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当前共找到 945 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2026-04-27 |
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2026-Apr-20, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101346
PMID:41895263
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研究论文 | 本研究评估了整合单细胞和单细胞核数据集以改善批量RNA-seq反卷积的策略，并提出了最佳实践方法 | 首次系统比较了多种整合策略（包括基于主成分的潜在偏移、条件和非条件scVI以及跨模态差异表达基因过滤）在提升单细胞核RNA-seq参考数据反卷积准确性的效果，并推荐了优先使用scRNA-seq及跨模态DEG过滤的方法 | 研究仅基于四种组织类型进行基准测试，可能未涵盖所有组织类型；跨模态DEG过滤需要配对的scRNA-snRNA细胞类型信息，实际应用中可能受限于数据可用性 | 评估并改进单细胞核RNA-seq数据作为批量RNA-seq反卷积参考的准确性 | 四种组织类型（具体未列出）的scRNA-seq和snRNA-seq数据；真实的脂肪组织批量样本 | 机器学习 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | 条件/非条件scVI（单细胞变分推断） | 基因表达数据 | 四种组织的scRNA-seq和snRNA-seq数据集；真实的脂肪组织批量样本（具体数量未说明） | NA | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | NA |
| 682 | 2026-04-27 |
Brain endothelial tmTNFα overexpression in a mouse model altered cell type-specific signaling changes linked to schizophrenia-relevant behaviors
2026-Apr-20, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106777
PMID:42019828
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研究论文 | 在小鼠模型中，脑内皮细胞tmTNFα过表达引发与精神分裂症相关行为相关的细胞类型特异性信号变化 | 首次在脑内皮细胞中通过tmTNFα过表达模型，揭示其通过TNFR2信号通路引发精神分裂症相关行为的细胞类型特异性分子机制，包括从急性星形胶质细胞和突触紊乱到慢性免疫激活、代谢失调和翻译后调控的时序演变 | 未明确提及研究局限性 | 探究脑内皮细胞中tmTNFα过表达导致精神分裂症相关行为的分子机制 | 小鼠模型（短期和长期tmTNFα表达模型）及TNFR2敲除小鼠 | 机器学习 | 精神分裂症 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 蛋白质印迹, sGC活性检测 | NA | 转录组数据, 蛋白质表达数据, 信号通路数据 | 小鼠模型（短期4周和长期28周表达模型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 683 | 2026-04-27 |
Maternal immune activation causes sex-specific impairment of microglial function during prefrontal cortex development
2026-Apr-19, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106770
PMID:42013920
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研究论文 | 该研究揭示了孕期母体免疫激活通过性别特异性损害小胶质细胞功能，导致前额叶皮层发育异常和雄性后代行为缺陷 | 首次证明MIA通过性别特异性方式损害小胶质细胞反应性，导致雄性后代前额叶皮层突触修剪缺陷和行为异常 | 未明确小胶质细胞功能障碍与神经发育异常之间的分子机制 | 探究母体免疫激活如何通过小胶质细胞介导性别特异性神经发育异常 | 母体免疫激活小鼠模型的后代，特别是前额叶皮层中的小胶质细胞 | 机器学习 | 神经发育障碍 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | MIA诱导的雄性及雌性小鼠后代，具体数量未在摘要中明确 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 684 | 2026-04-27 |
M2 macrophage-derived exosomes deliver NGF-modified mRNA to promote comprehensive corneal repair
2026-Apr-17, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114930
PMID:42002048
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研究论文 | 利用M2巨噬细胞来源的外泌体递送NGF修饰mRNA用于促进角膜综合修复 | 首次将M2巨噬细胞外泌体与NGF修饰mRNA结合，实现多维度的角膜修复，同时促进组织再生、抑制炎症和新生血管 | 未明确提及研究限制 | 开发一种基于M2巨噬细胞外泌体和NGF修饰mRNA的创新递送平台，用于角膜损伤后的综合修复 | M2巨噬细胞来源的外泌体、NGF修饰mRNA、碱烧伤的角膜组织 | 数字病理学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 685 | 2026-04-27 |
SCTGE infers transformer-based graph embeddings to improve cell-cell interaction identification and cell identity annotations
2026-Apr-11, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | SCTGE是一种基于Transformer的图嵌入新架构，整合自适应多尺度注意力和图神经网络，用于解决单细胞转录组空间嵌入难题并提升细胞间相互作用识别与细胞身份注释性能 | 创新性地融合Transformer自注意力机制与图神经网络，引入上下文感知自适应多头注意力和APPNP增强特征传播，有效应对空间转录组学中的可扩展性和噪声挑战 | 在特定数据集上细胞身份注释性能存在例外情况 | 开发可扩展且可解释的解决方案，用于空间嵌入提取、细胞间通信分析和细胞身份注释 | 单细胞转录组数据中的空间嵌入和细胞间相互作用 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 基于Transformer的图神经网络 | 单细胞转录组数据 | 六个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 686 | 2026-04-27 |
Multidimensional single-cell analysis reveals immune dysfunction and inflammatory response in lymphatic malformations
2026-Apr-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf103
PMID:41273773
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research paper | 通过单细胞多组学分析揭示了淋巴管畸形中免疫功能障碍和炎症反应的细胞类型特异性机制 | 首次整合单细胞RNA测序、T细胞受体测序和B细胞受体测序对淋巴管畸形患者外周血和胸腔积液进行多维免疫图谱分析，发现促炎性单核细胞和记忆B细胞扩增、细胞毒性T细胞和自然杀伤细胞减少，并鉴定出S100A8作为潜在治疗靶点 | 未提及 | 阐明淋巴管畸形中循环细胞的免疫表型和潜在分子机制 | 淋巴管畸形患者的外周血和胸腔积液样本 | 单细胞组学 | 淋巴管畸形 | scRNA-seq, scTCR-seq, scBCR-seq | NA | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列、B细胞受体序列 | 淋巴管畸形患者样本 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell TCR-seq, single-cell BCR-seq | NA | NA |
| 687 | 2026-04-27 |
Indirubin and Retinoic Acid Show Binding Affinity to Monocyte Biomarker CSF3R in Parkinson's Disease
2026-Apr, Journal of clinical laboratory analysis
IF:2.6Q2
DOI:10.1002/jcla.70197
PMID:41845882
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研究论文 | 本研究整合多组学数据分析，识别帕金森病单核细胞相关生物标志物CSF3R和IFITM3，并预测潜在靶向药物 | 首次结合单细胞测序与hdWGCNA分析，鉴定帕金森病外周血中单核细胞相关生物标志物，并预测其靶向药物 | NA | 通过多组学数据整合分析，揭示帕金森病中单核细胞的关键分子变化，识别新型生物标志物 | 帕金森病患者外周血单核细胞 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序、芯片分析 | NA | 单细胞转录组数据、芯片数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 688 | 2026-04-27 |
Multi-Omics Profiling Uncovers Predictive Factors for Tumor-Infiltrating Lymphocyte Therapy in Ovarian Cancer
2026-Apr, Journal of clinical laboratory analysis
IF:2.6Q2
DOI:10.1002/jcla.70196
PMID:41877397
|
research paper | 通过多组学分析揭示卵巢癌肿瘤浸润淋巴细胞治疗中的预测因素 | 首次对卵巢癌肿瘤样本进行多组学分析，整合全外显子组测序、bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据，系统性地识别与TIL治疗成功相关的细胞组成、代谢活性和细胞间通讯特征 | 样本量较小（仅10例患者），且主要基于回顾性分析，需要更大规模的前瞻性研究进行验证 | 识别预测卵巢癌患者肿瘤浸润淋巴细胞分离和扩增成功与否的关键因素 | 10例卵巢癌患者的肿瘤样本 | machine learning | ovarian cancer | 多组学分析 | NA | 基因组数据 | 10例卵巢癌患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 689 | 2026-04-25 |
Patterns of mitochondrial ATP predict tissue folding
2026-Apr-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aee6175
PMID:42018613
|
研究论文 | 研究发现线粒体ATP模式可预测组织折叠 | 首次揭示化学能以空间模式驱动组织折叠，并通过多物种实验验证线粒体富集与ATP增加对组织折叠的预测能力 | NA | 探索胚胎发育中组织形状构建的化学能量模式及其调控机制 | 果蝇、鸡和小鼠胚胎中的上皮细胞 | 计算生物学 | NA | 时间延时成像、空间转录组学、氧消耗速率测量 | 计算预测模型 | 时间序列图像、空间转录组数据、代谢率数据 | 果蝇、鸡和小鼠胚胎样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 690 | 2026-04-25 |
High altitude-mediated immune remodeling accelerates aging
2026-Apr-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb5599
PMID:42018634
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示高原环境诱导的免疫重塑加速衰老进程的机制 | 首次结合人类群体数据和模拟高原缺氧的小鼠模型，利用单细胞RNA测序和空间增强分辨率组学测序，系统描绘高原免疫重塑特征，并发现其与加速肠道衰老的关联 | 研究主要基于高海拔人群和小鼠模型，可能无法完全反映其他海拔环境或长期暴露的影响 | 探究高海拔介导的免疫重塑如何加速衰老轨迹 | 青藏高原海拔3656米（拉萨）和5070米（推瓦村）的居民，以及模拟5000米缺氧条件下的小鼠 | 免疫学与衰老研究 | 高原相关病理生理过程 | 单细胞RNA测序、空间增强分辨率组学测序（Stereo-seq） | NA | 单细胞基因表达数据、空间转录组数据 | 高海拔人群队列（具体样本量未说明）和小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Stereo-seq | 10x Chromium单细胞3'测序, Stereo-seq空间转录组学 |
| 691 | 2026-04-25 |
MMP9 in macrophages: A pivotal biomarker associated with immune dysregulation in interstitial cystitis/bladder pain syndrome
2026-Apr-24, Urologia
DOI:10.1177/03915603261440236
PMID:42028601
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示MMP9在巨噬细胞中作为间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征的关键生物标志物，并与免疫失调相关 | 首次通过整合单细胞与批量转录组数据，明确MMP9在IC/BPS巨噬细胞中高表达并增强吞噬活性，筛选出潜在的靶向药物 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量有限、缺乏功能验证实验等 | 探索间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征中关键的免疫靶点和生物标志物 | IC/BPS患者来源的单细胞和批量RNA测序数据 | 机器学习 | 间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 二元分类机器学习模型（14种算法） | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量（涉及GSE164557等数据集） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 692 | 2026-04-25 |
Mechanical load inhibits cancer growth in mouse and human hearts
2026-Apr-23, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.ads9412
PMID:42024763
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research paper | 研究了机械负荷如何抑制小鼠和人类心脏中的癌症生长，揭示了机械力通过影响表观遗传机制保护心脏的机制 | 首次揭示了机械负荷通过减少组蛋白甲基化和染色质压缩来抑制心肌中癌细胞增殖的机制，并识别Nesprin-2为关键机械传感器 | NA | 探究机械负荷在心脏抗癌症中的作用及其分子机制 | 小鼠心脏和人类心脏转移瘤样本 | NA | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类心脏转移瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 693 | 2026-04-25 |
Charting the transition from in vitro gliogenesis to the in vivo maturation of human glial progenitor cells transplanted into the hypomyelinated mouse brain
2026-Apr-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71803-3
PMID:42026046
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和CUT&TAG技术，追踪人多能干细胞来源的胶质祖细胞在体外生成和体内分化过程中的分子特征 | 首次结合scRNA-seq、scATAC-seq和CUT&TAG技术，系统描绘了人胶质祖细胞从体外生成到体内成熟的全过程分子图谱，并揭示了宿主环境通过激活不同的基因调控网络促进细胞命运决定的机制 | 仅使用小鼠模型（shiverer小鼠），可能无法完全模拟人脑微环境；未评估移植细胞的长期功能整合和安全性 | 阐明人胶质祖细胞从体外生成到体内分化为星形胶质细胞和少突胶质细胞的分子调控机制 | 人多能干细胞来源的胶质祖细胞及其在体外和体内（小鼠脑内）的分化产物 | 数字病理学 | 髓鞘发育不良性疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq, CUT&TAG | NA | 单细胞基因表达数据，染色质可及性数据，组蛋白修饰数据 | 未明确提及具体样本数量，涉及体外培养细胞和移植后小鼠脑组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序平台 |
| 694 | 2026-04-25 |
Mapping glioblastoma's isoform diversity using long-read single-cell analysis
2026-Apr-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72258-2
PMID:42026049
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研究论文 | 利用长读单细胞RNA测序技术构建胶质母细胞瘤的异构体图谱，揭示肿瘤特异性异构体及其作为潜在新抗原和治疗靶点的价值 | 首次应用单细胞长读RNA测序构建胶质母细胞瘤的异构体分辨率图谱，鉴定出大量未被注释的肿瘤特异性异构体，并提出基于肿瘤限制性异构体的双特异性靶向治疗策略 | 未提及具体的局限性，但可能包括样本量有限、长读测序技术成本高、验证实验不足等 | 解析胶质母细胞瘤中RNA剪接异构体的多样性及其在肿瘤异质性和治疗耐药中的作用 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织中的细胞群体 | 生物信息学， 癌症基因组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞长读RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自7名胶质母细胞瘤患者的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞长读RNA测序 |
| 695 | 2026-04-25 |
Multiomics immune profiling of a patient-relevant orthotopic lung cancer model using SEPARATE-Seq
2026-Apr-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72247-5
PMID:42026061
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研究论文 | 利用SEPARATE-Seq技术对与患者相关的原位肺癌模型进行多组学免疫分析 | 开发了一种可注射的原位肺腺癌模型，结合SEPARATE-Seq和空间转录组学，实现了血管内和血管外免疫细胞的分离及空间定位分析 | 未提及 | 建立更贴近人类肺癌患者的临床前小鼠模型，并利用多组学方法全面解析其肿瘤免疫微环境 | 原位肺腺癌小鼠模型中的肿瘤及非肿瘤相邻组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | SEPARATE-Seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 小鼠模型，具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 696 | 2026-04-25 |
Oocyte-specific acylglycerol kinase loss leads to infertility in mice via mitochondrial dysfunction
2026-Apr-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10073-7
PMID:42026151
|
研究论文 | 通过卵母细胞特异性敲除AGK的小鼠模型，揭示AGK缺失导致线粒体功能障碍，进而引起不孕 | 首次在卵母细胞中揭示AGK通过维持线粒体功能调控卵泡发育及卵母细胞成熟，并识别AGK为女性不孕的潜在诊断标志物和治疗靶点 | 未在人类卵母细胞中验证AGK功能，且机制探索主要依赖转录组和代谢组学，缺乏更直接的蛋白互作或信号通路验证 | 探究AGK在卵母细胞发育及卵巢功能中的作用，并为女性不孕提供潜在生物标志物和治疗靶点 | 卵母细胞特异性敲除Agk的小鼠 | 机器学习 | 女性不孕 | 单细胞RNA测序、空间代谢组学 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 卵母细胞特异性Agk敲除小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序使用10x Chromium平台，空间代谢组学未指定具体产品 |
| 697 | 2026-04-25 |
Protocol for isolating stromal cells from lymphoid tissue for performing scRNA-seq
2026-Apr-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104501
PMID:41989919
|
protocol | 提供从淋巴组织中分离基质细胞以进行单细胞RNA测序的协议 | 专门针对低丰度基质细胞（占比小于2%）的分离和纯化步骤优化 | 未提及 | 建立从淋巴组织中纯化成纤维细胞用于单细胞RNA测序分析的标准化流程 | 淋巴组织中的基质细胞（成纤维细胞） | NA | NA | scRNA-seq | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 698 | 2026-04-25 |
Transcriptomic and single-cell analyses reveal the prognostic value of ETV4 and its role in shaping the immune landscape of colorectal cancer
2026-Apr-15, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102775
PMID:41997046
|
研究论文 | 通过转录组和单细胞分析揭示了ETV4在结直肠癌中的预后价值及其通过诱导M2巨噬细胞极化重塑免疫微环境的作用 | 首次综合转录组和单细胞RNA测序数据，明确ETV4通过WNT/β-catenin通路调控，促进M2型巨噬细胞极化，进而塑造结直肠癌免疫抑制微环境 | 未在更大规模独立队列中验证，且ETV4与其他免疫细胞亚群的直接相互作用机制尚需进一步探索 | 研究ETV4在结直肠癌中的预后价值及其对肿瘤免疫微环境的影响机制 | 结直肠癌肿瘤组织及HCT-116细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组化, Q-PCR, Western blot | CIBERSORT, GSVA, GSEA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 650例CRC肿瘤组织和51例癌旁正常组织（TCGA队列） | NA | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 699 | 2026-04-25 |
RNA m6A methylation regulates CDH6 to promote epithelial-to-mesenchymal transition in cholangiocytes of biliary atresia
2026-Apr, Journal of pediatric surgery
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.jpedsurg.2025.162492
PMID:40774478
|
research paper | 本研究探讨了RNA m6A甲基化通过调控CDH6促进胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化的机制 | 首次揭示了m6A甲基化通过METTL3/YTHDF2轴调控CDH6表达，进而促进胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化的新机制 | 研究主要基于公开单细胞RNA测序数据集和体外实验，缺乏体内动物模型验证及临床样本的大规模验证 | 探究m6A修饰在胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化中的参与作用及其机制 | 胆道闭锁患者的胆管细胞 | machine learning | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, RNA免疫沉淀 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA-seq数据 | 公开单细胞RNA测序数据集HRA003163 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 700 | 2026-04-25 |
Mapping the zygote-to-adult developmental cell phylogeny in Arabidopsis thaliana reveals a three-cell rule of branching
2026-Apr, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-026-02264-1
PMID:41975122
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研究论文 | 通过开发e-SMALT系统整合单细胞RNA测序，绘制拟南芥从合子到成体的发育细胞系统发育树，揭示三分枝规则 | 首次在高等植物中实现从合子到成体的全发育追踪，发现每个枝条起源于三个创始细胞的三细胞规则，并通过单细胞转录组解析三层胚层起源 | 当前仅分析两个个体，且barcode序列长度与突变率的依赖性可能限制更复杂组织的解析能力 | 阐明多细胞生物从单细胞合子到成体组织的发育细胞谱系及其分支规则 | 拟南芥（Arabidopsis thaliana）的枝条、花和果实组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、细胞谱系追踪 | 系统发育树重建 | 单细胞转录组数据、突变条形码数据 | 两株3月龄拟南芥个体，数千个细胞来自多个枝条分支 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组建库方法 |