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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2026-04-21 |
STAPLE: automating spatial transcriptomics analysis and AI interpretation
2026-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.30.715127
PMID:41959373
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研究论文 | STAPLE是一个自动化空间转录组学分析和AI解释的模块化框架 | 将细胞分型、邻域分析和细胞间通讯等分散工具系统化整合,并引入AI驱动的报告层以合成生物学发现摘要 | NA | 自动化空间转录组学分析流程,提高可扩展性、解释性和可重复性 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | AI(未指定具体模型) | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 722 | 2026-04-21 |
The Mechanism of Gut Microbiota in Breast Cancer Based on the Bulk Transcriptome, Mendelian Randomization Analysis and Single Cell RNA Sequencing
2026-Apr, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.70284
PMID:41960682
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研究论文 | 本研究通过整合批量转录组、孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序,揭示了肠道微生物群在乳腺癌发病机制中的作用机制 | 首次将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序结合,重新定义乳腺癌为微生物群调控的网络,并识别出MCM6/NR3C1生物标志物对用于早期诊断 | 研究依赖于公共数据集,可能受样本异质性和数据质量限制,且机制验证主要在生物信息学层面,缺乏实验验证 | 阐明肠道微生物群在乳腺癌发病中的具体机制,并寻找早期诊断生物标志物 | 乳腺癌患者与对照样本的转录组数据、肠道微生物群全基因组关联研究数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 批量转录组测序、孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、基因集富集分析、免疫浸润分析、药物筛选与分子对接 | 机器学习 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 公共乳腺癌/对照样本数据,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 723 | 2026-04-21 |
Single-Cell Profiling Reveals RAB13+ Endothelial Cells and Profibrotic Mesenchymal Cells in Aged Human Bone Marrow
2026-Apr, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70475
PMID:41954292
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类骨髓中内皮细胞和间充质基质细胞在衰老过程中的转录变化,识别了RAB13+内皮细胞和促纤维化间充质细胞等新型细胞亚群 | 首次在衰老个体中识别出表达RAB13的新型动脉内皮细胞亚群,并揭示了THY1促纤维化间充质细胞在衰老相关基质重塑中的作用 | 研究主要基于转录组数据,功能验证和机制探索有待进一步深入 | 探究人类骨髓微环境在衰老过程中的分子和细胞变化 | 人类骨髓中的内皮细胞和间充质基质细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光成像, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 来自年轻和年老个体的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 724 | 2026-04-21 |
Comparative transcriptomics reveals differences in cortical cell type organization between metatherian and eutherian mammals
2026-Apr, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgag055
PMID:42005962
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研究论文 | 本研究通过比较转录组学分析,揭示了有袋类与真兽类哺乳动物在皮层细胞类型组织上的差异 | 首次在哺乳动物早期分化物种间比较皮层柱的细胞类型特异性组织,结合单核RNA测序和空间转录组学技术 | 研究仅关注初级视觉皮层(V1),可能无法完全代表整个新皮层的组织差异 | 比较有袋类和真兽类哺乳动物在皮层细胞类型组织和层状结构上的差异 | 有袋类和真兽类哺乳动物的初级视觉皮层(V1) | 转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 725 | 2026-04-20 |
A multifunctional ICAM1-directed MnO₂@ZIF8 nanoplatform with Tanshinone IIA synergistically reverses senescence and restores alveolar regeneration in septic lung injury
2026-Apr-18, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04362-w
PMID:42001182
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向ICAM1的多功能MnO₂@ZIF8纳米平台,用于协同递送丹参酮IIA,以逆转脓毒症肺损伤中的细胞衰老并促进肺泡再生 | 首次构建了一种集选择性靶向、氧化还原调节和衰老重编程于一体的多功能纳米平台,通过单细胞RNA测序揭示了其重塑肺泡II型上皮细胞分化轨迹和抑制衰老相关转录特征的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,其临床转化效果仍需进一步验证;纳米平台的长期生物安全性和体内代谢清除途径尚未完全阐明 | 开发一种能够逆转脓毒症诱导的急性肺损伤中细胞衰老并促进肺泡再生的纳米治疗策略 | 脓毒症诱导的急性肺损伤小鼠模型及其肺泡II型上皮细胞 | 纳米生物技术 | 脓毒症肺损伤 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | CLP诱导的脓毒症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 726 | 2026-04-20 |
Human hypofunctional NCF1 variant aggravates salivary gland immunopathology in Sjögren's disease by promoting switched memory B-cell recruitment and long-lived plasma cell differentiation
2026-Apr-17, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.03.026
PMID:42000201
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研究论文 | 本研究评估了低功能NCF1-p.R90H变异体在干燥综合征中的作用,发现其通过驱动转换记忆B细胞迁移和IgG+浆细胞分化,增加严重SSA+干燥综合征的风险 | 首次系统评估NCF1-p.R90H变异在干燥综合征中的作用,揭示了该变异通过影响B细胞亚群和浆细胞分化导致疾病严重化的新机制,并发现其可作为B细胞靶向治疗疗效的预测生物标志物 | 研究主要基于观察性队列和回顾性分析,需要进一步的前瞻性研究和机制验证 | 评估NCF1-p.R90H变异在干燥综合征发病机制和疾病严重性中的作用 | 干燥综合征患者的外周血单个核细胞和唇腺组织 | 免疫学 | 干燥综合征 | 飞行时间质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,临床数据 | 多个病例对照队列中的干燥综合征患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 727 | 2026-04-20 |
Identification of a Novel Mitochondrial-Related Gene Signature for BMSCs in Osteoporosis Combining Single-Cell and Bulk Transcriptome Data
2026-Apr, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11099-y
PMID:40221950
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,识别了骨质疏松症患者骨髓间充质干细胞中与线粒体相关的新型基因特征 | 结合单细胞RNA测序和批量转录组数据分析,首次在骨质疏松症BMSCs中鉴定出线粒体相关基因特征,并发现DUT作为关键调控因子 | 研究主要基于公共数据集GSE147287和GSE35956,样本来源和数量可能有限,且功能验证主要在细胞水平进行 | 旨在识别骨质疏松症患者骨髓间充质干细胞中线粒体相关基因特征,探索其在疾病发展中的作用 | 健康个体和骨质疏松症患者的骨髓间充质干细胞 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光, 电子显微镜扫描 | LASSO逻辑回归, 随机森林 | 转录组数据 | 基于公共数据集GSE147287(单细胞)和GSE35956(批量),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 728 | 2026-04-20 |
Single-Cell RNA Sequencing of Human Lung Tissues Reveals Metallothionein-Positive T Cells as a Novel Potential Marker of Susceptibility to Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509332
PMID:41684305
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,在人类肺组织中鉴定出一种新的T细胞亚群(MT-high T细胞),并发现其频率与慢性阻塞性肺疾病(COPD)的进展和易感性相关 | 首次在人类肺组织中通过单细胞RNA测序鉴定出以高表达金属硫蛋白基因为特征的新型T细胞亚群(MT-high T细胞),并揭示其在COPD进展中的动态变化及其作为疾病易感性生物标志物的潜力 | NA | 识别COPD的高风险人群生物标志物并探索疾病发病机制 | 人类肺组织及外周血样本 | 单细胞组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 来自从不吸烟的健康对照、COPD前期患者和COPD患者的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 729 | 2026-04-20 |
Eosinophilic Biliary Cystic Neoplasm of the Liver: A Case Report of an Unrecognized Subtype of Intrahepatic Biliary Neoplasm
2026-Apr, Pathology international
IF:2.5Q2
DOI:10.1111/pin.70114
PMID:41992682
|
病例报告 | 本文报告了一例肝脏嗜酸性胆管囊性肿瘤,这是一种先前未被识别的肝内胆管肿瘤亚型 | 描述了一种新的肝内胆管囊性肿瘤亚型,并通过单细胞空间转录组学等技术揭示了其与胆管系统的关联及KRAS突变特征 | 仅为一例个案报告,样本量小,需要更多病例验证 | 描述并定义一种新的肝脏肿瘤亚型 | 一名54岁日本女性的肝内多囊性肿瘤 | 数字病理学 | 肝脏肿瘤 | 全外显子组测序,RNA测序,单细胞空间转录组学,免疫组织化学 | NA | 基因组数据,转录组数据,空间转录组数据,组织学图像 | 1例患者肿瘤样本 | NA | 单细胞空间转录组学,全外显子组测序,RNA测序 | NA | NA |
| 730 | 2026-04-20 |
Rexinoid NEt-3IB Promotes Resident Macrophage Gene Expression and Mitigates Desiccation-Induced Ocular Surface Disease
2026-Apr-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.4.31
PMID:41979250
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研究论文 | 本研究评估了类视黄醇NEt-3IB对干燥应激诱导的干眼症的影响,以及其对单核细胞/巨噬细胞基因表达和细胞轨迹的调节作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析NEt-3IB对结膜免疫细胞基因表达的影响,并揭示其通过促进驻留巨噬细胞相关基因表达来缓解干眼症的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类临床试验;治疗时间较短(5天),长期效果未知 | 评估NEt-3IB对干燥应激诱导的干眼症的治疗效果及其对免疫细胞基因表达的调控机制 | 小鼠眼部组织、结膜免疫细胞(单核细胞/巨噬细胞)、培养的单核细胞 | 单细胞转录组学 | 干眼症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫荧光染色、细胞轨迹分析 | scVelo、Monocle 3 | 单细胞转录组数据、图像数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠模型和培养细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 731 | 2026-04-19 |
Spatial Mapping of the Precancer-to-Cancer Transition in Breast and Prostate
2026-Apr-17, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-26-0012
PMID:41997105
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研究论文 | 本研究通过空间映射技术揭示了乳腺癌和前列腺癌从癌前病变向侵袭性癌症过渡的基因表达特征和结构变化 | 开发了一种整合体积重建与空间转录组学的多模态连续切片工作流程,首次在完整肿瘤中识别出癌前与侵袭区域之间的过渡连接 | 研究样本量相对有限(51个病例),且主要关注特定癌症类型,可能无法完全代表所有癌症亚型 | 探索乳腺癌和前列腺癌从癌前状态向侵袭性癌症转变的分子和空间特征 | 乳腺癌和前列腺癌组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌,前列腺癌 | 光片显微镜,空间转录组学 | NA | 图像,空间转录组数据 | 51个病例的319个空间分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 732 | 2026-04-19 |
A Method for Imputing scRNA-seq Data Based on Mobile Graph Convolutional Generative Adversarial Networks
2026-Apr-17, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-026-11380-8
PMID:41998476
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 733 | 2026-04-19 |
An opposing molecular gradient axis underlies primate cortical organization
2026-Apr-16, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aea2673
PMID:41990166
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学、磁共振成像和逆行标记技术,在狨猴中识别出两个相反方向的分子梯度,揭示了灵长类大脑皮层组织的基本原理 | 首次在灵长类动物中识别出两个相反方向的分子梯度,这些梯度在出生后细化,并连接了皮层扩张的冲突假说,同时揭示了跨物种的分子相似性和功能连接差异 | 研究主要基于狨猴模型,虽然与人类进行了比较,但物种间差异可能影响结果的普适性;技术整合的复杂性可能引入偏差 | 探索灵长类大脑皮层细胞多样性和连接性的组织原则 | 狨猴、人类和猕猴的大脑皮层组织 | 神经科学 | NA | 空间转录组学、磁共振成像、逆行标记 | NA | 空间转录组数据、磁共振图像、逆行标记数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 734 | 2026-04-19 |
Multi-omic profiling reveals pericyte and smooth muscle cell contributions to CADASIL pathology in cell-specific Notch3 mutant mice
2026-Apr-16, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117285
PMID:41996236
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研究论文 | 本研究通过构建平滑肌细胞和血管周细胞特异性Notch3突变小鼠模型,揭示了两种细胞在CADASIL病理中的不同贡献 | 首次构建了细胞类型特异性的CADASIL小鼠模型,并发现平滑肌细胞和血管周细胞通过不同的分子机制(代谢通路失调 vs 免疫信号)导致神经血管病变 | 研究基于小鼠模型,与人类疾病可能存在差异;单细胞RNA-seq数据仅为关联性分析 | 探究CADASIL疾病中不同血管壁细胞(平滑肌细胞和血管周细胞)的特异性病理贡献机制 | 携带CADASIL致病性Notch3突变的条件性基因敲入小鼠模型 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 条件性基因敲入、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 两种特异性Notch3突变小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 735 | 2026-04-19 |
Optineurin modulates mTORC2/AKT/STAT3 signaling to control MHC class II expression and adaptive immunity against HSV-1
2026-Apr-16, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117263
PMID:41996245
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研究论文 | 本文揭示了optineurin(OPTN)通过稳定RICTOR调控mTORC2/AKT/STAT3信号通路,从而增强树突状细胞中MHC II类分子表面表达,以改善针对HSV-1的适应性免疫反应 | 发现OPTN作为自噬受体,意外地通过稳定RICTOR调控mTORC2/AKT/STAT3信号通路,这是先前未知的功能,为疫苗开发和免疫调节提供了新靶点 | 未明确提及具体实验样本量或技术平台的详细配置,可能限制结果的普遍性 | 研究OPTN在调控MHC II类分子表达和适应性免疫中的作用,以改善针对HSV-1的疫苗策略和免疫反应 | 树突状细胞、转基因小鼠模型、HSV-1感染 | 免疫学 | HSV-1感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 736 | 2026-04-19 |
Transmembrane TNF-α signalling of macrophages drives pathological osteogenesis in radiographic axial spondyloarthritis
2026-Apr-16, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.03.023
PMID:41997803
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研究论文 | 本研究揭示了在影像学中轴型脊柱关节炎中,巨噬细胞通过sTNFR1-tmTNF-PSMA1-NF-κB反向信号轴驱动病理性骨形成的分子机制 | 发现了一种新的反向信号轴,其中可溶性TNFR1与跨膜TNF结合,诱导其胞内结构域与蛋白酶体亚基PSMA1相互作用,从而激活IKKβ/NF-κB通路,上调TGF-β3和BMP2,驱动巨噬细胞介导的骨形成 | 研究主要基于转基因小鼠模型,人类临床样本验证有限 | 阐明影像学中轴型脊柱关节炎中炎症与病理性骨形成解耦的分子机制 | 巨噬细胞、跨膜TNF信号通路、骨形成过程 | 分子生物学与免疫学 | 脊柱关节炎 | 单细胞RNA测序、基因敲除、巨噬细胞耗竭、纳米颗粒递送系统 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据、细胞测序数据 | 转基因小鼠模型及相关实验样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 737 | 2026-04-19 |
Non-enzymatic Rnaseh2c orchestrates proliferating macrophage-driven immunosuppression and HCC progression via Cdk9 proliferation axis and CCL2/CCR2-mediated CD8+ Tex infiltration: a novel therapeutic paradigm with "Rnaseh2c-In1" inhibitor
2026-Apr-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-014993
PMID:41986071
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研究论文 | 本研究揭示了非酶活性蛋白Rnaseh2c通过调控增殖性巨噬细胞驱动肝细胞癌免疫抑制和进展的新机制,并开发了靶向抑制剂Rnaseh2c-In1 | 首次发现Rnaseh2c作为非酶活性调节因子,通过结合细胞周期蛋白依赖性激酶启动子驱动巨噬细胞增殖,同时通过CCL2/CCR2轴促进CD8+耗竭T细胞浸润,并开发了首个特异性抑制剂Rnaseh2c-In1 | 研究主要基于临床前模型,尚未进行人体临床试验验证 | 阐明增殖性巨噬细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中的功能作用及靶向治疗策略 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的增殖性巨噬细胞、CD8+耗竭T细胞、肝细胞 | 单细胞组学与肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、CUT&Tag、批量RNA测序、多参数免疫荧光、流式细胞术、分子动力学模拟 | NA | 单细胞转录组数据、表观基因组数据、批量转录组数据、图像数据、流式数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq、ATAC-seq(通过CUT&Tag技术)、批量RNA-seq | NA | NA |
| 738 | 2026-04-19 |
Stem-like PD-1+TCF-1+ CD8+ T cells result from helpless priming and rely on CD4+ T-cell help to complete their cytotoxic effector differentiation
2026-Apr-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014041
PMID:41974457
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研究论文 | 本研究探讨了CD4+ T细胞辅助在干细胞样PD-1+TCF-1+ CD8+ T细胞分化中的作用,揭示了其在癌症和慢性感染中的分化轨迹 | 揭示了干细胞样CD8+ T细胞是无助激活的细胞,位于CD8+ T细胞效应和耗竭轨迹的分叉点,并阐明了CD4+ T细胞辅助对其分化的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类系统中的适用性需要进一步验证 | 阐明CD4+ T细胞辅助对干细胞样CD8+ T细胞分化命运的影响 | 小鼠模型中的干细胞样PD-1+TCF-1+ CD8+ T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 光谱流式细胞术、单细胞RNA测序、生物信息学分析 | NA | 流式细胞数据、单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 739 | 2026-04-19 |
RNA helicase SKIV2L impedes tumor immunity by reprogramming arginine metabolism of hepatocellular carcinomas
2026-Apr-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014192
PMID:41956538
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研究论文 | 本研究揭示了RNA解旋酶SKIV2L通过调控精氨酸代谢促进肝细胞癌免疫逃逸的机制 | 首次发现SKIV2L作为c-Myc转录靶点,通过招募GNL3稳定精氨酸代谢相关mRNA,驱动肿瘤免疫抑制微环境形成 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化仍需进一步验证 | 阐明肝细胞癌免疫抑制微环境的分子机制,寻找免疫治疗新靶点 | 肝细胞癌肿瘤微环境、SKIV2L基因功能、精氨酸代谢通路 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、RNA免疫沉淀测序、免疫沉淀-质谱分析、邻近连接实验、流式细胞术 | NA | RNA测序数据、质谱数据、流式细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 740 | 2026-04-19 |
Metabolically reprogrammed eosinophils impair T cell immunity and cause chronic skin infection
2026-Apr, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00392-x
PMID:41813911
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了在慢性皮肤炎症中,代谢重编程的嗜酸性粒细胞通过竞争性葡萄糖摄取抑制Th1细胞功能,从而促进疾病慢性化 | 首次在非肠道组织中发现了具有代谢重编程特性的炎症性嗜酸性粒细胞亚群,并阐明其通过形成竞争性代谢微环境抑制T细胞免疫的新机制 | 研究基于小鼠模型,在人体中的验证尚需进一步研究;单细胞转录组分析仅揭示了转录水平的变化,蛋白质功能验证不足 | 探究皮肤嗜酸性粒细胞在慢性皮肤感染中的功能和转录异质性 | C57BL/6小鼠模型中的皮肤嗜酸性粒细胞和T细胞 | 免疫学 | 皮肤感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |