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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2026-04-25 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Bidirectional Development of Infantile Hemangioma
2026-May, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.10.593
PMID:41177260
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示婴儿血管瘤的双向发育机制 | 首次对婴儿血管瘤增殖期进行单细胞RNA测序,构建细胞图谱,发现血管瘤壁细胞释放VEGFA和PGF促进内皮细胞增殖,并揭示肾上腺素受体在不同细胞类型中的特异性表达 | 样本数量有限(仅3名婴儿),且仅关注增殖期,缺乏对其他阶段的比较 | 深入理解婴儿血管瘤的细胞机制和潜在治疗靶点 | 3名婴儿血管瘤患者的血管瘤组织样本 | 单细胞组学 | 婴儿血管瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例婴儿血管瘤样本,共36,237个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 862 | 2026-04-25 |
Focal Adhesion Kinase-Dependent Reprogramming of IFN-γ Signaling through PYK2 Coinhibition Sensitizes Melanoma to Immune Checkpoint Blockade
2026-May, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.09.376
PMID:41101630
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研究论文 | 本研究明确了FAK和PYK2在IFN-γ介导的免疫检查点阻断耐药中的不同作用,通过磷酸化组学分析及小鼠模型揭示了联合抑制FAK和PYK2可增强CD8 T细胞介导的肿瘤杀伤,并克服黑色素瘤对免疫治疗耐药 | 首次区分FAK(主要支架)和PYK2(辅助)在IFN-γ信号重编程中的特定角色,发现联合靶向二者可实现最大程度免疫增敏,且通过单细胞RNA测序揭示肿瘤细胞与免疫细胞中FAK/PYK2表达差异 | 研究主要基于抗PD-1耐药小鼠模型和公共数据集,需在更广泛临床样本中验证;PYK2抑制的长期安全性及联合治疗的最佳剂量未明确 | 探究FAK和PYK2在IFN-γ介导的黑色素瘤免疫检查点阻断耐药中的功能差异及治疗潜力 | 抗PD-1耐药的黑色素瘤小鼠模型、TCGA-SKCM队列及GSE91061临床数据集 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 无标磷酸化蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 磷酸化蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 临床转录组数据 | 小鼠模型(样本数未提及);TCGA-SKCM队列(约470例);GSE91061数据集(约100例黑色素瘤患者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 863 | 2025-11-16 |
Spatial Transcriptomics and Proteomics of Mycosis Fungoides Biopsies from Skin of Color Patients Reveal Biomarkers and Potential Treatment Targets
2026-May, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.10.608
PMID:41237899
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 864 | 2026-04-25 |
Lifestyle shapes preclinical social and microglial deficits in an Alzheimer's disease mouse model
2026-May, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03368-4
PMID:41388145
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研究论文 | 该研究利用新型富集范式对阿尔茨海默病敲入小鼠模型进行跟踪,发现其临床前阶段存在社会行为和免疫系统的早期缺陷 | 首次在阿尔茨海默病敲入小鼠模型中证明临床前阶段并非静默,而是存在多领域(包括社会行为、神经可塑性和免疫)相互交织的早期变化,并通过单细胞RNA测序揭示环境富集对干扰素响应小胶质细胞的抑制作用 | 该小鼠模型为简化的敲入模型,可能无法完全模拟人类阿尔茨海默病的复杂性;研究仅追踪至7个月龄,长期效果未评估 | 探究阿尔茨海默病临床前阶段的社会行为和免疫变化,以及环境富集对其的影响 | 阿尔茨海默病App敲入小鼠及其对照小鼠 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠数量未明确,但跟踪至7个月龄,包含不同时间点的行为学、血浆和小胶质细胞分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 865 | 2026-04-25 |
Dysfunctional Dendritic Cells in Radiation-Induced Jaw Injury: Insights From Single-Cell Transcriptomic Analysis of the Osteoimmune Microenvironment
2026-05, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70088
PMID:41424393
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示辐射诱导颌骨损伤中树突状细胞的功能失调 | 首次在单细胞分辨率下全面解析辐射诱导颌骨损伤的骨免疫微环境,发现迁移性树突状细胞功能受损及SPP1/CD44/NF-κB信号通路的关键作用 | 未提及具体局限性 | 探究辐射诱导颌骨损伤中骨免疫微环境的细胞和分子机制 | 小鼠下颌骨骨髓细胞 | 数字病理学 | 辐射诱导颌骨损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及具体样本数量 | 未提及 | 单细胞RNA-seq | 未提及 | 未提及 |
| 866 | 2026-04-25 |
Alterations in NK Cell Function and Glucose Metabolism Characteristics in Patients With Progressive Hepatocellular Carcinoma
2026-05, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70095
PMID:41500969
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术,研究进行性肝细胞癌患者NK细胞功能与葡萄糖代谢特征的改变 | 首次在单细胞水平揭示进行性肝细胞癌中TIM3+ NK细胞亚群的耗竭表型及糖酵解代谢重编程机制 | 样本量较小(6例患者),未纳入健康对照组,且未进行功能验证实验 | 阐明进行性肝细胞癌中NK细胞免疫抑制与代谢异常的特征及其机制 | 进行性肝细胞癌患者和稳定性肝细胞癌患者的外周血、肿瘤组织及癌旁组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多色流式细胞术、多色荧光分析 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 6例初治肝细胞癌患者(3年随访分为进行组和稳定组) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 867 | 2026-04-25 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify PGK1-sensitized hypoxia macrophages as a therapeutic target to overcome PDT resistance in glioma
2026-May, Journal of photochemistry and photobiology. B, Biology
DOI:10.1016/j.jphotobiol.2026.113430
PMID:41880777
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学鉴定PGK1致敏的缺氧肿瘤相关巨噬细胞,并揭示其在胶质瘤光动力疗法抵抗中的关键作用 | 首次结合单细胞和空间转录组学技术,在配对的人胶质瘤样本中系统解析缺氧肿瘤相关巨噬细胞的代谢重编程机制,并发现PGK1-PDHK1磷酸化与SPP1-CD44旁分泌轴共同驱动光动力疗法抵抗 | 研究主要基于体外功能实验和原位小鼠模型,仍需在更大临床队列中验证靶向PGK1或SPP1的治疗潜力 | 阐明缺氧肿瘤相关巨噬细胞在胶质瘤光动力疗法抵抗中的作用机制,并探索新的治疗靶点 | 人胶质瘤配对样本(治疗前与复发后),以及原位小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫共沉淀, 原位小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 配对的人胶质瘤样本(治疗前与复发后) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 868 | 2026-04-25 |
[Half a century of gene expression analysis : The path to modern spatial transcriptomics in autopsy tissue]
2026-May, Pathologie (Heidelberg, Germany)
DOI:10.1007/s00292-026-01551-0
PMID:41979651
|
综述 | 回顾基因表达分析五十年发展,重点介绍现代空间转录组学在尸检组织中的应用并评估当前平台 | 首次系统评估Visium HD、GeoMx、CosMx和Xenium等平台在FFPE和尸检组织中的分辨率、适用性和挑战 | RNA质量对FFPE和尸检样本分析可靠性构成关键制约因素 | 呈现基因表达分析的方法学发展并评估当前空间转录组学平台 | FFPE组织和尸检组织样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | 10x Genomics, NanoString, 华大智造 | 空间转录组学 | Visium HD, GeoMx, CosMx, Xenium | Visium HD用于FFPE组织分析,GeoMx和CosMx用于空间转录组学分析,Xenium用于亚细胞分辨率基因表达分析 |
| 869 | 2026-04-24 |
Dissecting placental host-pathogen interactions: Rift Valley fever virus infection in early human trophoblast stem cells
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115584
PMID:42023155
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研究论文 | 利用早期人类滋养层干细胞模型解析裂谷热病毒感染胎盘的宿主-病原体互作机制 | 首次使用早期人类滋养层干细胞(hTSC)建立胎盘感染的体外模型,并结合单细胞转录组学与病毒链特异性转录组学揭示裂谷热病毒在早期胎盘中的致病机制 | 未明确说明,但可能包括体外模型与体内环境的差异以及仅使用第一孕期细胞的局限性 | 探究裂谷热病毒在母胎界面的垂直传播机制及其对滋养层细胞的感染和病理影响 | 人早期滋养层干细胞(hTSC) | 数字病理学 | 裂谷热病毒感染相关妊娠疾病 | 免疫荧光、qRT-PCR、蛋白质印迹、单细胞转录组学、病毒链特异性转录组学 | NA | 图像、文本(转录组数据) | 人类早期滋养层干细胞(未明确具体数量) | Illumina | 单细胞转录组学 | Illumina NovaSeq | 单细胞转录组测序及链特异性病毒转录组分析 |
| 870 | 2026-04-24 |
Single-cell gene expression and TCR profiling reveal age-related differences in recent thymic emigrants
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115582
PMID:42023153
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研究论文 | 利用单细胞基因表达和TCR谱系分析揭示新生和成年小鼠近期胸腺迁出细胞在表型和功能上的年龄相关差异 | 首次结合单细胞转录组学和TCR测序,系统比较新生与成年阶段RTE的差异,并发现新生RTE中利用种系编码TCR的细胞具有更明显的效应基因特征 | 研究基于小鼠模型,其结果在人类中的适用性尚需验证 | 探究不同年龄阶段(新生与成年)近期胸腺迁出细胞的表型、功能及TCR使用差异 | 新生和成年小鼠的CD8阳性RTE细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序、TCR测序 | NA | 基因表达数据、TCR序列数据 | 小鼠模型,依赖命运映射模型比较新生和成年样本,具体数量未详述 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 871 | 2026-04-24 |
CD163 and Tim-4 identify resident intestinal macrophages that are spatially regulated by TGF-β
2026-May-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20240801
PMID:42012484
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术,识别肠道中由TGF-β空间调控的常驻巨噬细胞,并揭示CD163和Tim-4作为其标志物 | 挑战了肠道巨噬细胞仅存在于肌肉层的传统观点,发现固有层和黏膜下/肌层中均存在长寿命巨噬细胞,并揭示TGF-β信号对固有层巨噬细胞身份维持的关键作用 | 未提及的局限性 | 探究肠道不同组织中长寿命巨噬细胞的表型特征及其调控机制 | 野生型和Ccr2-/-小鼠的肠道巨噬细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型和Ccr2-/-小鼠肠道组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 872 | 2026-04-24 |
Klotho in the kidney distal convolution regulates urinary Klotho excretion and kidney calcium reabsorption, but not phosphate homeostasis
2026-May, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.01.030
PMID:41759932
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研究论文 | 本研究探讨了肾脏远端曲小管中的Klotho蛋白对尿Klotho排泄和钙重吸收的调节作用,但不影响磷酸盐稳态 | 首次通过多种基因修饰小鼠模型和单细胞RNA测序,明确肾脏远端曲小管(特别是晚期DCT/CNT)是尿液中可溶性Klotho的主要来源,且远端曲小管Klotho调控钙重吸收而非磷酸盐稳态 | 研究基于小鼠模型,结论向人类外推需谨慎;未深入探讨远端曲小管Klotho调控钙重吸收的分子机制细节 | 阐明肾脏远端曲小管中Klotho蛋白在可溶性Klotho释放和矿物质代谢调节中的功能 | 小鼠肾脏远端曲小管细胞及多种基因修饰小鼠模型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种基因修饰小鼠模型(Kl-KODC、Kl-KODCT/CNT、Kl-KODCT仅、泛肾小管敲除) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台,用于分析分离的小鼠远端曲小管细胞 |
| 873 | 2026-04-24 |
Senolytic Treatment With Fisetin Reverses Age-Related Endothelial Dysfunction Partially Mediated by SASP Factor CXCL12
2026-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70500
PMID:42021544
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研究论文 | 本研究探讨了衰老相关内皮功能障碍的分子机制,发现SASP因子CXCL12是关键驱动因素,以及非瑟酮通过清除衰老细胞逆转这一过程 | 首次通过单细胞转录组学揭示衰老内皮细胞中SASP因子CXCL12的升高,并证明非瑟酮治疗可逆转其表达,同时阐明CXCL12在介导内皮功能障碍中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类验证尚需进一步研究;未完全阐明非瑟酮影响CXCL12的具体分子机制 | 识别与衰老内皮细胞相关的信号通路、内皮相关SASP因子及其对内皮功能的影响 | 小鼠主动脉内皮细胞、人类主动脉内皮细胞、循环SASP因子 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠:年轻(6月龄)和老年(27月龄)雌雄小鼠,每组包括非瑟酮处理组和对照组 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 874 | 2026-04-23 |
A comprehensive multi-omics and functional study of evolutionary adaptive responses to smoke
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115547
PMID:42016314
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研究论文 | 本研究通过多组学和功能分析,全面探讨了吸烟引起的进化适应性反应,识别了吸烟特征及其在气道中的空间分布,并揭示了关键调控基因 | 结合单细胞和空间转录组学数据映射吸烟特征,识别人类特异性烟雾反应基因,表明进化适应,并通过甲基化和ChIP-seq分析确定主调控因子 | 研究可能受限于样本队列的多样性和规模,且进化适应性的机制需要进一步验证 | 研究吸烟引起的进化适应性反应及其在慢性肺病发展中的作用 | 当前吸烟者和非吸烟者的肺组织,包括人类和非人类灵长类动物 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组学、单细胞RNA-seq、空间转录组学、甲基化分析、ChIP-seq | NA | 转录组数据、单细胞数据、空间数据、甲基化数据、ChIP-seq数据 | 多个队列的当前吸烟者和非吸烟者样本,包括人类和非人类灵长类动物 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 875 | 2026-04-23 |
Keratin 15 Regulates Cell Proliferation in Outer Enamel Epithelium
2026-May, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251368346
PMID:41103018
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了小鼠牙胚中角蛋白15在牙釉质外上皮细胞中的特异性表达及其在调控细胞增殖和牙发育中的作用 | 首次将角蛋白15鉴定为牙釉质外上皮的特异性标记基因,并揭示了其通过抑制p38 MAPK通路调控牙上皮细胞增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞系,尚未在人类样本中验证,且对Krt15调控的具体下游靶点仍需进一步探索 | 阐明牙釉质外上皮在牙发育中的功能角色及其分子调控机制 | 小鼠牙胚(出生后第7天切牙和胚胎第14天第一磨牙)及牙上皮细胞系CLDE | 单细胞转录组学 | 牙发育异常 | 单细胞RNA测序,体外器官培养,基因敲低 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 小鼠牙胚样本(P7切牙和E14 P1磨牙)及CLDE细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 876 | 2026-04-23 |
Development and validation of a cuproptosis-related gene signature for predicting prognosis and drug sensitivity in gastric cancer
2026-May, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04132-4
PMID:41296174
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于铜死亡相关基因的预后模型,用于预测胃癌患者的生存和治疗反应 | 首次在胃癌中基于铜死亡相关基因构建预后模型,并关联化疗和免疫治疗敏感性 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 构建基于铜死亡相关基因的预后模型,评估其在胃癌预后预测和治疗反应评估中的临床效用 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序,qRT-PCR | LASSO回归 | 转录组数据,临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 877 | 2026-04-23 |
Identification of Apically Localized Endogenous Dental Pulp Stem Cells
2026-May, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251378094
PMID:41108143
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和谱系追踪技术,在小鼠磨牙根尖处鉴定出内源性Axin2+牙髓干细胞,并揭示了其在牙髓和牙本质再生中的作用机制 | 首次在小鼠磨牙根尖处鉴定出内源性Axin2+牙髓干细胞,并利用单细胞转录组学和谱系追踪技术详细描述了其在牙髓组织形成和损伤修复中的动态过程 | 研究主要基于小鼠模型,人类牙髓干细胞在根尖的定位和功能可能有所不同,且长期追踪时间(至少9个月)可能限制了临床转化的直接应用 | 探究牙髓干细胞在牙髓和牙本质再生中的在体作用机制,为再生牙髓治疗提供新见解 | 小鼠磨牙的牙髓组织和根尖乳头 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学, 谱系追踪 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 878 | 2026-04-23 |
Biological multi-omics approaches to next-generation biomarkers in immune-related disorders and malignancies: An overview
2026-May, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04128-0
PMID:41324821
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综述 | 本文概述了癌症和自身免疫性疾病中下一代生物标志物的研究进展,重点关注多组学整合和人工智能驱动的方法 | 强调多组学数据与人工智能/机器学习相结合,以揭示动态分子特征,并利用单细胞和空间分析来解析细胞异质性和组织背景 | 挑战包括检测标准化、患者间变异性和监管障碍 | 综述下一代生物标志物在癌症和自身免疫性疾病中的应用,以推动精准诊断和个性化治疗 | 癌症和自身免疫性疾病 | 自然语言处理 | 肺癌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 879 | 2026-04-23 |
The cardiac conduction system: development, function and therapeutic targets
2026-May, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-025-01227-x
PMID:41478886
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综述 | 本文综述了心脏传导系统的发育、功能及其作为治疗靶点的最新研究进展 | 整合单细胞基因组学、转录组学及空间转录组学技术,深入揭示心脏传导系统的细胞微环境与功能调控机制 | NA | 探讨心脏传导系统的生物学基础及其在疾病治疗中的应用潜力 | 心脏传导系统及其相关疾病 | NA | 心血管疾病 | 单细胞基因组学、转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 880 | 2026-02-14 |
First longitudinal spatial transcriptomics analysis in pulmonary arterial hypertension
2026-May, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.02.003
PMID:41679567
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |