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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2026-04-19 |
Hepatic-Differentiated Subpopulation in Clear Cell Renal Cell Carcinoma: A Multi-Omics Analysis of Tumors With Lymphovascular Invasion
2026-Apr, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71843
PMID:41981779
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探索了透明细胞肾细胞癌中淋巴血管侵袭的分子基础,发现了一个具有肝系分化特征的肿瘤亚群 | 首次在ccRCC中识别出一个表达肝系转录因子HNF1A和HNF4A的肿瘤亚群,该亚群位于肿瘤演化的终末阶段,并与淋巴血管侵袭和缺氧微环境相关 | 这是一项基于发现的假设生成研究,所有发现需要在临床应用前进行独立的功能验证 | 理解透明细胞肾细胞癌中淋巴血管侵袭的分子基础 | 透明细胞肾细胞癌标本(31例,其中11例LVI阳性,20例LVI阴性) | 数字病理学 | 肾癌 | 全基因组测序,RNA测序,蛋白质组学分析,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 | 31例ccRCC标本(11例LVI+,20例LVI-),并整合了公共单细胞RNA测序和空间转录组学数据集 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,全基因组测序,RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 762 | 2026-04-18 |
Targeting E3 Ubiquitin Ligase Hrd1 Prevents Myocardial Ischemia-Reperfusion Injury Through Enhancing ALDH2 Enzymatic Activity
2026-Apr-17, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过泛素组学、单细胞RNA测序和蛋白质组学联合分析,揭示了E3泛素连接酶Hrd1通过K33连接的多聚泛素化抑制ALDH2酶活性,从而加剧心肌缺血再灌注损伤的机制,并证明靶向Hrd1具有治疗潜力 | 首次系统性地将蛋白质泛素化与心肌缺血再灌注损伤联系起来,并鉴定出Hrd1-ALDH2轴在其中的关键作用,揭示了K33连接的多聚泛素化调控ALDH2四聚体形成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,其在人体中的确切作用及临床转化效果仍需进一步验证 | 探究蛋白质泛素化在心肌缺血再灌注损伤中的作用,并寻找潜在的治疗靶点 | 小鼠心脏组织、内皮细胞、ALDH2蛋白、Hrd1蛋白 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 泛素组学、单细胞RNA测序、蛋白质组学、质谱分析、免疫共沉淀 | NA | 组学数据、蛋白质相互作用数据 | 使用了全局杂合性Hrd1敲除、内皮细胞特异性Hrd1缺陷及过表达等多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 763 | 2026-04-18 |
Multi-omics validation of myelin water fraction as a myelin-specific MRI biomarker
2026-Apr-15, NeuroImage
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.neuroimage.2026.121852
PMID:41819433
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研究论文 | 本文通过整合高级MRI、高通量血浆蛋白质组学和空间转录组学数据,验证了髓鞘水分数作为髓鞘特异性MRI生物标志物的生物学相关性 | 首次将BMC-mcDESPOT MRI方法与血浆蛋白质组学和空间转录组学相结合,为MWF的髓鞘特异性提供了多组学验证证据 | 血浆蛋白质分析仅显示名义关联(p < 0.05,未校正),且样本可能仅限于成人白质束和深部灰质区域 | 验证髓鞘水分数作为体内髓鞘含量的特异性生物标志物 | 成人主要白质束和深部灰质区域的髓鞘含量 | 神经影像学 | NA | BMC-mcDESPOT MRI成像、高通量血浆蛋白质组学、空间转录组学 | NA | MRI图像、血浆蛋白质数据、空间基因表达数据 | NA | SomaLogic, Allen Institute for Brain Science | 血浆蛋白质组学、空间转录组学 | SomaScan 7k平台、Allen Human Brain Atlas | SomaScan 7k平台用于血浆蛋白质分析,Allen Human Brain Atlas用于MBP基因表达的空间映射 |
| 764 | 2026-04-18 |
Integrative multi‑omics and experimental validation reveal that Duhuo Jisheng Decoction alleviates IVDD by inhibiting MAPK signaling‑mediated inflammation, apoptosis, and mitochondrial dysfunction
2026-Apr-15, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2026.103535
PMID:41990698
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证,揭示了独活寄生汤通过抑制MAPK信号通路介导的炎症、细胞凋亡和线粒体功能障碍来缓解椎间盘退变 | 首次结合转录组学、单细胞RNA测序和网络药理学,系统阐明了独活寄生汤治疗椎间盘退变的具体分子机制,特别是通过p38MAPK信号通路调控线粒体自噬的新颖作用轴 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,尚未进行人体临床试验验证,且中药复方成分复杂,具体活性成分的体内代谢和作用途径仍需进一步探究 | 探究独活寄生汤治疗椎间盘退变的活性成分和分子机制 | 椎间盘退变模型大鼠和脂多糖诱导的退变髓核细胞 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 转录组学分析、单细胞RNA测序、网络药理学、CCK-8细胞增殖检测、免疫印迹、组织染色 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 | 未明确具体样本数量,但包括大鼠模型和细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 765 | 2026-04-18 |
Amoeboid-mesenchymal transition and the proteolytic control of cancer invasion plasticity
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2520717123
PMID:41961858
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研究论文 | 本文通过癌症球体-3D基质模型、单细胞RNA测序和人体组织外植体,揭示了控制间充质与阿米巴样侵袭的机制,并强调了膜锚定胶原酶MMP14在维持细胞核完整性和体内侵袭活性中的关键作用 | 挑战了当前关于阿米巴样侵袭独立于细胞外基质蛋白水解的教条,发现间充质和阿米巴样侵袭程序均涉及主动隧道形成和基质降解金属蛋白酶的表达,并首次证明MMP14的缺失会导致核膜和DNA损伤 | 研究主要基于体外模型(癌症球体-3D基质模型、人体组织外植体),体内验证虽通过空间转录组和免疫组化分析支持,但直接体内功能实验有限 | 探究控制癌症细胞间充质与阿米巴样侵袭表型转换的分子机制,特别是蛋白水解酶在侵袭可塑性中的作用 | 恶性癌症细胞(在乳腺癌背景下重点研究) | 癌症生物学与细胞侵袭 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 空间转录组学, CRISPR/Cas9基因编辑, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据 (RNA-seq, 空间转录组), 图像数据 (组织学) | NA (涉及癌症球体模型、人体乳腺癌组织外植体及人类乳腺癌样本分析) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 766 | 2026-04-18 |
Single-cell insights: Mosquito Toll activation enhances granulocyte differentiation and immune surveillance via Notch suppression
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2531951123
PMID:41941624
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究了蚊子Toll等先天免疫信号通路如何调控血细胞分化和功能,揭示了新的血细胞亚群及其在免疫监视中的作用 | 首次在蚊子中利用单细胞转录组学鉴定出oenocytoid和granulocyte亚群,并发现Toll和JNK激活通过抑制Notch信号促进粒细胞终末分化,增强免疫监视 | 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本来源单一,未涵盖不同蚊子品系或感染状态 | 探究蚊子先天免疫信号通路对血细胞分化和功能的调控机制 | 蚊子血细胞(免疫细胞) | 单细胞转录组学 | 疟疾 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 37,529个血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 767 | 2026-04-18 |
Spatial multiomics profiling reveals ZFP36-mediated immunometabolic reprogramming in bladder cancer
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2505125123
PMID:41950100
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研究论文 | 本研究通过空间代谢组学和空间转录组学技术,系统描绘了膀胱癌的代谢和转录景观,揭示了肿瘤异质性和免疫相关代谢重编程,并识别ZFP36作为潜在免疫治疗靶点 | 采用空间多组学整合分析,首次在膀胱癌中系统可视化代谢与转录异质性,并发现ZFP36通过调控关键免疫调节因子mRNA降解抑制T细胞功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和空间组学数据,人类样本验证和临床转化仍需进一步探索 | 揭示膀胱癌的免疫代谢重编程机制并寻找新的免疫治疗靶点 | 膀胱癌组织样本、ZFP36基因敲除小鼠模型、T细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间代谢组学、空间转录组学、基因敲除技术 | 基因敲除小鼠模型 | 空间代谢组数据、空间转录组数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间代谢组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 768 | 2026-04-18 |
Genetic interaction between Adgrg6 and Sox9 reveals a feedforward mechanism for postnatal spinal stability
2026-Apr-08, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9271349/v1
PMID:41994120
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了Adgrg6和Sox9在青少年特发性脊柱侧弯(AIS)中的遗传相互作用和反馈前调控机制 | 首次利用空间转录组学在Adgrg6条件性敲除小鼠模型中识别脊柱基因表达变化,并揭示了Adgrg6和Sox9之间的自我强化反馈前调控回路 | 研究主要基于小鼠模型,人类AIS的复杂多基因机制可能有所不同 | 探究AIS的遗传机制和功能基础 | Adgrg6条件性敲除小鼠模型和Sox9低效等位基因小鼠 | 空间转录组学 | 青少年特发性脊柱侧弯 | 空间转录组学,基因组关联研究(GWAS) | 条件性敲除小鼠模型 | 空间转录组数据,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 769 | 2026-04-18 |
An enzyme-responsive electrospun polyester membrane for sustained delivery of polymerized 2-methoxyestradiol to treat peritendinous adhesion
2026-Apr-04, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.04.007
PMID:41942050
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研究论文 | 本研究开发了一种负载聚合2-甲氧基雌二醇的酶响应性电纺聚己内酯膜,用于持续局部释放以抑制成纤维细胞增殖和胶原沉积,从而预防肌腱周围粘连 | 首次将聚合2-甲氧基雌二醇整合到电纺膜中,实现酶响应性持续释放,并通过单细胞RNA测序揭示其通过抑制HIF-1α/Sonic Hedgehog信号通路来预防肌腱粘连的分子机制 | 研究主要基于大鼠模型,临床转化效果需进一步验证;药物释放的长期安全性及膜材料的生物降解性未详细评估 | 开发一种新型生物材料,用于预防肌腱损伤后的周围粘连 | 大鼠跟腱修复模型、人肌腱样本、大鼠208F成纤维细胞 | 生物医学工程 | 肌腱损伤与粘连 | 单细胞RNA测序、RNA测序、酯化反应、RAFT聚合、电纺技术 | NA | 基因表达数据、组织病理图像、生物力学数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及人肌腱样本和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
| 770 | 2026-04-18 |
ORC6 Exerts Oncogenic Functions in Kidney Renal Clear Cell Carcinoma by Regulating Cell Proliferation and Apoptosis: A Prognostic and Immunological Indicator for Future Clinical Interventions
2026-Apr, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.70159
PMID:41992535
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研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk RNA测序探索了ORC6在肾透明细胞癌中的预后、免疫学特征、功能及潜在机制 | 首次通过单细胞和bulk RNA测序综合分析ORC6在KIRC中的功能,揭示了其在免疫T细胞中的主要表达模式,并构建了LncRNA/RBP/ORC6上游调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证和临床样本的深入验证 | 探索ORC6作为肾透明细胞癌新型生物标志物的预后价值和免疫治疗敏感性 | 肾透明细胞癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, PCR | NA | RNA测序数据, 基因表达数据 | 未明确具体样本数量,包含KIRC组织样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 771 | 2026-04-18 |
A TLR8 Variant Identified From Whole Exome Sequencing as a Sepsis-Prone Mutation
2026-Apr, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2026-00049
PMID:41994145
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研究论文 | 本研究通过全外显子组测序在脓毒症患者中发现了一个TLR8基因变异,并通过单细胞RNA测序和功能实验揭示了该变异通过增强IFN-β分泌影响脓毒症病理生理的机制 | 首次通过整合全外显子组测序、单细胞RNA测序和功能免疫学分析,在脓毒症患者中鉴定出跨年龄组存在的TLR8基因功能性变异,并阐明其通过放大IFN-β介导的单核细胞反应影响疾病进程的机制 | 样本量较小(31名脓毒症患者),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证该变异的临床意义 | 探索宿主基因组变异对脓毒症易感性和严重性的影响,并识别潜在的先天性免疫缺陷 | 脓毒症患者(包括学龄前儿童、学龄儿童和成人) | 基因组学与免疫学 | 脓毒症 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列数据, 单细胞转录组数据 | 31名脓毒症患者 | NA | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 772 | 2026-04-17 |
Patient-derived pediatric brain tumor orthotopic xenografts and tumor organoids faithfully recapitulate primary tumors
2026-Apr-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea4966
PMID:41984959
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研究论文 | 本研究建立了源自患者的小儿脑肿瘤类器官和类器官异种移植模型,并证明其能高度模拟原发肿瘤的分子特征和异质性 | 首次从髓母细胞瘤、多层菊形团胚胎性肿瘤和非典型畸胎样横纹肌样瘤的PDOX模型中成功建立了TO和TOX模型,并系统验证了其在表观遗传、转录组、基因组和细胞异质性层面对原发肿瘤的忠实复现能力 | 研究未明确说明建立的TO和TOX模型在长期培养中的稳定性,也未涉及模型对肿瘤微环境(如免疫细胞、血管等)的模拟程度 | 开发能够准确模拟小儿胚胎性脑肿瘤生物学特性的体外模型,以促进功能研究和药物筛选 | 髓母细胞瘤、多层菊形团胚胎性肿瘤、非典型畸胎样横纹肌样瘤的患者来源异种移植模型及其衍生的肿瘤类器官 | 数字病理学 | 小儿脑肿瘤 | DNA甲基化测序、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、全基因组测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 773 | 2026-04-17 |
Folate receptor beta drives NLRP3 inflammasome activation and pyroptosis in macrophages independent of folate binding
2026-Apr-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag051
PMID:41984502
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研究论文 | 本文发现叶酸受体β(FRβ)是巨噬细胞中NLRP3炎症小体激活和细胞焦亡的新型调节因子,且其作用不依赖于叶酸结合 | 首次揭示了FRβ在巨噬细胞中独立于叶酸结合功能,通过调控DNA甲基化、基因转录和钾离子外流来促进NLRP3炎症小体激活的新机制 | 研究主要在THP-1巨噬细胞系中进行,体内生理和病理环境下的功能验证尚需进一步研究 | 探究叶酸受体β在先天免疫信号传导中的功能,特别是在巨噬细胞炎症反应中的作用机制 | 人THP-1巨噬细胞 | 免疫学 | 自身免疫病 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、全基因组甲基化分析 | NA | 基因表达数据、甲基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 774 | 2026-04-17 |
Neoadjuvant stereotactic body radiation therapy plus immune therapy favorably remodels the hepatocellular carcinoma tumor microenvironment
2026-Apr-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-4779
PMID:41984885
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研究论文 | 本研究探讨了在可切除肝细胞癌患者中,新辅助立体定向体部放疗联合免疫疗法对肿瘤微环境的重塑作用及其安全性 | 首次在可切除肝细胞癌患者中,结合新辅助立体定向体部放疗与免疫疗法,并利用单细胞分辨率空间转录组学方法详细解析治疗后肿瘤免疫微环境的重塑 | 样本量较小(n=8),为单机构、单臂试点研究,缺乏对照组,且随访时间有限(中位随访16.3个月) | 评估新辅助立体定向体部放疗联合免疫疗法在可切除肝细胞癌患者中的安全性和对肿瘤微环境的影响 | 初始可切除的肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞分辨率空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | 8名患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 775 | 2026-04-17 |
CD16+ γδ T cells mediate antibody-dependent cellular cytotoxicity and associate with viral control in chronic hepatitis B virus infection
2026-Apr-15, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-337640
PMID:41986134
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研究论文 | 本研究通过多参数流式细胞术、单细胞RNA测序和体外ADCC实验,揭示了CD16+ γδ T细胞在慢性乙型肝炎病毒感染中通过抗体依赖性细胞毒性介导抗病毒免疫,并与病毒控制相关 | 首次系统性地表征了HBV感染中CD16+ γδ T细胞亚群,发现其与肝内病毒复制标志物HBcrAg呈负相关,并证实了该细胞亚群通过ADCC途径介导抗病毒免疫 | 样本量相对有限,特别是急性感染组和脐带血供体组样本较少;研究主要基于外周血分析,肝内样本数据不足;未进行长期随访以验证ADCC与临床结局的关联 | 表征HBV感染中γδ T细胞亚群的特征,评估其与病毒控制及抗体依赖性细胞毒性的关联 | 慢性HBV感染患者、急性HBV感染患者、健康对照者及脐带血供体的外周血样本 | 免疫学 | 乙型肝炎病毒感染 | 多参数流式细胞术、单细胞RNA测序、体外ADCC实验 | NA | 流式细胞数据、单细胞RNA测序数据、体外功能实验数据 | 慢性HBV感染患者83例、急性HBV感染患者16例、健康对照31例、脐带血供体3例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 776 | 2026-04-17 |
CSF1R inhibitors mitigate CDK4/6 inhibitor-induced immunosuppression to increase antitumor immunity in HR+/HER2- breast cancer
2026-Apr-15, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-026-03786-w
PMID:41986650
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研究论文 | 本研究揭示了CDK4/6抑制剂帕博西尼在HR+/HER2-乳腺癌中通过诱导成纤维细胞衰老促进M2样巨噬细胞极化,从而产生免疫抑制微环境,并证明CSF1R抑制剂培西达替尼可逆转此效应并增强抗肿瘤免疫 | 首次发现CDK4/6抑制剂通过诱导成纤维细胞衰老导致IGF1/FGF7分泌,进而驱动STAT3磷酸化依赖的M2样巨噬细胞极化及精氨酸耗竭的免疫抑制新机制 | 研究主要基于临床前模型(类器官、单细胞测序、共培养),尚未在临床试验中验证联合治疗策略的疗效与安全性 | 探究CDK4/6抑制剂在HR+/HER2-乳腺癌中诱导的免疫抑制机制,并开发逆转该效应的联合治疗策略 | HR+/HER2-乳腺癌细胞、肿瘤相关成纤维细胞、巨噬细胞、淋巴细胞及患者来源的肿瘤类器官 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 多重免疫组化、药物测试、单细胞测序、原代细胞共培养 | NA | 图像数据、测序数据、体外实验数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及患者来源的HR+/HER2-乳腺癌类器官及原代细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 777 | 2026-04-17 |
Benchmarking component choices for unpaired single cell RNA and epigenomic integration
2026-Apr-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04071-5
PMID:41987329
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研究论文 | 本文系统评估了未配对单细胞RNA与表观基因组数据整合流程中的组件选择,利用配对数据集进行基准测试 | 首次利用配对scRNA-seq与scATAC-seq/ChIP-seq数据系统评估未配对多组学整合流程,明确了各步骤(特征关联、降维、聚类)的最佳选择 | 研究主要基于特定配对数据集,可能未涵盖所有多组学技术或生物场景 | 建立稳健的未配对单细胞RNA与表观基因组数据整合通用流程 | 单细胞多组学数据(scRNA-seq、scATAC-seq、ChIP-seq) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、ChIP测序 | 最优传输(OT) | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 778 | 2026-04-17 |
Mast cell homeostasis depends on KIT ligand from dermal fibroblasts and perivascular cells in mouse skin
2026-Apr-13, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.03.029
PMID:41985710
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研究论文 | 本研究通过免疫荧光分析和单细胞RNA测序,揭示了小鼠皮肤中维持肥大细胞稳态的关键KIT配体来源细胞 | 首次系统性地通过六种条件性Kitl敲除小鼠模型,明确了皮肤中成纤维细胞和血管周围细胞(而非角质形成细胞)是维持肥大细胞稳态的关键KIT配体来源 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类皮肤中进行验证;且仅关注稳态皮肤,未涉及炎症或疾病状态 | 探究皮肤中哪些细胞类型通过表达KIT配体来维持肥大细胞的体内稳态 | 小鼠耳部皮肤中的肥大细胞及其微环境细胞 | 免疫学 | NA | 免疫荧光分析,单细胞RNA测序 | NA | 图像数据,基因表达数据 | 使用六种条件性Kitl敲除小鼠模型进行研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 779 | 2026-04-17 |
EpCAM supports exit from pluripotency of embryonic stem cells via Eomes
2026-Apr-11, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08734-w
PMID:41963283
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研究论文 | 本研究揭示了EpCAM通过调控Eomes表达,在胚胎干细胞退出多能性并分化为心肌细胞过程中的关键作用 | 首次发现EpCAM通过Wnt信号通路调控Eomes表达,从而介导胚胎干细胞退出多能性,这一机制在自发性分化过程中至关重要 | 研究主要基于小鼠胚胎干细胞模型和体外胚胎体分化系统,尚未在完整体内胚胎发育过程中验证 | 探究EpCAM在胚胎干细胞退出多能性及心肌细胞分化过程中的分子机制 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs)及其在胚胎体中的自发分化过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq)、转录组分析、基因敲除、条件性基因再表达 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 野生型和Epcam敲除型小鼠胚胎干细胞在不同分化时间点的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 780 | 2026-04-17 |
Integration of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Analyses in Biomedicine
2026-Apr-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27073334
PMID:41977508
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综述 | 本文综述了在生物医学中整合Bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据分析的概念、方法基础、互补优势与局限性,并概述了主要的整合策略和工具 | 强调通过整合Bulk RNA-seq和scRNA-seq数据,利用scRNA-seq衍生的细胞类型图谱作为参考矩阵进行Bulk数据的计算重建(解卷积),以克服各自的技术限制,并概述了包括基于参考的解卷积、伪批量聚合和贝叶斯联合建模在内的主要整合策略 | 本文是一篇综述,未涉及原始实验数据或具体应用案例,主要基于现有文献进行总结,可能未涵盖所有最新进展 | 探讨在生物医学研究中整合Bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据分析的方法与策略,以提升转录组分析的解析度和准确性 | Bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据及其在生物医学研究中的应用 | 生物信息学 | NA | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |