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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2026-04-17 |
A palmitoylation-related prognostic risk scoring model and tumor microenvironment characterization in lung adenocarcinoma, using single-cell RNA sequencing data
2026-Apr-06, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,构建了与棕榈酰化相关的预后风险评分模型,并表征了肺腺癌的肿瘤微环境 | 首次在单细胞水平上揭示了棕榈酰化在肺腺癌中的细胞异质性,并整合多种机器学习算法构建了稳健的预后模型,同时鉴定出SEC61G作为潜在的治疗靶点 | 研究样本量相对有限,仅使用了10个LUAD样本的单细胞数据,且体外实验未观察到联合治疗的协同效应 | 探究棕榈酰化相关基因在肺腺癌中的表达模式、预后价值及其对肿瘤微环境和药物敏感性的影响 | 肺腺癌(LUAD)患者样本,包括TCGA-LUAD和GSE68465数据集中的批量RNA-seq数据,以及10个LUAD样本的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),实时定量PCR(RT-qPCR),体外细胞实验 | CoxBoost, SuperPC, 以及共10种机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据,基因表达数据 | 10个肺腺癌样本的单细胞RNA测序数据,以及TCGA-LUAD和GSE68465数据集中的批量样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 702 | 2026-04-17 |
The m6Am methyltransferase PCIF1 promotes osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells through stabilization of Wnt-related transcripts
2026-Apr, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003739
PMID:41941537
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研究论文 | 本文揭示了m6Am甲基转移酶PCIF1通过稳定Wnt相关转录本促进间充质干细胞成骨分化的机制 | 首次发现PCIF1作为m6Am甲基转移酶在骨量维持和间充质干细胞成骨分化中的关键作用,并阐明其通过调控Wnt通路基因的mRNA稳定性来影响骨形成 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;PCIF1在其他细胞类型(如骨髓细胞)中的具体作用未完全阐明 | 探究PCIF1介导的m6Am修饰在骨稳态和成骨分化中的调控功能 | 间充质干细胞(MSCs)和小鼠模型 | 表观遗传学 | 骨质疏松症 | GWAS, TWAS, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 703 | 2026-04-17 |
Tumor Core-Edge Divergence in T-Cell Exhaustion and Clonal Expansion in HPV-Related Cervical Squamous Cell Carcinoma Unveiled by Simultaneous Single-Cell RNA and TCR Sequencing
2026-Apr, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70912
PMID:41964419
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA和TCR测序揭示了HPV相关宫颈鳞状细胞癌中肿瘤核心与边缘区域T细胞耗竭和克隆扩增的差异 | 首次在HPV相关宫颈鳞状细胞癌中同时使用单细胞RNA和TCR测序,系统比较了肿瘤核心与边缘区域的T细胞状态,并识别出一个与压力相关的耗竭CD8 T细胞亚群 | 样本量相对较小(scRNA-seq n=13, scTCR-seq n=9),且主要聚焦于HPV相关宫颈鳞状细胞癌,其他癌症类型的验证依赖于公共数据集 | 探究肿瘤空间结构(核心与边缘)对T细胞耗竭状态和克隆性的影响,以寻找预后生物标志物和潜在治疗靶点 | HPV相关宫颈鳞状细胞癌患者的配对肿瘤核心与边缘组织样本中的T细胞 | 单细胞组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 批量RNA测序, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 批量转录组数据, 公共癌症基因组数据 | 13例患者的单细胞RNA测序样本, 9例患者的单细胞TCR测序样本, 41例患者的批量RNA测序数据, 以及来自TCGA和结直肠癌的公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 704 | 2026-04-17 |
A Conserved Fibroblast-Myeloid Gene Signature in Digestive Cancers: Multi-Omics Integration Identifies DCN, COL10A1, CTHRC1, and TREM2 as Candidate Microenvironmental Markers
2026-Apr-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27073208
PMID:41977392
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析,在七种消化系统癌症中鉴定出一个保守的四基因特征(DCN、COL10A1、CTHRC1、TREM2),该特征在基质相关癌症相关成纤维细胞和髓系细胞中富集,揭示了跨癌种的保守基质-髓系相互作用 | 首次在多种消化系统癌症中鉴定出保守的成纤维细胞-髓系基因特征,并系统揭示了其细胞来源、细胞间通讯网络及多组学关联 | 研究主要基于生物信息学分析,需要后续实验验证基因特征的功能机制和临床转化潜力 | 探究消化系统癌症肿瘤微环境中是否存在保守的基质-免疫相互作用 | 七种消化系统癌症的肿瘤微环境 | 生物信息学 | 消化系统癌症 | 单细胞RNA测序,多组学整合分析,细胞间通讯分析 | NA | 基因组数据,表观遗传数据,转录组数据 | 涉及七种消化系统癌症类型(具体样本数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |
| 705 | 2026-04-17 |
Neural signaling contributes to heart formation and growth in the invertebrate chordate, Ciona robusta
2026-Apr, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003715
PMID:41980010
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研究论文 | 本研究揭示了神经肽tachykinin与经典Wnt信号通路在调控海鞘Ciona robusta心肌祖细胞增殖中的作用 | 首次在海鞘模型中阐明了神经肽tachykinin与Wnt信号协同调控心肌祖细胞增殖的机制,并发现神经样细胞直接支配远端祖细胞 | 研究局限于无脊椎脊索动物模型,结果在脊椎动物中的普适性有待验证 | 探究神经信号在心脏发育和生长中的调控作用 | 海鞘Ciona robusta的心脏及其心肌祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),CRISPR-Cas9敲低 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年海鞘心脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 706 | 2026-04-17 |
Whole-embryo spatial transcriptomics
2026-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02591-1
PMID:41986568
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 707 | 2026-04-17 |
Spatiotemporal immune dynamics in lung cancer progression and treatment
2026-Apr, Breathe (Sheffield, England)
DOI:10.1183/20734735.0335-2025
PMID:41988086
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综述 | 本文整合空间和时间视角,提供了肺癌免疫生物学的统一视图,重点讨论了肿瘤微环境中免疫、基质和恶性细胞之间的时空动态相互作用 | 将空间组织与时间变化相结合,揭示肺癌免疫微环境的动态重塑过程,并强调新兴技术在连接时空过渡与免疫背景方面的潜力 | 作为综述文章,主要基于现有研究进行整合和讨论,未提供原始实验数据或具体模型验证 | 理解肺癌免疫微环境的时空动态,以促进分期特异性生物标志物发现、治疗优化和个性化策略 | 肺癌肿瘤微环境,特别是非小细胞肺癌(NSCLC)中的免疫、基质和恶性细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学、多重成像、功能测定 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 708 | 2026-04-15 |
Molecular Markers Distinguishing Early-Stage Mycosis Fungoides From Atopic Dermatitis Skin Lesions
2026-Apr, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70240
PMID:41888970
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,比较早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变的转录组特征,揭示了两者在免疫和基质细胞中的分子差异 | 首次在单细胞水平上系统比较早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎的转录组特征,识别了恶性T细胞、角质形成细胞、成纤维细胞和髓系细胞中的特异性分子标记 | 研究样本量可能有限,且仅聚焦于早期阶段,未涵盖疾病进展或治疗响应 | 区分早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变,以改善诊断和治疗 | 早期蕈样肉芽肿和特应性皮炎患者的皮肤病变样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 709 | 2026-04-15 |
Ubiquitin-specific protease 20(USP20) mitigates doxorubicin-induced cardiotoxicity by deubiquitinating and stabilizing HuR
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151642
PMID:41921794
|
研究论文 | 本研究揭示了泛素特异性蛋白酶20(USP20)通过去泛素化并稳定HuR蛋白,从而抑制铁死亡并减轻阿霉素诱导的心肌病 | 首次阐明了USP20在阿霉素诱导心肌病中的保护作用机制,并发现其通过去泛素化HuR来稳定GPX4 mRNA以抑制铁死亡 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床样本中得到验证 | 探究USP20在阿霉素诱导心肌病中的作用机制 | 心肌细胞、小鼠心脏组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、LC-MS/MS、免疫共沉淀 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 710 | 2026-04-15 |
Multi omics analysis reveals senescence associated genes in metabolic dysfunction associated steatohepatitis related liver cancer and their functional validation
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151713
PMID:41933769
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌(MRLC)中的衰老相关基因,并进行了功能验证 | 结合全球疾病负担数据库、孟德尔随机化、多机器学习方法和单细胞RNA测序,首次系统筛选并验证了MRLC中的核心衰老相关基因及其潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型,缺乏临床样本的直接验证 | 探索衰老相关基因在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌(MRLC)患者数据及C57BL/6小鼠模型 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、多机器学习方法、分子对接 | 机器学习模型(未指定具体类型)、动物模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、疾病负担数据 | 未明确指定人类样本数量,使用C57BL/6小鼠建立MRLC模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 711 | 2026-04-14 |
Chronic psychological stress disrupts liver homeostasis by dysregulating oxidative phosphorylation via the PI3K/AKT/FoxO3a axis
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115389
PMID:41971987
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研究论文 | 本研究通过慢性束缚应激小鼠模型,揭示了慢性心理应激通过PI3K/AKT/FoxO3a轴抑制氧化磷酸化,从而破坏肝脏稳态的机制 | 首次在单细胞水平上识别FoxO3a作为关键转录因子,介导心理应激诱导的氧化磷酸化抑制,并发现FoxO3a驱动的表观遗传沉默作用 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;机制细节如FoxO3a具体靶基因有待深入探索 | 探究慢性心理应激导致慢性肝病的分子机制 | 慢性束缚应激小鼠模型中的肝细胞,特别是门静脉周围肝细胞(区域1) | 单细胞组学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序,组织学分析,生化分析,电子显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织图像,生化指标 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 712 | 2026-04-14 |
SpaHE-Infil: A spatial heterogeneity framework for decoding TME infiltration from H&E-stained slides
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115155
PMID:41971992
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研究论文 | 开发了一个名为SpaHE-Infil的多模态计算框架,通过整合空间转录组学和全切片图像,从H&E染色切片中解码肿瘤微环境中的免疫细胞浸润 | 结合空间转录组学和全切片图像,利用随机森林模型提取形态、纹理和密度特征,动态校准临床样本中的免疫细胞比例偏差,实现高精度的空间细胞分布预测 | 未明确提及具体局限性,但可能依赖于图像质量和样本可用性 | 解码肿瘤微环境中免疫细胞的空间分布,以预测免疫治疗反应和患者生存 | 肿瘤微环境中的12种核心细胞类型,包括免疫细胞 | 数字病理学 | 多种癌症 | 空间转录组学,全切片图像分析 | 随机森林 | 图像,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 713 | 2026-04-14 |
PEPITEM Regulates the Synovial Microenvironment During Immune-Mediated Inflammatory Arthritis to Limit Disease
2026-Apr-13, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70108
PMID:41968960
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研究论文 | 本文研究了PEPITEM在早期、未治疗类风湿关节炎和银屑病关节炎中的状态及其在临床前模型中的治疗效果 | 揭示了PEPITEM通过抑制COX-2和NF-κB信号通路,改变关节内白细胞亚群组成,从而减轻关节炎严重性 | 研究主要基于临床前动物模型,尚未在人类患者中进行大规模临床试验验证 | 探究PEPITEM在免疫介导的炎症性关节炎中的调控作用及治疗潜力 | 类风湿关节炎和银屑病关节炎患者的外周血单核细胞,以及三种不同的炎症性关节炎动物模型 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术、Western blot、单细胞RNA测序、多重分析 | NA | 流式细胞数据、蛋白质印迹数据、单细胞RNA测序数据、组织学数据 | 临床疑似关节痛和疑似炎症性关节炎患者的外周血样本,以及三种动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 714 | 2026-04-14 |
CKAP4 Regulates ERS-Induced Apoptosis in Osteoclasts Through FOXO3 in Periodontitis
2026-Apr-13, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70208
PMID:41969105
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研究论文 | 本研究揭示了CKAP4通过FOXO3调控内质网应激诱导的破骨细胞凋亡在牙周炎中的作用机制 | 首次发现CKAP4在牙周炎破骨细胞凋亡中的调控作用,并阐明其通过FOXO3介导的内质网应激通路 | 研究主要基于动物模型和测序数据分析,临床样本验证相对有限 | 探究牙周炎中破骨细胞凋亡失调的分子机制 | 破骨细胞(Osteoclasts) | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | GEO数据库中的牙周炎患者组织样本数据及Ckap4基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 715 | 2026-04-14 |
Vorinostat Potentiates Chemoimmunotherapy in Immune-Enriched Pancreatic Cancer
2026-Apr-13, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521844
PMID:41969226
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶抑制剂伏立诺他(SAHA)在免疫富集型胰腺癌中增强化疗免疫疗法效果的机制 | 通过整合体外药物筛选和计算机敏感性预测,首次识别出SAHA作为IE-PDAC中化疗免疫疗法的有效增敏剂,并揭示了其通过抑制FASN和PARP9破坏肿瘤微环境中代谢陷阱的新机制 | 研究主要基于临床前模型(如患者来源的异种移植模型和类器官共培养),尚未进行大规模临床试验验证 | 探究免疫富集型胰腺癌(IE-PDAC)的潜在机制并寻找有效疗法 | 胰腺导管腺癌(PDAC),特别是免疫富集型亚型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),体外药物筛选,计算机敏感性预测,患者来源的异种移植模型 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 716 | 2026-04-14 |
Integrating Radiomics and Computational Pathology to Predict Early Recurrence of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and Uncover Its Biological Basis in Tumor Microenvironment
2026-Apr-13, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523985
PMID:41969272
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个整合放射组学和计算病理学的模型,用于预测胰腺导管腺癌的早期复发,并揭示了其与肿瘤微环境中细胞外基质重塑相关的生物学机制 | 首次整合放射组学和计算病理学特征构建预测模型,并结合单细胞RNA测序和空间转录组学验证了预测结果与肿瘤微环境中成纤维细胞和胰腺星状细胞富集以及细胞外基质通路失调的关联 | 研究为回顾性设计,样本量有限(225例患者),且模型在外部验证中的性能略有下降 | 预测胰腺导管腺癌根治性切除后的早期复发,并阐明其生物学基础 | 胰腺导管腺癌患者 | 计算病理学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习模型(11种) | CT图像, 全切片图像 | 225例胰腺导管腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 717 | 2026-04-14 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals cellular heterogeneity and immune microenvironment dynamics in colorectal cancer
2026-Apr-12, The International journal of biological markers
DOI:10.1177/03936155261441324
PMID:41968056
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了结直肠癌中的细胞异质性和免疫微环境动态,重点关注CD8+ CD101hiTim3+ T细胞及其前体细胞与免疫治疗反应的关联 | 识别并注释了结直肠癌中的多种T细胞亚型,构建了CCT T细胞及其前体细胞的伪时间轨迹,揭示了PD-1免疫治疗组中CCT T细胞前体与其他细胞间增强的相互作用,并开发了一个包含15个基因特征的预后模型 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量可能限制结果的普适性;对免疫治疗反应的预测仍需临床数据进一步确认 | 通过研究结直肠癌微环境中的CCT T细胞及其前体细胞,识别新的治疗靶点和潜在生物标志物,并探索它们与免疫治疗反应的关联 | 结直肠癌患者样本中的T细胞,特别是CD8+ CD101hiTim3+ T细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 预后模型(基于基因特征) | 单细胞测序数据,转录组数据 | 未明确指定具体样本数量,但使用了单细胞测序数据和TCGA数据库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 718 | 2026-04-14 |
Senescence Programs Shape the Chronic Wound Microenvironment
2026-Apr-12, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1177/21621918261441046
PMID:41968061
|
综述 | 本文综述了细胞衰老在慢性伤口微环境中的作用及其对愈合过程的影响 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示慢性伤口中衰老细胞的异质性及其空间分布,为靶向治疗提供新见解 | 依赖非特异性衰老标志物(如p21或SA-β-gal)导致结果解释复杂化,且衰老细胞在慢性伤口中的身份、丰度和定位仍不明确 | 探讨细胞衰老如何影响慢性伤口的愈合过程,并评估靶向衰老细胞的治疗策略 | 慢性伤口(如糖尿病足溃疡、静脉性腿部溃疡和压力性溃疡)中的衰老细胞,特别是成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 慢性伤口 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 719 | 2026-04-14 |
COPD reshapes the tumor microenvironment of NSCLC and enhances anti-PD-1 therapy response
2026-Apr-10, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2025.100996
PMID:41690302
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研究论文 | 本研究揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)通过重塑非小细胞肺癌(NSCLC)的肿瘤微环境,特别是通过诱导上皮细胞重塑和建立CXCL14-CXCR4信号轴来招募巨噬细胞,从而增强抗PD-1免疫疗法的疗效 | 首次通过整合多组学分析和功能验证,阐明了COPD作为共病通过诱导特定的基底样肿瘤细胞群和建立肿瘤-巨噬细胞招募回路来增强NSCLC对PD-1阻断剂反应的分子机制 | 研究主要基于手术切除的新鲜肿瘤样本,样本量可能有限,且机制验证主要在体外进行,需要进一步的体内模型验证 | 探究COPD如何影响NSCLC的肿瘤微环境并增强抗PD-1免疫疗法的疗效 | 非小细胞肺癌(NSCLC)患者,特别是伴有COPD共病的患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫荧光图像 | 三个临床队列的新鲜手术肿瘤标本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 720 | 2026-04-14 |
Single-cell transcriptomics brings stroke thrombi into cellular and molecular focus: A commentary on "characterizing stroke clots using single-cell sequencing"
2026-Apr-10, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X261437925
PMID:41958358
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评论 | 本文评论了单细胞转录组学在人类缺血性卒中血栓研究中的应用,强调了血栓作为免疫活性微环境的重要性 | 通过单细胞RNA测序技术,揭示了卒中血栓并非惰性栓塞物质,而是具有结构化、免疫活性且受卒中病因塑造的微环境 | NA | 探讨单细胞转录组学如何提升对卒中血栓细胞和分子特征的理解 | 人类缺血性卒中血栓 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |