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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-05-20 |
COVARE for modeling latent random effect correlations to detect genes with specific spatial expression patterns
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111242
PMID:41941898
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研究论文 | 提出COVARE方法,基于线性混合效应模型检测具有特定空间表达模式的基因,以解决现有方法忽略协变量交互作用的问题 | 首次在空间转录组分析中引入协变量交互效应,通过线性混合效应模型实现基因空间效应的无偏估计,超越传统基于协变量独立假设的方法 | 未提及方法在高通量数据或大规模组织样本上的计算效率,以及协变量交互作用选择的潜在主观性 | 开发能检测空间可变基因并考虑协变量交互效应的新方法,以精确解析复杂疾病机制和识别潜在生物标志物 | 空间转录组数据中的基因及其空间表达模式 | 数字病理学 | 未特指疾病类别 | 空间转录组学 | 线性混合效应模型 | 空间转录组数据 | 未提及具体样本数量 | 未提及 | 空间转录组学 | 未提及 | 未提及 |
| 522 | 2026-05-20 |
OMICX: An AI-powered web platform for integrative analysis of multi-condition single-cell transcriptomics data
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111243
PMID:41941899
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研究论文 | 介绍OMICX,一个由大语言模型驱动的交互式、无需编程的网络平台,用于多条件单细胞转录组数据的综合分析 | 利用大语言模型助手(OMICX-Agent)实现通过自然语言对话进行单细胞数据分析,使高级生物信息学分析对非专业用户更易用 | 未明确说明局限性 | 开发一个无需编程的智能网络平台,简化多条件单细胞转录组数据的综合分析流程 | 单细胞转录组数据、批量RNA-seq数据、GWAS汇总统计数据的集成分析案例 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, GWAS汇总统计 | 大语言模型 | 文本, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, GWAS汇总统计 | NA | NA |
| 523 | 2026-05-20 |
A Decline in Follicle Cell Function Is a Major Driver of Drosophila Ovarian Aging
2026-05, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70529
PMID:42062799
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研究论文 | 发现卵泡细胞功能下降是果蝇卵巢老化的主要驱动因素 | 首次通过单细胞RNA测序揭示卵泡细胞在卵巢老化中具有最多的差异表达基因,并证实针对卵泡细胞的遗传操作足以改善生殖老化特征 | 研究仅以果蝇为模型,结果向哺乳动物(如人类)的转化需要进一步验证;具体机制(如Atg8a调控老化的分子通路)未完全阐明 | 探究果蝇卵巢老化的细胞分子机制,特别是体细胞(卵泡细胞)在老化过程中的作用 | 果蝇卵巢中的卵泡细胞和生殖细胞 | 生物信息学 | 生殖系统老化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本量,涉及年轻与年老果蝇卵巢组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于卵巢细胞转录组分析 |
| 524 | 2026-05-20 |
High-dimensional Spatial Immune Profiling Highlights Microglia-Like Cells in Human Dorsal Root Ganglia
2026-May, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70211
PMID:42153599
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研究论文 | 使用高维度成像质谱流式技术对人类背根神经节中的免疫细胞进行空间蛋白水平表征,识别出具有小胶质细胞样特征的髓系细胞 | 首次在人类背根神经节组织中实现亚细胞分辨率下的高多重蛋白水平免疫空间图谱,并通过41种标志物组合在单细胞层面鉴定出具有典型小胶质细胞标记物(P2RY12、TMEM119、SLC2A5)的细胞亚群及其空间分布 | 该研究主要基于成像质谱流式技术,可能受到标志物选择范围的限制,且未进行功能验证实验 | 在蛋白水平上对人类背根神经节中的免疫细胞进行空间映射和表型鉴定 | 人类背根神经节中的Iba1阳性髓系细胞 | 数字病理学 | 慢性疼痛, 周围神经病变 | 成像质谱流式 | FlowSOM聚类 | 图像 | 来自人类背根神经节组织的6000多个Iba1阳性细胞 | NA | 成像质谱流式 | NA | 41种标志物组成的成像质谱流式面板 |
| 525 | 2026-05-20 |
Tumor Electric Field Therapy Inhibits Epithelial-Mesenchymal Transition, Invasion, and Migration of Glioblastoma by Targeting the c-FOS/CXCL14 Axis
2026-May, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70926
PMID:42153722
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤电场疗法通过c-FOS/CXCL14轴抑制胶质母细胞瘤上皮-间充质转化的新机制 | 首次阐明TEFT通过c-FOS/CXCL14轴调控GBM上皮-间充质转化的具体分子机制,并发现CXCL14作为间充质亚型关键标志物及其在TEFT中的靶向作用 | 未提及具体局限性 | 探究肿瘤电场疗法抑制胶质母细胞瘤上皮-间充质转化、侵袭和迁移的分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系U87、U251、T98G,以及裸鼠原位模型和临床患者标本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 集成的多组学数据分析、单细胞测序、染色质免疫沉淀 | NA | 组学数据、图像 | 多种细胞系及动物模型(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 526 | 2026-05-19 |
Platelet-neutrophil niches associate with epidermal immune activation and systemic inflammation in psoriatic disease
2026-May-18, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-026-02680-y
PMID:42144473
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研究论文 | 利用空间转录组学绘制银屑病皮损中血小板-白细胞微环境(PLNi)的分布,揭示其选择性扩增及与免疫激活和全身性炎症的关联 | 首次通过空间转录组学系统描绘银屑病中血小板-中性粒细胞微环境(PLNi)的空间分布,发现其在表皮中与树突状细胞和T细胞活化程序协调,并关联疾病严重程度 | 未明确提及局限性 | 探究血小板-中性粒细胞微环境在银屑病皮损中的空间组织及其对免疫激活和全身性炎症的贡献 | 银屑病(PsO)和特应性皮炎(AD)患者的皮损组织及外周血样本 | 空间转录组学 | 银屑病、银屑病关节炎 | 空间转录组学、外周血多组学分析 | NA | 空间转录组数据、多组学数据 | 涉及银屑病和特应性皮炎患者的样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 527 | 2026-05-19 |
Eltrombopag restores T-cell homeostasis in aplastic anemia by regulating oxidative metabolism and reactive oxygen species levels
2026-May-18, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-026-07060-7
PMID:42144489
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研究论文 | 艾曲泊帕通过调节氧化代谢和活性氧水平恢复再生障碍性贫血中T细胞稳态 | 该研究首次揭示了艾曲泊帕通过氧化代谢途径调节T细胞功能表型的新机制,证明其通过上调ENPP1和ENTPD5来降低T细胞中活性氧水平并重塑T细胞亚群组成,从而恢复T细胞稳态 | 研究仅基于小鼠模型,缺乏临床样本验证;单细胞RNA测序的样本量有限;具体信号通路及上游调控机制尚未完全阐明 | 探究艾曲泊帕是否通过氧化代谢途径调节T细胞功能表型及其在再生障碍性贫血中的免疫调节作用 | 再生障碍性贫血小鼠模型中的T细胞亚群 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序、Western blot | NA | 基因表达数据 | 不同治疗方案的再生障碍性贫血小鼠模型,具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 528 | 2026-05-19 |
Immunopathophysiology of immune checkpoint inhibitor-related pneumonitis: insights from multi-omics and immune profiling
2026-May-18, Immunological medicine
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/25785826.2026.2674327
PMID:42148869
|
综述 | 通过多组学和免疫分析揭示免疫检查点抑制剂相关肺炎的免疫病理生理机制 | 综合运用空间转录组学和成像质谱流式技术,深入解析ICI肺炎中免疫细胞互作和肺部损伤的复杂微环境 | 未提及具体局限性 | 综述免疫检查点抑制剂相关性肺炎的免疫病理生理学研究进展 | ICI肺炎患者的外周血、支气管肺泡灌洗液和肺组织 | 机器学习 | 间质性肺炎 | 空间转录组学、成像质谱流式 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 529 | 2026-05-19 |
GLP1-E2 therapy delays autoimmune diabetes in late-stage prediabetic NOD mice and potentiates low-dose anti-CD3 therapy for enhanced disease protection
2026-May-18, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-026-06750-1
PMID:42149241
|
研究论文 | 研究GLP1-E2疗法联合低剂量抗CD3抗体在晚期糖尿病前期NOD小鼠中延缓自身免疫性糖尿病的效果 | 首次证明GLP1-E2(胰高血糖素样肽-1-17β雌二醇偶联物)能增强低剂量抗CD3抗体的治疗效果,通过同时靶向免疫失调和β细胞脆弱性实现协同保护 | 研究仅在雌性NOD小鼠中进行,未在其他模型或人类中验证,且未探索最优给药方案及长期安全性 | 探究GLP1-E2联合低剂量抗CD3抗体能否通过保护β细胞和调节免疫延缓1型糖尿病进展 | 晚期糖尿病前期雌性NOD小鼠 | 机器学习 | 1型糖尿病 | 空间转录组学、免疫染色 | NA | 图像、基因表达数据 | 雌性NOD小鼠,分为四组:未治疗对照组、抗CD3单药组、GLP1-E2单药组及联合治疗组,每组具体数量未明确 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学用于胰腺组织分析 |
| 530 | 2026-05-19 |
Basp1 Intensifies Neutrophil Migration and NETs Formation in Traumatic Brain Injury
2026-May-18, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-026-05927-4
PMID:42149339
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和动物模型,揭示Basp1在创伤性脑损伤后促进中性粒细胞迁移和NETs形成的关键作用 | 首次发现Basp1特异性上调于TBI后中性粒细胞中,并通过与Vimentin直接相互作用调控细胞骨架重排,为TBI的神经炎症治疗提供新靶点 | 分子机制仍不完全明确,需进一步验证Basp1-Vimentin相互作用的详细通路;样本仅依赖小鼠模型和体外实验,临床转化需更多数据 | 阐明Basp1在中性粒细胞驱动的TBI炎症中的分子机制 | TBI患者外周血和中性粒细胞、小鼠TBI模型 | 机器学习 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、流式细胞术、谱系追踪、蛋白质对接、免疫共沉淀 | 条件敲除小鼠 | 基因表达数据 | TBI患者外周血样本(具体数量未明确)、小鼠模型(数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 531 | 2026-05-19 |
The ATF5-GPER1 axis drives female protection in hepatocellular carcinoma through dual tumor-suppressive and immune-modulatory mechanisms
2026-May-17, Bioscience trends
IF:5.7Q1
DOI:10.5582/bst.2026.01026
PMID:41850858
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研究论文 | 本研究揭示了ATF5-GPER1轴通过肿瘤抑制和免疫调节双重机制驱动肝细胞癌女性保护作用 | 首次发现ATF5-GPER1轴作为女性特异性保护回路,通过肿瘤内在抑制和免疫重塑双重机制解释肝癌性别二态性 | 未在独立大样本中验证功能机制,缺乏体内动物模型验证 | 阐明肝细胞癌性别二态性的分子机制,识别女性保护基因 | 肝细胞癌患者的转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习, 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, SVM, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 58名患者的238,982个单细胞,167例组织微阵列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 532 | 2026-05-19 |
CXCL16 promotes macrophage-driven inflammation and vascular smooth muscle cell phenotypic switching during carotid plaque destabilization
2026-May-17, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116848
PMID:42143937
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研究论文 | 本研究整合多组GEO数据集和单细胞RNA测序,发现CXCL16通过促进NF-κB依赖的巨噬细胞活化和迁移,以及增强SPP1/骨桥蛋白介导的巨噬细胞-血管平滑肌细胞(VSMC)对话,驱动颈动脉斑块失稳 | 首次整合多组GEO数据集和单细胞RNA测序,提出CXCL16作为颈动脉斑块失稳的诊断生物标志物和潜在治疗靶点,并阐明其通过NF-κB和SPP1/骨桥蛋白通路促进巨噬细胞-血管平滑肌细胞互作的分子机制 | 研究中CXCL16在颈动脉斑块中的致病机制主要基于体外和动物模型,人体中的具体调控网络仍需进一步验证 | 探究CXCL16在颈动脉斑块失稳中的作用机制及其作为诊断生物标志物和潜在治疗靶点的价值 | 颈动脉斑块样本(包括稳定和不稳定斑块)、巨噬细胞、血管平滑肌细胞 | 生物信息学 | 颈动脉粥样硬化、缺血性脑卒中 | 转录组学、单细胞RNA测序、免疫组织化学、细胞共培养、NF-κB抑制实验 | 随机森林、LASSO回归 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、人类组织标本数据 | 多组GEO数据集中的颈动脉斑块样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 533 | 2026-05-19 |
Recombinant humanized type III collagen attenuates recurrent spontaneous abortion by regulating stromal cell decidualization and reinforcing protective immune microenvironment at the maternal-fetal interface
2026-May-17, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116836
PMID:42143931
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示重组人源化III型胶原蛋白通过调节基质细胞蜕膜化和增强母胎界面保护性免疫微环境来减轻复发性自然流产 | 首次在单细胞分辨率下阐明rhCOLIII治疗复发性自然流产的机制,发现其通过激活氧化应激反应通路调控基质细胞功能,并通过APOE-TREM2和BSG-PPIA信号增强抗炎巨噬细胞活性及CD16+ NK细胞丰度 | 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的直接适用性尚需进一步验证;单细胞分析仅限于妊娠第8天,未能全面覆盖时间动态变化 | 探究rhCOLIII在复发性自然流产中的治疗潜力及其分子机制 | 人子宫内膜/蜕膜组织样本、小鼠RSA模型(CBA/J ♀ × DBA/2 ♂)的子宫组织 | 数字病理学 | 复发性自然流产 | 免疫组织化学、免疫印迹、单细胞RNA测序、多重免疫组织化学、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、免疫组化图像 | 包含健康供体/正常妊娠者和RSA患者的人类样本,以及24只小鼠(RSA组和rhCOLIII治疗组各12只,具体样本数未明确逐项列出) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 534 | 2026-05-19 |
CCL5 at the tumor-bone interface: A lymphocyte-derived gatekeeper against mandibular invasion in oral squamous cell carcinoma
2026-May-17, Oral oncology
IF:4.0Q2
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研究论文 | 探究CCL5在口腔鳞状细胞癌下颌骨侵犯中的作用及其预后价值 | 首次揭示肿瘤免疫微环境中CCL5和FoxP3表达缺失与骨侵犯的关联,并证实CCL5可作为独立预后标志物 | 未提及 | 分析CCL5与口腔鳞状细胞癌骨侵犯的预后相关性及其免疫机制 | 口腔鳞状细胞癌患者肿瘤组织及免疫微环境 | 数字病理学 | 口腔癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 病理图像 | TCGA队列327例、回顾性队列206例 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | TCGA HNSCC队列RNA-seq数据;单细胞RNA测序数据来源 |
| 535 | 2026-05-19 |
Alleviation of diabetic cardiomyopathy via preventing VCAM1-positive cells from senescence by engineered nanovesicles
2026-May-17, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04555-3
PMID:42144613
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现VCAM1阳性细胞作为糖尿病心肌病的前衰老内皮细胞群体,并设计工程化纳米囊泡靶向递送STING抑制剂以缓解疾病 | 首次鉴定VCAM1作为前衰老细胞的标志物,并利用膜脂工程改造纳米囊泡实现精准靶向递送 | 仅在糖尿病小鼠模型中验证,缺乏临床试验数据 | 探讨靶向前衰老细胞治疗糖尿病心肌病的可行性 | 糖尿病小鼠心脏中的VCAM1阳性前衰老内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 糖尿病小鼠心脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 536 | 2026-05-19 |
Nuclear factor IX promotes endometriosis progression through transcriptional activation of tetraspanin-2
2026-May-16, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-026-02665-x
PMID:42141251
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研究论文 | 本研究通过整合公共单细胞RNA测序数据和自身RNA测序数据,发现并验证了核因子IX通过转录激活四跨膜蛋白2促进子宫内膜异位症进展的机制 | 首次揭示核因子IX在子宫内膜异位症间质细胞中高表达,并通过转录调控四跨膜蛋白2促进细胞增殖和侵袭,为子宫内膜异位症治疗提供新靶点 | 本研究未提及潜在局限性 | 探究核因子IX在子宫内膜异位症进展中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 | 子宫内膜异位症间质细胞、正常子宫内膜间质细胞、子宫内膜异位症小鼠模型 | 机器学习 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,荧光素酶报告基因实验,染色质免疫沉淀实验 | NA | 基因表达数据 | 整合公共数据库与自身样本,具体数量未说明;小鼠模型实验 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 537 | 2026-05-19 |
Role of HMGB1 in tumors and its targeted therapy
2026-May-16, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2026.189612
PMID:42144084
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综述 | 总结了HMGB1在肿瘤中的角色、靶向治疗及其作为生物标志物的应用价值 | 提出了利用单细胞RNA测序、空间转录组学、实时活细胞成像等前沿技术全面研究HMGB1时空动态及其分子调控机制 | 肿瘤异质性、HMGB1双面功能及靶向技术局限性仍构成挑战 | 阐明HMGB1在肿瘤进展中的角色及靶向治疗潜力 | 肿瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞、肿瘤相关中性粒细胞、肿瘤相关成纤维细胞、T细胞 | 机器学习和数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、实时活细胞成像 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 538 | 2026-05-19 |
Islet inflammatory macrophages drive MSC loss and multiple interactions involved in β-cell adaptation during diabetes
2026-May-16, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156636
PMID:42144182
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示2型糖尿病进展中胰岛炎症巨噬细胞导致间充质干细胞丢失及β细胞适应过程中的多重相互作用 | 首次在糖尿病小鼠模型中揭示巨噬细胞与间充质干细胞之间的旁分泌串扰共同调控β细胞适应,并阐明了TNF-α介导的Wntless下调在其中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,结论在人类中的适用性尚需验证 | 探究2型糖尿病进展中非β胰岛细胞(尤其是巨噬细胞和间充质干细胞)在β细胞功能适应中的作用 | 糖尿病小鼠胰岛中的巨噬细胞、间充质干细胞和β细胞 | 单细胞转录组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 糖尿病小鼠胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 539 | 2026-05-19 |
Predicting gene-specific regulation with transcriptomic and epigenetic single-cell data
2026-May-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag299
PMID:42143610
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研究论文 | 提出MetaFR方法,利用单细胞ATAC-seq和RNA-seq数据学习基因特异性调控模型 | 提出MetaFR方法,通过高效回归树在单细胞或元细胞水平建立基因表达预测模型,运行时间和预测性能优于现有方法SCARlink | 单细胞数据固有的稀疏性使分析具有挑战性 | 研究基因特异性调控机制,利用转录组和表观遗传组单细胞数据预测基因表达 | 基因表达预测模型及调控区域 | 机器学习 | NA | 单细胞ATAC-seq、单细胞RNA-seq | 回归树 | 表观遗传数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 540 | 2026-05-19 |
A CSF disease-associated macrophage signature defines progressive multiple sclerosis
2026-May-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03861-9
PMID:42129775
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研究论文 | 本研究结合流式细胞术和单细胞转录组学,揭示了进行性多发性硬化症患者脑脊液中CD14+单核细胞增多,这些细胞呈现边界相关巨噬细胞样特征并与疾病进展相关 | 首次在脑脊液中定义与进行性多发性硬化症相关的疾病相关巨噬细胞特征,并发现这些细胞与神经退行性病变中发现的疾病相关小胶质细胞/巨噬细胞共享部分特性 | 研究为回顾性与前瞻性结合设计,样本量相对有限,且未探讨脑脊液细胞变化的因果关系 | 探究进行性多发性硬化症患者脑脊液中的细胞变化及其作为生物标志物的潜力 | 多发性硬化症患者(包括复发-缓解型和进行性型)及非炎症性对照的脑脊液细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 流式细胞术、单细胞转录组学、ELISA | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、ELISA数据 | 回顾性流式细胞术:299例(169例RRMS,56例PMS,74例对照);前瞻性单细胞转录组学:35人(11例对照,12例RRMS,12例PMS);额外阿尔茨海默病对照数据来自公开数据集 | NA | 单细胞RNA-seq、流式细胞术 | NA | NA |