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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-07-08 |
Bispecific T-cell Engager (CD3 × EGFR)-Based Triplet Therapy Unlocks CD40/CD40L Crosstalk to Revert Immunosuppression in Third-Generation EGFR-Tyrosine Kinase Inhibitor-Refractory NSCLC
2026-May, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2026.103607
PMID:41672197
|
研究论文 | 该研究提出一种基于双特异性T细胞衔接器(CD3×EGFR)的三联疗法,通过激活CD40/CD40L通路逆转免疫抑制,以克服第三代EGFR-TKI耐药的非小细胞肺癌 | 首次将双特异性T细胞衔接器、组蛋白去乙酰化酶抑制剂和4-1BB激动剂联合应用,通过CD40-CD40L轴重新编程肿瘤微环境,解决T细胞衔接器在免疫抑制微环境中的局限性 | 样本量有限且主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;部分耐药机制尚未明确;三联疗法的长期效果和安全性需评估 | 开发新型三联疗法以恢复T细胞抗肿瘤活性,解决第三代EGFR-TKI耐药后免疫抑制问题 | 第三代EGFR-TKI耐药的非小细胞肺癌患者样本及人源化NOG-EXL小鼠模型 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 非小细胞肺癌患者临床样本及人源化小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'端测序平台 |
| 302 | 2026-07-08 |
Acinar Metaplastic Cells Generate Semi-Homogeneous Niches and Interact With Immune Cells
2026-05, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.12.014
PMID:41758082
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了胰腺腺泡化生细胞在半均匀生态位中的分布及其与免疫细胞的相互作用 | 首次发现化生细胞在病变中非随机分布,相同类型细胞倾向于聚集,并揭示了特定化生细胞亚型与免疫抑制性中性粒细胞和巨噬细胞的密切互作 | 未明确说明,但可能包括样本量有限或机制验证不足 | 探索胰腺腺泡化生细胞的异质性分布、细胞间相互作用及其与基质和免疫细胞的交叉对话 | 小鼠和人类的胰腺组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、苏木精-伊红染色 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、组织图像 | 小鼠和人类样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 303 | 2026-07-08 |
Activation of the Integrin αV-YAP-CTGF Axis in Liver Sinusoidal Endothelial Cells Promotes Liver Fibrogenesis, Leading to Portal Hypertension and Liver Carcinogenesis in Congestive Hepatopathy
2026-05, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.11.014
PMID:41758081
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了肝窦内皮细胞中整合素αV-YAP-CTGF轴在淤血性肝病中促进肝纤维化、门静脉高压和肝癌发生的机制 | 首次阐明肝窦内皮细胞中的整合素αV-YAP-CTGF轴在淤血性肝病纤维化中的上游作用,并发现CTGF在内皮细胞中的表达可诱发肝星状细胞的胶原上调 | 研究主要基于小鼠模型和少量临床样本,可能无法完全反映人类疾病的长期过程,且空间转录组学的分辨率有限 | 阐明淤血性肝病的分子机制,重点关注肝窦内皮细胞的作用 | 小鼠肝脏和人类Fontan相关肝病患者的肝脏样本 | 数字病理学 | 肝硬化, 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(部分下腔静脉结扎)和人类Fontan相关肝病患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和10x Visium空间转录组学 |
| 304 | 2026-07-08 |
Trans-Phylum Single Cell Orthology Reveals Conserved Ovarian Cell States Between Sea Urchin and Human
2026-05-01, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evag105
PMID:42037535
|
研究论文 | 通过跨门类单细胞同源性分析,揭示海胆与人类卵巢细胞状态的保守性 | 首次整合海胆成年卵巢与人类胎儿及成年卵巢单细胞RNA-seq数据集,利用SAMap分析证明跨物种卵巢细胞状态和基因表达的高度保守性 | 未明确说明,但可能包括物种间比较的局限性及数据整合方法的技术限制 | 比较海胆与人类卵巢的细胞状态,探索生殖策略差异及其对生殖衰老治疗的启示 | 海胆成年卵巢与人类胎儿和成年卵巢的单细胞RNA-seq数据 | 单细胞转录组学 | 生殖衰老 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | 海胆成年卵巢样本;人类胎儿和成年卵巢样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 305 | 2026-07-05 |
Single-cell transcriptomics reveals NDRG1/TGF‑β1 associated vascular smooth muscle cell phenotypic switching in chronic thromboembolic pulmonary hypertension
2026-May-29, Journal of thrombosis and thrombolysis
IF:2.3Q2
DOI:10.1007/s11239-026-03288-2
PMID:42213334
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研究论文 | 单细胞转录组学揭示NDRG1/TGF-β1相关的血管平滑肌细胞表型转换在慢性血栓栓塞性肺动脉高压中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合多种分析流程,系统性鉴定出NDRG1作为核心基因,驱动平滑肌细胞向成纤维细胞样表型转换,并通过TGF-β/SMAD通路促进肺血管重塑 | 样本量较小,缺乏体内实验验证,且部分分析依赖公开数据集,可能引入批次效应 | 阐明慢性血栓栓塞性肺动脉高压中平滑肌细胞表型转换的分子机制,识别潜在治疗靶点 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者和正常人的肺动脉组织,以及人肺动脉平滑肌细胞 | 机器学习 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 伪批量RNA测序 | Monocle3伪时间轨迹, hdWGCNA | 基因表达数据, 图像(Western blot、免疫荧光) | CTEPH患者和正常人肺动脉组织样本(具体数量未提供),以及HPASMCs细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 306 | 2026-07-05 |
Integrative single-cell and spatial multi-Omics analyses identify NETs-driven colon cancer subtypes with distinct metabolic features and prognostic implications
2026-May-09, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08227-6
PMID:42106773
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间多组学分析,识别NETs驱动的结肠癌亚型及其代谢特征和预后意义 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了NETs驱动的结肠癌亚型在免疫组成、代谢重编程和基因表达上的差异,并构建四基因预后模型 | 四基因预后模型的预测精度在当前阶段有限,需要进一步验证 | 探究NETs在结肠癌中的作用及其对肿瘤进展、免疫逃逸和代谢重编程的影响,并构建预后模型 | 结肠癌患者肿瘤样本中的NETs相关基因和细胞 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 多变量Cox回归, LASSO回归 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 来自TCGA和GEO的多个队列数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'端测序, 10x Visium空间转录组 |
| 307 | 2026-07-04 |
Scoring gene importance by interpreting single-cell foundation models
2026-May-27, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03112-5
PMID:42204361
|
研究论文 | 介绍SIGnature框架,通过单细胞RNA测序基础模型的归因分数评估基因功能重要性 | 首次利用单细胞基础模型的归因分数来评估基因重要性,减少技术噪声,强调调控基因,并支持跨数据集比较 | 未明确提及局限性 | 开发一个用于评分基因重要性的框架,并应用于大规模单细胞RNA测序图谱的基因集搜索和跨疾病分析 | 单细胞RNA测序数据中的基因 | 机器学习 | COVID-19, 脓毒症, 川崎病 | 单细胞RNA测序 | 基础模型 | 单细胞RNA测序数据 | 400项研究的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 308 | 2026-05-20 |
ASCL2-mediated macrophage-myofibroblast transition generates immunosuppressive CAF_7 in NSCLC bone metastases
2026-May-18, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-026-03735-1
PMID:42152025
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序、伪时间分析、调节子分析以及体内外实验,揭示ASCL2驱动的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化(MMT)生成免疫抑制性CAF_7,促进非小细胞肺癌骨转移的免疫逃逸 | 首次在非小细胞肺癌骨转移中鉴定出由ASCL2驱动的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化(MMT)生成免疫抑制性CAF_7亚群,并阐明其通过直接反式激活Il6ra促进免疫逃逸的机制,同时发现靶向ASCL2可与PD-1阻断疗法协同增强抗肿瘤效果 | 主要基于小鼠模型和体外实验,骨转移样本数量可能有限;CAF_7在人类患者中的临床相关性及治疗靶点的转化潜力需进一步验证 | 探究非小细胞肺癌骨转移中肿瘤相关巨噬细胞是否通过MMT生成免疫抑制性CAF亚群及其驱动机制,并评估靶向干预与免疫治疗的协同效应 | 非小细胞肺癌骨转移样本、小鼠骨转移模型、骨髓来源巨噬细胞、T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、伪时间分析、调节子分析、免疫荧光、流式细胞术、体外诱导分化、T细胞共培养、基因敲低/恢复、巨噬细胞耗竭/重建、体内示踪 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 人原发性肺肿瘤和骨转移样本、小鼠骨转移模型(具体样本量未在摘要中明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 309 | 2026-07-04 |
Exosomal NEAT1 from tumor stem cells induces SIRPA+ macrophages to enhance immune evasion and glioblastoma progression via upregulating the HSP90B1/STAT3 axis
2026-May-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-026-03729-z
PMID:42116089
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研究论文 | 发现肿瘤干细胞外泌体中的NEAT1通过HSP90B1/STAT3轴诱导SIRPA+巨噬细胞,促进胶质母细胞瘤的免疫逃逸和进展 | 首次揭示GSC来源的外泌体NEAT1通过稳定HSP90B1并增强其与STAT3相互作用来激活SIRPA转录,从而诱导巨噬细胞向免疫抑制表型转化 | 未充分阐明SIRPA+巨噬细胞在胶质母细胞瘤中诱导和发挥作用的确切信号通路 | 阐明SIRPA+巨噬细胞在胶质母细胞瘤中的诱导机制及其促进免疫逃逸和肿瘤进展的作用 | 胶质母细胞瘤干细胞来源的外泌体、SIRPA+巨噬细胞、肿瘤细胞和巨噬细胞的相互作用 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, qPCR, Western印迹, RIP, Co-IP, PLA, 双荧光素酶测定, ELISA, Transwell, CCK-8, 原位异种移植 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 公共单细胞RNA测序数据集(未明确样本数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 310 | 2026-07-04 |
Identification of PRRG1 as a possible molecular target of pancreatic cancer
2026-May-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08832-9
PMID:42108282
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研究论文 | 该研究探索了富含脯氨酸的γ-羧基谷氨酸蛋白1 (PRRG1) 在胰腺癌中的表达模式、生物学功能及分子机制 | 首次鉴定PRRG1作为胰腺癌潜在分子靶点,揭示KLF4转录因子调控PRRG1表达及其通过PI3K-Akt信号通路驱动肿瘤进展的机制,并发现低剂量华法林可抑制PRRG1过表达促癌作用 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型,临床样本量有限,且华法林剂量需进一步优化以平衡抗凝风险 | 明确PRRG1在胰腺癌发生发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 胰腺癌组织和细胞系(CFPAC-1、PATU-8988T)、皮下异种移植模型、免疫健全小鼠模型 | 分子生物学 | 胰腺癌 | RNA测序、单细胞测序、shRNA沉默、慢病毒过表达、免疫组化 | NA | 基因表达数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | 人胰腺癌组织样本及对应正常组织样本(具体数量未提及)、两种胰腺癌细胞系、皮下移植瘤模型小鼠 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 311 | 2026-07-04 |
NCAPD3 promotes osteosarcoma progression by modulating macrophage polarization and tumor cell proliferation
2026-May-09, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08168-0
PMID:42106714
|
研究论文 | NCAPD3通过调节巨噬细胞极化和肿瘤细胞增殖促进骨肉瘤进展 | 首次揭示NCAPD3在骨肉瘤中通过协调影响肿瘤细胞增殖和抑制巨噬细胞介导的炎症反应来促进肿瘤进展,并识别出NCAPD3⁺巨噬细胞亚群 | 未明确指出具体局限性 | 探究NCAPD3在骨肉瘤进展和肿瘤免疫微环境中的作用 | 骨肉瘤组织和细胞、巨噬细胞(RAW264.7、原代小鼠巨噬细胞、THP-1来源巨噬细胞) | 机器学习 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因敲低、通路富集分析、药物敏感性预测 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | scRNA-seq分析使用6个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 312 | 2026-07-04 |
Mesenchymal stem cell-derived extracellular vesicles attenuate liver transplantation-induced ischemia/reperfusion injury by suppressing hepatocellular complement C5 expression
2026-May-05, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04388-0
PMID:42087186
|
研究论文 | 间充质干细胞来源的细胞外囊泡通过抑制肝细胞补体C5表达减轻肝移植诱导的缺血再灌注损伤 | 首次通过单细胞多组学图谱揭示MSC-EV通过递送PTPN13抑制C5转录,阻断C5a-C5aR1通路减轻肝移植缺血再灌注损伤的机制 | 主要基于大鼠和小鼠模型,临床数据支持有限,需要进一步验证人类适用性 | 阐明MSC-EV减轻肝移植缺血再灌注损伤的机制,重点关注细胞间通讯和补体介导的炎症 | 大鼠肝移植和小鼠肝脏缺血再灌注模型 | 机器学习 | 肝移植缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 单核ATAC测序数据, 空间转录组数据 | 大鼠和小鼠肝脏样本,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 313 | 2026-07-03 |
ZNF469 drives TGF-β1/SMAD3-mediated extracellular matrix regulation in pulmonary fibrosis
2026-May-28, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2026.14165
PMID:42206677
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研究论文 | 通过整合功能与转录组方法,研究ZNF469在肺纤维化中通过TGF-β1/SMAD3轴驱动细胞外基质调控的机制 | 首次揭示ZNF469作为TGF-β1/SMAD3轴的下游转录因子在肺成纤维细胞激活及细胞外基质沉积中的关键作用,并利用CUT&RUN技术证明其直接调控胶原基因启动子 | 未在体内模型中验证ZNF469的促纤维化功能,且未阐明ZNF469与SMAD3相互作用的分子细节 | 揭示ZNF469在肺纤维化中调控成纤维细胞激活和细胞外基质沉积的转录机制 | 人类肺成纤维细胞及来自特发性肺纤维化和系统性硬化症患者的肺组织样本 | NA | 肺纤维化 | RNA-seq, CUT&RUN, 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | 转录组数据, 基因表达数据 | 来自特发性肺纤维化和系统性硬化症患者的肺组织样本(具体数量未提及) | NA | NA | NA | NA |
| 314 | 2026-07-03 |
Identification of Poor Prognosis-Associated Fibroblast Subpopulation Signature Genes Utilizing the Scissor Algorithm to Classify Colorectal Cancer Subtypes and Evaluate the Immune Landscape
2026-05-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl250363
PMID:41787974
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研究论文 | 利用Scissor算法鉴定与预后相关的成纤维细胞亚群特征基因,对结直肠癌亚型进行分类并评估免疫微环境 | 首次利用Scissor算法整合单细胞与批量转录组数据,鉴定出与结直肠癌不良预后显著相关的成纤维细胞亚群,并揭示其促转移通路激活及免疫激活但功能耗竭的特征 | 未提及具体局限性,可能包括算法依赖的数据整合质量及验证样本的有限性 | 识别与结直肠癌预后相关的成纤维细胞亚群特征基因,用于亚型分类和免疫微环境评估 | 结直肠癌成纤维细胞亚群及肿瘤微环境中的免疫细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Scissor算法 | 基因表达数据 | 从TCGA和GEO数据库整合的批量RNA-seq及单细胞RNA-seq数据 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 315 | 2026-07-03 |
Single-cell profiling identifies a pro-tumoral VCAN positive macrophage subset and defines a prognostic signature in glioblastoma
2026-May-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05166-y
PMID:42105040
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定胶质母细胞瘤中促肿瘤的VCAN阳性巨噬细胞亚群并构建预后特征 | 首次鉴定出GBM微环境中VCAN⁺巨噬细胞亚群,揭示其终末分化状态、TNF-α驱动的独特极化表型及SPP1信号介导的促肿瘤免疫抑制机制,并基于其相关基因构建有效预后模型 | 样本量较小,需更大队列和功能性验证以明确该亚群的治疗潜力和空间分布模式 | 解析胶质母细胞瘤微环境中巨噬细胞的异质性,鉴定关键亚群并建立预后模型 | 胶质母细胞瘤组织中的肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 316 | 2026-07-03 |
Combining single cell and bulk transcriptomics with Mendelian randomization identifies gut microbiota related prognostic genes and mechanisms in thyroid cancer
2026-May-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05132-8
PMID:42105187
|
研究论文 | 结合单细胞与批量转录组学及孟德尔随机化方法,鉴定甲状腺癌中与肠道菌群相关的预后基因及机制 | 首次通过整合单细胞RNA测序、批量转录组数据和孟德尔随机化分析,系统鉴定与肠道菌群相关的甲状腺癌预后基因,并揭示成纤维细胞在甲状腺癌进展中的关键作用 | 未明确提及局限性 | 鉴定与甲状腺癌及肠道菌群相关的预后基因,并探索其分子机制 | 甲状腺癌患者 | 机器学学习 | 甲状腺癌 | RNA-seq | 机器学习模型(如用于构建预后模型) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 317 | 2026-07-03 |
Integrating machine learning and single-cell sequencing to reveal the role of kinase-related genes in subtype classification and prognostic significance of lung squamous cell carcinoma
2026-May-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05168-w
PMID:42105179
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研究论文 | 通过整合机器学习和单细胞测序,揭示激酶相关基因在肺鳞癌亚型分类和预后中的作用 | 首次大规模系统探索激酶相关基因在肺鳞癌生存预后和微环境重塑中的调控功能,并构建包含四个关键激酶基因的预测模型 | 模型在训练和外部验证队列中1年、3年和5年的AUC值均在0.60左右,预测性能中等,可能存在进一步改进空间 | 研究激酶相关基因对肺鳞癌发展的影响,构建预后预测模型,为个性化治疗提供理论支持 | 肺鳞癌患者 | 机器学习和数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq,单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 转录组数据 | TCGA-LUSC队列和两个GEO外部数据集(GSE157010和GSE73403),以及单细胞RNA测序数据(GSE127465和GSE162498) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 318 | 2026-07-03 |
Super-enhancer-driven LncRNA MIR205HG promotes esophageal squamous cell carcinoma progression via glycolysis reprogramming
2026-May-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08202-1
PMID:42098726
|
研究论文 | 超级增强子驱动的长非编码RNA MIR205HG通过糖酵解重编程促进食管鳞状细胞癌进展 | 首次鉴定并表征了超级增强子驱动的lncRNA MIR205HG在食管鳞状细胞癌中的致癌作用及其通过结合PTBP3促进HIF-1α翻译和糖酵解的新机制 | 仅初步验证了MIR205HG在食管鳞状细胞癌中的作用,其在其他鳞状细胞癌中的功能及相关临床试验尚待进一步研究 | 探究超级增强子相关的长非编码RNA在食管鳞状细胞癌发生发展中的分子机制 | 食管鳞状细胞癌细胞系及患者样本 | 分子生物学 | 食管癌 | ChIP-Seq, HiChIP-Seq, ChIP-qPCR, 双荧光素酶报告基因检测, CRISPR干扰, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及体外细胞系实验、体内异种移植瘤模型及单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 319 | 2026-07-03 |
Single-cell profiling uncovers a hypoxia-vascular-immune axis underlying poor immunotherapy response in acral versus cutaneous melanoma
2026-May-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08201-2
PMID:42098765
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肢端黑色素瘤与皮肤黑色素瘤之间缺氧-血管-免疫轴差异,解释肢端黑色素瘤对免疫治疗反应较差的原因 | 首次系统性对比肢端与皮肤黑色素瘤的肿瘤微环境差异,发现RGS5+/COL3A1+周细胞与NECTIN2-TIGIT免疫抑制轴在免疫治疗抵抗中的关键作用 | 研究主要基于公开数据集,可能受到样本异质性和批次效应影响;功能验证主要依赖体外实验,缺乏体内模型验证 | 阐明肢端黑色素瘤对免疫治疗反应差的肿瘤微环境机制 | 肢端黑色素瘤、皮肤黑色素瘤及正常皮肤样本 | 机器学习, 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, qPCR, 蛋白印迹 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 31例肢端黑色素瘤、13例皮肤黑色素瘤、35例正常皮肤样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 320 | 2026-07-03 |
A pyroptosis-related molecular signature stratifies prognosis and highlights GSDMB-mediated malignancy in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-May-07, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00824-1
PMID:42098854
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研究论文 | 基于焦亡相关分子特征对肝内胆管癌进行预后分层并揭示GSDMB介导的恶性机制 | 首次构建基于焦亡相关基因(PRGs)的八基因预后模型,并整合单细胞转录组、空间转录组和磷酸化蛋白质组等多组学数据,揭示了TGF-β-GSDMB-CDH3轴在肝内胆管癌恶性进展中的新作用 | 预后模型仍需在更大规模独立队列中验证,且TGF-β-GSDMB-CDH3轴的机制研究仅在体外进行,缺乏体内动物模型和临床样本的进一步确认 | 阐明焦亡在肝内胆管癌中的临床和生物学意义,建立预后分层工具并探索潜在治疗靶点 | 肝内胆管癌患者组织样本及对应临床数据 | 机器学习和数字病理学 | 肝癌(肝内胆管癌) | 批量转录组测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学、基因组突变分析 | Lasso回归和Cox比例风险回归模型 | 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据、基因组突变数据 | 来自多个队列的肝内胆管癌患者样本,其中单细胞RNA测序包含165,236个细胞 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |