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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2026-05-04 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals cellular stress responses to hypothermic preservation in liver-on-chip model
2026-May-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-50200-2
PMID:42069926
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研究论文 | 利用肝芯片模型进行单细胞转录组分析,揭示低温保存过程中不同保存液引发的细胞应激反应差异 | 首次在包含多种原代人肝细胞的肝芯片模型中,通过单细胞RNA测序高分辨率解析低温保存对细胞类型特异的转录组影响,并比较了临床标准UW液与新型HPG配方在应激反应、线粒体功能和细胞间通讯方面的差异 | 观察结论为探索性发现,缺乏独立的生物学重复和功能验证(如代谢通量分析、ROS检测),无法直接推断线粒体保护或临床保存效力 | 阐明肝移植中低温保存诱导的细胞类型特异性转录组变化及保存液化学组成的影响 | 肝芯片模型中的原代肝细胞类器官(PDOs)、肝星状细胞(HSCs)、肝窦内皮细胞(LSECs)和巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 肝缺血-再灌注损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 4组肝芯片样本(UW液保存组、HPG液保存组,每组含常温和复温条件) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'测序平台 |
| 822 | 2026-05-04 |
Spatially resolved ex vivo drug response profiling in SMARCB1-deficient sinonasal carcinoma
2026-May-02, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00437-1
PMID:42070010
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研究论文 | 结合单核RNA测序、空间转录组学和离体患者来源组织切片培养,解析SMARCB1缺陷型鼻窦癌的瘤内异质性、微环境结构和治疗脆弱性 | 首次将单核RNA测序、空间转录组学和离体组织切片培养整合应用于SMARCB1缺陷型鼻窦癌,发现mTOR抑制剂Sapanisertib能诱导肿瘤广泛坏死并有效清除特定恶性亚群 | 离体模型可能无法完全模拟体内治疗的复杂微环境,且回顾性队列样本量较小 | 解析SMARCB1缺陷型鼻窦癌的恶性亚群异质性、空间组织特征并筛选潜在治疗靶点 | SMARCB1缺陷型鼻窦癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | SMARCB1缺陷型鼻窦癌 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 离体组织切片培养 | NA | 基因表达数据, 空间基因表达数据 | 1例指数病例进行深度分析,12例回顾性队列 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 823 | 2026-05-04 |
PD-1 Blockade-Induced DKK1 Expression by CD8+ T Cells Promotes Blood-Brain Barrier Permeabilization
2026-May-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1222
PMID:41525686
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示抗PD-1治疗通过诱导CD8+ T细胞表达DKK1促进血脑屏障通透性,从而影响脑转移瘤治疗效果 | 首次发现抗PD-1治疗可特异性地破坏血脑屏障完整性,并阐明DKK1/β-catenin/TCF及FOXM1通路介导的机制 | 未明确提及研究局限性 | 探究抗PD-1治疗脑转移瘤效果异质性的宿主驱动因素 | 脑转移微环境中的免疫细胞及内皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌脑转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 临床肺癌患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 824 | 2026-05-04 |
Preimplantation genetic testing for meiotic aneuploidy in trophectoderm biopsies - is it time to change our approach?
2026-May, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2026.105504
PMID:41865500
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评论文章 | 讨论在滋养层活检中区分减数分裂与有丝分裂非整倍体的必要性,提出核型定位技术可改善胚胎植入前遗传学检测的准确性 | 首次提出结合核型定位和亲本强度分析来区分减数分裂与非整倍体,避免误弃仅含临床意义未知的有丝分裂非整倍体的潜在可用胚胎 | NA | 改进胚胎植入前遗传学检测策略,减少非整倍体误判导致的胚胎丢弃 | 囊胚期滋养层活检样本 | 生物信息学 | 染色体非整倍体相关疾病 | 单核苷酸多态性亲本单倍型分析(核型定位)、单细胞测序 | NA | 遗传数据(单核苷酸多态性、单细胞序列) | NA | NA | NA | NA | NA |
| 825 | 2026-05-04 |
scSurvival: Single-Cell Survival Analysis of Clinical Cancer Cohort Data at Cellular Resolution
2026-May-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-0965
PMID:42013315
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研究论文 | 提出scSurvival框架,在单细胞分辨率下对临床癌症队列数据进行生存分析 | 首个直接从单细胞数据建模生存结局的注意力多实例Cox回归框架,整合变分自编码器处理高维、稀疏和批次效应 | 未明确说明 | 开发直接从单细胞转录组数据预测患者生存并识别关键细胞亚群的方法 | 黑色素瘤和肝癌患者的单细胞RNA测序队列数据 | 机器学习 | 黑色素瘤, 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 注意力多实例Cox回归, 变分自编码器 | 单细胞转录组数据, 临床生存数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 826 | 2026-05-04 |
Macrophage-related Genomic Signatures Predict HCC Prognosis and Therapy Response
2026 May-Jun, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20587
PMID:42055628
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研究论文 | 整合单细胞和bulk RNA-seq数据识别巨噬细胞相关基因特征,构建HCC预后和免疫治疗反应预测模型 | 首次利用巨噬细胞相关基因特征进行肝癌分子亚型划分,并基于主成分分析构建预后模型;整合单细胞与bulk转录组数据揭示免疫微环境差异 | 研究仅依赖公开数据库(GSE151530, HCCDB18, TCGA-HCC),缺乏独立外部验证队列;未进行实验验证巨噬细胞相关基因的功能机制 | 识别巨噬细胞相关基因组特征,划分肝细胞癌分子亚型,构建预后模型预测生存和疗法反应 | 肝细胞癌患者样本的转录组数据(单细胞和bulk RNA-seq)及对应临床信息 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | 主成分分析 | 基因表达数据 | 整合GSE151530(scRNA-seq)、HCCDB18(bulk RNA-seq)和TCGA-HCC(bulk RNA-seq)数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 827 | 2026-05-04 |
Immune cell annotation in the single-cell studies: technologies, challenges, and integrative solutions
2026-May-01, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-026-09780-4
PMID:42062653
|
综述 | 综述单细胞研究中免疫细胞注释的技术挑战与整合解决方案 | 详细阐述mRNA与蛋白质表达差异的生物学因素和技术假象,并系统评估转录组、蛋白质组及多模态技术的优缺点 | 未提供实证数据验证所提方法的有效性,且未涉及大规模临床样本的应用验证 | 探讨免疫细胞注释在单细胞研究中的挑战并整合多模态解决方案 | 免疫细胞(如外周血单核细胞)及其转录组与蛋白质组数据 | 自然语言处理,数字病理 | 非特定疾病 | 单细胞RNA测序,CITE-seq | NA | 转录组数据,蛋白质组数据 | NA | 10x Genomics, BD Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | 10x Chromium, BD Rhapsody, Illumina NovaSeq | CITE-seq整合转录组与表位测序 |
| 828 | 2026-05-04 |
Conventional type-1 DC density is associated with checkpoint inhibitor response across multiple types of cancer
2026-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI200987
PMID:42065248
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研究论文 | 分析多种癌症类型中传统1型树突状细胞密度与检查点抑制剂治疗反应之间的关联 | 首次在多癌种中系统验证cDC1密度与免疫检查点抑制剂疗效的强关联,并结合空间转录组学揭示cDC1-CD8+ T细胞组织微环境与治疗预后的关系 | 主要基于回顾性临床试验数据,cDC1作为生物标志物的前瞻性验证尚未完成 | 探究cDC1树突状细胞密度对免疫检查点抑制剂治疗反应的预测价值 | 黑色素瘤、尿路上皮癌、非小细胞肺癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肺癌, 黑色素瘤, 尿路上皮癌 | RNA测序, 多重免疫荧光, 空间转录组学, GeoMX-DSP | NA | RNA序列, 图像 | 7项关键临床试验的RNA序列数据,黑色素瘤、尿路上皮癌和非小细胞肺癌的多重免疫荧光样本 | NA | 空间转录组学 | Xenium, GeoMX-DSP | Xenium空间转录组学平台用于黑色素瘤样本分析,NSCLC样本使用GeoMX-DSP分析 |
| 829 | 2026-05-03 |
Plasma Proteomics Identifies Thousand-and-One-Amino Acid Kinase 3 as a Potential Biomarker of Rheumatoid Arthritis Activity and a Novel Therapeutic Target
2026-May, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70020
PMID:41429590
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research paper | 通过血浆蛋白质组学鉴定TAOK3作为类风湿关节炎活动性的潜在生物标志物和新治疗靶点 | 首次发现TAOK3与活动性类风湿关节炎的骨破坏相关,并验证其作为诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究样本量有限,功能研究主要在体外和动物模型中进行,需进一步临床验证 | 识别与活动性类风湿关节炎骨破坏相关的新型生物标志物和治疗靶点 | 类风湿关节炎患者血浆样本、成纤维样滑膜细胞、胶原诱导关节炎小鼠模型 | machine learning | 类风湿关节炎 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序、酶联免疫吸附试验、多重免疫组化 | NA | 蛋白质组学数据、单细胞RNA测序数据 | 160例RA患者和40例健康对照,两个独立验证队列(N1=50, N2=10) | NA | NA | NA | NA |
| 830 | 2026-05-03 |
Activation of the Cerebrospinal Fluid-Contacting Nucleus Mitigates Systemic Inflammation Induced by Sepsis
2026-May-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002665
PMID:41457044
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研究论文 | 本研究揭示脑脊液接触核在脓毒症中通过调节全身炎症反应发挥保护作用 | 首次发现脑脊液接触核在脓毒症免疫调节中的关键作用,并通过单细胞RNA测序鉴定其调控系统性炎症的关键组分 | 未明确脑脊液接触核调控免疫下游的具体分子通路,且动物模型可能不完全反映人类脓毒症复杂性 | 探究脑脊液接触核在脓毒症中调控全身炎症的机制 | 脓毒症小鼠模型的脑脊液接触核 | 神经免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 化学遗传学 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像, 细胞因子水平 | 脓毒症小鼠模型(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 831 | 2026-05-03 |
SPT6 maintains epidermal homeostasis by inhibiting an NF-κB-positive feedback loop to prevent excessive inflammation
2026-May, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-026-01410-1
PMID:41922599
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研究论文 | 研究SPT6通过抑制RELA基因增强子来阻断NF-κB正反馈环路,维持表皮免疫稳态和防止过度炎症的机制 | 首次发现SPT6作为转录延伸因子,通过结合RELA基因增强子抑制NF-κB正反馈环路,在表皮干细胞和祖细胞中主动抑制促炎信号通路以维持免疫静息状态 | 未提及具体局限性,但研究主要基于小鼠模型,需在人类皮肤疾病中进一步验证 | 探讨SPT6在表皮免疫稳态维持中的作用及其分子机制 | 表皮干细胞和祖细胞(EPSCs)、角质形成细胞 | 分子生物学 | 银屑病 | 条件性基因敲除、单细胞RNA测序 | 条件性敲除小鼠模型(K14-CreERT; Supt6) | 单细胞转录组数据 | 条件性敲除小鼠(K14-CreERT; Supt6) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 832 | 2026-05-03 |
Plasma ceramide mediates the association of peripheral T cells with Alzheimer's disease
2026-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.08.027
PMID:40835004
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术鉴定了阿尔茨海默病(AD)进展中外周T细胞亚群的动态变化,并发现血浆神经酰胺介导了CD4效应记忆(EM)T细胞与AD风险之间的关联 | 首次整合单细胞RNA测序、流式细胞术和孟德尔随机化方法,揭示CD4 EM和CD8 CM T细胞通过神经酰胺代谢途径影响AD风险,并提出免疫代谢通路的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和人群遗传数据,可能无法完全反映人类复杂疾病中的免疫-代谢相互作用,且神经酰胺介导效应仅占11.20%,其他潜在介质未充分探索 | 确定外周T细胞亚群对AD风险的因果贡献,并探究血液代谢物是否介导这种关联 | 阿尔茨海默病(AD)患者和APP/PS1小鼠模型中的T细胞亚群及血液代谢物 | machine learning | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,孟德尔随机化 | NA | 单细胞基因表达数据,流式细胞术数据,遗传变异数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 833 | 2026-05-03 |
Lung-Targeted HGF mRNA Restores Alveolar Structure in Experimental Emphysema
2026-May-01, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02323-2025
PMID:42067211
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研究论文 | 通过临床阶段SM92脂质纳米颗粒递送HGF mRNA,在实验性肺气肿模型中恢复肺泡结构 | 首次利用临床阶段SM92脂质纳米颗粒平台实现HGF mRNA的靶向肺部递送,并证明通过雾化和气管内滴注两种方式均能有效治疗肺气肿,通过激活肺泡II型细胞内源性修复通路 | 研究仅限于小鼠模型和患者来源肺类器官,临床转化性需进一步验证 | 评估HGF mRNA疗法在肺气肿治疗中的可行性和疗效 | 人类数据集、肺组织样本、弹性蛋白酶诱导和香烟烟雾诱导的小鼠模型、患者来源肺类器官 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病,肺气肿 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像、文本 | 人类数据集和肺组织样本,以及弹性蛋白酶诱导和香烟烟雾诱导的小鼠模型,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 834 | 2026-05-03 |
CD109 is associated with an immunosuppressive microenvironment and M2 macrophage polarization: pan-cancer analysis and functional validation
2026-May-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16100-4
PMID:42067796
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研究论文 | 通过泛癌分析及功能验证揭示了CD109与免疫抑制微环境和M2型巨噬细胞极化的关联 | 首次在泛癌水平系统评估CD109的表达、预后相关性及免疫调节作用,并结合单细胞RNA测序和体外功能验证阐明其与M2型巨噬细胞极化和免疫抑制微环境的关系 | 巨噬细胞相关功能效应仅在肺癌模型中验证,仍需在其他肿瘤类型中进一步研究 | 探讨CD109在多种癌症中的预后价值及其免疫调节作用 | CD109基因及其在肿瘤免疫微环境中的角色 | 生物信息学 | 泛癌,非小细胞肺癌 | RNA-seq,单细胞RNA测序,siRNA敲低,共培养实验,流式细胞术,qPCR,ELISA,迁移实验 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | GTEx和TCGA数据库中的多癌种样本,以及非小细胞肺癌队列的单细胞RNA测序样本 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 835 | 2026-05-02 |
Impact of enteric neuronal loss on intestinal cell composition
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115491
PMID:42063560
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究肠神经元缺失对野生型和突变型斑马鱼肠道细胞组成的影响,并验证于人类HSCR组织 | 首次系统揭示肠神经系统缺失对肠道细胞组成的影响,包括免疫细胞增加、上皮细胞代谢紊乱及ECM产生细胞纤维化标志物富集,并验证了临床相关性 | 未提及具体局限 | 探究肠神经元缺失对肠道稳态维持的影响及其潜在机制 | 野生型和突变型(HSCR模型)斑马鱼以及人类HSCR组织 | 数字病理学 | 先天性巨结肠 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量,包括野生型和突变型斑马鱼及人类HSCR组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 836 | 2026-05-02 |
Wnt3-mediated fibrosis and carcinogenesis of lung squamous cell carcinoma in idiopathic pulmonary fibrosis
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115667
PMID:42063567
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研究论文 | 通过多组学分析揭示特发性肺纤维化相关肺鳞癌中Wnt3介导的纤维化与癌变机制 | 首次利用单细胞RNA测序和数字空间分析,阐明IPF相关LUSC起源于AT2细胞转分化的化生基底细胞,并揭示Wnt3在此过程中的关键作用 | 样本量较小(仅7例UIP患者),且机制验证主要依赖细胞系模型,需进一步在体内模型中确认 | 探索IPF增加LUSC风险的分子机制,特别是Wnt信号在纤维化与癌变关联中的作用 | 伴有寻常型间质性肺炎的肺鳞癌标本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、数字空间分析、多组学分析 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 7例UIP患者的LUSC标本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 837 | 2026-05-02 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq identifies matrisome-related biomarkers for prognostic stratification and immune landscape in lung adenocarcinoma
2026-May-01, The Korean journal of physiology & pharmacology : official journal of the Korean Physiological Society and the Korean Society of Pharmacology
DOI:10.4196/kjpp.25.293
PMID:41496514
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研究论文 | 整合scRNA-seq与bulk RNA-seq数据,识别与基质体相关基因相关的生物标志物,用于肺腺癌预后分层及免疫景观分析 | 通过整合单细胞与批量转录组数据,构建了一个七基因风险模型(ANGPTL4, C1QTNF6, CCL20, CLEC3B, FCN1, LAMA3, PRELP),能够有效区分肺腺癌患者的生存风险,并揭示免疫微环境特征 | 未提及 | 探索基质体相关基因(MRGs)在肺腺癌肿瘤微环境和免疫调控中的作用,构建预后分层模型并指导个体化治疗 | 肺腺癌患者的转录组及临床数据,包括TCGA、GEO(GSE31210)和单细胞数据(GSE189357) | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq | LASSO-Cox风险比例模型 | 基因表达数据 | 多个数据集,具体例数未明确报告 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 838 | 2026-05-02 |
Single-Cell RNA-seq Analysis Reveals Distinct Tumor and Immunosuppressive T-Cell Phenotypes in Patients with CLL Treated with Ibrutinib
2026-May-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3349
PMID:42018044
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析揭示ibrutinib治疗的慢性淋巴细胞白血病患者中肿瘤和免疫抑制性T细胞的不同表型 | 首次在单细胞水平上揭示了ibrutinib敏感和耐药CLL患者的肿瘤和免疫微环境的转录异质性,并发现T细胞耗竭和单核细胞极化与耐药性相关 | 未提及具体局限性,但可能包括样本量较小或缺乏对耐药机制的进一步功能验证 | 理解ibrutinib敏感和耐药CLL细胞及其免疫微环境的差异,以确定控制BTKi治疗期间残留疾病的治疗策略 | 接受ibrutinib治疗的CLL患者的外周血单核细胞 | 自然语言处理 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自ibrutinib治疗患者的多个样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 839 | 2026-05-02 |
Single-Cell Analysis of Preeclamptic Cord Blood Mononuclear Cells Revealed Activation of Heme-Associated Signalling Pathways
2026-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71150
PMID:42050777
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析先兆子痫脐带血单核细胞,揭示血红素相关信号通路的激活 | 首次对先兆子痫妊娠的脐带血细胞进行单细胞RNA测序研究,发现血红素相关信号通路在多种细胞类型中被激活 | 需要进一步研究以阐明这些机制与胎盘血红素代谢之间的直接关系 | 探究先兆子痫脐带血单核细胞的分子变化及其在疾病中的作用 | 先兆子痫和对照组脐带血单核细胞 | 自然语言处理 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,生物信息学分析,批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,批量转录组数据 | 先兆子痫组和对照组的脐带血样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 840 | 2026-05-02 |
Novel Approaches for Investigating Host Responses to HIV Infection in Ex Vivo Human Genital Tissues
2026-May, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.70240
PMID:42053961
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综述 | 概述利用离体人类生殖组织研究HIV感染宿主反应的新型方法 | 重点介绍空间转录组学和多重成像等高分辨率技术在分析生殖组织黏膜免疫反应和结构变化中的创新应用 | 当前空间转录组学和生物成像平台存在分辨率限制和高成本等问题 | 阐明生殖组织黏膜屏障的局部免疫反应和结构完整性,以加深对HIV性传播易感性和慢性感染发病机制的理解 | 离体人类生殖组织 | 机器学习 | 人类免疫缺陷病毒感染 | 空间转录组学, 多重成像 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |