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当前共找到 987 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-06-17 |
A Novel Low-Dimensional Sparse and Low-Rank Representation Method for Single-Cell RNA Sequencing Data Clustering
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3674992
PMID:41843533
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研究论文 | 提出一种名为LDSLRR的新方法，通过整合降维、自表示矩阵构建和聚类过程到端到端模型中，实现单细胞RNA测序数据的精确聚类 | 将降维、自表示矩阵构建和聚类过程整合为一个端到端模型，同时优化三个模块以提高聚类准确性 | 未提及 | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 低秩表示(LRR)、稀疏约束、非负矩阵分解(NMF) | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 422 | 2026-06-17 |
Rudolf Buchheim Award 2026: Toward a ToxAtlas of carbon-based nanomaterials: single-cell RNA sequencing reveals initiating cell circuits in pulmonary inflammation
2026-May, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05170-7
PMID:41848856
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研究论文 | 该论文利用单细胞RNA测序技术构建碳基纳米材料肺部炎症起始细胞图谱 | 首次在单细胞分辨率下系统解析碳基纳米材料暴露后肺部炎症的起始事件及涉及的细胞类型，建立理化性质与细胞特异性炎症反应的关联图谱 | NA | 揭示碳基纳米材料引发呼吸道炎症的起始机制及关键细胞类型 | 碳基纳米材料（类烟尘碳纳米颗粒、柔性双壁碳纳米管、针状多壁碳纳米管）暴露的小鼠肺部细胞 | 数字病理学 | 肺部炎症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 423 | 2026-06-17 |
Defocus coding and transcriptomic remodeling in the mouse myopic retina
2026-05-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00011.2026
PMID:41910002
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研究论文 | 本研究通过全细胞记录和单细胞RNA测序，揭示了小鼠视网膜如何感知光学离焦并将其转化为调节生长的遗传信号 | 首次发现外侧视网膜的水平细胞而非内侧视网膜的AII无长突细胞对光学离焦有反应，并揭示多巴胺能无长突细胞在不同聚焦状态下受到差异性调控，以及透镜诱导近视视网膜中细胞类型特异性的基因表达重塑 | 未明确指出限制，但研究仅在小鼠模型中进行，可能不完全适用于人类；此外，透镜诱导近视模型可能不能完全模拟自然条件下近视发展的复杂性 | 探究视网膜如何感知聚焦与离焦信号，并将其转化为调控生长的遗传信号，以理解近视的视觉引导性眼球生长机制 | 小鼠视网膜细胞，包括水平细胞、AII无长突细胞、多巴胺能无长突细胞等 | 机器学习 | 近视 | 全细胞记录、单细胞RNA测序 | NA | 电生理数据、单细胞转录组数据 | 小鼠视网膜样本，具体数量在摘要中未明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 424 | 2026-06-17 |
Renal involvement in systemic sclerosis
2026-May, Best practice & research. Clinical rheumatology
DOI:10.1016/j.berh.2026.102138
PMID:41946628
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综述 | 系统综述系统性硬化症肾受累的流行病学、病理生理、临床表现、诊断与管理策略，并探讨精准医学、单细胞测序等新兴研究方向 | 整合单细胞测序、分子分型及补体靶向治疗等前沿技术，提出系统性硬化症肾受累的精准医疗新方向 | 未明确说明具体研究样本量及数据来源，可能受限于综述类型对原始数据的整合深度 | 系统性分析系统性硬化症肾受累的全方位特征，指导临床优化管理 | 系统性硬化症患者的肾并发症（包括硬皮病肾危象、肾衰竭、继发性肾损伤） | 数字病理学 | 风湿免疫病 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 425 | 2026-06-17 |
Robust Algorithm With Contrastive Learning for Identifying Spatial Domains From Noised Spatial Transcriptomics Data
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3683521
PMID:42247557
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研究论文 | 提出一种名为jNFACL的鲁棒算法，用于从含噪声的空间转录组数据中识别空间域，将去噪和识别任务同时集成 | 首次将噪声分离和空间域识别整合为统一框架，通过联合网络特征-亲和度对比学习在特征层面分离噪声，并利用自监督对比学习增强斑点特征质量 | 未明确讨论，但可能对极高噪声或复杂组织类型的适应性有限，且计算复杂度未详细分析 | 提高含噪声空间转录组数据中空间域识别的准确性和鲁棒性 | 空间转录组数据中的斑点（spots）及其对应基因表达和空间坐标 | 机器学习 | 不适用 | 空间转录组学 | 联合网络特征-亲和度对比学习框架 | 基因表达数据和空间坐标数据 | 多个平台和物种的不同噪声水平数据集 | 10x Genomics, Illumina, BGI, MGI | 空间转录组学 | 10x Visium, Illumina NovaSeq, BGI MGISEQ, MGI DNBSEQ | 10x Visium FFPE等平台的具体配置未详细说明 |
| 426 | 2026-06-16 |
DGAE: Dynamic Graph Convolutional Network for Multi-Slice Spatial Transcriptomics Alignment and Enhancement
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3682296
PMID:41950130
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研究论文 | 提出基于动态图卷积网络的多切片空间转录组学对齐与增强框架DGAE | 首次将动态图卷积神经网络用于多切片空间转录组学数据对齐和增强，通过K近邻和r半径构建混合图实现跨切片信息融合 | 未明确说明，但动态图结构可能增加计算复杂度和对超参数的敏感性 | 开发一种多切片空间转录组学数据对齐与增强的统一框架 | 多切片空间转录组学数据及其空间分布模式 | 机器学 | NA | 空间转录组学 | 动态图卷积神经网络 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 427 | 2026-06-15 |
Insights into speckled eggs provided by single-cell transcriptomics in high-yield laying hens
2026-May, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106581
PMID:41687261
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研究论文 | 利用单细胞转录组学解析高产蛋鸡斑点蛋的分子特征 | 首次通过单细胞RNA测序构建斑点蛋壳的细胞图谱，揭示不同细胞类型的分子特征及斑点组与对照组间的细胞通信差异 | 未提及 | 探究蛋壳斑点表型的遗传机制和细胞基础 | 高产蛋鸡的子宫组织 | 单细胞转录组学 | 禽类蛋壳品质问题 | 10X Genomics单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 斑点蛋率分组，每组子宫组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 428 | 2026-06-15 |
A CD57+CD8+ T cell subset links T cell cytotoxicity to fibrotic lung disease in systemic sclerosis
2026-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI194288
PMID:41701649
|
研究论文 | 本研究识别并验证了系统性硬化症相关间质性肺病中一个扩增的CD57+细胞毒性CD8+ T细胞亚群，揭示了其与肺纤维化的关联 | 首次发现CD57+效应记忆CD8+ T细胞在SSc-ILD患者中特异性扩增，并阐明CD155-CD226共刺激通路增强其细胞毒性功能 | 研究主要基于外周血样本，肺组织样本来源于独立的患者队列且未经配对外周血比较；scRNA-seq分析依赖公共数据集，未进行原位功能验证 | 揭示系统性硬化症相关间质性肺病的免疫病理机制，特别是T细胞在肺损伤中的作用 | 系统性硬化症合并间质性肺病患者的外周血T细胞和肺组织 | 免疫学 | 系统性硬化症相关间质性肺病 | 单细胞RNA测序, 免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据, 组织样本 | SSc-ILD患者外周血样本（具体数量未明确），独立患者队列的肺活检或切除标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 公共多发性ILD队列的单细胞RNA测序数据集 |
| 429 | 2026-06-15 |
ScRNA-Seq: A way to reveal the potential mechanisms of metastasis in small cell lung cancer
2026-May, Bulletin du cancer
IF:1.1Q4
DOI:10.1016/j.bulcan.2025.12.014
PMID:41760455
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在揭示小细胞肺癌转移潜在机制中的应用 | 通过单细胞测序技术揭示肿瘤细胞异质性、肿瘤微环境和细胞间通讯网络，为小细胞肺癌转移机制提供新视角 | 主要讨论当前肺癌研究中遇到的挑战，但未提供具体实验数据或解决方案 | 探讨单细胞测序技术在小细胞肺癌转移机制研究中的应用和前景 | 小细胞肺癌的转移机制 | 数字病理学 | 小细胞肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 430 | 2026-06-15 |
Hemp seed oil mediates injury mitigation and anti-inflammation in radiated splenic T cells
2026-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158004
PMID:41797188
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研究论文 | 探究大麻籽油对辐射后脾脏T细胞的损伤缓解和抗炎作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合网络药理学揭示大麻籽油通过成纤维细胞Itgb8信号促进Treg细胞分化从而缓解辐射损伤的机制 | 未提及 | 阐明大麻籽油对急性辐射损伤的防护机制 | 辐射暴露小鼠的脾脏T细胞 | 机器学习和生物信息学 | 放射性损伤 | 单细胞RNA测序、HPLC、网络药理学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 431 | 2026-03-13 |
MT2A buffering exhaustion marks cuproptosis in severe COVID-19: Multi-omics integration, computational modeling, and experimental validation
2026-May, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据、计算建模和实验验证，揭示了MT2A在严重COVID-19中通过铜缓冲耗竭触发铜死亡的作用机制 | 提出了“铜缓冲-执行失衡”假说，首次将MT2A耗竭与铜死亡联系起来，并利用单细胞转录组学、蛋白质组学和计算模拟验证了这一机制 | 研究主要基于公开数据集和小鼠模型，缺乏大规模临床样本的直接验证，且LUS放射组学作为宏观标志物的特异性有待进一步确认 | 阐明严重COVID-19中铜死亡的分子机制，并识别新的氧化还原检查点作为治疗干预靶点 | 严重COVID-19患者的外周血单核细胞、支气管肺泡灌洗液和肺组织样本，以及LPS诱导的小鼠模型 | 计算生物学 | COVID-19 | 单细胞转录组学, 蛋白质组学, 计算建模, 虚拟敲除模拟, 床边肺超声放射组学 | scTenifoldKnk, 单细胞伪时间分析 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | 三个独立数据集：GSE158055（PBMC单细胞转录组，24个基因）、GSE145926（BALF单细胞转录组，31个基因）、Nie2021（肺组织蛋白质组，26个蛋白质），以及LPS诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 432 | 2026-06-14 |
Single-Cell and Bulk Transcriptomics Uncover the Cellular Ecosystem of Vascular Invasion in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2026-May-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15111016
PMID:42274609
|
研究论文 | 通过单细胞和 bulk 转录组学揭示了肝内胆管癌中血管浸润的细胞生态系统 | 首次发现一种新型肿瘤样癌症相关成纤维细胞（tCAFs）在血管浸润阳性的肝内胆管癌中富集，并揭示缺氧-tCAFs-内皮细胞轴作为血管浸润的关键机制 | 未明确具体限制信息 | 探究肝内胆管癌中血管浸润的肿瘤微环境驱动因素及其分子机制 | 肝内胆管癌患者的肿瘤样本及临床特征 | 机器学学习，数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞 RNA 测序，bulk RNA 测序，空间转录组学，多重免疫荧光，RT-qPCR | NA | 转录组数据，空间转录组数据，图像数据 | 25 个肝内胆管癌样本 | NA | 单细胞 RNA 测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 433 | 2026-06-14 |
Transcriptomic Signature of PDGF-BB Control of Annulus Fibrosus Reveals Modulation of Inflammatory and Neurogenic Pathways
2026-May-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15111007
PMID:42274599
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了PDGF-BB对人类纤维环细胞中炎症和神经源性信号通路及细胞外基质重塑的调控作用 | 首次通过转录组分析揭示PDGF-BB在健康和退变纤维环细胞中具有上下文依赖性的转录调控作用，并发现其通过调节GPCR网络和抑制炎症-神经源性信号通路发挥抗炎效果 | 未明确提出局限性 | 研究PDGF-BB对纤维环细胞生物学的影响及其在椎间盘退变中的作用机制 | 人类纤维环细胞（健康和退变） | 转录组学 | 椎间盘退变 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 健康和退变AF细胞经PDGF-BB处理3或5天 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 使用了公开的单细胞RNA-seq数据集 |
| 434 | 2026-06-14 |
Network-Based Bioinformatics Reveal Microenvironment-Driven Cell-to-Cell Communication in the Progression of Multiple Myeloma
2026-May-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114986
PMID:42278510
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研究论文 | 基于网络生物信息学分析揭示多发性骨髓瘤进展中微环境驱动的细胞间通讯 | 开发了一个结合CellChat、NicheNet等工具的计算流程，通过微环境特异性方法重建多发性骨髓瘤进展过程中的细胞间通讯网络，并识别关键细胞节点和信号通路 | 未明确提及 | 研究多发性骨髓瘤进展中肿瘤微环境驱动的细胞间通讯模式 | 多发性骨髓瘤进展过程中肿瘤微环境中的细胞群体 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个公开的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 435 | 2026-06-14 |
Sinomenine Regulates PSMB9 to Mediate Therapeutic Effects in Rheumatoid Arthritis
2026-May-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15111005
PMID:42274598
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研究论文 | 本研究通过整合差异表达基因分析和加权基因共表达网络分析，鉴定出PSMB9为类风湿关节炎的枢纽基因，并探讨了青藤碱通过调控PSMB9发挥治疗作用的机制 | 首次将PSMB9鉴定为类风湿关节炎的潜在诊断生物标志物和治疗靶点，并揭示了青藤碱通过直接结合并降低PSMB9蛋白表达发挥抗炎作用的新机制 | 未提及 | 识别类风湿关节炎的潜在诊断生物标志物，并研究其与免疫浸润的关系及青藤碱的治疗机制 | 类风湿关节炎患者样本中的差异表达基因和免疫细胞浸润 | 机器学习 | 类风湿关节炎 | 基因表达分析、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、细胞热转变分析、Western blot | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 436 | 2026-06-14 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cellular Heterogeneity and Developmental Dynamics of Goose Satellite Cells During Embryogenesis
2026-May-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15110983
PMID:42274576
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示鹅胚胎发育过程中卫星细胞的异质性和发育动态 | 首次在鹅胚胎发育过程中对卫星细胞进行单细胞转录组分析，鉴定出三种功能状态（静息、激活、增殖/分化）及其连续线性伪时间轨迹，并揭示了细胞间通讯网络的动态变化 | 尚未提及具体局限 | 探究禽类胚胎发育过程中肌肉卫星细胞的细胞异质性和转录动态 | 鹅胚胎腿肌组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组 | 四个胚胎阶段（E13、E15、E18、E23），每阶段4个雌性胚胎的混合组织，共42,886个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 437 | 2026-06-14 |
A Dual-Gene Signature of PMAIP1 and GADD45A for Early Detection of Intrahepatic Cholangiocarcinoma in the Context of Primary Sclerosing Cholangitis
2026-May-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114826
PMID:42278359
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析识别原发性硬化性胆管炎相关肝内胆管癌的早期检测双基因标志物 | 首次提出基于背景偏差框架分析PSC相关胆管癌发生，并识别出PMAIP1和GADD45A双基因标志物用于早期检测 | 仅在内部交叉验证和外部肿瘤-邻近验证队列中验证，尚需更多独立队列验证 | 探索PSC相关胆管癌发生过程中的恶性相关决定因素，建立早期检测标志物 | 原发性硬化性胆管炎患者、肝内胆管癌肿瘤组织和癌旁组织 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归、穷举最优子集选择 | 单细胞转录组数据 | 包含PSC、ICC肿瘤组织和癌旁组织的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 438 | 2026-06-14 |
Coevolution of NK and Tumor Cell States Along Multiple Myeloma Progression from Precursor Conditions
2026-May-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114682
PMID:42278213
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研究论文 | 探讨多发性骨髓瘤从癌前状态进展过程中NK细胞与肿瘤细胞状态的协同进化 | 首次整合NK细胞功能状态与基于CRISPR筛选的血浆细胞内在易感性程序，揭示多发性骨髓瘤进展中免疫-肿瘤协同重塑的阶段性共变模式，并突出NKG2A-HLA-E轴作为关键界面 | 未明确说明局限性（需结合全文补充） | 阐明多发性骨髓瘤疾病演变过程中NK细胞状态变化及其与肿瘤细胞的免疫-肿瘤协同重塑机制 | 健康供者、意义未明的单克隆丙种球蛋白病、冒烟型多发性骨髓瘤和新诊断多发性骨髓瘤患者 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、CRISPR筛选、多参数流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康供者、MGUS、SMM和新诊断MM患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 439 | 2026-06-14 |
Integrative Multi-Omics Analysis Prioritizes Candidate Therapeutic Targets for Primary Open-Angle Glaucoma
2026-May-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114684
PMID:42278218
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，优先确定了原发性开角型青光眼的候选治疗靶点 | 首次多组学框架结合大规模血浆蛋白质组与GWAS数据，并通过跨物种单细胞图谱定位候选蛋白于常规流出通路细胞，提出SEL1L作为新型小梁网稳态靶点及TFPI作为药物重定位靶点 | 未提供明确局限性信息 | 通过整合多组学分析识别原发性开角型青光眼的候选因果蛋白和治疗靶点 | 原发性开角型青光眼患者的血浆蛋白质组数据、GWAS统计汇总、人类和小鼠眼单细胞RNA-seq图谱 | 机器学习的多组学整合 | 原发性开角型青光眼 | 蛋白质组学、全基因组关联研究、孟德尔随机化、贝叶斯共定位、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、基因组数据（GWAS统计）、单细胞转录组数据 | UK Biobank血浆蛋白质组53,022例样本及大规模POAG GWAS数据集 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | NA |
| 440 | 2026-06-14 |
State-Aware RNA Biomarkers in Triple-Negative Breast Cancer (TNBC): Integrating Tumor Plasticity, Spatial Architecture, and Temporal Monitoring
2026-May-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114692
PMID:42278225
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综述 | 综述RNA作为三阴性乳腺癌状态感知生物标志物的潜力，整合肿瘤可塑性、空间架构与时间监测 | 提出RNA（尤其是非编码RNA）作为“状态感知”标志物的概念，能捕捉静态基因组标志物无法检测的转录适应、调控阈值动态和细胞状态转换，并构建状态引导的适应性管理框架 | 未提供具体实验验证数据，主要基于现有文献推论，且RNA检测的临床部署标准和验证要求仍需进一步完善 | 论证RNA在三阴性乳腺癌中作为状态感知生物标志物的生物学合理性和临床应用前景 | 三阴性乳腺癌中的RNA分子（包括长链非编码RNA和环状RNA）及微环境组分 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序、空间转录组学、液体活检（细胞外囊泡RNA和循环肿瘤RNA） | NA | 转录组数据、空间转录组图像 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学、液体活检RNA分析 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台用于绘制RNA定义的耐药微环境，Illumina NovaSeq用于RNA测序 |