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当前共找到 943 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-05-08
Lineage-specific CK2α deletion reshapes the transcriptome of hematopoietic stem cells toward an immune-primed state
2026-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞RNA测序研究CK2α缺失对造血干细胞转录组的影响,发现其向免疫启动状态重塑 首次揭示CK2α在稳态造血中调控造血干细胞免疫转录程序,发现组织环境可调节CK2α缺失的转录后果 NA 明确CK2α如何塑造造血细胞,特别是其在稳态造血中的功能 小鼠骨髓和脾脏组织样本中的造血干细胞 数字病理学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 野生型对照和条件性敲除CK2α的转基因小鼠骨髓和脾脏样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
102 2026-05-08
Integrative Analysis and Experimental Validation Identify Potential m6A-Related Biomarkers for Osteoporosis
2026-Apr-14, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合分析和实验验证,鉴定了骨质疏松症中潜在的m6A相关生物标志物 首次将m6A调控因子与免疫微环境联系起来,并通过多级实验验证(单细胞测序、转录组测序、蛋白印迹)确认HIRA为持续下调的生物标志物 未提及样本量和实验验证的具体局限性,可能需要更多人群验证 鉴定骨质疏松症中m6A相关生物标志物,用于风险评估和治疗 骨质疏松症患者的外周血单核细胞和骨组织 机器学学习 骨质疏松症 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质印迹 共识聚类, 机器学习算法(未明确具体模型), 列线图 转录组数据 来自GEO数据集的外部数据集,以及实验验证中的PBMCs和骨组织样本(具体数量未明确) NA NA NA NA
103 2026-05-08
Heterogeneous, population-level drug-tolerant persisters exhibit ion-channel remodeling and ferroptosis susceptibility
2026-Apr-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究揭示药物耐受持久细胞(DTPs)并非单一细胞状态,而是由多个具有不同分裂和死亡速率的亚状态组成的异质性群体,并发现离子通道重塑和铁死亡易感性 提出DTPs是异质性种群而非单一细胞状态的新观点,通过单细胞转录组学和谱系条形码技术识别多个表型状态,并发现离子通道活性改变和铁死亡易感性 未提及具体局限性 研究药物耐受持久细胞的异质性及其对靶向癌症治疗的潜在影响 药物耐受持久细胞及其亚状态的异质性 机器学习 癌症 单细胞转录组学、谱系条形码 NA 单细胞转录组数据、谱系条形码数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
104 2026-05-08
Single-Cell Immune Atlases to Map Small Extracellular Vesicle Cargo in Tuberculosis-Diabetes Comorbidity: A Narrative Review and Conceptual Roadmap
2026-Apr-11, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文提出利用单细胞免疫图谱解析结核病-糖尿病共病中小细胞外囊泡货物,并构建概念性路线图 首次提出将单细胞多模态免疫参考图谱(scRNA-seq/CITE-seq)作为支架,将小细胞外囊泡货物模式与特定免疫细胞状态、通路和解剖区室联系起来,用于结核病-糖尿病共病研究 大部分小细胞外囊泡研究仍为整体水平且未考虑细胞来源,解释受限于囊泡异质性、选择性货物包装及共分离的非囊泡污染物,尤其缺乏严格对照的核酸分析 为结核病-糖尿病共病中宿主导向干预提供具有细胞来源解析的生物标志物和机制靶点 结核病-糖尿病共病患者血浆和支气管肺泡灌洗液中的小细胞外囊泡及其RNA和蛋白质货物 生物信息学 结核病,糖尿病 单细胞RNA测序,CITE-seq,小细胞外囊泡分离与分析 NA 单细胞转录组数据,蛋白数据 NA NA 单细胞RNA测序,单细胞多组学 NA NA
105 2026-05-08
Histo-Molecular Intratumoral Heterogeneity in Meningiomas: A Narrative Review
2026-Apr-10, Cancers IF:4.5Q1
综述 本文对脑膜瘤组织分子瘤内异质性进行了叙述性综述,总结了其临床意义和潜在机制 系统整合了组织学、细胞遗传学、单细胞RNA测序和空间转录组学等多层次数据,揭示了脑膜瘤中复杂的组织分子异质性,首次强调了SULT1E1亚克隆和COL6A3介导的巨噬细胞-肿瘤相互作用在恶性进展和复发中的关键作用 仅纳入已发表文献,可能存在出版偏倚;综述为叙述性,缺乏定量荟萃分析;部分研究的样本量较小可能影响结论的普适性 阐明脑膜瘤组织分子瘤内异质性的特征及其临床意义 脑膜瘤患者 数字病理学 脑膜瘤 FISH、核型分析、单细胞RNA测序、拷贝数变异分析、空间转录组学 NA 图像, 文本, 基因表达数据 2952例脑膜瘤患者,平均年龄59.4±14.8岁,范围16-85岁 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析
106 2026-05-08
spRefine denoises and imputes spatial transcriptomic data with a reference-free framework powered by genomic language model
2026-04-07, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 spRefine是一种无参考框架,利用基因组语言模型对空间转录组数据进行降噪和填补 首次将基因组语言模型应用于空间转录组数据的联合降噪和填补,无需参考数据,能提升细胞和点级表示的鲁棒性、数据整合效果,并发现新的生物学信号 未明确提及 开发一种深度学习方法,以降低空间转录组数据的噪声和缺失基因测量,提高数据质量,并用于下游分析 空间转录组数据中的细胞和点级表示 机器学习 老年病(利用空间转录组分析衰老效应) 空间转录组学 基因组语言模型(深度学习框架) 空间转录组数据 多种规模的公开数据集 NA 空间转录组学 NA NA
107 2026-05-08
Single-nucleus multiomic profiling of the aging mouse substantia nigra reveals conserved gene alterations linked to Parkinson's disease
2026-04-07, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 利用单细胞多组学技术绘制小鼠黑质衰老图谱,揭示与帕金森病相关的保守基因变化 首次利用单核多组学测序技术同时获取小鼠黑质全生命周期的转录组和表观遗传组图谱,并整合公共帕金森病单细胞RNA-seq数据集,系统性鉴定与衰老和帕金森病相关的保守基因变化 研究基于小鼠模型,其与人类帕金森病的直接相关性需进一步验证;未对功能验证实验进行描述 阐明衰老与帕金森病病理之间的分子机制 小鼠黑质细胞(包括少突胶质细胞、小胶质细胞、谷氨酸能神经元等) 机器学习 帕金森病 单核多组学测序(snRNA-seq + scATAC-seq) NA 转录组和表观基因组数据 40,125个小鼠黑质单细胞核(覆盖全生命周期) 10x Genomics 单细胞多组学测序(单核转录组+染色质可及性) 10x Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression 10x Chromium单细胞核多组学测序(同时捕获转录组和染色质可及性)
108 2026-05-08
Scalable cell-specific coexpression networks for granular regulatory pattern discovery with NeighbourNet
2026-04-07, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出一种名为NeighbourNet的可扩展细胞特异性共表达网络构建方法,用于单细胞RNA测序数据中细粒度调控模式发现 首次实现基于K近邻局部回归的细胞特异性共表达网络构建,解决小样本量和数据稀疏性问题,并支持下游元网络聚类和信号推断 文中未明确提及局限性,但可能对极端稀疏数据或非常异质性的细胞群体表现有限 开发一种可扩展方法,构建细胞特异性共表达网络,以捕捉单个细胞水平上的动态调控变异 单细胞RNA测序数据中的基因共表达关系 机器学生物学 NA scRNA-seq KNN回归、主成分分析 单细胞基因表达数据 大规模单细胞数据集(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
109 2026-05-08
High-fidelity bidirectional translation between single-cell transcriptomes and DNA methylomes with scBOND
2026-04-07, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出scBOND框架,实现单细胞转录组与DNA甲基化组之间的高保真双向翻译 引入混合专家模块捕获上下文依赖调控模式,结合自注意力机制和特征校准模块增强生物信号保真度,并采用生物信息数据增强策略提升少配对数据场景下的泛化能力 现有方法存在单向性、缺乏对上下文特异性DNA甲基化-表达关联的建模、评价中忽视生物学相关性、在有限配对训练数据中表现差等问题 开发计算框架实现单细胞RNA测序与单细胞DNA甲基化数据间的双向跨模态翻译 小鼠胚胎数据、人类脑神经元数据、少突胶质细胞谱系数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序、单细胞DNA甲基化测序 混合专家模型、自注意力机制 基因表达数据、DNA甲基化数据 小鼠胚胎样本、人类脑神经元样本、少突胶质细胞谱系样本 NA 单细胞RNA测序、单细胞DNA甲基化测序 NA NA
110 2026-05-08
A Tissue Virus Microenvironment with Activated Stress Responses Underlies Durable SIV Persistence
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过比较感染早期与晚期治疗后的SIV感染恒河猴模型,结合免疫PET/CT引导采样和空间转录组学,定义了维持病毒库持久性的组织病毒微环境(VME) 首次空间定义病毒微环境(VME)作为病毒库持久性的关键决定因素,并揭示其与肿瘤微环境相似的应激适应、代谢重编程等特征 研究仅基于非人灵长类模型,未在人体组织直接验证VME机制;样本量可能有限 探究HIV/SIV病毒库在抗逆转录病毒治疗期间持续存在的组织微环境机制 SIV感染的恒河猴肠道相关淋巴组织中的病毒微环境 数字病理学 艾滋病 空间转录组学, 免疫PET/CT引导采样, 免疫荧光显微镜 NA 影像数据, 空间转录组数据 SIV感染的恒河猴(早期治疗组与晚期治疗组) NA 空间转录组学 NA NA
111 2026-05-08
Genome and Single-Cell Transcriptome Reveal the Evolution of Holoparasitic Plants: A Case Study of Cistanche deserticola
2026-Apr, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
研究论文 构建了荒漠肉苁蓉首个染色体级别基因组图谱,并结合单细胞转录组解析全寄生植物的分子与细胞进化机制 首次构建了荒漠肉苁蓉的染色体级别基因组和单细胞转录组图谱,揭示了全寄生植物中光合作用和免疫相关基因大量丢失、水平转移基因获得,以及寄生过程中细胞阶段特异性分化 文章未明确提及局限性 探究全寄生植物在分子和细胞水平上的进化机制 荒漠肉苁蓉(Cistanche deserticola) 基因组学, 单细胞转录组学 NA 全基因组测序, 单细胞RNA测序, 比较基因组分析 NA 基因组序列, 单细胞转录组数据 一个荒漠肉苁蓉个体用于基因组组装;单细胞转录组样本数未明确提供 NA 单细胞RNA-seq NA NA
112 2026-05-08
Cellular microenvironment of erythropoietin-producing cells in hypoxic and injured mouse kidneys
2026-Apr, Experimental physiology IF:2.6Q2
研究论文 结合空间转录组学、mRNA荧光原位杂交和顺序免疫荧光技术,表征缺氧和损伤小鼠肾脏中促红细胞生成素产生细胞的细胞微环境 首次通过多种技术结合,详细描述了缺氧和损伤条件下REP细胞的直接微环境及其与近端肾小管细胞和内皮细胞的空间关系 仅基于小鼠模型,未验证在人类肾脏中的适用性;未深入探讨细胞间相互作用的分子机制 阐明肾脏中促红细胞生成素产生细胞的微环境及其调控机制 小鼠肾脏中的促红细胞生成素产生细胞(REP细胞)及其邻近细胞 数字病理学 肾脏疾病 空间转录组学, mRNA荧光原位杂交, 顺序免疫荧光 NA 图像, 转录组数据 小鼠肾脏样本(具体数量未明确) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium 空间转录组学平台用于小鼠肾脏组织切片分析
113 2026-05-08
Metabolic reprogramming in lacrimal gland GVHD: Stage-specific shifts in acinar cells as drivers of disease progression
2026-Apr, The ocular surface
研究论文 通过整合单细胞RNA测序,揭示泪腺移植物抗宿主病从急性到慢性阶段的细胞生态动态变化,重点阐明腺泡细胞代谢重编程在疾病进展中的作用 首次构建泪腺oGVHD的时间分辨单细胞图谱,发现腺泡细胞代谢重编程和髓系-上皮串扰是慢性期关键驱动因素,并鉴定出新型配体-受体对(Gm-Sort1和Ptprc-Cd22) 研究基于小鼠模型,结果需在人类样本中验证;计算预测的细胞间相互作用需进一步功能实验确认 阐明泪腺移植物抗宿主病从炎症期到纤维化期的阶段特异性细胞和分子机制 小鼠泪腺组织(急性GVHD第7天和慢性GVHD第28天) 单细胞组学 移植物抗宿主病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 小鼠泪腺样本(急性期7天和慢性期28天各一组) 10x Genomics(根据单细胞RNA-seq推断) 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
114 2026-05-08
A pH-responsive hyaluronic acid hydrogel facilitates lesion-localized integrin α5β1 agonism to attenuate osteopontin signaling and fibrosis in intrauterine adhesions
2026-04, Acta biomaterialia IF:9.4Q1
研究论文 本文开发了一种pH响应性透明质酸水凝胶,通过递送α5β1选择性激动剂肽,在宫腔粘连部位实现局部整合素激活,从而抑制骨桥蛋白信号传导和纤维化 首次将pH响应性脂质体硫醇化透明质酸水凝胶与α5β1选择性激动剂肽结合,实现病变局部持久的α5β1激活,并利用单细胞RNA-seq验证了巨噬细胞为中心的免疫-基质通讯重塑机制 NA 开发一种可局部注射的pH响应性水凝胶平台,通过激活整合素α5β1来调节巨噬细胞功能,抑制SPP1介导的促纤维化信号,从而治疗宫腔粘连及相关纤维炎症性疾病 大鼠宫腔粘连模型中的巨噬细胞和子宫内膜基质细胞 机器学习和数字病理学 宫腔粘连 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 大鼠宫腔粘连模型样本(具体数量未明确) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
115 2026-05-08
Multidimensional profiling of heterogeneity in supratentorial ependymomas
2026-04, Nature IF:50.5Q1
研究论文 整合单细胞和空间转录组学等技术,揭示幕上室管膜瘤的细胞异质性、空间组织及动态行为 首次在单细胞和空间水平上定义幕上室管膜瘤的细胞状态、空间组织及动态行为,并发现脑驻留细胞在异质性形成中的作用 未明确提及具体局限性,但可能受限于样本量或模型系统的代表性 理解幕上室管膜瘤的细胞状态、空间组织及动态行为,揭示肿瘤异质性的驱动因素 幕上室管膜瘤的肿瘤细胞及其神经微环境中的细胞 数字病理学 儿童脑癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、活细胞成像 NA 基因表达数据、空间转录数据、活细胞成像数据 未明确提及具体样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'试剂盒, 10x Visium空间转录组学试剂盒
116 2026-05-08
Small and Large Extracellular Vesicles in Circulation of Diffuse Large B-Cell Lymphoma Patients Originate From Different Cell Types of the Tumor Microenvironment
2026-Apr, Journal of extracellular vesicles IF:15.5Q1
研究论文 研究了弥漫大B细胞淋巴瘤患者循环中大小细胞外囊泡的起源及其在肿瘤微环境中的细胞类型来源 首次揭示DLBCL肿瘤微环境中不同细胞类型优先分泌小或大细胞外囊泡,且循环中的S-EVs和L-EVs携带互补的生物学信息 未明确说明具体局限性 探讨弥漫大B细胞淋巴瘤患者循环中小细胞外囊泡和大细胞外囊泡的细胞起源及其生物学意义 弥漫大B细胞淋巴瘤患者的血浆样本以及肿瘤组织单细胞测序数据 数字病理学 弥漫大B细胞淋巴瘤 密度梯度分离、可调电阻脉冲感应分析、小RNA测序、信使RNA测序、单细胞测序 NA 测序数据 17个DLBCL肿瘤组织的单细胞测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
117 2026-05-08
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Chemotherapy-Induced Changes in Osteosarcoma With a Pyroptosis-Related Gene-Based Prognostic Model
2026-Apr, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 利用单细胞转录组学分析化疗诱导的骨肉瘤变化,并基于焦亡相关基因构建预后模型 首次通过单细胞转录组学揭示化疗对骨肉瘤细胞亚群和肿瘤微环境的改变,并基于焦亡相关基因开发了名为 Pyroscore 的预后模型,实现了多算法集成 未提及具体局限性 探究化疗引起的骨肉瘤细胞和分子水平变化,并构建基于焦亡相关基因的预后模型 骨肉瘤患者的细胞亚群及肿瘤微环境 机器学习 骨肉瘤 单细胞RNA测序 机器学习集成模型(基于101种算法) 单细胞转录组数据 多数据集,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
118 2026-05-08
ZFP36L1 promotes non-small cell lung cancer progression under hypoxia by modulating CXCL9:SPP1 polarity: A single-cell transcriptomic study
2026-Apr, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 通过单细胞转录组学分析,发现ZFP36L1在缺氧条件下通过调节CXCL9:SPP1极性促进非小细胞肺癌进展 首次揭示ZFP36L1通过转录调控SPP1,在缺氧环境下改变巨噬细胞CXCL9:SPP1比率,从而驱动非小细胞肺癌恶性进展的新机制 NA 探究ZFP36L1在非小细胞肺癌缺氧微环境中的作用机制 非小细胞肺癌细胞、巨噬细胞、患者来源类器官、巨噬细胞特异性ZFP36L1敲除小鼠模型 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blot、免疫荧光、流式细胞术、ELISA、双荧光素酶报告实验、ChIP实验、CCK-8、Transwell、集落形成、划痕实验、H&E、EdU、CellTiter-Glo NA 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序
119 2026-05-08
Cell-Type-Resolved Acetylation Regulator Atlas Defines Immune Endotypes and Druggable Vulnerabilities in Psoriasis
2026-Apr-01, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 通过整合转录组与单细胞数据,构建银屑病中乙酰化调节因子细胞类型分辨图谱,定义免疫内型与可药物靶点 首次在单细胞分辨率下系统揭示银屑病皮肤中乙酰化调节因子的细胞类型特异性表达模式,并基于此定义两种具有不同炎症程序特征的乙酰化内型 主要基于公开数据集分析,关键调节因子的验证仅在银屑病小鼠模型和有限的外部数据集上进行 解析银屑病中赖氨酸乙酰化调节因子的细胞类型特异性景观及其临床分层价值 银屑病患者和健康对照的皮肤样本(746例银屑病、515例对照)及两个公共皮肤单细胞RNA测序数据集 生物信息学 银屑病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR NA 转录组数据, 单细胞转录组数据 746例银屑病和515例对照的皮肤样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
120 2026-05-08
FURIN Stimulates NOTCH2 and NOTCH3 Pathways, Leading to Return of Function in Aged Cells
2026-Apr-01, Life (Basel, Switzerland)
研究论文 研究发现FURIN通过激活NOTCH2和NOTCH3通路恢复衰老细胞功能 首次揭示FURIN表达下降导致衰老肌肉细胞NOTCH2/3信号通路受损,并通过过表达FURIN部分恢复肌原分化能力 仅使用体外细胞模型(C2C12肌母细胞)验证,缺乏体内实验支持;样本量有限,需进一步在人体组织中验证 探究年龄相关的FURIN下调是否导致NOTCH2/3信号通路受损以及肌原功能衰退 早代次和晚代次C2C12肌母细胞(作为肌肉细胞衰老的模型) 机器学习 老年病 单细胞RNA测序,质粒转染 NA 基因表达数据 公开单细胞RNA测序数据(GTEx项目),C2C12细胞系培养 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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