单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202604-202604] [清除筛选条件]
当前共找到 951 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-07-02
Retinoic acid drives cell fate specification, maturation and retinal regionality in human retinal organoids
2026-Apr-25, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 视黄酸通过时空剂量调控驱动人视网膜类器官中的细胞命运特化、成熟及区域化特征 首次揭示视黄酸剂量依赖性地调控人视网膜类器官中黄斑样与外周样区域身份的建立,并结合单细胞与空间转录组学解析其机制 视黄酸浓度梯度在体内动态调控的复杂性尚未完全模拟,且类器官模型可能无法完全再现人视网膜的完整区域性特征 阐明视黄酸在人类视网膜发育中调控细胞命运、成熟及区域特化的分子机制 人视网膜类器官 数字病理学 遗传性视网膜疾病 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质分析 NA 转录组数据、空间表达数据 人视网膜类器官样本,具体数目未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞转录组,10x Visium 用于空间转录组分析
62 2026-07-02
A macrophage MHC-I axis links intratumoral heterogeneity to terminal CD8+ T cell exhaustion in lung adenocarcinoma
2026-Apr-25, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 通过整合批量、单细胞和空间转录组学数据,研究肺腺癌中肿瘤内异质性如何加剧CD8 T细胞耗竭 首次揭示巨噬细胞MHC-I轴连接肿瘤内异质性与终末期CD8+T细胞耗竭,并开发六基因决策树分类器预测表型 未提及具体的实验验证或临床干预结果,分类器的临床实用性需进一步验证 探索肺腺癌中肿瘤内异质性与CD8 T细胞耗竭之间的分子机制 肺腺癌患者的肿瘤样本(包括批量、单细胞和空间转录组数据) 数字病理学 肺癌 批量转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学 NA 转录组数据 未明确具体样本数量,但涉及多个队列的批量、单细胞和空间数据 NA 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
63 2026-07-02
Deep learning for predicting pituitary neuroendocrine tumour lineage and high-risk subtypes from histology
2026-Apr-24, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 利用深度学习模型从常规H&E染色全切片图像预测垂体神经内分泌肿瘤的谱系、高风险亚型和复发 首次使用深度学习模型直接从常规H&E染色全切片图像中预测垂体神经内分泌肿瘤的谱系、高风险亚型和复发,并通过空间转录组学验证了与复发相关的免疫和分子特征 复发预测的AUC仅为0.641,表明模型在预测复发方面性能有限 开发深度学习模型以预测垂体神经内分泌肿瘤的谱系、高风险亚型和复发 垂体神经内分泌肿瘤患者 数字病理学 垂体神经内分泌肿瘤 NA 深度学习 图像 训练集925例(中国科学技术大学),外部验证集:太和医院226例、华山医院193例 NA 空间转录组学 NA NA
64 2026-07-02
DAPK2 Regulates PKM2 Phosphorylation at Threonine 45 to Facilitate Disturbed Flow-Induced Atherosclerosis
2026-Apr-14, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 该研究发现DAPK2通过磷酸化PKM2的苏氨酸45位点,促进扰动血流诱导的动脉粥样硬化形成 首次揭示DAPK2通过磷酸化PKM2的T45位点调控内皮细胞炎症反应,并鉴定该通路为动脉粥样硬化的新机制和治疗靶点 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床验证尚需进一步开展 阐明DAPK2在振荡剪切应力诱导的内皮细胞活化和动脉粥样硬化中的作用 人及小鼠动脉内皮细胞、Apoe-/-小鼠模型 机器学习 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 质谱, 免疫共沉淀, 邻近连接法 NA 基因表达数据, 测序数据 包括公开数据库数据及小鼠模型样本(具体数量未明确) Illumina 单细胞RNA-seq, RNA-seq Illumina NovaSeq 公开数据库包括基因芯片、RNA测序及单细胞RNA测序数据
65 2026-07-02
Tumor-derived ITIH2 activates PI3K\AKT pathway via THBS1 ubiquitination and promotes tumor angiogenesis in hepatocellular carcinoma
2026-Apr, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
研究论文 研究发现肿瘤来源的ITIH2通过泛素化调控THBS1激活PI3K/AKT通路,促进肝细胞癌血管生成 首次发现ITIH2作为肝细胞癌预后生物标志物,通过泛素化介导的THBS1稳定性调控激活PI3K/AKT通路,促进血管生成,且不直接影响肿瘤细胞增殖或凋亡 未具体说明局限性,但可能包括样本量有限和机制细节需进一步验证 阐明肝细胞癌中血管生成与肿瘤进展之间的分子机制 肝细胞癌肿瘤微环境中的血管内皮细胞 机器学习 肝癌 单细胞RNA测序 LASSO回归、多变量Cox回归 单细胞转录组数据 2例肝细胞癌患者单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
66 2026-07-02
Repeated proliferative events ameliorate age-associated accumulation of DNA damage in HSPCs
2026-Apr, Life science alliance IF:3.3Q1
研究论文 研究重复性增殖事件对造血干细胞和祖细胞年龄相关DNA损伤积累的改善作用 通过多次放血实验诱导小鼠HSPC持续增殖,发现重复增殖事件可清除年龄相关的DNA双链断裂积累,而不影响造血功能 未提供具体局限性信息 探究增殖速率增加对造血干细胞和祖细胞造血衰老的影响 小鼠和人的造血干细胞和祖细胞(HSPCs) 机器学 老年疾病 scRNA-seq NA 单细胞转录组数据 小鼠和人类样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
67 2026-07-02
Maternal obesity induces activator protein 1-mediated inflammatory response to impair embryonic neurogenesis
2026-04, The Journal of physiology
研究论文 该论文通过单细胞RNA测序和ATAC测序揭示母体肥胖通过激活蛋白1介导的炎症反应损害胚胎神经发生的机制 首次利用单细胞多组学技术(scRNA-seq和scATAC-seq)揭示母体肥胖通过激活蛋白1(AP-1)转录因子增强炎症基因(如Tnf和Cd68)的染色质可及性,从而抑制神经发生的关键转录因子(如Neurod1、Neurog2和Ascl1)表达 NA 探究母体肥胖对胚胎神经发育影响的分子机制 母体肥胖小鼠及其E11.5和E13.5胚胎 数字病理学 神经发育障碍 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 NA 单细胞转录组、单细胞染色质可及性 母体肥胖小鼠(高脂饮食喂养2个月)及其E11.5和E13.5胚胎 NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 NA NA
68 2026-07-01
Genetic and chemical correction of cystic fibrosis reduces airway susceptibility to SARS-CoV-2
2026-04-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
研究论文 研究囊性纤维化患者的基因和化学校正如何降低气道对SARS-CoV-2的易感性 首次利用同基因诱导多能干细胞衍生气道模型,揭示CFTR调节剂ETI不仅在CF气道中,也能在非CF气道中降低SARS-CoV-2感染和炎症的广泛保护作用 NA 探究CFTR调节剂ETI如何减轻SARS-CoV-2感染和气道损伤及其潜在机制 诱导多能干细胞衍生的气道上皮模型、同基因CFTR校正细胞、原代气道上皮 数字病理学 囊性纤维化、COVID-19 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多组iPSC衍生气道模型及原代上皮样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
69 2026-06-30
The PPTC7/BNIP3/NIX axis induces cGAS/STING-mediated senescence and augments CAR-T efficacy by repressing tumor-intrinsic mitophagy
2026-Apr-18, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 本研究揭示PPTC7/BNIP3/NIX轴通过抑制肿瘤内在的线粒体自噬,诱导cGAS/STING介导的衰老,并增强CAR-T细胞疗法的疗效 首次发现PPTC7作为线粒体自噬的负调控因子,通过促进BNIP3和NIX的泛素化降解,抑制线粒体自噬,从而释放线粒体DNA激活cGAS/STING通路,增强肿瘤免疫原性和CAR-T疗效 未明确说明限制 探索多发性骨髓瘤中影响CAR-T疗法敏感性的肿瘤内在因素,尤其是线粒体自噬的调控机制 多发性骨髓瘤细胞及CAR-T细胞 机器学习 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序、转录组分析 NA 基因表达数据 多发性骨髓瘤患者样本,具体数量未说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 公共单细胞RNA-seq数据
70 2026-06-30
Revealing an enhanced cytotoxic immune microenvironment at the human maternal-fetal interface in preeclampsia
2026-Apr-16, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示先兆子痫患者蜕膜免疫细胞中增强的细胞毒性免疫微环境 首次在先兆子痫的母胎界面进行单细胞水平免疫细胞图谱分析,发现NK细胞和T细胞均表现出增强的细胞毒性活性,并识别出具有高细胞毒性和趋化因子基因表达的独特组织驻留ITGAECD160 NK细胞亚群 样本量有限,仅来源于先兆子痫患者的蜕膜组织,未涵盖正常妊娠对照的比较分析 探究先兆子痫中蜕膜免疫细胞的功能异常及其机制 先兆子痫患者的蜕膜免疫细胞 单细胞转录组学 先兆子痫 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 先兆子痫患者(具体数量未提及)的蜕膜免疫细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
71 2026-06-30
CSTA and DDX24: potential biomarkers regulating ferroptosis in sepsis and their diagnostic value
2026-Apr-09, BMC medical genomics IF:2.1Q3
研究论文 通过多组学数据分析,发现CSTA和DDX24是脓毒症中铁死亡的潜在生物标志物,并验证其诊断价值 首次综合多个转录组数据集与单细胞测序数据,系统鉴定铁死亡关键调控基因CSTA和DDX24,并构建miRNA-mRNA互作网络 仅基于公开数据集和体外实验验证,缺乏体内动物模型和临床队列的进一步证实 探究脓毒症中铁死亡的分子调控机制,识别诊断和治疗新靶点 脓毒症相关转录组和单细胞测序数据集 计算机视觉 脓毒症 转录组测序, 单细胞RNA测序 加权基因共表达网络分析, 机器学习 转录组数据, 单细胞测序数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
72 2026-06-30
Circulating Immune Cells are Associated with Non-Inflammatory Pain in Rheumatoid Arthritis
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探索类风湿性关节炎患者中循环免疫细胞与非炎性疼痛的关联 通过多参数光谱流式细胞术和单细胞RNA测序,首次识别出与非塑性疼痛相关的免疫细胞群 样本量较小(39例RA患者,其中22例进行单细胞测序),且未包含纵向数据 阐明类风湿性关节炎患者中区分中枢性疼痛的细胞状态变化 类风湿性关节炎患者的外周血免疫细胞 免疫学 类风湿性关节炎 多参数光谱流式细胞术、单细胞RNA-seq NA 细胞、基因表达数据 39例RA患者(其中22例进行单细胞RNA-seq分析) NA 单细胞RNA-seq NA NA
73 2026-06-30
Thymic stromal lymphopoietin promotes ozone-induced inflammation in the airway
2026-04-01, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
research paper 研究表明胸腺基质淋巴细胞生成素通过调控cDC1来源的Fscn1促进臭氧诱导的气道炎症 首次发现TSLP通过cDC1中的Fscn1基因调控臭氧诱导的中性粒细胞性气道炎症,为2型低炎症表型哮喘提供潜在治疗靶点 研究仅限于小鼠模型,且未深入探讨Fscn1在人类中的对应机制 探究TSLP在臭氧诱导的气道炎症中的作用机制 BALB/c小鼠和TSLP受体缺陷小鼠 machine learning, digital pathology NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序用于识别靶细胞簇和基因
74 2026-06-30
Single cell omics identify an anti-inflammatory niche in macrophages of mild to moderate chronic obstructive pulmonary disease
2026-04-01, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 利用单细胞组学技术鉴定轻中度慢性阻塞性肺疾病中巨噬细胞的抗炎微环境 首次在轻中度COPD中发现一种称为间质COPD相关巨噬细胞(ICM)的新亚群,该亚群具有抗炎活性,并揭示了SCGB3A2-MARCO通路在分泌细胞与巨噬细胞间的保护性调控作用 未明确提及局限性 探究轻中度COPD中巨噬细胞与分泌细胞的协同抗炎作用 轻中度COPD患者及对照组的肺组织样本、小鼠肺组织、重度COPD患者肺组织 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病 Microwell-seq、微流控单细胞RNA测序、高通量单核总RNA测序(snHH-seq)、空间转录组学、免疫染色 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 轻中度COPD患者及对照组的肺组织、小鼠肺组织、重度COPD患者肺组织 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
75 2026-06-29
Multiomic, Histologic, and scRNA-seq Profiling of Pleural Mesothelioma Reveals Negative Prognosis Associated With a Novel Uncommitted Molecular Phenotype
2026-04, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer IF:21.0Q1
研究论文 通过多组学、组织学和单细胞RNA测序对胸膜间皮瘤进行分析,揭示一种与新型未定型分子表型相关的负面预后 鉴定了在双相型胸膜间皮瘤中富集的新型未定型恶性细胞状态,并发现该状态不限于特定克隆,提出了TGF-β和GAS6-AXL信号通路作为候选驱动因素 样本量较小(40名患者93例样本),结论需要进一步实验探索和临床验证 探索胸膜间皮瘤不同组织学类型中调节生存的潜在生物学机制 胸膜间皮瘤患者肿瘤组织样本 数字病理学 胸膜间皮瘤 单细胞RNA测序,全外显子和RNA测序,光学基因组图谱,空间转录组学,组织学分析 NA RNA序列,外显子序列,基因组数据,空间转录数据,组织学图像 40名患者的93例胸膜间皮瘤肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,全外显子测序,RNA测序 NA NA
76 2026-06-26
Somatic Mutation Trajectories Define Prognostically Distinct Subtypes and Shape the Tumor Microenvironment in Gastric Cancer
2026-Apr-30, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过重构体细胞突变轨迹,定义胃癌中预后不同的亚型并揭示其肿瘤微环境特征 首次应用SuStaIn算法推断胃癌体细胞突变累积的时间顺序,识别出两种预后截然不同的进化轨迹(加速路径和渐进路径),并系统关联了转录组、肿瘤微环境和药物敏感性特征 计算药物敏感性预测及基因表达模式与临床结局之间的机制联系为假说生成性发现,需前瞻性和功能性验证 通过重构体细胞突变轨迹,识别胃癌中预后不同的亚型并研究其转录组与微环境特征 胃癌患者的体细胞突变、基因表达、肿瘤微环境特征及药物敏感性 机器学习 胃癌 NGS SuStaIn算法 基因突变数据、转录组数据 TCGA-STAD队列及三个独立外部转录组队列 NA NA NA NA
77 2026-06-26
Characterizing Infiltrating Macrophages in Intracranial Aneurysm with IA Animal Models and Spatial Transcriptomics
2026-Apr-29, Translational stroke research IF:3.8Q2
综述 总结颅内动脉瘤中浸润性巨噬细胞的研究现状,并介绍用于研究巨噬细胞浸润的动物模型和空间转录组学方法 结合空间转录组学和动物模型,系统性总结浸润性巨噬细胞在颅内动脉瘤中的特征,包括其发生起源、转录组谱及与其他细胞亚群的相互作用 空间转录组学受限于样本可用性,动物模型的应用需要谨慎以转化研究解决未满足的临床需求 理解颅内动脉瘤病理生理学,识别潜在治疗靶点 颅内动脉瘤中的浸润性巨噬细胞 数字病理学 脑血管疾病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
78 2026-06-26
Spatial profiling of chronic liver disease: a pilot spatial case series
2026-Apr-20, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 利用基于测序的空间转录组学对酒精性肝病、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎和慢性丙型肝炎患者的肝脏组织进行空间分析,揭示慢性肝病组织可能共享重复的假小叶功能结构 首次采用病毒感知工作流程的空间转录组学进行慢性肝病空间病例系列研究,实现丙肝病毒RNA原位检测、组织学指导的微环境注释及细胞间通讯分析,发现跨病因的共享假小叶功能架构 样本量小(仅4例通过质控),为初步试点研究;乙型肝炎样本未纳入核心分析,结论外推性受限 探究不同病因慢性肝病在保留组织学背景下的空间组织规律 酒精性肝病、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎和慢性丙型肝炎患者肝脏八份组织样本(其中四份通过质控) 数字病理学 肝病 空间转录组学 NA 基因表达数据 四例通过质控的慢性肝病患者肝脏组织 NA 空间转录组学 NA 基于测序的空间转录组学,包含病毒感知工作流程(用于丙肝病毒RNA原位检测)
79 2026-06-26
Advances in the Genetics and Molecular Biology of Brain Arteriovenous Malformations
2026-Apr-18, Translational stroke research IF:3.8Q2
综述 本文综述了脑动静脉畸形在遗传学和分子生物学方面的最新进展,包括体细胞突变、转录组图谱和动物模型的研究 揭示了KRAS和BRAF体细胞突变在散发性bAVM内皮细胞中的关键作用,以及RAS/MAPK通路激活驱动异常血管生成的新机制 临床转化仍面临挑战,原因是变异等位基因频率低且组织获取受限 总结bAVM的遗传和分子机制进展,为靶向治疗提供基础 脑动静脉畸形的内皮细胞、体细胞突变和血管病变 分子生物学 脑血管疾病 单细胞RNA测序、全转录组分析 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
80 2026-06-26
Aging restricts maturation of CXCL13+ T follicular helper cells in human immunity
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用人类扁桃体类器官、单细胞RNA测序和CRISPR扰动技术,揭示了衰老通过限制CXCL13+ T滤泡辅助细胞的成熟来削弱人类体液免疫的机制 首次发现人类特异性CXCL13+ Tfh细胞在衰老过程中成熟受阻,并确定BACH2和SOX4为年龄相关的分化转录调控因子 研究仅基于扁桃体类器官模型,可能无法完全反映体内复杂免疫微环境;样本量较小且未涉及其他淋巴组织 探究人类免疫衰老过程中抗体反应下降的B细胞和T细胞相对贡献,以及CXCL13 Tfh细胞的调控机制 人类扁桃体样本(来自年轻和老年供体) 机器学习和数字病理学 免疫衰老 单细胞RNA测序、CRISPR扰动、类器官培养 轨迹分析 单细胞转录组数据 涉及年轻和老年供体的扁桃体类器官样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部