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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
781 2026-04-17
Mesenchymal Tissue-Driven Gene Programs Identify EMP3 as a Key Biomarker of Aggressiveness in Undifferentiated Sarcomas
2026-Apr-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学和空间分析,发现EMP3是未分化肉瘤中与上皮-间质转化、肿瘤进展和临床结局相关的关键间质组织驱动的生物标志物 首次将空间转录组学(CosMx)应用于未分化肉瘤异种移植模型,并结合批量RNA-seq数据,系统性地识别出EMP3作为与肿瘤侵袭性和临床预后相关的稳健间质相关生物标志物 研究主要基于异种移植模型和回顾性队列,需要在更大规模的前瞻性临床队列中进一步验证EMP3的预后和治疗价值 识别未分化肉瘤中用于预后评估和治疗分层的分子生物标志物 未分化肉瘤(包括未分化多形性肉瘤)组织、细胞系、异种移植肿瘤模型以及临床队列样本 数字病理学 肉瘤 RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 空间表达数据, 图像数据 两个UPS细胞系衍生的异种移植肿瘤、国家癌症中心队列样本、三十个US组织 NA 空间转录组学, 批量RNA-seq CosMx NA
782 2026-04-17
A palmitoylation-related prognostic risk scoring model and tumor microenvironment characterization in lung adenocarcinoma, using single-cell RNA sequencing data
2026-Apr-06, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据,构建了与棕榈酰化相关的预后风险评分模型,并表征了肺腺癌的肿瘤微环境 首次在单细胞水平上揭示了棕榈酰化在肺腺癌中的细胞异质性,并整合多种机器学习算法构建了稳健的预后模型,同时鉴定出SEC61G作为潜在的治疗靶点 研究样本量相对有限,仅使用了10个LUAD样本的单细胞数据,且体外实验未观察到联合治疗的协同效应 探究棕榈酰化相关基因在肺腺癌中的表达模式、预后价值及其对肿瘤微环境和药物敏感性的影响 肺腺癌(LUAD)患者样本,包括TCGA-LUAD和GSE68465数据集中的批量RNA-seq数据,以及10个LUAD样本的单细胞RNA测序数据 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),实时定量PCR(RT-qPCR),体外细胞实验 CoxBoost, SuperPC, 以及共10种机器学习算法 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据,基因表达数据 10个肺腺癌样本的单细胞RNA测序数据,以及TCGA-LUAD和GSE68465数据集中的批量样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
783 2026-04-17
The m6Am methyltransferase PCIF1 promotes osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells through stabilization of Wnt-related transcripts
2026-Apr, PLoS biology IF:7.8Q1
研究论文 本文揭示了m6Am甲基转移酶PCIF1通过稳定Wnt相关转录本促进间充质干细胞成骨分化的机制 首次发现PCIF1作为m6Am甲基转移酶在骨量维持和间充质干细胞成骨分化中的关键作用,并阐明其通过调控Wnt通路基因的mRNA稳定性来影响骨形成 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;PCIF1在其他细胞类型(如骨髓细胞)中的具体作用未完全阐明 探究PCIF1介导的m6Am修饰在骨稳态和成骨分化中的调控功能 间充质干细胞(MSCs)和小鼠模型 表观遗传学 骨质疏松症 GWAS, TWAS, 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
784 2026-04-17
Tumor Core-Edge Divergence in T-Cell Exhaustion and Clonal Expansion in HPV-Related Cervical Squamous Cell Carcinoma Unveiled by Simultaneous Single-Cell RNA and TCR Sequencing
2026-Apr, Journal of medical virology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA和TCR测序揭示了HPV相关宫颈鳞状细胞癌中肿瘤核心与边缘区域T细胞耗竭和克隆扩增的差异 首次在HPV相关宫颈鳞状细胞癌中同时使用单细胞RNA和TCR测序,系统比较了肿瘤核心与边缘区域的T细胞状态,并识别出一个与压力相关的耗竭CD8 T细胞亚群 样本量相对较小(scRNA-seq n=13, scTCR-seq n=9),且主要聚焦于HPV相关宫颈鳞状细胞癌,其他癌症类型的验证依赖于公共数据集 探究肿瘤空间结构(核心与边缘)对T细胞耗竭状态和克隆性的影响,以寻找预后生物标志物和潜在治疗靶点 HPV相关宫颈鳞状细胞癌患者的配对肿瘤核心与边缘组织样本中的T细胞 单细胞组学 宫颈癌 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 批量RNA测序, 免疫荧光 NA 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 批量转录组数据, 公共癌症基因组数据 13例患者的单细胞RNA测序样本, 9例患者的单细胞TCR测序样本, 41例患者的批量RNA测序数据, 以及来自TCGA和结直肠癌的公共数据集 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq, 批量RNA-seq NA NA
785 2026-04-17
Whole-embryo spatial transcriptomics
2026-Apr, Nature genetics IF:31.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
786 2026-04-17
Spatiotemporal immune dynamics in lung cancer progression and treatment
2026-Apr, Breathe (Sheffield, England)
综述 本文整合空间和时间视角,提供了肺癌免疫生物学的统一视图,重点讨论了肿瘤微环境中免疫、基质和恶性细胞之间的时空动态相互作用 将空间组织与时间变化相结合,揭示肺癌免疫微环境的动态重塑过程,并强调新兴技术在连接时空过渡与免疫背景方面的潜力 作为综述文章,主要基于现有研究进行整合和讨论,未提供原始实验数据或具体模型验证 理解肺癌免疫微环境的时空动态,以促进分期特异性生物标志物发现、治疗优化和个性化策略 肺癌肿瘤微环境,特别是非小细胞肺癌(NSCLC)中的免疫、基质和恶性细胞 数字病理学 肺癌 空间转录组学、多重成像、功能测定 NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
787 2026-04-15
Molecular Markers Distinguishing Early-Stage Mycosis Fungoides From Atopic Dermatitis Skin Lesions
2026-Apr, Experimental dermatology IF:3.5Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据,比较早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变的转录组特征,揭示了两者在免疫和基质细胞中的分子差异 首次在单细胞水平上系统比较早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎的转录组特征,识别了恶性T细胞、角质形成细胞、成纤维细胞和髓系细胞中的特异性分子标记 研究样本量可能有限,且仅聚焦于早期阶段,未涵盖疾病进展或治疗响应 区分早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变,以改善诊断和治疗 早期蕈样肉芽肿和特应性皮炎患者的皮肤病变样本 数字病理学 皮肤T细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
788 2026-04-15
Ubiquitin-specific protease 20(USP20) mitigates doxorubicin-induced cardiotoxicity by deubiquitinating and stabilizing HuR
2026-Apr, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究揭示了泛素特异性蛋白酶20(USP20)通过去泛素化并稳定HuR蛋白,从而抑制铁死亡并减轻阿霉素诱导的心肌病 首次阐明了USP20在阿霉素诱导心肌病中的保护作用机制,并发现其通过去泛素化HuR来稳定GPX4 mRNA以抑制铁死亡 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床样本中得到验证 探究USP20在阿霉素诱导心肌病中的作用机制 心肌细胞、小鼠心脏组织 分子生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序、LC-MS/MS、免疫共沉淀 基因敲除小鼠模型 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
789 2026-04-14
Chronic psychological stress disrupts liver homeostasis by dysregulating oxidative phosphorylation via the PI3K/AKT/FoxO3a axis
2026-Apr-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过慢性束缚应激小鼠模型,揭示了慢性心理应激通过PI3K/AKT/FoxO3a轴抑制氧化磷酸化,从而破坏肝脏稳态的机制 首次在单细胞水平上识别FoxO3a作为关键转录因子,介导心理应激诱导的氧化磷酸化抑制,并发现FoxO3a驱动的表观遗传沉默作用 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;机制细节如FoxO3a具体靶基因有待深入探索 探究慢性心理应激导致慢性肝病的分子机制 慢性束缚应激小鼠模型中的肝细胞,特别是门静脉周围肝细胞(区域1) 单细胞组学 慢性肝病 单细胞RNA测序,组织学分析,生化分析,电子显微镜 NA 单细胞RNA测序数据,组织图像,生化指标 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
790 2026-04-14
SpaHE-Infil: A spatial heterogeneity framework for decoding TME infiltration from H&E-stained slides
2026-Apr-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 开发了一个名为SpaHE-Infil的多模态计算框架,通过整合空间转录组学和全切片图像,从H&E染色切片中解码肿瘤微环境中的免疫细胞浸润 结合空间转录组学和全切片图像,利用随机森林模型提取形态、纹理和密度特征,动态校准临床样本中的免疫细胞比例偏差,实现高精度的空间细胞分布预测 未明确提及具体局限性,但可能依赖于图像质量和样本可用性 解码肿瘤微环境中免疫细胞的空间分布,以预测免疫治疗反应和患者生存 肿瘤微环境中的12种核心细胞类型,包括免疫细胞 数字病理学 多种癌症 空间转录组学,全切片图像分析 随机森林 图像,空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
791 2026-04-14
CKAP4 Regulates ERS-Induced Apoptosis in Osteoclasts Through FOXO3 in Periodontitis
2026-Apr-13, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本研究揭示了CKAP4通过FOXO3调控内质网应激诱导的破骨细胞凋亡在牙周炎中的作用机制 首次发现CKAP4在牙周炎破骨细胞凋亡中的调控作用,并阐明其通过FOXO3介导的内质网应激通路 研究主要基于动物模型和测序数据分析,临床样本验证相对有限 探究牙周炎中破骨细胞凋亡失调的分子机制 破骨细胞(Osteoclasts) 单细胞组学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 GEO数据库中的牙周炎患者组织样本数据及Ckap4基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
792 2026-04-14
Single-cell RNA sequencing analysis reveals cellular heterogeneity and immune microenvironment dynamics in colorectal cancer
2026-Apr-12, The International journal of biological markers
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了结直肠癌中的细胞异质性和免疫微环境动态,重点关注CD8+ CD101hiTim3+ T细胞及其前体细胞与免疫治疗反应的关联 识别并注释了结直肠癌中的多种T细胞亚型,构建了CCT T细胞及其前体细胞的伪时间轨迹,揭示了PD-1免疫治疗组中CCT T细胞前体与其他细胞间增强的相互作用,并开发了一个包含15个基因特征的预后模型 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量可能限制结果的普适性;对免疫治疗反应的预测仍需临床数据进一步确认 通过研究结直肠癌微环境中的CCT T细胞及其前体细胞,识别新的治疗靶点和潜在生物标志物,并探索它们与免疫治疗反应的关联 结直肠癌患者样本中的T细胞,特别是CD8+ CD101hiTim3+ T细胞及其前体细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 预后模型(基于基因特征) 单细胞测序数据,转录组数据 未明确指定具体样本数量,但使用了单细胞测序数据和TCGA数据库 NA 单细胞RNA-seq NA NA
793 2026-04-14
Senescence Programs Shape the Chronic Wound Microenvironment
2026-Apr-12, Advances in wound care IF:5.8Q1
综述 本文综述了细胞衰老在慢性伤口微环境中的作用及其对愈合过程的影响 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示慢性伤口中衰老细胞的异质性及其空间分布,为靶向治疗提供新见解 依赖非特异性衰老标志物(如p21或SA-β-gal)导致结果解释复杂化,且衰老细胞在慢性伤口中的身份、丰度和定位仍不明确 探讨细胞衰老如何影响慢性伤口的愈合过程,并评估靶向衰老细胞的治疗策略 慢性伤口(如糖尿病足溃疡、静脉性腿部溃疡和压力性溃疡)中的衰老细胞,特别是成纤维细胞和免疫细胞 数字病理学 慢性伤口 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
794 2026-04-14
COPD reshapes the tumor microenvironment of NSCLC and enhances anti-PD-1 therapy response
2026-Apr-10, Med (New York, N.Y.)
研究论文 本研究揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)通过重塑非小细胞肺癌(NSCLC)的肿瘤微环境,特别是通过诱导上皮细胞重塑和建立CXCL14-CXCR4信号轴来招募巨噬细胞,从而增强抗PD-1免疫疗法的疗效 首次通过整合多组学分析和功能验证,阐明了COPD作为共病通过诱导特定的基底样肿瘤细胞群和建立肿瘤-巨噬细胞招募回路来增强NSCLC对PD-1阻断剂反应的分子机制 研究主要基于手术切除的新鲜肿瘤样本,样本量可能有限,且机制验证主要在体外进行,需要进一步的体内模型验证 探究COPD如何影响NSCLC的肿瘤微环境并增强抗PD-1免疫疗法的疗效 非小细胞肺癌(NSCLC)患者,特别是伴有COPD共病的患者 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫荧光 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫荧光图像 三个临床队列的新鲜手术肿瘤标本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
795 2026-04-14
Pan-cancer macrophage atlas uncovers that MHC-IIhigh TAMs induce Treg activation through physical interactions
2026-Apr-10, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过整合10种癌症类型的单细胞RNA-seq数据,揭示了肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在肿瘤微环境中通过MHC-II介导抗原呈递并激活调节性T细胞(Tregs)的新机制 首次在泛癌层面系统描绘了巨噬细胞的抗原呈递功能,挑战了树突状细胞是肿瘤微环境中主要抗原呈递细胞的传统观点,并发现MHC-II高表达的TAMs通过物理接触直接激活Tregs 研究主要基于单细胞转录组数据,功能验证主要在肺癌小鼠模型中进行,其他癌症类型的体内验证尚不充分 探究肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的抗原呈递功能及其对免疫调节的影响 10种癌症类型的肿瘤样本、肺癌小鼠模型、接受免疫治疗的临床患者数据集 肿瘤免疫学 泛癌研究(包括肺癌、乳腺癌、结直肠癌等10种癌症) 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组数据 10种癌症类型的多中心样本集合 NA 单细胞RNA-seq NA NA
796 2026-04-14
Psoriatic arthritis monocyte DNA methylomes bridge joint and skin inflammatory pathways across rheumatoid arthritis and psoriasis
2026-Apr-10, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究通过分析类风湿关节炎、银屑病关节炎和银屑病患者的单核细胞DNA甲基化组,揭示了这些免疫介导炎症性疾病之间共享和特异的表观遗传特征 首次系统比较了RA-PsA-PsO谱系中单核细胞的DNA甲基化特征,并整合单细胞转录组数据验证表观遗传发现,揭示了PsA作为连接关节和皮肤炎症的双重分子状态 研究主要基于外周血单核细胞,可能未完全反映组织局部免疫环境;样本量未明确说明 探究免疫介导炎症性疾病(特别是RA、PsA和PsO)共享和疾病特异性的表观遗传驱动因素 类风湿关节炎、银屑病关节炎、银屑病、未分化关节炎患者及健康对照者的外周血单核细胞 表观遗传学 类风湿关节炎、银屑病关节炎、银屑病 全基因组DNA甲基化分析、单细胞RNA测序 NA DNA甲基化数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
797 2026-04-14
RA and PsA synovial tissue single-cell analysis demonstrates differential fibroblast populations with distinct phenotypes and functional capacities
2026-Apr-10, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析,揭示了类风湿关节炎和银屑病关节炎中成纤维样滑膜细胞的不同亚群及其功能特性 首次在单细胞水平上系统比较了RA和PsA中FLS的异质性,并识别出与疾病特异性相关的功能亚群,特别是通过Hippo信号通路分析揭示了RA的潜在致病机制 研究样本量相对有限,且主要基于体外分析,需要进一步在体实验验证这些亚群的功能 比较类风湿关节炎和银屑病关节炎中成纤维样滑膜细胞的表型和功能差异 类风湿关节炎和银屑病关节炎患者的滑膜组织细胞 单细胞组学 关节炎 单细胞RNA测序, 流式细胞术, ELISA, qPCR, 代谢分析 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 未明确样本数量,但涉及RA和PsA患者的滑膜细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
798 2026-04-14
Circadian-driven transcriptional programs govern metastatic progression
2026-Apr-10, Cancer biology & medicine IF:5.6Q1
综述 本文综述了昼夜节律如何通过调控肿瘤微环境(TME)成分来影响转移进程 整合了单细胞RNA-seq和活体成像数据,揭示了昼夜节律扰动(如时差反应或CRY1敲除)如何改变TME中的细胞因子网络、缺氧反应和代谢共生,从而识别了时间治疗靶点 关于TME分子机制的细节尚未完全阐明 探讨昼夜节律在肿瘤转移进程中的作用机制 肿瘤微环境(TME)成分,包括细胞外基质、基质细胞(如癌症相关成纤维细胞、巨噬细胞)和免疫细胞 肿瘤生物学 癌症 单细胞RNA-seq, 活体成像 NA 转录组数据, 成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
799 2026-04-14
Investigating the potential risk of nicotine exposure on glioblastoma: Integrating Mendelian randomization and network toxicology analysis
2026-Apr-09, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本研究整合孟德尔随机化和网络毒理学分析,探讨尼古丁暴露对胶质母细胞瘤的潜在风险 首次结合孟德尔随机化与网络毒理学方法,系统评估血清可替宁(尼古丁代谢物)与胶质母细胞瘤的因果关系,并识别核心靶点基因 研究依赖于公开数据库数据,可能存在样本选择偏倚;未进行实验验证核心靶点的功能机制 探究尼古丁暴露与胶质母细胞瘤风险之间的关联 胶质母细胞瘤(GBM)患者数据及尼古丁相关靶点基因 生物信息学 胶质母细胞瘤 孟德尔随机化、网络毒理学分析、机器学习、分子对接、结构动力学分析 机器学习(未指定具体模型) 基因表达数据、单细胞测序数据 NA CNGB 单细胞测序 NA CNGB单细胞测序数据库
800 2026-04-14
Robust integration and annotation of single-cell and spatial omics data using interpretable gene programs
2026-Apr-08, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本文介绍了一个名为SSpMosaic的计算框架,该框架利用可解释的基因程序作为通用锚点,实现了单细胞和空间组学数据的稳健整合与注释 提出了以元程序(跨数据集对齐的高阶基因程序表示)作为生物学状态表示的通用锚点,实现了跨批次、模态和物种的一致且准确的整合,并支持无需参考数据的空间特征描述 NA 开发一个计算框架,以解决单细胞和空间组学数据整合与注释中的挑战,并实现跨尺度的空间转录组学解卷积 单细胞和空间组学数据,包括单核转录组学、染色质可及性和空间转录组学数据 计算生物学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq 基于元程序的迁移学习框架 转录组数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 NA 10x Genomics, NanoString 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq 10x Visium, CosMx, Visium HD 10x Visium(spot级), CosMx/Visium HD(亚细胞级)
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