单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 987 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-09-23 |
WATER reveals heterochrony of molecular programs underlies developmental failure caused by minor spliceosome inhibition
2026-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.08.723603
PMID:42182497
|
研究论文 | 该研究开发了WATER框架，通过独立重建不同条件下的基因表达时间轨迹，揭示了小型剪接体抑制导致小鼠前肢发育失败是由于分子程序时序错乱而非程序缺失 | 首次提出WATER（加权窗口时间表达分配）框架，能够独立重建每种条件下的时间基因表达轨迹，实现野生型与扰动系统之间时间程序架构的直接比较；揭示了发育失败源于完整分子程序的时序错位部署，而非程序本身缺失；证明了Eed缺失足以独立于其他剪接缺陷产生时间程序重分布 | 研究主要基于小鼠前肢发育模型，WATER框架在其他发育系统和物种中的普适性有待验证；对时间轨迹重建的精度可能受限于采样时间点的密度；未完全阐明小型剪接体抑制与p53凋亡检查点之间的精确分子机制 | 开发新的计算框架以解析和比较不同条件下基因表达的时间动态，并阐明小型剪接体抑制导致发育失败的时间分子机制 | U11缺失小鼠前肢发育过程及Eed敲除干细胞 | 机器学习, 计算生物学, 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2026-09-23 |
GatorDuo: Global-Consistency Dual-Graph Refinement With Pseudo-Label Agreement for Spatial Transcriptomics
2026-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.10.724039
PMID:42182473
|
研究论文 | 提出GatorDuo，一种拓扑感知的双图对比自监督框架，通过全局一致性图细化和伪标签一致性掩码抑制跨域捷径边，结合上下文赌博机强化学习自适应选择聚类粒度，并使用混合路由的专家混合模块整合视图特异性嵌入，用于空间转录组学的空间域识别 | 引入基于全局一致性的图细化方法，利用伪标签一致性掩码在基因表达相似性图和空间邻近图中同时抑制跨域捷径边，稳定邻域拓扑；采用上下文赌博机强化学习策略自适应选择聚类粒度，避免手动调参；使用混合路由的专家混合模块整合双视图嵌入，并设计MoE对齐项增强对比学习目标 | 摘要中未明确提及局限性 | 实现稳健的空间域识别，提升空间转录组学中组织区域聚类的准确性和鲁棒性 | 空间转录组学数据，涵盖基于测序和基于成像的技术，包括spot分辨率和单细胞分辨率的数据 | 空间转录组学，机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络，对比学习，专家混合模型，强化学习 | 空间转录组数据（基因表达矩阵和空间坐标） | 八个公开基准数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 43 | 2026-09-23 |
δ-catenin controls layer-specific transcriptional maturation of astrocytes via Zbtb20
2026-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.12.724361
PMID:42182221
|
研究论文 | 该研究揭示δ-catenin通过调控Zbtb20依赖的转录程序，协调不同神经细胞类型的转录成熟，特别是控制星形胶质细胞层特异性身份的建立 | 首次发现δ-catenin作为黏附连接组分将细胞间相互作用与转录调控联系起来，并鉴定Zbtb20为胶质细胞富集的BTB/POZ转录因子，是层特异性星形胶质细胞身份的关键调控因子 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 探究神经细胞类型转录成熟同步化的机制，特别是细胞间相互作用如何调控转录程序以协调皮层回路发育 | 小鼠皮层神经细胞（特别是星形胶质细胞），δ-catenin缺失模型 | 神经科学、单细胞转录组学、空间转录组学 | 神经发育障碍 | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞核RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 44 | 2026-09-23 |
Dogcatcher2: Improved statistical detection of transcriptional readthrough and repetitive element analysis across sequencing platforms
2026-May-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.07.723642
PMID:42182342
|
研究论文 | 本文提出了Dogcatcher2，一种改进的统计检测方法，用于从短读长RNA-seq中检测转录通读（DoG），并分析了其与重复元件和双链RNA生成的关系 | Dogcatcher2采用基因体归一化的覆盖度谱和统计检测方法，克服了现有基于绝对阈值和滑动窗口方法的深度敏感性，在低测序深度下仍保持高精度，并首次系统揭示了DoG区域中Alu元件（特别是可形成双链RNA的倒置Alu对）的富集以及转座元件表达升高 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 改进转录通读（DoG）的统计检测方法，并探究DoG区域与重复元件及双链RNA生成之间的关系 | 多种测序平台产生的RNA-seq数据集（包括短读长和长读长数据）、人类DoG区域、重复元件（Alu元件、转座元件） | 机器学习 | 癌症 | 短读长RNA-seq, 长读长RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-09-23 |
Quantifying Cross-Modal Association Confidence for Single-Cell RNA-ATAC Integration
2026-May-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.07.723400
PMID:42182231
|
研究论文 | 本文提出了一种跨模态关联置信度评分（CLIC），用于量化基因表达与染色质可及性之间的关联可靠性，并基于该评分提出混合特征选择策略，以提高单细胞RNA-ATAC数据整合的准确性和鲁棒性 | 首次提出了CLIC评分，一种基于多组学数据定量衡量基因表达与附近染色质可及性经验一致性的指标，并利用该评分进行特征选择，改进了跨模态整合方法 | CLIC评分依赖于ENCODE项目的多组学数据集，可能受限于数据覆盖度和细胞类型特异性；特征选择策略仅在公开数据集上验证，未在更多新生成的数据集上测试 | 提高单独测量的单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据整合的准确性和可靠性 | 单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据，以及单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 来自ENCODE项目的多种单细胞多组学数据集，以及多个公开可用的单细胞和空间数据集，具体样本数未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 46 | 2026-09-23 |
Influenza-induced tuft cell expansion alters ILC-mediated inflammation
2026-May-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.08.723776
PMID:42182319
|
研究论文 | 本研究探讨了流感感染后小鼠远端气道中异位簇细胞（tuft cells）如何通过调控固有淋巴样细胞（ILCs）来塑造固有免疫应答 | 揭示了簇细胞与ILC2之间的相互调控轴，即IFNγ抑制簇细胞分化而ILC2驱动簇细胞扩增，并发现簇细胞缺失小鼠在流感损伤消退后表现出嗜酸性炎症减少及ILC1s和ILC3s扩增 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证；单细胞RNA-seq仅分析了全肺组织，未对特定细胞亚群进行深入功能验证 | 探究流感感染后异位簇细胞在塑造固有免疫和维持炎症平衡中的功能 | 流感感染小鼠模型中的远端气道异位簇细胞及固有淋巴样细胞（ILC1s、ILC2s、ILC3s） | 免疫学 | 流感病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2026-09-23 |
Identification of ATF3 as a Potential Key Biomarker for Hypertensive Nephropathy via Single-Cell Transcriptome Sequencing
2026-May-11, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-026-02515-5
PMID:42113322
|
研究论文 | 通过对高血压肾病患者和健康对照的肾脏组织进行单细胞RNA测序分析，并结合体内外实验验证，鉴定出ATF3作为高血压肾病潜在的关键生物标志物 | 首次通过单细胞转录组测序整合分析，在高血压肾病肾小管上皮细胞中发现了以ATF3为中心的调控网络，并揭示其可能通过FOSB调控氧化应激信号通路参与疾病进展 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 鉴定能够早期检测肾损伤并反映分子病理特征的高血压肾病特异性生物标志物 | 高血压肾病患者的肾脏组织样本及健康对照的肾脏组织样本 | 数字病理学 | 高血压肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2026-09-23 |
Lense: Optimizing data preprocessing in single-cell omics using LLMs
2026-May-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.07.723465
PMID:42182127
|
研究论文 | 提出了一种利用语言模型自动选择单细胞组学数据预处理流程的方法 Lense，通过比较不同流程变体的低维表示图来优化预处理 | 利用语言模型自动比较可视化图来选择最优预处理流程，无需手动调参，并集成到 Seurat 中 | 未提及具体性能评估和大规模验证 | 优化单细胞组学数据预处理，特别是针对空间转录组等新兴平台的数据 | 单细胞组学数据（包括空间转录组数据） | 机器学习 | NA | 单细胞组学 | 语言模型（LLM） | 图像（低维表示图）、文本（预处理步骤描述） | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2026-09-23 |
A Perturb-seq screen guided by species divergence uncovers pathways for collateral artery formation
2026-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.29.721711
PMID:42146601
|
研究论文 | 本研究通过比较豚鼠和小鼠的单细胞RNA测序数据，识别与侧支动脉发育相关的内皮细胞基因表达模式，并利用Perturb-seq平台在小鼠中测试这些基因的功能，从而发现调控侧支动脉形成的新通路 | 首次结合物种差异引导的Perturb-seq筛选策略，发现豚鼠具有密集侧支动脉网络是由于动脉抑制通路和缺氧反应活性降低，并鉴定了促进侧支动脉形成的新靶点 | 研究主要基于小鼠模型验证，豚鼠中的发现是否完全适用于人类仍需进一步研究；Perturb-seq筛选可能未涵盖所有相关基因和通路 | 揭示侧支动脉发育的分子机制，并寻找刺激侧支动脉生长的治疗靶点 | 豚鼠和小鼠的组织样本，以及小鼠模型中的内皮细胞 | 单细胞组学、功能基因组学 | 中风、冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Perturb-seq | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Perturb-seq | NA | NA |
| 50 | 2026-09-23 |
Heterogeneous, population-level drug-tolerant persisters exhibit ion-channel remodeling and ferroptosis susceptibility
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.02.03.479045
PMID:42039444
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学和谱系条形码技术，揭示药物耐受持留细胞（DTPs）并非单一细胞状态，而是由多个具有不同分裂和死亡速率的亚状态组成的异质性群体，并发现其存在离子通道重塑和对铁死亡敏感性增加的特征。 | 提出DTPs并非单一细胞状态，而是由多个亚状态组成的异质性群体，这些亚状态的分裂和死亡速率平衡产生接近零的净群体增长；发现idling DTPs存在离子通道活性改变，且对铁死亡表现出更高的敏感性。 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性。 | 探究药物耐受持留细胞（DTPs）的异质性本质，揭示其亚状态组成、谱系来源、离子通道重塑及对铁死亡的敏感性，提出群体水平的肿瘤药物耐受新观点。 | 药物耐受持留细胞（DTPs），特别是称为“idling”的群体水平DTP | 单细胞转录组学 | 癌症 | 单细胞转录组学，谱系条形码 | NA | 转录组数据，条形码数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2026-09-23 |
BART-spatial unravels biologically significant transcriptional regulators from spatial omics data
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.05.723027
PMID:42146333
|
研究论文 | 开发了一种名为BART-spatial的计算方法，从空间组学数据中推断功能性转录调控因子，并在多个空间数据集上验证了其优越性 | 首次将空间变异性和伪时间信息与公开的TR结合谱整合，专门用于从空间组学数据中推断功能性TR，克服了TR低表达和TR活性与mRNA水平不直接相关的问题，并兼容空间表观组学数据实现交叉验证 | 摘要中未明确提及局限性 | 从空间组学数据中识别功能性转录调控因子，以理解发育、组织组织和疾病中的基因调控程序 | 空间转录组学和空间表观组学数据 | 空间组学分析 | NA | 空间转录组学, 空间表观组学, 空间RNA-ATAC-seq | NA | 空间组学数据 | 多个空间数据集 | 10x Genomics, Atera | 空间转录组学, 空间ATAC-seq | 10X Visium, Visium HD, Atera | 10X Visium, Visium HD, Atera, 空间RNA-ATAC-seq |
| 52 | 2026-09-23 |
Flow Matching for Count Data
2026-May-08, ArXiv
PMID:42147731
|
研究论文 | 提出了一种基于连续时间生灭过程的流匹配框架 count-FM，用于计数数据的生成与传输建模 | 基于连续时间生灭过程与局部单位跳跃，在计数空间直接进行无模拟训练，实现任意计数分布源与目标群体之间的高效迁移 | 未明确提及 | 为高维计数数据（如单细胞 RNA 测序和神经脉冲序列）构建高效且可解释的流匹配生成模型 | 单细胞 RNA 测序数据、神经脉冲序列数据 | 机器学习 | NA | 单细胞 RNA 测序 | 流匹配 | 计数数据 | NA | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | NA |
| 53 | 2026-09-23 |
CXCL13-CXCR5 Signaling in CD8+ T Cell Recruitment and Lymphoid Immune Organization in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722710
PMID:42146336
|
研究论文 | 本文研究CXCL13-CXCR5信号轴在透明细胞肾细胞癌中调控CD8 T细胞募集、分化及淋巴免疫组织形成的作用 | 首次系统揭示CXCL13-CXCR5轴在ccRCC中驱动CD8 T细胞募集并促进干细胞样CD8 T细胞在淋巴聚集体中的空间组织，提出其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于高-risk非转移性ccRCC样本，样本量有限，且小鼠模型与人类肿瘤微环境存在差异，CXCL13-CXCR5轴的具体治疗干预效果仍需进一步临床验证 | 探究CXCL13-CXCR5轴在透明细胞肾细胞癌中对CD8 T细胞募集、分化和免疫组织结构的调控作用 | 高风险非转移性透明细胞肾细胞癌患者肿瘤组织、血浆、配对癌旁肾组织及同源小鼠模型 | 数字病理学 | 肾癌 | ELISA、定量PCR、迁移实验、多重免疫荧光、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 人类肿瘤、血浆及配对癌旁肾组织样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 54 | 2026-09-23 |
The abscopal effect of IRE combined with anti-PD-1 achieves local ablation and systemic control of PDAC
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722535
PMID:42146443
|
研究论文 | 本文研究了不可逆电穿孔（IRE）联合抗PD-1抗体在胰腺导管腺癌（PDAC）临床前模型中诱导远端效应，实现局部消融和全身控制 | 首次证明IRE联合抗PD-1抗体可在转移性PDAC临床前模型中触发强烈的远端效应，揭示了cGAS-STING通路激活、髓系细胞浸润和M1极化、以及B细胞在IRE介导的全身抗肿瘤免疫中的重要作用 | 研究仅限于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证IRE联合抗PD-1的远端效应和安全性 | 探讨IRE联合抗PD-1抗体是否能诱导远端效应，并实现PDAC的局部消融和全身控制 | 转移性PDAC临床前模型（包括原位小鼠PDAC肿瘤模型和B细胞敲除小鼠模型） | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 空间免疫荧光 | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 图像 | 多个模型（具体数量未提及） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 55 | 2026-09-23 |
Genetic suppression of myeloid receptor Clec7a attenuates microglia neuroinflammation and promotes microglial phagocytosis to delay disease progression in ALS models
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722437
PMID:42146463
|
研究论文 | 该研究揭示了髓系受体Clec7a（Dectin-1）在调控小胶质细胞激活及肌萎缩侧索硬化（ALS）疾病进展中的关键作用，发现Clec7a缺失可减轻神经炎症、促进小胶质细胞吞噬hTDP43并延缓疾病进展 | 首次确定Clec7a作为疾病相关小胶质细胞（DAM）核心标志基因在ALS中调控小胶质细胞激活和疾病进展的具体作用，并证明小胶质细胞中选择性敲除Clec7a可促进对病理性hTDP43的吞噬并延缓ALS疾病进展 | 研究主要基于SOD1G93A小鼠模型，人ALS样本验证有限，Clec7a作为治疗靶点的临床转化潜力尚需进一步验证 | 确定Clec7a在调控小胶质细胞激活和ALS疾病进展中的作用 | SOD1G93A ALS小鼠模型、人ALS样本、小胶质细胞 | 机器学习 | 肌萎缩侧索硬化 | 单细胞RNA测序、双光子成像 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2026-09-23 |
Macrophage metabolism directs regenerative versus fibrotic healing through BMP signaling in the mouse digit tip
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722661
PMID:42146602
|
研究论文 | 本研究利用小鼠指尖截肢模型，通过单细胞RNA测序、空间转录组学和代谢组学分析，揭示了巨噬细胞代谢通过BMP信号通路决定再生与纤维化愈合的机制。 | 首次鉴定出一群特异性存在于P3再生指尖的巨噬细胞群体，该群体定位于生长骨前沿，表达BMP配体驱动邻近成骨细胞中BMP激活，并受脂肪酸氧化增加与糖酵解活性降低的双重代谢开关调控；揭示了再生特异性巨噬细胞信号中心在模式化骨形成中的作用。 | 研究基于小鼠指尖截肢模型，结论是否适用于其他组织或人类再生医学尚需进一步验证。 | 探究驱动巨噬细胞与周围细胞不同交叉通讯通路从而决定愈合结局（再生与瘢痕形成）的机制。 | 小鼠指尖截肢模型中的巨噬细胞及周围骨细胞 | 空间转录组学、单细胞组学、代谢组学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、代谢组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, metabolomics | NA | NA |
| 57 | 2026-09-23 |
Gene-Modulated Network Diffusion for Improved Modeling of Amyloid- β Spread in Alzheimer's Disease
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722725
PMID:42146687
|
研究论文 | 本文扩展了网络扩散模型，通过引入基因调控的区域脆弱性来改进阿尔茨海默病中淀粉样蛋白β扩散的建模 | 提出了一种扩展网络扩散模型框架，包含蛋白质合成项，并利用空间转录组学数据调制区域级合成速率参数，使用APOE、SORL1和FGL2等基因进行调控 | 基线网络扩散模型在机制可解释性方面存在不足，基因扩展模型在轻度认知障碍和阿尔茨海默病组中的性能提升仅在P<0.10水平上显著 | 研究淀粉样蛋白β在白质结构脑网络中的病理生理扩散，并改进其建模和预测 | 阿尔茨海默病神经影像学队列中的淀粉样蛋白β沉积，以及阿尔茨海默病测序计划的外部队列 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 网络扩散模型 | 影像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 58 | 2026-09-23 |
Modeling human B cell development with pluripotent stem cells
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722674
PMID:42146710
|
研究论文 | 该研究建立了一种从人多能干细胞（hPSCs）高效生成B细胞并使其成熟为浆细胞的培养方案，用于模拟人类B细胞发育过程 | 首次通过多组学单细胞RNA测序证明hPSC来源的B细胞发育经过pro-B、pre-B和naïve B细胞阶段，准确重现成人骨髓B淋巴细胞生成；发现IL-7对功能性IgH重排的抑制效应；揭示卵黄囊和永久造血祖细胞均具有B细胞潜能 | 未明确讨论该培养体系的长期稳定性、规模化生产可行性及体内功能验证的局限性 | 建立从人类多能干细胞高效生成功能性B细胞和浆细胞的方案，为B细胞发育机制研究和B细胞疗法开发提供平台 | 人类多能干细胞（hPSCs）及其定向分化产生的B系细胞（pro-B、pre-B、naïve B和浆细胞） | 干细胞生物学、免疫学、发育生物学 | NA | 流式细胞术、多组学单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2026-09-23 |
Human neural organoid modeling of diffuse midline glioma captures the complexity of patient tumors
2026-May-07, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-026-05515-5
PMID:42098359
|
研究论文 | 该研究利用人类iPSC来源的可扩展平面神经类器官（PNO）模型，结合NanoString GeoMx空间转录组技术，对三种DMG患者来源异种移植细胞系进行空间分析，验证该模型能复现患者肿瘤的转录组和蛋白质组特征 | 首次使用可扩展的人类iPSC来源平面神经类器官（PNO）系统建模弥漫性中线胶质瘤，该系统包含神经元、功能性星形胶质细胞和小胶质细胞，可模拟肿瘤微环境，并实现传统肿瘤细胞单培养无法完成的药物靶点旁观者毒性筛选 | 该研究仅为概念验证性研究，样本量有限（仅3个DMG PDX细胞系），尚未进行大规模药物筛选验证或体内实验验证 | 建立可靠、可扩展的DMG体外临床前模型，复现肿瘤微环境复杂性，并用于物种匹配的药物测试 | 3种DMG患者来源异种移植（PDX）细胞系与人类iPSC来源平面神经类器官（PNO）的共培养体系，以及DMG患者活检样本 | 数字病理学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 3个DMG PDX细胞系及DMG患者活检样本 | NanoString | 空间转录组学 | NanoString GeoMx | NanoString GeoMx空间转录组学系统用于空间分辨感兴趣区域（ROI）的转录组分析 |
| 60 | 2026-09-23 |
A diagnostic plasma omics-biomarker for Alzheimer's disease informed by microglial single-cell transcriptomics: A pilot study
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.30.721959
PMID:42146366
|
研究论文 | 该研究利用小胶质细胞单核RNA测序数据，通过统计方法筛选基因组合，并映射到血液单核细胞转录组数据，开发阿尔茨海默病早期诊断的血浆组学生物标志物 | 首次将小胶质细胞单细胞转录组数据与血液单核细胞转录组数据整合，通过基于最优传输统计的图映射方法开发阿尔茨海默病血浆诊断生物标志物 | 这是一项初步研究，样本量较小，300基因组方法对认知正常患者的预测准确性较低（53%），需要更大规模的验证研究 | 开发基于组学信息的阿尔茨海默病早期血液诊断生物标志物框架 | 阿尔茨海默病患者和认知正常对照者的血液样本及小胶质细胞单核RNA测序数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |