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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2026-06-03 |
Beyond sex determination: the Y chromosome in male cancers
2026-May-21, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-026-00935-x
PMID:42168613
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综述 | 综述Y染色体缺失(LOY)在男性癌症中的作用机制、功能研究及生物标志物潜力 | 系统总结Y染色体在肿瘤免疫监视、DNA修复、代谢及肿瘤微环境重塑中的多效性功能,并提出LOY作为癌症风险与精准治疗生物标志物的新见解 | LOY是癌症因果事件、协同事件还是伴随事件仍不明确,且不同肿瘤类型中LOY的影响具有背景依赖性 | 阐明Y染色体缺失对男性癌症易感性、进展及预后的影响机制 | 男性癌症患者血液及肿瘤组织中的Y染色体缺失事件 | 机器学习 | 前列腺癌, 肺癌, 心血管疾病, 老年性疾病 | CRISPR, 单细胞测序, 批量测序, LOY评分算法 | NA | 基因测序数据 | NA | Illumina, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | NA |
| 542 | 2026-06-03 |
Single-cell Sequencing and Machine Learning Identify Amino Acid Metabolism-related Biomarkers and Regulatory Mechanisms in Diabetic Foot Ulcers
2026-May-21, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 通过单细胞测序和机器学习识别糖尿病足溃疡中氨基酸代谢相关的生物标志物和调控机制 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习方法,系统鉴定出糖尿病足溃疡中角质形成细胞亚型Kera1驱动的钙黏蛋白信号通路以及五个氨基酸代谢相关诊断标志物 | 主要基于公开数据集进行分析,临床样本验证规模有限,且分子对接结果需进一步实验验证 | 识别糖尿病足溃疡中与氨基酸代谢相关的生物标志物和调控机制,为临床诊断和靶向治疗提供分子层面的框架 | 糖尿病足溃疡患者的角质形成细胞亚型及相关氨基酸代谢基因 | 机器学习 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序、大量RNA测序、qPCR、分子对接 | 机器学习模型(具体类型未明确) | 基因表达数据 | 两个公开数据集:GSE165816(单细胞)和GSE134431(大量RNA测序),另使用临床样本进行qPCR验证(样本量未具体说明) | NA | 单细胞RNA测序, 大量RNA测序 | NA | NA |
| 543 | 2026-06-03 |
Identification of Potential Biomarkers in Autism: PRELID2, MYO1B, LRCH2, LIFR, and RERG May Serve as Regulators in Synaptic Membrane-Integrating Interneurons
2026-May-19, Current gene therapy
IF:3.8Q2
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析自閉症谱系障碍患者前额叶皮层中间神经元亚型,并鉴定出五个潜在生物标志物 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据,鉴定出突触膜整合中间神经元(SMI-IN)为自闭症关键细胞亚型,并发现PRELID2、MYO1B、LRCH2、LIFR和RERG五个潜在生物标志物及候选治疗化合物 | 所有发现均基于计算分析,需进一步的细胞和临床实验验证 | 识别自闭症谱系障碍中中间神经元亚型的分子特征及潜在生物标志物 | 人类前额叶皮层的中间神经元及其亚型 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 自闭症和对照组的前额叶皮层样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 544 | 2026-06-03 |
D-SPIN constructs regulatory network models from scRNA-seq that reveal organizing principles of perturbation response
2026-May-12, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.04.028
PMID:42127893
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研究论文 | 提出D-SPIN计算框架,从scRNA-seq数据推断基因调控网络模型,揭示扰动响应的组织原理 | 开发了维度可扩展的单细胞扰动整合网络(D-SPIN),能从数千种扰动条件下推断机理可解释且生成式的基因调控网络模型 | NA | 从单细胞mRNA测序数据中重建基因调控网络,揭示细胞维持稳态和执行状态转换的控制原理 | 基因调控网络模型、Perturb-seq和药物响应数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | 生成模型 | 文本 | 数千种扰动条件下采集的单细胞mRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 545 | 2026-06-03 |
Hypoxia Impairs CD8+ T Cell Fitness and Is Associated with a Dysfunctional CD8+ T Cell State in Pancreatic Cancer
2026-May-08, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18101508
PMID:42192869
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研究论文 | 研究缺氧如何通过肿瘤微环境损害CD8+ T细胞功能,并在胰腺癌中导致T细胞功能障碍 | 揭示了缺氧与肿瘤细胞和癌症相关成纤维细胞因子的协同作用对CD8+ T细胞适应性损伤的机制,并结合单细胞RNA测序数据验证了缺氧特征与T细胞终末分化和功能障碍的关联 | 使用体外系统,可能无法完全模拟体内复杂微环境;未深入探讨缺氧信号的分子机制 | 探究缺氧在胰腺癌微环境中对CD8+ T细胞适应性和功能状态的影响 | CD8+ T细胞、胰腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胰腺癌单细胞RNA测序数据(样本量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 546 | 2026-06-03 |
A comprehensive survey of computer vision methods for spatial transcriptomics
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag255
PMID:42184118
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综述 | 首次系统综述了基于计算机视觉的人工智能模型在空间转录组学分析中的应用,涵盖架构、学习范式、任务和数据集,并探讨其技术演进和未来方向 | 首次系统梳理计算机视觉AI方法在空间转录组学中的应用,从架构、学习范式、任务和数据集多维度分类,并指出其能克服传统生物信息学方法的局限,如虚拟测序降低成本和实现3D组织重建 | 文中未明确指出自身局限性,但提及空间转录组学的高成本、有限临床适用性和对2D分析的依赖仍是该领域的主要挑战 | 系统综述计算机视觉AI模型在空间转录组学分析中的应用,并提供全景视角以推动基础研究和临床转化 | 空间转录组学数据分析中的计算机视觉AI模型 | 计算机视觉 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 图像 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 547 | 2026-06-02 |
EXPRESS: Metabolic reprogramming of oligodendrocyte lineage cells in ischemic stroke: insights from literature review and single-cell transcriptomic re-analyses
2026-May-31, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X261458133
PMID:42219915
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研究论文 | 通过文献综述和单细胞转录组再分析,揭示缺血性脑卒中后少突胶质细胞谱系细胞的代谢重编程 | 整合文献综述与三个独立小鼠卒中模型的单细胞RNA测序数据的再分析,首次揭示少突胶质细胞前体细胞和成熟少突胶质细胞中分期特异性的代谢变化,如氧化磷酸化、肌醇磷酸代谢、鞘脂代谢及胆固醇生物合成 | 仅基于小鼠卒中模型的单细胞转录组数据再分析,缺乏人体研究验证,且系统性的代谢变化全景尚未完全阐明 | 系统了解经典代谢通路与少突胶质细胞谱系在缺血性脑卒中中的相互作用,并探索潜在治疗靶点 | 少突胶质细胞谱系细胞,包括少突胶质细胞前体细胞和成熟少突胶质细胞 | 数字病理学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三个独立的小鼠卒中模型数据集,涵盖超急性期、急性期和慢性恢复期 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 548 | 2026-06-02 |
Erratum to: Distinct immune escape and microenvironment between RG-like and pri-OPC-like glioma revealed by single-cell RNA-seq analysis
2026-May-30, MedScience
DOI:10.1007/s11684-026-1253-8
PMID:42223858
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 549 | 2026-06-02 |
COUP-TFII promotes macrophage-myofibroblast transition by attenuating HIF-1α-mediated glycolysis
2026-05-28, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153640
PMID:41916009
|
研究论文 | 本研究揭示COUP-TFII通过抑制HIF-1α介导的糖酵解促进巨噬细胞-肌成纤维细胞转化,从而驱动糖尿病肾病纤维化 | 首次阐明COUP-TFII在糖尿病肾病纤维化中通过负调控HIF-1α依赖性糖酵解促进巨噬细胞-肌成纤维细胞转化的新机制 | NA | 探究COUP-TFII在糖尿病肾病肾纤维化中的调控机制 | TGF-β处理的巨噬细胞和22周龄DB/DB糖尿病肾病小鼠模型 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | Western blotting, 单细胞测序, GEO数据库分析, 基因敲减载体构建, 免疫荧光 | NA | 蛋白质表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 550 | 2026-06-02 |
Single-cell transcriptomics and multimodal molecular profiling revealed the oncogenesis and tumor microenvironment of cardiac myxoma
2026-May-27, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3299-0
PMID:42223569
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和多模态分子分析揭示了心脏黏液瘤的癌变机制及肿瘤微环境 | 首次利用单细胞RNA测序构建心脏黏液瘤细胞图谱,阐明内皮细胞向间充质转化是其细胞起源,并揭示肿瘤相关成纤维细胞和壁细胞亚型差异导致不同形态分化 | 样本量有限(仅5例肿瘤及5例正常组织),缺乏功能验证实验,未深入探讨信号通路调控机制 | 探究心脏黏液瘤的细胞组成、起源及肿瘤形态多样性的形成机制 | 心脏黏液瘤组织和正常房间隔组织 | 机器学习 | 心脏黏液瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例心脏黏液瘤组织样本和5例正常房间隔样本,共86,741个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 551 | 2026-06-02 |
Integrating bulk and single-cell sequencing reveals cellular heterogeneity between lung adenocarcinoma in smokers and never-smokers
2026-May-21, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.39.20250160
PMID:40878768
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研究论文 | 整合单细胞和批量测序揭示吸烟与非吸烟肺腺癌患者的细胞异质性 | 首次通过整合单细胞RNA测序和批量测序数据,系统揭示了吸烟与非吸烟肺腺癌患者在细胞亚群、肿瘤微环境和免疫逃逸机制上的差异,并识别出潜在免疫治疗靶点 | NA | 探究吸烟与非吸烟肺腺癌患者的细胞异质性及其在肿瘤发展和免疫治疗中的差异 | 吸烟与非吸烟肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 552 | 2026-06-02 |
Scalable genotyping in fixed transcriptomes resolves clonal heterogeneity via single-cell sequencing
2026-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.11.717967
PMID:41993258
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研究论文 | 提出GIFT技术,用于在固定转录组中同时检测大量靶向遗传变异和全转录组图谱,实现单细胞水平的克隆异质性分析 | 创新性地设计了一种基于相邻ssDNA探针的间隙填充反应,通过条码化天然转录序列实现高特异性靶向突变检测,并可在福尔马林固定石蜡包埋组织中进行克隆谱系追踪 | 未提及具体局限性 | 开发一种可扩展的基因分型方法,用于在单细胞水平同时解析转录状态和体细胞突变,以研究克隆异质性 | 来自35名骨髓增殖性肿瘤(MPN)供体的超过70万个人类细胞 | 单细胞基因组学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序、靶向突变检测 | NA | 单细胞转录组数据、突变数据 | 超过70万个来自35名MPN供体的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 553 | 2026-06-02 |
Myeloid compartment reprogramming through nanoparticle-delivered resiquimod blocks paracrine growth support and activates phagocytosis to slow tumor progression in endogenous mouse medulloblastoma and diffuse midline glioma models
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.714454
PMID:41993485
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研究论文 | 通过纳米颗粒递送的瑞西奎莫德(ResiPOx)重新编程髓系区室,阻断旁分泌生长支持并激活吞噬作用,从而在小鼠髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤模型中减缓肿瘤进展 | 首次利用脑渗透性聚噁唑啉纳米颗粒制剂ResiPOx靶向TAMs的TLR7/8受体,逆转其促肿瘤表型,并在非人灵长类中验证了转化潜力 | NA | 研究通过刺激TAMs病原体受体以逆转肿瘤支持性表型的潜力,评估ResiPOx的抗肿瘤疗效和免疫重塑机制 | 肿瘤相关髓系细胞(TAMs)、小鼠髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤模型、恒河猴 | 机器学习 | 髓母细胞瘤, 弥漫性中线胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤模型样本、恒河猴脑组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于scRNA-seq分析 |
| 554 | 2026-06-02 |
T-cell distribution in the dorsal root ganglion across species, sex, and age
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.30.722027
PMID:42146464
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研究论文 | 通过比较生物学方法,研究T细胞在哺乳动物背根神经节中的分布,涵盖人类、非人灵长类、猪和啮齿类,并分析性别和年龄的影响 | 首次系统比较多个物种间背根神经节T细胞的分布差异,并揭示人类绝经前女性T细胞增多现象及Trm表型 | 未深入探讨DRG驻留T细胞的功能机制及物种差异的进化原因 | 阐明不同物种、性别和年龄下背根神经节T细胞的分布特征及其进化意义 | 人类、非人灵长类、猪、大鼠和小鼠的背根神经节组织 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 空间转录组学、免疫荧光 | NA | 空间转录组数据、免疫荧光图像 | 人类样本包括不同性别和年龄组,非人灵长类、猪、大鼠和小鼠各物种样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于人类DRG组织分析 |
| 555 | 2026-06-02 |
Sinonasal biphasic seromucinous adenocarcinomas: a report of two morphologically distinct cases with multimodal omics characterization
2026-May-04, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-026-04562-7
PMID:42080922
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研究论文 | 报告两例形态不同的双相型鼻窦浆液黏液腺癌,并通过多组学分析揭示其分子异质性 | 首次对双相型鼻窦腺癌进行多模态组学表征(包括空间转录组学),揭示肿瘤内和肿瘤间的转录组异质性 | 仅报告两例病例,样本量有限,无法全面代表该类肿瘤的遗传多样性 | 阐明双相型鼻窦浆液黏液腺癌的分子特征和生物学复杂性 | 两例双相型鼻窦腺癌(嗜酸性细胞型和基底样细胞型) | 数字病理学 | 鼻窦腺癌 | 空间转录组学, 多组学分析(如HRAS/AKT1突变检测和FGFR2::SORB3融合检测) | 不适用 | 转录组数据, 基因突变数据 | 2例患者肿瘤样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组学平台用于分析肿瘤样本的转录组异质性 |
| 556 | 2026-06-02 |
Integration of Single-Cell and Spatial Transcriptomics With Experimental Validation Uncovers Macrophage Diversity and Spatial Landscape in Carotid Atherosclerosis
2026-05, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70105
PMID:42052790
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研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学与实验验证,揭示巨噬细胞多样性和空间景观在颈动脉粥样硬化中的作用 | 首次整合单细胞RNA测序、体外模型和空间转录组学,系统揭示颈动脉粥样硬化中巨噬细胞亚群的功能特征、分化轨迹及空间信号通路网络 | 未提及 | 研究颈动脉粥样硬化中巨噬细胞亚群的功能特征和调控机制 | 颈动脉粥样硬化组织中的巨噬细胞 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, 空间转录组学, 体外模型 | NA | 单细胞转录组, 空间转录组, 体外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 557 | 2026-06-02 |
Single-Cell Dissection of Malignant Cell Heterogeneity Reveals Functional Programs and Clinically Relevant Subtypes in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2026-05, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70104
PMID:42068156
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研究论文 | 通过整合58例头颈部鳞状细胞癌患者的单细胞RNA测序数据,揭示恶性细胞异质性、功能程序及临床相关亚型 | 首次系统性解析HNSCC恶性细胞异质性,鉴定12个恶性细胞亚群及其分化状态、发育轨迹和空间定位,并通过hdWGCNA和NMF识别共表达基因模块和元程序,定义三种具有不同临床预后的分子亚型(MS-1/2/3),开发了能预测预后和免疫治疗反应的25基因恶性细胞评分(MCScore) | 基于公共数据整合,缺乏独立外部验证队列;单细胞数据可能遗漏稀有细胞亚群;细胞间相互作用分析基于配体-受体预测,需实验验证 | 解析HNSCC恶性细胞异质性,构建临床相关分子亚型,开发预后和免疫治疗预测标志物 | 58例HNSCC患者的181,003个恶性细胞 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | hdWGCNA, NMF | 单细胞转录组数据, bulk RNA-seq数据 | 58例HNSCC患者(181,003个细胞) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 558 | 2026-06-02 |
Single-cell RNAseq identifies persistent epithelial and immune dysfunction in PwCF by mitigating inter-individual sampling heterogeneity
2026-May, Journal of cystic fibrosis : official journal of the European Cystic Fibrosis Society
IF:5.4Q1
DOI:10.1016/j.jcf.2026.01.009
PMID:41807181
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析囊性纤维化患者鼻腔上皮的细胞类型特异性基因表达和免疫功能障碍 | 通过单细胞转录组学揭示囊性纤维化患者鼻腔上皮的细胞类型特异性差异表达基因,并发现伴侣蛋白表达下调在低CFTR表达细胞类型中的调节作用 | 样本量较小,仅9名患者和7名健康志愿者,且未涉及下气道直接比较 | 探究囊性纤维化患者鼻腔上皮组织的细胞类型异质性及其在疾病中的影响 | 囊性纤维化患者和健康志愿者的鼻腔刮取样本 | 单细胞转录组学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、批量RNA测序数据 | 9名囊性纤维化患者和7名健康志愿者的鼻腔刮取样本,其中5名患者和5名健康志愿者有配对批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 559 | 2026-05-31 |
A gene signature derived from leukemia associated macrophages provides a compelling risk stratification for human AML patients
2026-May-29, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-026-00944-w
PMID:42210435
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研究论文 | 本研究基于FGFR1驱动的小鼠白血病模型,鉴定出白血病相关巨噬细胞(LAMs)的32个基因特征,并将其应用于人类AML患者的风险分层 | 首次利用单细胞RNA测序分析白血病相关巨噬细胞,开发出32基因特征评分系统,并将其整合到现有的欧洲白血病网风险分组标准中,为AML风险分层提供了独立的预后价值 | 未提及 | 开发一个基于白血病相关巨噬细胞基因特征的评分系统,用于急性髓系白血病患者的风险分层 | FGFR1驱动的小鼠白血病模型和838名新诊断的AML患者(接受CALGB/Alliance治疗方案) | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 838名新诊断的AML患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 560 | 2026-05-31 |
Single-cell analyses of tissue regeneration in two true jellyfish
2026-May-29, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msag128
PMID:42212572
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析两种真水母(亚洲月水母和火焰海蜇)在截肢后的钟状体组织重塑/再生过程,揭示了12个细胞类群及其标记基因和信号通路 | 首次通过单细胞RNA测序技术在两种真水母中系统描绘细胞类型图谱,鉴定出保守的转录因子和Wnt/β-catenin信号通路,并发现两种保守的序贯激活模式 | 研究侧重于基因表达层面的分析,未涉及蛋白质或代谢层面的验证;物种特异性基因的功能尚未通过实验验证 | 阐明真水母再生的分子机制和细胞类型动态变化,揭示物种特异性遗传网络的进化 | 亚洲月水母(Aurelia coerulea)和火焰海蜇(Rhopilema esculentum)的钟状体组织 | 单细胞生物学、进化发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种水母物种的钟状体组织(具体样本量未在摘要中明确提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |