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当前共找到 484 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-05-15 |
GatorST: A Versatile Contrastive Meta-Learning Framework for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2026-May, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202600006
PMID:41947710
|
research paper | 提出一种名为GatorST的对比元学习框架，用于空间转录组数据分析，通过整合局部邻域和全局组织上下文生成空间信息表示 | 将图建模与元学习策略相结合，通过双跳子图捕捉细粒度空间上下文，并利用聚类产生伪标签进行弱监督学习，采用情景训练方法增强模型泛化能力 | 未提及具体局限性，但从方法描述看可能依赖邻域图构建的准确性，且伪标签质量可能影响弱监督学习效果 | 开发一种能够有效整合局部和全局空间信息，稳健生成空间转录组数据表示的通用框架 | 空间转录组数据中的基因表达谱及其空间背景信息 | machine learning | NA | 空间转录组学 | 对比学习，元学习，图神经网络 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 82 | 2026-05-15 |
Chikungunya virus persists in joint-associated macrophages and promotes chronic disease in mice
2026-May, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02303-9
PMID:41922840
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序、空间转录组学和流式细胞术研究基孔肯雅病毒在小鼠关节相关组织中的持续存在及其在慢性疾病中的作用 | 首次在单细胞和空间水平上揭示关节相关巨噬细胞中持续存在的病毒RNA与慢性炎症的关联，并通过CD4 T细胞耗竭实验和抗病毒治疗验证了其病理机制 | 仅在小鼠模型中进行研究，缺乏人类样本验证；未深入探究病毒RNA持续复制的分子机制 | 阐明甲病毒（如基孔肯雅病毒）感染后慢性关节疾病的驱动机制 | 甲病毒（基孔肯雅病毒、马亚罗病毒、罗斯河病毒）感染小鼠的关节相关组织 | 机器学习和生物信息学 | 传染病相关关节炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 甲病毒感染小鼠的关节相关组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞测序系统及10x Visium空间转录组学平台 |
| 83 | 2026-05-15 |
A single-cell atlas of Toxoplasma sexual development in the feline intestinal tract
2026-May, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02294-7
PMID:42020723
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研究论文 | 对弓形虫在猫肠道内进行有性发育的单细胞图谱分析 | 首次通过单细胞转录组学解析弓形虫在猫肠道中的有性发育基因调控网络，并鉴定出AP2X6为大配子体发育的调控因子 | 数据主要来源于猫肠道样本，可能无法完全反映体外培养条件下的发育过程 | 探究弓形虫在猫肠道中的有性发育基因调控网络 | 从猫肠道中分离的弓形虫细胞 | 数字病理学 | 弓形虫病 | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9 Perturb-seq | NA | 基因表达数据 | 2次实验中采集15,068个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2026-05-15 |
Unravelling bacterial complexity at high resolution with single-cell transcriptomics
2026-May, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02333-3
PMID:42067624
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综述 | 综述细菌单细胞转录组学的高分辨率研究方法及其在理解细菌异质性、生理、代谢、抗生素耐药、致病性和微生物群落相互作用中的应用 | 系统梳理了细菌单细胞RNA测序的最新进展，包括开发的方法和从应用中获得的见解，强调该领域如何革新对细菌生理学、感染生物学和微生物群落相互作用的认知 | 讨论了技术上和计算上的挑战、标准化的必要性及实现方式 | 总结细菌单细胞RNA测序的最新进展和应用，展望未来发展 | 细菌单细胞转录组学研究 | 机器学习 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2026-05-15 |
PEDF Prevents Corneal Endothelial Dysfunction of Fuchs Endothelial Corneal Dystrophy
2026-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.2
PMID:42080792
|
研究论文 | 探索色素上皮衍生因子对Fuchs内皮角膜营养不良角膜内皮的保护作用 | 首次发现PEDF能通过抑制p53、TGF-β和Hippo信号通路预防FECD角膜内皮功能障碍 | 仅限于小鼠模型和体外细胞实验，缺乏人体临床试验数据 | 研究PEDF对FECD角膜内皮的保护机制 | FECD患者房水、人角膜内皮细胞、UVA诱导的FECD小鼠模型 | 机器学习 | Fuchs内皮角膜营养不良 | 酶联免疫吸附测定、免疫荧光染色、单细胞RNA测序、RNA测序、定量PCR、自动化简单Western分析 | NA | 图像、文本、数值 | FECD患者房水样本、培养的人角膜内皮细胞、UVA诱导的FECD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2026-05-15 |
Suboptimal Responses to Anti-VEGF in Retinal Neurovascular Diseases: Linking Aging and Alternative Angioinflammatory Pathways
2026-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.4
PMID:42080790
|
研究论文 | 采用系统生物学框架揭示视网膜神经血管疾病中抗VEGF治疗反应不佳的机制，关注衰老与替代性血管生成炎症通路 | 整合多组学数据集、网络机器学习与疾病特异性通路映射，识别了EGFR、HSP90AA1、SIRT1和STAT3作为中心耐药枢纽，并发现21条保守核心信号级联 | 结果需在疾病相关模型中进行验证 | 阐明抗VEGF治疗失败和疾病进展的共同机制 | 糖尿病视网膜病变、年龄相关性黄斑变性、视网膜色素变性、青光眼及衰老相关的眼部疾病 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | 网络机器学习 | 多组学数据 | 14个核心基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | AMD-RPE簇单细胞RNA测序 |
| 87 | 2026-05-15 |
MXRA5 is identified and validated as a key gene related to epithelial-mesenchymal transition in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes
2026-05, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/dt5mf6
PMID:41105461
|
研究论文 | 通过单细胞分析及机器学习方法识别并验证MXRA5为类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞中与上皮-间质转化相关的关键基因 | 首次结合单细胞分析及五种机器学习算法（XGBoost、Boruta、随机森林、LASSO、SVM-RFE）筛选出RA滑膜细胞中与EMT相关的关键基因MXRA5，并通过功能实验验证其作用 | 未提及具体局限性信息 | 利用单细胞分析及机器学习方法识别RA滑膜细胞中与EMT相关的重要基因并进行功能验证 | 类风湿关节炎患者的滑膜细胞，特别是成纤维样滑膜细胞 | 机器学习 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | XGBoost，Boruta，随机森林，LASSO，SVM-RFE | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2026-05-12 |
Exceptional Longevity Modifying Allele APOE2 Promotes DNA Signaling Pathways Resisting Cellular Senescence in Human Neurons
2026-05, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70494
PMID:42103698
|
研究论文 | 研究发现长寿相关APOE2等位基因通过促进DNA修复和抑制细胞衰老途径，增强人类神经元的抗衰老能力 | 首次揭示APOE2通过促进DNA修复和信号通路而非单纯脂质代谢来抵抗神经元衰老，并在两种神经元亚型中验证了该机制 | 未提供 | 探究APOE2等位基因如何促进神经元长寿并提供神经保护 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）来源的GABA能神经元和谷氨酸能神经元，以及APOE靶向替换小鼠 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类iPSC来源的GABA能神经元和谷氨酸能神经元，以及APOE靶向替换小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2026-05-15 |
Spatial transcriptomics maps host-gut microbiome biogeography at high resolution
2026-May, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02286-7
PMID:41792309
|
研究论文 | 开发了一种高分辨率的空间转录组学方法，用于研究肠道中微生物组与宿主的相互作用 | 结合酶促原位加尾和空间RNA测序，实现了对细菌和宿主RNA的广泛空间采样，提高了细菌RNA回收率，并能分析低丰度和空间受限的微生物类群 | 未提及具体局限性，可能包括对复杂微生物群落的适用性或验证范围有限 | 建立一种高分辨率空间采样方法，以原位测量肠道微生物组-宿主相互作用 | 小鼠肠道组织及其微生物组 | 空间转录组学 | 肠道肿瘤（小鼠模型） | 空间RNA测序、酶促原位聚腺苷酸化 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠肠道肿瘤模型样本（具体数量未提及） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 90 | 2026-05-15 |
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus infection of the male reproductive tract induces pathology and inflammation
2026-May, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02298-3
PMID:41882300
|
研究论文 | 研究发现严重发热伴血小板减少综合征病毒（SFTSV）感染雄性生殖道，导致病理变化和炎症反应 | 首次揭示SFTSV对雄性生殖器官的广泛趋向性，发现病毒引起睾丸间质细胞凋亡、焦亡和炎症，破坏睾酮生成，并鉴定出CCR2和SPP1巨噬细胞表达的S100A4蛋白是附睾过度炎症和纤维化的关键驱动因子 | 未提及具体局限性 | 探究SFTSV是否感染雄性生殖道及其对生殖健康的影响 | 小鼠模型及感染患者（男性） | 数字病理学 | 发热伴血小板减少综合征 | single-cell RNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠和感染患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chrome单细胞基因表达分析 |
| 91 | 2026-05-15 |
RELB Overexpression Induced by DNA Hypomethylation Contributes to Perioperative Immunotherapy Resistance in Resectable Esophageal Squamous Cell Carcinoma by Modulating the mregDC-Treg Axis
2026-May, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71863
PMID:42130013
|
研究论文 | 本研究揭示了DNA低甲基化诱导的RELB过表达通过调节mregDC-Treg轴促进可切除食管鳞癌围手术期免疫治疗耐药 | 首次发现DNA低甲基化调控的RELB过表达通过mregDC-Treg轴驱动食管鳞癌围手术期免疫治疗耐药，并提出RELB作为预测免疫治疗疗效的潜在生物标志物 | 样本量相对较小（59例），且为单中心研究 | 鉴定可切除食管鳞癌围手术期免疫治疗疗效的预测生物标志物，并阐明非应答者治疗耐药的机制 | 可切除食管鳞癌患者组织样本及Eca109、KYSE450细胞系 | 数字病理学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 重亚硫酸盐测序, 甲基化特异性PCR, 三重标记免疫荧光染色, 组织芯片 | NA | 基因表达数据, 图像 | 59例食管鳞癌患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序和批量RNA测序平台未指定 |
| 92 | 2026-05-15 |
osr1 as a Novel Marker for ICC-Like Cells Development in Zebrafish
2026-May, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.70162
PMID:42132003
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现osr1是ICC样细胞的新型标志物，并在斑马鱼模型中验证其在肠道发育中的关键作用 | 首次鉴定osr1作为Cajal间质细胞样细胞的新型标志物，并揭示其通过调控yap1影响肠道发育的机制 | 未在人类模型中验证osr1的功能，且osr1突变导致肠道发育缺陷的具体分子机制还需进一步探索 | 阐明osr1在肠道发育和ICC样细胞形成中的功能 | 人类肠道组织、斑马鱼胚胎及成体 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序、转基因斑马鱼模型 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类肠道组织活检样本（数量未明确）、斑马鱼转基因系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2026-05-12 |
Dynamics of severity-associated immune remodeling by granulocytes and macrophages in acute lung injury
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115816
PMID:42111184
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2026-05-12 |
iS2C2: a cointelligent platform for mechanistic discovery of disease cellular crosstalk
2026-May-11, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02691-8
PMID:42108258
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研究论文 | iS2C2是一个结合数学算法与大语言模型的协同智能平台，用于从单细胞和空间转录组数据中自动生成疾病细胞互作的生物学假设 | 首次将严格数学计算算法与大语言模型上下文推理能力协同整合，实现了从多模态组学数据到生物学假设的完全自动化解读，无需人工专家干预 | 对大规模组学数据的直接解读能力受限，依赖算法与LLM的整合来提取可解释的生物学意义 | 建立全自动且可解释的生物学发现平台，用于揭示疾病微环境中细胞间信号通路的机制 | 阿尔茨海默病和癌症数据集中的细胞间通讯 | 机器学习 | 阿尔茨海默病, 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 大语言模型（LLM） | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 95 | 2026-05-12 |
Spatiotemporal regulation of arbuscular mycorrhizal symbiosis at cellular resolution
2026-May-11, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag133
PMID:42108419
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研究论文 | 通过单细胞分辨率下的空间转录组学和阶段特异性TRAP-seq技术，解析水稻与丛枝菌根真菌共生过程中时空调控机制 | 首次在单细胞分辨率下结合空间转录组学和阶段特异性TRAP-seq技术，揭示了宿主细胞在不同共生阶段的转录和翻译异质性，以及丛枝发育过程中养分转运蛋白和细胞壁基因的精细调控模式 | 未涉及对真菌基因功能的直接验证，且研究局限于水稻单一物种，可能缺乏跨物种的通用性 | 阐明丛枝菌根共生建立过程中的细胞动态调控机制，特别是营养交换和真菌发育的时空协调 | 水稻根组织及丛枝菌根真菌根内球囊霉 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, TRAP-seq | NA | 转录组数据 | 水稻根组织样本（具体数量未提及） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2026-05-12 |
Combining Spatial Multi-Omics Data to Decipher Spatial Domains and Elucidate Cell Heterogeneity Based on Self-Supervised Graph Learning
2026-May-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75533
PMID:42109219
|
研究论文 | 提出SOTMGF，一种自监督多视图图融合框架，用于整合空间多组学数据以识别空间域和分析细胞异质性 | 首次在统一框架中联合分析空间转录组学和空间蛋白质组学数据，通过自训练和图表征迭代优化，并计算生成空间ATAC-seq数据以重建空间伪表达并识别暗基因/蛋白 | NA | 改进空间多组学数据整合方法，提升空间域识别和数据去噪能力，促进分子调控机制和治疗靶点发现 | 空间多组学数据（空间转录组学、空间蛋白质组学、空间ATAC-seq） | 机器学习 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间ATAC-seq | 图神经网络、自监督学习 | 多模态空间数据（分子表达、空间位置、微环境、分子关联） | NA | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间ATAC-seq | NA | NA |
| 97 | 2026-05-12 |
Low-Strength Type I Interferon Signaling Promotes CAR T Cell Treatment Efficacy
2026-May-11, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0691
PMID:42112708
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了低强度I型干扰素信号可增强CAR T细胞治疗效果，并提出了一种新的体外生产策略 | 首次发现低强度I型干扰素信号能增强CAR T细胞对B细胞淋巴瘤和白血病的细胞毒性及治疗效果，且利用已获FDA批准的药物，避免了体内干扰素相关毒性 | 未提及具体局限性 | 揭示CD19靶向CAR T细胞疗法疗效的决定因素，并开发提高疗效的新策略 | 8例接受axicabtagene ciloleucel治疗的复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者的输注产品 | 机器学习 | 弥漫大B细胞淋巴瘤, B细胞淋巴瘤, 白血病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8例复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者的输注产品 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2026-05-12 |
Correction to: Spatial transcriptomics in the human adult ovary: insights into key signalling pathways during follicular atresia
2026-May-11, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deag080
PMID:42112982
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2026-05-12 |
Molecular mechanisms linking cadmium chloride exposure to ankylosing spondylitis: an integrative network-based study
2026-May-11, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05394-7
PMID:42113191
|
研究论文 | 采用网络毒理学框架，整合多机器学习和单细胞转录组分析，揭示氯化镉暴露与强直性脊柱炎之间的分子机制 | 首次通过网络毒理学结合多种机器学习算法（LASSO、SVM、随机森林和XGBoost）鉴定氯化镉暴露与强直性脊柱炎的核心共靶基因，并利用孟德尔随机化和单细胞RNA-seq虚拟敲除验证ETFA的因果作用 | 研究基于公开数据库和计算分析，缺乏大规模的队列验证和深入的体内实验验证 | 阐明氯化镉慢性暴露通过免疫调控异常参与强直性脊柱炎发病的分子机制 | 氯化镉暴露相关的毒理学靶点与强直性脊柱炎患者差异表达基因的交集基因 | 机器学习 | 强直性脊柱炎 | NGS, RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO, SVM, 随机森林, XGBoost | 基因表达数据 | GSE73754数据集（AS相关DEGs）、GSE194315数据集（单细胞RNA-seq） | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2026-05-12 |
Identification of ATF3 as a Potential Key Biomarker for Hypertensive Nephropathy via Single-Cell Transcriptome Sequencing
2026-May-11, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-026-02515-5
PMID:42113322
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序鉴定ATF3作为高血压肾病的关键生物标志物 | 首次利用单细胞RNA测序整合分析，鉴定出ATF3作为高血压肾病的潜在关键生物标志物，并揭示其通过FOSB调控氧化应激信号通路的机制 | 未在更大规模临床样本中验证ATF3的诊断价值，且机制研究主要基于体内外模型，需进一步在人体中验证 | 寻找高血压肾病的早期诊断生物标志物并阐明其分子病理机制 | 高血压肾病患者及健康对照的肾组织样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 高血压肾病患者和健康对照的肾组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |