单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 987 篇文献,本页显示第 861 - 880 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
861 2026-05-08
Mitochondrial RNA helicase DDX28 promotes cell cycle and DNA repair programs and shapes an immunosuppressive microenvironment in acute myeloid leukemia
2026-May-05, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 该研究揭示了线粒体RNA解旋酶DDX28在急性髓系白血病中通过促进细胞周期和DNA修复程序并塑造免疫抑制微环境的作用机制 首次系统阐明DDX28在AML中通过启动子低甲基化及转录因子THAP11调控,将线粒体翻译与快速增殖细胞的生物合成和基因组维护需求耦合,并关联免疫抑制微环境 未进行直接代谢通量测量 探究DDX28在急性髓系白血病中的表达模式、预后意义及作用机制 急性髓系白血病患者队列及HEL细胞系 机器学习 急性髓系白血病 RNA-seq,单细胞RNA-seq,siRNA敲低 NA 转录组数据,单细胞转录组数据 多个AML队列(具体样本量未在摘要中明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
862 2026-05-08
MLN2SVG: domain-aware spatially variable gene detection using contrastive variational autoencoder and multi-level neighbor search
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出MLN2SVG框架,整合对比变分自编码器和多级邻居搜索算法,用于联合学习组织域和空间变异基因检测 首次将对比变分自编码器与多级邻居搜索相结合,同时捕捉局部和远程空间关系,在空间转录组数据中实现域感知的SVG检测 信息不足,输出NA 开发能准确识别空间变异基因并同时发现组织域的稳健框架 人类和小鼠空间转录组数据集,包括背外侧前额叶皮层、乳腺癌和脑组织 机器学习 乳腺癌 空间转录组学 对比变分自编码器、多级邻居搜索算法 空间转录组数据 多个数据集:背外侧前额叶皮层、乳腺癌和脑组织(具体样本数NA) NA 空间转录组学 NA NA
863 2026-05-08
RAD23A promotes multiple myeloma cell survival through DNA damage response, proteostasis and enhanced metabolic activity
2026-May-04, Toxicology and applied pharmacology IF:3.3Q2
研究论文 该文章研究了RAD23A在多发性骨髓瘤(MM)中的作用,发现其通过DNA损伤反应、蛋白质稳态和增强代谢活性促进MM细胞生存 首次揭示RAD23A在多发性骨髓瘤中的多功能调控作用,包括促进代谢活性和蛋白运输,并增强对硼替佐米的敏感性 未提及明显的局限性 探究RAD23A在多发性骨髓瘤中的生物学功能和潜在治疗靶点价值 多发性骨髓瘤细胞系H929和RPMI8226 机器学习 多发性骨髓瘤 批量RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术、氧消耗率测量、细胞外酸化率测量、葡萄糖摄取测定 NA 基因表达数据、RNA序列 多个MM队列(具体数量未说明) NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
864 2026-05-08
Efficient pulmonary-targeted therapy and mechanistic insights of a novel glutathione dry powder inhaler in a model of radiation-induced lung injury
2026-May-03, Toxicology and applied pharmacology IF:3.3Q2
研究论文 开发新型谷胱甘肽干粉吸入剂用于放射性肺损伤治疗并揭示其通过抗氧化和抗焦亡双重机制保护肺泡II型上皮细胞的分子机理 首次将谷胱甘肽制成干粉吸入剂实现肺部靶向递送,并利用单细胞RNA测序揭示其通过中断‘氧化应激-焦亡-炎症’恶性循环的双重治疗机制 研究基于小鼠模型,临床转化需验证;单细胞RNA测序分析仅提供相关性证据,缺乏直接因果验证 开发并验证一种新型谷胱甘肽干粉吸入剂对放射性肺损伤的治疗效果及其分子机制 放射性肺损伤小鼠模型及肺组织细胞(特别是肺泡II型上皮细胞) 机器学习 放射性肺损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型,具体样本数未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
865 2026-05-08
Role for Complement C5 in Eosinophilic Inflammation of Severe Asthma
2026-May, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 通过痰液蛋白质组学分析,研究补体C5在严重哮喘嗜酸性炎症中的作用 首次通过痰液蛋白质组学分析揭示补体C5在严重哮喘中直接加剧嗜酸性炎症的作用,并通过体外和体内实验验证了其机制 未提及具体限制,但可能包括样本量有限或动物模型与人类疾病的差异 探究补体系统,特别是补体C5,在严重哮喘中的作用 严重哮喘患者和健康对照的痰液样本,以及哮喘小鼠模型 机器学习 哮喘 蛋白质组学、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 加权相关网络分析(WGCNA) 蛋白质表达谱、单细胞转录组数据 纳入健康对照和严重哮喘患者,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
866 2026-05-08
Acetylcholine From Solitary Chemosensory Cell, Not Neuron, Regulates Basal Cell Fate Driving Eosinophilic Chronic Rhinosinusitis With Nasal Polyps
2026-May, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 研究显示从孤立化学感觉细胞而非神经元释放的乙酰胆碱通过调节基底细胞命运驱动嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉的发展 首次揭示孤立化学感觉细胞来源的乙酰胆碱在嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉中通过毒蕈碱乙酰胆碱受体调控基底细胞增殖和分化异常,而非传统的副交感神经途径,并涉及YAP信号通路激活 仅基于组织样本和体外/体内模型验证,具体临床转化效果及长期安全性尚未在人类中充分评估 探讨孤立化学感觉细胞来源的乙酰胆碱在基底细胞命运决定中的作用机制 健康个体、嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者和非嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的组织样本 数字病理学 嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉 单细胞测序 NA 组织样本 未具体说明样本数量,涉及健康个体、eCRSwNP患者和neCRSwNP患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
867 2026-05-08
Characterization of Human Group 9 Innate Lymphoid Cells in Response to Allergen Immunotherapy in Patients With Allergic Rhinitis
2026-May, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 揭示过敏性鼻炎患者中第9群先天淋巴样细胞(ILC9)的存在及其在变应原免疫治疗中的特征 首次报道了ILC9细胞亚群的存在,并阐明了其在过敏性鼻炎患者鼻黏膜和外周血中的高表达,以及对变应原免疫治疗的响应和调控机制 研究样本量有限,且仅关注了尘螨皮下免疫治疗(SCIT)一种免疫治疗方式,机制研究主要基于体外实验 探究过敏性鼻炎患者中ILC9细胞的存在、功能及其在变应原免疫治疗中的变化 过敏性鼻炎患者和接受皮下免疫治疗的患者 免疫学 过敏性鼻炎 流式细胞术、单细胞RNA测序、qRT-PCR、siRNA敲低、免疫荧光染色 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据 未明确列出具体样本数量 Illumina, 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序系统
868 2026-05-08
Co-morbid biomarkers for sarcopenic obesity associated with gut microbiota metabolites: From burden to treatment
2026-May, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 通过整合差异表达基因、基因共表达网络分析和肠道菌群代谢物靶点,结合机器学习方法识别肌肉减少性肥胖的共病生物标志物,并在高脂饮食诱导的小鼠模型中进行验证 首次通过整合多组学数据(差异表达基因、基因共表达网络分析和肠道菌群代谢物靶点)结合多种机器学习方法(LASSO、XGBoost、SVM-REF、随机森林)识别肌肉减少性肥胖的共病生物标志物,并在单细胞测序和小鼠模型中验证 未明确说明局限性 识别肌肉减少性肥胖(SO)的共病生物标志物,并探讨其与肠道菌群代谢物的关联及潜在治疗化合物 中国中老年人(CHARLS数据库)和饮食诱导肥胖小鼠 机器学习 老年疾病 机器学习, 单细胞测序, 分子对接 LASSO, XGBoost, SVM-REF, 随机森林 基因表达数据, 单细胞测序数据 中国中老年人(2011年样本量未明确,2018年样本量未明确); 四个独立GEO队列 NA 单细胞测序 NA NA
869 2026-05-08
Interleukin-7 receptor activation in interstitial macrophages promotes lung fibrosis through secreted phosphoprotein 1
2026-May-01, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 该文章揭示了间质巨噬细胞通过分泌磷酸蛋白1(SPP1)在肺纤维化中的关键作用,并阐明了白细胞介素-7受体(IL7R)信号调控这一过程的机制 首次鉴定出间质巨噬细胞是肺纤维化中SPP1的主要来源,并发现IL7R信号通过调控SPP1和Gpnmb表达促进纤维化,为靶向IL-7/巨噬细胞/SPP1轴治疗肺纤维化提供新思路 主要基于小鼠模型和公共数据集,缺乏人体临床验证;未深入探讨IL7R信号下游具体分子通路 明确SPP1产生型巨噬细胞在肺纤维化中的功能角色及其调控机制 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型、特发性肺纤维化患者单细胞RNA测序数据 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序、多组学分析、基因敲入报告小鼠、条件性基因敲除小鼠 NA 单细胞转录组数据 包括博来霉素处理小鼠(至少7天时间点)、Spp1-EGFP敲入报告小鼠、Il7r fl/fl Csf1r-iCre条件敲除小鼠,以及人类特发性肺纤维化公共数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
870 2026-05-08
Single-cell spatiotemporal dissection of the human maternal-fetal interface
2026-May, Nature IF:50.5Q1
研究论文 通过整合单核转录组、染色质可及性、空间转录组和多重蛋白成像,构建了人类母胎界面从早期到足月的综合时空图谱 以前所未有的时空分辨率,系统解析了正常妊娠期间母胎界面的细胞状态、空间微环境和转录程序,并开发了预测细胞滋养层侵袭性的机器学习模型 未明确提及 揭示人类母胎界面的细胞、分子和空间程序,构建全面参考图谱 人类母胎界面(胎盘和蜕膜)的母体和胎儿细胞 机器学习, 数字病理学 先兆子痫, 早产, 流产 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq, 空间转录组学, CODEX多重蛋白成像 机器学习模型 图像, 文本, 基因表达数据 正常妊娠样本(从早期到足月) 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 10x Chromium 大规模配对单核转录组和染色质可及性分析,亚微米分辨率空间转录组学和CODEX多重蛋白成像
871 2026-05-08
Tailoring the Extent of Lymphadenectomy for Esophageal Squamous Cell Carcinoma: Insights From a Comparative Study of Neoadjuvant Chemo-Immunotherapy and Surgery Cohort
2026-May, Thoracic cancer IF:2.3Q2
研究论文 比较食管鳞癌患者接受新辅助化学免疫治疗与单纯手术队列中淋巴结清扫范围的最佳数量,发现淋巴结清扫数量与预后的关系取决于治疗方案 首次揭示在新辅助化学免疫治疗背景下,淋巴结清扫数量与预后呈非线性“金发姑娘”原则关系,而非单纯手术中的持续生存获益,并通过单细胞测序阐明肿瘤反应性细胞毒性T细胞在转移阴性淋巴结中的富集机制 未明确提及 探讨食管鳞癌患者在新辅助化学免疫治疗与单纯手术队列中,淋巴结清扫数量对预后的影响及其免疫机制 621例接受R0切除的食管鳞癌患者(单纯手术组451例,新辅助化学免疫治疗组170例) 机器学学习 食管癌 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 Cox回归模型 临床数据、单细胞测序数据、TCR测序数据 621例患者(单纯手术组451例,新辅助化学免疫治疗组170例),以及配对肿瘤和淋巴结样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
872 2026-03-13
Molecular subtypes of vascular endothelial cell differentiation in keloid by single-cell sequencing
2026-May-05, Chinese medical journal IF:7.5Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
873 2026-05-06
Induction alectinib or crizotinib for stage III NSCLC harboring ALK fusion: A study with 4-year follow-up
2026-May-05, Chinese medical journal IF:7.5Q1
研究论文 评估阿来替尼或克唑替尼诱导治疗ALK融合阳性III期非小细胞肺癌的短期和长期疗效,并伴有4年随访数据 首次系统性评估ALK-TKI诱导治疗在局部晚期NSCLC中的疗效,结合纵向单细胞RNA测序分析肿瘤微环境变化 样本量较小(40例),且为回顾性研究,可能存在选择偏倚 验证ALK靶向诱导治疗在III期肺癌中的疗效和安全性 ALK融合阳性的IIIA-IIIB期非小细胞肺癌患者 医学影像分析 肺癌 ALK-TKI诱导治疗、单细胞RNA测序 NA 临床数据、纵向单细胞RNA测序数据 40例III期NSCLC患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
874 2026-05-06
Patient-derived surgical samples reveal the cellular and molecular signatures of glioblastoma infiltration in distinct radiological zones
2026-May-05, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
研究论文 研究揭示胶质母细胞瘤在不同放射学区域浸润的细胞和分子特征 首次结合MRI分区与多区域活检,系统描述GBM周边区域的细胞景观与临床关联 基于MRI的nCE区域分类低估了水肿区域内的肿瘤浸润 定义GBM外周区域的细胞景观及其临床意义 45例胶质母细胞瘤患者的161份活检样本 数字病理学 胶质母细胞瘤 免疫组化、单细胞RNA测序转录组分析 NA 图像、转录本数据 45例患者,161份活检样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
875 2026-05-06
Advances in sex-specific single-cell transcriptomic profiling in Parkinson's disease
2026-May-05, Journal of Parkinson's disease
综述 综述单细胞转录组学在帕金森病研究中的应用进展,重点关注性别特异性分子改变 系统总结了单细胞RNA测序技术揭示帕金森病中细胞异质性和性别特异性分子变化的创新发现 主要基于现有文献总结,未涵盖所有潜在性别差异研究,且技术方法仍在快速发展中 探讨单细胞转录组学如何深化对帕金森病病理机制的理解,并强调性别意识研究设计的重要性 帕金森病相关细胞类型,包括多巴胺能神经元、小胶质细胞和少突胶质细胞 数字病理学 帕金森病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
876 2026-05-06
Syrah: a pipeline to maximize spatial transcriptomics data output
2026-May-04, G3 (Bethesda, Md.)
研究论文 Syrah是一个用于最大化空间转录组学数据输出的分析流程,通过识别和纠正Slide-seqV2和Curio Seeker数据集中的条形码错误来显著提高可用读数 提出基于生化模型和条形码序列数据的错误校正方法,无需额外数据集或复杂计算,相比传统精确匹配方法可多恢复35%的读数 未提及 开发一种能够最大化空间转录组学数据输出的分析流程 Slide-seqV2和Curio Seeker空间转录组数据集 生物信息学 NA 空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 Slide-seqV2, Curio Seeker Slide-seqV2和Curio Seeker空间转录组平台
877 2026-05-06
The CXCL12-CXCR4 Axis Mediates Lymphocyte Immune Overactivation in IgG4-Related Chronic Rhinosinusitis
2026-May, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示IgG4相关慢性鼻窦炎中CXCL12-CXCR4轴介导的淋巴细胞免疫过度活化机制 首次在单细胞水平解析IgG4相关慢性鼻窦炎的转录组变化,并阐明CXCL12-CXCR4轴在疾病发病机制中的核心作用 样本量较小(仅5例患者),且控制组数据来源于已发表数据,可能引入批次效应 揭示IgG4相关慢性鼻窦炎的发病机制 IgG4相关慢性鼻窦炎患者的鼻黏膜组织 数字病理学 IgG4相关慢性鼻窦炎 单细胞RNA测序, 免疫组化, 多色免疫荧光 NA 单细胞转录组数据, 组织图像 5例患者样本和3例已发表控制样本,共49063个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
878 2026-05-06
Epithelial-Associated CD207+ DCs Link Allergen Sensing and IL-25-Driven Th2 Inflammation in Asthma
2026-May, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 本研究揭示CD207+树突状细胞作为上皮相关抗原递呈细胞,在哮喘中连接IL-25信号与Th2型免疫应答的机制 首次鉴定CD207+树突状细胞作为上皮源性细胞因子IL-25的下游效应细胞,阐明其将过敏原感知与Th2炎症相联系的分子机制 尚未在人体哮喘模型中直接验证CD207缺失的治疗效果,且IL-25-CD207轴的上游调控网络仍需进一步解析 探究CD207+树突状细胞是否响应上皮源性细胞因子并参与哮喘Th2免疫应答 健康人肺组织单细胞RNA-seq数据、Cd207-/-小鼠尘螨诱导哮喘模型及U-BIOPRED队列哮喘患者气道样本 免疫学 哮喘(T2-high型) 单细胞RNA测序、流式细胞术、DC-T细胞共培养、Transwell气液界面共培养 NA 单细胞转录组数据、流式细胞数据、共培养实验数据 人肺样本、Cd207-/-小鼠模型、U-BIOPRED队列哮喘患者气道样本 未知 单细胞RNA测序 NA NA
879 2026-05-06
Transcriptomic profiling of insulinomas reveals a new "low-endocrine" subtype with low YY1 expressions
2026-May, Pancreatology : official journal of the International Association of Pancreatology (IAP) ... [et al.] IF:2.8Q2
研究论文 对胰岛素瘤进行转录组分析,发现一种新的“低内分泌”亚型,其YY1表达水平较低 首次通过转录组分析识别出胰岛素瘤的低内分泌亚型,并揭示YY1表达水平与胰岛素合成途径的相关性 未详细说明样本量大小或临床数据的差异,以及YY1突变率与表达水平不一致的机制 探究胰岛素瘤的转录组异质性以及转录因子YY1的调控作用 胰岛素瘤肿瘤样本 数字病理学 胰岛素瘤 bulk RNA-seq, 全外显子测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间转录组数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium HD平台
880 2026-05-06
Integrative transcriptomic profiling reveals molecular signatures of disease progression from gastroesophageal reflux disease to Barrett's esophagus: A foundation for single-cell resolution studies
2026-May, SLAS technology IF:2.5Q3
research paper 通过整合性转录组分析揭示了从胃食管反流病到巴雷特食管进展的分子特征,为单细胞分辨率研究奠定基础 首次系统性地在胃食管反流病和巴雷特食管之间进行大规模转录组比较,识别出1247个差异表达基因及相关信号通路,并揭示了疾病进展的分子标志物 缺少单细胞分辨率数据支撑,研究队列样本量较小(N=40),部分临床分子关联分析存在重叠分布 阐明胃食管反流病向巴雷特食管转变过程中的分子机制,建立单细胞转录组研究的框架基础 胃食管反流病和巴雷特食管患者的食管组织样本 数字病理学 食管癌 RNA测序 NA 转录组数据 40名患者(20名胃食管反流病,20名巴雷特食管) Illumina 批量RNA测序 Illumina NovaSeq 高通量RNA测序平台,使用HISAT2比对和StringTie定量分析
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