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当前共找到 987 篇文献,本页显示第 201 - 220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
201 2026-08-08
Single-cell transcriptomics unveils the immunologic landscape of anti-PD-1-associated indirect drug-induced liver injury
2026-05, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了抗PD-1相关的间接药物性肝损伤的免疫学景观,首次提供了肿瘤负荷条件下小鼠模型的肝脏微环境单细胞图谱。 首次构建了抗PD-1诱导肝损伤的肿瘤负荷小鼠模型的单细胞图谱,揭示了代谢重编程和促纤维化表型,并鉴定NETosis作为关键致病事件。 研究主要基于小鼠模型,患者样本验证有限,具体机制尚需进一步探索。 阐明抗PD-1相关间接药物性肝损伤的病理机制,特别是免疫细胞间的相互作用。 Lewis肺腺癌荷瘤小鼠的肝组织,以及用于验证的患者标本。 单细胞转录组学 药物性肝损伤 单细胞RNA测序 小鼠模型,可能涉及聚类分析等,但未明确指定具体模型(如CNN等),故输出NA 单细胞转录组数据 两只小鼠的肝组织(对照组和处理组各一只),以及有限的患者标本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
202 2026-08-03
scZGA: a novel model based on ZINB distribution and graph attention for scRNA-seq data clustering
2026-May-29, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 提出了一种基于零膨胀负二项分布和图注意力网络的单细胞RNA测序数据聚类模型scZGA 结合ZINB分布与图注意力网络,利用残差连接图自编码器保留拓扑结构,并通过自优化嵌入算法进行深度聚类 信息不足,输出NA 解决scRNA-seq数据中高丢失率和复杂细胞间关系导致的聚类挑战 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA scRNA-seq 图注意力网络、图自编码器、ZINB模型 基因表达数据 六个scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
203 2026-08-03
Decoding the role of H19 in cholestatic liver injury using snRNA-seq, spatial transcriptomics, and machine learning-based disease prediction
2026-May-29, Cell & bioscience
研究论文 本研究利用单核RNA测序和空间转录组学技术,结合机器学习模型,解析了长链非编码RNA H19在胆汁淤积性肝损伤中的作用机制 首次结合snRNA-seq、空间转录组学和机器学习预测模型,系统性揭示了H19缺失通过抑制致病性胆管细胞状态和Spp1信号通路来缓解胆汁淤积性肝损伤的机制,并开发了跨物种验证的细胞类型特异性基因预测特征 研究主要基于小鼠模型,人类数据集的验证仅限于一个公开数据集,可能限制结论的泛化性;此外,未深入探讨H19在其他细胞类型中的潜在作用 阐明H19在原发性硬化性胆管炎(PSC)相关胆汁淤积性肝损伤中的细胞和分子机制,并开发疾病预测模型 小鼠肝组织(野生型、H19敲除、Mdr2敲除、双敲除)及人类患者数据集GSE243981 数字病理学 肝胆疾病 单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学(GeoMx)、机器学习 机器学习预测模型 基因表达数据、空间转录组数据 小鼠模型:4种基因型(WT、H19KO、Mdr2KO、DKO)的肝组织;人类数据集:GSE243981 NanoString 单核RNA测序 NA NA
204 2026-08-03
Identification of RPL4 as a biomarker associated with disulfidptosis and arachidonic acid metabolism in breast cancer
2026-May-07, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞测序、加权基因共表达网络分析和转录组差异表达分析,建立乳腺癌中与二硫下垂和花生四烯酸代谢相关的预后模型,并鉴定RPL4作为潜在生物标志物 首次探讨二硫下垂与花生四烯酸代谢在乳腺癌中的关联,并基于此构建预后模型,发现RPL4作为关键候选基因,结合分子对接预测阿昔替尼与RPL4的结合关系 研究基于公共数据库和计算分析,缺乏实验验证;RPL4作为治疗靶点需要进一步的临床前和临床验证 建立乳腺癌中二硫下垂和花生四烯酸代谢相关的预后模型,并探索其潜在机制 乳腺癌患者样本及基因表达数据 机器学习 乳腺癌 scRNA-seq, WGNA, 转录组差异表达分析 Cox回归, Lasso回归 单细胞测序数据, 转录组数据, 临床数据 未明确 NA 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA NA
205 2026-08-03
Modern Mining: The Role of Single-cell RNA Sequencing in Advancing Neuroscience Research
2026-May, BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology IF:3.2Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在神经科学研究中的重要作用,强调其如何推动对大脑细胞多样性和发育程序的理解 系统性地总结了scRNA-seq在多种模式生物和人类中揭示神经细胞类型及发育轨迹方面的最新进展 未具体说明局限性 探讨scRNA-seq如何推进神经科学研究,包括理解细胞类型多样性和神经疾病机制 神经细胞和胶质细胞类型,以及斑马鱼、果蝇、小鼠和人类等模式生物 基因组学 神经系统疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未具体说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
206 2026-08-02
Diving into the transcriptional landscape of leukemic stem cells in acute myeloid leukemia at single-cell resolution
2026-May-29, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
综述 本文综述了利用单细胞RNA测序和批量RNA测序研究急性髓系白血病中白血病干细胞转录组的研究。 强调了单细胞RNA测序技术在揭示白血病干细胞异质性、细胞可塑性和代谢重编程方面的优势,并对比了诊断和治疗后样本的动态变化。 缺乏标准化的白血病干细胞鉴定标准,且需要更多临床相关时间点的纵向研究。 总结单细胞RNA测序和批量RNA测序在急性髓系白血病中研究白血病干细胞转录组的现状。 急性髓系白血病中的白血病干细胞群体。 单细胞转录组学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA 基因表达数据 27项研究 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
207 2026-08-02
An integrated peripheral immune circuit of inflammation and dysfunction underlies drug resistance in pediatric drug-resistant epilepsy
2026-May-28, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析儿童药物难治性癫痫患者、药物有效患者和健康对照的外周血单个核细胞,揭示与药物抵抗相关的免疫细胞亚群和调控网络 首次对儿童药物难治性癫痫、药物有效和健康对照的外周血单个核细胞进行单细胞RNA测序分析,识别出与药物抵抗强烈相关的VCAN+单核细胞亚群及其促炎特性 样本量较小,可能影响统计效能,导致部分结果不可靠 系统研究不同临床表型下外周血免疫细胞组成和功能的动态变化,识别导致药物难治性癫痫的重要免疫亚群和调控网络,为免疫分型、早期干预和靶向治疗提供新见解 儿童药物难治性癫痫患者、药物有效患者和健康对照的外周血单个核细胞 单细胞测序 药物难治性癫痫 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 7例(3例药物难治性癫痫、2例药物有效、2例健康对照) NA 单细胞RNA测序 NA NA
208 2026-08-02
The implications of TMSB4X in TIM3 hypermethylation and CD8+ T cell exhaustion in diffuse large B-cell lymphoma
2026-May-23, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 该研究揭示了TMSB4X在弥漫大B细胞淋巴瘤中通过影响TIM3甲基化状态调控CD8+ T细胞耗竭的机制,并评估了其临床意义 首次发现TMSB4X缺失与TIM3 3'UTR区域高甲基化相关,进而促进TIM3转录上调,连接基因突变与表观遗传调控在CD8+ T细胞耗竭中的作用 基于公共数据集和体外实验,缺乏体内验证及大规模前瞻性临床研究 阐明TMSB4X在DLBCL中调控TIM3甲基化和CD8+ T细胞耗竭的机制及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 弥漫大B细胞淋巴瘤患者的CD8+ T细胞及肿瘤组织样本 基因组学, 表观遗传学, 肿瘤免疫学 弥漫大B细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序, 免疫荧光, DNA甲基化分析, 全外显子测序, 批量RNA测序, 免疫组化 NA 单细胞转录组, 甲基化阵列, 突变数据, 批量转录组, 免疫组化图像 涉及多个DLBCL公共数据集(具体数量未在摘要中说明),并进行了免疫组化验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
209 2026-08-01
Convergent immune dysregulation in sepsis and colorectal cancer highlights plasma cells and identifies shared candidate genes
2026-May-29, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 整合脓毒症和结直肠癌的多队列批量及单细胞RNA测序数据,发现两者共享的免疫失调特征,尤其是浆细胞的异常激活,并鉴定出八个候选共享基因 首次通过跨疾病整合分析揭示脓毒症和结直肠癌在免疫失调上的趋同机制,特别是浆细胞的共同贡献,并识别出潜在的共享诊断标志物 研究主要基于公开数据集,缺乏实验验证;临床验证队列样本量小(每组仅3例) 探索脓毒症和结直肠癌共有的免疫失调机制,并识别共享的候选诊断基因 脓毒症和结直肠癌患者的外周血及肿瘤组织样本,包括批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 机器学习 脓毒症、结直肠癌 RNA-seq、单细胞RNA测序、MCP-counter、ssGSEA、WGCNA、CellChat NA 基因表达数据 多队列批量RNA-seq和scRNA-seq数据,以及独立临床scRNA-seq队列(CRC n=3,CRC伴脓毒症 n=3) NA 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
210 2026-08-01
Generation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Hepatocellular Carcinoma Organoids following Drug Treatment
2026-05-26, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 开发了一种标准化工作流程,用于肝癌类器官的药物处理及单细胞RNA测序分析 提出了一个连接类器官药物处理与下游单细胞转录组分析的综合工作流程,包含类器官复苏、扩增、处理前后单细胞测序及比较分析 未提及明显限制 深入理解肝癌细胞在药物处理前后的转录组变化,以改进治疗策略 肝癌类器官 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
211 2026-08-01
Membrane depolarization drives tumor-suppressive cell competition via hedgehog signaling activation
2026-May-25, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 本研究通过果蝇遗传学、单细胞RNA测序和哺乳动物共培养模型,揭示膜去极化通过激活Hedgehog信号通路驱动肿瘤抑制性细胞竞争 首次阐明膜电位去极化作为细胞竞争的关键驱动因素,通过稳定Smoothened激活Hedgehog信号,连接生物电调节与肿瘤监视 研究主要基于果蝇和体外哺乳动物模型,缺乏体内哺乳动物验证 探究膜电位去极化在肿瘤抑制性细胞竞争中的机制作用及其在癌症预防中的潜在治疗价值 果蝇眼上皮组织、scribble缺陷细胞克隆、Scrib耗竭的MDCK细胞 细胞生物学、癌症生物学 癌症 单细胞RNA测序、果蝇遗传学、共培养模型 NA 单细胞基因表达数据、图像数据 未明确说明,涉及果蝇组织和MDCK细胞系 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
212 2026-08-01
[Novel CD6-targeted CAR-T cell therapy for T-cell acute lymphoblastic leukemia: a safe and efficient strategy to prevent fratricide through gene editing]
2026-May-14, Zhonghua xue ye xue za zhi = Zhonghua xueyexue zazhi
研究论文 本研究针对T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)的CAR-T疗法,开发了一种新型CD6靶向且通过基因编辑防止自相残杀的策略 首次提出CD6作为T-ALL的CAR-T治疗新靶点,并利用CRISPR/Cas9基因编辑技术敲除内源性CD6,构建6KO-6CAR细胞,以同时解决 fratricide 和 off-tumor 毒性问题 该研究主要在体外和基于公共数据集进行,未涉及体内动物模型或临床试验,需进一步验证其安全性和有效性 开发一种安全有效的抗T-ALL CAR-T产品,通过识别新靶点并采用兼容的基因编辑方法,解决传统CAR-T治疗中的自相残杀和靶向肿瘤外毒性问题 T-ALL患者和健康供者的骨髓细胞,以及MOLT-4、CCRF-CEM和Jurkat等T-ALL细胞系 数字病理学 T细胞急性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),CRISPR/Cas9基因编辑 CAR-T细胞模型 图像, 文本 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
213 2026-08-01
Navigating cell maps by deep learning integration of single-cell and spatially resolved transcriptomics
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出Cell2Map,一种无监督深度学习方法,整合单细胞和空间转录组数据,以高精度将细胞映射到空间位置 采用图注意力自编码器,设计多项目标函数联合优化表达、密度和嵌入层面的相似性与距离约束,实现细胞与空间点的无监督映射 摘要中未明确提及局限性 开发一种整合单细胞和空间转录组数据的方法,以全面解析异质性空间域和细胞基因表达 小鼠小脑和海马、乳腺癌和心肌梗死数据 机器学习 乳腺癌, 心肌梗死 单细胞RNA测序, 空间转录组学 图注意力自编码器 基因表达数据, 空间转录组数据 数据集包括小鼠小脑、海马、乳腺癌、心肌梗死样本,具体数量未给出 NA NA NA NA
214 2026-08-01
Cell type-specific dissection of cell death programs during ovarian aging
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出DeepMCD,一种用于从批量RNA-seq数据中同时解卷积细胞类型比例和程序性细胞死亡组成的端到端多任务深度学习框架,并应用于卵巢衰老研究。 利用Transformer-based跨任务注意力机制,在共享的token化潜在空间中利用细胞形态学背景校准PCD预测,并通过自适应不确定性加权损失实现平衡优化,显著优于现有单任务算法。 未提及具体限制,但可能包括对批量RNA-seq数据的依赖以及计算方法的验证范围有限。 开发一种计算工具,以细胞类型特异性的方式解析卵巢衰老过程中的程序性细胞死亡程序,无需昂贵的单细胞测序。 小鼠卵巢衰老队列的批量RNA-seq数据。 机器学习 卵巢衰老 RNA-seq Transformer 基因表达数据(批量RNA-seq) 多个小鼠卵巢衰老队列(具体数量未提及) NA 批量RNA-seq NA NA
215 2026-08-01
Age-stratified treatment response in rheumatoid arthritis: a systematic review, meta-analysis, and integrated genetic and single-cell evidence implicating IL6R/TYK2 signaling
2026-May, Clinical rheumatology IF:2.9Q2
系统综述与Meta分析 本研究通过系统综述、Meta分析及整合遗传与单细胞证据,评估了晚发型类风湿关节炎(LORA)患者对DMARDs的治疗反应,并揭示了IL6R/TYK2信号通路在年龄分层治疗优化中的潜在机制 首次结合Meta分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序,系统评估LORA与YORA的治疗反应差异,并鉴定IL6R和TYK2通路为年龄分层治疗的关键分子靶点 纳入研究数量有限(12项),且存在异质性;单细胞数据仅来源于关节组织,可能未全面反映全身免疫状态 评估LORA与YORA患者对DMARDs的治疗反应差异,并探索年龄相关免疫变化对药物反应影响的分子机制,为年龄分层治疗优化提供依据 晚发型类风湿关节炎(LORA,发病年龄≥60岁)和早发型类风湿关节炎(YORA,发病年龄<60岁)患者,以及RA关节组织中的细胞群体 系统综述、遗传学、单细胞生物学 类风湿关节炎 Meta分析、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 随机效应模型、孟德尔随机化(IVW等) 临床数据、GWAS汇总统计、单细胞转录组数据 12项研究,超过5000名患者;单细胞数据包含13,979个细胞 NA 单细胞RNA测序 GSE299518 RA关节组织(软骨、半月板、滑膜)的单细胞RNA测序数据,来自GEO数据库
216 2026-07-28
Exploratory multiomics analysis identifies WDR17 as a potential biomarker of tyrosine kinase inhibitor resistance in lung adenocarcinoma
2026-May-28, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 探索性多组学分析确定WDR17作为肺腺癌酪氨酸激酶抑制剂耐药性的潜在生物标志物 首次利用TCGA和单细胞转录组数据识别WDR17与肺腺癌TKI耐药性相关,并在体外实验中验证其增强克唑替尼敏感性的功能 样本量有限(仅8例TCGA LUAD患者),且缺乏大规模独立队列验证 鉴定与肺腺癌TKI耐药性相关的紊乱基因,揭示潜在机制 肺腺癌患者肿瘤样本及TKI耐药细胞系 机器学习 肺癌 RNA测序,单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 8例TCGA LUAD患者(RNA-seq数据分析),TKI耐药细胞系(体外实验) Illumina 批量RNA测序,单细胞RNA测序 NA NA
217 2026-07-28
PAX4 R192H variant impairs β cell function by disrupting β cell identity and compensatory capacity in response to metabolic stress
2026-May-28, Genome medicine IF:10.4Q1
research paper 研究PAX4 R192H变异通过破坏β细胞身份和代谢应激下的代偿能力导致β细胞功能障碍的机制 首次在PAX4 R192H敲入小鼠模型中结合代谢表型分析、批量与单细胞转录组学及14年人类队列数据,揭示该变异通过增强内质网应激和破坏β细胞成熟度来增加2型糖尿病风险 研究主要基于小鼠模型和东亚人群队列,可能无法直接推广至其他种族;单细胞转录组分析仅在高脂饮食条件下进行,未涵盖正常饮食长期效应 阐明PAX4 R192H变异如何通过影响β细胞身份和代谢应激下的代偿能力增加2型糖尿病易感性 PAX4 R192H敲入小鼠、人类队列参与者 machine learning 糖尿病 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、口服葡萄糖耐量测试 NA 转录组数据、代谢表型数据 小鼠模型及4242名人类参与者 NA 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA NA
218 2026-07-28
MicroRNA-7: a versatile player and core target in brain disorders
2026-May-27, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
review 系统综述MicroRNA-7在神经系统疾病中的生物学特性、调控机制及作用,并探讨其临床转化潜力与挑战 首次系统阐述miR-7通过ceRNA网络与表观遗传修饰形成的多层动态调控系统,并整合其在脑疾病中多维度干预机制(蛋白聚集、神经炎症、线粒体功能障碍等)及纳米递送系统的临床转化前景 机制复杂性、递送系统靶向性不足、临床转化标准缺乏 探讨miR-7在脑疾病中的调控机制及其临床转化潜力 MicroRNA-7(miR-7)及其在脑疾病中的调控网络 machine learning 帕金森病,阿尔茨海默病,缺血性脑卒中,脑出血,胶质母细胞瘤 NA NA NA NA NA 单细胞测序,空间转录组学 NA NA
219 2026-07-28
HucMSC-mediated stromal metabolic reprogramming in reactivating aged ovaries: a single-cell transcriptomic perspective
2026-May-26, Cellular & molecular biology letters IF:9.2Q1
研究论文 通过单细胞转录组学揭示人脐带间充质干细胞通过基质代谢重编程恢复衰老卵巢功能 首次在单细胞水平揭示HucMSC通过诱导卵母细胞和体细胞的代谢重编程,特别是基质细胞向类固醇生成和卵泡生成方向重定向而非纤维化,以及增强卵母细胞线粒体功能,从而恢复衰老卵巢功能和卵子质量 未明确提及,但可能限于小鼠模型及对具体分子机制仍需进一步验证 研究HucMSC是否以及如何恢复衰老卵巢功能和卵母细胞质量,并阐明潜在通路 衰老小鼠卵巢(包括卵母细胞、颗粒细胞、基质细胞) 单细胞转录组学 老年性疾病 scRNA-seq NA 基因表达数据 衰老小鼠卵巢样本,未提供具体数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
220 2026-07-28
Lysosome-related biomarkers in peripheral blood immune cells discriminate sepsis from SIRS
2026-May-21, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 筛选外周血免疫细胞中溶酶体相关基因以区分脓毒症与全身炎症反应综合征 首次从溶酶体相关基因角度筛选区分脓毒症与SIRS的生物标志物,并结合单细胞RNA测序明确核心基因表达的主要免疫细胞类型 样本量较小,核心基因的诊断效能需进一步在大规模临床队列中验证 寻找区分脓毒症与全身炎症反应综合征的溶酶体相关生物标志物 外周血免疫细胞 数字病理学 脓毒症 RNA测序, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 12例SIRS患者和20例脓毒症患者 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
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