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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2026-04-11 |
Liver sinusoidal endothelial TGF-β signaling accelerates partial endothelial-mesenchymal transition and MASH through Notch
2026-Apr, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101784
PMID:41861675
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研究论文 | 本研究揭示了肝窦内皮细胞(LSECs)中TGF-β/Notch信号轴通过诱导部分内皮-间质转化(EndMT)驱动代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)进展的机制 | 发现了MASH中由LSECs通过TGF-β驱动的部分EndMT产生的新型双表型细胞群,并阐明了TGF-β/Notch串扰在其中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,未来需要在MASH患者队列中进行验证,并开发LSEC特异性递送系统 | 探究LSECs在MASH进展中的具体作用及其功能障碍的分子机制 | 肝窦内皮细胞(LSECs)、人脐静脉内皮细胞(HUVECs)、转基因小鼠模型 | 单细胞组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠:每条件3-10只;原代LSECs:每条件3-6只;HUVECs用于体外实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 842 | 2026-04-11 |
Aggressive prostate cancer is associated with pericyte dysfunction
2026-Apr, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70135
PMID:41117203
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研究论文 | 本文通过计算和实验方法揭示了前列腺癌中周细胞功能障碍的分子机制及其与肿瘤血管异常的关系 | 挑战了传统上认为肿瘤中周细胞数量减少的范式,转而强调其功能障碍,并发现TGF-β信号通路在此过程中的关键作用 | 研究主要基于人类前列腺癌样本和小鼠模型,可能未完全覆盖所有癌症类型或临床异质性 | 探究前列腺癌中周细胞在肿瘤血管生成和进展中的分子重编程机制 | 人类前列腺癌组织和小鼠模型中的周细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类前列腺癌样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 843 | 2026-04-11 |
Pleural Mesothelioma-A Novel Uncommitted Molecular Phenotype Identified by Multiomics, Histologic, and scRNA-Seq Profiling
2026-Apr, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2026.103562
PMID:41956634
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 844 | 2026-04-11 |
Transcriptome-based cell type assignment for kidney cell culture models
2026-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.30.715265
PMID:41959092
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研究论文 | 本文开发了一种基于转录组的方法,通过将肾脏细胞系、原代细胞或组织的批量RNA-seq数据与单细胞RNA-seq数据集衍生的参考细胞类型进行匹配,以评估细胞系与其原生细胞类型的相似性 | 结合批量RNA-seq与单细胞参考数据集,利用基因表达秩相关和机器学习方法(如TabPFN)系统评估细胞系身份,并提供了两种互补的实现工具 | 方法主要依赖于转录组数据,可能未考虑表观遗传或蛋白质水平差异;验证策略虽全面,但可能受参考数据集质量和覆盖范围限制 | 开发并验证一种转录组学方法,以评估肾脏细胞系是否在基因表达上类似于其原生细胞类型,从而辅助细胞培养模型的选择和解释 | 人类和小鼠肾脏细胞系、原代细胞、微分离肾脏组织以及非肾脏阴性对照 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | Random Forest, XGBoost, TabPFN | 转录组数据 | 涉及两个人类和两个小鼠肾脏scRNA-seq数据集,以及多个肾脏细胞系和对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 845 | 2026-04-10 |
Clonal hematopoiesis and lymphoma-associated mutations in hematopoietic progenitors in B-cell non-Hodgkin lymphoma
2026-Apr-09, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030489
PMID:41490454
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研究论文 | 本研究通过全外显子组、靶向和单细胞测序方法,系统分析了B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的克隆造血和疾病起始前体,揭示了克隆造血在淋巴瘤发生发展中的作用 | 首次系统性地在B细胞非霍奇金淋巴瘤中描述了克隆造血突变,并发现了B细胞偏向的克隆扩增模式,以及淋巴瘤相关突变在造血祖细胞中的存在,为疾病起源提供了新见解 | 样本量相对较小(43例患者),且主要关注特定B细胞非霍奇金淋巴瘤亚型,可能限制了结果的普遍适用性 | 探究克隆造血和疾病起始前体在B细胞非霍奇金淋巴瘤中的贡献,以理解疾病进展和复发的机制 | 43例B细胞非霍奇金淋巴瘤患者,包括惰性和侵袭性亚型 | 基因组学 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 全外显子组测序、靶向测序、单细胞测序 | NA | 基因组数据、单细胞数据 | 43例患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 846 | 2026-04-10 |
TBXAS1 deficiency causes autoinflammation responsive to IL-6 inhibitor
2026-Apr, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.09.014
PMID:41162285
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研究论文 | 本研究揭示了TBXAS1缺陷通过花生四烯酸代谢通路异常导致系统性自身炎症的分子机制,并证实IL-6抑制剂托珠单抗对该病症的有效治疗作用 | 首次将TBXAS1缺陷与系统性自身炎症联系起来,阐明了前列腺素E2通过EP2/cAMP/CREB通路诱导IL-6表达的新机制,并成功将IL-6抑制剂应用于Ghosal血骨发育不良综合征的治疗 | 研究仅纳入2例患者,样本量较小;机制研究主要基于体外实验,需进一步体内验证 | 探索TBXAS1缺陷导致自身炎症的分子机制并寻找靶向治疗方案 | 2例TBXAS1缺陷患者及其外周血单个核细胞 | NA | Ghosal血骨发育不良综合征 | 全外显子组测序、Sanger测序、定量逆转录PCR、Western blotting、细胞因子微球阵列、酶联免疫吸附试验、质谱分析、飞行时间质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、蛋白质数据、代谢物数据、单细胞转录组数据 | 2例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 847 | 2026-04-10 |
Clonal differentiation of plasmablasts undergoing oral immunotherapy in patients with milk allergy
2026-Apr, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2025.10.006
PMID:41350126
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析,描述了牛奶过敏患者在接受口服免疫治疗期间浆母细胞的克隆分化特征 | 首次在牛奶过敏患者口服免疫治疗中,通过单细胞转录组学和B细胞免疫受体分析,揭示了浆母细胞的克隆扩增、IgD克隆识别过敏原以及克隆树中超过80%的CDR克隆匹配,并发现IgA1抗体也能识别过敏原 | 研究仅基于2名患者的小样本,可能限制结果的普遍性和统计效力 | 旨在表征接受口服免疫治疗的牛奶过敏患者中浆母细胞的克隆分化特征 | 牛奶过敏患者在接受口服免疫治疗期间的浆母细胞 | 免疫学 | 食物过敏 | 单细胞转录组学分析、B细胞免疫受体分析、重组抗体谱分析 | NA | 单细胞转录组数据、B细胞受体序列数据 | 2名牛奶过敏患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 848 | 2026-04-10 |
Spatial Transcriptomics Analysis of Macrophage-to-Myofibroblast Transition in Bronchiolitis Obliterans Following Hematopoietic Stem Cell Transplantation
2026-Apr, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2025.12.950
PMID:41429336
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,分析了造血干细胞移植后闭塞性细支气管炎中巨噬细胞向肌成纤维细胞转化的作用 | 首次在BO中应用空间转录组学揭示巨噬细胞向肌成纤维细胞转化的时空特异性基因表达模式,并明确了疾病进展中从炎症到纤维化的转录组转变 | 样本量较小(3例BO患者,2例对照),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究巨噬细胞向肌成纤维细胞转化是否参与造血干细胞移植后闭塞性细支气管炎的纤维化进程 | 造血干细胞移植后发生闭塞性细支气管炎患者的肺组织样本,以及肺癌患者的肺组织作为对照 | 数字病理学 | 肺移植相关并发症/纤维化肺病 | 免疫荧光染色,空间转录组学 | 无监督聚类分析 | 空间基因表达数据,免疫荧光图像 | 3例BO患者的肺移植样本,2例肺癌患者的肺组织作为对照 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 849 | 2026-04-10 |
Identification of novel fibroblast subsets in diffuse cutaneous systemic sclerosis
2026-Apr, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.11.027
PMID:41457004
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,在弥漫性皮肤系统性硬化症中识别出新型成纤维细胞亚群,并探讨了CD9和FHL1蛋白在纤维化环境中的功能作用 | 首次在系统性硬化症中利用单细胞RNA测序揭示成纤维细胞的高度异质性,并鉴定出CD9和FHL1上调的新型成纤维细胞亚群,建立了FHL1与VGLL3调控之间的新机制联系 | 研究基于体外培养的皮肤成纤维细胞,可能无法完全反映体内微环境;样本量未在摘要中明确说明,可能限制统计效力 | 识别系统性硬化症中的新型成纤维细胞亚群并确定其功能角色 | 健康供体和弥漫性皮肤系统性硬化症患者的皮肤成纤维细胞 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序,siRNA敲低实验,蛋白质水平验证 | NA | RNA测序数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 850 | 2026-04-10 |
Treatment nonresponders in lupus nephritis characteristically exhibit persistent type I interferon signalling in monocytes: a longitudinal single-cell transcriptomic analysis
2026-Apr, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.002
PMID:41484050
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研究论文 | 本研究通过纵向单细胞转录组分析,揭示了狼疮性肾炎治疗无应答者单核细胞中持续存在的I型干扰素信号特征 | 首次在狼疮性肾炎治疗过程中进行纵向单细胞转录组分析,并识别出单核细胞中持续的I型干扰素信号是治疗抵抗的关键特征 | 样本量较小(n=10),需要在更大规模的独立队列中进行验证 | 表征狼疮性肾炎治疗应答过程中的动态转录变化,识别治疗抵抗的生物标志物 | 活检证实活动性增殖性狼疮性肾炎患者的外周血单个核细胞和单核细胞 | 单细胞转录组学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 转录组数据 | 单细胞RNA测序队列10名患者,bulk RNA测序验证队列13名患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 851 | 2026-04-10 |
A brain-driven neural circuit contributes to tissue regeneration in joint cartilage
2026-Apr, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.004
PMID:41535204
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研究论文 | 本研究揭示了一个大脑驱动的神经回路,通过调控去甲肾上腺素信号通路促进关节软骨的再生 | 首次实验证实大脑通过特定神经回路(PVNCRH神经元至滑膜交感神经)直接调控组织再生,并识别了ADRB2受体在Proteoglycan 4+细胞中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类软骨外植体,临床转化需进一步验证;神经回路的具体调控机制仍需深入探索 | 探究大脑是否及如何调控组织再生,以关节软骨为例 | 人类骨关节炎患者和小鼠模型的关节软骨组织 | 神经科学 | 骨关节炎 | 磁共振成像、多突触逆行追踪、化学遗传学/光遗传学操作、单细胞RNA测序 | NA | 影像数据、基因表达数据、生理指标数据 | 人类骨关节炎患者和小鼠模型(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 852 | 2026-04-09 |
Shear stress-induced endothelial HEG1 signalling regulates vascular tone and blood pressure
2026-Apr-07, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf742
PMID:40986512
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研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞中HEG1蛋白在血流剪切应力感应和血压调节中的关键作用及其分子机制 | 首次发现内皮HEG1通过CUL3介导的PHACTR1降解调控eNOS转录和NO产生,从而影响血管舒张和血压 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限,且未探讨HEG1信号通路在其他心血管疾病中的潜在作用 | 阐明内皮HEG1在血压调节中的作用及其分子机制 | 内皮细胞、小鼠模型、人类动脉和血浆样本 | 心血管生物学 | 高血压 | 单细胞RNA测序、计算流体动力学分析、蛋白质组学、转录组学、泛素化分析 | 内皮特异性Heg1敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、血流动力学数据 | 多个独立队列的人类动脉和血浆样本,以及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 853 | 2026-04-09 |
Img2Gene: Debiased Spatially Resolved Transcriptomics with Biological Context from Pathology Images
2026-Apr-07, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3681769
PMID:41945845
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研究论文 | 提出一个名为Img2Gene的去偏框架,用于从病理全切片图像中预测基因表达水平,通过整合生物学上下文信息来解决数据稀疏性和模态异质性问题 | 首次将因果分析整合到基因表达预测任务中,以缓解数据稀疏性并实现无偏预测;利用基因集富集分析识别高度相关的通路信息作为生物学上下文;引入跨模态一致性损失来对齐不同模态的数据 | 未明确说明模型在临床样本或更大规模数据集上的泛化能力,也未讨论计算资源需求 | 开发一个能够从病理图像中准确、无偏地预测空间分辨转录组基因表达水平的计算框架 | 空间转录组数据与病理全切片图像的整合分析 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习框架(具体架构未明确说明,但涉及因果分析和跨模态对齐) | 图像(病理全切片图像)与基因表达数据 | 四个公共数据集(具体样本数量未说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 854 | 2026-04-09 |
The roles of NF-κB-activated theca cell subtypes in subclinical premature ovarian insufficiency
2026-Apr-05, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaag032
PMID:41818683
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序,探索了早发性卵巢功能不全患者卵泡微环境中细胞和分子的改变,特别是炎症通路的作用 | 首次在早发性卵巢功能不全患者中,通过单细胞测序鉴定出NF-κB激活的卵泡膜/基质细胞亚型,并揭示了其可能通过影响颗粒细胞分化参与疾病早期发病机制 | 样本量有限(单细胞测序每组仅n=1),初步发现需要更大样本量的研究进一步验证 | 探究早发性卵巢功能不全的早期发病机制,特别是卵泡微环境中炎症通路的角色 | 早发性卵巢功能不全患者的卵泡微环境细胞(颗粒细胞、卵泡膜/基质细胞等) | 单细胞组学 | 卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 单细胞测序:每组1例(共2例);批量RNA测序:每组4例(共8例) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 855 | 2026-04-09 |
Single-cell transcriptomics reveals cytotrophoblast subtypes and senescence in recurrent spontaneous abortion
2026-Apr-05, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaag030
PMID:41849438
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了复发性自然流产中细胞滋养层细胞的亚型特征及细胞衰老现象 | 首次在复发性自然流产中鉴定出三种细胞滋养层细胞亚型,并发现CTB2和CTB3亚型存在显著的细胞衰老特征 | 研究样本量有限,且未深入探讨细胞衰老的具体分子机制 | 探究复发性自然流产的发病机制,特别是滋养层细胞的功能异常 | 对照和复发性自然流产患者的绒毛组织 | 数字病理学 | 复发性自然流产 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确具体样本数量,但包括对照和RSA两组绒毛组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 856 | 2026-04-09 |
NRF2/SLC7A11 axis-mediated metabolic reprogramming drives Benzo[a]pyrene-induced malignant transformation: Evidence from lung organoid and 16HBE cell models
2026-Apr-03, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究利用肺类器官和BaP诱导的恶性转化细胞模型,揭示了NRF2/SLC7A11轴介导的氨基酸代谢重编程在苯并[a]芘诱导的细胞恶性转化中的关键作用 | 首次在肺类器官和细胞模型中系统阐明了NRF2通过直接结合SLC7A11启动子调控氨基酸代谢,从而驱动BaP诱导的恶性转化的分子机制 | 研究主要基于体外模型(类器官和细胞系),缺乏体内动物模型的验证,且临床相关性有待进一步探索 | 阐明苯并[a]芘诱导肺癌发生的分子机制 | 肺类器官和BaP诱导的恶性转化人支气管上皮细胞(16HBE-T) | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 857 | 2026-04-09 |
scGraphDap: Integrating Functional State Pseudo-Labels and Graph Structure Learning for Robust Cell Type Annotation in Tumor Microenvironments
2026-Apr, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3607687
PMID:40928910
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研究论文 | 本文提出了一种名为scGraphDap的图神经网络框架,通过整合功能状态伪标签和图结构学习,以改善肿瘤微环境中的细胞类型注释和细胞间通讯推断 | 利用通路活性评分作为伪标签优化细胞-细胞图,以捕捉超越几何相似性的功能邻近性,并引入图域适应模块对齐不同患者间的细胞嵌入,增强跨个体泛化能力 | NA | 改善肿瘤微环境中基于非空间单细胞RNA测序数据的细胞类型注释和细胞间通讯推断 | 肿瘤微环境中的细胞 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 来自15名患者的38,667个细胞,涵盖三种癌症 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 858 | 2026-04-09 |
AutoGRN: An Automated Graph Neural Network Framework for Gene Regulatory Network Inference
2026-Apr, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3609408
PMID:40956752
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研究论文 | 本文提出了AutoGRN,一个用于基因调控网络推断的自动化图神经网络框架,通过遗传搜索算法优化GNN架构以适应单细胞RNA测序数据的特性 | AutoGRN通过将影响GRN推断性能的多种组件纳入搜索空间,并利用信息熵约束的遗传搜索算法,自动适应不同单细胞RNA测序数据集的特征,从而优化GNN架构,解决了固定架构难以泛化的问题 | 未在摘要中明确提及 | 开发一个自动化框架以提高基因调控网络推断的准确性和泛化能力 | 基因调控网络(GRN) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 图神经网络(GNN) | 基因表达数据 | 多个公共数据集(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 859 | 2026-04-09 |
scProca: A Cross-Attention-Enhanced Deep Generative Model for Single-Cell Transcriptomics and Proteomics Integration and Imputation
2026-Apr, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3615771
PMID:41021958
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scProca的深度生成模型,用于整合和插补单细胞转录组学和蛋白质组学数据 | scProca通过交叉注意力机制整合细胞间关系,以处理异质性输入数据,并在高蛋白质稀疏性下保持鲁棒性,实现了最先进的整合和插补性能 | NA | 旨在通过整合单细胞转录组学和蛋白质组学数据,更深入地理解复杂疾病的分子机制和细胞状态 | 单细胞转录组学和蛋白质组学数据 | 机器学习 | 复杂疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学和蛋白质组学共分析 | 深度生成模型(基于交叉注意力机制) | 单细胞转录组学和蛋白质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学和蛋白质组学共分析 | NA | NA |
| 860 | 2026-04-09 |
TMEM158-mediated TGF-β signaling pathway modulates the sensitivity of TP53-deficient osteosarcoma to USP14 inhibitors
2026-Apr, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-026-05487-0
PMID:41642468
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研究论文 | 本研究探讨了TMEM158介导的TGF-β信号通路在调节TP53缺陷型骨肉瘤对USP14抑制剂敏感性中的作用 | 首次揭示了TMEM158作为关键调节因子,通过TGF-β信号通路介导TP53缺陷型骨肉瘤对USP14抑制剂的敏感性,并发现其与USP14/UCHL5表达正相关且可作为独立预后标志物 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化需进一步验证;单细胞RNA测序数据的分析可能受样本量限制 | 阐明TP53缺陷型骨肉瘤对USP14抑制剂敏感性的分子机制,探索TMEM158-TGF-β通路作为治疗靶点的潜力 | TP53缺陷型骨肉瘤细胞(原代肿瘤细胞、SAOS-2和U-2OS细胞系)、TP53缺陷型骨肉瘤小鼠模型、临床骨肉瘤数据库 | 癌症生物学 | 骨肉瘤 | 生物信息学分析(聚类分析、差异表达分析、功能富集分析)、qPCR、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 多个细胞系、动物模型及临床数据库数据(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |