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当前共找到 943 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-05-05 |
Transcriptional profiling of extraocular motor neurons reveals sim1a as a candidate strabismus-related gene
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717009
PMID:41993546
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研究论文 | 通过斑马鱼外眼运动神经元的转录组分析，发现 sim1a 是潜在的斜视相关基因 | 利用斑马鱼作为模型进行外眼运动神经元的单细胞和批量测序，揭示了 nIII/nIV 脑神经核中运动神经元亚群的转录组多样性，并建立了研究眼运动疾病病因的筛选管道 | 仅进行了 CRISPR/Cas9 介导的基因敲除功能验证，未在人类样本中直接验证；仅检测了前庭眼反射行为，未评估其他眼动功能 | 鉴定调控外眼运动神经元发育并与斜视相关的候选基因 | 斑马鱼幼虫的外眼运动神经元（颅神经核 nIII/nIV 中的神经元亚群） | 数字病理学 | 斜视 | NGS, 单细胞测序, 批量RNA测序, CRISPR/Cas9 | NA | 转录组数据（RNA-seq） | 斑马鱼幼虫（未具体说明数量） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2026-05-05 |
A transcriptomic axis aligns with in vivo functional dynamics in hippocampal inhibitory circuits
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.716935
PMID:41993541
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研究论文 | 通过细胞分辨双光子成像和空间转录组学，将小鼠海马体抑制性回路的分子身份与体内功能动态直接关联 | 建立端到端流程，结合双光子钙成像与空间转录组学，揭示转录组轴与神经元功能动态的对应关系，并证明仅凭生理特征即可恢复转录组分类 | 研究仅限于小鼠海马体CA1区，且虚拟现实导航行为的复杂性可能限制生理反应分类的普适性 | 在单细胞分辨率下桥接神经元分子身份与功能动态的关系 | 小鼠海马体CA1区的抑制性中间神经元 | 数字病理学， 机器学习 | NA | 空间转录组学， 双光子钙成像 | 分类器 | 基因表达数据， 成像数据 | 小鼠海马体CA1区的抑制性中间神经元（具体数量未提及） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 163 | 2026-05-05 |
Longitudinal Single-Cell RNA-seq Profiling of Lung Cell Phenotypes, Signaling, and Cross-talk During Fibrosis Resolution
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716772
PMID:41993271
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研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序分析肺纤维化消退过程中的细胞表型、信号通路和细胞间通讯变化 | 首次在自发消退的肺纤维化小鼠模型中进行纵向单细胞RNA测序，系统描绘了纤维化消退过程中免疫、间质和上皮细胞的动态变化，并发现cAMP、HGF/MET和TWEAK等潜在抗纤维化通路 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类肺纤维化消退机制；单细胞测序缺乏空间信息，无法提供细胞在组织中的位置分布 | 阐明肺纤维化自发消退过程中涉及的信号通路、细胞间通讯和表型变化，为治疗肺纤维化发现内源性通路 | 小鼠全肺细胞 | 单细胞基因组学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 自发消退纤维化小鼠模型的纵向样本，具体数量未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 164 | 2026-05-05 |
STDrug enables spatially informed personalized drug repurposing from spatial transcriptomics
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.715101
PMID:41993522
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研究论文 | STDrug是一个空间感知的计算框架，整合空间转录组学、图建模和多模态学习，实现患者特异性的药物重定位 | 首次将空间转录组学与药物重定位结合，通过图卷积网络和相干点漂移技术对齐疾病与对照空间域，并融合多模态学习进行药物优先排序 | 需要利用空间转录组数据，可能对数据质量和可用性有较高要求；且仅通过肝细胞癌和前列腺癌数据集验证，泛化性有待进一步测试 | 利用空间转录组学实现患者特异性的药物重定位 | 肝细胞癌和前列腺癌患者的空间转录组数据 | 机器学习 | 肝细胞癌, 前列腺癌 | 空间转录组学 | 图卷积网络, 机器学习框架 | 空间转录组数据 | 肝细胞癌和前列腺癌数据集（具体样本数未提供） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 165 | 2026-05-05 |
Gain-of-function mutation in SKAP2 leads to type 1 diabetes and broader autoimmunity through hyperactive integrin signaling in myeloid cells
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716136
PMID:41993266
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研究论文 | 本文发现SKAP2基因的功能获得性突变通过髓系细胞中过度活跃的整合素信号通路导致1型糖尿病和更广泛的自身免疫 | 首次鉴定出SKAP2基因功能获得性突变与1型糖尿病相关，并通过整合素信号过度激活解释机制 | 研究主要基于小鼠模型，突变对人类的直接作用需进一步验证 | 阐明SKAP2基因突变导致1型糖尿病和自身免疫的机制 | 携带SKAP2 p.G153R突变的小鼠（NOD和C57BL/6J遗传背景） | 机器学习 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 携带突变的SKAP2小鼠（雌性和雄性）与对照小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 166 | 2026-05-05 |
Halo: a pretrained model for whole-cell segmentation from nuclei images in spatial transcriptomics
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716237
PMID:41993456
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研究论文 | 介绍Halo，一种基于核形态与RNA转录本空间分布整合的全细胞分割预训练模型，用于空间转录组学中从细胞核图像重建全细胞边界 | 提出Halo模型，直接整合原子核形态与RNA转录本的空间分布，无需特定数据集训练即可应用于新数据集，且在多种组织中优于传统核扩张策略 | NA | 开发一种通用且可规模化的全细胞分割模型，提高图像空间转录组学中细胞边界推断的准确性和可重复性 | 空间转录组学中的细胞核图像和RNA转录本坐标 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | Cellpose-SAM | 图像 | 12种组织类型的Xenium多模态数据 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | NA |
| 167 | 2026-05-05 |
Comparative single cell analysis of wound and cancer identifies the metabolic dialogues between tumor initiating stem cells and macrophages
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716187
PMID:41993506
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研究论文 | 通过比较单细胞分析揭示伤口愈合与癌症中肿瘤起始干细胞与巨噬细胞之间的代谢对话 | 首次通过比较单细胞RNA测序揭示伤口相关巨噬细胞与肿瘤相关巨噬细胞的差异，发现失调的脂质代谢是TAMs的独特特征，并识别SOX2肿瘤起始干细胞为调控TAMs脂质代谢和细胞状态的关键协调者 | NA | 探究伤口相关巨噬细胞与肿瘤相关巨噬细胞的分子和功能差异，以及肿瘤起始干细胞如何调节TAMs的代谢对话 | 皮肤伤口愈合和皮肤鳞状细胞癌进展过程中的巨噬细胞和SOX2肿瘤起始干细胞 | 机器学习 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 168 | 2026-05-05 |
Mapping whole-organism genetic comorbidities across model Species using unified ontologies
2026-04-04, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyag038
PMID:41664592
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研究论文 | 利用统一本体论跨物种绘制全生物体遗传合并症图谱 | 首次开发了跨物种表型本体整合框架，结合新构建的生殖表型本体与标准化全身体表型类别，实现了小鼠、斑马鱼、果蝇、线虫和人类之间的直接跨物种比较 | 仅分析了与无梗阻性无精症相关的基因，且跨物种表型比较依赖于现有数据库的完备性和注释质量 | 识别与无梗阻性无精症相关基因在全生物体层面的合并症模式，揭示男性不育与系统性疾病之间的共享遗传基础 | 204个小鼠生精失败相关基因及其在人、小鼠、斑马鱼、果蝇、线虫中的直系同源基因和表型注释 | 机器学习 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序、基因本体注释 | 聚类分析 | 基因型-表型关联数据、单细胞RNA测序数据、全身体基因表达数据 | 204个小鼠基因，涵盖多种跨物种模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2026-05-05 |
Single-cell, clonal and spatial atlases of cranial placodes illuminate their specification and evolution
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715621
PMID:41959073
|
研究论文 | 整合单细胞、克隆和空间图谱揭示颅窝的发育和进化机制 | 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学和高分辨率克隆追踪整合，构建颅窝发育的综合性图谱，揭示前体细胞连续转录景观及竞争性谱系分离模型 | 未明确提及研究局限性，可能包括样本量有限或跨物种比较的潜在偏差 | 解析颅窝前体细胞的谱系分化动态和进化起源 | 脊椎动物颅窝及其前体细胞 | 生物信息学, 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 克隆追踪 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据, 克隆谱系数据 | 涉及多个脊椎动物样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 170 | 2026-05-05 |
Single-cell transcriptomics of acetaminophen-induced responses in human 2D and 3D liver microtissues
2026-04, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-025-04296-6
PMID:41535591
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术比较对乙酰氨基酚在人类2D单层和3D肝微组织中的细胞反应，揭示氧气可用性与药物代谢之间的相互作用 | 首次在人源2D和3D肝细胞培养模型中，通过单细胞转录组学系统比较对乙酰氨基酚诱导的细胞反应差异，特别是氧气张力对代谢活性和药物解毒途径的影响 | 2D培养仅使用低剂量暴露，未进行高剂量对比；研究仅在体外模型中进行，缺乏体内验证 | 评估人源2D和3D肝细胞培养模型在药物性肝损伤研究中的生理相关性，了解氧气微环境对对乙酰氨基酚代谢和毒性的影响 | 原代人肝细胞、库普弗细胞和肝内皮细胞组成的2D单层和3D球体培养物 | 数字病理学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2D和3D肝细胞培养物，暴露于低浓度（350µM）和高浓度（2687µM）对乙酰氨基酚，2D仅接受低剂量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 171 | 2026-05-05 |
Human hippocampal neurogenesis in adulthood, ageing and Alzheimer's disease
2026-Apr, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10169-4
PMID:41741649
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研究论文 | 通过多组学单细胞测序技术，研究了人类海马神经发生在成年期、衰老和阿尔茨海默病中的变化及其分子机制 | 首次利用多组学单细胞测序（单细胞核RNA测序和单细胞核ATAC测序）分析大规模海马样本，揭示了神经发生失调与染色质可及性变化的关联，并识别了SuperAgers中的‘韧性特征’ | 研究仅基于死后人体样本，样本量有限，且未直接验证神经发生在认知功能中的因果关系 | 探索人类海马神经发生是否存在，以及其在衰老和阿尔茨海默病中的调控机制和认知影响 | 来自不同队列的人类死后海马样本，包括记忆完整的年轻成人、无认知障碍的老年人、有非凡记忆能力的老年人（SuperAgers）、临床前中间病理成人及阿尔茨海默病患者 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序 | NA | 单细胞测序数据 | 355,997个海马样本的单细胞核 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞核RNA测序和单细胞核ATAC测序 |
| 172 | 2026-05-05 |
Prosta-omics: machine learning-driven TPSA prediction and molecular modeling of ASPM-inhibitors for prostate cancer treatment
2026-Apr, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-026-11470-0
PMID:41781783
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研究论文 | 提出Prosta-Omics整合流程，将单细胞转录组学、化学信息学和机器学习结合，用于前列腺癌生物标志物发现和药物筛选 | 首次将单细胞RNA测序、机器学习预测拓扑极性表面积与分子对接相结合，构建从组学到治疗的全链条精准医学平台 | 未进行体外或体内实验验证预测化合物的实际疗效 | 开发整合组学与机器学习的前列腺癌精准治疗策略，筛选新型治疗靶点和候选药物 | 前列腺癌组织样本中的恶性及非恶性细胞群体 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟，ADMET分析 | 随机森林 | 单细胞转录组数据，分子SMILES数据 | 前列腺癌组织样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 173 | 2026-05-05 |
Maternal obesity induces activator protein 1-mediated inflammatory response to impair embryonic neurogenesis
2026-04, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP289326
PMID:41823327
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研究论文 | 母体肥胖通过激活蛋白1介导的炎症反应损害胚胎神经发生 | 首次通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序揭示母体肥胖通过激活蛋白1转录因子增强炎症基因染色质可及性，从而抑制胚胎神经发生 | 未说明 | 探讨母体肥胖影响胚胎神经发育的分子机制 | 母鼠及其胚胎（E11.5和E13.5） | 单细胞组学 | 母体肥胖、神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞基因表达数据、单细胞染色质可及性数据 | 对照组和高脂饮食组母鼠胚胎（E11.5和E13.5） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 |
| 174 | 2026-05-05 |
How to efficiently establish animal models of cholangiocarcinoma: challenges and inspiration
2026-Apr, Medical review (2021)
DOI:10.1515/mr-2025-0081
PMID:42078198
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综述 | 本文综述了胆管癌动物模型建立的方法、挑战与启示，重点讨论了原发性胆管癌模型在临床前研究中的应用及其局限性 | 强调单细胞测序技术在癌症模型研究中的创新应用和巨大潜力，并系统分析了肝内外胆管发育差异对模型构建的影响 | 原生胆管癌模型存在固有局限性，需要进一步改进和优化 | 为建立更先进、更具临床相关性的胆管癌模型提供建议和推荐 | 胆管癌动物模型（包括原发性胆管癌模型、胆管癌类器官等） | 机器学习 | 胆管癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 175 | 2026-05-04 |
A human endometrium-on-chip platform for functional assessment of luminal epithelial receptivity
2026-Apr-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117349
PMID:42068548
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研究论文 | 开发了一种人类子宫内膜芯片模型，用于评估腔上皮细胞对胚胎植入的功能性接收能力 | 首次构建了能够定量测量胚泡附着到患者来源腔上皮的人类器官芯片模型，并挑战了基于转录组标记的接收性定义 | 未提及具体局限性，但可能包括模型简化了体内微环境的复杂性 | 研究人类子宫内膜上皮细胞在胚胎植入过程中获得接收性的分子机制 | 人类子宫内膜腔上皮细胞和胚泡 | 数字病理学 | 生殖医学相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 器官芯片模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及患者来源的子宫内膜上皮 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 176 | 2026-05-04 |
Identification of key driver genes in idiopathic pulmonary arterial hypertension by single-cell RNA sequencing and experimental validation
2026-Apr-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153869
PMID:42068750
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和实验验证，鉴定特发性肺动脉高压的关键驱动基因 | 首次整合单细胞RNA测序分析与体内外实验验证，系统筛选出四个关键枢纽基因（COL1A1、MYL9、COL1A2和TPM2），并证实其沉默可抑制HMGB1诱导的肺动脉平滑肌细胞增殖和迁移 | 未提及研究局限 | 揭示特发性肺动脉高压的分子机制并鉴定潜在治疗靶点 | 肺动脉平滑肌细胞 | 生物信息学 | 特发性肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、qPCR、Western blotting、siRNA敲低 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 177 | 2026-05-04 |
The BTN3A3-TOMM22 axis preserves mitochondrial homeostasis to facilitate HCC stemness and drug resistance
2026-Apr-30, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218557
PMID:42069175
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研究论文 | 本研究揭示了BTN3A3-TOMM22轴通过维持线粒体稳态促进肝癌干性和耐药性的新机制 | 首次阐明BTN3A3在肝细胞癌中通过非免疫性方式调控线粒体重编程，防止TOMM22泛素化降解以维持线粒体稳态，从而驱动干性和耐药性 | 尚未明确BTN3A3在线粒体转位及与TOMM22相互作用的精细分子机制 | 探究BTN3A3在肝细胞癌干性和耐药性中的作用及其线粒体相关分子机制 | 肝细胞癌细胞、原位异种移植小鼠模型、患者来源类器官 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞转录组测序、批量转录组测序、质谱分析、免疫共沉淀 | NA | 转录组数据 | 批量与单细胞转录组数据来源样本数未明确，体内模型和类器官实验样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2026-05-04 |
GRK5 in dorsolateral septal somatostatin neurons mediates chronic stress-induced depression via the AKT-mTORC1 pathway
2026-Apr-28, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2026.110997
PMID:42061809
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现，慢性束缚压力导致小鼠背外侧隔核中生长抑素阳性神经元的GRK5下调，并通过AKT-mTORC1通路介导抑郁样行为 | 首次发现背外侧隔核SST神经元中GRK5的特异性下调是慢性应激诱发抑郁的关键机制，并验证GRK5作为新型抗抑郁靶点的潜力 | 研究仅在动物模型上进行，未在人类样本中验证；未阐明GRK5下调的上游调控机制 | 探究背外侧隔核SST神经元中GRK5在慢性应激诱发抑郁中的作用及其分子机制 | 小鼠的背外侧隔核SST阳性GABA能神经元 | 机器学习 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 179 | 2026-05-04 |
Multi-organ single-cell analysis of preferential expression of CAKUT genes
2026-Apr-27, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-026-05003-y
PMID:42045859
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研究论文 | 通过多器官单细胞分析揭示CAKUT相关基因的优先表达模式 | 首次利用单细胞RNA测序数据系统分析CAKUT相关基因在人类胎儿和成人肾、输尿管及膀胱中的细胞类型特异性表达，并发现共享的基质-间充质基因表达特征 | 基于公共数据集，缺乏独立验证实验；样本仅涉及人胎儿和成人组织，未涵盖所有发育阶段 | 探究先天性肾脏和尿路畸形（CAKUT）相关基因是否在发育过程中共享细胞表达程序 | 人胎儿和成人肾、输尿管及膀胱组织中的单细胞 | 单细胞生物学 | 先天性肾脏和尿路畸形（CAKUT） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 公开数据集中的多个胎儿和成人样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 180 | 2026-05-04 |
Integrative multi-omics analysis identifies stromal-immune crosstalk as a determinant of immunotherapy efficacy and establishes a prognostic signature in gastric cancer
2026-Apr-23, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示胃癌中基质-免疫互作对免疫检查点抑制剂疗效的影响，并建立预后特征 | 首次将基质-免疫细胞间通信（MHC-I和胶原/层粘连蛋白信号）与帕博利珠单抗耐药机制直接关联，并开发了包含VWF/VCAN等基因的预后评分系统（LSR） | 文中未明确提及研究的局限性 | 探究转移性胃癌中帕博利珠单抗疗效的分子驱动因素，并建立预后签名 | 转移性胃癌患者（包括帕博利珠单抗治疗组及多个独立队列） | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 多组学分析 | Lasso-Cox回归模型（用于构建预后签名） | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 | 包含TIGER数据库中帕博利珠单抗治疗的胃癌队列，以及4个独立验证队列（来自GEO和TCGA数据库） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据来自GEO数据库，空间转录组学用于GC组织分析 |