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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-07-23 |
CD73high fibroblasts orchestrate keratinocyte inflammation in the psoriasis-associated epithelial immune microenvironment
2026-Apr-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71323-0
PMID:41957361
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研究论文 | 通过对银屑病患者皮肤进行代谢组学、单细胞和空间转录组学分析,发现CD73高表达的成纤维细胞通过腺苷信号调控角质形成细胞炎症,揭示成纤维细胞-角质形成细胞互作在银屑病发病中的关键作用 | 首次揭示CD73高表达成纤维细胞通过腺苷代谢途径介导成纤维细胞与角质形成细胞间的互作,驱动银屑病上皮免疫微环境炎症,为靶向代谢微环境治疗炎症性皮肤病提供新思路 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,其结论在人体内的普适性及长期临床转化效果仍需进一步验证 | 探究银屑病上皮免疫微环境中代谢失调的免疫机制及下游后果 | 银屑病患者皮肤组织、咪喹莫特和IL-23A诱导的小鼠皮肤炎症模型 | 机器学习 | 银屑病 | 代谢组学, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 基因敲除, 药理学抑制 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 银屑病患者皮肤组织样本(数量未明确说明),以及咪喹莫特和IL-23A诱导的小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 162 | 2026-07-18 |
Current understanding and future directions in severe asthma through artificial intelligence-integrated multi-omic approaches
2026-Apr, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society
IF:9.0Q1
DOI:10.1183/16000617.0040-2025
PMID:42203233
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综述 | 探讨通过人工智能整合多组学方法在重症哮喘研究中的当前理解与未来方向 | 首次系统综述人工智能与多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)整合在重症哮喘研究中的应用,揭示传统方法难以发现的模式 | 未提供具体实验数据或模型验证结果,仅基于文献综述,缺乏临床试验转化证据 | 理解重症哮喘的分子机制并改善其管理 | 重症哮喘患者及其分子特征 | 机器学习 | 哮喘 | 多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学), 单细胞RNA测序 | NA | 文本, 基因数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
| 163 | 2026-07-17 |
High ALG1 Expression Is Correlated With Poor Prognosis and the Immune Microenvironment in Glioma
2026-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71142
PMID:42002825
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,探讨ALG1在胶质瘤中的表达及其与预后和免疫微环境的关系 | 首次系统揭示ALG1在胶质瘤中的高表达与不良预后相关,并阐明其通过调节细胞迁移、上皮间质转化及免疫抑制微环境促进肿瘤恶性的机制 | 未提及具体的样本量局限性或潜在混杂因素 | 研究ALG1在胶质瘤中的表达及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 胶质瘤患者的临床样本、TCGA和CGGA数据库数据及小鼠模型 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 生物信息学分析、RT-qPCR、Western blotting、免疫组化/免疫荧光、单细胞RNA测序、siRNA敲低、伤口愈合实验、原位小鼠模型 | NA | 基因表达数据、临床样本数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和CGGA数据库中的胶质瘤样本及临床样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 164 | 2026-07-15 |
Integrated bioinformatics analysis of the shared molecular mechanisms between Parkinson's disease and COVID-19
2026-Apr-28, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00908-25
PMID:41930954
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析和单细胞RNA测序,探究帕金森病与COVID-19之间的共享分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示CHI3L1表达的星形胶质细胞在COVID-19中显著增加,并发现星形胶质细胞通过多种信号分子与神经元和免疫细胞相互作用,可能加剧帕金森病症状 | 需要更大规模的研究进一步验证CHI3L1的病理相关性和功能意义 | 探究帕金森病与COVID-19之间的共享分子机制以及潜在的治疗靶点 | COVID-19患者脑组织样本和帕金森病样本中的基因表达数据 | 机器学习 | 帕金森病, COVID-19 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | COVID-19样本和帕金森病样本的批量RNA-seq数据及COVID-19患者脑组织单细胞RNA-seq数据 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 165 | 2026-07-15 |
Single-Cell Sequencing Analysis-Driven Nanomedicine Design for Mimicking Endogenous Immune Repair in Myocardial Infarction
2026-Apr-21, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01251
PMID:41934404
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研究论文 | 利用单细胞测序分析驱动纳米医学设计,通过模拟内源性免疫修复过程来治疗心肌梗死 | 首次提出数据驱动的仿生策略,通过顺序递送免疫细胞模拟纳米颗粒来复制自然免疫修复机制,并基于单细胞RNA测序揭示了巨噬细胞亚型在心肌梗死后不同阶段的动态分布及作用 | 未提及具体局限性 | 设计并验证一种模拟内源性免疫修复的纳米医学策略用于心肌梗死治疗 | 心肌梗死小鼠模型中的免疫细胞(重点为巨噬细胞亚型M2a、M2b、M2c) | 数字病理学 | 心血管疾病(心肌梗死) | 单细胞RNA测序 | 纳米颗粒递送系统 | 单细胞转录组数据 | 心肌梗死小鼠模型(具体样本数未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'测序平台 |
| 166 | 2026-07-15 |
Single-cell RNA sequencing and Mendelian randomization identify context-dependent LIPA-associated classical monocyte states in sepsis and breast cancer
2026-Apr-17, Breast cancer research and treatment
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10549-026-07965-x
PMID:41991741
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,鉴定败血症和乳腺癌中与LIPA相关的经典单核细胞状态及其环境依赖性 | 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法,揭示LIPA基因在败血症和乳腺癌两种疾病环境中对经典单核细胞状态的差异调控作用 | 研究结果仅作为假设生成,需要未来配对样本、机制性和实验性研究来验证LIPA在免疫调节和乳腺癌中的功能相关性 | 探究LIPA基因在败血症和乳腺癌中与经典单核细胞状态的环境依赖性关联 | 败血症和乳腺癌患者的外周血单核细胞及肿瘤微环境中的经典单核细胞 | 单细胞转录组学、基因组学 | 乳腺癌、败血症 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化 | NA | 单细胞转录组数据 | 乳腺癌和败血症的单细胞RNA测序数据集,以及独立验证的乳腺癌患者外周血单核细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2026-07-15 |
Deciphering oxidative stress-related heterogeneity and developing a prognostic signature for colorectal cancer
2026-Apr-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-46560-4
PMID:41935137
|
研究论文 | 通过单细胞和批量RNA-seq数据解析氧化应激相关异质性,构建结直肠癌预后风险评分模型 | 创新性地结合单细胞和批量转录组数据解析氧化应激在结直肠癌肿瘤微环境中的异质性,并构建了12基因的氧化应激相关风险评分(OSRRS)模型 | 未明确说明局限性 | 揭示氧化应激对结直肠癌肿瘤微环境的影响,并开发OS相关风险评分模型 | 结直肠癌恶性肿瘤细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq, qRT-PCR, IHC | LASSO Cox | 转录组数据 | 单细胞RNA-seq数据集GSE132465、TCGA-CRC批量RNA-seq数据集、GSE39582和GSE17538验证队列 | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2026-07-15 |
New perspectives on the mechanisms and treatment of valvular heart disease: Mendelian randomization and systematic analysis based on plasma proteins
2026-Apr-03, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000048210
PMID:41931316
|
研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化和整合分析方法,识别心脏瓣膜病的分子靶点和潜在治疗药物 | 首次将孟德尔随机化、药物重定位与单细胞RNA测序结合,系统分析心脏瓣膜病的分子机制和候选药物 | 仅基于公共GWAS数据,缺乏实验验证, 且药物预测需进一步临床检验 | 识别心脏瓣膜病的关键分子靶点和潜在治疗候选物 | 心脏瓣膜病患者及其相关基因和蛋白质 | 机器学习 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 基于公共GWAS数据集,未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2026-07-15 |
Transcriptome data combined with two-sample Mendelian randomization reveal IRF1 and PRKD1 as UPR-related key regulators in intervertebral disc degeneration
2026-Apr-03, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000048213
PMID:41931350
|
研究论文 | 通过整合转录组数据与双样本孟德尔随机化分析,发现IRF1和PRKD1是椎间盘退变中UPR相关的关键调控因子 | 首次结合双样本孟德尔随机化与单细胞RNA测序数据,证实IRF1和PRKD1与椎间盘退变风险的因果关系,并揭示其在免疫浸润中的角色 | 基于公共数据库的样本量有限,且未进行体外或体内实验验证因果关系的机制 | 探索内质网应激与未折叠蛋白反应在椎间盘退变中的分子调控机制 | 人类髓核组织样本中的差异表达基因、免疫细胞浸润及转录因子靶点 | 机器学习 | 椎间盘退变 | 转录组学、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据 | 包含GSE70362和GSE56081两个转录组数据集,以及独立验证数据集和单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2026-07-15 |
Regulation of mitochondrial ROS by C15ORF48 in a basal cell subpopulation contributes to chemotherapy resistance in TNBC
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec8684
PMID:41931605
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示在TNBC中C15ORF48在基底细胞亚群中调控线粒体ROS导致化疗耐药的机制 | 首次发现C15ORF48作为线粒体细胞色素c氧化酶相关亚基FA4的旁系同源物,在基底细胞亚群中上调并通过抑制ROS积累诱导化疗耐药,为克服TNBC耐药提供新靶点 | NA | 阐明三阴性乳腺癌对标准化疗(阿霉素和环磷酰胺)耐药的分子机制 | 三阴性乳腺癌患者来源的异种移植模型中的肿瘤上皮细胞 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 171 | 2026-07-15 |
TMBIM6 enhances dopaminergic neuron survival by modulating the IRE1a pathway in Parkinson's disease
2026-Apr-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08391-5
PMID:41932887
|
研究论文 | 该研究揭示了TMBIM6通过调控IRE1a通路增强帕金森病中多巴胺能神经元存活的机制 | 首次发现TMBIM6在帕金森病中通过直接结合IRE1a调控未折叠蛋白反应,并证明TMBIM6/IRE1a轴可作为潜在治疗靶点 | 文章未明确提及研究局限性,但可能包括动物模型与人类疾病的差异以及机制验证的深度限制 | 探究TMBIM6在帕金森病多巴胺能神经元变性中的作用及其分子机制 | 帕金森病细胞模型、原代神经元、果蝇模型和小鼠模型 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 基因表达数据 | 包括细胞模型、原代神经元、果蝇和小鼠样本,具体数量未提及 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 172 | 2026-07-15 |
Research progress in heterogeneity of dental mesenchymal stem cells
2026-Apr-03, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-026-00433-8
PMID:41932866
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综述 | 综述了牙科间充质干细胞在发育异质性和亚群异质性方面的研究进展 | 应用单细胞RNA测序等新技术揭示了牙科间充质干细胞的发育层次和异质性 | NA | 整合牙齿和牙周组织发育过程中牙科间充质干细胞异质性的现有知识 | 颅神经嵴来源的牙科间充质干细胞及相关细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 173 | 2026-07-15 |
Single-cell transcriptomics reveals FXR1 as an actionable target for siRNA therapy in ovarian cancer
2026-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71468-y
PMID:41932914
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研究论文 | 单细胞转录组学揭示FXR1是卵巢癌中siRNA治疗的一个可行靶点 | 首次利用单细胞RNA测序分析高表达FXR1的卵巢癌腹水样本,证实LNA修饰的siRNA(siFXR1-LNA)在体内比天然siRNA更有效抑制肿瘤生长、腹水形成和转移,并揭示FXR1沉默对肿瘤细胞增殖及免疫细胞亚群的调控作用 | 未提供具体样本量或临床前模型的详细限制描述 | 评估FXR1作为卵巢癌中siRNA治疗靶点的可行性和机制 | 卵巢癌肿瘤组织、腹水中的肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞 | 机器学习 | 卵巢癌 | RNA干扰、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'转录组学 |
| 174 | 2026-07-15 |
Spatially resolved osteoblast-traced transcriptomics uncovers TGF-β as a combination target with sclerostin in osteoporosis
2026-Apr-02, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-026-00521-9
PMID:41927532
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研究论文 | 利用空间分辨成骨细胞示踪转录组学揭示TGF-β与硬骨抑素联合治疗骨质疏松的潜力 | 首次结合成骨细胞特异性谱系追踪和空间分辨激光激活细胞分选技术,实现对静息骨表面成骨细胞状态的空间转录组分析,并发现TGF-β作为成骨细胞活化调控因子,提出双靶点治疗策略 | 未提及具体限制 | 阐明成骨细胞在静息与激活状态间动态转换的分子机制,并探索骨质疏松新型治疗靶点 | 小鼠成骨细胞及骨组织 | 机器学习 | 骨质疏松 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(后肢卸载模型)及体外实验样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 空间分辨激光激活细胞分选(SLACS)结合10x Visium空间转录组学;10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 175 | 2026-07-15 |
MYC-induced USP10 stabilizes SOX4 to promote thymocyte proliferation and leukemia onset in mice
2026-Apr-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71084-w
PMID:41927540
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研究论文 | 本研究揭示了MYC诱导的USP10通过稳定SOX4促进胸腺细胞增殖及小鼠白血病发生的分子机制 | 首次整合去泛素化酶文库筛选与单细胞RNA测序,发现USP10是连接胸腺细胞发育信号、增殖信号与白血病转化的关键协调因子,并验证其作为T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)治疗靶点的潜力 | 研究主要在动物模型中进行,USP10在人类T-ALL患者中的作用机制及其临床应用价值仍需进一步验证 | 阐明胸腺细胞发育异常与白血病发生的分子机制,特别是去泛素化酶USP10在此过程中的功能 | 小鼠胸腺细胞、人胸腺细胞及T-ALL患者外周血样本 | 机器学习 | 白血病(T细胞急性淋巴细胞白血病,T-ALL) | 去泛素化酶文库筛选、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 小鼠胸腺细胞、人胸腺细胞及T-ALL患者外周血样本(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 公开可用的单细胞RNA测序数据 |
| 176 | 2026-07-15 |
Single-cell transcriptome profiling reveals herpesviral manipulation of host processes in spleen of gibel carp infected with a Cyvirus cyprinidallo2
2026-Apr, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1014114
PMID:41926453
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示疱疹病毒对银鲫脾脏宿主过程的操控 | 首次通过单细胞RNA测序解析了鲤疱疹病毒2型在体内的允许细胞类型及其对宿主细胞过程的精细操控机制,发现了病毒诱导的广泛宿主过程抑制和M2型巨噬细胞极化 | 研究仅聚焦于脾脏组织,未涵盖其他可能受影响的组织或器官,且缺乏对病毒潜伏期和再激活机制的探讨 | 揭示鲤疱疹病毒2型(CaHV)在银鲫体内的感染机制及与宿主的相互作用 | 感染鲤疱疹病毒2型(CaHV)的银鲫脾脏细胞 | 单细胞转录组学 | 疱疹病毒性造血坏死病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞基因表达数据 | 感染CaHV的银鲫脾脏样本(具体数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA |
| 177 | 2026-07-15 |
"Eye-Conic" Spatial Transcriptomics Reveals the Layer-Specific Molecular Alterations in Corneas of Patients With Keratoconus
2026-Apr-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.4.7
PMID:41931003
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研究论文 | 使用空间转录组学揭示圆锥角膜患者角膜的层特异性分子改变 | 首次应用空间转录组学方法研究圆锥角膜角膜的层特异性分子改变,揭示细胞周期失调、细胞外基质通路上调及内皮层翻译和核糖体通路激活等新发现 | 信息未提供 | 识别圆锥角膜锥形成过程中角膜层特异性细胞和分子改变 | 圆锥角膜和正常对照角膜 | 数字病理学 | 圆锥角膜 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 圆锥角膜和对照角膜样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 178 | 2026-07-15 |
Using cell-specific late-phase asthma mRNA biomarkers to repurpose drugs that concurrently reverse disease signatures across multiple immune cell-types
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014081
PMID:41931526
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research paper | 本研究利用哮喘晚期反应特异性mRNA生物标志物,通过药物特征匹配重新定位药物,以逆转多个免疫细胞类型中的疾病特征 | 结合血液生物标志物与单细胞RNA测序数据,识别细胞特异性转录变化,并通过公共单细胞扰动数据集进行药物特征匹配,发现能逆转这些变化的化合物 | 研究样本量较小,且仅基于轻度过敏性哮喘患者,结果需在更大样本和更严重患者中验证 | 探索哮喘晚期反应mRNA生物标志物在预测哮喘恶化和严重程度中的作用,并识别潜在的治疗药物 | 轻度过敏性哮喘患者 | machine learning | asthma | RNA-seq, single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data, single-cell RNA sequencing data | 轻度过敏性哮喘患者,具体数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2026-07-15 |
Multi omics analysis reveals senescence associated genes in metabolic dysfunction associated steatohepatitis related liver cancer and their functional validation
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151713
PMID:41933769
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research paper | 通过多组学分析揭示代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌中的衰老相关基因并进行功能验证 | 首次系统性地筛选并验证了SOD2、ALDH2、MME和IGFBP1四个衰老相关基因在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌中的关键作用,并发现EPZ5676药物对这些基因具有良好亲和力,为MRLC的靶向治疗提供新思路 | 未提及明显的局限性,但可能包括样本量有限或动物模型与人类疾病的差异 | 探究衰老相关基因在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌中的作用及其潜在治疗靶点 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌患者和C57BL/6小鼠模型 | 机器学习 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 多机器学习方法(包括加权基因共表达网络分析、Mendelian randomization等) | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 全球疾病负担数据库分析,C57BL/6小鼠模型用于实验验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 180 | 2026-07-12 |
Spatiotemporal profiling of Fat family genes highlights Fat2 as a novel marker of outer enamel epithelium and stratum intermedium
2026-Apr, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2026.100766
PMID:41862271
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研究论文 | 本研究揭示了Fat基因家族在小鼠牙齿发育过程中的时空表达模式,并发现Fat2可作为外釉上皮和中间层的新的标志物 | 首次系统描绘Fat1-Fat4在小鼠牙齿发育中的时空表达谱,并鉴定Fat2为外釉上皮和中间层的特异性标志物,通过功能实验证实其在牙上皮干细胞分化和细胞身份维持中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚需在人类牙齿发育中验证;Fat2调控下游基因的具体分子机制未完全阐明 | 探究Fat基因家族(Fat1-Fat4)在小鼠牙齿发育过程中的时空表达模式及其功能 | C57BL/6J小鼠胚胎及新生小鼠的牙齿组织;M3H1牙上皮干细胞系 | 数字病理学 | 牙齿发育异常 | 定量聚合酶链反应, 原位杂交, 小干扰RNA敲低, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 从胚胎第12.5天到出生的小鼠牙齿样本;M3H1细胞系样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 使用了公共单细胞RNA-seq数据集 |