单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 943 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2026-04-13 |
High-throughput strategy for targeting MDM2 in uveal melanoma to reverse radiation therapy resistance
2026-Apr-11, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-02970-x
PMID:41965789
|
研究论文 | 本研究结合机器学习模型与高通量筛选平台，识别靶向MDM2的新型小分子抑制剂，以逆转葡萄膜黑色素瘤的放疗抵抗 | 首次将机器学习模型、高通量筛选与单细胞RNA测序数据整合，系统性地识别并验证了MDM2作为克服葡萄膜黑色素瘤放疗抵抗的关键靶点 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内动物模型或临床数据的验证 | 克服葡萄膜黑色素瘤对放射治疗的固有抵抗性 | 葡萄膜黑色素瘤细胞 | 机器学习 | 葡萄膜黑色素瘤 | 转录组测序，单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 682 | 2026-04-13 |
Characterizing gene perturbations in single cells via network divergence analysis
2026-Apr-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71507-8
PMID:41965857
|
研究论文 | 本文介绍了scDNS框架，用于通过测量条件特异性基因相互作用网络配置之间的信息论差异来量化单细胞中基因特异性功能扰动 | 提出了一种新的方法scDNS，专注于通过网络重连而非基因表达变化来推断基因功能扰动，并将其与特定细胞群体关联，这在现有scRNA-seq数据分析中较少涉及 | 未在摘要中明确说明 | 开发一个工具来推断单细胞中动态基因功能扰动，并识别关键调控因子和受扰动的细胞群体 | 单细胞RNA测序数据 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | scRNA-seq | 网络分析框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 683 | 2026-04-13 |
CBP/p300 is critical for the expansion and maintenance of functional pancreatic α cell mass
2026-Apr-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71499-5
PMID:41965878
|
研究论文 | 本文通过小鼠模型揭示了CBP/p300在调控功能性胰腺α细胞质量中的核心作用，涉及氨基酸感知、细胞增殖和自噬过程 | 首次发现CBP/p300通过调控Slc7a2介导的氨基酸感知来维持α细胞身份和功能，揭示了新的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类α细胞中的相关性尚需验证 | 探究CBP/p300在胰腺α细胞功能和质量维持中的分子机制 | 小鼠胰腺α细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 684 | 2026-04-13 |
A machine learning model integrating circulating Temra cell transcriptional profiles to predict immunotherapy efficacy
2026-Apr-10, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2026.101027
PMID:41747737
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于循环终末分化效应记忆CD8+ T细胞转录组特征的机器学习模型，用于预测免疫治疗疗效 | 整合了13个公开单细胞数据集构建全面的CD8+ T细胞转录组图谱，首次利用循环Temra细胞的转录特征建立预测模型，并在前瞻性多中心队列中验证 | 样本量相对有限（15例配对样本），模型需在更广泛癌种和更大队列中进一步验证 | 开发血液来源的转录组生物标志物以预测免疫检查点抑制剂疗效 | 癌症患者（特别是非小细胞肺癌患者）的循环CD8+ T细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | 逻辑回归 | 转录组数据 | 15例配对外周血和肿瘤样本，整合748,082个CD8+ T细胞，前瞻性队列131例晚期NSCLC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 685 | 2026-04-13 |
Single-cell profiling of immune reset in patients with refractory generalized myasthenia gravis receiving autologous CD19/BCMA CAR-T cell therapy
2026-Apr-10, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2026.101026
PMID:41747738
|
研究论文 | 本研究评估了自体CD19/BCMA双靶向CAR-T细胞疗法在难治性全身型重症肌无力患者中的安全性、有效性及对系统性免疫的影响 | 首次在难治性全身型重症肌无力患者中应用无需淋巴细胞清除的自体CD19/BCMA双靶向CAR-T细胞疗法，并通过单细胞测序揭示了疗法诱导的系统性免疫重置机制 | 研究样本量较小（仅6名患者），且为单臂I期试验，缺乏对照组，长期疗效和安全性需更大规模临床试验验证 | 评估CD19/BCMA双靶向CAR-T细胞疗法在难治性全身型重症肌无力中的安全性、疗效及对免疫系统的影响 | 难治性全身型重症肌无力患者 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 6名患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 686 | 2026-04-13 |
Dissection of the T cell infiltrate in mouse pancreatic tumors reveals an extensive and diverse tumor-reactive T cell repertoire
2026-Apr-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adr6132
PMID:41961941
|
研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学和功能性T细胞受体表征，探索了小鼠胰腺癌模型中的T细胞库，揭示了肿瘤反应性T细胞受体克隆型的广泛多样性 | 结合单细胞转录组学和功能性TCR表征，首次在小鼠胰腺癌模型中系统性地揭示了肿瘤反应性TCR克隆型的多样性，并鉴定了三种与人类癌症相关的T细胞表位 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类胰腺癌；样本规模可能有限，未详细说明具体样本数量 | 探索胰腺癌中肿瘤浸润T细胞的T细胞受体库多样性及其抗原特异性，以评估个性化免疫疗法的治疗潜力和安全性 | 小鼠胰腺癌模型中的肿瘤浸润T细胞 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学，免疫肽组分析，T细胞受体表征 | NA | 单细胞转录组数据，TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 687 | 2026-04-13 |
Demystifying Plasmodium development within the Anopheles mosquito
2026-Apr-10, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102751
PMID:41966627
|
综述 | 本文总结了显微镜、单细胞RNA测序和遗传筛选等新技术如何革新了对疟原虫在按蚊体内发育阶段的研究 | 整合了最新的显微镜、单细胞RNA测序和遗传筛选技术，以揭示疟原虫在蚊媒中发育的复杂过程 | NA | 提高对疟原虫在按蚊体内发育阶段的理解，以支持新型疟疾传播控制工具的研发 | 疟原虫在按蚊体内的生命周期阶段 | 自然语言处理 | 疟疾 | 显微镜、单细胞RNA测序、遗传筛选 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 688 | 2026-04-13 |
Targeting ANXA1/TRKA axis enhances immunotherapy sensitivity in neural invasion-positive gastric cancer
2026-Apr-09, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-026-00444-1
PMID:41954859
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了神经侵犯阳性胃癌（NIGC）中独特的免疫微环境特征，并阐明了ANXA1/TRKA轴通过抑制糖酵解代谢驱动CD8⁺T细胞耗竭的分子机制 | 首次在单细胞水平系统描绘NIGC的免疫景观，发现ANXA1⁺CD8⁺T细胞耗竭的关键亚群，并揭示ANXA1通过结合TRKA阻断其泛素化降解的新机制，提出靶向该轴联合免疫治疗的新策略 | 研究样本量有限，临床前模型需进一步验证，ANXA1肽段（A11）的临床转化潜力有待评估 | 阐明神经侵犯阳性胃癌的免疫微环境特征及其对免疫治疗敏感性的影响机制 | 神经侵犯阳性与阴性胃癌患者的肿瘤组织样本 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，多重免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质互作数据 | 未明确患者数量（来自NIGC和神经侵犯阴性GC患者的肿瘤标本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 689 | 2026-04-13 |
Comprehensive multi-omics analyses reveal small intestinal genetic mechanisms regulating milk protein trait in yak
2026-Apr-09, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2026-28364
PMID:41966396
|
研究论文 | 本研究通过构建首个牦牛小肠单细胞转录组图谱，并结合多组学分析，揭示了小肠功能特化及其相关基因调控牦牛乳高蛋白含量的遗传机制 | 首次构建了牦牛小肠的单细胞转录组图谱，并开发了一个整合基因组学和scRNA-seq数据的多策略GWAS框架来鉴定与乳蛋白含量相关的候选基因 | NA | 探究牦牛乳高蛋白含量的生物学基础，特别是小肠的调控机制 | 牦牛、犏牛和奶牛的生乳营养成分、氨基酸组成，以及牦牛小肠细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，全基因组关联分析 | NA | 转录组数据，基因组数据 | 从小肠组织中共获得27,026个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 690 | 2026-04-13 |
NPTX2 accelerates cell cycle progression, activates EMT, and regulates glycolytic metabolic pathways to promote clear cell renal cell carcinoma progression
2026-Apr-07, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.117950
PMID:41956427
|
研究论文 | 本研究揭示了神经元五聚蛋白2（NPTX2）通过调控细胞周期、上皮-间质转化（EMT）和糖酵解驱动的组蛋白乳酸化，促进透明细胞肾细胞癌（ccRCC）进展的机制 | 首次在单细胞水平鉴定出NPTX2过表达的恶性上皮亚群，并阐明了NPTX2通过协调调控细胞周期、EMT和糖酵解驱动的组蛋白乳酸化（特别是H3K18la）来驱动ccRCC进展的多重机制 | 研究主要基于细胞系和临床队列数据，体内实验模型可能未能完全模拟人类肿瘤的复杂性，且NPTX2的具体上游调控机制和下游效应通路的全面性有待进一步探索 | 探究NPTX2在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）进展中的功能作用和分子机制 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞系（786-O和Caki-1）、临床肿瘤组织样本（来自TCGA-KIRC数据库和自有样本）以及体内肿瘤模型 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、慢病毒介导的基因敲低/过表达、细胞增殖/迁移/周期分析、糖酵解功能测定、组蛋白乳酸化检测、体内肿瘤生长实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、临床队列数据、体外功能实验数据、体内实验数据 | 包括TCGA-KIRC数据库的临床队列和自有样本，以及786-O和Caki-1细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 691 | 2026-04-13 |
An integrative single-nucleus multiomic atlas of the human left ventricle identifies gene regulatory network dynamics across cardiac development, aging, and disease
2026-Apr-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04061-7
PMID:41937210
|
研究论文 | 本研究构建了一个整合的单核多组学图谱，揭示了人类左心室在发育、衰老和疾病过程中的基因调控网络动态 | 整合了大规模单核RNA测序和ATAC测序数据，首次系统揭示了心脏发育与疾病中胎儿基因程序在多种细胞类型中的广泛再激活，并构建了细胞类型特异性的增强子-基因关联图谱 | 研究主要基于左心室组织，可能无法完全代表心脏其他区域的特征；样本主要来自死后组织，可能存在死后变化的影响 | 理解人类心脏在发育、衰老和疾病过程中的基因调控机制 | 人类左心室组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 | 299名供体的单核RNA测序数据集和106名供体的单核ATAC测序数据集 | NA | 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 692 | 2026-04-13 |
Spatial metabolomics and transcriptomics reveal the metabolic-immune niche associated with renal fibrosis in hyperuricemia
2026-Apr-06, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究通过整合空间代谢组学、单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了高尿酸血症肾病中与肾纤维化相关的代谢-免疫微环境 | 首次构建了高分辨率多组学图谱，阐明了代谢重塑与细胞间通讯的空间协调关系，并提出了缺氧依赖性成纤维细胞-巨噬细胞串扰的新机制 | 研究基于小鼠模型，尚未在人体样本中得到验证，且机制假设需要进一步实验证实 | 探究高尿酸血症肾病中代谢微环境与免疫-间质细胞相互作用的时空关系 | 高尿酸血症小鼠模型的肾脏组织 | 空间多组学 | 高尿酸血症肾病 | 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化分析 | NA | 代谢组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 高尿酸血症小鼠模型肾脏组织（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 693 | 2026-04-13 |
PCSK9 promotes prostate cancer via facilitating intratumoral cholesterol accumulation and enhancing immunosuppressive tumor microenvironment
2026-Apr-06, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.04.020
PMID:41951051
|
研究论文 | 本研究揭示了PCSK9通过促进前列腺癌肿瘤内胆固醇积累和塑造免疫抑制微环境来驱动前列腺癌进展的新机制 | 首次阐明了PCSK9在前列腺癌中的促癌作用机制，发现了新的免疫抑制因子（Sig15IM、ABI3、CORO1A、CD53等）在塑造免疫抑制微环境中的关键作用，并证实了抗PCSK9抗体（evolocumab）的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，临床样本验证相对有限；免疫抑制因子在人类前列腺癌中的确切功能需要进一步验证 | 探究PCSK9在前列腺癌进展中的功能及其潜在分子机制 | 前列腺癌干细胞、原发性及转移性前列腺癌组织、基因工程小鼠模型（Pten-/-、TRAMP）、异种移植瘤模型、LNCaP细胞系 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个独立前列腺癌人群（包括转移性和去势抵抗性前列腺癌）、8种其他癌症类型的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 694 | 2026-04-13 |
Depletion of Fibrinogen Suppresses Growth of Primary Tumors and Metastasis of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2026-Apr, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.09.024
PMID:41432649
|
研究论文 | 本文研究了纤维蛋白原在胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤生长和转移中的作用，通过临床测试中的技术平台（反义寡核苷酸或含小干扰RNA的脂质纳米颗粒）在PDAC患者来源的异种移植模型中耗竭纤维蛋白原，并监测肿瘤生长和转移 | 首次在PDAC模型中利用临床测试中的技术平台（如反义寡核苷酸或siRNA脂质纳米颗粒）耗竭纤维蛋白原，并系统评估其对原发肿瘤生长和转移的影响，结合蛋白质组学和空间转录组学揭示其机制 | 研究未涉及纤维蛋白原耗竭对晚期转移阶段（如肝定植）的影响，且模型可能不完全反映人类PDAC的复杂性 | 探究纤维蛋白原在PDAC肿瘤进展和转移中的作用，评估靶向纤维蛋白原作为临床治疗策略的潜力 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者来源的异种移植模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | 3个PDAC患者来源的异种移植模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 695 | 2026-04-13 |
ENPP1-Regulated Extracellular Purine Metabolism Drives Pancreatitis-Mediated Pancreatic Cancer
2026-Apr, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.09.032
PMID:41553309
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了ENPP1调控的细胞外嘌呤代谢在胰腺炎介导的胰腺癌发生中的关键作用 | 首次将ENPP1调控的细胞外嘌呤代谢与胰腺炎向胰腺癌转化联系起来，并阐明其通过激活胰腺星状细胞和招募免疫抑制细胞促进肿瘤发生的机制 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本，临床转化仍需进一步验证 | 探究胰腺炎促进胰腺癌发生的分子机制 | 慢性胰腺炎患者和胰腺炎相关胰腺癌患者样本，以及基因工程小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞测序 | NA | 多组学数据 | 人类胰腺样本和小鼠模型组织 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 696 | 2026-04-13 |
NK Cell Activation by Platinum Boosts Immunotherapy in HR+/HER2- Breast Cancer
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518978
PMID:41691453
|
研究论文 | 本研究通过大规模多组学和单细胞RNA测序揭示了NK细胞在HR+/HER2-乳腺癌中对免疫治疗反应的关键作用，并发现铂类药物通过增强NK细胞毒性来提升免疫治疗效果 | 首次在HR+/HER2-乳腺癌中系统阐明NK细胞介导免疫治疗反应的机制，并发现铂类药物通过NF-κB通路增强NK细胞功能的新协同作用 | 临床队列分析样本量有限，铂类药物增强NK细胞的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究HR+/HER2-乳腺癌中免疫治疗响应机制及增效策略 | HR+/HER2-乳腺癌肿瘤微环境中的NK细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据，临床队列数据 | 临床队列样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 697 | 2026-04-13 |
Single-Cell Analysis of Chemotherapy-induced Remodeling Reveals CD276-driven Basal-like Chemoresistance in Pancreatic Cancer
2026-Apr, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.09.043
PMID:41701125
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胰腺癌化疗前后肿瘤细胞可塑性和肿瘤微环境的重塑，揭示了CD276/B7-H3在驱动基底样化疗耐药中的关键作用 | 首次在单细胞分辨率上表征了化疗诱导的恶性状态和免疫微环境的动态重塑，并识别出由SNCG+基底样肿瘤细胞、SPP1+肿瘤相关巨噬细胞和耗竭T细胞组成的化疗耐药生态位，同时发现CD276/B7-H3作为双重功能免疫检查点 | 样本量相对有限（28例患者），且研究主要基于特定化疗方案（abraxane加吉西他滨），可能不适用于其他治疗方案 | 探究化疗如何重塑胰腺导管腺癌的肿瘤细胞可塑性和肿瘤微环境，以影响临床结局 | 胰腺导管腺癌患者（28例）的配对治疗前后肿瘤活检样本和外周血单个核细胞，以及KPC小鼠模型和裸鼠异种移植瘤 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光，空间转录组学，CRISPR-Cas9敲除，肿瘤杀伤实验 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组学数据，免疫荧光图像 | 28例胰腺导管腺癌患者的配对样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10X Visium HD | 10X Visium HD空间转录组学平台，分辨率达2微米 |
| 698 | 2026-04-13 |
Overcoming CXCR4-Mediated T-Cell Exclusion Potentiates Antitumor Cytotoxicity in Fibrolamellar Carcinoma
2026-Apr, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.10.006
PMID:41701126
|
研究论文 | 本研究探讨了纤维板层肝细胞癌中CXCR4介导的T细胞排斥如何限制抗肿瘤免疫，并通过联合CXCR4和PD-1阻断在人类肿瘤切片培养模型中增强抗肿瘤细胞毒性 | 首次在纤维板层肝细胞癌中利用单核RNA测序和肿瘤切片培养系统揭示CXCL12+肌成纤维细胞与CXCR4+淋巴细胞间的相互作用是T细胞排斥的关键机制，并证明联合CXCR4和PD-1阻断能协同克服免疫抵抗 | 研究基于人类肿瘤切片培养模型，可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性；样本量可能受限于这种罕见癌症的稀缺性 | 探究纤维板层肝细胞癌对免疫疗法缺乏反应的机制，并开发有效的联合免疫治疗策略 | 纤维板层肝细胞癌患者的肿瘤组织及肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单核RNA测序, 多重免疫组织化学, 活体成像, 单细胞测序, 空间蛋白质组学 | 人类肿瘤切片培养模型 | RNA测序数据, 图像数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 单细胞测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 699 | 2026-04-13 |
Using cell-specific late-phase asthma mRNA biomarkers to repurpose drugs that concurrently reverse disease signatures across multiple immune cell-types
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014081
PMID:41931526
|
研究论文 | 本研究利用过敏原诱导的晚期哮喘反应（LAR）mRNA生物标志物，预测哮喘急性发作和严重程度，并通过单细胞RNA测序分析细胞特异性变化，识别潜在治疗药物 | 结合基线血液mRNA生物标志物与LAR相关标志物，形成109个LAR-mRNA生物标志物组合，首次在多个公共基因表达数据集中验证其预测能力，并利用单细胞扰动数据集进行药物签名匹配，识别出能逆转细胞特异性转录变化的化合物 | 生物标志物在男性中的预测性能优于女性，且样本主要来自轻度过敏性哮喘患者，可能无法完全代表所有哮喘亚型 | 研究晚期哮喘反应（LAR）的mRNA生物标志物在预测哮喘急性发作和严重程度中的作用，并探索潜在的治疗策略 | 轻度过敏性哮喘患者，以及公共基因表达数据集中的血液、气道、支气管肺泡灌洗液（BALF）和诱导痰样本 | 自然语言处理 | 哮喘 | mRNA基因表达分析，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | mRNA表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 700 | 2026-04-13 |
Integrative Single-Cell and Machine Learning Analysis Identifies an EMT-Associated Prognostic Signature for Papillary Thyroid Cancer
2026-Apr, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71766
PMID:41957879
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和机器学习分析，识别了与上皮-间质转化相关的八个预后基因，并构建了用于甲状腺乳头状癌预后评估的风险模型 | 首次将单细胞RNA测序与101种机器学习算法组合相结合，系统识别甲状腺乳头状癌中与上皮-间质转化相关的预后基因，并构建了综合性的预后风险模型 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证，缺乏体内实验和更大规模的前瞻性临床队列验证 | 探究甲状腺乳头状癌中上皮-间质转化的分子机制，并开发预后评估的生物标志物 | 甲状腺乳头状癌患者组织样本和正常甲状腺组织 | 机器学习 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型和多种机器学习算法组合 | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量，涉及内部验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |