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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2026-04-23 |
Molecular signatures of cell diversity modulated by long noncoding RNAs in the human fetal spinal cord
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115399
PMID:42006319
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,探索了人类胎儿脊髓中神经干细胞谱系、运动神经元和胶质细胞的分子特征及长链非编码RNA的表达模式 | 结合scRNA-seq和scStereo RNA-seq技术,首次在人类胎儿脊髓中系统解析了长链非编码RNA与邻近编码基因的空间共表达网络及其在细胞多样性调控中的作用 | 研究仅覆盖妊娠8至12周的胎儿样本,未涉及更早或更晚发育阶段,且样本量有限 | 揭示人类胎儿脊髓中细胞多样性的分子调控机制,特别是长链非编码RNA在神经发育中的功能 | 人类胎儿脊髓组织中的神经干细胞、运动神经元、星形胶质细胞和少突胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间表达数据 | 妊娠8至12周的人类胎儿脊髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞Stereo RNA-seq | NA | NA |
| 722 | 2026-04-23 |
Transcriptional noise sets fundamental limits to decoding circadian clock phase from single-cell RNA snapshots
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115394
PMID:42006364
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研究论文 | 本研究探讨了从单细胞RNA快照解码生物钟相位的根本限制,发现转录噪声限制了单细胞水平的相位估计精度 | 结合多重smFISH技术和基于高斯过程的算法,首次量化了核心生物钟基因的转录噪声对单细胞相位估计的影响,并提出了通过平均多个细胞数据来克服噪声的方法 | 研究主要基于小鼠成纤维细胞,结论在其他细胞类型或生物体中的普适性有待验证;单细胞RNA-seq数据中非核心基因的噪声问题尚未完全解决 | 评估从单细胞RNA测量中准确推断生物钟相位的可行性,并探索克服转录噪声的策略 | 小鼠成纤维细胞中的核心生物钟基因(如Per1, Per2, Cry1, Cry2, Bmal1, Rev-erbα) | 单细胞转录组学 | NA | 多重smFISH(单分子荧光原位杂交),单细胞RNA-seq | 基于高斯过程的算法 | 图像(smFISH),RNA序列数据 | 涉及超过70个小鼠成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 723 | 2026-04-23 |
Impaired insulin signaling limits osteogenic potential of bone marrow stromal cells in type 2 diabetes
2026-Apr-06, European journal of endocrinology
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/ejendo/lvag063
PMID:41985043
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研究论文 | 本研究探讨了2型糖尿病患者骨髓基质细胞中胰岛素信号受损如何限制其成骨潜能 | 首次在人类骨髓基质细胞中证明2型糖尿病导致胰岛素信号通路受损,并发现其与成骨分化能力下降及体内骨形成率降低直接相关 | 样本量较小(16例患者),且仅使用骨髓基质细胞进行研究,未涉及其他骨细胞类型 | 探究2型糖尿病患者骨髓基质细胞胰岛素信号通路异常与骨形成受损之间的关联 | 人类骨髓基质细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、定量磷酸化蛋白质组学 | NA | RNA测序数据、蛋白质组学数据 | 16例长期2型糖尿病患者(男女均有)及年龄性别匹配的健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 724 | 2026-04-23 |
NK cells undergo transcriptional and functional reprogramming following Streptococcus pneumoniae infection
2026-Apr, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.11.012
PMID:41320160
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了自然杀伤细胞在肺炎链球菌感染后的转录和功能重编程过程 | 首次在细菌感染背景下系统揭示了NK细胞的转录重编程和记忆反应机制,并识别了特定的记忆NK细胞亚群 | 研究主要关注肺炎链球菌感染模型,其他细菌感染的普适性尚需验证 | 探究NK细胞在细菌感染中的记忆形成机制和功能特性 | 自然杀伤细胞在肺炎链球菌感染后的转录组和功能变化 | 单细胞转录组学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 725 | 2026-04-23 |
A trispecific antibody engaging T cells with tumour and myeloid cells augments antitumour immunity
2026-Apr, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01569-4
PMID:41372583
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向B7H3、CD3和PDL1的三特异性抗体,用于重定向旁观者T细胞并克服免疫抑制微环境,以增强实体瘤的抗肿瘤免疫 | 首次设计并验证了一种同时靶向肿瘤抗原(B7H3)、T细胞(CD3)和免疫检查点(PDL1)的三特异性抗体,能够重定向非肿瘤特异性(旁观者)T细胞并解除免疫抑制 | 研究主要基于体外和动物模型验证,临床疗效和安全性仍需进一步临床试验证实 | 开发一种新型免疫疗法,以克服免疫检查点抑制剂在免疫无应答肿瘤中的耐药性 | 实体瘤(特别是卵巢癌和结直肠癌)中的旁观者T细胞和免疫抑制微环境 | 机器学习 | 卵巢癌, 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据, 细胞毒性数据 | 来自17种肿瘤类型的300名患者的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 726 | 2026-04-23 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the association between ketone body synthesis and morphogenic profile of intestinal epithelia in neonatal mice
2026-Apr, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.12.005
PMID:41478463
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了新生小鼠肠道上皮细胞中酮体合成与细胞形态发生特征之间的关联 | 首次在新生小鼠肠道上皮细胞中发现了酮体合成基因的上调与细胞形态发生基因高表达之间的相关性,而非主要作为能量来源 | 研究仅关注了10天和21天两个时间点的小鼠,未涵盖更广泛的发育阶段;且仅分析了特定病原体无菌和普通条件下的样本,可能未完全反映真实肠道环境 | 探究新生儿期肠道上皮细胞的早期生命特征及其成熟过程 | 新生(10天)和幼年(21天)小鼠的肠道上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 新生和幼年小鼠的肠道上皮细胞,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 727 | 2026-04-23 |
Integrated human and mouse single-cell profiling reveals immune-stromal niche driving silicosis
2026-Apr, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2026.01.003
PMID:41520918
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研究论文 | 本研究通过整合人类和小鼠的单细胞RNA测序数据,揭示了驱动矽肺病的免疫-基质微环境的关键细胞亚群及其相互作用 | 开发了使用微型支气管镜的位点特异性矽肺小鼠模型,并结合单细胞测序与细胞间通讯模型,首次系统性地揭示了CCL2-hi单核样巨噬细胞(MLM)亚群的分化轨迹及其与基质细胞(如Sfrp1-hi/Spp1-hi成纤维细胞)的互作网络 | 研究主要基于全肺灌洗液样本,可能无法完全代表肺组织原位微环境;小鼠模型虽具位点特异性,但与人类疾病进程的完全对应仍需进一步验证 | 阐明矽肺病中巨噬细胞与基质细胞相互作用的分子机制,以识别可干预的免疫-基质轴靶点 | 矽肺病患者(人类)和矽肺病小鼠模型的肺组织免疫与基质细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化/矽肺病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞间通讯建模 | 细胞间通讯网络模型 | 单细胞转录组数据 | 人类矽肺病患者全肺灌洗液样本及矽肺病小鼠模型样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 728 | 2026-04-23 |
CellVoyager: AI CompBio agent generates new insights by autonomously analyzing biological data
2026-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03029-6
PMID:41845065
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研究论文 | 本文介绍了CellVoyager,一个基于大语言模型的AI代理,能够自主生成并执行单细胞RNA测序分析,以加速计算生物学研究 | 开发了首个能够自主生成并实施scRNA-seq分析的AI代理,在预测已发表研究分析方法方面优于GPT-4o和o3-mini,并能产生专家认可的新发现 | 仅评估于CellBench基准的76项研究,在更广泛数据集和生物学问题上的普适性有待验证 | 解决单细胞RNA测序数据分析耗时且需要专业知识的挑战,实现生物学假设空间的自主探索 | 单细胞RNA测序数据 | 计算生物学 | COVID-19, 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 单细胞RNA测序数据 | 基于76项已发表scRNA-seq研究的基准测试 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 729 | 2026-04-23 |
Immunosuppressive Microenvironment Reprogramming by Synergistic Sonodynamic Therapy of Phthalocyanine-MOF Hybrids for Hepatocellular Carcinoma
2026-Apr, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20250074
PMID:42016746
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研究论文 | 本研究介绍了一种新型酞菁-金属有机框架杂化材料(Pc@Zr-MOF),用于肝细胞癌的声动力治疗和免疫调节 | 开发了一种新型的酞菁-金属有机框架杂化材料(Pc@Zr-MOF),通过增强超声转换效率和协同作用,实现了直接杀伤肿瘤细胞与重塑免疫微环境的双重机制 | NA | 解决肝细胞癌治疗中因缺氧诱导的免疫抑制和耐药性导致的疗效有限问题,旨在重塑免疫抑制微环境并建立持久的抗肿瘤免疫 | 肝细胞癌 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 730 | 2026-04-22 |
Organelle symphony: Nuclear factor erythroid 2-related factor 2 and nuclear factor-kappa B in stroke pathobiology
2026-Apr-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01404
PMID:40146002
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综述 | 本文综述了核因子红细胞2相关因子2和核因子κB在缺血性和出血性中风病理生物学中的作用机制,重点关注它们在氧化应激、炎症和神经保护中的功能 | 强调了Nrf2和NF-κB在细胞器间相互作用中的潜在串扰,并指出单细胞测序和空间转录组学技术为理解中风发病机制和开发靶向治疗提供了新视角 | NA | 探讨Nrf2和NF-κB在中风病理生理学中的核心作用及其在氧化应激、炎症和神经保护中的机制 | 中风(包括缺血性中风和出血性中风)的病理生物学过程 | NA | 中风 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 731 | 2026-04-21 |
Therapy-induced remodeling of the tumor immune microenvironment: Mechanistic insights and implications for immunotherapy
2026-Apr-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000004035
PMID:41813658
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综述 | 本文综述了治疗诱导的肿瘤免疫微环境重塑,阐明了其机制及对免疫治疗的影响,并讨论了治疗优化的潜在策略 | 利用单细胞测序、空间转录组学等新兴高分辨率技术,前所未有地揭示了治疗方式与肿瘤免疫微环境之间的动态相互作用及关键的继发性微环境变化 | 作为一篇综述文章,主要总结现有研究,不包含原始实验数据,其讨论基于已发表文献 | 总结治疗诱导的肿瘤免疫微环境重塑,阐明其调节免疫治疗反应的机制,并讨论治疗优化的潜在策略 | 肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 732 | 2026-04-21 |
Biomimetic Bamboo-Inspired Bone Repair Scaffold: Reversing Degraded States and Promoting Mesenchymal Stem Cell Differentiation
2026-Apr-20, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.6c00387
PMID:41915781
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研究论文 | 本研究报道了一种受竹子和骨小梁启发的多功能骨修复支架,旨在通过上调Slc25a33和Crabp1来逆转骨质疏松条件下骨髓间充质干细胞的衰老表型,从而促进骨再生 | 设计了一种结合聚乳酸纳米取向纤维和I型胶原的仿生多孔支架,其独特的纺锤形孔道结构模拟了骨小梁的管腔陷窝,能够持续提供I型胶原并上调关键线粒体生物合成和视黄酸信号通路基因 | 研究主要在老年骨质疏松大鼠模型中进行,尚未在更大型动物或人体中进行验证 | 开发一种能够逆转骨髓间充质干细胞衰老、促进骨质疏松性骨缺损修复的生物材料 | 衰老的骨髓间充质干细胞和15月龄的骨质疏松大鼠 | 组织工程与再生医学 | 骨质疏松症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据、组织形态学数据 | 老年骨质疏松大鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 733 | 2026-04-21 |
Time-resolved single-cell transcriptomics maps zebrafish heart development
2026-Apr-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117249
PMID:42001417
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研究论文 | 本研究通过时间分辨的单细胞转录组学技术,绘制了斑马鱼心脏从早期到晚期发育过程的细胞图谱 | 首次对斑马鱼心脏从25小时到60天受精后十个发育阶段进行全面的单细胞RNA测序分析,揭示了心肌细胞在14天受精后的额外增殖高峰,并发现了新的心肌细胞亚型标记基因 | 研究仅基于斑马鱼模型,结果向其他脊椎动物的直接推广需谨慎;单细胞测序技术可能无法完全捕获所有低丰度转录本 | 全面解析斑马鱼心脏发育过程中的细胞类型动态变化和分子机制 | 斑马鱼心脏细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过34,000个细胞,涵盖10个发育阶段(25小时至60天受精后) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 734 | 2026-04-21 |
UHRF1-mediated DNA 5-mC modification drives super-enhancer redistribution and impedes osteogenesis via TGM2-regulated autophagic flux in senile osteoporosis
2026-Apr-17, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.04.042
PMID:42002028
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研究论文 | 本研究揭示了UHRF1介导的DNA 5-mC修饰通过调控超增强子重分布和TGM2调节的自噬流,从而阻碍间充质干细胞成骨分化,导致老年性骨质疏松的机制 | 首次揭示了DNA 5-mC修饰、超增强子景观和自噬流在MSC成骨过程中的相互作用,并明确了UHRF1缺陷在SOP中的核心作用 | 机制研究主要在体外细胞模型中进行,体内验证主要依赖小鼠模型,人类样本的直接验证可能有限 | 探究老年性骨质疏松中MSC成骨能力受损的内在机制,并寻找潜在治疗靶点 | 老年性骨质疏松患者的间充质干细胞、SOP小鼠模型 | 表观遗传学、骨生物学 | 老年性骨质疏松 | WGBS, CUT&Tag, scRNA-seq, bulk RNA-seq, 免疫共沉淀, 蛋白质印迹, 透射电镜, 免疫荧光 | NA | 基因组学数据、表观基因组学数据、转录组学数据、蛋白质数据、图像数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量,涉及SOP患者MSC和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组亚硫酸氢盐测序, 批量RNA测序, CUT&Tag | NA | NA |
| 735 | 2026-04-21 |
scRNA-seq based gene and cell dynamics behind the formation of the non-caseating granulomas
2026-Apr-16, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析,揭示了非干酪样肉芽肿形成的遗传和免疫学基础 | 首次通过单细胞RNA测序数据系统分析非干酪样肉芽肿的基因表达和细胞动态,识别了506个肉芽肿相关基因和10个关键的免疫信号通路 | 分析基于单细胞RNA测序驱动的计算机模拟,需要在更大、特征明确的队列中并通过独立实验方法进行验证 | 阐明非干酪样肉芽肿形成的分子机制 | 结节病和纹身葡萄膜炎患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 慢性肺部炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 健康对照、活动性结节病患者以及活动性和非活动性纹身葡萄膜炎患者的数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 736 | 2026-04-21 |
Neuroinflammation in Spinal Cord Injury: Cellular and Molecular Mechanisms
2026-Apr-16, Current neuropharmacology
IF:4.8Q1
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综述 | 本文综述了脊髓损伤后神经炎症的细胞与分子机制,重点关注不同阶段免疫反应的作用及单细胞和空间转录组学的新发现 | 超越传统的二元模型,利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示状态特异性和区域特异性的免疫程序,并识别致病性和修复性回路 | 需要未来研究优先验证体内因果免疫节点,并开发基于生物标志物、阶段特异性的免疫疗法 | 阐明脊髓损伤后神经炎症的细胞与分子机制,以支持精准免疫调节 | 脊髓损伤后的神经炎症过程,涉及小胶质细胞、浸润巨噬细胞、星形胶质细胞、中性粒细胞、树突状细胞以及T和B淋巴细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 737 | 2026-04-21 |
The impact of package selection and versioning on single-cell RNA-seq analysis
2026-Apr-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101560
PMID:41903535
|
研究论文 | 本文比较了单细胞RNA测序分析中两个主流软件包Seurat和Scanpy的算法差异及其对分析结果的影响 | 首次系统量化了Seurat和Scanpy在单细胞RNA-seq分析各步骤中的输出差异,并发现软件版本更新会显著影响差异表达分析结果 | 研究主要基于模拟和基准数据集,未全面评估所有分析参数组合或真实临床样本的适用性 | 评估单细胞RNA-seq分析软件包选择及版本控制对分析结果可重复性的影响 | 单细胞RNA测序数据分析流程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 738 | 2026-04-21 |
Multi-Omics Analysis Reveals DNASE1L3 in Hepatocellular Carcinoma Prognosis, Immune Microenvironment, and Immunotherapy Response
2026-Apr-14, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了DNASE1L3在肝细胞癌预后、免疫微环境和免疫治疗反应中的作用 | 首次通过整合转录组和蛋白质组数据集,结合WGCNA和Lasso回归分析,系统性地揭示了DNASE1L3在肝细胞癌中的临床诊断意义及其与免疫治疗反应性的关联 | 研究主要基于TCGA等公共数据库的回顾性分析,缺乏前瞻性临床队列验证,且DNASE1L3的具体分子机制尚未通过实验阐明 | 探究DNASE1L3在肝细胞癌中的表达特征、预后价值及其与免疫微环境和免疫治疗反应的关系 | 肝细胞癌患者样本及相关公共数据库数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、WGCNA、Lasso回归分析 | NA | 基因表达数据、临床数据 | 基于TCGA等公共数据库的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 739 | 2026-04-21 |
Revealing Metabolic Reprogramming Genes as Biomarkers of Rheumatoid Arthritis: A Bioinformatics Study Based on Ensemble Learning Approach and Single Cell RNA Sequencing
2026-Apr-13, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法,结合集成学习模型和单细胞RNA测序,系统研究了类风湿关节炎中代谢重编程与免疫失调的分子相互作用,并鉴定了新的诊断生物标志物和治疗靶点 | 首次系统整合代谢重编程基因集、机器学习模型和单细胞RNA测序数据,全面揭示RA中代谢与免疫的交互作用,并开发了高性能的集成诊断模型 | 研究主要基于生物信息学分析,临床样本验证规模较小(RA n=5;对照 n=6),且单细胞数据仅来自一名RA患者,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 系统研究类风湿关节炎中代谢重编程与免疫失调的分子相互作用,并鉴定诊断生物标志物和治疗靶点 | 类风湿关节炎患者和对照个体的基因表达数据,包括批量RNA测序数据集和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, qPCR | LASSO回归, XGBoost, 集成学习模型 | 基因表达数据 | 批量RNA-seq数据集:GSE93272(232 RA/43对照)和GSE110169(84 RA/77对照);单细胞RNA-seq数据集:GSE159117(1名RA患者);qPCR验证:RA患者5名,对照6名 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 740 | 2026-04-21 |
DestinyNet: A deep-learning framework for cell-fate analysis from lineage-tracing single-cell RNA sequencing data
2026-Apr-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2025.101471
PMID:42005385
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研究论文 | 本文介绍了一个名为DestinyNet的多任务深度学习框架,用于从谱系追踪单细胞RNA测序数据中进行细胞命运分析 | DestinyNet通过细胞关系三元组实现端到端的细胞表示学习,并能够处理静态、累积和动态条形码等多种LT-scSeq数据类型 | NA | 开发一个准确、稳健且可扩展的细胞命运分析框架,以解析细胞发育动态,包括谱系承诺、分化和疾病进展 | 谱系追踪单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |