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当前共找到 987 篇文献,本页显示第 181 - 200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
181 2026-08-13
[Half a century of gene expression analysis : The path to modern spatial transcriptomics in autopsy tissue]
2026-May, Pathologie (Heidelberg, Germany)
综述 本文回顾了基因表达分析半个世纪的发展历程,并评估了现代空间转录组学平台在福尔马林固定石蜡包埋和死后组织中的应用 首次系统评估了Visium HD、GeoMx、CosmX和Xenium等空间转录组学平台在死后组织分析中的分辨率和适用性,并强调与神经病理学家的合作 基于文献综述,可能受限于现有研究的质量和数量,且对死后组织RNA质量的影响需要进一步标准化验证 展示基因表达分析的方法学发展,并评估当前空间转录组学平台在处理FFPE和死后组织时的分辨率、适用性和挑战 基因表达分析方法和空间转录组学平台,包括Visium HD、GeoMx、CosmX和Xenium 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics, NanoString, Vizgen 空间转录组学 Visium HD, GeoMx, CosMx, Xenium FFPE和死后组织分析
182 2026-08-13
Single-Cell Sequencing Analysis Reveals Dysregulated Energy Metabolism and Altered Synaptic Connectivity in the Mouse Retina Following Dark Rearing
2026-05-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 使用单细胞RNA测序分析揭示暗饲养小鼠视网膜中能量代谢失调和突触连接改变,并发现Müller胶质细胞来源的DIO2作为补偿机制维持甲状腺激素稳态 首次在单细胞水平上系统解析视觉剥夺引起的视网膜各细胞类型的转录组变化,特别是发现Müller胶质细胞中DIO2的动态补偿上调及其对视网膜结构和功能的保护作用 未明确提及研究局限性 探究暗饲养诱导的视觉剥夺如何影响视网膜各细胞类型的能量代谢和突触连接,并阐明潜在的补偿机制 C57BL/6J小鼠的视网膜组织 单细胞转录组学 视觉剥夺相关视网膜病变 单细胞RNA测序、免疫荧光、qPCR、Seahorse代谢分析、流式细胞术、靶向生化测定 NA 单细胞转录组数据、图像、生理数据 暗饲养和正常饲养小鼠视网膜样本,具体数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
183 2026-08-12
IgG2a-formatted 4-1BB agonism combined with S100A9 inhibition enhances T cell activation and tumor control in a preclinical model of multiple myeloma
2026-May-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了IgG2a型4-1BB激动剂单独及联合S100A9抑制剂Tasquinimod在多发性骨髓瘤小鼠模型中的抗肿瘤疗效和免疫调节机制 首次证明4-1BB激动剂抗肿瘤疗效具有IgG亚型特异性,并发现其与S100A9抑制剂联合可协同增强T细胞活化和肿瘤控制 主要基于小鼠模型,且未进行长期生存分析或临床验证 评估4-1BB激动剂与Tasquinimod联合治疗多发性骨髓瘤的潜力,并探索其免疫机制 多发性骨髓瘤小鼠(5TGM1模型)和新诊断患者骨髓样本中的T细胞、NK细胞和髓系细胞 癌症免疫治疗 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序、流式细胞术、多参数流式细胞术 小鼠肿瘤模型 基因表达、细胞表型数据 使用5TGM1肿瘤小鼠和初诊多发性骨髓瘤患者骨髓样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA-seq、流式细胞术 NA NA
184 2026-08-12
Reflections on the use of LLMs for cell annotation
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
评论 本文对近期发布的基于大语言模型(LLM)的细胞类型注释平台AICellType进行评论,指出其依赖专有商业LLM的问题,并建议优先发展开源生物医学LLM、多模态视觉语言模型、本地部署等,以提高可重复性、隐私保护和合规性。 提出在生物医学细胞注释领域应减少对专有商业LLM的依赖,强调开源模型和多模态视觉语言模型的重要性,并关注本地部署、可重复性和隐私合规等实际问题。 未提供实验验证,仅为观点性评论,缺乏系统性比较或实证数据支持其建议。 探讨用于单细胞和空间转录组数据细胞类型注释的LLM平台(特别是AICellType)的局限性,并提出可持续改进方向。 LLM平台(如AICellType)及用于细胞注释的LLM相关技术。 自然语言处理 NA 单细胞及空间转录组测序 大语言模型(LLM) 文本, 单细胞和空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
185 2026-08-12
GPR183 contributes to renal macrophage infiltration and fibrosis in kidney injury
2026-05-01, American journal of physiology. Renal physiology
研究论文 本研究探讨GPR183在肾脏损伤中对巨噬细胞浸润和纤维化的贡献,发现其通过oxysterol-GPR183轴促进M1巨噬细胞极化和肾脏炎症纤维化 首次揭示GPR183作为肾脏损伤中巨噬细胞极化和肾纤维化的关键调节因子,并证实oxysterol-GPR183信号轴通过NF-κB通路促进M1极化 研究主要基于小鼠模型和公共数据,未进行人体临床试验验证 明确GPR183在肾脏损伤中的作用及其机制,评估其作为治疗靶点的潜力 小鼠肾脏损伤模型(腺嘌呤饮食诱导的慢性肾病和叶酸诱导的肾病)及人公共单细胞RNA测序数据 机器学习和数字病理学 慢性肾病 基因敲除、免疫荧光、单细胞RNA测序分析 NA 图像和基因表达数据 包含小鼠模型和人类公共数据,具体样本数量未提供 Illumina 单细胞RNA测序 NA NA
186 2026-08-12
Tumour-derived SAA1 reprogrammes macrophages to promote CXCL1-mediated metastasis in Ovarian Cancer
2026-05, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究揭示了肿瘤来源的SAA1通过FPR2介导的JAK2/STAT3信号通路重编程巨噬细胞,促进CXCL1分泌,进而驱动卵巢癌腹膜转移 首次鉴定出具有转移特征的SAA1富集肿瘤细胞亚群,并阐明SAA1-TAM-CXCL1免疫炎症信号轴在卵巢癌转移中的关键作用 未提及明显限制 探究晚期高级别浆液性卵巢癌腹膜转移的驱动机制 高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤组织及巨噬细胞 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
187 2026-08-11
Mapping cellular heterogeneity and dynamic interactions in pancreatic cancer
2026-05-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在胰腺导管腺癌中的应用,探讨了肿瘤内异质性、微环境组成及治疗靶点的识别。 系统梳理了scRNA-seq在PDAC中从样本制备到数据分析的全流程,并强调了新生物标志物如MMP1和S100A2以及联合治疗策略的发现。 未提及scRNA-seq技术本身存在的稀疏性、批次效应等技术挑战的详细解决方案。 总结scRNA-seq在揭示胰腺癌异质性和微环境动态变化中的应用,为精准治疗提供依据。 胰腺导管腺癌肿瘤组织中的细胞亚群,包括肿瘤细胞、免疫细胞、癌症相关成纤维细胞等。 单细胞转录组学 胰腺导管腺癌 scRNA-seq NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
188 2026-08-09
Spatial transcriptomics of cervical cancer reveals microenvironment shaped the malignant epithelial programs and ECM-associated immune niches
2026-May-29, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 应用Stereo-seq空间转录组学技术研究宫颈癌微环境如何塑造恶性上皮程序及ECM相关免疫生态位 首次使用Stereo-seq空间转录组学技术对宫颈癌FFPE标本进行分析,鉴定了四种恶性上皮程序并揭示了其空间组织和分化轨迹 未提及 阐明宫颈癌进展和治疗反应受肿瘤内异质性和微环境影响,通过空间转录组学揭示恶性上皮亚型及其与免疫细胞的相互作用 宫颈癌FFPE标本、CIN III和浸润癌组织、公共scRNA-seq数据集 空间转录组学 宫颈癌 Stereo-seq空间转录组学、免疫组织化学、单细胞RNA测序分析、细胞通讯分析 NA 空间转录组数据、免疫组化图像、单细胞转录组数据 宫颈癌FFPE标本数量未在摘要中明确 BGI 空间转录组学 Stereo-seq Stereo-seq空间转录组学平台用于FFPE宫颈癌样本分析
189 2026-08-09
A multi-center cross-platform single-cell multimodal atlas of the mouse cerebral cortex
2026-May-11, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 基于九个小鼠数据集,构建了多中心、多平台的皮层细胞图谱,并进行了跨平台整合分析。 提出了一个多中心、多平台的小鼠皮层细胞图谱,并建立了跨技术和物种的标准化整合分析框架。 未在摘要中明确提及。 构建小鼠大脑皮层多模态单细胞图谱,并阐明跨平台和跨物种的细胞特性。 小鼠大脑皮层细胞。 单细胞组学 不适用 单细胞RNA测序、单核RNA测序 不适用 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 173,081个高质量细胞,来自九个小鼠数据集 10x Genomics 单细胞RNA测序、单核RNA测序 10x Genomics(具体产品未提及) 10x Genomics和Drop-seq平台,分别进行单细胞和单核RNA测序
190 2026-08-09
SPARC is associated with tumor nerve stroma interactions and perineural invasion in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-May-11, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过垂直多共培养模型和蛋白质组学分析,发现SPARC在胰腺导管腺癌中与肿瘤神经间质相互作用及神经周围侵袭相关 首次采用垂直多共培养模型结合蛋白质组学鉴定SPARC为DRG和PSC共培养条件下的高表达因子,并整合公共转录组数据和免疫组化验证其临床相关性 未进行SPARC的功能验证,且研究局限于单一机构样本,样本量较小 探究胰腺导管腺癌中基质-神经相互作用在神经周围侵袭中的机制,并寻找相关生物标志物 人胰腺导管腺癌细胞、新生小鼠背根神经节神经元、人胰腺星状细胞以及81例手术切除的PDAC标本 数字病理学 胰腺导管腺癌 蛋白质组学、RNA-seq、scRNA-seq、免疫组化 NA 蛋白质组数据、转录组数据、图像 81例PDAC手术标本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA NA
191 2026-08-09
Using CRISPR barcoding as a molecular clock to capture dynamic processes at single-cell resolution
2026-05-06, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出scDynaBar方法,结合CRISPR-Cas9动态条形码与单细胞测序,利用条形码突变记录细胞事件时间,并追踪小鼠胚胎干细胞向2C样状态的转变。 将CRISPR动态条形码作为分子时钟,通过突变积累记录细胞事件的时间顺序,为单细胞动态过程研究提供新工具。 摘要未提及具体局限性。 开发一种能在单细胞分辨率下捕捉动态生物学过程的新方法。 小鼠胚胎干细胞(mESCs)和小鼠胃样体(gastruloid)模型。 单细胞基因组学 不适用 CRISPR-Cas9动态条形码、单细胞测序 不适用 单细胞转录组和基因条形码数据 小鼠胚胎干细胞和小鼠胃样体模型,具体样本量未在摘要中提及。 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
192 2026-08-09
Suboptimal Responses to Anti-VEGF in Retinal Neurovascular Diseases: Linking Aging and Alternative Angioinflammatory Pathways
2026-05-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究采用整合系统生物学框架,结合多组学数据、网络机器学习和疾病特异性通路映射,揭示视网膜神经血管疾病中抗VEGF治疗反应不佳的共享机制,并确定关键耐药枢纽和潜在治疗策略。 创新性地整合多组学数据集、网络机器学习与疾病特异性通路映射,识别出EGFR、HSP90AA1、SIRT1和STAT3作为连接血管生成和炎症过程的中心耐药枢纽,并利用单细胞RNA测序数据发现AMD-RPE中的细胞簇特异性基因枢纽。 研究结论基于计算分析和文献综述,需要进一步的疾病相关模型验证。 阐明视网膜神经血管疾病中抗VEGF治疗失败和疾病进展的共享机制。 视网膜神经血管疾病,包括糖尿病视网膜病变、年龄相关性黄斑变性、视网膜色素变性、青光眼和衰老。 机器学习 年龄相关性黄斑变性 多组学分析、单细胞RNA测序 网络机器学习 多组学数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
193 2026-08-08
CA9 targets ITGB1 to accelerate the progression of colorectal cancer by promoting the neutrophil extracellular traps formation
2026-May-31, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了碳酸酐酶IX(CA9)通过促进中性粒细胞胞外陷阱形成加速结直肠癌进展的机制。 首次阐明CA9通过结合ITGB1激活NF-κB通路,促进CXCL8分泌,进而诱导中性粒细胞募集和NETs形成,从而推动结直肠癌进展;并确定CA9为结直肠癌的潜在新治疗靶点。 未提及具体研究局限性。 探究CA9在结直肠癌进展中的免疫学作用及其分子机制。 结直肠癌细胞系、小鼠模型及结直肠癌患者血清样本。 分子生物学 结直肠癌 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、分子对接、免疫共沉淀、细胞因子芯片 NA 基因表达数据、细胞图像、蛋白质相互作用数据 结直肠癌患者血清样本(具体数量未提及)。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
194 2026-08-08
Spatially resolved single cell analysis suggests an APOE NCF1 associated immunosuppressive niche and its prognostic signature in thyroid cancer
2026-May-30, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 整合单细胞与空间转录组分析揭示甲状腺癌中APOE-NCF1相关的免疫抑制微环境及其预后标志物 首次在甲状腺癌中描绘了特定肿瘤-免疫相互作用微环境,通过APOE-NCF1轴揭示免疫逃逸潜在机制,并构建了可转化的预后风险分层模型 未在摘要中明确说明局限性,可能包括样本量有限或需要进一步功能验证 系统解析甲状腺癌肿瘤微环境中与免疫耗竭和肿瘤演进相关的细胞互作,并构建预后预测模型 人类甲状腺癌样本中的肿瘤细胞亚群和CD8+ T细胞亚群 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 机器学习模型 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 未明确说明样本数量,涉及人类甲状腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
195 2026-08-08
[Dual role and therapeutic potential of TREM2 in atherosclerosis]
2026-May-28, Zhong nan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Central South University. Medical sciences
综述 本文综述了TREM2在动脉粥样硬化斑块进展不同阶段的双重调控作用、分子机制及其作为治疗靶点和生物标志物的临床转化潜力。 系统阐述了TREM2在动脉粥样硬化早期和晚期的双向调节作用,并结合单细胞测序技术明确了TREM2高表达巨噬细胞为脂质相关巨噬细胞亚群,提出阶段特异性的精准调控策略。 摘要未提及明确的研究局限性。 探讨TREM2在动脉粥样硬化中的双重角色及其治疗潜力,为免疫治疗提供新方向。 TREM2及其在动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞亚群。 免疫学 动脉粥样硬化 单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞测序 NA NA
196 2026-08-08
[Single-cell RNA sequencing reveals the driving mechanism of CXCL9꞉SPP1 polarization in the progression of non-alcoholic fatty liver disease]
2026-May-28, Zhong nan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Central South University. Medical sciences
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了非酒精性脂肪肝病进展中库普弗细胞的CXCL9:SPP1极化特征及其与内皮细胞的通讯机制 首次在NAFLD中表征库普弗细胞的CXCL9:SPP1极化状态,并揭示其与内皮细胞亚群间的TNF-TNFRSF1A信号通讯 研究样本量较小(每组3只小鼠的测序数据),且基于动物模型,结果需在人体样本中进一步验证 探究NAFLD中库普弗细胞的CXCL9:SPP1极化及其与内皮细胞的细胞间通讯在疾病进展中的作用 NAFLD小鼠模型的肝脏组织,包括库普弗细胞、内皮细胞等细胞类型 单细胞转录组学 非酒精性脂肪肝病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、病理图像、小鼠生理数据 3只NAFLD小鼠和3只对照小鼠的肝脏单细胞数据,以及20只C57BL/6J小鼠(对照组10只,高脂饮食组10只) NA 单细胞RNA测序 NA NA
197 2026-08-08
Single-cell RNA Sequencing for Profiling Ganglionic and Aganglionic Colonic Segments from Patients with Hirschsprung Disease
2026-05-22, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 建立单细胞RNA测序工作流程,分析Hirschsprung病患者神经节段和无神经节段结肠组织的转录图谱,揭示免疫微环境差异 采用单细胞RNA测序技术解析HSCR患者结肠神经节段与无神经节段的细胞异质性,弥补了批量RNA测序无法分辨细胞亚群的不足 研究仅涉及少数患者样本,未进行功能验证或机制探讨 研究Hirschsprung病中神经节段与无神经节段结肠组织的细胞组成和基因表达差异,特别是免疫微环境 Hirschsprung病患者的结肠神经节段和无神经节段组织 单细胞转录组学 Hirschsprung病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
198 2026-08-08
Optimized Preparation of Whole Murine Tumor-Bearing Lung Tissue for Flow Cytometry and Single-Cell RNA-Sequencing
2026-05-22, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文提出了一种优化的方案,用于从健康和肿瘤-bearing小鼠肺组织中制备高质量单细胞悬液,以供流式细胞术和单细胞RNA测序使用 该方案优化了组织灌注、酶消化、机械解离等步骤,成功从纤维化和异质性强的肿瘤肺组织中获得了超过85%的存活细胞,并通过FACS和scRNA-seq有效分离和检测tdTomato肿瘤细胞 文中未明确提及局限性 开发从肿瘤-bearing小鼠肺组织中制备高质量单细胞悬液的详细步骤方案,以支持单细胞RNA测序研究 健康和肿瘤-bearing小鼠肺组织,使用Kras; tdTomato报告基因小鼠模型 单细胞测序 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序,流式细胞术,FACS NA 单细胞转录组数据 未明确提及样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
199 2026-08-08
Bilirubin reductase regulates macrophage senescence and modulates implant-associated Staphylococcus aureus osteomyelitis
2026-May-14, Chinese journal of traumatology = Zhonghua chuang shang za zhi
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序、批量转录组学和衰老相关基因集,识别骨髓炎诊断生物标志物并探讨其在巨噬细胞衰老中的作用。 首次将多组学数据与孟德尔随机化相结合,确定胆绿素还原酶A(BLVRA)为骨髓炎的因果中介因子,并关联到巨噬细胞衰老。 未在摘要中提及具体局限性。 识别可靠的骨髓炎诊断生物标志物,并探索其在巨噬细胞衰老中的作用,为早期诊断和免疫治疗提供基础。 骨髓炎患者样本、小鼠模型、巨噬细胞 机器学习、数字病理学 骨髓炎 单细胞RNA测序、批量转录组学、孟德尔随机化 机器学习算法(具体模型未指定) 基因表达数据、单细胞数据 未在摘要中指明样本数量 未指定 单细胞RNA测序、批量RNA测序 未指定 未指定
200 2026-08-08
Agonistic GITR treatment enhances antitumor immune responses and suppresses tumor progression in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-05, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 本研究探讨了GITR激动剂治疗在胰腺导管腺癌中增强抗肿瘤免疫反应并抑制肿瘤进展的作用 首次在PDAC中系统评估GITR激动剂治疗的效果,并结合空间转录组学揭示GITR表达与肿瘤细胞的邻近关系,以及长期生存患者中GITR+淋巴细胞的高水平 主要基于小鼠模型和有限的人体样本,需要进一步临床验证 评估GITR激活在PDAC中的抗肿瘤作用及其免疫调节机制,以期为免疫治疗提供新靶点 PDAC患者肿瘤样本及Pan02小鼠模型 免疫学, 肿瘤学 胰腺导管腺癌 scRNA-seq, 空间转录组学, 免疫荧光 小鼠模型 基因表达数据, 图像数据 未明确列出具体样本数量 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
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