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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-06-10 |
Aflatoxin B1 accelerates diabetic nephropathy progression via ITGA11/LTBP1-dependent oxidative and fibrotic pathways: Evidence from multi-omics and molecular simulations
2026-May-01, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2026.111974
PMID:41722833
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示黄曲霉毒素B1通过ITGA11/LTBP1依赖的氧化和纤维化通路加速糖尿病肾病进展 | 首次系统整合bulk转录组、单细胞转录组和空间转录组数据,结合分子模拟,阐明AFB1在糖尿病肾病中的分子机制,并优先鉴定ITGA11和LTBP1作为关键介质 | 研究基于计算分析和体外模拟,缺乏体内或临床验证实验;分子相互作用的直接实验证据有待进一步确证 | 明确黄曲霉毒素B1加快糖尿病肾病进展的相关分子通路及关键介质 | 糖尿病肾病相关转录组数据及AFB1响应分子 | 计算生物学 | 糖尿病肾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 图像, 文本 | 多队列转录组数据(具体数量未提供) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 482 | 2026-06-10 |
MIF-CD74 axis facilitates MDSC infiltration in the tumor microenvironment of pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218348
PMID:41722836
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研究论文 | 本研究探讨了MIF-CD74轴在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中促进髓系抑制细胞浸润的机制 | 首次揭示MIF-CD74轴在PDAC中驱动MDSC与CAF之间的相互作用,并鉴定出MIF CAFs为免疫抑制关键细胞群 | NA | 研究PDAC肿瘤微环境的免疫抑制特征 | 胰腺导管腺癌组织、肿瘤浸润白细胞、MDSC、CAF | NA | 胰腺导管腺癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | PDAC手术标本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 483 | 2026-06-10 |
SAD: Sparse-Aware Diffusion Model for Single-Cell Gene Expression Completion
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3674362
PMID:41838515
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research paper | 提出SAD,一种基于扩散模型的框架,用于单细胞RNA测序的基因补全,纠正稀疏性偏差,并支持超过30k基因的输入 | 首次针对scRNA-seq开创性地提出基因补全任务,并设计了专门应对极端稀疏数据的扩散模型SAD,可生成原本缺失的基因条目并纠正分布偏差 | 未明确说明,但可能涉及极端高缺失率场景下的性能边界或计算成本 | 解决单细胞RNA测序数据中基因覆盖不全和技术性零点问题,为下游任务提供可靠且一致的基因表达数据 | 单细胞RNA测序表达数据,特别是高缺失率的稀疏数据集 | 机器学习, 自然语言处理 | NA | scRNA-seq | 扩散模型(Diffusion Model) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 484 | 2026-06-10 |
Epidermal MHC-II-mediated NK cell recruitment triggers keratinocyte pyroptosis, facilitating pathogenesis of psoriasis
2026-May, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01717-z
PMID:42104015
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研究论文 | 本文研究了表皮MHC-II介导的NK细胞招募诱导角质形成细胞焦亡在银屑病发病机制中的作用 | 首次揭示表皮MHC-II通过ERK-CREB轴调控CXCL10招募NK细胞,以及NK细胞释放颗粒酶B引发GSDME阳性角质形成细胞焦亡的新机制 | 本研究主要基于小鼠模型和体外实验,未在人体样本中进行全面验证,且对MHC-II调控角质形成细胞-免疫细胞相互作用的分子机制解析尚不够深入 | 探讨银屑病发病中角质形成细胞如何招募自然杀伤细胞以及NK细胞参与炎症反应的机制 | 银屑病患者的皮肤病变组织和小鼠银屑病样皮炎模型 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未在摘要中明确说明样本量的具体数字 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 485 | 2026-06-10 |
MeCP2 regulates cell-type-specific functions of depressive-like symptoms in the nucleus accumbens
2026-May, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01721-3
PMID:42120477
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研究论文 | 本研究利用慢性束缚应激模型,揭示了MeCP2在伏隔核多巴胺D2受体神经元中的细胞类型特异性功能,及其在抑郁样症状调节中的作用 | 首次发现慢性束缚应激选择性降低伏隔核D2R神经元中的MeCP2蛋白,并通过细胞类型特异性MeCP2恢复实验证明其可减轻应激诱导的抑郁样表型及伴随的回路/转录组特征 | 腹侧苍白球的下游分子特征未解决投射特异性问题,且未进行全脑范围的分析 | 探究MeCP2在伏隔核D2R神经元中的细胞类型特异性功能及其在应激反应和抑郁中的作用机制 | 小鼠伏隔核中的D2R表达中等棘状神经元,以及腹侧苍白球区域 | 分子神经科学 | 抑郁症 | 慢性束缚应激模型、脑片电生理记录、光遗传学刺激、GeoMx数字空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 慢性束缚应激模型小鼠,具体样本数未在摘要中提及 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx数字空间转录组学用于病毒标记的NAc D2R神经元的细胞类型解析 |
| 486 | 2026-06-10 |
LoHi-SSL: A Multi-Level Synergistic Learning Model for Integrating Single-Cell Multi-Omics Data via Low- and High-Order Information Fusion
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3672503
PMID:41805524
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研究论文 | 提出一种多层级协同学习模型LoHi-SSL,通过低阶和高阶信息融合实现单细胞多组学数据高效整合 | 首次将低阶信息(图自编码器保留组学内细胞相似性)与高阶信息(超图学习捕获跨组学复杂关系)结合,并利用对比学习增强细胞分辨能力 | 未提及对大规模数据集的计算效率或超大规模细胞图谱的适用性 | 开发单细胞多组学数据整合方法以解析细胞异质性和状态转变 | 单细胞多组学数据(如不同分子层的数据集) | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 图自编码器、超图学习、对比学习 | 单细胞多组学数据 | 6个公开数据集 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 487 | 2026-06-09 |
A first-in-class bifunctional antibody targeting CD20 and CD37 remodels the immune microenvironment in relapsed or refractory B-cell malignancies
2026-May-29, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01796-5
PMID:42216090
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研究论文 | 描述了一种靶向CD20和CD37的首创双功能抗体PSB202在复发或难治性B细胞恶性肿瘤中的I期临床试验,该抗体通过重塑免疫微环境发挥抗肿瘤作用 | 首次开发靶向CD20和CD37的双功能抗体,无需T细胞参与即可耗竭恶性B细胞,可能减轻CD3相关毒性同时促进细胞毒性免疫激活 | 该研究为I期试验,样本量较小(15例患者),且未达到最大耐受剂量 | 评估双特异性抗体PSB202在复发或难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的安全性和疗效 | 复发或难治性CD20阳性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者 | 数字病理学 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例经过大量预治疗的患者,中位年龄67.7岁(范围54-78岁) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 488 | 2026-06-09 |
Single-cell transcriptomics reveals glycolytic heterogeneity and identifies STC2 as a key regulator of metabolic reprogramming in osteosarcoma
2026-May-21, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-026-05578-y
PMID:42166004
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示骨肉瘤中糖酵解异质性并确定STC2为代谢重编程的关键调控因子 | 通过整合单细胞RNA测序与hdWGCNA,首次在单细胞水平描绘骨肉瘤的代谢图谱,并发现STC2作为糖酵解相关肿瘤进展的关键调控因子,其靶向治疗可有效逆转代谢重编程 | 文中未明确提及研究局限性 | 解析骨肉瘤中糖酵解相关的细胞亚群和调控网络,探索治疗新靶点 | 骨肉瘤细胞(包括MG-63和U2OS细胞系)以及12个骨肉瘤样本的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、大容量转录组学、高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、Seahorse细胞外通量分析 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 12个骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 489 | 2026-06-09 |
Efficacy and Safety of Tunlametinib in Adults with Inoperable Neurofibromatosis Type 1-Associated Plexiform Neurofibromas: Phase IIa Trial and Biomarker Research
2026-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3291
PMID:41671075
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研究论文 | 一项IIa期试验评估Tunlametinib在成人不可手术的神经纤维瘤病1型相关丛状神经纤维瘤中的疗效和安全性,并探索相关生物标志物 | 首次在成人PN患者中评估MEK抑制剂Tunlametinib的疗效与安全性,并结合单细胞转录组分析揭示微环境异质性与治疗反应差异的关联 | 样本量小(仅15例),单臂开放标签设计可能引入偏倚,缺乏对照组,且单细胞分析仅基于少数患者(1例快速应答者和2例缓慢应答者) | 评估Tunlametinib对成人不可手术的丛状神经纤维瘤的疗效和安全性,并探索临床变量和单细胞转录组特征以解释应答异质性 | 成人不可手术且放射学上可测量的丛状神经纤维瘤患者 | 机器学习 | 神经纤维瘤病1型 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据,单细胞转录组数据 | 15名成人患者(10男5女,中位年龄27岁),其中3例预处理活检用于单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 预处理活检标本进行单细胞RNA测序以分析肿瘤微环境 |
| 490 | 2026-06-09 |
Linking Genetic Risk to Disease-Relevant Cellular States via Metacell-Informed Modeling with ICePop
2026-May-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715877
PMID:41959181
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研究论文 | 提出ICePop框架,通过元细胞分辨率整合GWAS与单细胞转录组数据,识别疾病相关细胞状态 | 首次在元细胞水平实现疾病-细胞类型关联,兼具细胞类型级方法的统计功效和单细胞级方法的异质性检测能力 | 未提及具体局限性,但可能依赖单细胞数据质量和GWAS汇总统计精度 | 开发新方法解决GWAS信号向特定细胞状态转化的挑战 | 81种人类疾病/性状与120种细胞类型 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎,自闭症谱系障碍,肺部疾病,血细胞计数相关疾病,免疫疾病 | GWAS,单细胞RNA测序 | 元细胞模型 | 基因表达数据,遗传关联数据 | Tabula Muris数据集,涵盖81种性状和120种细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 491 | 2026-06-09 |
Discovery and Evaluation of Biomarkers for Triple-Negative Breast Cancer Subtypes Uncovers Patient Stratification and Targeted Therapeutic Strategies
2026-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2758
PMID:41671401
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现基底标志物用于三阴性乳腺癌亚型分类,并鉴定达沙替尼作为潜在靶向治疗策略 | 首次利用单细胞RNA测序定义的基底身份基因对三阴性乳腺癌进行精确亚型划分,并发现TAGLN作为达沙替尼疗效的预测性生物标志物 | 未提及具体局限性 | 识别三阴性乳腺癌亚型的生物标志物,改进患者分层并发现靶向治疗方案 | 三阴性乳腺癌患者样本和细胞系 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、高通量药物筛选 | NA | 基因表达数据 | 两个独立三阴性乳腺癌队列及患者来源异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 492 | 2026-06-09 |
SOCS2 inhibits neutrophil N1 polarization to attenuate cardiomyocyte PANoptosis through HSPA8 ubiquitination in atrial fibrillation
2026-May-12, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153941
PMID:42251819
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了SOCS2通过HSPA8泛素化抑制中性粒细胞N1极化,从而减轻房颤中心肌细胞PANoptosis的机制 | 首次阐明SOCS2通过泛素化HSPA8调控中性粒细胞N1极化,进而影响心肌细胞PANoptosis在房颤中的作用 | 未提及具体局限性 | 探究房颤中免疫细胞(特别是中性粒细胞N1极化)对心肌细胞PANoptosis的调控机制及SOCS2的作用 | 房颤患者与非房颤对照者心房组织中的免疫细胞及中性粒细胞、心肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、泛素化分析 | NA | 基因表达数据 | 房颤患者与非房颤对照者心房组织(具体样本量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据库GSE224959中的单细胞RNA测序数据 |
| 493 | 2026-06-09 |
LongAllele: a joint inference framework for allele-specific analysis on long-read bulk and single-cell RNA sequencing
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.05.722992
PMID:42146353
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研究论文 | 提出一种联合推理框架LongAllele,用于长读长批量与单细胞RNA测序的等位基因特异性分析 | 通过期望最大化算法联合推断杂合变异、单倍型结构和读段-单倍型分配,并引入可定相感知测试避免假阳性 | 未提及具体局限性 | 开发统一的统计框架以全面解析顺式调控效应中的等位基因特异性表达 | 长读长RNA测序数据,包括GTEx多组织批量数据、外周血单核细胞单细胞数据和人海马体单细胞核数据 | 自然语言处理 | NA | 长读长RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据 | 多个组织(GTEx批量数据)、外周血单核细胞(单细胞)、人海马体(单细胞核) | NA | 长读长RNA-seq | NA | NA |
| 494 | 2026-06-09 |
CDCP1 Deletion Protects Against Pressure Overload-Induced Cardiac Dysfunction and Fibrosis in Mice
2026-May-08, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9236741/v1
PMID:42147194
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研究论文 | 本研究证实CDCP1缺失可通过减少成纤维细胞活化和炎症反应来保护小鼠免受压力超负荷诱导的心脏功能障碍和纤维化 | 首次在体内验证CDCP1作为心脏纤维化关键调节因子的作用,并利用空间转录组学揭示其影响成纤维细胞亚群和心肌细胞亚群的分子机制 | 未提及作用机制的完整信号通路以及从动物到人类的转化验证 | 探究CDCP1对压力超负荷诱导的心脏纤维化及功能障碍的体内调控作用 | CDCP1基因敲除小鼠模型及人体心室成纤维细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | CDCP1基因敲除小鼠模型(部分采用血管紧张素Ⅱ/苯肾上腺素诱导),以及人体心室成纤维细胞样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 495 | 2026-06-09 |
Exploring adenoid basal carcinoma to squamous cell carcinoma of the uterine cervix transformation using spatial transcriptomics
2026-May, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70036
PMID:41670056
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research paper | 使用空间转录组学探索子宫颈腺样基底细胞癌向鳞状细胞癌的转化 | 首次通过数字空间分析技术揭示了腺样基底细胞癌向鳞状细胞癌转化过程中过渡性巢的分子特征,证实了疾病谱系的存在 | 样本量有限(仅20例,其中4例用于数字空间分析),仍需更大规模研究指导临床决策 | 阐明腺样基底细胞癌与鳞状细胞癌之间的组织形态学和分子生物学关系,以指导治疗策略 | 20例腺样基底细胞癌病例,多数伴有鳞状细胞癌、过渡性巢或高级别鳞状上皮内病变亚型 | digital pathology | 子宫颈癌 | DSP, H&E, IHC | NA | image | 20例(其中4例用于数字空间分析) | NA | spatial transcriptomics | NA | 数字空间分析(Digital Spatial Profiling) |
| 496 | 2026-06-08 |
Supplementation with Lycium barbarum glycopeptide (LbGP) rescues the quality of aged oocytes
2026-May-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121318
PMID:41651042
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研究论文 | 研究了枸杞糖肽(LbGP)补充对老龄小鼠卵母细胞质量的恢复作用及其机制 | 首次发现LbGP通过同时恢复老龄卵母细胞线粒体功能和重塑卵巢微环境来延缓生殖衰老 | 具体机制尚未完全阐明 | 探究LbGP对老龄小鼠卵巢功能和卵母细胞质量的恢复作用及潜在机制 | 老龄小鼠卵母细胞和卵巢组织 | 机器学习 | 生殖衰老 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据 | 老龄小鼠(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 497 | 2026-06-08 |
Happening in the Prostate Tumor Microenvironment: Ion Channels and Extrachromosomal DNA Driving Phenotypic Plasticity
2026-May, The Prostate
DOI:10.1002/pros.70139
PMID:41632930
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综述 | 本文评估了离子通道和染色体外DNA在前列腺癌肿瘤微环境中驱动表型可塑性的证据,并分析了单细胞RNA测序数据 | 首次系统整合离子通道与染色体外DNA在前列腺癌表型可塑性中的协同作用,并通过公共单细胞数据集揭示细胞类型特异性表达模式 | 没有提供新的实验数据,依赖现有文献和两个公开数据集的分析 | 研究离子通道和染色体外DNA在前列腺癌肿瘤微环境中驱动表型可塑性和耐药性的机制 | 前列腺癌肿瘤微环境中的离子通道和染色体外DNA | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个公开可用的单细胞RNA测序数据集(原发性前列腺癌和去势抵抗性前列腺癌) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 498 | 2026-06-08 |
Adenosine A2B Receptor Promotes Tumor Progression and Metastases in Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma
2026-May-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3934
PMID:41642698
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研究论文 | 本研究利用多组学方法分析未分化多形性肉瘤(UPS)配对原发和转移肿瘤样本,发现ADORA2B促进肿瘤进展和转移的机制 | 首次发现ADORA2B作为UPS转移的关键驱动因子,并通过空间转录组学、CRISPR敲除及体内模型验证其促转移功能 | 未明确说明局限性 | 探究UPS转移的分子机制及潜在治疗靶点 | 未分化多形性肉瘤(UPS)患者的原发和转移肿瘤样本 | 机器学习 | 肉瘤 | 空间转录组学、批量RNA测序、CRISPR-Cas9敲除 | NA | 转录组数据 | 13例UPS患者的配对原发和转移肿瘤样本 | NA | 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 499 | 2026-06-08 |
Heterogeneous responses of IM19 anti-CD19 CAR T-cell therapy in refractory systemic lupus erythematosus: an open-label pilot study and a mini-review
2026-May, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.014
PMID:41644365
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研究论文 | 评估IM19抗CD19 CAR T细胞疗法治疗难治性系统性红斑狼疮的疗效和安全性,特别关注狼疮性肾炎 | 首次在难治性系统性红斑狼疮患者中评估IM19 CAR T细胞疗法的异质性反应,并通过重复肾活检和单细胞RNA测序深入分析 | 样本量小(仅6例),单臂开放标签设计,缺乏对照组,迷你综述纳入文献有限 | 评估IM19 CAR T细胞疗法在难治性系统性红斑狼疮患者中的疗效和安全性,特别是狼疮性肾炎的反应 | 难治性系统性红斑狼疮伴肾脏受累患者 | 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | CAR T细胞疗法、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6例难治性系统性红斑狼疮伴肾脏受累患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 500 | 2026-06-07 |
The GATA1 N terminus coordinates metabolic reprogramming in erythropoiesis
2026-May-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030464
PMID:41587073
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示GATA1 N末端缺失通过代谢重编程导致红细胞生成缺陷的分子机制 | 首次证明GATA1 N末端缺失通过诱导PKM启动子组蛋白乳酸化增强糖酵解通量,而不影响线粒体呼吸,并将GATA1s驱动的红细胞生成缺陷与糖酵解失调联系起来 | 未提供 | 阐明GATA1 N末端区域在红细胞生成中的分子功能 | Gata1突变胚胎的胎肝细胞和急性GATA1删除的红系细胞 | 机器学习和单细胞组学 | 唐氏综合征相关髓系白血病和戴-布二氏贫血(DBA) | 单细胞RNA测序、精准核糖体转录测序、CUT&RUN | NA | 单细胞转录组数据 | Gata1突变胚胎和DBA患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |