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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-06-07 |
Urinary single-cell transcriptomics in kidney transplantation: Elucidation of donor-recipient cellular dynamics and fibrogenic stress
2026-May-14, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2026.05.007
PMID:42134416
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研究论文 | 通过尿液单细胞转录组学揭示肾移植中供体-受体细胞动态与纤维化应激机制 | 首次建立高质量尿液单细胞RNA测序工作流程,并通过基因型反卷积准确区分供体与受体细胞来源,为非侵入性监测肾移植排斥和纤维化提供新方法 | 样本量较小(仅12名受者),且未指定 | 探索尿液单细胞RNA测序在肾移植中捕获细胞动态和纤维化应激的可行性 | 12名不同临床状态的肾移植受者尿液样本 | 数字病理学 | 肾移植相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12名肾移植受者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 502 | 2026-06-07 |
Single-cell transcriptomics and metabolomics demonstrate that Taohe Chengqi decoction alleviates sepsis-associated acute lung injury by modulating immunometabolism
2026-May-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121283
PMID:41619860
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和代谢组学分析,揭示桃核承气汤通过调节免疫代谢缓解脓毒症相关急性肺损伤的机制 | 首次整合单细胞转录组学和代谢组学方法,系统阐明桃核承气汤通过调节糖酵解通路改善肺泡-毛细血管屏障、重塑免疫微环境治疗脓毒症相关急性肺损伤的免疫代谢机制 | 研究仅基于单批次桃核承气汤,需要多批次验证以确保结果的可重复性和临床相关性 | 探索桃核承气汤治疗脓毒症相关急性肺损伤的免疫代谢机制 | 桃核承气汤及脂多糖诱导的脓毒症相关急性肺损伤小鼠模型 | 数字病理学 | 脓毒症相关急性肺损伤 | 非靶向代谢组学, 单细胞转录组学 | NA | 代谢组学数据, 单细胞转录组数据 | 脂多糖诱导的脓毒症相关急性肺损伤小鼠模型(具体样本量未提供) | NA | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学 | NA | NA |
| 503 | 2026-06-07 |
Circulating Tumor Cells Predict Response to the DLL3-Targeting Bispecific Antibody Tarlatamab
2026-May-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1483
PMID:41532856
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研究论文 | 循环肿瘤细胞预测靶向DLL3的双特异性抗体Tarlatamab的疗效反应 | 首次利用单细胞RNA测序分析小细胞肺癌活检组织中DLL3表达的异质性,并通过循环肿瘤细胞区分患者为DLL3阳性或DLL3低表达,前瞻性队列中CTC的DLL3表达预测Tarlatamab临床获益具有高灵敏度和特异性 | 样本量较小(20例患者),未提及长期随访数据,耐药机制分析仅限于部分病例 | 评估循环肿瘤细胞上DLL3表达作为小细胞肺癌患者Tarlatamab治疗疗效预测生物标志物的可行性 | 小细胞肺癌患者 | 医学图像分析 | 小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本、图像 | 20例患者的前瞻性队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 504 | 2026-06-07 |
An integrative multi-cohort transcriptomic study reveals cell cycle- and adhesion-related hub genes as diagnostic biomarkers for pulmonary arterial hypertension
2026-May, Advances in biological regulation
DOI:10.1016/j.jbior.2026.101145
PMID:41576688
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研究论文 | 通过整合多个GEO数据集和实验验证,发现细胞周期和黏附相关关键基因CDK1、TPX2、IGF1和VCAM1可作为肺动脉高压的诊断生物标志物 | 首次综合多队列转录组分析并结合单细胞测序数据及动物模型验证,鉴定出CDK1、TPX2、IGF1和VCAM1四个关键基因作为PAH的多基因诊断标志物 | NA | 筛选并验证肺动脉高压相关关键基因作为无创诊断生物标志物 | 肺动脉高压患者血液或组织样本及尼古丁诱导的肺动脉高压小鼠模型 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 基因表达芯片、单细胞测序、RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 5个GEO数据集(GSE117261, GSE24988, GSE53408, GSE113439, GSE33463, GSE228644)及小鼠模型样本 | NA | 批量RNA-seq | NA | NA |
| 505 | 2026-06-07 |
Monocyte-derived macrophages promote retinal damage after ischemic stroke via IL-1β-dependent mechanism
2026-May, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115676
PMID:41621472
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研究论文 | 本研究利用小鼠模型证明单核细胞来源的巨噬细胞通过IL-1β依赖机制促进缺血性卒中后的视网膜损伤 | 首次阐明单核细胞来源的巨噬细胞在缺血性卒中后视网膜损伤中的关键作用及其IL-1β依赖机制 | 主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证;可能未涵盖所有潜在的免疫细胞亚型 | 探究缺血性卒中后视网膜损伤的炎症机制 | 利用中脑动脉闭塞模型模拟缺血性卒中的小鼠视网膜 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, Luminex检测 | NA | RNA测序数据, 图像数据 | 涉及小鼠样本,具体数量未在摘要中说明 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 视网膜bulk RNA测序和单细胞RNA测序使用Illumina平台 |
| 506 | 2026-06-07 |
Mosaic variants in KRAS and STAT5B associated with a mixed phenotype of 2 acquired errors of immunity
2026-May, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.018
PMID:41628732
|
研究论文 | 该文章报告了一例18岁女性患者携带KRAS和STAT5B体细胞嵌合变异,导致混合性获得性免疫缺陷的病例 | 首次报道两种不同的获得性免疫缺陷(Ras相关自身免疫性白细胞增殖性疾病和非克隆性STAT5B功能获得性疾病)共同导致混合临床表型 | NA | 研究一例携带KRAS和STAT5B功能获得性嵌合变异的独特病例,探讨其与免疫缺陷疾病的关联 | 一名18岁女性患者,患有炎症性肠病、脾肿大、血小板减少、支气管扩张、单核细胞增多和嗜酸性粒细胞增多 | 数字病理学 | 免疫缺陷疾病 | 全基因组测序、靶向扩增子测序、短读长单细胞RNA测序、长读长单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因序列数据、单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 | 1例患者的纵向血液和组织样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 短读长和长读长单细胞RNA测序 |
| 507 | 2026-06-07 |
Multi-omics identifies an epithelial-B cell cross-talk that drives functional B cell diversion in breast cancer lymph node metastasis
2026-May, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112394
PMID:41610965
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示乳腺癌淋巴结转移中上皮细胞与B细胞间的相互作用,导致B细胞功能分化 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和体内功能模型,系统描绘乳腺癌转移过程中B细胞状态和相互作用 | NA | 阐明乳腺癌淋巴结转移中B细胞的功能异质性和作用机制 | 乳腺癌原发肿瘤和转移淋巴结中的B细胞 | 机器学习和数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 测序数据, 图像数据 | 配对的原发肿瘤和转移淋巴结样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 508 | 2026-06-07 |
Depression-related chronic stress promotes ovarian cancer progression via metabolic dysfunction and IRF1-mediated immune suppression
2026-May, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106471
PMID:41605304
|
研究论文 | 探讨抑郁相关慢性应激如何通过代谢功能障碍和IRF1介导的免疫抑制促进卵巢癌进展 | 首次揭示抑郁相关慢性应激通过下调IRF1表达、重塑免疫-代谢微环境促进卵巢癌进展的机制,并提出抗抑郁药联合化疗作为潜在治疗策略 | 未明确说明 | 研究抑郁与卵巢癌进展的关系及抗抑郁药物的潜在治疗价值 | 卵巢癌患者及小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢组数据 | 卵巢癌患者样本及小鼠慢性应激模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 509 | 2026-06-07 |
scGHSOM: A Hierarchical Framework for Single-Cell Data Clustering and Visualization
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3593632
PMID:40811172
|
研究论文 | 开发了一个基于层次生长自组织映射的框架scGHSOM,用于单细胞数据的分层聚类和可视化 | 提出了显著属性识别算法以最小化簇内变异并最大化簇间变异,并引入簇特征图和簇分布图两种新可视化工具 | 仅在三个CyTOF数据集上验证性能,未在更多样化的单细胞RNA测序数据上测试 | 解决高维单细胞数据分析中的层次聚类和可视化挑战 | 单细胞数据集,包括CyTOF和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | CyTOF, 单细胞RNA测序 | 层次生长自组织映射 (GHSOM) | 高维单细胞数据 | 三个CyTOF数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 510 | 2026-06-06 |
Single-cell spatial transcriptional profiling of pancreatic ductal adenocarcinoma uncovers key immune-modulating and pro-metastatic mechanisms
2026-May-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218613
PMID:42214806
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研究论文 | 利用单细胞空间转录组学技术解析胰腺导管腺癌从原发肿瘤到肝转移的细胞动态、空间结构及分子机制,揭示免疫调节和促转移的关键机制 | 首次在匹配的原发肿瘤和肝转移样本上应用高分辨率单细胞空间转录组学,构建包含超过90万个细胞的单细胞空间图谱,识别出TREM2和MMP12巨噬细胞亚群分别驱动血管重塑和细胞外基质重组,并发现CXCL9/10细胞可增强免疫检查点阻断疗效 | 未明确说明局限性,但基于摘要推测可能包括样本量有限、动物模型与人类生物学差异、以及空间转录组学技术的分辨率限制 | 揭示胰腺导管腺癌从原发肿瘤到肝转移过程中肿瘤微环境的细胞动态、空间结构及分子机制,寻找新的免疫调节和促转移机制及治疗靶点 | 胰腺导管腺癌患者的匹配原发肿瘤和肝转移样本 | 数字病理学,机器学习 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞空间转录组学 (Xenium In Situ), 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 超过90万个细胞 | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | Xenium In Situ (5K) | Xenium In Situ (5K) 用于FFPE样本的单细胞空间转录组分析 |
| 511 | 2026-06-06 |
Targeting LRRC15 in Cancer-Associated Fibroblasts Modifies the Extracellular Matrix and Enhances Tumor Immune Responses to Suppress Lung Cancer Progression
2026-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-2871
PMID:41591362
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研究论文 | 本研究识别了LRRC15+癌症相关成纤维细胞是肺癌中肿瘤特异性的CAF亚群,并提出LRRC15作为潜在治疗靶点,通过调节细胞外基质和增强免疫应答抑制肺癌进展 | 首次提出LRRC15作为肺癌治疗靶点,并开发了靶向LRRC15和TGFβ的双特异性抗体,为靶向CAF的癌症治疗提供新策略 | 研究主要在动物模型中进行,未在人类患者中验证其疗效和安全性 | 探索LRRC15在癌症相关成纤维细胞中的作用及其作为肺癌治疗靶点的潜力 | 肺癌相关成纤维细胞(CAF)、小鼠肺癌模型 | 机器学习和数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | NA | 小鼠肺癌模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3端测序平台用于单细胞转录组分析 |
| 512 | 2026-06-06 |
Immune dysfunction contributes to comorbid depression in patients with multiple sclerosis
2026-May-15, Journal of affective disorders
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jad.2026.121253
PMID:41605342
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研究论文 | 通过整合基因组和单细胞数据,研究免疫功能障碍在多发性硬化症合并抑郁中的作用 | 首次整合GWAS和单细胞RNA测序数据,发现CD8+ T细胞介导的HLA-B限制性靶向5-HT1F受体神经元可能是MS合并抑郁的机制 | 单细胞数据样本量较小(仅4例MS患者),且未验证因果关系 | 探讨免疫功能障碍是否促进多发性硬化症合并抑郁的发病机制 | 多发性硬化症患者及抑郁患者 | 机器学习 | 多发性硬化症, 抑郁症 | GWAS, 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 4例多发性硬化症患者(2例合并抑郁,2例无抑郁)的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 513 | 2026-06-06 |
Single-cell and spatial analyses identify a glycolysis-high state driven by STOML2 in epithelial ovarian cancer
2026-May-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2026.115066
PMID:42142700
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序与空间转录组学,揭示STOML2驱动上皮性卵巢癌中糖酵解高活性恶性表型及其调控机制 | 首次通过单细胞和空间多组学联合分析,发现STOML2作为糖酵解枢纽基因通过AKT/mTOR信号通路驱动卵巢癌代谢重编程,并构建基于STOML2的预后风险模型 | 未明确STOML2直接结合靶点,体内动物模型验证尚缺,临床样本验证队列规模有限 | 阐明上皮性卵巢癌中糖酵解相关恶性上皮状态的调控机制,鉴定可干预的代谢调控枢纽 | 上皮性卵巢癌细胞(A2780和SKOV3细胞系)及临床肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, Seahorse细胞外通量分析, 蛋白质免疫印迹 | 高维加权基因共表达网络分析, 机器学习预后模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | TCGA-OV队列及多个独立GEO队列,具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 514 | 2026-06-06 |
Multi-Omics Analysis and In Vitro Experimental Validation Identify Candidate Mechanisms of Baicalein Against Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2026-May-11, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31101610
PMID:42197164
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研究论文 | 该研究通过多组学分析和体外实验验证,探讨黄芩素对抗慢性阻塞性肺疾病的潜在机制 | 创新地将多数据集转录组分析、单细胞转录组学、机器学习特征选择、孟德尔随机化、分子模拟和虚拟敲除分析等多种方法整合,用于黄芩素治疗COPD的靶点优先排序和机制探索 | 预测的以巨噬细胞为中心的机制尚需在免疫细胞和体内模型中进行专门的验证 | 阐明黄芩素治疗慢性阻塞性肺疾病的潜在机制 | 慢性阻塞性肺疾病(COPD)和黄芩素 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | 转录组学分析、单细胞转录组学、机器学习的特征选择、孟德尔随机化、分子模拟、虚拟敲除分析、体外实验 | LASSO回归、随机森林、支持向量机 | 转录组数据、单细胞转录组数据、蛋白质组数据、遗传关联数据 | 260个对照样本和250个COPD样本(来自四个整合的GEO数据集) | NA | NA | NA | NA |
| 515 | 2026-06-06 |
Beyond the Cell Atlas: Functional Communities as the Essential Pathologic Units Driving Kidney Disease
2026-May-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001023
PMID:41563353
|
综述 | 本文提出‘功能社群’概念作为肾脏疾病的关键病理单元,并探讨其临床应用价值 | 首次系统性地提出‘功能社群’作为肾脏疾病的病理单元,整合空间和多组学技术解析细胞间相互作用 | 该框架仍处于概念阶段,面临技术挑战和临床转化的关键问题 | 提出基于功能社群的新型肾脏病理认知框架并指导下一代诊疗方案开发 | 肾小管损伤修复微环境、促纤维化微环境、免疫破坏微环境等三个典型病理社群 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学、多组学技术、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
| 516 | 2026-06-06 |
Parasympathetic nerves in the kidney pelvis contribute to blood pressure regulation
2026-May, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.01.002
PMID:41565024
|
研究论文 | 本研究证实肾盂存在副交感神经支配,并揭示迷走神经肾传入通路参与血压调节 | 首次通过多标记技术确认肾盂存在交感、副交感和感觉神经的多组分支配,并利用光纤光度法检测到肾神经释放乙酰胆碱,通过光遗传学激活证实迷走神经肾传入通路可降低血压 | 未提及具体限制 | 验证肾副交感神经的功能活性及其在血压调节中的生理作用 | 小鼠肾盂的神经支配、乙酰胆碱受体表达及血压调节机制 | 神经科学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、定量逆转录聚合酶链反应、荧光原位杂交、光纤光度法、光遗传学 | NA | 基因表达数据、生理信号数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 517 | 2026-06-06 |
Longitudinal spatial transcriptomics reveals the molecular dynamics of pulmonary artery remodeling in pulmonary arterial hypertension
2026-May, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.017
PMID:41577266
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研究论文 | 首次纵向空间转录组分析揭示肺动脉高压患者肺动脉重塑的分子动态变化 | 首次对同一肺动脉高压患者间隔13年的两次肺移植样本进行纵向空间转录组分析,揭示血管病变的时间动态,并识别出与严重重塑小肺动脉相关的115个基因重塑特征及25个核心基因特征 | 仅基于一名患者的两次移植样本,样本量极小,可能限制结论的普适性 | 探究肺动脉高压中肺动脉重塑的分子动态变化,识别可用于指导靶向治疗的基因特征 | 肺动脉高压患者肺移植组织中的小动脉(20-500 µm)和大动脉(>500 µm) | 空间转录组学 | 肺动脉高压 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 1名肺动脉高压患者,两次肺移植样本(间隔13年) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 518 | 2026-06-06 |
CXCR2+ Neutrophils Drive Neutrophil Extracellular Traps Formation and Exacerbate Pulpitis in Rats: An In Vitro and In Vivo Laboratory Investigation
2026-May, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70098
PMID:41589026
|
研究论文 | 该研究通过转录组分析和单细胞RNA测序揭示了CXCR2+中性粒细胞在牙髓炎中驱动中性粒细胞胞外陷阱形成并加重炎症的机制,并评估了靶向CXCR2的治疗潜力 | 首次在牙髓炎中鉴定出CXCR2+中性粒细胞亚群作为促炎亚型,并阐明其通过巨噬细胞来源的CXCL8-CXCR2信号驱动NETs形成的机制,同时验证了CXCR2抑制剂作为免疫调节靶点的治疗潜力 | 未提及具体的局限性 | 表征牙髓炎中中性粒细胞胞外陷阱的特征及其调控机制,并评估靶向中性粒细胞亚群的治疗潜力 | 牙髓炎组织、HL-60来源的中性粒细胞、THP-1巨噬细胞、人牙髓细胞、Sprague-Dawley大鼠 | 数字病理学 | 牙髓炎 | 转录组分析、单细胞RNA测序、免疫荧光、微CT分析 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、组织样本数据 | 人类细胞系和大鼠模型(每组5只,7-8周龄雄性Sprague-Dawley大鼠) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 分析GSE92681、GSE274562、GSE280528数据集 |
| 519 | 2026-06-06 |
α -Klotho Promotes Cell Death and Suppresses Inflammation through TNF-Cellular Inhibitor of Apoptosis Protein 1 Signaling in Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease
2026-May-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000940
PMID:41563399
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研究论文 | 研究表明α-Klotho通过TNF-细胞凋亡抑制蛋白1信号通路在常染色体显性多囊肾病中促进细胞死亡并抑制炎症 | 首次阐明α-Klotho在ADPKD中通过与细胞凋亡抑制蛋白1相互作用并使其不稳定,调控TNF依赖性囊性细胞凋亡和炎症的新机制 | 未提及具体局限性 | 研究α-Klotho在常染色体显性多囊肾病中的作用及机制 | α-Klotho蛋白、Pkd1突变小鼠模型 | 机器学习 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Pkd1突变小鼠和转基因α-Klotho/Pkd1突变小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 520 | 2026-06-05 |
Oral epithelial barrier: Gatekeeper of mucosal immunity and driver of disease
2026-May-30, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2026.128568
PMID:42235250
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综述 | 探讨口腔上皮屏障作为黏膜免疫守门人和疾病驱动因子的角色,综述其在健康和疾病中的免疫调控机制 | 提出了上皮炎性记忆的新概念,即上皮干细胞和前体细胞保留过去炎症刺激的持久印记,为理解牙周炎等慢性疾病提供了新视角 | NA | 综述口腔上皮屏障在黏膜免疫和口腔炎症疾病中的核心作用及靶向治疗潜力 | 口腔黏膜上皮及其免疫调控机制 | NA | 口腔炎症性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |