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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2026-05-31 |
Spatial multi-omics reveals region-specific redox dysregulation in chronic aristolochic acid I-induced nephrotoxicity
2026-May-27, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 整合空间代谢组学、空间转录组学和区域定量分析,揭示慢性马兜铃酸I暴露引起的肾脏区域特异性氧化还原失调 | 首次建立慢性AAN大鼠模型,结合空间代谢组学、空间转录组学与区域LC-MS/MS定量分析,阐明毒物累积与代谢功能障碍的空间关联 | 未提及 | 阐明慢性马兜铃酸I暴露引起的区域特异性代谢功能障碍及其与毒物累积的空间关系 | 慢性马兜铃酸肾病大鼠模型 | 数字病理学 | 肾病 | 空间代谢组学、空间转录组学、AFADESI-MSI、LC-MS/MS | NA | 代谢组学数据、转录组学数据 | 慢性AAN大鼠模型,12周口服AAI(1和10 mg/kg/天) | NA | 空间代谢组学、空间转录组学 | AFADESI-MSI | AFADESI-MSI用于空间代谢组学分析 |
| 582 | 2026-05-31 |
Single cell sequencing in acute myeloid leukemia: Linking genotype to functional phenotype for precision risk stratification and treatment decisions
2026-May-27, Human pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1016/j.humpath.2026.106174
PMID:42208774
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在急性髓系白血病中的应用,探讨其如何将基因型与功能表型联系起来,以实现精准风险分层和治疗决策 | 系统总结了单细胞多组学技术在解析AML克隆复杂性、区分残留白血病与克隆性造血方面的最新进展,并展望了空间单细胞技术对骨髓微环境研究的影响 | 未明确提及该领域当前的技术成本、数据整合复杂性及临床转化中的实际障碍 | 探讨单细胞测序技术如何改善AML的风险分层和治疗决策 | 急性髓系白血病(AML)的细胞、血液及骨髓样本 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组、表观基因组、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 583 | 2026-05-31 |
Asiaticoside alleviates mesothelial cell senescence and peritoneal fibrosis by targeting macrophage-mesothelial communication in single-cell peritoneal landscape
2026-May-23, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158339
PMID:42208108
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析,揭示积雪草苷通过调控巨噬细胞-间皮细胞通讯缓解间皮细胞衰老和腹膜纤维化的机制 | 首次在单细胞水平解析腹膜纤维化微环境中的细胞组成和细胞间通讯网络,并阐明积雪草苷通过IGF1信号通路抑制间皮细胞衰老的抗纤维化新机制 | 未提及在人类样本中的验证,也未探讨长期治疗的安全性 | 研究腹膜纤维化进展中腹膜细胞成分及其相互作用的变化,探索积雪草苷对抗腹膜纤维化的药理作用和潜在机制 | 小鼠腹膜纤维化模型及高糖腹膜透析液诱导的腹膜样本 | 数字病理学 | 腹膜纤维化、慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | 无特定模型 | 基因表达数据 | 57,032个单细胞,分为7种细胞类型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒用于单细胞RNA测序 |
| 584 | 2026-05-31 |
Integrative single-cell analysis reveals Bu-Shen-Huo-Xue Formula rescues iron-overloaded ovarian function via rewiring IFN-γ/JAK/STAT/CXCL10-driven immune-stromal interactions and BNIP3-mediated mitophagy in endometriosis
2026-May-23, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158343
PMID:42208103
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研究论文 | 通过整合单细胞分析揭示补肾活血方通过重编程IFN-γ/JAK/STAT/CXCL10驱动的免疫-基质相互作用和BNIP3介导的线粒体自噬,挽救子宫内膜异位症中铁超载的卵巢功能 | 首次利用整合单细胞RNA测序和Stereo-seq技术,从单细胞分辨率阐明补肾活血方通过双重机制——抑制铁超载诱导的免疫-纤维化微环境及恢复BNIP3-PINK1/Parkin依赖性线粒体自噬——改善卵巢子宫内膜异位症相关卵巢损伤和不孕症 | 未在人类样本中验证BNIP3靶向作用及毛蕊异黄酮苷的治疗潜力,缺乏长期生殖结局的随访数据,且未探讨其他潜在活性成分的协同效应 | 确定补肾活血方如何减轻卵巢子宫内膜异位症相关卵巢损伤和不孕,并识别关键生物活性成分及分子靶点 | 卵巢子宫内膜异位症小鼠模型 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, Stereo-seq, 血清药化学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 卵巢子宫内膜异位症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 585 | 2026-05-31 |
Single-cell RNA sequencing reveals cadmium-induced cell-type-specific mechanisms of developmental neurotoxicity in human cortical organoids
2026-May-22, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142493
PMID:42208297
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示镉在人类皮层类器官中诱导细胞类型特异性发育神经毒性的机制 | 首次在人类皮层类器官模型中利用单细胞RNA测序技术揭示镉暴露引起细胞周期阻滞、锌铜离子稳态失调及抑制性神经元丢失的细胞类型特异性机制 | 未提供明确局限性信息 | 评估镉诱导的细胞类型特异性发育神经毒性并阐明分子机制 | 人类皮层类器官及其中神经细胞(如增殖神经细胞、星形胶质细胞) | 单细胞转录组学 | 发育神经毒性 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 人类皮层类器官样本(未具体说明数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 586 | 2026-05-31 |
Spatially Resolved Microglial State Transitions Govern Strain-Specific Zika Neuropathogenesis
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.30.721456
PMID:42146367
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研究论文 | 通过整合高分辨率空间转录组学与感染感知细胞类型分析,构建寨卡病毒感染小鼠大脑的时空图谱,揭示小胶质细胞状态转变驱动毒株特异性神经发病机制 | 首次结合空间转录组学和感染感知细胞分型,在时空维度上对比亚洲和非洲ZIKV毒株的差异,发现毒株特异性小胶质细胞状态转化(如疾病相关小胶质细胞DAM)是感染控制的关键,并阐明Apoe-Trem2信号通路在其中的调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全代表人类感染过程;未深入探讨小胶质细胞状态转变的上下游分子机制;样本量及时间点有限,可能遗漏其他关键细胞类型或信号通路 | 探究神经性病毒感染如何通过空间、时间和细胞类型间的相互作用影响疾病严重程度,特别是病毒毒株差异如何塑造神经发病机制 | 寨卡病毒亚洲株和非洲株感染的小鼠大脑 | 空间转录组学 | 寨卡病毒感染相关神经疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据(空间转录组)、组织图像 | 小鼠脑组织样本(多个感染阶段及毒株条件) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台用于捕获小鼠脑组织切片中的mRNA |
| 587 | 2026-05-31 |
A spatial atlas of the healthy human liver from live donors
2026-May, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10377-y
PMID:41986723
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研究论文 | 利用空间转录组学和单核RNA测序构建健康人体肝脏空间基因表达图谱,并揭示早期脂肪变性肝细胞的动态变化 | 首次从活体健康捐赠者获取肝脏样本,避免了传统死后或病变邻近组织样本的基因表达偏差,并结合多种空间转录组学技术(Visium、Visium HD、MERFISH、PhenoCycler)和单核RNA测序进行全面分析 | 样本量有限(16个样本),且仅涉及早期脂肪变性,未涵盖其他肝脏疾病阶段 | 构建健康人体肝脏的空间基因表达参考图谱,并研究早期脂肪变性中肝细胞的变化 | 健康肝脏和病变肝脏的邻近正常组织 | 空间转录组学 | 肝脏疾病 | 空间转录组学、单核RNA测序(snRNA-seq)、多重抗误差荧光原位杂交(MERFISH)、PhenoCycler成像 | NA | 基因表达数据、图像 | 16个肝脏样本:8个来自年轻健康活体捐赠者,8个来自肝脏病变个体的邻近正常组织 | 10x Genomics, Vizgen, Akoya Biosciences | 空间转录组学, 单核RNA测序, 多重抗误差荧光原位杂交, PhenoCycler成像 | 10x Visium, 10x Visium HD, MERFISH, PhenoCycler | 10x Visium空间转录组学、10x Visium HD高分辨率空间转录组学、Vizgen MERFISH多重抗误差荧光原位杂交、Akoya PhenoCycler成像系统 |
| 588 | 2026-05-31 |
Spatial atlas of diabetic kidney disease reveals a B cell-rich subgroup
2026-May, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10363-4
PMID:42056516
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研究论文 | 利用空间转录组学和单核RNA测序构建糖尿病肾病空间图谱,揭示以B细胞为主的亚群与疾病进展加速相关 | 跨平台整合Xenium和CosMx单细胞空间转录组学与单核RNA测序,首次构建可计算的组织架构图谱,并鉴定出以B细胞为主的免疫微环境定义的糖尿病肾病亚型 | 未提及 | 建立糖尿病肾病的空间转录组图谱,识别不同预后亚群及其组织微环境特征 | 糖尿病肾病患者的肾脏组织样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学、单核RNA测序 | 未提及 | 空间转录组数据、单核RNA测序数据 | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics、NanoString | 单细胞空间转录组学、单核RNA测序 | Xenium、CosMx | 未提及具体平台配置 |
| 589 | 2026-05-31 |
Redundant and distinct mechanisms suppress innate immune activation during SARS-CoV-2 infection
2026-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003808
PMID:42160380
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研究论文 | 利用一系列重组SARS-CoV-2病毒,揭示NSP1与NSP15等蛋白通过冗余和不同机制抑制先天免疫激活 | 首次通过构建12个点突变的重组SARS-CoV-2病毒库,系统比较多种病毒蛋白在感染背景下对先天免疫的抑制相对贡献,并明确NSP1和NSP15在抑制I型干扰素应答和树突状细胞成熟中的关键作用 | 未在动物模型中对其他突变蛋白(如NSP2、ORF6等)进行体内验证;体外实验主要基于293T-ACE2/TMPRSS2细胞和Calu-3细胞系,可能不能完全代表体内感染微环境 | 阐明SARS-CoV-2感染过程中多种病毒蛋白抑制宿主先天免疫的机制及其相对重要性 | SARS-CoV-2病毒蛋白(NSP1、NSP2、NSP3、NSP6、NSP12、NSP13、NSP14、NSP15、NSP16、ORF3a、ORF6和ORF8)及相关突变病毒,人类细胞(293T-ACE2/TMPRSS2,Calu-3),人单核细胞来源树突状细胞,K18 hACE2转基因小鼠 | 分子生物学 | COVID-19 | 细菌人工染色体介导的诱变,ISRE驱动的荧光素酶报告基因检测,RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 12个重组SARS-CoV-2病毒突变体;293T-ACE2/TMPRSS2细胞;Calu-3细胞;人单核细胞来源树突状细胞;K18 hACE2转基因小鼠(具体数量未说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA-seq平台 |
| 590 | 2026-05-30 |
Molecular insight into the interplay among heterogeneous plasmacytes and microenvironment cells and their clinical relevance in myeloma
2026-May-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2537965123
PMID:42154554
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研究论文 | 通过多组学分析揭示多发性骨髓瘤中异质性浆细胞与微环境细胞之间的相互作用及其临床相关性 | 首次在大量中国多发性骨髓瘤患者中结合全基因组/全外显子测序、RNA测序和单细胞RNA测序,定义了8种浆细胞亚群并构建了分化轨迹,同时揭示了肿瘤细胞与微环境细胞间的动态、全面的配体-受体相互作用网络 | 样本主要来自中国人群,可能限制了结果的普适性;部分单细胞数据来自公共数据库的复发患者,可能存在批次效应 | 探究多发性骨髓瘤中异质性浆细胞与微环境细胞的相互作用及其临床意义 | 277例新诊断多发性骨髓瘤患者、20例复发患者(来自公共数据库)和30例正常对照 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序、全外显子测序、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据 | 267例进行WGS/WES和RNA-seq,59例进行scRNA-seq,20例复发患者(公共数据库),30例正常对照 | NA | 全基因组测序、全外显子测序、bulk RNA-seq、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 591 | 2026-05-30 |
TAZ integrates ECM remodeling with uterine stromal differentiation to maintain early pregnancy
2026-May-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2528309123
PMID:42154563
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了TAZ整合细胞外基质重塑与子宫基质分化以维持早期妊娠的机制 | 首次发现Hippo信号通路效应因子TAZ通过调控胶原相关的细胞外基质重塑,在蜕膜形成中发挥关键作用,并利用小鼠条件性敲除模型验证其功能 | NA | 探究子宫蜕膜化过程中基质细胞分化和细胞外基质重塑的分子调控机制 | 小鼠和人类子宫内膜组织,包括患者样本 | 单细胞组学、空间转录组学 | 妊娠相关疾病、胎盘缺陷 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、组织学分析 | NA | 基因表达数据、空间转录数据、组织图像 | 小鼠子宫内膜和人类患者子宫内膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台,10x Visium空间转录组学平台 |
| 592 | 2026-05-30 |
Molecular architecture of the tumor microenvironment caused by BRCA1 and BRCA2 somatic mutations in human lung adenocarcinoma
2026-May-26, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.110662
PMID:42189716
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研究论文 | 利用单细胞测序和多组学数据,表征BRCA1和BRCA2体细胞突变引起的人肺腺癌肿瘤微环境的分子架构 | 首次揭示了BRCA1和BRCA2突变在肺腺癌中不同的免疫微环境特征和转录模式,并发现其与免疫检查点阻断治疗反应及组蛋白去乙酰化酶抑制剂敏感性的关联 | 该研究仅提供了对BRCA突变肿瘤微环境的初步表征,未在更大规模队列或前瞻性研究中验证 | 探讨BRCA1和BRCA2体细胞突变对肺腺癌肿瘤微环境中免疫组成、T细胞功能及治疗反应的影响 | BRCA1或BRCA2体细胞突变的肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序, 多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 多组学数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 593 | 2026-05-30 |
IL-6/STAT3 signaling drives mitochondrial oxidative phosphorylation dysfunction and AP-1 activation in fibroblasts during sepsis-induced lung injury
2026-May-26, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示IL-6/STAT3信号驱动脓毒症诱导肺损伤中成纤维细胞的线粒体氧化磷酸化功能障碍和AP-1激活 | 首次通过单细胞RNA测序系统描绘脓毒症期间成纤维细胞从静息态向促炎和促纤维化表型转变的图谱,并阐明IL-6/STAT3信号通过线粒体代谢重塑调控AP-1激活的新机制 | 未提及具体局限性,但研究主要基于动物模型,临床相关性需进一步验证 | 探索脓毒症诱导肺损伤和纤维化中成纤维细胞的角色及潜在治疗靶点 | 脓毒症诱导的肺损伤小鼠模型中的成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 脓毒症相关肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本数量,包括小鼠肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 594 | 2026-05-30 |
Single-Cell Landscape Change in Cervical Epithelial Cells and Microenvironment During the Transformation from CINIII to Cervical Squamous Cell Carcinoma
2026-May-21, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18101674
PMID:42193032
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research paper | 利用单细胞测序技术揭示了宫颈上皮细胞及微环境从CINIII向宫颈鳞状细胞癌转变过程中的细胞和分子变化 | 首次通过单细胞测序全面解析CINIII向CSCC转变过程中宫颈上皮细胞及微环境的动态变化,并鉴定了Sox2及其信号通路作为恶性转化中特定宫颈干细胞的标志物 | 未明确提及局限性 | 研究CINIII向宫颈鳞状细胞癌转变过程中的细胞和分子机制,为非侵入性治疗提供分子基础 | 宫颈上皮细胞及其微环境中的多种细胞类型,包括血管内皮细胞、成纤维细胞、巨噬细胞、T细胞、B细胞等 | 单细胞组学, 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本量 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 595 | 2026-05-30 |
Integrative Analysis of Major Depressive Disorder and Ovarian Cancer: From Genetic Association to Single-Cell Mechanisms
2026-May-21, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14051167
PMID:42193490
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研究论文 | 利用单细胞转录组学和遗传学方法探究重度抑郁症与卵巢癌之间的关联机制 | 首次通过整合单细胞RNA-seq、eQTL和GWAS数据,以CD8效应记忆T细胞为共同焦点,识别出CLSTN3作为连接抑郁症与卵巢癌的候选分子 | MR分析中CLSTN3与卵巢癌风险的关联未经过多重比较校正;功能验证仅局限于体外实验,缺乏体内研究支持 | 揭示重度抑郁症增加卵巢癌风险的潜在生物学机制 | 重度抑郁症和卵巢癌患者的免疫细胞亚群(特别是CD8效应记忆T细胞)及卵巢癌细胞系HOC7 | 机器学习 | 抑郁症、卵巢癌 | 单细胞RNA-seq、流式细胞术、eQTL分析、孟德尔随机化、siRNA敲低 | NA | 单细胞转录组数据、基因组关联研究摘要统计数据 | 未明确总样本量,涉及抑郁症和卵巢癌患者外周血单细胞数据及HOC7细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 596 | 2026-05-30 |
Pyroptosis-Related Gene Signatures and Immune Modulation in Ovarian Cancer: Insights from Multi-Omics and Machine Learning
2026-May-21, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17050595
PMID:42195052
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研究论文 | 通过多组学和机器学习分析卵巢癌中焦亡相关基因特征及其免疫调节作用,确定CEP55为潜在生物标志物 | 首次系统整合焦亡相关基因与多组学数据及机器学习算法,鉴定CEP55作为卵巢癌核心生物标志物,并揭示其在细胞周期调控与免疫调节之间的桥梁作用 | 研究主要依赖公开数据库GSE54388,样本来源有限,且缺乏体外实验验证CEP55的功能机制 | 系统分析卵巢癌中焦亡相关基因的表达谱,发现稳健的生物标志物以改善早期诊断和预后评估 | 卵巢癌患者样本及正常对照样本的基因表达数据,包括微阵列数据和单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | 卵巢癌 | 微阵列、单细胞RNA-seq | 支持向量机、XGBoost、广义线性模型 | 基因表达数据、免疫细胞浸润数据 | GSE54388数据集的卵巢癌及正常样本,多个独立bulk和scRNA-seq数据集用于验证 | NA | NA | NA | NA |
| 597 | 2026-05-30 |
Neuregulin-1β Mitigates Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity via Serping1 in Cardiac Fibroblasts
2026-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104616
PMID:42196592
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研究论文 | 本研究评估了Neuregulin-1β在阿霉素诱导的心脏毒性中的保护作用,特别是通过Serping1调节心脏成纤维细胞 | 首次发现Serping1在蒽环类心脏毒性中的新作用,并揭示了NRG1通过调节成纤维细胞-心肌细胞相互作用发挥保护作用的机制 | NA | 阐明NRG1在DOX治疗期间(特别是在癌症存在时)的心脏保护机制 | 荷瘤雌性BALB/c小鼠、人3D心脏微组织、原代心脏成纤维细胞富集培养物 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | 4T1肿瘤携带雌性BALB/c小鼠,分组为盐水组、DOX组、DOX+NRG1组 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 598 | 2026-05-30 |
Deciphering Cell-Type-Specific Transcriptional Regulation in Tomato Leaves Through Ensemble Machine Learning and Single-Cell Transcriptomics
2026-May-21, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15101578
PMID:42197712
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研究论文 | 通过集成机器学习和单细胞转录组学解析番茄叶片细胞类型特异性转录调控 | 首次将高维加权基因共表达网络分析与集成机器学习结合,用于非模式作物番茄的单细胞转录组分析,并通过计算机模拟预测转录因子敲除对细胞命运的影响 | 研究基于计算机模拟分析,缺乏实验验证;仅聚焦番茄叶片,未涉及其他组织或胁迫条件 | 解析番茄叶片中细胞类型特异性的转录调控机制 | 番茄叶片单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成机器学习模型(如XGBoost) | 单细胞转录组数据 | 涉及19个细胞亚群,分属5种主要细胞类型,样本总数未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 599 | 2026-05-30 |
A Vascular-Extracellular Matrix Molecular Program Identifies High-Risk Diffuse Glioma Across Independent Multi-Omics
2026-May-20, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18101652
PMID:42193012
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研究论文 | 利用MOFA+从弥漫性胶质瘤多组学数据中识别出血管-细胞外基质重塑程序作为独立预后因子 | 首次通过多组学因子分析(MOFA+)整合转录组、甲基化和基因组数据,识别出血管-ECM轴作为弥漫性胶质瘤的独立预后因子,并通过外部验证和单细胞数据投影验证其稳健性 | 血管-ECM程序在TCGA的IDH分层亚组中未达到FDR校正显著性,且在CGGA队列中方向一致但效应大小存在队列依赖性;研究为相关性分析,缺乏因果验证 | 识别弥漫性胶质瘤中独立于IDH突变状态和肿瘤纯度的稳健预后分子程序 | 弥漫性胶质瘤患者(TCGA 667例,CGGA批次1 325例,批次2 693例,共1685例) | 机器学习 | 弥漫性胶质瘤 | MOFA+, RNA-seq, 甲基化测序, 基因组测序, 单细胞RNA-seq | MOFA+ | 转录组数据, 甲基化数据, 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 1685例弥漫性胶质瘤患者(含TCGA 667例,CGGA批次1 325例,批次2 693例) | Illumina | bulk RNA-seq, 甲基化测序, 全外显子组测序, 单细胞RNA-seq | Illumina HiSeq, Illumina NovaSeq | TCGA和CGGA队列使用Illumina平台进行RNA-seq和甲基化阵列分析;单细胞数据来自GSE131928(GBM样本) |
| 600 | 2026-05-30 |
Organoids to Model Tumor Microenvironment in Progression of Pathogenesis and Treatment Resistance in Glioblastoma Multiforme
2026-May-18, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci16050531
PMID:42192843
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综述 | 本文综述了类器官技术在多形性胶质母细胞瘤(GBM)肿瘤微环境建模及治疗耐药机制研究中的最新进展 | 系统比较了多种GBM类器官策略(患者来源类器官、脑类器官共培养系统及免疫/血管整合平台),并强调空间转录组学、芯片上类器官及人工智能集成等新兴技术的应用 | 未讨论类器官模型的长期稳定性、标准化问题及临床转化中的大规模验证挑战 | 总结GBM类器官技术在模拟肿瘤微环境驱动机制和治疗耐药中的最新进展 | 多形性胶质母细胞瘤及其肿瘤微环境中的细胞组分(肿瘤相关巨噬细胞、反应性星形胶质细胞、内皮细胞、周细胞、GBM干细胞)和非细胞组分(细胞外基质重塑、缺氧、代谢梯度及细胞因子网络) | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学、类器官培养、芯片上类器官、活体成像、谱系追踪、基因组编辑 | 类器官模型 | 空间转录组数据、成像数据 | 不适用 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |