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当前共找到 987 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2026-05-27 |
Epithelial YPEL3 Modulates CD8+ T-Cell Infiltration and Tumor Progression Through CREB1-CXCL16 Signaling in HNSCC
2026-May-25, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70409
PMID:42186216
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研究论文 | 整合多组学数据揭示YPEL3通过CREB1-CXCL16信号轴调节头颈鳞癌中CD8阳性T细胞浸润与肿瘤进展 | 首次发现YPEL3在头颈鳞癌中作为肿瘤抑制因子，通过CREB1而非TFAP2C调控CXCL16表达，建立上皮分化状态与抗肿瘤免疫之间的分子联系 | 未提及 | 探究YPEL3在头颈鳞癌中的表达、预后价值及免疫调节机制 | 头颈鳞癌患者肿瘤组织及细胞系，包括上皮细胞和CD8阳性T细胞 | 机器学习，数字病理学 | 头颈鳞癌 | 转录组测序，DNA甲基化测序，单细胞RNA测序，功能实验 | NA | 转录组数据，DNA甲基化数据，单细胞RNA测序数据，临床病理数据 | 来自TCGA/GEO数据库的多中心HNSCC队列，具体样本量未提及 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序使用10x Genomics平台，具体配置未详细说明 |
| 662 | 2026-05-27 |
Enhancing cell type annotation for cancer transcriptomics using retrieval-augmented generation
2026-May-20, Cancer genetics
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.cancergen.2026.05.002
PMID:42184649
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研究论文 | 本研究开发了一种基于检索增强生成的框架，用于提高癌症转录组学中细胞类型注释的准确性和可重复性 | 提出混合词汇-语义信息检索与本体感知评估的集成方法，结合查询扩展、释义和轻量级重排序来优化语义相关性，并通过细胞本体论确保生物学有效性 | 未提及框架在除人类组织外的其他物种或大规模数据集上的性能，也未讨论计算资源需求 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的稳定性和可重复性 | 来自不同人类组织的九个公开单细胞RNA测序数据集 | 自然语言处理 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 检索增强生成模型 | 文本（单细胞基因表达数据及细胞注释结果） | 9个人类组织单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 663 | 2026-05-27 |
Charting spatial ligand-target activity using Renoir
2026-05-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72388-7
PMID:42086556
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研究论文 | 提出Renoir方法，用于在空间转录组数据中绘制配体-靶基因活性图谱，揭示组织微环境中的细胞间通讯 | 首次实现空间拓扑上配体-靶基因活性映射，能解析特定空间生态位中的配体-下游靶标关系，并识别具有不同配体-靶标相互作用的细胞生态位 | 未提及具体局限性 | 开发一种方法以在空间转录组数据中推断配体对下游靶基因的影响，并识别特定空间生态位中的细胞间相互作用 | 发育到疾病状态的各种空间转录组数据集，包括胎儿肝脏和肝细胞癌组织 | 计算机视觉, 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 多个空间转录组数据集，涵盖不同分辨率和发育阶段至疾病状态 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 664 | 2026-05-27 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify immune-stromal interactions in cardiac allograft vasculopathy
2026-May, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00813-7
PMID:42151633
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学整合分析，鉴定心脏同种异体移植血管病变（CAV）中免疫-基质细胞相互作用 | 首次在人体冠状动脉中结合单细胞RNA测序和空间转录组学，全面刻画CAV新内膜微环境，并发现IFN信号作为潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性 | 阐明心脏同种异体移植血管病变（CAV）的关键细胞和分子机制 | 人体冠状动脉组织和CAV小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 包括CAV、动脉粥样硬化性冠状动脉疾病和非疾病对照的人体冠状动脉组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 单细胞RNA测序和空间转录组学平台，用于分析人体冠状动脉组织 |
| 665 | 2026-05-27 |
Single-cell transcriptomics reveals lateral transfers of multiple functional genes from prokaryotes to free-living ciliated protists in detrital food webs
2026-May, Marine life science & technology
IF:5.8Q1
DOI:10.1007/s42995-026-00382-5
PMID:42186547
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了自由生活的原生生物在碎屑食物网中通过水平基因转移从原核生物获取多个功能性基因的机制 | 首次在自由生活的厌氧纤毛虫APM类群中基于单细胞转录组进行全基因组水平基因转移筛选，发现63个候选原核水平转移基因，其中多个形成降解复杂有机物的互联通路，并首次记录CPR细菌到真核生物的水平转移事件 | 研究基于有限的数据集（9种APM纤毛虫的36个组学数据集），且候选基因的功能预测主要依赖生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索侧向基因转移在自由生活的原生生物厌氧环境适应中的进化意义和生态角色 | 9种土壤/沉积物中的APM纤毛虫（包括Armophorea、Muranotrichea和Parablepharismea类群） | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 文本 | 36个组学数据集，涵盖9种APM纤毛虫 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 666 | 2026-05-21 |
Corrigendum to: Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals endoplasmic reticulum stress-related CAF subpopulations associated with chordoma progression
2026-May-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf159
PMID:40719554
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 667 | 2026-05-21 |
Macrophage-Fibroblast Crosstalk Shapes Wound Repair Signaling In Vitro
2026-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202601156R
PMID:42149092
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研究论文 | 利用体外2D和3D伤口愈合模型结合活细胞钙成像和单细胞RNA测序，研究巨噬细胞与成纤维细胞之间的接触依赖性和旁分泌互作机制 | 揭示了接触依赖性钙信号和连接蛋白信号与转录重塑的整合如何协调巨噬细胞-成纤维细胞行为，特别是发现连接蛋白Cx43介导的细胞-细胞接触增强巨噬细胞IL10生成并抑制TNFα分泌 | 研究仅基于体外模型，尚未在体内伤口愈合环境中验证相关信号通路 | 阐明巨噬细胞与成纤维细胞之间接触依赖性信号如何与旁分泌通路整合以调控伤口愈合过程中的相互行为 | 骨髓来源巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序、活细胞钙成像 | NA | 基因表达数据、钙成像数据 | 使用骨髓来源巨噬细胞和成纤维细胞进行体外实验，未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 668 | 2026-05-21 |
Contrastive graph regularized non-negative matrix factorization for domain identification of spatial transcriptomics
2026-May-20, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2025.0424
PMID:42159088
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研究论文 | 提出对比图正则化非负矩阵分解模型用于空间转录组学的域识别，实现可解释的降维和空间结构保留 | 首次将对比学习与图正则化非负矩阵分解相结合，通过构建正负样本对同时利用基因表达相似性和空间邻近性，增强特征表示和空间结构保留，提升模型的可解释性 | 未提及局限性，但可能依赖于高质量空间转录组数据，且对比学习框架的计算复杂度较高 | 开发一种可解释的降维方法，用于空间转录组学中的空间域自动识别和生物学相关区域发现 | 空间转录组学数据中的空间域和生物功能区域 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 三个公开空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 669 | 2026-05-21 |
Decoding the breast cancer microenvironment by spatial multi-omics: from architecture to clinical translation
2026-May-20, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-026-04398-2
PMID:42159876
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综述 | 通过空间多组学技术解码乳腺癌微环境，从结构到临床转化的全面综述 | 综合讨论空间转录组学、空间蛋白质组学和新兴代谢组学在乳腺癌微环境中的应用，强调从静态分子清单向高分辨率空间图谱的转变，并构建基于肿瘤-免疫界面距离的预后模型 | 多模态数据整合、批次效应、高成本以及临床实施中缺乏标准化方案 | 评估空间多组学技术在乳腺癌研究中的进展、挑战及临床转化潜力 | 乳腺癌肿瘤微环境，包括肿瘤细胞异质性、基质细胞亚型、免疫细胞拓扑结构和三级淋巴结构 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 代谢组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 670 | 2026-05-21 |
Senescent-like neutrophils shape angiogenic immunosuppressive niches in colorectal cancer liver metastasis
2026-May-19, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-0820
PMID:42154581
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间增强分辨率组学测序揭示结直肠癌肝转移中肿瘤相关中性粒细胞的转录组图谱，并发现衰老样中性粒细胞通过促进血管生成和招募免疫抑制巨噬细胞形成免疫抑制微环境 | 首次在单细胞和空间水平系统描绘结直肠癌肝转移中肿瘤相关中性粒细胞的转录图谱，并鉴定出以糖酵解特征和衰老表型为特征的终末分化促肿瘤中性粒细胞亚群（TAN1），揭示BHLHE40在葡萄糖剥夺驱动的TAN1生成中的关键作用 | 未提及明显局限性 | 阐明结直肠癌肝转移中肿瘤相关中性粒细胞的异质性和功能 | 结直肠癌肝转移肿瘤组织中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序，空间增强分辨率组学测序 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 结直肠癌肝转移患者样本（具体数量未提及） | 10x Genomics，华大基因 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium，华大基因Stereo-seq | 10x Chromium单细胞RNA测序，华大基因Stereo-seq空间转录组学 |
| 671 | 2026-05-21 |
Stem cell activity is linked to a transient acquisition of pluripotency during callus proliferation
2026-May-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73124-x
PMID:42156391
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析，揭示愈伤组织形成过程中多能性获得是短暂的，并由WOX5-TAA1模块的干细胞活性调控 | 首次发现愈伤组织多能性获得是短暂的，并识别出WOX5-TAA1模块在干细胞活性中的关键作用，以及愈伤组织发育的连续程序 | 未说明 | 研究植物体细胞重编程过程中多能性获得的动态机制 | 拟南芥的愈伤组织细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 多能性和非多能性愈伤组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 672 | 2026-05-21 |
E2F-mediated activation of mTORC1 through the ubiquitin-proteasome system promotes lung adenocarcinoma progression
2026-May-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08863-2
PMID:42156726
|
研究论文 | 通过整合TCGA/GEO数据集和单细胞RNA-seq数据，发现E2F8通过泛素-蛋白酶体系统激活mTORC1通路，促进肺腺癌进展 | 首次揭示E2F8通过转录激活E3连接酶WWP1，介导TSC1的K48连接多聚泛素化降解，从而维持mTORC1信号通路的分子机制，并鉴定出E2F8-WWP1-TSC1-mTORC1轴作为肺腺癌的可靶向调控回路 | 尚未明确E2F8在肺腺癌中上调的上游调控机制，以及该轴在其他肺癌亚型或临床样本中的验证 | 探究肺腺癌中mTORC1异常激活的分子机制及其与E2F转录因子的关联 | TCGA/GEO数据集中的肺腺癌样本、PC-9和H1975细胞系及异种移植瘤模型 | 分子生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、RNA-seq、免疫印迹、免疫组化 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | TCGA/GEO公共数据库肺腺癌样本及实验室单细胞RNA-seq样本（具体数量未明确提及） | Illumina | 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 用于单细胞RNA测序的Illumina平台（具体配置未详述） |
| 673 | 2026-05-21 |
Inferring stochastic dynamics by biophysical Neural ODE using single-cell transcriptomics
2026-May-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73257-z
PMID:42156756
|
研究论文 | 提出一种名为DynNet的深度学习方法，整合神经ODE与生物物理模型，从单细胞转录组数据推断随机动力学 | 将神经ODE与生物物理模型和基因表达动力学先验知识相结合，实现可解释的细胞命运随机动力学推断 | 主要依赖合成数据和有限实验数据验证，未见大规模临床应用或跨物种泛化性评估 | 开发从静态单细胞转录组数据推断细胞命运随机动力学的计算方法 | 合成数据及肝细胞分化、上皮间质转化（EMT）实验数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经ODE | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 674 | 2026-05-21 |
Depicting the dynamic transcriptional and epigenetic landscape of testis development in pubertal Simmental cattle
2026-May-18, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01406-x
PMID:42144636
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和单核ATAC测序揭示了青春期西门塔尔牛睾丸发育中的动态转录和表观遗传图谱 | 首次整合scRNA-seq和sNucATAC-seq技术系统解析青春期前后西门塔尔牛睾丸发育中生殖细胞命运转变的调控网络，并鉴定出跨物种保守的转录因子E2F1、BCLAF1和YY1 | 未明确提及样本量局限性或技术验证不足等限制 | 阐明牛睾丸发育中生殖细胞命运转变的调控机制 | 西门塔尔牛睾丸组织（出生后、青春期前和青春期三个阶段） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核ATAC测序（sNucATAC-seq） | NA | 基因表达数据、染色质开放性数据 | 西门塔尔牛睾丸组织样本覆盖三个发育阶段（出生后、青春期前、青春期） | NA | 单细胞RNA测序、单核ATAC测序 | NA | NA |
| 675 | 2026-05-21 |
Single-cell profiling and machine learning identify cuproptosis-related fibroblast subpopulations and fibrogenesis modulator AEBP1 in endometriosis
2026-05-18, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02342-x
PMID:42149287
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和机器学习，鉴定子宫内膜异位症中与铜死亡相关的成纤维细胞亚群和纤维化调节因子AEBP1 | 首次将铜死亡与子宫内膜异位症的成纤维细胞介导的纤维化进程关联，并利用机器学习和网络分析优先筛选出关键枢纽基因AEBP1 | 铜死亡相关分子机制与纤维化进展的因果关联仍需进一步验证，且目前仅限于体外和动物模型 | 阐明铜死亡在子宫内膜异位症成纤维细胞介导的纤维化进程中的作用 | 正常、在位和异位子宫内膜组织、子宫内膜基质细胞、子宫内膜异位症小鼠模型 | 单细胞分析、机器学习 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 正常、在位和异位子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 676 | 2026-05-21 |
PSD3 links autophagic flux to MHC-I-associated immune modulation in esophageal squamous cell carcinoma
2026-05-18, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02345-8
PMID:42149295
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研究论文 | PSD3连接食管鳞状细胞癌中的自噬通量与MHC-I相关免疫调控 | 首次发现PSD3在食管鳞状细胞癌中上调且与不良预后相关，并揭示其通过自噬通量调控MHC-I分子表达及免疫细胞浸润的机制 | 需要进一步研究明确通路层级和抗原呈递功能的关系 | 探究PSD3在食管鳞状细胞癌中连接自噬过程与免疫调控的分子机制 | 食管鳞状细胞癌组织、小鼠及人ESCC模型细胞（如KYSE150） | 机器学习 | 食管鳞状细胞癌 | 共免疫沉淀、蛋白质印迹、串联荧光LC3报告基因、免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 食管鳞状细胞癌组织样本及小鼠/人细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序试剂盒 |
| 677 | 2026-05-21 |
Selenium-GPX4 Axis Orchestrates Intestinal Arachidonic Acid Metabolic Reprogramming to Mitigate Inflammation
2026-May-18, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 通过小鼠模型和单细胞RNA测序，揭示硒-GPX4轴通过重编程肠道花生四烯酸代谢来缓解炎症的机制 | 首次阐明硒通过上调GPX4调控花生四烯酸代谢重编程以缓解肠道炎症的分子机制，并发现IEC-GPX4在调控oxylipin谱和巨噬细胞极化中的核心作用 | 未提及具体局限性 | 探究硒-GPX4轴在调控花生四烯酸代谢重编程中缓解肠道炎症的机制 | 脂多糖诱导和饮食AA喂养的小鼠模型，以及肠上皮细胞（IEC）-巨噬细胞共培养体系 | 数字病理学 | 肠道炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 基因敲除, 共培养实验 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 678 | 2026-05-21 |
Single-cell multi-omics analysis reveals two molecular subtypes of human male breast cancer with distinct neuroendocrine and immune characteristics
2026-May-16, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.05.041
PMID:42144060
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示人类男性乳腺癌的两种分子亚型，具有不同的神经内分泌和免疫特征 | 首次在单细胞分辨率下解析男性乳腺癌的分子亚型，发现神经内分泌状态与免疫微环境的关键关联，并鉴定出DLX2转录因子和NPY+/NPY1R+细胞通讯在神经内分泌特征中的调控作用 | 未指定 | 解析男性乳腺癌在单细胞水平的分子机制，为分子分型和新治疗策略提供依据 | 男性乳腺癌患者的多组学数据集 | 单细胞组学 | 男性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、成像质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据、蛋白质成像数据 | 未指定 | 未指定 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 未指定 | 未指定 |
| 679 | 2026-05-21 |
Fibroblast Heterogeneity in Colorectal Cancer: Insights from Integrative Single-Cell Transcriptomics
2026-May-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl260162
PMID:42137937
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 680 | 2026-05-21 |
Targeting CD74 may mitigate immune-escape features and enhance BCMA CAR-T activity in preclinical models of relapsed/refractory multiple myeloma
2026-May-14, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013255
PMID:42134899
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研究论文 | 本研究探讨了靶向CD74在复发/难治性多发性骨髓瘤中减轻免疫逃逸特征并增强BCMA CAR-T活性的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示BCMA CAR-T治疗后残留骨髓瘤细胞中CD74的上调，并验证靶向CD74可增强CAR-T疗效 | 未详细说明CD74抑制在临床样本中的长期效果及潜在副作用 | 阐明复发/难治性多发性骨髓瘤中免疫逃逸和CAR-T耐药性的分子机制，并探索CD74作为治疗靶点的可行性 | 复发/难治性多发性骨髓瘤患者的骨髓样本，以及体外和体内模型中的骨髓瘤细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 配对骨髓样本（治疗前后） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |