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当前共找到 951 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-06-17 |
Machine learning predictions surpass individual mRNAs as a proxy of single-cell protein expression
2026-Apr-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04083-1
PMID:42021407
|
研究论文 | 测试九种机器学习方法预测单细胞蛋白表达，并与单独使用mRNA进行比较 | 系统比较多种机器学习方法在单细胞蛋白表达预测中的性能，发现基于全转录组的推断能预测mRNA缺失的蛋白表达 | 模型泛化能力有限，需要高度相似的训练数据，限制了当前应用范围 | 评估机器学习方法预测单细胞蛋白表达的能力，并比较其与直接使用mRNA的准确性 | 单细胞RNA测序数据及对应的表面蛋白表达数据 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 九种机器学习方法（包含多种类型） | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 142 | 2026-06-17 |
Clonal biases dictate availability of colonic cancer driver mutations for transformation
2026-Apr-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71944-5
PMID:41991531
|
研究论文 | 通过靶向测序分析正常结肠腺体中的癌症驱动突变，揭示不同基因突变在组织中的克隆行为及其转化风险差异 | 首次在组织学正常的结肠腺体中系统比较五种结直肠癌驱动基因（APC、KRAS、TP53、FBXW7和CTNNB1）的突变频率、克隆动态及转化风险，并揭示FBXW7 R465C突变倾向于固定而KRAS G12突变强力促进扩增的差异机制 | 未明确说明局限性 | 探究人结肠中不同原癌事件在频率、行为及后续转化风险方面的差异 | 来自56名患者的76,800个正常结肠腺体 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 靶向测序, 空间转录组学 | NA | 测序数据, 空间转录组数据 | 56名患者的76,800个正常结肠腺体 | NA | 靶向测序， 空间转录组学 | NA | NA |
| 143 | 2026-06-17 |
Spatial transcriptomics of en bloc transurethral resection of bladder tumor specimens defines an invasive-front gene expression signature
2026-Apr-14, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01417-x
PMID:41981124
|
研究论文 | 使用空间转录组学分析膀胱肿瘤整块经尿道切除标本，识别出侵袭前沿的基因表达特征 | 首次利用空间转录组学技术对整块经尿道膀胱肿瘤切除标本进行分析，在保留三维肿瘤结构的前提下，识别出与非肌层浸润性膀胱癌侵袭相关的前沿基因表达特征，并发现该15基因特征与预后相关 | 样本量较小（共7例），且仅针对高风险非肌层浸润性膀胱癌，结果需在更大队列中验证 | 阐明非肌层浸润性膀胱癌向肌层浸润性膀胱癌进展的侵袭机制，并识别预后标志物 | 7例高级别非肌层浸润性膀胱癌的整块经尿道切除标本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据，批量RNA-seq数据 | 7例膀胱肿瘤整块经尿道切除标本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台，用于分析整块经尿道切除标本 |
| 144 | 2026-06-17 |
Prognostic Implications of Programmed Cell Death Ligand 1 Expression, Cluster of Differentiation 8-Positive T-Cell Infiltration, and Related Immunophenotypes in Invasive Mucinous Adenocarcinoma of the Lung: A Multicenter Study
2026-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70710
PMID:41948454
|
研究论文 | 本研究系统评估了肺浸润性黏液腺癌中PD-L1表达和CD8阳性T细胞浸润，并建立了新的免疫表型分类 | 首次在最大样本队列中深入分析了IMA的免疫微环境，并提出四类免疫表型分类系统，具有预后和预测潜力 | 未明确提及具体局限性，但单细胞RNA-seq分析样本量较小（20例接受免疫检查点抑制剂治疗的患者） | 探索肺浸润性黏液腺癌的免疫微环境及其对免疫治疗的潜在反应 | 肺浸润性黏液腺癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | PD-L1免疫组化, CD8免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 转录组数据 | 312例纯IMA患者，其中20例接受免疫检查点抑制剂治疗 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 145 | 2026-06-16 |
The crosstalk between epigenetics and metabolism in the malignant cell
2026-Apr-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05082-1
PMID:42043678
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2026-06-16 |
Single-cell profiling reveals distinct populations of tumor-associated macrophages and metastatic tumor cells in breast cancer brain metastasis
2026-Apr-25, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08807-w
PMID:42034645
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析乳腺癌脑转移的肿瘤免疫微环境，鉴定与脑转移进展相关的候选调节因子 | 首次在单细胞分辨率下全面解析乳腺癌脑转移中肿瘤相关巨噬细胞和转移性肿瘤细胞的异质性，并发现GABRB3和NRXN1基因突变与患者生存率降低相关 | 样本量较小（7例患者用于单细胞测序，47例用于批量DNA测序），且功能实验仅基于异种移植模型 | 阐明乳腺癌脑转移的分子机制，识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 乳腺癌脑转移患者、异种移植小鼠模型 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、批量DNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 7例患者的脑转移组织、邻近肿瘤组织、脑脊液和循环肿瘤细胞；47例患者的原发乳腺肿瘤、外周血和脑转移组织；共131,880个单细胞 | Illumina | 单细胞RNA测序、批量DNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 147 | 2026-06-16 |
Establishment of a prognostic model for hepatocellular carcinoma patients based on bioinformatics analysis and exploration of prognostic biomarker EPPK1
2026-Apr-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-48984-4
PMID:42031825
|
研究论文 | 基于生物信息学分析建立肝细胞癌预后模型并探索预后生物标志物EPPK1 | 通过整合转录组、蛋白质组和单细胞测序数据，首次发现并验证EPPK1在肝细胞癌中的特异性高表达及其与免疫浸润和空间转录组学的关联 | 研究主要基于公开数据库（如TCGA-LIHC）进行生物信息学分析，体外功能实验验证相对有限，未涉及大规模临床样本的独立验证 | 利用生物信息学方法识别肝细胞癌预后相关基因EPPK1，并评估其作为诊断和预后生物标志物的潜在价值 | 肝细胞癌患者，包括转录组、蛋白质组和单细胞测序数据 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析, 单细胞测序, 空间转录组学, 免疫浸润分析, 虚拟扰动技术 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | 基于TCGA-LIHC数据集，具体样本数量未在摘要中明确给出 | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 148 | 2026-06-16 |
A tumor microenvironment integrated (TMI) staging system for pancreatic ductal adenocarcinoma based on cancer-associated fibroblast and molecular consensus signatures
2026-Apr-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05091-0
PMID:42033556
|
研究论文 | 基于癌症相关成纤维细胞和分子共识特征，提出胰腺导管腺癌的肿瘤微环境整合分期系统 | 将肿瘤分子亚型、基质肌成纤维细胞CAF比例与临床分期整合，首次提出TMI分期系统，优于传统AJCC分期，并发现FN1是关键信号蛋白 | TMI分期在风险一致性上弱于AJCC分期，且可能需更大规模验证 | 改进胰腺导管腺癌预后预测系统的准确性 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织样本及相关分子数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、分子特征聚类 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 发现队列320例，验证队列156例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 149 | 2026-06-16 |
CD71+ erythroid progenitor cells with mitochondrial retention were associated with inferior prognosis among patients with end-stage renal disease
2026-Apr-25, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-026-05009-6
PMID:42035018
|
研究论文 | 探索终末期肾病（ESRD）患者中CD71+红系祖细胞（EPC）与不良预后（包括心血管疾病和死亡率）的关联 | 首次揭示CD71+EPC在ESRD中通过线粒体滞留和功能障碍参与无效的代偿性髓外造血，并与不良预后相关 | 研究主要基于患者样本和小鼠模型，需要进一步验证结果在更大人群中的适用性 | 阐明ESRD贫血的机制及其与不良预后的关联 | 终末期肾病患者、5/6部分肾切除（PNx）小鼠 | 数字病理学 | 终末期肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、病理影像 | ESRD患者与健康对照者 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 150 | 2026-06-16 |
Bibliometric analysis of single-cell RNA sequencing in tumor microenvironment
2026-Apr-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05073-2
PMID:42032150
|
文献计量学分析 | 对单细胞RNA测序在肿瘤微环境研究中的文献进行计量学分析 | 首次对1999年至2024年间单细胞RNA测序在肿瘤微环境领域的187篇文献进行系统文献计量学分析，揭示了国家、机构和关键词的分布格局 | 仅基于Web of Science核心合集数据库，且数据截止至2024年7月，可能遗漏其他来源的新近文献 | 分析单细胞RNA测序在肿瘤微环境研究中的应用现状，识别研究热点和未来方向 | 187篇关于单细胞RNA测序在肿瘤微环境中应用的文献 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献元数据 | 187篇文献 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 151 | 2026-06-16 |
A method for CRISPR/Cas9-induced genetic barcoding and lineage tracing in sheep
2026-Apr-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-49093-y
PMID:42031935
|
研究论文 | 开发了一种基于CRISPR/Cas9的绵羊遗传条形码与细胞谱系追踪方法 | 首次将PiggyBac转座子与CRISPR/Cas9基因编辑工具结合，在绵羊基因组中构建可遗传的条形码区域，实现多时间点细胞谱系追踪 | 未提及与单细胞测序技术的实际结合效果及在绵羊胚胎发育中的全面验证 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2026-06-16 |
IST: an ontology-guided attention-based autoencoder for interpretable analysis of single-cell transcriptomic data
2026-Apr-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-50009-z
PMID:42032017
|
研究论文 | 提出了一个名为IST的基于注意力机制的框架，用于整合基因本体知识以进行单细胞转录组数据的可解释分析 | 将基因本体结构直接融入模型架构，利用注意力机制捕获上下文相关的基因活动，并通过相关损失确保学习到的基因活动与已知基因功能关系对齐 | 未在文摘中明确提及具体局限性 | 实现单细胞转录组数据的生物学可解释分析，整合先验知识以提高下游洞察力 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 基于注意力机制的自编码器 | 基因表达数据 | 三个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 153 | 2026-06-16 |
Fludarabine disrupts the STAT1/AhR interaction to attenuate type 1 diabetes by inducing tolerogenic dendritic cells along with targeting effector T cells
2026-Apr-23, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-026-01483-8
PMID:42026463
|
研究论文 | 氟达拉滨通过破坏STAT1/AhR相互作用诱导耐受性树突状细胞并靶向效应T细胞，从而减轻1型糖尿病 | 首次发现氟达拉滨通过破坏STAT1与AhR的相互作用，促进AhR核转位，进而诱导耐受性树突状细胞，并靶向效应T细胞，恢复免疫耐受，为1型糖尿病提供新的免疫代谢治疗候选药物 | NA | 探究氟达拉滨在1型糖尿病中恢复免疫稳态的机制及其治疗效果 | 1型糖尿病患者和动物模型中的树突状细胞、CD4+效应T细胞和调节性T细胞 | 机器学习和免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序、RNA-seq、ChIP-qPCR、Co-IP/MS、CESTA、透射电子显微镜、Seahorse分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、RNA-seq | NA | NA |
| 154 | 2026-06-16 |
Integrated in vitro and multi-cohort cross-omics analysis of HTLV-1-associated lung pathology reveals a RelA-dependent mechanism for monocyte recruitment and differentiation
2026-Apr-23, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-026-01482-9
PMID:42026465
|
研究论文 | 通过体外共培养和多队列跨组学分析，揭示HTLV-1相关肺病理中RelA依赖的单核细胞募集和分化机制 | 首次整合体外共培养模型与多队列跨组学数据（包括单细胞转录组、表观基因组、病毒互作组和多祖先全基因组关联研究），阐明NF-κB RelA/p65依赖的CSF-1诱导在HTLV-1相关肺病理中驱动单核细胞趋化和巨噬细胞分化的机制 | 体外模型可能无法完全复现体内复杂的微环境，且仅使用A549细胞系和特定T细胞株，未涵盖其他细胞类型和原代细胞 | 探究HTLV-1暴露如何通过上皮细胞信号通路引发肺部炎症，特别是单核细胞募集和分化的分子机制 | HTLV-1感染相关肺病理（如支气管扩张）中上皮-髓系炎症轴的作用机制 | 数字病理学 | HTLV-1相关肺病 | RNA-seq, CRISPR/Cas9, RT-qPCR, 单细胞RNA-seq, 表观基因组学, 病毒互作组学, 全基因组关联研究 | NA | 转录组、表观基因组、病毒互作组、基因变异 | 体外：A549细胞与MT-2/MT-4/Jurkat细胞共培养；体内：HTLV-1感染者、HAM/TSP患者和特发性肺纤维化患者的公开数据 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 全基因组关联研究 | NA | NA |
| 155 | 2026-06-16 |
The dynamic landscape of alternative splicing during silicosis progression
2026-Apr-23, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03683-6
PMID:42026633
|
研究论文 | 本研究揭示了矽肺病进展过程中可变剪接的动态景观，并发现Clec4e-RI剪接异构体可能通过调节巨噬细胞相关炎症反应在疾病发病机制中发挥关键作用 | 首次系统描绘矽肺病进展中的可变剪接动态景观，发现大多数差异表达的可变剪接事件与基因表达变化无关，揭示了剪接调控作为独立于转录调控的病理调节关键层面 | 未提及具体研究限制 | 探究可变剪接在矽肺病发病机制中的动态变化及其功能意义 | 矽肺病小鼠模型中的RNA测序数据和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 矽肺病 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型样本，具体数量未明确 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2026-06-16 |
Single-cell analysis highlights the role of CD4+ IFN-I-related T cells in Behcet's uveitis during Interferonα-2a therapy
2026-04-22, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00810-7
PMID:42021381
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示了干扰素α-2a治疗白塞病葡萄膜炎期间CD4+ IFN-I相关T细胞的作用机制 | 首次在单细胞水平上阐明了IFNα-2a通过恢复CD4+ IFN-I相关T细胞频率并调控LLT1-CD161相互作用抑制NK细胞炎症表型的治疗机制 | 未提及具体局限性 | 研究IFNα-2a治疗活动性白塞病葡萄膜炎时CD4+ IFN-I相关T细胞的作用机制 | 白塞病伴活动性葡萄膜炎患者、经IFNα-2a治疗4个月的患者、活动性白塞病患者及健康对照的外周血单个核细胞 | 单细胞分析 | 白塞病 | scRNA-seq, bulk mRNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量mRNA测序数据 | 活动性葡萄膜炎BD患者、IFNα-2a治疗后BD患者、活动性BD患者及健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 整合内部和公共scRNA-seq数据 |
| 157 | 2026-06-16 |
ADAMDEC1 predicts prognosis and immunotherapy response in a pan-cancer study with experimental validation
2026-Apr-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04977-3
PMID:42018213
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研究论文 | 通过泛癌分析及实验验证，揭示ADAMDEC1在肿瘤预后和免疫治疗反应中的预测作用 | 首次系统性阐明ADAMDEC1在多种癌症中具有组织特异性预后价值，并发现其预测免疫治疗反应的潜力可与传统生物标志物相媲美 | 文中未提及具体局限性 | 探究ADAMDEC1在泛癌中的作用及其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的价值 | ADAMDEC1基因及其在多种癌症中的表达、预后、免疫浸润和治疗反应 | 机器学习 | 泛癌（包括低级别胶质瘤、葡萄膜黑色素瘤、卵巢癌、皮肤黑色素瘤、食管癌等） | 单细胞RNA测序、免疫组化、基因集富集分析 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、组织微阵列图像 | 食管癌组织微阵列样本48例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2026-06-16 |
YBX1/PPIB axis promotes post-maturation arteriovenous fistula stenosis via enhancing endothelial to mesenchymal transition
2026-Apr-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-49568-y
PMID:42020533
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了YBX1/PPIB轴通过促进内皮-间充质转化导致动静脉瘘成熟后狭窄的机制 | 首次发现YBX1作为上游转录因子直接调控PPIB表达，揭示YBX1/PPIB轴驱动内皮-间充质转化并促进动静脉瘘成熟后狭窄的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证，且样本量可能有限 | 阐明动静脉瘘成熟后狭窄的细胞异质性和分子机制 | 动静脉瘘成熟后狭窄患者与匹配的非狭窄血管组织 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 动静脉瘘成熟后狭窄患者与匹配的非狭窄血管组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 159 | 2026-06-16 |
A multimodal approach integrating NK cell-associated gene signatures and pathomics to predict colon adenocarcinoma prognosis
2026-Apr-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-49584-y
PMID:42020555
|
研究论文 | 提出了一种整合自然杀伤细胞相关基因特征与病理组学的多模态方法，用于预测结肠腺癌预后 | 首次将自然杀伤细胞相关基因特征、病理组学特征与临床变量整合至多模态预后框架，并利用深度学习提取组织病理图像特征，提高了结肠腺癌预后预测准确性 | 没有明确提及局限性 | 构建并验证一个整合单细胞RNA测序、转录组、病理组学和临床数据的多模态预后框架，用于预测结肠腺癌预后 | 结肠腺癌患者 | 机器学习, 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序, LASSO回归, 深度学习 | Clustering-constrained Attention Multiple Instance Learning模型 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 全切片病理图像, 临床数据 | 458份TCGA-COAD全切片图像及对应临床数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 160 | 2026-06-16 |
Evolutionary Trajectory of Radioresistance in Lung Cancer Brain Metastasis Organoids
2026-Apr-21, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-026-00339-z
PMID:42010399
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研究论文 | 本研究利用肺癌脑转移患者来源类器官模拟临床放射反应，通过单细胞RNA测序揭示放射抵抗的进化轨迹和分子代谢机制 | 首次在单细胞分辨率下描绘肺癌脑转移放射抵抗的进化轨迹，揭示了乏氧-上皮间充质转化亚群在放射抵抗中的关键作用以及病毒模拟反应和代谢可塑性新机制 | 未提及 | 解析肺癌脑转移获得性放射抵抗的分子和代谢机制 | 肺癌脑转移患者来源类器官（PDOs） | 自然语言处理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 放射治疗前后配对的肺癌脑转移患者来源类器官样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 文库构建 |