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当前共找到 991 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-06-18 |
EPHB2 drives EMT-linked vasculogenic mimicry and cervical cancer progression via an ERK-ETV4 transcriptional program
2026-May-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08300-0
PMID:42143313
|
research paper | 本研究揭示了EPHB2通过ERK-ETV4转录程序驱动宫颈癌中EMT相关的血管生成拟态和肿瘤进展 | 首次发现EPHB2作为上游调控因子，通过ERK-ETV4转录程序协调EMT和血管生成拟态，促进宫颈癌侵袭和耐药 | 机制验证主要基于体外细胞实验和异种移植模型，缺乏临床样本的大规模队列验证和更深入的信号网络解析 | 阐明EPHB2在宫颈癌血管生成拟态相关可塑性中的功能角色和分子机制 | 宫颈癌细胞系HeLa和SiHa，以及宫颈癌组织样本 | machine learning | 宫颈癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化, qRT-PCR, Western blot | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | 多个公共数据集包括GSE168244、GSE138080、TCGA-CESC、GTEx，以及一个机构的免疫组化队列 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 公共转录组数据集和单细胞RNA-seq数据 |
| 242 | 2026-06-18 |
Novel Approaches for Investigating Host Responses to HIV Infection in Ex Vivo Human Genital Tissues
2026-05, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.70240
PMID:42053961
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综述 | 综述利用离体人类生殖组织研究HIV感染宿主反应的新方法 | 聚焦空间转录组学与多重成像技术在生殖组织免疫微环境分析中的创新应用，开发定制化计算流程以整合转录组与成像数据 | 现有空间转录组学与生物成像平台仍存在分辨率限制和高成本等问题 | 揭示生殖黏膜免疫反应与结构完整性对HIV性传播易感性和慢性感染的作用机制 | 离体人类生殖组织 | 数字病理学 | 艾滋病 | 空间转录组学，多重成像 | NA | 图像， 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 243 | 2026-06-18 |
Single-Cell Characterization of Terminal States and State-Specific Transcriptional Regulatory Networks in Hepatocellular Carcinoma
2026-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71214
PMID:42186138
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据揭示肝细胞癌的终端细胞状态及其特异性转录调控网络 | 首次构建连接细胞命运动态与转录调控网络的整合框架，识别出肝细胞癌的三种终端细胞状态（免疫激活型、代谢型和增殖型），并发现每种状态由特定核心调控因子（IRF3、PPARA和JUN）调控 | 基于公开数据且主要依赖计算预测，缺乏体外或体内实验验证 | 阐明肝细胞癌肿瘤细胞沿命运轨迹状态的涌现及其转录调控机制 | 肝细胞癌中的恶性细胞及其细胞状态和转录调控网络 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | CellRank、SCENIC | 单细胞转录组数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据（具体样本量未在标题和摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2026-06-17 |
Optimized Preparation of Whole Murine Tumor-Bearing Lung Tissue for Flow Cytometry and Single-Cell RNA-Sequencing
2026-May-22, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70452
PMID:42258443
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研究论文 | 提出了一种从荷瘤小鼠肺组织中制备高质量单细胞悬液用于流式细胞术和单细胞RNA测序的优化方案 | 针对肿瘤形成过程中肺组织纤维化和异质性特点，优化了组织灌注、酶消化、机械解离等步骤，实现了>85%的细胞活性率，并有效分离tdTomato标记的肿瘤细胞 | 未提及 | 开发从健康及荷瘤小鼠肺组织中高效制备高活性单细胞悬液的标准化流程 | Kras; tdTomato报告基因小鼠模型中的健康及荷瘤肺组织 | 单细胞转录组学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | Kras; tdTomato报告基因小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 245 | 2026-06-17 |
Machine learning-based study on Xin-Pi simultaneous treatment formula via drug nanodelivery systems regulating macrophage polarization and TEAD2/PKM2 synergistic repair strategy in myocarditis
2026-May-17, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100433
PMID:42150704
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研究论文 | 利用机器学习与药物纳米递送系统研究心脾同治法通过调控巨噬细胞极化和TEAD2/PKM2协同修复策略治疗心肌炎的分子机制 | 首次系统阐明心脾同治法结合纳米载药系统通过调控巨噬细胞M1/M2极化平衡和TEAD2/PKM2代谢重编程网络修复心肌炎损伤的分子机制，并整合机器学习、单细胞测序、空间转录组学等多维技术 | 研究仅在动物模型中进行，尚需在人类队列和临床试验中验证其临床转化可行性 | 分析心脾同治方纳米载药系统通过调控巨噬细胞极化和TEAD2/PKM2信号通路治疗心肌炎的分子机制 | 心肌炎小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学, 蛋白质组学, 网络药理学 | 随机森林, 支持向量机, XGBoost | 图像, 文本 | 心肌炎小鼠模型（具体样本数未提及） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 246 | 2026-06-17 |
Spatiotemporal dynamics of adoptively transferred stem-like CD8+ T cells in the tumor microenvironment following vaccination
2026-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.12.724323
PMID:42182429
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研究论文 | 本研究开发了一种优化过继性T细胞疗法的方法，并利用空间转录组学揭示疫苗接种后干细胞样和效应CD8 T细胞在肿瘤微环境中差异介导肿瘤控制的机制 | 首次结合干细胞样CD8 T细胞过继转移与静脉疫苗接种，利用空间转录组学揭示肿瘤微环境的转录组重塑机制 | NA | 优化过继性T细胞疗法，解析干细胞样CD8 T细胞在肿瘤微环境中的空间动态调控机制 | 肿瘤特异性CD8 T细胞、肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 247 | 2026-06-17 |
Histone H3 lysine 18 lactylation-mediated SULF1 transcription promotes atherosclerosis by regulating endothelial-to-mesenchymal transition
2026-May-13, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag078
PMID:42126087
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研究论文 | 该论文研究了组蛋白H3赖氨酸18乳酰化介导的SULF1转录通过调控内皮-间充质转化促进动脉粥样硬化的机制 | 揭示了氧化应激下代谢与表观遗传通过H3K18la和HDAC3的精确串扰调控SULF1转录及EndMT的新机制 | 未提及具体限制 | 探讨SULF1在氧化应激诱导的内皮-间充质转化及动脉粥样硬化中的作用机制 | 内皮细胞、动脉粥样硬化斑块、小鼠模型 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类颈动脉粥样硬化核心样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 248 | 2026-06-17 |
δ-catenin controls layer-specific transcriptional maturation of astrocytes via Zbtb20
2026-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.12.724361
PMID:42182221
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研究论文 | 该研究鉴定了δ-连环蛋白通过Zbtb20控制星形胶质细胞层特异性转录成熟的机制 | 首次揭示δ-连环蛋白作为黏附连接组分连接细胞间相互作用与转录调控，协调神经细胞类型转录成熟，特别是星形胶质细胞的层特异性身份建立 | 未提及具体局限性 | 研究δ-连环蛋白在哺乳动物皮层回路发育中协调神经细胞类型转录成熟的机制 | δ-连环蛋白、Zbtb20转录因子、星形胶质细胞、皮层回路 | 机器学习 | 神经发育障碍 | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单核RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单核RNA测序和空间转录组学平台 |
| 249 | 2026-06-17 |
Integrating single-cell multi-omics and machine learning to reveal triaptosis heterogeneity in clear cell renal cell carcinoma
2026-May-07, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00982-3
PMID:42098870
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研究论文 | 通过整合单细胞多组学和机器学习，揭示透明细胞肾细胞癌中triaptosis异质性，并开发预后基因签名 | 首次在单细胞分辨率下描绘透明细胞肾细胞癌中triaptosis的异质性景观，结合空间转录组学和机器学习构建预后模型 | 未提及具体局限性 | 探究透明细胞肾细胞癌中triaptosis的异质性及其临床意义 | 透明细胞肾细胞癌患者样本中的单细胞、空间转录组及大块转录组数据 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序、大块转录组分析 | 机器学习 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、大块转录组数据 | 单细胞、空间转录组和大块转录组样本，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 250 | 2026-06-17 |
Loss of PINK1 impairs mitophagy and accelerates ovarian aging independent of Parkin
2026-05, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示PINK1缺失通过损害线粒体自噬加速卵巢衰老，而Parkin对卵巢生理影响甚微 | 首次发现PINK1独立于Parkin调控卵巢衰老，明确了PINK1缺失导致线粒体自噬障碍和卵巢功能衰退的机制 | 研究基于小鼠模型，尚需在人类卵巢组织中验证PINK1的作用 | 探究PINK1和Parkin在卵巢生理和衰老中的具体作用 | Pink1基因敲除小鼠和Parkin基因敲除小鼠 | 机器学 | 卵巢衰老 | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | Pink1敲除小鼠和Parkin敲除小鼠的卵巢组织样本 | NA | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 251 | 2026-06-17 |
Exploring the causal relationship between plasma proteins and obstructive sleep apnea: a study using genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing analysis, and network pharmacology
2026-May, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05087-1
PMID:41711838
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研究论文 | 通过孟德尔随机化、单细胞RNA测序和网络药理学，探索血浆蛋白与阻塞性睡眠呼吸暂停之间的因果关系 | 首次结合双向孟德尔随机化、单细胞转录组测序和网络药理学策略，系统评估血浆蛋白与阻塞性睡眠呼吸暂停的因果关系，并发现62个候选治疗靶点及潜在药物分子 | 未提及具体局限性 | 揭示血浆蛋白与阻塞性睡眠呼吸暂停的因果关系并发现潜在治疗靶点 | 阻塞性睡眠呼吸暂停患者及欧洲人群队列 | 自然语言处理 | 阻塞性睡眠呼吸暂停 | 基因组关联研究,单细胞RNA测序,分子对接模拟 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 | 血浆蛋白数据来自35559人，OSA相关数据来自芬兰生物样本库的欧洲人群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 252 | 2026-06-17 |
Environmental PET-microplastic exposure and risk of non-alcoholic fatty liver disease: An integrated computational toxicology and multi-omics study
2026-May, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05115-0
PMID:41731169
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研究论文 | 采用综合计算毒理学与多组学方法，系统阐明PET微塑料暴露与非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）之间的分子机制关联 | 首次整合网络毒理学、多组学数据和机器学习框架，系统揭示PET纳米塑料暴露与NAFLD发病机制之间的分子联系，并通过SHAP分析和单细胞转录组学识别关键基因及细胞类型特异性表达模式 | 目前公共数据库中缺乏同时包含微塑料暴露测量和转录组谱的临床队列，研究依赖于计算毒理学框架和生物信息学分析 | 阐明PET纳米塑料暴露与非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）之间的分子机制关系 | PET微塑料暴露与NAFLD的分子关联机制 | 机器学习 | 非酒精性脂肪性肝病 | 网络毒理学、多组学分析、分子对接、分子动力学模拟 | 机器学习算法（11种算法） | 多组学数据（转录组、单细胞转录组） | 训练集和独立验证集 | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2026-06-17 |
Guidelines for evaluating endothelial function in vascular tissue
2026-05-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00656.2025
PMID:41801061
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指南 | 本文提供了评估血管组织中内皮功能的指南，整合传统功能检测与现代分子方法 | 首次结合传统肌电图技术与现代组学方法（如单细胞转录组学、蛋白质组学）制定内皮功能评估的统一指南 | 未提及具体局限性，但可能面临技术整合的复杂性和不同实验室之间的标准化挑战 | 建立评估内皮功能的最佳实践，提高研究的严谨性、可重复性和发现能力 | 内皮细胞和血管组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 254 | 2026-06-17 |
A Novel Low-Dimensional Sparse and Low-Rank Representation Method for Single-Cell RNA Sequencing Data Clustering
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3674992
PMID:41843533
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研究论文 | 提出一种名为LDSLRR的新方法，通过整合降维、自表示矩阵构建和聚类过程到端到端模型中，实现单细胞RNA测序数据的精确聚类 | 将降维、自表示矩阵构建和聚类过程整合为一个端到端模型，同时优化三个模块以提高聚类准确性 | 未提及 | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 低秩表示(LRR)、稀疏约束、非负矩阵分解(NMF) | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 255 | 2026-06-17 |
Rudolf Buchheim Award 2026: Toward a ToxAtlas of carbon-based nanomaterials: single-cell RNA sequencing reveals initiating cell circuits in pulmonary inflammation
2026-May, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05170-7
PMID:41848856
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研究论文 | 该论文利用单细胞RNA测序技术构建碳基纳米材料肺部炎症起始细胞图谱 | 首次在单细胞分辨率下系统解析碳基纳米材料暴露后肺部炎症的起始事件及涉及的细胞类型，建立理化性质与细胞特异性炎症反应的关联图谱 | NA | 揭示碳基纳米材料引发呼吸道炎症的起始机制及关键细胞类型 | 碳基纳米材料（类烟尘碳纳米颗粒、柔性双壁碳纳米管、针状多壁碳纳米管）暴露的小鼠肺部细胞 | 数字病理学 | 肺部炎症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 256 | 2026-06-17 |
Defocus coding and transcriptomic remodeling in the mouse myopic retina
2026-05-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00011.2026
PMID:41910002
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研究论文 | 本研究通过全细胞记录和单细胞RNA测序，揭示了小鼠视网膜如何感知光学离焦并将其转化为调节生长的遗传信号 | 首次发现外侧视网膜的水平细胞而非内侧视网膜的AII无长突细胞对光学离焦有反应，并揭示多巴胺能无长突细胞在不同聚焦状态下受到差异性调控，以及透镜诱导近视视网膜中细胞类型特异性的基因表达重塑 | 未明确指出限制，但研究仅在小鼠模型中进行，可能不完全适用于人类；此外，透镜诱导近视模型可能不能完全模拟自然条件下近视发展的复杂性 | 探究视网膜如何感知聚焦与离焦信号，并将其转化为调控生长的遗传信号，以理解近视的视觉引导性眼球生长机制 | 小鼠视网膜细胞，包括水平细胞、AII无长突细胞、多巴胺能无长突细胞等 | 机器学习 | 近视 | 全细胞记录、单细胞RNA测序 | NA | 电生理数据、单细胞转录组数据 | 小鼠视网膜样本，具体数量在摘要中未明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 257 | 2026-06-17 |
Renal involvement in systemic sclerosis
2026-May, Best practice & research. Clinical rheumatology
DOI:10.1016/j.berh.2026.102138
PMID:41946628
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综述 | 系统综述系统性硬化症肾受累的流行病学、病理生理、临床表现、诊断与管理策略，并探讨精准医学、单细胞测序等新兴研究方向 | 整合单细胞测序、分子分型及补体靶向治疗等前沿技术，提出系统性硬化症肾受累的精准医疗新方向 | 未明确说明具体研究样本量及数据来源，可能受限于综述类型对原始数据的整合深度 | 系统性分析系统性硬化症肾受累的全方位特征，指导临床优化管理 | 系统性硬化症患者的肾并发症（包括硬皮病肾危象、肾衰竭、继发性肾损伤） | 数字病理学 | 风湿免疫病 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2026-06-17 |
Robust Algorithm With Contrastive Learning for Identifying Spatial Domains From Noised Spatial Transcriptomics Data
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3683521
PMID:42247557
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研究论文 | 提出一种名为jNFACL的鲁棒算法，用于从含噪声的空间转录组数据中识别空间域，将去噪和识别任务同时集成 | 首次将噪声分离和空间域识别整合为统一框架，通过联合网络特征-亲和度对比学习在特征层面分离噪声，并利用自监督对比学习增强斑点特征质量 | 未明确讨论，但可能对极高噪声或复杂组织类型的适应性有限，且计算复杂度未详细分析 | 提高含噪声空间转录组数据中空间域识别的准确性和鲁棒性 | 空间转录组数据中的斑点（spots）及其对应基因表达和空间坐标 | 机器学习 | 不适用 | 空间转录组学 | 联合网络特征-亲和度对比学习框架 | 基因表达数据和空间坐标数据 | 多个平台和物种的不同噪声水平数据集 | 10x Genomics, Illumina, BGI, MGI | 空间转录组学 | 10x Visium, Illumina NovaSeq, BGI MGISEQ, MGI DNBSEQ | 10x Visium FFPE等平台的具体配置未详细说明 |
| 259 | 2026-06-16 |
DGAE: Dynamic Graph Convolutional Network for Multi-Slice Spatial Transcriptomics Alignment and Enhancement
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3682296
PMID:41950130
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研究论文 | 提出基于动态图卷积网络的多切片空间转录组学对齐与增强框架DGAE | 首次将动态图卷积神经网络用于多切片空间转录组学数据对齐和增强，通过K近邻和r半径构建混合图实现跨切片信息融合 | 未明确说明，但动态图结构可能增加计算复杂度和对超参数的敏感性 | 开发一种多切片空间转录组学数据对齐与增强的统一框架 | 多切片空间转录组学数据及其空间分布模式 | 机器学 | NA | 空间转录组学 | 动态图卷积神经网络 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 260 | 2026-06-15 |
Region-Resolved Integrative Multi-Omic Characterization Reveals Diverse Tumor and Microenvironment Features of Pituitary Neuroendocrine Tumors
2026-May-12, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2026.101583
PMID:42119924
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研究论文 | 首次整合蛋白质组、代谢组和单细胞转录组的多组学分析，揭示垂体神经内分泌肿瘤海绵窦区和鞍区的区域异质性及肿瘤微环境特征 | 首次对垂体神经内分泌肿瘤的不同解剖区域（海绵窦和鞍区）进行整合多组学分析，发现海绵窦肿瘤中癌相关成纤维细胞通过IGF1-IGF1R-MAPK1轴驱动肿瘤细胞增殖，并揭示脯氨酸作为关键代谢物促进微环境重塑 | 标题与摘要未明确说明研究局限性 | 探究垂体神经内分泌肿瘤海绵窦侵袭的区域差异，揭示其分子机制和微环境特征，为精准治疗提供靶点 | 从海绵窦和鞍区获取的垂体神经内分泌肿瘤样本 | 分子生物学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 蛋白质组学, 代谢组学, 单细胞转录组测序 | NA | 蛋白质组数据, 代谢组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |