编程的连续状态及其分子调控机制 | 拟南芥根再生过程中的细胞 | 单细胞组学， 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序， ATAC测序， 成像， 突变体分析 | NA | 单细胞基因表达数据， 染色质可及性数据， 图像数据 | 拟南芥根再生过程中的细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq， 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和ATAC测序 |
| 115 | 2026-05-12 |
scPASU: A computational protocol for quantifying polyadenylation site usage and alternative polyadenylation from 3' scRNA-seq data
2026-May-04, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104544
PMID:42085187
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研究方案 | 提出scPASU：一种从3'单细胞RNA测序数据中量化多聚腺苷酸化位点使用和可变多聚腺苷酸化的计算协议 | 开发了Snakemake工作流程scPASU，可灵活配置生物体和样本特定参数，支持多聚腺苷酸化位点发现 | 未明确说明 | 构建从3'scRNA-seq数据中量化多聚腺苷酸化位点使用和可变多聚腺苷酸化的计算协议 | 3'单细胞RNA测序数据中的多聚腺苷酸化位点 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2026-05-12 |
GR2ST: spatial transcriptomics prediction based on graph-enhanced multimodal contrastive learning
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag209
PMID:42036805
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研究论文 | 提出GR2ST深度学习模型，利用图增强多模态对比学习从组织学图像预测空间转录组 | 创新性地结合动态阈值功能图和半径约束空间图的双分支图架构，并通过多模态对比学习与细胞类型引导的回归头实现图像特征与基因表达的精准对齐 | 未详细说明模型在更多组织类型或低质量图像上的泛化能力，以及计算资源需求 | 开发从组织学图像高效预测空间转录组的方法，降低实验成本和时间 | 皮肤鳞状细胞癌和两种人类乳腺癌的空间转录组数据 | 数字病理学 | 皮肤癌, 乳腺癌 | 空间转录组学 | 图神经网络, 对比学习, 回归模型 | 组织学图像, 基因表达数据 | 三个癌症空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 117 | 2026-05-12 |
TransGRN: A Transfer Learning-Based Framework for Inferring Gene Regulatory Networks Across Cell Lines
2026-May, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3628564
PMID:41191474
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研究论文 | 提出TransGRN，一种基于迁移学习的框架，用于跨细胞系推断基因调控网络 | 采用跨细胞系预训练策略，结合多个源细胞系的单细胞RNA测序数据和大语言模型的生物学知识，实现通用调控模式的迁移 | 依赖源细胞系数据的质量和多样性，可能影响在目标细胞系数据极度稀缺时的性能 | 开发无需大量先验调控信息即可推断基因调控网络的方法 | 基因调控网络推断、细胞系间调控模式迁移 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 迁移学习模型 | 基因表达数据 | 多个源细胞系和目标细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2026-05-12 |
Bispecific T-cell Engager (CD3 × EGFR)-Based Triplet Therapy Unlocks CD40/CD40L Crosstalk to Revert Immunosuppression in Third-Generation EGFR-Tyrosine Kinase Inhibitor-Refractory NSCLC
2026-May, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2026.103607
PMID:41672197
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研究论文 | 研究针对第三代EGFR-TKI耐药的非小细胞肺癌，提出了一种基于双特异性T细胞衔接器（CD3×EGFR）的三联疗法，通过激活CD40/CD40L信号通路逆转免疫抑制 | 首次提出三联疗法结合双特异性T细胞衔接器、组蛋白去乙酰化酶抑制剂和4-1BB激动剂，以克服EGFR-TKI耐药肿瘤中的免疫抑制微环境 | 文中未明确提及具体局限性，但可能需要进一步验证该疗法在更大样本中的安全性和有效性 | 开发一种新的三联组合疗法，以恢复T细胞抗肿瘤活性，解决第三代EGFR-TKI耐药非小细胞肺癌的免疫抑制问题 | 非小细胞肺癌患者样本、人源化NOG-EXL小鼠模型 | 机器学习 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序、多色荧光染色 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 文中未明确样本数量，但包括非小细胞肺癌患者样本和小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3 |
| 119 | 2026-05-12 |
Deubiquitinase USP2 promotes hepatic stellate cell activation via p300 stabilization
2026-May, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70301
PMID:41703985
|
研究论文 | 该研究通过去泛素化酶抑制剂筛选发现USP2在肝星状细胞活化中稳定p300，促进肝纤维化 | 首次识别USP2作为p300的新型去泛素化酶，揭示其在肝星状细胞活化和肝纤维化中的关键调控作用，为纤维化治疗提供新靶点 | 未明确说明研究局限 | 探索肝星状细胞活化过程中p300稳定性的上游调控机制 | 肝星状细胞、纤维化肝脏组织、慢性肝病患者样本 | 数字病理学 | 肝纤维化、代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序、去泛素化酶抑制剂筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 人纤维化肝脏组织样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 120 | 2026-05-12 |
Comparison of single-cell sequencing technologies for allele-specific expression analysis in rabbit spermatids
2026-May, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111224
PMID:41780767
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研究论文 | 通过比较单细胞测序技术，分析兔子精子细胞中等位基因特异性表达，以识别可用于遗传生物防治的候选基因 | 首次对欧洲兔精子细胞进行等位基因特异性表达分析，并比较短读长和长读长测序技术的适用性 | 仅对三个候选基因进行了分析，且未来需要进一步评估这些基因在遗传生物防治中的适用性 | 识别欧洲兔中可能存在的自然基因驱动，探索其在遗传生物防治中的应用潜力 | 欧洲兔的精子细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序，短读长测序，长读长测序 | NA | 基因表达数据 | 兔子精子细胞样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 短读长测序平台，长读长测序平台 |