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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2026-05-15 |
First-in-human single-cell and TCR atlas reveals peripheral immune remodeling before and after irreversible electroporation in prostate cancer
2026-May-13, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014288
PMID:42128518
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研究论文 | 首次在人体中通过单细胞和TCR图谱揭示不可逆电穿孔治疗前列腺癌前后的外周免疫重塑 | 首次利用单细胞RNA测序和TCR谱分析绘制前列腺癌IRE治疗后系统性免疫应答的时空动态图谱 | 样本量较小(仅5例患者),且仅收集了治疗前和治疗后第7天的外周血样本,尚缺乏更长时间点及组织层面的数据 | 探究不可逆电穿孔(IRE)治疗前列腺癌后系统性免疫应答的机制和时间动态 | 5例局限性前列腺癌患者(T2a-T2c期) | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、T细胞受体(TCR)谱分析 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据 | 5例前列腺癌患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞TCR分析 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序和TCR谱分析平台 |
| 682 | 2026-05-21 |
Synthetic DNA vaccine platform elicits potent immunity where electroporated naked-mRNA is non-immunogenic
2026-May-13, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013812
PMID:42128520
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研究论文 | 开发基于线性发夹DNA(hpDNA)的合成DNA疫苗平台,在电穿孔递送下诱导强效免疫应答,而修饰mRNA在该条件下无免疫原性 | 首次证明电穿孔递送的非包封修饰mRNA无法诱导可检测的T细胞免疫,而hpDNA疫苗能在相同条件下引发有效炎症反应和持久免疫记忆 | 研究仅在小鼠模型中进行,未在人体中验证;mRNA疫苗仅测试电穿孔递送,未包含脂质纳米颗粒等其他递送系统 | 开发临床可扩展的个性化新抗原癌症疫苗平台 | MC38和CT26肿瘤小鼠模型的新抗原特异性T细胞免疫应答 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序、酶联免疫斑点检测、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组、T细胞受体序列 | 小鼠模型:MC38和CT26荷瘤小鼠的多组实验(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞5'基因表达与V(D)J测序 |
| 683 | 2026-05-21 |
Single-cell analysis reveals the role of interleukins in impairing osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells and promoting osteoporosis
2026-May-13, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/h7t1u6
PMID:42154637
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术,揭示白细胞介素在骨质疏松症中如何损害间充质干细胞成骨分化并促进疾病进展的机制 | 首次通过单细胞转录组学系统解析骨质疏松微环境中白细胞介素信号调控间充质干细胞命运的新机制,并发现IL34-CSF1R轴作为潜在治疗靶点 | 样本来源为公共数据集,缺乏独立验证队列;仅分析了骨关节和骨质疏松样本,未纳入健康对照组 | 阐明白细胞介素在骨质疏松症发生发展中对间充质干细胞成骨分化调控的分子机制 | 人骨质疏松症和骨关节炎患者的骨髓间充质干细胞样本 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自GSE147287数据集的多例骨质疏松和骨关节炎样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 684 | 2026-05-21 |
Engineering of Immunoactive Hydrogels Complements Tumor-Treating Fields for Glioblastoma Therapy
2026-May-12, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c00361
PMID:42054424
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研究论文 | 本研究揭示肿瘤治疗电场(TTF)通过鞘脂代谢相关通路介导的内质网应激触发免疫原性细胞死亡,并设计ATP响应性水凝胶佐剂与TTF协同,实现抗原和CpG的时空控释,重激活髓系细胞相互作用网络,增强抗肿瘤免疫反应 | 首次在单细胞RNA测序分辨率下揭示TTF触发GBM免疫原性细胞死亡的分子机制,并开发ATP响应性水凝胶佐剂与TTF协同治疗新策略 | NA | 开发TTF联合免疫活性水凝胶佐剂的GBM治疗新策略,并阐明其免疫激活机制 | 多形性胶质母细胞瘤(GBM)大鼠模型 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | GBM荷瘤大鼠(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 685 | 2026-05-21 |
CXCL16-driven CD4+ T cells orchestrate immunosurveillance against MHC-I-deficient hepatocellular tumors
2026-May-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012347
PMID:42120180
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研究论文 | 研究CXCL16驱动的CD4+ T细胞在MHC-I缺陷肝肿瘤中的免疫监视作用 | 发现MHC-I缺失对肿瘤生长的影响具有情境依赖性,揭示CXCL16和CD4+ T细胞在抗MHC-I缺陷肿瘤免疫中的核心调控作用 | 主要基于小鼠模型,与人类肿瘤的差异可能需要进一步验证 | 阐明MHC-I缺失如何通过趋化因子CXCL16调控CD4+ T细胞介导的免疫监视,影响肿瘤生长 | MHC-I缺陷的肝癌细胞(Hepa1-6)及其他肿瘤细胞(MC38、AKR、LLC1) | 数字病理学 | 肝癌 | CRISPR/Cas9基因敲除,单细胞RNA测序,流式细胞术,ELISA | NA | 基因表达数据,免疫细胞表型数据 | 多种小鼠模型(皮下和原位移植瘤),具体样本量未明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 686 | 2026-05-21 |
Ferroptosis, orchestrated by GPX4 downregulation, serves as a critical mediator of neutrophil extracellular trap-driven pathology in hypoxic pulmonary edema
2026-05-11, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02331-0
PMID:42115527
|
研究论文 | 该研究探索了铁死亡(一种由GPX4下调调控的细胞死亡形式)在低氧条件下肺水肿发展中的作用,并揭示了其与中性粒细胞胞外陷阱(NET)形成的相互作用 | 首次阐明了低氧诱导的GPX4抑制通过促进铁死亡细胞死亡,进而驱动NET相关炎症的致病级联反应,将GPX4确定为预防高原肺水肿(HAPE)的关键治疗靶点 | 研究基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体临床样本中验证,且多组学分析可能遗漏某些组织特异性变化 | 探究铁死亡在高原肺水肿(HAPE)低氧条件下的贡献,特别是GPX4与NET形成的相互作用 | 小鼠高原低氧模型和体外低氧/复氧模型中的肺组织及人肺微血管内皮细胞 | 机器学习 | 呼吸系统疾病 | 转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 小鼠模型和体外细胞模型,具体样本数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 687 | 2026-05-21 |
Super-enhancer-driven TCF4 orchestrates neuroblastoma metastasis by sphingolipid-dependent membrane remodeling and ITGB1-FAK activation
2026-May-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag021
PMID:41630015
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research paper | 本文揭示了超级增强子驱动的TCF4通过鞘脂依赖性膜重塑和ITGB1-FAK激活调控神经母细胞瘤转移的分子机制 | 首次发现超级增强子驱动的转录因子TCF4在神经母细胞瘤转移中的核心作用,并阐明其通过调控鞘脂代谢和膜重塑激活ITGB1-FAK信号通路的新机制,同时提出HDAC6抑制剂ACY-1215作为潜在治疗药物 | NA | 鉴定神经母细胞瘤转移中超级增强子驱动的转录因子并探索潜在靶向药物 | 神经母细胞瘤细胞及其转移机制 | machine learning | 神经母细胞瘤 | ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, CUT&Tag, 转录组测序 | NA | 基因表达数据, 染色质免疫沉淀测序数据 | NA | Illumina | 单细胞RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 688 | 2026-05-21 |
NAD(P)H: quinone oxidoreductase 1-mediated oxidative stress resistance and tumor microenvironment remodeling in glioblastoma
2026-May-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag015
PMID:41738493
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研究论文 | 本研究揭示NQO1在胶质母细胞瘤干细胞中高表达,通过调控ROS水平维持细胞稳定性并抑制cGAS-I型干扰素信号,重塑免疫抑制性肿瘤微环境 | 首次发现NQO1通过维持核Lamin B1稳定性调控cGAS-I型干扰素信号,连接氧化应激与免疫抑制微环境重塑,并验证NRF2对NQO1的转录调控 | 未明确提及临床样本验证及长期治疗安全性评估 | 阐明NQO1在胶质母细胞瘤抗氧化应激及免疫微环境重塑中的作用机制 | 胶质母细胞瘤干细胞(GSCs)及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 蛋白质组学, ChIP-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | 患者来源胶质母细胞瘤干细胞及异种移植小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序技术用于分析肿瘤微环境细胞异质性 |
| 689 | 2026-05-21 |
PSGRN: Gene regulatory network inference from single-cell perturbational data through self-training with synthetic gold standards
2026-May, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb3376
PMID:42054465
|
研究论文 | 提出了一种名为PSGRN的方法,通过自训练框架结合合成金标准,从单细胞扰动数据中推断基因调控网络 | 首次将自训练框架与合成金标准结合,充分利用单细胞扰动数据中的干预信息,在CausalBench挑战中表现最佳 | NA | 开发一种能从单细胞扰动数据中准确推断基因调控网络的鲁棒方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自训练框架 | 单细胞扰动数据 | 8个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 690 | 2026-05-21 |
Exceptional Longevity Modifying Allele APOE2 Promotes DNA Signaling Pathways Resisting Cellular Senescence in Human Neurons
2026-05, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70494
PMID:42103698
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研究论文 | 本研究通过人类同基因APOE iPSC衍生模型和APOE2靶向替换小鼠,揭示APOE2等位基因通过促进DNA修复和抑制细胞衰老机制赋予神经保护作用,解释其与卓越长寿及阿尔茨海默病抵抗的关联 | 首次从DNA修复和衰老抑制角度阐明APOE2对神经元的保护机制,并通过单细胞RNA测序揭示APOE4特异性基因表达特征与重复核糖体RNA增加导致的衰老关联 | 未提及 | 探究APOE2等位基因如何促进神经元长寿并发挥神经保护作用 | 人类同基因APOE iPSC衍生抑制性GABA能神经元和兴奋性神经元,以及APOE2靶向替换小鼠 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类同基因APOE iPSC衍生神经元模型及小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 691 | 2026-05-21 |
Inflammation-Driven Lymphoid Structures: Organization, Function, and Clinical Impact Across Autoimmunity, Cancer, and Checkpoint Toxicity
2026-May, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.70127
PMID:42144723
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综述 | 本文提出一个框架区分炎症驱动淋巴样结构与成熟三级淋巴样结构,探讨它们在自身免疫、癌症和检查点毒性中的组织、功能及临床影响 | 提出了炎症性淋巴样结构与成熟三级淋巴样结构的区分框架,强调淋巴样结构作为异质性免疫微环境而非二元分类的新视角 | 未提及具体局限性 | 阐明淋巴样结构在不同疾病背景下的形成机制、功能异质性和临床意义 | 自身免疫性疾病、癌症、移植、免疫相关不良事件及衰老过程中的淋巴样结构 | 机器学习 | 自身免疫性疾病, 癌症, 移植排斥, 老年病 | NA | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 692 | 2026-05-21 |
Transcriptional Profiling at Single-Cell Resolution Reveals Diversity and Regulatory Networks of Primary and Secondary Senescent Cells
2026-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70540
PMID:42148795
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析原代和次代衰老细胞的转录多样性及调控网络 | 首次在单细胞分辨率下系统比较原代和次代衰老细胞的转录谱差异,揭示其不同的终末簇及共享的应激反应模块,并鉴定亚型特异性基因和候选转录调控因子 | 仅以人类肾上皮细胞为模型,可能无法完全代表其他组织类型中衰老细胞的异质性;依赖体外培养体系,体内衰老过程的复杂性未涉及 | 探究原代和次代衰老细胞在单细胞水平的转录组异质性及调控机制 | 人类肾上皮细胞的原代和次代衰老模型 | 单细胞转录组学 | 肾脏衰老及相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类肾上皮细胞的原代和次代衰老模型样本,具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium(推断) | NA |
| 693 | 2026-05-20 |
Myeloid Mas drives pyruvate kinase M2-mediated Spi1 lactylation to fuel inflammatory senescence in MASLD
2026-May-19, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02704-6
PMID:42151117
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研究论文 | 揭示了髓系Mas通过驱动丙酮酸激酶M2介导的Spi1乳酰化促进MASLD炎症性衰老的机制 | 首次发现G蛋白偶联受体Mas作为MASLD的代谢检查点,并通过Mas-PKM2-Spi1乳酰化轴调控糖酵解重编程和单核前体细胞分化 | 未提及具体局限性 | 阐明免疫代谢与MASLD疾病进展之间的精确机制 | MASLD患者及饮食诱导小鼠模型的肝髓系细胞 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者肝组织样本及饮食诱导小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 694 | 2026-05-20 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal an arachidonic acid-related cellular atlas in lung adenocarcinoma
2026-May-19, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02251-4
PMID:42151495
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学揭示肺腺癌中花生四烯酸相关的细胞图谱 | 整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,首次在肺腺癌中系统探索花生四烯酸代谢相关的关键生物标志物及其在肿瘤微环境中的作用 | 未明确说明局限性 | 探究肺腺癌中花生四烯酸代谢的关键生物标志物及其在肿瘤微环境中的调控机制 | 肺腺癌组织中的肿瘤细胞、T细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 695 | 2026-05-20 |
Basal cell subsets, as biomarker to predict the therapeutic effect of neoadjuvant therapy for esophageal carcinoma
2026-May-19, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-026-06503-y
PMID:42151650
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research paper | 通过单细胞RNA测序分析食管癌新辅助治疗中基底细胞亚群作为疗效预测的生物标志物 | 首次发现基底细胞亚群Basal3、Basal8与病理完全缓解相关,Basal7与不完全病理反应相关,并识别了ATF3和JUN基因对生存的影响 | 样本量较小(仅22例患者),且包含多数食管鳞癌和1例腺鳞癌,统计结果代表性有限 | 探索食管癌新辅助治疗疗效预测的生物标志物 | 来自22例II-IV期接受新辅助化免疫治疗的食管癌患者的肿瘤及配对邻近组织 | 数字病理学 | 食管癌 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 22例食管癌患者(21例食管鳞癌,1例食管腺鳞癌) | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 696 | 2026-05-20 |
Decoding circulating neutrophil phenotypes in triple-negative breast cancer via optimized single-cell RNA sequencing
2026-May-19, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04345-8
PMID:42154046
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研究论文 | 通过优化的单细胞RNA测序解码三阴性乳腺癌中循环中性粒细胞的表型 | 开发了基于两个中性粒细胞标记基因面板和排除非中性粒细胞标记基因的稳健分析框架,实现了对单细胞数据中中性粒细胞的精准鉴定与功能表征 | 研究样本量较小(仅6名TNBC患者和6名对照),且中性粒细胞分离数量有限(TNBC组84个,对照组128个),可能限制结果的普适性 | 表征三阴性乳腺癌患者循环中性粒细胞的转录组差异,探究肿瘤对免疫细胞的影响机制 | 三阴性乳腺癌患者和非恶性供体的循环中性粒细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12例样本(6例TNBC患者和6例非恶性供体),共分离212个中性粒细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 697 | 2026-05-20 |
Multiscale domain identification for spatial transcriptomics via persistent homology
2026-May-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101376
PMID:41916308
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研究论文 | 利用持续同调方法对空间转录组数据进行多尺度域识别 | 首次将拓扑数据分析中的持续同调方法应用于空间转录组的多尺度域识别,解决了传统聚类方法仅能识别单一形态尺度域、忽略多尺度交互的问题 | 未对计算效率进行详细评估,且方法在异构区域与同质域之间的边界识别能力有待进一步验证 | 开发一种基于持续同调的多尺度空间域识别方法,以捕捉跨形态尺度的组织结构 | 空间转录组数据中的空间域 | 数字病理学, 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 持续同调 | 基因表达数据 | 多组织类型与空间转录组技术的数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 698 | 2026-05-20 |
Decoding spatial transcriptomics across multicellular and subcellular resolutions
2026-May-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72872-0
PMID:42151140
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研究论文 | 提出STARS方法,利用Vision Transformer和对比学习,从多细胞和亚细胞分辨率空间转录组数据中重建单细胞水平基因表达 | 首次实现跨多细胞和亚细胞分辨率空间转录组平台的单细胞水平基因表达重建,结合组织学图像和转录组数据 | 未明确指出局限性 | 开发能准确从多细胞和亚细胞分辨率空间转录组数据中分解或聚合信号至单细胞水平的方法 | 小鼠肺组织、结直肠癌组织中的细胞类型,包括免疫细胞和成纤维细胞等 | 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 | 结直肠癌, 流感感染, 细菌继发感染 | 空间转录组学 | Vision Transformer, 对比学习 | 图像, 转录组数据 | 小鼠肺组织(3个平台:Visium、Visium HD、Stereo-seq)及额外公共数据集 | 10x Genomics, BGI | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Visium HD, BGI Stereo-seq | 10x Visium多细胞分辨率平台, 10x Visium HD亚细胞分辨率平台, BGI Stereo-seq亚细胞分辨率平台 |
| 699 | 2026-05-20 |
Identification of diagnostic and therapeutic roles of programmed cell death-related proteins in dilated cardiomyopathy: a multi-omics and experimental validation study
2026-May-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-52624-2
PMID:42151293
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研究论文 | 通过多组学整合分析与实验验证,识别与程序性细胞死亡相关的扩张型心肌病的诊断和治疗分子特征 | 首次结合批量与单细胞RNA测序数据,利用六种机器学习算法构建基于程序性细胞死亡相关核心基因的预测模型,并鉴定两种具有不同免疫代谢特征的分子亚型 | 多数转录组数据集代表晚期疾病状态,发现可能反映心脏重塑的共同分子特征而非早期疾病特异性机制 | 揭示程序性细胞死亡在扩张型心肌病中的诊断和治疗潜力 | 扩张型心肌病患者和动物模型的心肌组织样本 | 机器学习 | 扩张型心肌病 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、差异基因表达分析、加权基因共表达网络分析、机器学习、分子对接 | 预测模型 | 转录组数据 | 五个独立队列 | NA | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 700 | 2026-05-20 |
Single-cell analysis reveals IL1B+ macrophages promote lung metastasis in adenoid cystic carcinoma
2026-May-16, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218590
PMID:42144099
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和批量转录组分析,结合多重免疫组化,揭示了IL1B+肿瘤相关巨噬细胞在腺样囊性癌肺转移中的作用机制 | 首次鉴定了IL1B TAMs在肺转移中的双重作用:在原发性病灶中促进血管生成和细胞外基质重塑以协助肿瘤细胞入血,在转移灶中通过IL-1R1/ACKR1/SELP轴吸引肿瘤细胞定植,并诱导CD8 T细胞耗竭 | 小鼠模型与人类患者之间的差异可能影响结论的普适性,机制验证主要基于相关性分析,缺乏直接的因果证据 | 探索腺样囊性癌肺转移的分子机制,特别是IL1B+肿瘤相关巨噬细胞的作用 | 腺样囊性癌患者的原发灶和肺转移灶样本,以及携带转移性ACC细胞的小鼠模型 | 单细胞生物学 | 腺样囊性癌 | 单细胞RNA测序,批量转录组分析,多重免疫组化,血浆细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据,批量转录组数据,组织切片图像,血浆样本数据 | ACC患者原发灶和肺转移灶组织样本(具体数量未在摘要中说明),以及小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |