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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2026-03-04 |
Islet amyloid disrupts MHC class II antigen presentation and delays autoimmune diabetes in NOD mice
2026-Apr, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06622-0
PMID:41423547
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研究论文 | 本研究探讨了胰岛淀粉样蛋白通过下调胰岛巨噬细胞中的MHC II类抗原呈递基因,从而延缓NOD小鼠自身免疫性糖尿病发病的机制 | 首次揭示了胰岛淀粉样蛋白在早期形成阶段通过减少抗原呈递来干扰β细胞自身免疫的新作用,挑战了其仅促炎的既定观点 | 研究主要基于小鼠模型,人类中的直接相关性尚需进一步验证;且机制细节如具体信号通路未完全阐明 | 理解胰岛淀粉样蛋白对胰岛巨噬细胞及β细胞自身免疫的影响,以阐明其在1型糖尿病发病中的作用 | 表达人胰岛淀粉样多肽(hIAPP)的NOD小鼠、胰岛巨噬细胞、树突状细胞及自身反应性T细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定样本数量,但涉及转基因与野生型NOD小鼠的比较组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 922 | 2026-03-04 |
Phosphodiesterase ENPP2, which is co-upregulated in obese and pregnant mice, is essential for islet beta cell compensation during obesity
2026-Apr, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06639-5
PMID:41454014
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,识别出在肥胖和妊娠小鼠胰岛β细胞中共同上调的磷酸二酯酶ENPP2,并证实其在肥胖期间β细胞代偿中的关键作用 | 首次利用单细胞RNA-seq技术比较肥胖和妊娠小鼠胰岛细胞的转录组,发现ENPP2作为共同上调基因,并揭示其通过LPA-Akt/mTOR信号通路促进β细胞增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且ENPP2在糖尿病模型中表达下降,其治疗潜力需进一步临床验证 | 识别能适度增强肥胖期间β细胞代偿能力的关键分子 | 饮食诱导的肥胖小鼠、妊娠小鼠、Min6β细胞系、Enpp2基因敲除小鼠及β细胞过表达ENPP2的转基因小鼠 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA-seq, 定量PCR, 免疫荧光 | NA | RNA表达数据, 蛋白质表达数据 | 小鼠模型及人类参与者(具体数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 923 | 2026-03-03 |
Nerandomilast, a PDE4B inhibitor, alleviates silica-induced lung inflammation and fibrosis by inhibition of NLRP3 inflammasome and TGF-β/Smad signalling
2026-Apr, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.70240
PMID:41255094
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研究论文 | 本研究评估了PDE4B抑制剂nerandomilast在矽肺模型中的治疗效果及其机制,发现其通过抑制NLRP3炎症小体和TGF-β/Smad信号通路减轻炎症和纤维化 | 首次在矽肺模型中评估nerandomilast的疗效,并利用单细胞RNA测序识别PDE4B作为关键调控靶点 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,未涉及人类临床试验,且机制探索可能未覆盖所有相关通路 | 探究PDE4B抑制剂nerandomilast在矽肺中的治疗潜力及其分子机制 | 雄性C57BL/6N小鼠、THP-1巨噬细胞和MRC-5细胞 | NA | 矽肺 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、转录组分析 | NA | RNA测序数据 | 未明确样本数量,涉及小鼠模型和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 924 | 2026-02-28 |
C3a-C3ar1 axis mediates macrophage M1 polarization to drive silicosis inflammation and fibrosis
2026-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2026.127816
PMID:41698428
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研究论文 | 本研究揭示了C3a-C3ar1轴通过调控巨噬细胞M1极化驱动矽肺炎症和纤维化的机制 | 首次通过时间序列转录组分析系统研究了矽肺不同阶段所有补体成分的表达模式,并确定了C3a-C3ar1轴是唯一贯穿矽肺发展的补体通路,同时结合时间序列单细胞测序定位了C3ar1在M1巨噬细胞中的表达 | 未明确提及 | 阐明补体系统在矽肺进展中的作用和机制 | 矽肺患者外周血和支气管肺泡灌洗液细胞,以及矽肺模型 | 生物医学研究 | 矽肺 | 时间序列转录组分析,时间序列单细胞测序 | NA | 转录组数据,单细胞数据,临床样本数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 925 | 2026-02-28 |
Thrombospondin-1-mediated macrophage efferocytosis dysfunction exacerbates intestinal pathology in Hirschsprung's disease
2026-Apr-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116344
PMID:41679183
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了血栓反应蛋白-1(THBS1)在巨噬细胞胞葬功能障碍中的作用,及其在先天性巨结肠症肠道病理中的关键调控机制 | 首次发现THBS1通过CD36/Rac1信号轴调控巨噬细胞胞葬功能,并证实其在先天性巨结肠症中作为新型治疗靶点和生物标志物的潜力 | 样本量相对较小(scRNA-seq仅3对样本),且体内验证主要依赖于DSS诱导的结肠炎模型,可能不完全反映人类疾病复杂性 | 阐明先天性巨结肠症中肠道稳态破坏、持续炎症和纤维化的细胞与分子机制 | 先天性巨结肠症患者结肠活检组织、骨髓来源巨噬细胞、DSS诱导的结肠炎小鼠模型 | 单细胞组学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、qRT-PCR、FRET生物传感器 | NA | 单细胞转录组数据、组织病理图像、流式细胞数据 | 3对配对结肠活检(scRNA-seq)+5例额外样本(验证实验) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 926 | 2026-02-28 |
NGR-modified cancer-associated fibroblast-derived exosomes deliver resveratrol to inhibit CXCR2/NF-κB signaling in myeloid-derived suppressor cells and reverse immune suppression in liver cancer
2026-Apr-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116326
PMID:41679176
|
研究论文 | 本研究开发了一种NGR肽修饰的癌症相关成纤维细胞来源的外泌体,用于递送白藜芦醇,靶向肿瘤微环境中的髓源性抑制细胞,通过抑制CXCR2/NF-κB信号通路逆转免疫抑制并抑制肝癌进展 | 创新性地提出了一种靶向肿瘤相关MDSCs而非直接杀伤肿瘤细胞的免疫治疗策略,并首次鉴定和验证了CXCR2作为白藜芦醇在MDSCs中的功能靶点 | NA | 开发靶向MDSCs的精准药物递送系统,以逆转肝癌免疫抑制微环境并克服免疫治疗耐药性 | 髓源性抑制细胞、癌症相关成纤维细胞、肝癌细胞、CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 网络药理学、分子对接、单细胞RNA测序、Western印迹、免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、体外实验数据、体内小鼠模型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 927 | 2026-02-28 |
Necroptosis mediated by FKBP5 in alveolar fibroblasts drives Pseudomonas aeruginosa-induced acute lung injury
2026-Apr-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116368
PMID:41687524
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肺泡成纤维细胞中FKBP5介导的坏死性凋亡在铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤中的核心作用机制 | 首次在单细胞水平上发现肺泡成纤维细胞中FKBP5通过促进坏死性凋亡激活NF-κB信号通路,驱动中性粒细胞募集和活化,从而加剧肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚需进一步开展 | 探究铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤中肺泡成纤维细胞的具体作用机制 | 肺泡成纤维细胞 | 单细胞组学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 928 | 2026-02-28 |
Bulk Microarray and Single-Cell Transcriptomic Analyses Reveal Bacterial Lipopolysaccharide-Related Biomarkers in Sepsis
2026-Apr, Drug development research
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/ddr.70241
PMID:41649833
|
研究论文 | 本研究通过整合批量微阵列和单细胞转录组数据,识别了与脓毒症相关的细菌脂多糖相关生物标志物,并构建了诊断和预后模型 | 首次结合批量微阵列和单细胞RNA-seq数据识别脓毒症中LPS相关基因,并应用多种机器学习算法筛选出七个关键生物标志物,提供了新的诊断和预后见解 | 研究依赖于公共数据库数据,可能受样本异质性和批次效应影响,且需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 | 识别脓毒症中与细菌脂多糖相关的生物标志物及其潜在机制,以改善诊断和预后评估 | 脓毒症患者相关的基因表达数据,包括批量微阵列和单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 批量微阵列分析,单细胞RNA-seq,qRT-PCR验证 | LASSO回归,支持向量机-递归特征消除,极端梯度提升 | 基因表达数据 | 来自Gene Expression Omnibus的多个数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,批量微阵列 | NA | NA |
| 929 | 2026-02-27 |
Emerging roles of non-coding RNAs in the tumor microenvironment of pancreatic cancer: Focusing on current challenges and future directions
2026-Apr-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150063
PMID:41707796
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综述 | 本文综述了非编码RNA在胰腺癌肿瘤微环境中的多重作用,并探讨了当前挑战与未来方向 | 聚焦于非编码RNA作为肿瘤微环境中细胞通讯和功能重塑的关键介质,并讨论了单细胞与空间转录组学等新兴策略 | 非编码RNA的多效性及肿瘤微环境的异质性阻碍了机制解释和临床转化 | 总结非编码RNA在胰腺癌肿瘤微环境中的作用,并探索其诊断和治疗潜力 | 胰腺导管腺癌(PDAC)及其肿瘤微环境中的非编码RNA | 数字病理学 | 胰腺癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 930 | 2026-02-21 |
ROS-responsive, brain- and M1 microglia-targeting modified ginkgetin-loaded smart liposomes ameliorate cerebral ischemia by HIF-1α-mediated negative regulation of microglia pyroptosis
2026-Apr, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2026.102870
PMID:41716338
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研究论文 | 本研究设计了一种ROS响应、靶向大脑和M1小胶质细胞的银杏双黄酮智能脂质体,通过抑制HIF-1α通路减轻小胶质细胞焦亡,从而改善脑缺血损伤 | 开发了具有ROS响应性和双重靶向功能(RVG29靶向大脑,MG1靶向小胶质细胞)的智能脂质体递送系统,用于精准递送银杏双黄酮至缺血病灶,并揭示了其通过HIF-1α/c-Myc/NLRP3轴抑制小胶质细胞焦亡的新机制 | 研究主要在动物模型中进行,尚未进行人体临床试验;长期安全性和免疫原性有待进一步评估;具体靶向效率和脱靶效应在复杂人体环境中的表现仍需验证 | 开发一种能够克服血脑屏障、精准靶向缺血病灶的纳米治疗策略,以改善脑缺血后的神经功能恢复 | 大脑、小胶质细胞、神经元、脑缺血损伤区域 | 神经科学、纳米医学、药物递送 | 脑缺血、缺血性卒中 | 单细胞RNA测序、共培养实验、动物模型(大脑中动脉闭塞/再灌注模型) | NA | 基因表达数据、组织病理学数据、行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 931 | 2026-02-17 |
Single-cell transcriptomics combined with spatial proteomics defines phagocytes type-specific immune regulation in diabetic cataract
2026-Apr, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.110865
PMID:41565148
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学和空间蛋白质组学,定义了糖尿病性白内障中吞噬细胞类型特异性的免疫调节机制 | 首次在糖尿病性白内障中结合单细胞RNA测序和基于串联质量标签的定量蛋白质组学,系统揭示了单核吞噬细胞在疾病发展中的关键作用,并发现了MIF蛋白作为重要巨噬细胞趋化因子的上调 | 研究样本主要来自大鼠模型和有限的患者样本,需要更大规模的人类队列研究来验证结果;免疫细胞的具体功能机制仍需进一步探索 | 研究糖尿病性白内障中免疫细胞的特征及其潜在机制,以寻找潜在的治疗靶点 | 糖尿病大鼠的晶状体样本、糖尿病性白内障患者和年龄相关性白内障患者的前囊膜样本 | 数字病理学 | 糖尿病性白内障 | 单细胞RNA测序,基于串联质量标签的定量蛋白质组学,免疫荧光染色,前节光学相干断层扫描 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,图像数据 | 糖尿病大鼠和正常大鼠的晶状体样本,糖尿病性白内障患者和年龄相关性白内障患者的前囊膜样本 | NA | 单细胞RNA测序,定量蛋白质组学 | NA | NA |
| 932 | 2026-02-16 |
Integrative functional genomics and fine-mapping identify regulatory mechanisms of multivariate obesity GWAS and its cardiometabolic implications
2026-Apr, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156509
PMID:41570977
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研究论文 | 本研究通过整合多变量肥胖GWAS与功能基因组学数据,揭示了肥胖的跨组织神经-脂肪调控轴及其心脏代谢影响 | 采用基因组结构方程模型构建多变量肥胖表型,结合多组学数据(染色质可及性、增强子-启动子互作、eQTL、TWAS、PWAS)进行精细定位和共定位分析,首次系统识别了肥胖相关的神经-脂肪调控机制 | 研究主要基于欧洲人群数据,可能限制其跨人群普适性;功能验证实验不足,机制结论仍需进一步实验证实 | 解析肥胖的共享遗传结构和关键调控机制,特别是非编码变异的作用,及其对心脏代谢特征的影响 | 五种肥胖相关性状(体重指数、腰围、内脏脂肪、肝脏脂肪、体脂百分比)的GWAS数据,脂肪组织多组学数据,以及心脏代谢特征 | 基因组学 | 肥胖症 | GWAS, 基因组结构方程建模, 染色质可及性分析, 增强子-启动子互作分析, eQTL分析, TWAS, PWAS, 精细定位, 共定位分析, 单细胞分析 | 基因组结构方程模型, MAGMA, scPagwas | 基因组数据, 表观基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 933 | 2026-02-13 |
The role of insulin-like growth factor binding proteins in TGF-β1-induced fibroblast-myofibroblast transition during endometriosis fibrosis
2026-Apr, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112362
PMID:41520746
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研究论文 | 本研究探讨了胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBPs)在子宫内膜异位症纤维化过程中TGF-β1诱导的成纤维细胞-肌成纤维细胞转化(FMT)中的作用 | 首次定义了IGFBPs在子宫内膜异位症纤维化中的作用,并发现IGFBP6是一种潜在的抗纤维化因子和治疗靶点 | NA | 研究IGFBPs在子宫内膜异位症相关纤维化中TGF-β1诱导的FMT过程中的作用 | 子宫内膜异位症患者的异位子宫内膜组织及异位子宫内膜基质细胞(EcESCs) | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 934 | 2026-02-13 |
Integrated methylome and hydroxymethylome analysis identifies CAMK2G, NFATC4, and SFRP2 as TET1-regulated drivers of odontoblastic differentiation in human dental pulp cells
2026-Apr, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2026.117775
PMID:41534676
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研究论文 | 本研究通过整合甲基组和羟甲基组分析,揭示了TET1调控的CAMK2G、NFATC4和SFRP2作为人牙髓细胞成牙本质分化的关键驱动因子 | 首次在全基因组水平描绘了人牙髓细胞成牙本质分化过程中的DNA甲基化动态,并识别出TET1通过5hmC修饰调控的新表观遗传驱动因子 | 研究主要基于体外细胞模型,未在体内验证这些驱动因子的功能 | 阐明人牙髓细胞成牙本质分化过程中的DNA甲基化动态及TET1介导的调控机制 | 人牙髓细胞 | 表观遗传学 | 牙科疾病 | 微阵列、hMeDIP-seq、scRNA-seq | NA | 基因组DNA甲基化数据、羟甲基化数据、单细胞RNA-seq数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 935 | 2026-02-06 |
Efferocytosis-associated transcriptomic patterns characterize prognosis and immune landscape in osteosarcoma
2026-Apr, Journal of bone oncology
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jbo.2026.100743
PMID:41631009
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,构建了一个与胞葬作用相关的骨肉瘤预后特征,并揭示了MAGEA11通过Gas6-MERTK/AXL通路促进免疫抑制的机制 | 首次在骨肉瘤中系统性地将胞葬作用与预后、免疫微环境及单细胞/空间转录组特征联系起来,并鉴定出关键基因MAGEA11的功能机制 | 研究结论主要基于生物信息学分析和有限的实验验证,需要在更大规模的独立队列和更深入的体内外模型中进一步确认 | 阐明胞葬作用在骨肉瘤进展和免疫微环境重塑中的作用,并开发相关的预后标志物 | 骨肉瘤患者(来自TARGET-OS和GEO数据库的队列)及相关的细胞与动物模型 | 生物信息学,计算生物学,肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,加权基因共表达网络分析,机器学习模型,体内外功能实验 | StepCox + Ridge 回归模型,机器学习模型 | 转录组数据,单细胞RNA-seq数据,空间转录组数据 | 多个公共数据库队列(TARGET-OS及三个GEO数据集)用于建模与验证,额外包括6名骨肉瘤患者的单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 936 | 2026-02-05 |
Single-cell RNA-seq data of wild type and fli1b mutant zebrafish embryos
2026-Apr, Data in brief
IF:1.0Q3
DOI:10.1016/j.dib.2026.112459
PMID:41624301
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研究论文 | 本文提供了野生型和fli1b突变斑马鱼胚胎在受精后24小时的单细胞RNA测序数据,用于研究血管和造血发育的分子机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术比较野生型和fli1b突变斑马鱼胚胎的转录组,识别出34个不同的细胞簇,为血管和造血发育研究提供了新的数据资源 | 研究仅基于24小时时间点的胚胎样本,未涵盖其他发育阶段;样本量相对较小(约40个胚胎),可能影响统计效力 | 研究fli1b转录因子在斑马鱼血管和造血发育中的作用,并提供单细胞转录组数据以支持相关分子机制分析 | 野生型和母体合子fli1b突变斑马鱼胚胎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 约40个母体合子fli1b突变胚胎和野生型同胞胚胎 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium平台用于单细胞RNA测序 |
| 937 | 2026-02-03 |
Duhuo Jisheng decoction alleviates knee osteoarthritis via synovial mesenchymal stem cell-derived exosomes mediating the microRNA-194-5p/wnt signaling pathway
2026-Apr-06, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.121140
PMID:41506303
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研究论文 | 本研究探讨了独活寄生汤通过滑膜间充质干细胞来源的外泌体介导microRNA-194-5p/Wnt信号通路,从而缓解膝骨关节炎的机制 | 首次探索了独活寄生汤对滑膜间充质干细胞及其外泌体的影响,并揭示了其通过外泌体传递miR-194-5p调控Wnt信号通路促进软骨修复的新机制 | 研究为临床前动物和细胞模型,未来需进行更深入的机制探索、转化研究并确保复方中药成分的一致性以推进临床应用 | 研究独活寄生汤通过滑膜间充质干细胞来源的外泌体介导的miR-194-5p/Wnt信号通路修复软骨的治疗效果 | 膝骨关节炎大鼠模型、原代滑膜间充质干细胞、H2O2诱导的软骨细胞 | NA | 膝骨关节炎 | LC-MS, RNA测序, 定量聚合酶链反应, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹法, 流式细胞术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 938 | 2026-01-21 |
Multi-omics profiling of ACOX3 unveils pan-cancer clinical biomarker potential
2026-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究通过多组学分析全面评估了ACOX3作为新型泛癌生物标志物的表达异质性、临床相关性、肿瘤-免疫相互作用和治疗潜力 | 首次将ACOX3作为泛癌生物标志物进行系统表征,结合单细胞和空间转录组学揭示其在肿瘤微环境中的富集模式,并通过分子对接和动力学模拟筛选出潜在抑制剂 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于HNSCC细胞系,缺乏体内模型验证和更广泛的癌症类型实验数据 | 评估ACOX3作为泛癌生物标志物的诊断和预后价值,探索其与肿瘤免疫微环境的关联及治疗潜力 | 多种癌症类型(包括KICH、PRAD、THCA、COAD、HNSCC等)的肿瘤样本和HNSCC细胞系 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 多组学分析、Cox回归、Kaplan-Meier生存分析、ROC分析、分子对接、分子动力学模拟、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 涉及多种癌症类型的公共数据集和HNSCC细胞系 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 939 | 2026-01-21 |
Cellular and molecular determinants of lymph node metastasis in papillary thyroid carcinoma: Integrated multi-omics profiling and machine learning models
2026-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和大块转录组数据,系统解析了甲状腺乳头状癌淋巴结转移的细胞和分子决定因素,并构建了基于随机森林的预测模型 | 首次整合多组学数据揭示PTC淋巴结转移的免疫微环境变化、恶性细胞异质性及FN1-SDC4轴的关键调控作用,并开发了17个关键基因的预测签名 | 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内模型验证;样本量可能有限,需进一步临床队列验证 | 阐明甲状腺乳头状癌淋巴结转移的机制并开发预测工具 | 甲状腺乳头状癌的原发灶和转移灶组织 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 大块转录组测序 | 随机森林 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 大块转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 940 | 2026-01-21 |
scGImpute: A hybrid BiLayer multi-head graph attention-based imputation framework for zero dropout in single-cell sequencing datasets
2026-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种名为scGImpute的混合双层多头图注意力神经网络框架,用于在单细胞测序数据中恢复技术性零值同时保留生物性零值 | 提出了一种新颖的混合双层多头图注意力神经网络框架,专门针对单细胞测序数据中的零值丢失问题,并适用于多种组学数据类型 | NA | 解决单细胞测序数据中高频零读计数或丢失事件的技术挑战,以降低技术噪声并改善下游分析 | 单细胞测序数据集,包括scRNA-seq、scATAC-seq和CITE-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 混合双层多头图注意力神经网络 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, CITE-seq | NA | NA |