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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2026-04-04 |
Single-cell and haplotype-resolved transcriptomics reveal molecular signatures of orchid floral structures
2026-Apr-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.03.016
PMID:41928475
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研究论文 | 本研究通过单细胞和单倍型解析转录组学,揭示了兰花特殊花器官结构的细胞异质性和分子基础 | 首次对兰花(石斛属)花芽进行空间分辨的单细胞转录组普查,并结合单倍型解析基因组,揭示了亲本基因组通过细胞类型和等位基因特异性表达塑造种间杂交性状的机制 | 研究仅针对石斛属的一个杂交品种(Dendrobium Chao Praya Smile),结果在其他兰花物种中的普适性有待验证 | 解析兰花特殊花器官结构(如花粉块、唇瓣、色素分布)形成的细胞和分子机制 | 石斛属杂交品种Dendrobium Chao Praya Smile的花芽 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞转录组学,单倍型解析基因组学 | NA | 单细胞转录组数据,基因组数据 | 未明确样本数量,但分析了花芽中的14种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 802 | 2026-04-04 |
Identifying maximally informative signal-aware representations of single-cell data using the information bottleneck
2026-Apr-01, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101571
PMID:41928515
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研究论文 | 本文介绍了一种基于信息瓶颈方法的框架bioIB,用于从单细胞RNA测序数据中提取与特定生物信号(如疾病状态)最优相关的可解释压缩表示 | 开发了bioIB框架,通过加权基因簇(metagenes)压缩数据,最大化信号特异性信息,并揭示metagenes的层次结构,以展示生物过程和细胞群体间的互连关系 | 未明确提及具体局限性,可能依赖于准确的细胞标签输入 | 旨在解决单细胞数据复杂性对特定生物信号分析任务的阻碍,提取最优信息表示 | 单细胞RNA测序数据,应用于阿尔茨海默病、上皮-间质转化、免疫发育和造血等生物背景 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 信息瓶颈方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 803 | 2026-04-04 |
Application and Challenges of Chimeric Antigen Receptor T Cell Therapy in Systemic Rheumatic Diseases and Autoimmune Disorders
2026-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70658
PMID:41930334
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综述 | 本文综述了嵌合抗原受体T细胞疗法在系统性风湿病和自身免疫性疾病中的应用、挑战及新兴策略 | 系统整合了CAR-T疗法在自身免疫性疾病中的作用机制、临床挑战及面向精准医疗的创新策略,弥补了现有综述多聚焦肿瘤学或孤立技术层面的不足 | NA | 总结CAR-T疗法在自身免疫性疾病中的应用现状、核心挑战及未来发展方向 | 系统性风湿病和自身免疫性疾病 | NA | 系统性风湿病和自身免疫性疾病 | 单细胞转录组学、空间图谱、B细胞受体/T细胞受体谱分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 804 | 2026-04-04 |
Metabolic Alterations in Macrophage Subtypes Propel Immune and Stromal Remodeling in Neurofibroma's Malignant Progression
2026-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70709
PMID:41930352
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了神经纤维瘤恶性进展中SPP1KYNU巨噬细胞亚群通过色氨酸代谢重编程驱动基质重塑和免疫抑制的关键作用 | 首次在神经纤维瘤恶性转化过程中鉴定出具有独特代谢特征的SPP1KYNU巨噬细胞亚群,并阐明其通过色氨酸代谢重编程协调基质重塑与免疫抑制的双重机制 | 样本量相对有限(9个PNF和5个MPNST样本),功能验证实验仍需在更大队列中进一步确认 | 探究神经纤维瘤恶性进展的分子机制,寻找潜在治疗靶点 | 神经纤维瘤病1型患者的良性丛状神经纤维瘤和恶性外周神经鞘瘤组织 | 单细胞组学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14个肿瘤样本(9个PNF,5个MPNST) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 805 | 2026-04-04 |
High-Purity Functional Corneal Endothelial Cells From Human Induced Pluripotent Stem Cells via a Novel Wash-Out Method
2026-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70650
PMID:41930340
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研究论文 | 本研究开发了一种新型的“冲洗”方法,从人诱导多能干细胞中高效、高纯度地生成功能性的角膜内皮样细胞,并在兔模型中验证了其治疗角膜内皮功能障碍的安全性和有效性 | 提出了一种新型、高效、非细胞毒性的“冲洗”方法,用于去除未分化的iPSCs并获得高纯度的角膜内皮样细胞群体,并首次通过单细胞测序数据证实了经此方法处理的iPSC-CECs与人类原代CECs高度相似 | 研究仅在兔角膜内皮功能障碍模型中进行体内验证,尚未在更大型动物或人体中进行临床试验 | 建立一种稳健的方法,从诱导多能干细胞生成具有临床级质量的角膜内皮样细胞,以解决角膜内皮衰竭治疗中的供体短缺问题 | 人诱导多能干细胞、分化得到的角膜内皮样细胞、兔角膜内皮功能障碍模型 | 干细胞与再生医学 | 角膜内皮功能障碍 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据、形态学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 806 | 2026-04-04 |
"Eye-Conic" Spatial Transcriptomics Reveals the Layer-Specific Molecular Alterations in Corneas of Patients With Keratoconus
2026-Apr-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.4.7
PMID:41931003
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了圆锥角膜患者角膜各层的分子变化 | 首次应用空间转录组学技术系统分析圆锥角膜的层特异性分子改变,并识别了与疾病进展相关的细胞间通讯模式 | 样本量有限,且主要依赖空间转录组学数据,需要进一步验证 | 探究圆锥角膜形成过程中的层特异性细胞和分子改变 | 圆锥角膜患者和对照组的角膜组织 | 空间转录组学 | 圆锥角膜 | 空间转录组学、bulk RNA-seq、免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据、RNA-seq数据、图像数据 | 未明确具体样本数量,涉及圆锥角膜和对照组角膜 | NA | 空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 807 | 2026-04-02 |
Identification of potential biomarkers and therapeutic targets for cerebral venous thrombosis
2026-Apr, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2025.2532039
PMID:40684330
|
研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化方法,整合大规模表达数量性状位点数据和脑静脉血栓形成全基因组关联研究,系统识别并验证了与脑静脉血栓形成易感性相关的可药物化基因 | 首次通过整合外周血和脑组织表达数量性状位点数据,结合孟德尔随机化框架,识别出IL18、BMPR2和COMT等基因作为脑静脉血栓形成的新型潜在生物标志物和治疗靶点 | 研究结果基于遗传推断,需要进一步的机制和临床验证 | 系统识别和验证与脑静脉血栓形成易感性相关的可药物化基因 | 脑静脉血栓形成患者 | 生物信息学 | 脑静脉血栓形成 | 孟德尔随机化、表达数量性状位点分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、分子对接 | 两样本孟德尔随机化框架 | 遗传数据、表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 808 | 2026-04-02 |
Spatial transcriptomics reveals TGF-β-driven endothelial-mesenchymal transition in vascular remodeling of moyamoya disease
2026-Apr, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X251388370
PMID:41305891
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学揭示了TGF-β信号通路驱动的内皮-间质转化在烟雾病血管重塑中的关键作用 | 首次在烟雾病中应用空间转录组学技术,识别了具有内皮和间质双重表型的细胞簇,并明确了TGF-β/Snail通路在驱动内皮-间质转化中的核心作用 | 需要在临床前模型中进行进一步验证 | 阐明TGF-β信号通路在烟雾病血管重塑中的作用机制 | 烟雾病患者血管标本 | 数字病理学 | 烟雾病 | 空间转录组学,免疫组织化学,免疫荧光,苏木精-伊红染色 | 伪时间轨迹分析,细胞-细胞通讯模型 | 空间转录组数据,图像数据 | 11例烟雾病标本用于空间转录组学,总计51例烟雾病和11例对照血管标本用于组织学分析 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 809 | 2026-04-02 |
Sex-Based Differences in Cell Types and Gene Expression within the Anterior Cruciate Ligament
2026-Apr-01, The Journal of bone and joint surgery. American volume
DOI:10.2106/JBJS.25.00860
PMID:41587266
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前交叉韧带中基于性别的细胞类型和基因表达差异,特别是女性患者的TPPP3+祖细胞样细胞在胶原失调和降解相关基因上表达更高 | 首次在单细胞水平上系统比较了前交叉韧带中男性和女性患者的细胞类型和基因表达差异,并识别出与性别相关的祖细胞群体 | 样本量较小(4名男性和5名女性患者),且仅关注了前交叉韧带,未考虑其他因素如年龄、活动水平等 | 探究前交叉韧带损伤率性别差异的细胞和分子基础 | 人类前交叉韧带样本中的活细胞 | 单细胞组学 | 肌肉骨骼损伤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织切片图像 | 9名患者(4名男性,5名女性)的前交叉韧带样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 810 | 2026-04-02 |
KGLAR: Deconvoluting Spatial Transcriptomics Data with Single-cell Transcriptomes through Knowledge-guided NMF and Least Angle Regression
2026-Apr-01, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-026-00815-w
PMID:41920506
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 811 | 2026-04-01 |
Cytotoxic T cell recognition of α-synuclein drives pathogenic immune responses in multiple system atrophy
2026-Apr-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2537271123
PMID:41911451
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学、流式细胞术和抗原特异性功能实验,揭示了多系统萎缩(MSA)患者外周和中枢T细胞对α-突触核蛋白的细胞毒性识别,驱动了致病性免疫反应 | 首次证明MSA患者的外周T细胞被激活并偏向细胞毒性和炎症表型,且CD4和CD8 T细胞以HLA I/II依赖方式识别α-突触核蛋白单体及原纤维,导致克隆扩增和细胞毒性特征获得 | 研究主要基于患者样本和死后脑组织,未涉及动物模型验证,且样本量相对有限,需进一步扩大以确认普遍性 | 探究多系统萎缩(MSA)中适应性免疫机制,特别是T细胞对α-突触核蛋白的识别及其在神经炎症和疾病进展中的作用 | 多系统萎缩(MSA)患者、帕金森病(PD)患者和健康对照者的外周和中枢T细胞 | 免疫学 | 多系统萎缩 | 单细胞转录组学、流式细胞术、抗原特异性功能实验 | NA | 转录组数据、流式细胞数据、功能实验数据 | MSA患者、PD患者和健康对照者队列,具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 812 | 2026-03-31 |
Valvular Leaflets Are Not Innocent Bystanders: Divergent Fibrotic Remodeling Accompanies Functional Mitral and Tricuspid Regurgitation
2026-Apr, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.324134
PMID:41744092
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研究论文 | 本研究探讨功能性瓣膜反流中瓣叶纤维化重塑的机制,揭示了二尖瓣和三尖瓣反流的不同病理过程 | 首次系统比较功能性二尖瓣和三尖瓣反流中瓣叶特异性纤维化重塑机制,并识别出PDK4和IFN信号作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限,单细胞RNA测序仅基于19个瓣叶样本,且动物模型可能无法完全模拟人类疾病 | 阐明功能性瓣膜反流中瓣叶纤维化重塑的细胞机制和潜在治疗策略 | 心脏移植患者的功能性二尖瓣和三尖瓣反流瓣叶组织,以及原发性瓣膜内皮细胞和间质细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,组织病理学分析 | NA | RNA测序数据,组织图像数据 | 单细胞RNA测序:19个FVR瓣叶样本(FMR:8个,FTR:11个);bulk RNA测序:82个样本(FMR/FTR各41个) | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 813 | 2026-03-31 |
Glial Plasticity and Dysfunction: Mechanistic Insights and Therapeutic Opportunities in Neurodegeneration
2026-Apr, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.70414
PMID:41906403
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综述 | 本文综述了神经胶质细胞在神经退行性疾病中的多样生理病理作用及新兴治疗策略 | 整合单细胞转录组学、谱系追踪和活体成像等先进技术,系统揭示胶质细胞的异质性、可塑性及其在神经退行性疾病中的双重角色,并评估基于胶质细胞可塑性的新兴治疗策略 | 面临细胞异质性、递送障碍和缺乏特异性生物标志物等临床转化挑战 | 探讨胶质细胞在神经退行性疾病中的作用机制及治疗潜力 | 星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞和施万细胞等神经胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症、多发性硬化症等神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、谱系追踪、活体成像 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 814 | 2026-03-30 |
The plastic stomatal development in grasses and its implications in crop improvement
2026-Apr, Journal of plant physiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.jplph.2026.154748
PMID:41849825
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综述 | 本文综述了禾本科植物气孔发育的物种特异性机制及其在作物改良中的应用潜力 | 系统总结了禾本科植物四细胞气孔复合体的独特发育机制、可塑性及其关键调控因子,并强调了整合单细胞RNA-seq、空间转录组学、泛基因组学和人工智能等多组学方法在加速新型调控因子发现和基因型-表型关联研究中的应用 | NA | 阐明禾本科植物气孔发育的物种特异性机制,为通过遗传改良提高作物水分利用效率和抗旱性提供理论框架和可行靶点 | 禾本科植物(特别是谷物作物)的气孔发育 | 植物生物学与作物遗传改良 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、泛基因组学、全基因组关联研究、人工智能驱动的数据挖掘 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 815 | 2026-03-30 |
A Tumor Microenvironment-Derived CAF-VEGF Model and Its Application in Biomarker Screening for HCC
2026-Apr, Cell biochemistry and function
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/cbf.70204
PMID:41902797
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研究论文 | 本研究构建了一个基于肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞和血管内皮生长因子的预后评分模型,用于评估肝细胞癌患者的预后,并筛选出关键生物标志物 | 首次结合单细胞测序数据构建了CAF-VEGF预后评分模型,并发现ESCO2和WDHD1两个新基因通过调控血管生成促进肝细胞癌进展 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证模型的普适性 | 开发肝细胞癌预后评估模型并筛选关键生物标志物 | 肝细胞癌组织及其邻近正常组织 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | COX回归模型,LASSO回归模型 | 单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量(使用GEO数据库数据) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 816 | 2026-03-29 |
Construction of TLS-related gene signature for predicting prognosis and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2026-Apr-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000925
PMID:41894176
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研究论文 | 本研究构建了三级淋巴结构相关基因特征(TLSRS),用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次开发了基于三级淋巴结构相关基因的预后和免疫治疗反应预测模型,并利用单细胞、空间转录组学等技术验证了基因与TLS的关联 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证;基因特征的普适性需在更多独立队列中验证 | 预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应,推动精准医疗发展 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 差异基因表达分析、加权相关网络分析、LASSO回归、GSEA、单细胞RNA-seq、空间转录组学、免疫组化、多重免疫荧光 | LASSO回归模型 | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据、免疫组化图像 | 未明确指定样本数量,涉及肝细胞癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 817 | 2026-03-28 |
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2026-Apr-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0424
PMID:41563441
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研究论文 | 本研究优化了单细胞长读长测序协议,以增强胰腺胰岛中异构体的检测能力 | 通过优化5'文库制备协议并采用胰岛素转录本靶向耗竭策略,提高了长读长测序在单细胞水平上的转录本检测效率和准确性 | 技术挑战包括读长不足和较高错误率,可能影响某些低丰度转录本的识别 | 优化单细胞长读长测序协议,以改善胰腺胰岛中异构体的检测和基因表达分析 | 胰腺胰岛中的各种细胞类型,特别是胰岛内分泌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞长读长测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 818 | 2026-03-28 |
Activation of the Pancreatic "Metabolic Synapse" Aggravates Type 2 Diabetes Mellitus by Inducing PANoptosis in β-Cells
2026-Apr-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0863
PMID:41701561
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序和体外实验,揭示了胰腺成纤维细胞通过分泌过量谷氨酸激活β细胞中的NMDAR,从而触发PANoptosis并加速2型糖尿病进展的新机制 | 首次提出“代谢突触”概念来描述胰腺成纤维细胞与β细胞间的相互作用,并发现谷氨酸-NMDAR轴在2型糖尿病发病中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据,缺乏大规模临床验证;人类胰腺样本的NMDAR表达变化仅作为相关性观察,未进行功能验证 | 探究胰腺成纤维细胞对β细胞功能障碍和2型糖尿病进展的贡献,并阐明减肥手术改善糖尿病的机制 | 胰腺β细胞、胰腺成纤维细胞、2型糖尿病患者胰腺样本 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据、体外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 819 | 2026-03-25 |
FOXE1 promotes the progression of pulp inflammation by activating PANoptosis in dental pulp cells
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115204
PMID:41869565
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研究论文 | 本研究揭示了FOXE1通过激活牙髓细胞中的PANoptosis来促进牙髓炎症进展的机制 | 首次在牙髓炎症中鉴定出PANoptotic牙髓细胞簇,并发现FOXE1是调控该过程的关键转录因子 | 未明确FOXE1调控PANoptosis的具体下游信号通路 | 探究PANoptosis在牙髓炎中的作用及调控机制 | 牙髓细胞、临床牙髓炎样本、小鼠实验性牙髓炎模型 | 单细胞组学 | 牙髓炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类临床牙髓炎样本、原代培养牙髓细胞、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 820 | 2026-03-25 |
Single-cell resolution spatial transcriptomic signature of the retrosplenial cortex during memory consolidation
2026-Apr, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03331-3
PMID:41188622
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学揭示了学习后压后皮层在空间记忆巩固过程中的分子特征和细胞类型特异性变化 | 首次在单细胞分辨率下解析了空间记忆巩固过程中压后皮层的转录组特征,并揭示了在阿尔茨海默病小鼠模型中学习诱导的神经元激活减少 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类转化的普适性有待验证;化学遗传学干预的时间窗口和特异性可能存在局限 | 探究压后皮层在空间记忆巩固过程中的转录组学变化及其在阿尔茨海默病中的异常 | 小鼠压后皮层神经元,特别是兴奋性神经元亚型 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病及相关痴呆 | 空间转录组学,化学遗传学,深度学习计算工具 | 深度学习模型 | 空间转录组数据,基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及正常成年小鼠和ADRD模型小鼠 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组学平台,用于解析细胞类型和兴奋性神经元层特异性的基因表达变化 |