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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-05-08 |
The Emerging Role of Ly6G⁺Nur77⁺ Lung Macrophages in Type-2 Allergic Inflammation: A Comprehensive Review on Asthma Pathogenesis
2026-May-07, Current allergy and asthma reports
IF:5.4Q1
DOI:10.1007/s11882-026-01274-5
PMID:42095968
|
综述 | 本文综述了Ly6G⁺Nur77⁺肺巨噬细胞在过敏性气道炎症和哮喘发病机制中的新兴作用,并讨论了其作为新型治疗靶点的潜力 | 首次系统阐述了Ly6G⁺Nur77⁺肺巨噬细胞在哮喘中的双重角色:既作为早期哨兵启动变应原驱动的Th2反应,又通过调节性控制炎症消退,为严重和激素抵抗性哮喘的亚型特异性治疗提供了新靶点 | 本文为综述,未提供新的实验数据或原始研究结果 | 探讨Ly6G⁺Nur77⁺肺巨噬细胞在哮喘发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | Ly6G⁺Nur77⁺肺巨噬细胞 | NA | 哮喘 | 单细胞RNA测序,高维表型分析 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 202 | 2026-05-08 |
Identification of RPL4 as a biomarker associated with disulfidptosis and arachidonic acid metabolism in breast cancer
2026-May-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05087-w
PMID:42096008
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研究论文 | 本研究利用机器学习和多组学分析,鉴定RPL4为与乳腺癌中二硫化物应激诱导的细胞死亡(disulfidptosis)和花生四烯酸代谢相关的生物标志物,并建立预后模型 | 首次构建了结合二硫化物应激性死亡和花生四烯酸代谢的乳腺癌预后模型,并通过单细胞测序和分子对接鉴定了关键候选基因RPL4 | 缺乏对RPL4作为治疗靶点的实验验证,分子对接分析结果需进一步的临床前和临床研究确认 | 建立乳腺癌中二硫化物应激性死亡和花生四烯酸代谢相关的预后模型,并探索其潜在机制 | 乳腺癌 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、加权基因共表达网络分析(WGNA)、转录组差异表达分析、Cox回归、Lasso回归、分子对接 | Cox回归模型、Lasso回归模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 203 | 2026-05-08 |
Human pancreatic ductal cells from non-diabetic donors function as non-professional antigen-presenting cells upon inflammatory cytokine exposure
2026-May-07, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-026-06746-x
PMID:42096071
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研究论文 | 研究非糖尿病供体的人胰腺导管细胞在炎性细胞因子暴露下作为非专业抗原呈递细胞的功能 | 首次证明非糖尿病的人类导管细胞能够向T细胞呈递抗原,揭示了导管细胞在1型糖尿病进展中的潜在作用 | 仅限于体外实验,未在体内验证;样本来自非糖尿病供体,未直接比较糖尿病患者导管细胞的功能 | 检验导管细胞对1型糖尿病相关促炎细胞因子的反应性及其作为非专业APC的假设 | 非糖尿病尸体供体的胰腺外分泌细胞(导管细胞) | 免疫学 | 1型糖尿病 | RNA-seq,单细胞RNA-seq,流式细胞术,Western blot | NA | 基因表达数据(RNA-seq,单细胞RNA-seq) | 86名供体的单细胞RNA-seq数据集;非糖尿病尸体供体(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 204 | 2026-05-08 |
Multivariable genome-wide analysis elucidates the shared genetic architecture, immunosenescence features, and gut-origin therapeutic targets of ulcerative colitis-associated multisystem inflammation
2026-May-07, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02257-y
PMID:42096094
|
研究论文 | 通过多变量全基因组分析揭示溃疡性结肠炎相关多系统炎症的共享遗传架构、免疫衰老特征及肠道来源治疗靶点 | 首次定义溃疡性结肠炎相关多系统炎症遗传架构(UC-MIGA)并利用基因组结构方程模型(SEM)整合七种欧洲血统GWAS数据集,揭示共享遗传因子及免疫衰老与端粒功能障碍在肠外表现中的核心作用 | 样本仅限欧洲血统人群,缺乏跨种群验证;部分肠外表型的GWAS数据集规模较小可能影响统计效力;因果推断依赖孟德尔随机化需进一步实验验证 | 阐明溃疡性结肠炎相关多系统炎症的共享遗传基础、免疫衰老特征及潜在治疗靶点 | 溃疡性结肠炎及其肠外表现(深静脉血栓、强直性脊柱炎、原发性硬化性胆管炎、坏疽性脓皮病、间质性肺病、结节性红斑) | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | GWAS | 结构方程模型 | 基因组数据 | 七种欧洲血统GWAS数据集(具体样本量未在摘要中提供) | NA | NA | NA | NA |
| 205 | 2026-05-08 |
Using CRISPR barcoding as a molecular clock to capture dynamic processes at single-cell resolution
2026-05-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280915.125
PMID:42067223
|
研究论文 | 本文提出scDynaBar方法,结合CRISPR-Cas9动态条形码与单细胞测序,以分子时钟方式记录细胞动态过程 | 首次利用CRISPR条形码随时间积累突变的特性作为分子时钟,通过单细胞测序同时捕获转录组和时序信息,实现对细胞动态过程的时序追踪 | 当前方法依赖于体外系统验证,在体内复杂环境中的稳定性和普适性仍需进一步验证 | 开发能够以单细胞分辨率捕获动态生物学过程的新技术 | 小鼠胚胎干细胞和小鼠类原肠胚模型中的多种细胞类型 | 单细胞测序 | NA | CRISPR-Cas9动态条形码、单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎干细胞和小鼠类原肠胚模型中多种细胞类型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'测序平台 |
| 206 | 2026-05-08 |
Lignature provides a curated resource of ligand-induced transcriptomic signatures for signaling inference
2026-05-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281287.125
PMID:41951436
|
研究论文 | Lignature是一个包含362种人类配体诱导转录组特征的数据库,用于推断配体信号传导 | 首次系统性地构建了362种人类配体的细胞内转录组响应特征库,并整合了基因和通路层面的特征,显著扩展了现有资源(如CytoSig和ImmuneDictionary)的覆盖范围 | 论文未明确提及限制,但可能包括数据库依赖已有转录组数据集的质量和覆盖范围,以及组合调控模型需要进一步验证 | 建立配体诱导转录组特征的综合性资源,用于推断配体-受体相互作用和信号传导 | 362种人类配体的配体-受体相互作用及相关转录响应 | 机器学习 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 包含来自已发表转录组数据集的362种配体特征 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 207 | 2026-05-08 |
Schlemm's Canal Development and Implications for Glaucoma Treatment
2026-May-06, Annual review of vision science
IF:5.0Q1
|
综述 | 探讨Schlemm管在眼压调节中的发育机制及其对青光眼治疗的启示 | 结合单细胞测序技术的最新研究进展,系统阐述Schlemm管发育与房水引流的关系,并探索新的青光眼治疗策略 | Schlemm管发育调控房水引流的具体机制仍未完全阐明 | 总结Schlemm管的发育过程、功能形态及其在青光眼治疗中的潜在应用 | Schlemm管、小梁网、房水引流系统 | NA | 青光眼 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 208 | 2026-05-08 |
Single-cell RNA sequencing of intestinal Behçet's disease identifies putative pathogenic programs and potential therapeutic targets
2026-May-06, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2026.14124
PMID:42090727
|
研究论文 | 通过对肠道白塞病患者的回肠活检样本进行单细胞RNA测序,首次构建了人类肠道白塞病的单细胞转录组图谱,揭示了其潜在致病程序和可能的治疗靶点 | 首次构建了人类肠道白塞病的单细胞转录组图谱,并系统比较了其与克罗恩病的转录组差异 | 样本量较小(仅4名患者),且未对发现的致病相互作用进行功能验证 | 阐明肠道白塞病的单细胞转录组特征,识别其致病机制及潜在诊断和治疗靶点 | 4名活动性肠道白塞病患者的炎症和正常末端回肠活检标本 | 机器学习和单细胞转录组学 | 肠道白塞病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名肠道白塞病患者(炎症和正常组织配对样本),并进行整合分析(12名克罗恩病患者和6名健康对照的公开数据集) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |
| 209 | 2026-05-08 |
Multidimensional immune ecological subtyping identifies RUNX1 as a prognostic factor in uveal melanoma
2026-May-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05160-4
PMID:42091786
|
研究论文 | 通过整合bulk和单细胞转录组学,建立葡萄膜黑色素瘤的多维免疫生态分型,并鉴定RUNX1为预后因子 | 首次构建了多维免疫生态分型框架,整合了免疫活性、代谢程序、调控子状态和细胞间通讯等多维度信息,并识别出RUNX1与不良预后亚型CS1的相关性 | 关于RUNX1在CS1免疫生态状态中的作用推论基于亚型特征,尚需进一步验证 | 建立葡萄膜黑色素瘤的多维免疫生态分型系统,揭示免疫-基质相互作用及其临床意义 | 葡萄膜黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、转录组分析 | NA | 文本、基因表达数据 | 未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 210 | 2026-05-08 |
Targeting coupling of type H-like vessels and cell fate transition to delay soft tissue aging
2026-May-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72503-8
PMID:42091889
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和光片成像,揭示H型样血管浸润和Coch细胞亚群驱动软组织衰老的机制,并发现靶向H型样血管与细胞命运转变的耦联可延缓软组织衰老 | 发现软组织衰老中存在H型样血管的异常浸润以及一个衰老特异性Coch细胞亚群,并阐明其通过CXCL12和ANG2/VEGF-A信号轴驱动干细胞/祖细胞异常分化和血管入侵,为延缓软组织衰老提供新靶点 | 研究基于小鼠模型,人类软组织衰老的机制有待验证;H型样血管在其他组织中的作用及其长期干预的副作用未深入探讨 | 探究软组织衰老中血管变化与细胞命运转变的机制,寻找延缓软组织衰老的治疗靶点 | 小鼠软组织(如肌肉、皮肤等)及其中H型样血管、Coch细胞亚群、干细胞/祖细胞 | 计算机视觉, 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞转录组测序, 光片成像 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 小鼠软组织样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 211 | 2026-05-08 |
A single-cell atlas revealing cellular heterogeneity across healthy and diseased human thymus
2026-May-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72760-7
PMID:42091897
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研究论文 | 通过整合53个数据集中的453,727个细胞的单细胞RNA测序数据,构建了涵盖健康胸腺和六种病理状态的高分辨率细胞图谱 | 首次系统构建了健康及病理胸腺(包括胸腺增生和多种胸腺上皮肿瘤)的单细胞图谱,揭示了疾病特异性细胞亚群和转录程序,特别是成纤维细胞亚群和胸腺上皮细胞中的变化 | 未详细说明分析中的技术偏差或样本异质性限制,也未提及外部验证队列的适用性 | 揭示胸腺发育及病理过程中细胞异质性和转录程序,为诊断和治疗创新提供基础资源 | 健康产前、儿童和成人胸腺组织以及六种病理条件(胸腺增生和A、AB、B、C型胸腺上皮肿瘤及微结节性胸腺瘤)的细胞 | 数字病理学 | 胸腺肿瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 53个数据集共453,727个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 212 | 2026-05-08 |
Prognostic biomarkers and Hedgehog pathway activation in early prostate cancer neuroendocrine differentiation via spatial profiling
2026-May-06, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01398-x
PMID:42092131
|
研究论文 | 利用空间组学和单细胞RNA测序,揭示了早期前列腺癌神经内分泌分化的预后生物标志物及Hedgehog通路激活 | 首次通过空间分析和单细胞测序识别早期神经内分泌分化阶段的特异性标志物(FMN2、APLP1等)并揭示Hedgehog通路在早期阶段特异性激活,而在晚期下调,建立了预后风险评分 | 样本量有限(86例内分泌治疗患者),且依赖公共数据库TCGA进行外部验证,早期NED阶段标志物的功能验证仍需进一步实验 | 识别早期前列腺癌神经内分泌分化的生物标志物并阐明其分子机制 | 人类前列腺癌组织样本,涵盖从激素初治到治疗相关的神经内分泌前列腺癌的各个阶段 | 数字病理学 | 前列腺癌 | GeoMx数字空间分析、单细胞RNA测序、多组学验证 | NA | 空间基因表达数据、单细胞转录组数据 | 86例内分泌治疗患者样本及TCGA外部数据集 | NanoString | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx数字空间分析系统进行组织切片原位基因表达检测 |
| 213 | 2026-05-08 |
A network medicine framework for multi-modal data integration in therapeutic target discovery
2026-May-06, Communications chemistry
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s42004-026-02049-9
PMID:42092189
|
研究论文 | 提出一种基于网络医学的机器学习框架,整合多模态数据以发现治疗靶点 | 将网络医学与机器学习结合,整合单细胞转录组、多组学、CRISPR筛选和蛋白质互作网络等多模态数据,实现疾病特异性靶点的系统优先排序 | 临床验证仅限于体外实验,缺乏体内模型和临床试验数据支持 | 发展有效的治疗靶点发现策略以降低药物开发的高成本和失败率 | 肾透明细胞癌的潜在治疗靶点,包括ENO2和LRRK2等 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞转录组测序, CRISPR筛选, 蛋白质组学 | 网络医学模型, 机器学习模型 | 单细胞数据, 多组学数据, CRISPR筛选数据, 蛋白质互作网络数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量多组学分析 | NA | NA |
| 214 | 2026-05-08 |
Dissecting and steering cell dynamics using spatially-informed RNA velocity with veloAgent
2026-May-06, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-026-00213-w
PMID:42092184
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研究论文 | 提出veloAgent框架,结合空间信息和深度学习推断RNA速度,分析细胞动态并模拟扰动 | 首次将空间上下文整合到RNA速度推断中,通过基于智能体的模拟实现亚线性内存扩展,并包含计算机模拟扰动模块预测细胞命运调控效果 | 现有方法忽略空间上下文且难以扩展到大数据集,限制了组织结构和动态过程的洞察 | 开发一种可扩展且通用的框架,用于解析空间分辨的细胞动态并指导细胞命运调控 | 单细胞转录组数据和空间转录组数据中的细胞动态 | 深度学习, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 深度生成模型, 基于智能体的模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 215 | 2026-05-08 |
Modulation of tumor-derived exosomes and reprogramming of cancer-associated fibroblasts for colorectal cancer therapy
2026-May-06, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02661-2
PMID:42092888
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研究论文 | 探讨缺氧诱导的结直肠癌细胞外泌体通过HIF1A-AS2/miR-33/HIF-1α轴激活成纤维细胞并促进肿瘤进展的机制 | 首次发现缺氧诱导的结直肠癌外泌体中的lncRNA HIF1A-AS2通过海绵吸附miR-33,激活HIF-1α和Notch1/ERK信号通路,促进正常成纤维细胞向癌症相关成纤维细胞转化,并验证了沉默HIF1A-AS2或过表达miR-33可抑制肿瘤生长 | 基于小鼠异种移植模型,需进一步在临床样本中验证;未深入探讨外泌体递送系统的靶向性和安全性 | 阐明缺氧肿瘤外泌体在结直肠癌微环境中调控成纤维细胞重编程的分子机制,为结直肠癌治疗提供新靶点 | 结直肠癌细胞、正常组织相关成纤维细胞、癌症相关成纤维细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 涉及结直肠癌细胞系和小鼠异种移植模型,未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 216 | 2026-05-08 |
Survival Genie 2: a next-generation web server for targeted and single-cell-based survival analyses
2026-May-06, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01651-9
PMID:42092983
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研究论文 | 介绍Survival Genie 2,首个可整合用户生成单细胞数据进行生存分析的网络平台 | 首个支持用户单细胞数据整合生存分析的网络平台,可识别与预后相关的单细胞簇标志物和加权基因共表达网络模块,并解析输入为lncRNA、转录因子和配体-受体信号基因等生物相关类别 | NA | 开发新一代生存分析网络服务器,整合用户单细胞数据与公开批量测序数据集,以识别生物标志物和治疗靶点 | 来自132个数据集、53个癌症基因组项目、38种恶性肿瘤的基因表达和患者生存数据,包括成人和儿童癌症 | 生物信息学 | 癌症(多种恶性肿瘤) | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、反卷积分析 | Cox比例风险模型 | 基因表达数据、生存数据、单细胞测序数据 | 132个数据集,涵盖53个项目、38种癌症类型 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 217 | 2026-05-08 |
Clonal Lineage Tracing Reveals Distinct Invasive Subpopulations in Triple-Negative Breast Cancer
2026-May-06, Tissue engineering. Part C, Methods
DOI:10.1177/19373384261432668
PMID:42093205
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研究论文 | 结合克隆谱系追踪与单细胞RNA测序,揭示三阴性乳腺癌中驱动侵袭行为的克隆亚群及转录状态 | 首次将克隆谱系追踪平台与单细胞RNA测序结合,同时追踪侵袭性亚群的克隆身份和转录状态,发现侵袭性由预先存在的克隆亚群驱动,并存在两种不同的转录状态 | 未提及具体局限性,但基于摘要推断可能样本量有限或需要体外模型验证 | 解析三阴性乳腺癌中驱动侵袭行为的克隆和转录程序,识别稳定的克隆亚群及其动态重组机制 | 三阴性乳腺癌细胞模型中的侵袭性亚群及克隆谱系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 克隆谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 未具体说明,但涉及三阴性乳腺癌细胞模型和多次独立筛选 | 未明确 | 单细胞RNA测序 | 未明确,可能涉及10x Genomics等平台 | 克隆谱系追踪平台结合单细胞RNA测序 |
| 218 | 2026-05-08 |
Integration of Genome-Wide Association Studies With Single-Cell and Bulk Expression Quantitative Trait Locus to Identify Stroke Susceptibility Genes
2026-May-05, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.046208
PMID:42003665
|
研究论文 | 通过整合全基因组关联研究和单细胞及组织表达数量性状位点数据,识别中风易感基因 | 首次将单细胞eQTL数据与中风亚型GWAS结合,发现多种先前未检测到的细胞类型特异性因果基因,并优先考虑潜在治疗靶点 | 未明确说明,摘要中未提及具体限制 | 利用单细胞eQTL数据识别中风及其亚型的易感基因和潜在治疗靶点 | 脑部7种细胞类型的eQTL数据以及5种中风表型的GWAS数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究、表达数量性状位点分析、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、遗传变异数据 | 未明确说明,涉及GWAS数据和eQTL数据来源(如GTEx项目) | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 219 | 2026-05-08 |
Cardiomyocyte-Specific Plakophilin-2 Loss Is Sufficient to Induce Aging and Senescence of Nonmyocytes: Relevance to Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2026-May-05, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.047447
PMID:42047205
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研究论文 | 本研究探讨心肌细胞特异性Plakophilin-2缺失是否足以诱导非心肌细胞的提前衰老和促炎性衰老 | 首次将细胞衰老和提前衰老与桥粒致心律失常性心肌病联系起来 | 未在摘要中明确说明局限性 | 研究心肌细胞特异性PKP2缺失对非心肌细胞衰老和心脏整体老化的影响 | 心肌细胞特异性PKP2条件敲除小鼠 | 数字病理学 | 致心律失常性心肌病 | NA | NA | 图像、转录组数据 | 小鼠样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 220 | 2026-05-08 |
An Ad5-vectored platform generating self-assembling VLPs elicits potent mucosal immunity against influenza A virus and SARS-CoV-2
2026-May-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2519857123
PMID:42054358
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研究论文 | 开发一种基于Ad5载体的平台,通过自组装病毒样颗粒诱导针对流感病毒和SARS-CoV-2的强效黏膜免疫 | 利用EABR招募ESCRT复合物实现体内自组装病毒样颗粒,并通过鼻内给药同时激发黏膜和系统性免疫,提供针对多种呼吸道病原体的单剂量多联疫苗策略 | 未明确说明局限性 | 开发一种通用的多联黏膜疫苗平台以应对呼吸道病原体 | 流感病毒和SARS-CoV-2的病毒样颗粒疫苗 | 机器学习 | 呼吸道感染 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 未说明 | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 小鼠、狗、猫模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |