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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-05-08 |
PFDN5 synergizes with anti-PD1 therapy to promote triple-negative breast cancer cell death through JAK2/STAT3/c-Myc signaling axis
2026-Apr-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08115-z
PMID:42032729
|
研究论文 | 研究PFDN5在三阴性乳腺癌中的抑癌作用及其与抗PD1治疗协同诱导肿瘤细胞死亡的分子机制 | 首次明确PFDN5通过JAK2/STAT3/c-Myc信号轴抑制三阴性乳腺癌进展并重塑免疫微环境,揭示其与抗PD1治疗的协同抗肿瘤效应 | 主要基于细胞系和小鼠模型,缺乏大规模临床样本验证;PFDN5的调控机制在人体中的复杂性尚未完全阐明 | 阐明PFDN5在三阴性乳腺癌进展中的功能作用及其对免疫微环境的影响 | 三阴性乳腺癌临床标本、细胞系以及小鼠异种移植瘤模型 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫组化、蛋白质芯片分析 | NA | 图像、文本 | 涉及临床标本和细胞系,具体样本量未明确,小鼠模型中使用了免疫缺陷和免疫健全小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序,10x Visium空间转录组学,结合多重免疫组化 |
| 82 | 2026-05-08 |
The role and underlying mechanism of FABP4 dysregulation mediated by m6A modification in unexplained recurrent spontaneous abortion
2026-Apr-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08118-w
PMID:42032620
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研究论文 | 探讨m6A修饰介导的FABP4失调在不明原因复发性流产中的作用及其分子机制 | 首次揭示FABP4通过m6A表观遗传机制调控滋养细胞脂质代谢和线粒体功能,并鉴定FTO和IGF2BP3为关键调控因子,为URSA提供潜在治疗靶点 | 主要基于动物模型和体外细胞实验,缺乏大规模临床样本验证;具体临床转化价值需进一步研究 | 阐明FABP4在不明原因复发性流产发病机制中的作用及m6A修饰的调控机制 | 人类胎盘组织、Fabp4基因敲除小鼠模型、滋养细胞系 | 数字病理学 | 不明原因复发性流产 | MeRIP-qPCR, Seahorse代谢分析, 拉曼光谱, 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型、细胞系 | RNA测序数据、代谢数据 | 人类胎盘组织样本(URSA患者与对照组)、小鼠模型、滋养细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2026-05-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals depot-specific characteristics of adipose progenitor cells in ducks
2026-Apr-23, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.107004
PMID:42061263
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术绘制了鸭不同脂肪组织中脂肪祖细胞的分子图谱,揭示了不同脂肪库的特异性调控机制 | 首次在鸭中构建了跨脂肪库的脂肪祖细胞单细胞图谱,揭示了其分子异质性和谱系动态,并鉴定了库特异性调控因子 | NA | 探究鸭不同脂肪库中脂肪祖细胞的调控机制,以理解脂肪沉积差异并改善肉品质和生产效率 | 鸭的胸肌、皮下和内脏脂肪组织中的脂肪祖细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 84 | 2026-05-08 |
Resilience to Diabetic Retinopathy (RDR) Is Associated with a Pre-Retinopathy Transcriptional Program Induced by Diabetes
2026-Apr-21, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16040614
PMID:42072736
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究糖尿病抵御能力获得与丧失过程中的视网膜细胞基因表达变化 | 首次揭示糖尿病持续时间短于引发视网膜病变时,视网膜细胞(特别是穆勒细胞)中已发生转录组重编程,且这种保护性基因表达变化与糖尿病抵御能力的获得和丧失在时间上高度一致 | 研究仅基于小鼠模型,且糖尿病持续时间较短(5天和15天),未涉及长期糖尿病或人类样本 | 定义糖尿病视网膜病变抵御能力获得与丧失过程中单个视网膜细胞的基因表达变化 | 雄性小鼠的视网膜细胞,包括穆勒细胞等 | 单细胞测序 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 糖尿病5天组、15天组及同龄非糖尿病对照组小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2026-05-08 |
Neutrophil Heterogeneity: Molecules to Cellular Behavior
2026-Apr-21, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16040696
PMID:42073503
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综述 | 综述了中性粒细胞在分子和细胞行为层面的异质性,并探讨了单细胞RNA测序和活体成像等技术如何揭示其在健康和疾病中的功能多样性 | 首次系统整合单细胞RNA测序和高维流式细胞术揭示的中性粒细胞分子异质性,并提出活体成像技术作为连接静态分子图谱与动态细胞行为的桥梁 | 未提供具体实验数据支持,主要依赖现有文献综述,且对中性粒细胞异质性在不同疾病中的具体调控机制阐述有限 | 总结中性粒细胞异质性的分子基础及其在癌症、脓毒症和缺血性中风等疾病中的体内功能行为,并探讨活体成像技术的应用前景 | 中性粒细胞 | 自然语言处理 | 癌症, 脓毒症, 缺血性中风 | 单细胞RNA测序, 高维流式细胞术, 活体成像 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2026-05-08 |
The Hodgkin Lymphoma Microenvironment: Insights from Spatial Transcriptomics
2026-Apr-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083689
PMID:42074324
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综述 | 总结空间转录组学在经典霍奇金淋巴瘤肿瘤微环境研究中的最新进展 | 首次系统综述空间转录组学技术在cHL微环境研究中的应用,揭示HRS细胞为中心的细胞生态位和免疫逃逸机制 | 未提及具体局限性,但作为综述可能依赖于现有研究数据,缺乏原始实验验证 | 探讨空间转录组学如何提升对cHL微环境中细胞间相互作用和空间组织的理解 | 经典霍奇金淋巴瘤的肿瘤微环境 | 自然语言处理 | 淋巴癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 87 | 2026-05-08 |
Integrated Transcriptomic and Single-Cell Analyses Identify HILPDA as a Hypoxia-Mediated Regulator of Ferroptotic Signaling in Glioblastoma
2026-Apr-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083698
PMID:42074335
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研究论文 | 通过整合转录组和单细胞分析,鉴定HILPDA为胶质母细胞瘤中缺氧介导的铁死亡信号调节因子 | 首次发现HILPDA作为缺氧与铁死亡信号之间的关键连接基因,并揭示其在胶质母细胞瘤免疫微环境中的潜在作用 | 主要基于转录组关联分析,缺乏功能验证实验来确认HILPDA在铁死亡调控中的直接作用 | 探究胶质母细胞瘤中缺氧信号与铁死亡相关基因表达谱的关系 | 胶质母细胞瘤肿瘤样本和单细胞数据 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序 | 结构方程模型 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量,但使用了公开的转录组和单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2026-05-08 |
Prognostic Role of Uric Acid-Related Gene Signatures in Glioblastoma Multiforme: Insights from Bulk RNA and Single-Cell RNA Sequencing
2026-Apr-20, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18081297
PMID:42073621
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研究论文 | 基于尿酸相关基因在多形性胶质母细胞瘤中构建预后风险模型,并利用批量RNA和单细胞RNA测序揭示其免疫微环境特征 | 首次从尿酸相关基因角度构建GBM预后模型,结合批量RNA和单细胞RNA测序揭示树突状细胞、巨噬细胞和T细胞等关键细胞亚群与尿酸基因表达的关联 | 未提及外部验证队列或实验验证,依赖公开数据库且样本量有限 | 阐明尿酸驱动机制在GBM风险分层和治疗脆弱性中的作用 | TCGA和GEO数据库中的多形性胶质母细胞瘤转录组数据及单细胞数据集GSE162631 | 机器学习 | 多形性胶质母细胞瘤 | RNA-seq | LASSO回归 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的GBM样本(具体数量未提及)以及GSE162631单细胞数据集 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-05-08 |
Multimodal Single-Cell Transcriptomic and Chromatin Accessibility Profiling Reveals Monocyte-Derived Macrophage Dynamics Following Ischemic Stroke
2026-Apr-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083657
PMID:42074294
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研究论文 | 通过单细胞转录组和染色质可及性分析揭示缺血性卒中后单核细胞来源巨噬细胞的动态变化 | 鉴定出应激反应性单核细胞来源巨噬细胞(MDM)亚群,并揭示其向溶酶体富集MDM功能状态的转变轨迹 | 研究局限于小鼠模型和卒中后48小时时间点,人类卒中后期MDM动态变化尚未探索 | 解析缺血性卒中后单核细胞来源巨噬细胞(MDM)的异质性和表型转变 | 小鼠大脑中的巨噬细胞谱系细胞 | 神经科学、单细胞组学 | 缺血性卒中 | scRNA-seq、scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据 | 小鼠脑组织样本:卒中模型组和假手术对照组 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于scRNA-seq,10x Chromium Single Cell ATAC用于scATAC-seq |
| 90 | 2026-05-08 |
An Integrative Network Analysis Framework for Identifying Altered Glycosylation Pathways Associated with Autism Spectrum Disorder
2026-Apr-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040486
PMID:42074604
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研究论文 | 开发整合转录组和网络分析框架研究自闭症谱系障碍中糖基化通路改变及其功能关联 | 首次系统性地利用转录组和网络分析框架,结合公开数据集的批量及单细胞RNA测序数据,研究自闭症中糖基化相关基因的表达变化及其与免疫和神经发育通路的互作 | 依赖公开数据集的可用性和质量,可能限制发现的特异性和可重复性 | 探究糖基化通路在自闭症谱系障碍病理生理学中的作用 | 自闭症谱系障碍患者脑和血液组织中的糖基化相关基因表达变化 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍 | RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2026-05-08 |
Spatial Dynamics Links PD-L1 and Tumor-Associated Macrophage-Enriched Niches to Immune and Mesenchymal States in Microsatellite-Stable Colorectal Cancer
2026-Apr-18, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18081288
PMID:42073611
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研究论文 | 探索微卫星稳定结直肠癌中PD-L1表达与肿瘤相关巨噬细胞富集微环境对免疫和间充质状态的影响 | 首次在微卫星稳定结直肠癌中通过空间转录组学揭示PD-L1表达与免疫激活状态及间充质主导状态之间的关联,并指出PD-L1阴性肿瘤中上皮-间充质转化相关程序在巨噬细胞富集的基质微环境中占主导地位 | 样本仅为254例局部错配修复能力完好的结直肠癌病例,属于探索性分析,且未涉及功能性验证实验 | 识别微卫星稳定结直肠癌中与预后相关的免疫细胞成分,并探究其与RNA表达谱及高分辨率空间转录组特征的差异 | 254例局部错配修复能力完好的结直肠癌病例的肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学, 批量RNA表达分析 | NA | 空间转录组数据, 批量RNA表达数据 | 254例局部错配修复能力完好的结直肠癌病例 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于高分辨率空间基因表达分析 |
| 92 | 2026-05-08 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of Ectopic ACTH-Secreting Pheochromocytoma Reveals the Chromaffin Cell Origin of Ectopic Hormone Production
2026-Apr-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083625
PMID:42074262
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示异位ACTH分泌性嗜铬细胞瘤中ACTH产生的嗜铬细胞起源 | 首次通过单细胞RNA测序揭示异位ACTH分泌性嗜铬细胞瘤中POMC阳性嗜铬细胞是ACTH的细胞来源,并发现代谢重编程和免疫调节机制 | 样本量较小(仅3例患者),缺乏功能验证实验,未探讨POMC表达调控机制 | 阐明异位ACTH分泌性嗜铬细胞瘤的细胞起源和分子特征 | 异位ACTH分泌性嗜铬细胞瘤患者的肿瘤组织和邻近肾上腺组织 | 数字病理学 | 内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例患者的肿瘤标本和邻近肾上腺组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 93 | 2026-05-08 |
Single-cell landscape of goose thymus uncovers developmental and regulatory dynamics of T cell differentiation
2026-Apr-17, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106951
PMID:42061246
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研究论文 | 通过单细胞转录组图谱揭示了浙东白鹅胸腺中T细胞分化的发育和调控动态 | 首次构建了鸟类胸腺发育的单细胞转录组图谱,发现γδ T细胞在禽类中异常丰富,并揭示了T细胞分化中DN细胞从预承诺状态到承诺状态的转变过程及胸腺上皮细胞作为信号中枢的调控作用 | 未提及具体局限性 | 研究禽类胸腺T细胞发育的细胞和分子机制 | 浙东白鹅胸腺细胞 | 数字化病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖胚胎、幼鹅、幼年和成年四个发育阶段 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 94 | 2026-05-08 |
SEC-seq reveals translation-focused metabolic strategies for high IgG productivity in clonal CHO cells
2026-Apr-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.14.718270
PMID:42039631
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研究论文 | 应用SEC-seq技术同时测量单细胞转录组和分泌的IgG,揭示CHO细胞高产IgG的翻译聚焦型代谢策略 | 首次利用分泌编码单细胞测序(SEC-seq)同时分析单细胞中的转录组和分泌蛋白,克服了传统转录组分析无法完全解释分泌异质性的局限,并发现了与IgG产量耦合的代谢和分泌回路特征 | NA | 解析CHO细胞中IgG产量相关的代谢和分泌异质性,为工程化改造或选育高产细胞系提供框架 | 中国仓鼠卵巢(CHO)细胞,包括一个亲本生产细胞系和五个克隆 | machine learning | NA | SEC-seq(分泌编码单细胞测序) | NA | 单细胞转录组和分泌蛋白数据 | 一个亲本细胞系和五个CHO克隆 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | SEC-seq(分泌编码单细胞测序) |
| 95 | 2026-05-08 |
CCL5 Orchestrates Paradoxical Immune Landscapes in NSCLC: Simultaneous Recruitment of Effector and Suppressor Cells Shapes Immunotherapy Resistance
2026-Apr-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18081271
PMID:42073595
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research paper | 研究发现CCL5在NSCLC中同时招募效应细胞和抑制性细胞,导致免疫治疗耐药 | 揭示CCL5在非小细胞肺癌中同时促进免疫效应细胞和免疫抑制细胞招募的双重免疫调节功能,并提出其作为免疫治疗生物标志物的可能性 | 样本量较小(外周血队列33例),缺乏独立前瞻性队列验证,属于假设生成性研究 | 探索CCL5在非小细胞肺癌免疫治疗中的双重免疫调节作用及其对预后的影响 | 非小细胞肺癌患者(外周血队列33例)及公共单细胞RNA测序数据集 | machine learning | lung cancer | single-cell RNA-seq, CellChat, SCENIC | NA | scRNA-seq数据 | 外周血队列33例,单细胞RNA测序数据8例和234例 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2026-05-08 |
Research on Bamboo Shoot Bud Development: A Leap from Tissue Heterogeneity to Single-Cell Spatial Atlas
2026-Apr-16, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15081233
PMID:42075434
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综述 | 本文综述了毛竹笋芽发育的研究进展,提出从组织异质性到单细胞空间图谱的转变策略以突破现有瓶颈 | 首次系统提出构建单细胞分辨率、空间解析、多组学整合和功能验证框架的核心策略,以解决组织均质化掩盖细胞异质性、空间位置信息丢失、单细胞技术应用困难和染色质可及性与转录调控耦合未解析等关键瓶颈 | 未涉及具体实验验证,仅提供理论框架和策略,缺乏对现有技术局限性的定量评估 | 阐明毛竹笋芽发育的分子基础,为笋品质和竹材机械性能的遗传改良提供关键靶标 | 毛竹笋芽发育过程 | 机器学习 | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 97 | 2026-05-08 |
Microbial Monotherapy With Leuconostoc sp LB-P8 Improves Inflammation and Fibrosis in Mouse Primary Sclerosing Cholangitis by Inhibiting Transforming Growth Factor β1/SMAD Signaling
2026-Apr-15, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101789
PMID:41997362
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研究论文 | 本研究鉴定了一种新的明串珠菌菌株LB-P8,并证明其通过抑制TGF-β1/SMAD信号通路改善小鼠原发性硬化性胆管炎的炎症和纤维化 | 首次发现明串珠菌菌株LB-P8具有抗纤维化特性,并通过抑制TGF-β/SMAD信号通路发挥作用,为原发性硬化性胆管炎提供了新型微生物治疗策略 | NA | 研究微生物如何影响原发性硬化性胆管炎进展,并评估新型明串珠菌菌株LB-P8的治疗效果和机制 | 原发性硬化性胆管炎小鼠模型和人类肠道细胞 | 机器学习 | 原发性硬化性胆管炎 | 超高效液相色谱-串联质谱、逆转录定量聚合酶链反应、空间转录组学分析 | NA | 文本, 图像 | 三种小鼠模型(胆管结扎、DDC喂养、Mdr2-/-小鼠)和人类肠道细胞 | Nanostring | 空间转录组学 | GeoMX | Nanostring GeoMX空间转录组分析 |
| 98 | 2026-05-08 |
In Silico Perturbation Identifies Transcription Factors as Protective Targets in HSPCs After Irradiation
2026-Apr-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083522
PMID:42074165
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和计算机扰动分析,识别具有保护作用的转录因子,以加速辐照后造血干细胞和祖细胞的造血重建 | 首次将计算机模拟转录因子扰动分析与单细胞RNA测序相结合,系统地预测辐照后HSPCs谱系偏向中的转录因子作用,并验证了具有药理激活潜力的新调控因子 | 主要依赖计算机模拟预测,体内外验证仅针对个别转录因子,可能未涵盖所有关键调控因子 | 识别能加速辐照后造血重建的转录因子调控因子 | 辐照后小鼠骨髓中的造血干细胞和祖细胞 | 机器学习 | 辐射诱导的造血损伤 | 单细胞RNA测序、计算机模拟转录因子扰动分析 | 基因调控网络模型 | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2026-05-08 |
Single-Cell Analysis Highlights Pivotal Role of Eosinophil-Basophil Mast Cell Progenitor-Related Mechanism in Primary Immune Thrombocytopenia
2026-Apr-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083535
PMID:42074179
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示嗜酸性-嗜碱性肥大细胞祖细胞相关机制在原发性免疫性血小板减少症中的关键作用 | 首次利用单细胞测序分析揭示ITP患者骨髓中CD34+造血干祖细胞的异质性,特别是发现嗜酸性-嗜碱性肥大细胞祖细胞比例显著升高,并鉴定出LGALS9-CD44轴在EBMP与MkP1细胞间的受损交互,为ITP治疗提供了新靶点 | 样本量可能有限,且机制验证主要基于体外实验和细胞间通讯分析,需进一步体内实验验证 | 探索原发性免疫性血小板减少症中巨核细胞功能障碍的潜在机制 | ITP患者与健康对照组的骨髓CD34+造血干祖细胞 | 单细胞组学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | ITP患者与健康对照组骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2026-05-08 |
Multi-Omics Analyses Identify ANLN as a Prognostic Biomarker for Recurrence and Metastasis in Non-Small Cell Lung Cancer
2026-Apr-15, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040461
PMID:42074579
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研究论文 | 通过多组学分析鉴定ANLN为非小细胞肺癌复发和转移的预后生物标志物 | 整合bulk和单细胞转录组数据,首次系统性鉴定ANLN是肺癌复发和转移的核心驱动基因,并验证其在上皮细胞和增殖性肿瘤细胞中高表达与侵袭表型相关 | 功能验证仅限于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;药物预测未进行体内药效学验证 | 识别调控肺癌复发和转移的关键分子标志物 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织及单细胞RNA测序数据 | 机器学习和生物信息学 | 非小细胞肺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 多个队列的bulk转录组和单细胞RNA测序数据集,具体样本数未提及 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |