单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 991 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-18 |
Empowering fungal infection research with single-cell RNA sequencing
2026-05-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10304-x
PMID:42215623
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综述 | 本文概述了单细胞RNA测序在真菌感染研究中的应用，总结了关键发现并探讨了宿主-真菌病原体相互作用的动态机制 | 首次系统地总结了单细胞RNA测序在真菌感染研究中的应用进展，并提出了未来研究方向以促进该技术的更广泛采用 | 当前技术仍存在局限性，如样本处理复杂性和数据分析挑战，且真菌感染研究整体滞后于其他传染病领域 | 推动单细胞RNA测序技术在真菌感染研究中的更广泛应用，以深化对宿主-真菌病原体相互作用的理解 | 真菌病原体与宿主之间的相互作用 | 机器学习 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-06-15 |
Molecular signatures and lineage diversification of neurogenic and gliogenic radial glia in the gyrencephalic ferret cortex
2026-05-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10366-x
PMID:42203905
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研究论文 | 利用具有脑回结构的雪貂模型，系统表征了皮层放射状胶质细胞的分子特征和谱系动态，揭示了保守的调控程序及其在神经发生和胶质发生中的作用 | 首次在雪貂模型中系统解析了外层放射状胶质细胞的ERK/PKA信号协同作用，并发现YAP/TAZ和SHH通路分别调控不同区域胶质放射状胶质细胞的谱系分化，提出了一个整合信号网络共同调控皮层神经发生、胶质发生和进化扩张的模型 | 未提及具体局限性 | 揭示皮层放射状胶质细胞在神经发生和胶质发生中的分子特征和谱系分化调控机制 | 雪貂和人类皮层组织中的放射状胶质细胞 | 机器学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 雪貂和人类皮层样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 3 | 2026-07-26 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal SPRR2A+ epithelial-MMP1+ fibroblast interactions as key drivers of Esophageal Squamous Cell Carcinoma progression
2026-May-21, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152654
PMID:42173220
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2026-07-26 |
HO-1-modified umbilical cord MSCs alleviate pulmonary arterial hypertension by reducing inflammation and endothelial dysfunction
2026-05-18, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szag036
PMID:42367077
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2026-05-04 |
Preimplantation genetic testing for meiotic aneuploidy in trophectoderm biopsies - is it time to change our approach?
2026-May, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2026.105504
PMID:41865500
|
评论文章 | 讨论在滋养层活检中区分减数分裂与有丝分裂非整倍体的必要性，提出核型定位技术可改善胚胎植入前遗传学检测的准确性 | 首次提出结合核型定位和亲本强度分析来区分减数分裂与非整倍体，避免误弃仅含临床意义未知的有丝分裂非整倍体的潜在可用胚胎 | NA | 改进胚胎植入前遗传学检测策略，减少非整倍体误判导致的胚胎丢弃 | 囊胚期滋养层活检样本 | 生物信息学 | 染色体非整倍体相关疾病 | 单核苷酸多态性亲本单倍型分析（核型定位）、单细胞测序 | NA | 遗传数据（单核苷酸多态性、单细胞序列） | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2026-06-03 |
Application of single-cell transcriptomic technology in cell fate determination of embryonic liver
2026-May-29, Histology and histopathology
IF:2.5Q2
DOI:10.14670/HH-25-100
PMID:42227418
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综述 | 综述单细胞转录组技术在胚胎肝脏细胞命运决定中的应用，整合单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合和类器官建模的最新进展 | 提出细胞图谱构建、细胞间通讯分析、空间验证和类器官功能建模形成迭代循环的新范式，推动从描述性编目向机制解析的转变 | 未明确说明本综述的局限 | 总结单细胞转录组学在解析胚胎肝脏发育中细胞命运决定机制的研究进展，为先天性肝病、肿瘤分层和再生医学提供概念和方法基础 | 人及小鼠胚胎肝脏中的肝母细胞、肝细胞、胆管细胞、肝胆双能祖细胞、内皮细胞和星状细胞等非实质细胞 | 机器学习和数字病理学 | 先天性肝病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合、类器官建模 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、多组学数据 | 人类和小鼠胚胎肝脏样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-05-29 |
Thyroid-stimulating hormone receptor mediates peripheral-central neuroimmune crosstalk in autoimmune thyroid diseases
2026-May-27, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04957-y
PMID:42204533
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示促甲状腺激素受体在自身免疫性甲状腺疾病中介导外周-中枢神经免疫串扰的分子机制 | 首次从多组学层面系统证明TSHR作为分子枢纽连接外周与中枢神经免疫串扰，并鉴定出三种潜在的再利用化合物 | 样本量有限，缺乏纵向随访和体内验证，结果需谨慎解释并进一步研究 | 阐明促甲状腺激素受体如何连接外周自身免疫与中枢神经系统特征 | Graves病、Graves眼病患者及小鼠模型 | 自然语言处理 | 甲状腺疾病 | GWAS, RNA-seq, 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 脑影像数据 | NA | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-05-29 |
Integrative single-cell and bulk analyses reveal ATF4-associated immune suppression and WNT/β-catenin signaling in osteosarcoma
2026-May-27, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00797-1
PMID:42204636
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研究论文 | 整合单细胞和批量分析揭示骨肉瘤中ATF4相关的免疫抑制和WNT/β-catenin信号通路 | 首次通过整合单细胞RNA-seq和批量转录组数据，系统揭示ATF4在骨肉瘤中连接应激相关肿瘤程序、免疫抑制和WNT/β-catenin激活的关键作用，并构建了ATF/CREB相关风险评分（ACS）用于预后分层 | 主要依赖公开数据集进行生物信息学分析，缺乏大规模前瞻性临床验证；ATF4在骨肉瘤中的具体分子机制和调控网络仍需进一步实验验证 | 探究ATF/CREB应激反应网络（特别是ATF4）在骨肉瘤免疫抑制微环境和预后的作用机制 | 骨肉瘤（OS）肿瘤样本的单细胞RNA-seq和批量转录组数据 | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子动力学模拟 | NA | 单细胞基因表达数据, 批量转录组数据 | 多个公共数据集，包括TARGET和GEO队列，具体样本量未详细列出 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-07-25 |
Investigation of the clinical value of artificial intelligence-derived prognostic signature in cervical cancer based on machine learning algorithms
2026-May-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05182-y
PMID:42201622
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2026-07-25 |
Decoding lactylation heterogeneity in glioblastoma: machine learning identifies G6PC3 as a prognostic target
2026-May-26, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16225-6
PMID:42192326
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2026-07-25 |
Sigma-1R-CD36 axis in myeloid cells contributes to the alleviation of depression-like behaviors
2026-May-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08297-6
PMID:42192440
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2026-05-27 |
Explainable machine learning-guided integrated multiomics analysis reveals macrophage-driven immune suppression in breast cancer
2026-May-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73617-9
PMID:42185288
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研究论文 | 本研究利用可解释机器学习管道整合多组学数据分析，揭示了巨噬细胞在乳腺癌中驱动的免疫抑制机制 | 创新性地结合可解释机器学习与多组学分析（包括成像质谱流式技术和单细胞RNA测序），发现了巨噬细胞浸润与乳腺癌复发风险及化疗反应的矛盾关联，并揭示了HLA-ABC+巨噬细胞通过特定配体-受体相互作用介导免疫抑制的新机制 | 研究主要基于回顾性数据分析，巨噬细胞驱动免疫抑制的因果关系需进一步实验验证 | 解析乳腺肿瘤微环境中细胞组成与疾病进展及预后的关联，为改善治疗结局提供潜在靶点 | 乳腺癌肿瘤微环境中的巨噬细胞、调节性T细胞和耗竭性T细胞 | 机器学习和数字病理学 | 乳腺癌 | 可解释机器学习、成像质谱流式技术（IMC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞间通讯分析 | 可解释机器学习模型 | 基因表达数据、细胞分数数据、成像质谱流式数据、单细胞转录组数据 | 约5000份患者样本（来自METABRIC和TCGA数据集） | NA | 成像质谱流式技术、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-05-27 |
CR1(+) tumor-associated macrophages orchestrate an immunosuppressive niche in hepatocellular carcinoma: a genetic and multi-omics dissection
2026-May-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08301-z
PMID:42185899
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研究论文 | 利用遗传和多组学框架研究CR1(+)肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌中形成免疫抑制微环境的作用 | 首次整合遗传、空间和功能证据，揭示CR1+肿瘤相关巨噬细胞构成肝细胞癌中一个临床相关的免疫调控轴，将补体相关免疫抑制扩展到经典补体级联反应之外 | NA | 探讨CR1在肝细胞癌中驱动肿瘤相关巨噬细胞功能障碍的遗传决定因素 | 肝细胞癌患者样本及THP-1来源的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 孟德尔随机化、代谢物介导分析、批量转录组学、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、临床组织样本 | 21份样本共53,474个高质量单细胞、两个空间剖面的肝细胞癌切片、30对配对的肝细胞癌及癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-07-25 |
Optimized nuclei isolation and snRNA-seq reveal oligodendrocyte pathway dysregulation in MOGHE brain tissue from pediatric patients
2026-May-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-54112-z
PMID:42168328
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2026-07-25 |
Single-cell multiomics gene regulatory landscape reveals impaired spermatogonial stem cells and macrophage-driven inflammaging during testicular aging
2026-May-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.05.005
PMID:42167485
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2026-07-25 |
Single-Cell Profiling Reveals Distinct Immune Hallmarks in Untreated Primary Colorectal and Liver Metastasis Cancers
2026-May-12, Chronic diseases and translational medicine
DOI:10.1002/cdt3.70051
PMID:42494952
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2026-05-21 |
TNFAIP3 in M2 Macrophage Attenuates Subretinal Fibrosis in Laser-Induced Murine Model
2026-05-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.25
PMID:42126158
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2026-07-23 |
Endothelial cells recruit pro-inflammatory macrophage clusters via App-Cd74 exacerbating ICI-associated myocarditis
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111238
PMID:41905617
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示内皮细胞通过App-Cd74轴招募促炎性巨噬细胞簇加剧ICI相关心肌炎 | 首次在ICI相关心肌炎小鼠模型中鉴定出共表达Cxcl9和Cxcl10的促炎性巨噬细胞亚群，并发现内皮细胞通过App-Cd74信号轴与该亚群相互作用，为ICI心肌炎的免疫病理机制提供了新视角 | NA | 阐明ICI相关心肌炎的免疫病理机制，寻找潜在治疗靶点 | 小鼠ICI心肌炎模型的心脏组织 | 单细胞测序， 免疫学 | ICI相关心肌炎 | 单细胞RNA测序， 深度学习框架scTenifoldXct | scTenifoldXct | 单细胞转录组数据 | 小鼠ICI心肌炎模型的心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-07-23 |
COVARE for modeling latent random effect correlations to detect genes with specific spatial expression patterns
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111242
PMID:41941898
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研究论文 | 提出COVARE方法，基于线性混合效应模型建模潜在随机效应相关性，以检测具有特定空间表达模式的基因 | 首次在线性混合效应模型框架下整合多种先验生物学信息并考虑协变量间的潜在交互作用，实现对基因空间表达的多因素共调控的精确分析 | 未提及具体局限性 | 开发一种能够检测空间可变基因并考虑协变量交互效应的新方法 | 基因的空间表达模式及细胞微环境中的协变量交互效应 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 线性混合效应模型 | 空间转录组数据 | 使用了公共数据集进行模拟和分析，未说明具体样本量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-07-23 |
OMICX: An AI-powered web platform for integrative analysis of multi-condition single-cell transcriptomics data
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111243
PMID:41941899
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研究论文 | 介绍了一个名为OMICX的基于AI的Web平台，用于多条件单细胞转录组数据的综合分析 | 搭载大型语言模型助手OMICX-Agent，用户可通过自然语言对话进行高级单细胞数据分析，无需编程技能 | 未明确提及局限性 | 开发一个交互式、无需编程的Web平台，使研究者能够通过自然语言对话进行单细胞数据的综合分析 | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据、GWAS汇总统计数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 大型语言模型 | 文本 | 三个真实案例研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |