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当前共找到 942 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2026-05-12 |
Single-nucleus transcriptome profiling unveils cell-type-specific ethylene and TOR signaling in tomato
2026-May, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhag044
PMID:42111481
|
研究论文 | 利用单核转录组图谱解析番茄黄化过程中细胞类型特异的乙烯和TOR信号调控机制 | 首次在单核分辨率下整合乙烯和TOR信号通路对番茄黄化过程的调控，并鉴定出表皮细胞中JA1转录因子作为乙烯负调控因子 | 未在摘要中说明实验重复次数或统计验证的详细方法 | 阐明番茄黄化过程中乙烯和TOR信号通路的细胞类型特异性调控机制 | 番茄幼苗的黄化顶钩和下胚轴组织 | 植物单细胞转录组学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 单核转录组表达谱 | 117,929个细胞核，来自三种处理（ACC、Torin2、对照）的顶钩和下胚轴组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 682 | 2026-05-12 |
Ginsenosides exhibit potential therapeutic potential in photoaging by regulating keratinocyte ferroptosis
2026-May, Journal of ginseng research
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.jgr.2025.11.002
PMID:42112127
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研究论文 | 本研究探讨人参皂苷通过调节角质细胞铁死亡来缓解皮肤光老化的潜在治疗机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示UVB照射后角质细胞铁死亡信号变化，并发现人参皂苷C-K和C-Mc靶向铁死亡调节蛋白SLC7A11/GPX4轴和HMGB1表达的机制 | 尚未提及具体研究局限，但可能包含动物模型与人体差异、样本量有限、机制细节未完全阐明等 | 探索人参皂苷调节角质细胞铁死亡在皮肤光老化治疗中的作用机制 | 小鼠UVB照射后的皮肤组织及培养的角质细胞 | 分子生物学与皮肤药理学 | 皮肤光老化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子对接、Western blot、RT-qPCR、斑马鱼胚胎毒性实验 | NA（未明确使用特定深度学习模型） | 基因表达数据 | 小鼠皮肤组织样本（具体数量未给出）及斑马鱼胚胎样本 | NA（未明确平台公司） | 单细胞RNA测序 | NA（未明确具体平台或试剂盒） | NA（未提供具体平台配置细节） |
| 683 | 2026-05-10 |
Identification of circadian rhythm-related biomarkers and development of diagnostic models for Crohn's disease using machine learning algorithms
2026-May, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2453922
PMID:39836385
|
研究论文 | 利用机器学习算法识别克罗恩病中与昼夜节律相关的生物标志物并构建诊断模型 | 首次将昼夜节律相关基因与克罗恩病诊断模型结合，利用单细胞测序验证基因表达谱 | 未明确指出样本量和外部验证的局限性 | 识别克罗恩病中与昼夜节律相关的生物标志物并开发诊断模型 | 克罗恩病患者与对照组的基因表达数据 | 机器学习 | 克罗恩病 | 基因表达芯片、单细胞测序 | 机器学习算法（具体类型未明确） | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 684 | 2026-05-10 |
The construction of a breast cancer prognostic model by combining genes related to hypoxia and endoplasmic reticulum stress
2026-May, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2453941
PMID:39868728
|
研究论文 | 结合缺氧和内质网应激相关基因构建乳腺癌预后模型 | 首次将缺氧和内质网应激相关基因结合构建乳腺癌预后模型，并分析了免疫浸润和药物敏感性 | NA | 利用缺氧和内质网应激相关基因预测乳腺癌患者预后 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞测序 | Cox回归, Lasso回归 | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 685 | 2026-05-10 |
GZMK+CD8+ T cells target a specific acinar cell type in Sjögren's disease
2026-May, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.08.014
PMID:41162286
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学及空间免疫表型分析，揭示干燥综合征中GZMK+CD8+ T细胞靶向特定腺泡细胞类型及其致病机制 | 首次发现PRR4+CST3+WFDC2-浆黏液性腺泡细胞在干燥综合征中选择性丢失，并揭示了GZMK+CD8+ T细胞通过亚胞溶解效应机制损害线粒体完整性和激活先天免疫信号 | 研究仅限于唾液腺组织，可能不适用于其他外分泌腺体；体外实验可能无法完全反映体内复杂微环境 | 探究干燥综合征中唾液腺内不同细胞类型的相互作用及其在病理过程中的角色 | 人类小唾液腺组织样本，包括干燥综合征患者和非患者 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 干燥综合征患者和对照组的唾液腺样本（具体数量未在摘要中明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium用于单细胞测序，10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 686 | 2026-05-10 |
The transcriptome of CD14+CD163-HLA-DRlow monocytes predicts mortality in idiopathic pulmonary fibrosis
2026-May, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00804-2025
PMID:41360505
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的转录组，预测特发性肺纤维化患者的死亡率 | 首次发现CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的转录组特征可预测特发性肺纤维化患者的死亡风险，并识别出潜在的药物靶点 | 研究基于样本量有限（n=1054），且未在更大规模独立队列中验证；基因评分与功能的因果关系需进一步实验验证 | 探究免疫细胞特异性转录组特征与特发性肺纤维化死亡率之间的关联 | 特发性肺纤维化患者、健康对照及其他肺部疾病患者 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、细胞反卷积分析 | LASSO回归 | 单细胞转录组数据、临床随访数据 | 1054例样本（特发性肺纤维化555例，其他499例） | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 未明确提及，可能基于10x Genomics平台，但文中仅描述scRNA-seq |
| 687 | 2026-05-10 |
Agonistic GITR treatment enhances antitumor immune responses and suppresses tumor progression in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-May, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02347-y
PMID:41620983
|
研究论文 | 通过GITR激动剂治疗增强胰腺导管腺癌的抗肿瘤免疫反应并抑制肿瘤进展 | 首次在胰腺导管腺癌中证实GITR激活可减少调节性T细胞并增加细胞毒性效应细胞，结合常规化疗可能改善患者预后 | 主要基于小鼠模型和有限的人类样本，临床转化需进一步验证 | 探索GITR作为胰腺导管腺癌免疫治疗靶点的潜力及其机制 | 胰腺导管腺癌细胞、肿瘤微环境中的淋巴细胞 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 小鼠Pan02模型及人类手术切除样本（包括未治疗和新辅助化疗患者） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium空间转录组学 |
| 688 | 2026-05-10 |
Multi-Scale Mapping of Gene Expression from Whole-slide Images for Identifying Phenotype-Associated Subpopulations
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521151
PMID:41736695
|
研究论文 | 提出BiSCALE框架，从全切片图像预测组织和近细胞水平的基因表达，并关联临床表型 | 首次实现从全切片图像到组织和近细胞水平的双重尺度基因表达预测，结合Vision-Mamba融合模块和两阶段训练策略，解决了尺度和分布差异 | 仅基于三种癌症类型训练和验证，泛化性需进一步验证；近细胞分辨率仍受限于空间转录组数据质量 | 开发一种经济高效的方法，从常规病理切片多尺度预测基因表达，识别表型相关亚群 | 肿瘤组织和微环境中的细胞亚群 | 数字病理学 | 癌症（三种类型） | NA | Vision-Mamba融合模块 | 图像（全切片图像） | 2109个批量肿瘤样本和141,000个空间转录组斑点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 689 | 2026-05-10 |
Single-cell transcriptomics unveils the immunologic landscape of anti-PD-1-associated indirect drug-induced liver injury
2026-May, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02370-z
PMID:41739156
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示抗PD-1相关间接药物性肝损伤的免疫学机制 | 首次构建了荷瘤小鼠模型中抗PD-1诱导肝损伤的肝脏微环境单细胞图谱，揭示了代谢重编程与促纤维化表型的伴随变化，并发现NETosis激活在肝损伤进展中的关键作用 | 主要在动物模型中验证，临床患者标本用于辅助验证，需要更多人类队列研究来确认发现 | 探索抗PD-1相关肝损伤的病理机制，特别是免疫细胞相互作用和分子通路 | Lewis肺腺癌小鼠模型（C57BL/6J小鼠）及患者肝组织标本 | 机器学习 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（数量未明确说明）及患者标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 690 | 2026-05-09 |
Maternal opioid use and hepatitis C infection disrupt the placental immune landscape and structure
2026-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199606
PMID:41842943
|
研究论文 | 利用空间和单细胞转录组学等技术揭示母体阿片类药物使用障碍和丙型肝炎感染对胎盘免疫景观和结构的影响 | 首次综合运用流式细胞术、组织学、空间和单细胞转录组学，系统研究母体阿片类药物使用障碍对胎盘结构和功能的影响，并根据丙型肝炎感染状态进一步分层分析 | 未明确提及局限性 | 探究母体阿片类药物使用障碍对胎盘组织的影响及其潜在机制 | 胎盘组织 | 机器学习 | NA | 流式细胞术, 组织学, 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 691 | 2026-05-09 |
Focal adhesion proteins confer smooth muscle anoikis resistance and protection against aortic aneurysm and dissection
2026-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195291
PMID:41874580
|
研究论文 | 本研究探究黏着斑蛋白在平滑肌细胞失巢凋亡抵抗及防止主动脉瘤和夹层中的作用 | 发现黏着斑蛋白（如FAK、VCL、ILK）通过非激酶活性依赖的方式保护平滑肌细胞免受失巢凋亡，从而抑制胸主动脉瘤和夹层进展 | 主要基于小鼠模型和体外实验，需进一步验证人类患者中的机制 | 明确平滑肌细胞黏着斑蛋白在胸主动脉瘤和夹层发病机制中的功能 | 人类胸主动脉瘤样本、平滑肌细胞特异性Ptk2、Vcl和Ilk基因敲除小鼠 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，小鼠模型，免疫印迹，细胞凋亡检测 | NA | 基因表达数据，组织病理图像 | 人类胸主动脉瘤样本及基因敲除小鼠队列 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序分析人类TAA主动脉样本 |
| 692 | 2026-05-09 |
Distinct single-cell cellular states and ecosystems linked to HPV status distinguish therapeutic vulnerability of head and neck squamous cell carcinoma
2026-May-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10213-z
PMID:42098219
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research paper | 使用EcoTyper框架分析HPV感染对头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境中细胞状态和生态系统的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示HPV相关HNSCC中46种独特细胞状态和生态型，并关联预后与药物敏感性 | 尚未验证细胞状态在更大样本队列中的临床可重复性及机制细节 | 阐明HPV感染如何塑造HNSCC肿瘤微环境的细胞异质性和生态系统 | HPV阳性和阴性头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间基因表达 |
| 693 | 2026-05-09 |
Spatial transcriptomics defines IM-crypt as a premalignant niche with bidirectional divergence in early gastric carcinogenesis
2026-May-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10179-y
PMID:42098407
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研究论文 | 利用空间转录组学定义IM隐窝为早期胃癌发生过程中具有双向分化的癌前微环境 | 首次通过空间转录组学在人类胃组织疾病进展过程中识别出OLFM4阳性过渡亚群，揭示了肠化生隐窝作为癌前微环境且具有向不同肠分化程序的双向转录轨迹，并发现USF2相关调控网络在隐窝和癌症区域的共享活性 | 未明确说明局限性 | 阐明早期胃癌发生过程中恶性转化和亚型分化的空间起源 | 人类胃组织样本，涵盖从胃炎、肠化生到早期胃癌的疾病进展阶段 | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 涵盖疾病进展的不同阶段的人类胃组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间基因表达平台 |
| 694 | 2026-05-09 |
10 × Genomics Flex Gene Expression is a powerful tool for single-cell transcriptomics of xenografts models
2026-May-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04092-0
PMID:42098734
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研究论文 | 该研究展示了10× Genomics Flex基因表达方案能有效分析异种移植模型中的单细胞转录组，通过组合人源和鼠源探针实现物种特异的细胞图谱 | 首次证明在单次反应中同时使用人鼠两种探针集可对混合细胞异种移植样本进行单细胞转录组分析，无需流式分选即可获得干净的物种特异性数据 | NA | 验证10× Genomics Flex基因表达方案在异种移植模型单细胞转录组研究中的适用性 | 异种移植样本中的人源和鼠源混合细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Flex | 10× Genomics Flex基因表达方案，基于探针的固定或冷冻样本处理方法 |
| 695 | 2026-05-09 |
Cross-Species Plant Single-Cell Analysis: Community Challenges and Shared Solutions
2026-May-08, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag218
PMID:42099283
|
综述 | 报告了2025年植物单细胞分析暑期研讨会的成果，包括社区面临的挑战和解决方案，并建立了PlantSCHub社区门户以支持可重复的植物单细胞分析 | 通过研讨会形式系统梳理植物单细胞分析的五大优先挑战领域，并提出跨物种整合、多模态轨迹与基因调控网络推断、空间锚定可视化以及AI科学家代理等概念路线图 | 未具体说明局限性 | 推动植物单细胞分析领域从孤立研究转变为互操作、不断发展的生态系统，加速发现和作物改良 | 植物单细胞分析社区的需求和解决方案 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | 深度生成模型, AI基础模型 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 696 | 2026-05-09 |
EssentCell: Discovering Essential Evolutionary Relations in Noisy Single-Cell Data
2026-May-07, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3691222
PMID:42096398
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研究论文 | 提出EssentCell算法，通过整数线性规划识别噪声单细胞数据中所有最优进化关系中的本质关系 | 首次关注单细胞测序数据中多个最优完美系统发育树间的本质关系，而非仅重建单一树 | 未明确讨论算法在大规模数据集上的计算效率及对噪声水平的鲁棒性 | 在考虑假阳性率约束下，从噪声单细胞数据矩阵中寻找最小翻转问题的最优解中的本质进化关系 | 肿瘤细胞单细胞测序数据中的突变矩阵 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序 | 整数线性规划 | 二元突变矩阵 | 多个数据集（具体样本量未说明） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 697 | 2026-05-09 |
TranscriptFormer: A generative cell atlas across 1.5 billion years of evolution
2026-May-07, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aec8514
PMID:42096520
|
研究论文 | 开发了名为TranscriptFormer的生成式基础模型，基于多达1.12亿个细胞、跨越12个物种（涵盖15.3亿年进化历程）进行训练，实现了跨物种细胞类型分类、零样本疾病状态识别以及系统发育关系的自然涌现 | 首次训练跨越15.3亿年进化历程的跨物种单细胞基础模型，零样本识别人类疾病状态，且在不依赖显式训练的情况下从表示中自然涌现发育轨迹与系统发育关系 | 未提及具体限制 | 建立跨物种单细胞转录组定量分析与比较细胞生物学的通用框架 | 12个物种的细胞（跨越15.3亿年进化历程） | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 生成式基础模型（Transformer架构的变体） | 基因表达数据 | 1.12亿个细胞，12个物种 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 698 | 2026-05-09 |
SCOTCH: isoform-level characterization of gene expression through long-read single-cell RNA sequencing
2026-May-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72665-5
PMID:42098110
|
研究论文 | 提出了SCOTCH，一个端到端、平台无关的分析流程，用于从长读长单细胞RNA测序数据中进行异构体表征 | 通过非重叠子外显子组合建模、动态阈值分配、整合读段覆盖与现有注释优化子外显子边界以及迭代聚类重构新转录本，比现有拼接图方法更可靠地恢复真实新异构体，并具有poly(A)感知过滤减少假阳性 | NA | 开发一种从长读长单细胞RNA测序数据中进行异构体表征的平台无关流程 | 人类血液和脑类器官数据集中的细胞类型特异性转录组谱和新异构体 | 计算生物学 | NA | 长读长单细胞RNA测序（lr-scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 多平台人类血液和脑类器官数据集 | 牛津纳米孔科技（ONT）, 太平洋生物科学（PacBio）, 10x Genomics, Parse Biosciences, BGI | 单细胞RNA测序 | 纳米孔测序仪（MinION, PromethION）, PacBio测序仪（Sequel, Revio）, 10x Chromium, Parse Biosciences分区生物试剂盒 | NA |
| 699 | 2026-05-09 |
Refinement of renal T lymphocytes enrichment strategies: advancing the in-depth study of renal immune responses
2026-May-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-51954-5
PMID:42098282
|
研究论文 | 优化从小鼠和人类肾脏中分离和纯化T淋巴细胞的方案，以提高细胞产量和存活率，并应用于肾脏疾病研究 | 首次系统评估不同组织破碎、酶消化和Percoll梯度离心条件，优化出机械剪切结合0.2% IV型胶原酶和0.02% DNase I消化45分钟，再经33-80% Percoll梯度离心的高效方案 | 该方案主要基于小鼠和人类肾脏组织，对不同物种或病理条件下的适用性需进一步验证；单细胞测序分析仅使用公共数据库数据，未进行独立验证 | 建立优化的肾脏T淋巴细胞分离纯化方案，支持肾脏免疫反应的深入研究 | 小鼠和人类肾脏组织中的T淋巴细胞，包括CD4 T细胞、CD8 T细胞和双阴性T细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | 小鼠肾脏组织（缺血再灌注损伤、肾纤维化、顺铂诱导急性肾损伤模型）及正常人类肾脏组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 公共单细胞RNA-seq数据作为补充参考 |
| 700 | 2026-05-09 |
NSUN6-Mediated m5C Modification of OAS2 Is Implicated in Neuronal PANoptosis during Perioperative Neurocognitive Disorders
2026-May-07, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-026-05770-7
PMID:42098355
|
研究论文 | 该研究通过多组学技术揭示NSUN6介导的OAS2 m5C修饰在围术期神经认知障碍神经元PANoptosis中的作用 | 首次发现PANoptosis在围术期神经认知障碍中的角色，并揭示NSUN6通过OAS2的m5C修饰调控神经元PANoptosis的新机制 | 未提及具体局限性 | 探究PANoptosis在围术期神经认知障碍中的作用及潜在机制 | 围术期神经认知障碍小鼠模型及神经元 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序, meRIP-seq, RNA-seq, 免疫荧光, TUNEL染色 | NA | 基因表达数据, 序列数据 | 小鼠模型（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序, 甲基化RNA免疫沉淀测序, 批量RNA测序 | NA | NA |