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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-05-06 |
The dual molecular identity of vestibular kinocilia bridges structural and functional traits of primary and motile cilia
2026-Apr-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108071
PMID:42029006
|
研究论文 | 揭示了前庭动纤毛兼具初级纤毛和运动纤毛的结构与功能特征 | 首次通过单细胞RNA测序发现前庭毛细胞中动纤毛同时表达初级和运动纤毛相关基因,并证实其具有自发运动能力 | 未明确动纤毛自发运动在机械传导中的具体功能机制 | 阐明前庭动纤毛的分子组成、结构特征和功能特性 | 成年小鼠前庭和耳蜗毛细胞 | 机器学习和数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 成年小鼠前庭和耳蜗毛细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2026-05-06 |
Decoding Organ-Specific Vulnerability to Triptolide Toxicity: A Systems Toxicology Approach Targeting Glucose Metabolism
2026-Apr-24, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 利用系统毒理学方法解析雷公藤甲素多器官毒性的分子机制,重点关注葡萄糖代谢紊乱 | 首次通过整合网络药理学、孟德尔随机化、分子对接、分子动力学模拟和单细胞RNA测序分析,系统揭示雷公藤甲素通过靶向糖酵解和磷酸戊糖途径关键酶导致器官特异性毒性的双重机制 | 该研究主要基于计算分析,缺乏体内外实验验证;孟德尔随机化分析受限于现有GWAS数据质量;分子对接结果需进一步晶体学验证 | 阐明雷公藤甲素导致多器官毒性的分子机制,为设计更安全的雷公藤甲素类似物提供理论基础 | 雷公藤甲素对肝脏、肾脏、心脏和生殖系统的毒性作用及其靶点 | 系统毒理学 | 药物毒性 | 网络药理学, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 123 | 2026-05-06 |
Mechanisms Underlying the Therapeutic Effects of GeXiaZhuYu Decoction Treating Colorectal Cancer based on Network Pharmacology, Molecular Docking, and Molecular Dynamics Simulations
2026-Apr-23, Current computer-aided drug design
IF:1.5Q3
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学、分子对接和分子动力学模拟,揭示了膈下逐瘀汤治疗结直肠癌的潜在分子机制 | 首次结合网络药理学、分子对接、分子动力学模拟和MM-GBSA结合自由能分析的多层次计算策略,从系统层面解析膈下逐瘀汤的活性成分与结直肠癌相关靶点的相互作用,并利用单细胞RNA-seq数据验证关键靶点的细胞类型特异性表达 | 研究结果基于计算分析,不直接暗示药理效应或因果机制,需要进一步实验验证 | 从系统层面表征膈下逐瘀汤治疗结直肠癌的潜在药理机制 | 膈下逐瘀汤的活性成分(槲皮素、木犀草素、山奈酚)与结直肠癌相关靶点(HSP90AA1、AKT1、TP53) | 机器学习 | 结直肠癌 | 网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、MM-GBSA分析、单细胞RNA-seq | NA | 文本、基因表达数据 | 单细胞RNA-seq数据集GSE144735 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2026-05-06 |
Single-Cell Ligand-Receptor Profiling Identifies Targetable Signaling Axes and Therapeutic Candidates in Lupus Nephritis
2026-Apr-22, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 通过单细胞配体-受体分析鉴定狼疮性肾炎中可靶向的信号轴及治疗候选药物 | 首次基于高关联配体-受体对进行狼疮性肾炎亚型分类,并结合分子对接和动力学模拟筛选老药新用候选物 | 仅基于公共单细胞数据,缺乏前瞻性队列验证;体内实验尚未开展 | 阐明配体-受体信号在狼疮性肾炎免疫微环境中的作用并发现治疗靶点 | 狼疮性肾炎患者肾脏组织的单细胞转录组数据 | 计算生物学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 整合多个公开单细胞RNA-seq数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序 |
| 125 | 2026-05-06 |
Divergent Macrophage-Regulated T cell States Determine Response to Bacillus Calmette-Guérin vaccine in High-Risk Bladder Cancer
2026-Apr-21, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI200442
PMID:42081487
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2026-05-06 |
Single-cell TCR mapping reveals spatially coordinated T cell states in head and neck cancer
2026-Apr-10, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aec3133
PMID:41961948
|
研究论文 | 提出一种空间TCR图谱分析策略,以单细胞分辨率解析头颈鳞癌中T细胞克隆、转录状态和空间位置的关系 | 首次实现单细胞层面同时解析T细胞克隆身份、转录状态和空间位置,揭示肿瘤微环境中T细胞状态的空间协调性 | 标题和摘要未提及明显局限性 | 开发空间TCR图谱方法,解析头颈癌肿瘤微环境中T细胞的空间组织与功能状态 | 人原发性头颈部鳞状细胞癌组织样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | 空间TCR图谱分析 | NA | 空间转录组与TCR测序数据 | 多例头颈鳞癌患者样本(具体数量未提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 127 | 2026-05-06 |
CD55-expressing myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) drive cancer immunoevasion
2026-Apr-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012980
PMID:41963079
|
研究论文 | 发现表达CD55的髓系来源抑制细胞(MDSCs)驱动肿瘤免疫逃逸 | 首次鉴定CD55作为MDSCs的保守表面标志物,并揭示其通过代谢重编程(促进糖原磷酸化酶PYGL磷酸化驱动糖酵解)维持免疫抑制表型的新机制 | 主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证规模有限;托马替丁等小分子抑制剂的体内应用效果需进一步评估 | 阐明MDSCs表面分子CD55在肿瘤免疫逃逸中的作用机制及治疗潜力 | MDSCs及其表达的CD55分子 | 数字病理学 | 多种癌症类型(八种癌症) | 单细胞RNA测序、RNA测序、DNA pulldown、染色质免疫共沉淀、荧光素酶报告基因、免疫共沉淀、免疫印迹、免疫沉淀-质谱、分子对接、表面等离子共振成像 | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 八种癌症类型的公共单细胞RNA测序数据集、人类患者样本及小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2026-05-06 |
QuantumXCT: Learning Interaction-Induced State Transformation in Cell-Cell Communication via Quantum Entanglement and Generative Modeling
2026-Apr-09, ArXiv
PMID:41958473
|
research paper | 提出一个混合量子-经典生成框架QuantumXCT,从单细胞转录组中推断细胞间通讯,通过量子纠缠学习相互作用诱导的状态变换 | 将细胞间通讯推断从静态配体-受体数据库查询转变为学习数据驱动的状态变换,利用量子电路的可解释性揭示生物通信网络,无需先验生物学假设 | 未明确说明,但可能受限于量子电路的规模及对合成数据的验证而非大规模真实数据 | 开发一种无先验知识依赖的细胞间通讯推断方法,通过量子机器学习建模信号导致的细胞状态变化 | 卵巢癌-成纤维细胞共培养模型中的单细胞转录组数据及合成数据中的已知交互 | machine learning, quantum machine learning, computational biology | ovarian cancer | single-cell RNA-seq, quantum computing | hybrid quantum-classical generative model, parameterized quantum circuits | gene expression data, synthetic data | 未知具体样本数量,涉及卵巢癌-成纤维细胞共培养的scRNA-seq数据 | Illumina(假设用于scRNA-seq测序,从上下文推断) | single-cell RNA-seq | NA(未在标题或摘要中指定具体平台产品) | NA |
| 129 | 2026-05-06 |
Generation of a prop1 knock-in zebrafish enables single-cell transcriptomics of early pituitary development
2026-Apr-07, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqag043
PMID:42035243
|
研究论文 | 通过生成prop1敲入斑马鱼,利用单细胞转录组学研究早期垂体发育 | 首次创建了prop1基因敲入GAL4报告基因斑马鱼品系,实现了对早期垂体发育的单细胞分辨率和活体成像研究,并提供了首个斑马鱼早期垂体发育的单细胞图谱 | 未明确提及 | 研究脊椎动物腺垂体原基发育的早期分子机制及内分泌细胞谱系分化 | 斑马鱼和小鼠的早期垂体组织 | 单细胞转录组学 | 垂体发育相关疾病(如侏儒症、性成熟障碍) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、活体成像 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼和小鼠垂体组织样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 130 | 2026-05-06 |
Cardiac Fibrosis: Mechanobiology, Epigenetics, and the Path to Precision Therapy
2026-Apr, Cellular and molecular bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s12195-026-00896-z
PMID:42080143
|
综述 | 全面综述心脏纤维化的机械生物学、表观遗传学机制及精准治疗路径 | 整合单细胞和空间转录组学、生物力学及表观遗传学数据,系统阐述纤维化细胞异质性与分子环路;提出CRISPR基因编辑、FAP靶向CAR-T、纳米RNA递送及患者心脏类器官等新兴可逆疗法;构建结合基因组学、生物标志物、AI和环境风险评估的精准抗纤维化策略 | 作为综述,未提供原创实验数据;新兴疗法的临床转化尚处于早期阶段,缺乏大规模验证 | 阐明心脏纤维化的机械生物学与表观遗传学机制,并规划从基础研究到临床精准治疗的转化路线图 | 心脏纤维化中的成纤维细胞、心肌细胞-细胞外基质串扰、机械传导信号及表观遗传调控网络 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学,空间转录组学,基因编辑,CAR-T免疫疗法,纳米医学,类器官技术 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学平台 |
| 131 | 2026-05-05 |
Unraveling the role of non-coding RNAs in Parkinson's disease: Molecular mechanisms and therapeutic insights
2026-Apr-30, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2026.106963
PMID:42067182
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综述 | 本文系统总结了非编码RNA(miRNA、lncRNA和circRNA)在帕金森病发病机制中的分子调控作用,并探讨其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 整合了从单细胞测序和多组学数据中发现的非编码RNA细胞特异性失调模式,并提出了基于ncRNA的分子分层和靶向治疗策略 | 未涉及非编码RNA在帕金森病中直接用于临床治疗的验证数据,也缺乏跨病理阶段的纵向研究支持 | 阐明非编码RNA在帕金森病中的分子机制及其作为早期诊断和治疗靶点的潜力 | 帕金森病患者脑组织中的非编码RNA(miRNA、lncRNA和circRNA)及其调控网络 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞测序、多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学 | NA | NA |
| 132 | 2026-05-05 |
Integrated single-cell transcriptomics and in vivo investigation reveal the role of ANXA1 in intestinal barrier dysfunction during heat stroke by mediating neutrophil-monocyte interaction and regulating the TLR4/ERK/NF-κB pathway
2026-Apr-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153873
PMID:42070539
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和体内实验,揭示了ANXA1在中暑引起的肠道屏障功能障碍中通过调节中性粒细胞-单核细胞相互作用和TLR4/ERK/NF-κB通路的作用 | 首次整合单细胞RNA测序和体内实验,阐明了ANXA1通过中性粒细胞-单核细胞相互作用和TLR4/ERK/NF-κB通路保护肠道屏障的机制,并确定了ANXA1-FPR2为关键轴 | 未提供显著局限性 | 研究ANXA1在中暑引起的肠道屏障功能障碍中的作用机制 | 中暑患者和健康对照者的单细胞转录组数据,以及小鼠中暑模型中的结肠组织 | 数字病理学 | 中暑 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 中暑患者和健康对照组,以及小鼠中暑模型(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2026-05-05 |
Kidney Hematopoietic Stem and Progenitor Cells Contribute to Myeloid Development and Pathology in Lupus Nephritis
2026-Apr-28, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70201
PMID:42047318
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研究论文 | 探讨肾脏驻留造血干细胞和祖细胞在狼疮性肾炎中对髓系发育和病理的贡献 | 首次证明肾脏中的造血干细胞和祖细胞参与髓外造血,并通过局部髓系细胞扩增促进狼疮性肾炎进展 | 主要基于小鼠模型,人源样本分析有限,可能需要进一步验证临床相关性 | 研究髓外造血和肾脏驻留造血干细胞和祖细胞在狼疮性肾炎发病机制中的作用 | 狼疮性肾炎小鼠模型(MRL/lpr和TLR7激动剂诱导)及患者尿液样本 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序、免疫染色、过继转移实验 | NA | 序列数据、图像数据 | 两种小鼠模型及狼疮性肾炎患者尿液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于肾脏和骨髓祖细胞分析 |
| 134 | 2026-05-05 |
Myeloid Cell States in Influenza-Associated Pulmonary Aspergillosis Are Shaped by Iron Overload and Metabolic Reprogramming
2026-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.22.720189
PMID:42079193
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研究论文 | 结合小鼠模型和单细胞RNA测序探究流感相关肺曲霉病中髓系细胞功能紊乱及铁超载和代谢重编程的作用 | 首次通过单细胞转录组学揭示铁超载驱动的免疫代谢重编程在流感诱导的肺曲霉病中导致髓系细胞抗真菌功能受损 | 仅基于小鼠模型和单细胞RNA测序数据,可能不完全反映人类复杂的免疫反应 | 揭示流感病毒预感染如何通过铁代谢和代谢重编程破坏髓系细胞抗真菌功能,增加继发性曲霉病易感性 | 小鼠模型中的肺单核细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺部感染 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(未提供具体数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2026-05-05 |
SIV infection disrupts the spatial cellular and communication networks of pulmonary granulomas during SIV/Mtb co-infection
2026-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.24.720743
PMID:42079194
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研究论文 | 利用空间转录组学比较SIV/Mtb共感染猕猴肺部肉芽肿的细胞和通讯网络,探究HIV如何破坏肉芽肿的空间免疫功能 | 首次在SIV/Mtb共感染模型中,通过空间转录组学揭示HIV干扰了肺部肉芽肿内部髓系和T细胞区域的空间分化模式,并指出抗逆转录病毒治疗无法完全恢复这些免疫网络 | 未提供具体限制信息 | 研究HIV/Mtb共感染中肺部肉芽肿的免疫相互作用,以及抗逆转录病毒治疗的影响 | SIV/Mtb共感染猕猴的肺部肉芽肿 | 数字病理学 | 肺结核、HIV共感染 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 猕猴样本,具体数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 136 | 2026-05-05 |
Synovial transcriptional clusters link cartilage degeneration to cell-type-specific gene expression in knee osteoarthritis
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.21.719697
PMID:42079156
|
研究论文 | 通过转录组聚类分析揭示膝关节骨关节炎滑膜转录簇与软骨退变及细胞类型特异性基因表达的关系 | 首次将人类膝关节骨关节炎滑膜组织分为四个转录簇,并明确它们与软骨退变严重程度的关联 | 样本量有限,未涉及纵向随访数据验证,需要进一步验证这些转录簇在其他人群中的可重复性 | 识别膝关节骨关节炎中滑膜的转录簇,并阐明其与滑膜组织学特征、细胞类型特异性基因表达和软骨退变严重程度的关系 | 膝关节骨关节炎患者的滑膜组织 | 机器学习 | 骨关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 共识聚类 | 基因表达数据, 组织学图像 | n=135(批量RNA-seq),n=18(单细胞RNA-seq) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 137 | 2026-05-05 |
Turep: Detecting cross-cancer tumor-reactive T cells in single-cell and spatial transcriptomics data
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.21.719961
PMID:42079298
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研究论文 | 提出Turep深度学习方法,利用单细胞和空间转录组数据稳健预测跨癌种肿瘤反应性T细胞 | 整合七种人类恶性肿瘤的配对单细胞RNA和T细胞受体测序数据,识别泛癌肿瘤反应性基因特征,并采用生成式数据增强解决数据不平衡问题 | NA | 开发一种通用性强的方法,用于跨癌种预测肿瘤反应性T细胞 | 肿瘤浸润淋巴细胞中的肿瘤反应性T细胞与非反应性旁观者细胞 | 机器学习 | 多种癌症(泛癌) | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 空间转录组学 | 深度学习模型(Turep) | 基因表达数据(单细胞和空间转录组) | 七种人类恶性肿瘤的患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 138 | 2026-05-05 |
scSketch: Interactive Sketch-based Trajectory Exploration and Pathway-Aware Analysis of Single-Cell Data
2026-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.16.718997
PMID:42079097
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研究论文 | scSketch是一个交互式工具,允许用户通过草图轨迹探索单细胞数据中的基因表达梯度并进行通路感知分析 | 首次允许用户通过绘制轨迹交互式探索单细胞数据,并在迭代探索中保持统计有效性和生物学可解释性,同时自动计算基因-轨迹相关性并应用在线错误发现率控制 | NA | 开发一个能够交互式探索单细胞数据中轨迹假设并保持统计有效性和生物学可解释性的工具 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达梯度及细胞状态转变过程 | 机器学习 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2026-05-05 |
Interpreting and Validating a Deep Learning Model Predictive of Spatial Morphologic-Molecular Patterns in Lung Adenocarcinoma, Using Ground Truth Immunohistochemistry Images
2026-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.20.719723
PMID:42079136
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研究论文 | 开发并验证了深度学习模型XpressO-Lung,该模型利用常规H&E染色的全切片图像预测肺腺癌中空间形态-分子模式,并通过免疫组化在外部临床样本中验证 | 首次实现通过常规病理切片预测肿瘤及其微环境的基因表达空间异质性,无需空间转录组学技术,且模型具有可解释性 | 训练样本仅来自TCGA的200例肺腺癌病例,可能存在选择偏倚;预测基因数量有限;AUC范围0.64-0.92,部分基因预测性能中等 | 开发可解释的深度学习模型,通过学习组织形态与批量转录组数据的关联,在常规病理切片上预测肿瘤及其微环境的基因表达空间异质性 | 肺腺癌肿瘤组织及其微环境中的空间基因表达模式 | 数字病理学 | 肺癌 | 深度学习 | 可解释深度学习模型 | 图像 | 200例TCGA肺腺癌病例用于训练,外部验证集来自Dartmouth Health的临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2026-05-05 |
Atypical memory B cell clonal expansion and inflammatory programs associate with platelet-activating antibody development in COVID-19
2026-Apr-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.201033
PMID:41746733
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序、单B细胞V(D)J测序及血浆细胞因子分析,揭示了COVID-19患者中血小板激活抗体发展与免疫特征的关系 | 首次通过单细胞多组学方法系统描绘了与血小板激活抗体产生相关的非典型记忆B细胞克隆扩增和炎症程序 | NA | 阐明COVID-19患者血小板激活抗体发展的免疫特征 | COVID-19患者的B细胞、T细胞及血浆 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、单细胞V(D)J测序、血浆细胞因子分析 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞B细胞V(D)J-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |