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当前共找到 943 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-04-17 |
Mesenchymal Tissue-Driven Gene Programs Identify EMP3 as a Key Biomarker of Aggressiveness in Undifferentiated Sarcomas
2026-Apr-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27073309
PMID:41977488
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和空间分析，发现EMP3是未分化肉瘤中与上皮-间质转化、肿瘤进展和临床结局相关的关键间质组织驱动的生物标志物 | 首次将空间转录组学（CosMx）应用于未分化肉瘤异种移植模型，并结合批量RNA-seq数据，系统性地识别出EMP3作为与肿瘤侵袭性和临床预后相关的稳健间质相关生物标志物 | 研究主要基于异种移植模型和回顾性队列，需要在更大规模的前瞻性临床队列中进一步验证EMP3的预后和治疗价值 | 识别未分化肉瘤中用于预后评估和治疗分层的分子生物标志物 | 未分化肉瘤（包括未分化多形性肉瘤）组织、细胞系、异种移植肿瘤模型以及临床队列样本 | 数字病理学 | 肉瘤 | RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 空间表达数据, 图像数据 | 两个UPS细胞系衍生的异种移植肿瘤、国家癌症中心队列样本、三十个US组织 | NA | 空间转录组学, 批量RNA-seq | CosMx | NA |
| 622 | 2026-04-17 |
A palmitoylation-related prognostic risk scoring model and tumor microenvironment characterization in lung adenocarcinoma, using single-cell RNA sequencing data
2026-Apr-06, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，构建了与棕榈酰化相关的预后风险评分模型，并表征了肺腺癌的肿瘤微环境 | 首次在单细胞水平上揭示了棕榈酰化在肺腺癌中的细胞异质性，并整合多种机器学习算法构建了稳健的预后模型，同时鉴定出SEC61G作为潜在的治疗靶点 | 研究样本量相对有限，仅使用了10个LUAD样本的单细胞数据，且体外实验未观察到联合治疗的协同效应 | 探究棕榈酰化相关基因在肺腺癌中的表达模式、预后价值及其对肿瘤微环境和药物敏感性的影响 | 肺腺癌（LUAD）患者样本，包括TCGA-LUAD和GSE68465数据集中的批量RNA-seq数据，以及10个LUAD样本的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），实时定量PCR（RT-qPCR），体外细胞实验 | CoxBoost, SuperPC, 以及共10种机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据，基因表达数据 | 10个肺腺癌样本的单细胞RNA测序数据，以及TCGA-LUAD和GSE68465数据集中的批量样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 623 | 2026-04-17 |
The m6Am methyltransferase PCIF1 promotes osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells through stabilization of Wnt-related transcripts
2026-Apr, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003739
PMID:41941537
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研究论文 | 本文揭示了m6Am甲基转移酶PCIF1通过稳定Wnt相关转录本促进间充质干细胞成骨分化的机制 | 首次发现PCIF1作为m6Am甲基转移酶在骨量维持和间充质干细胞成骨分化中的关键作用，并阐明其通过调控Wnt通路基因的mRNA稳定性来影响骨形成 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；PCIF1在其他细胞类型（如骨髓细胞）中的具体作用未完全阐明 | 探究PCIF1介导的m6Am修饰在骨稳态和成骨分化中的调控功能 | 间充质干细胞（MSCs）和小鼠模型 | 表观遗传学 | 骨质疏松症 | GWAS, TWAS, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 624 | 2026-04-17 |
Tumor Core-Edge Divergence in T-Cell Exhaustion and Clonal Expansion in HPV-Related Cervical Squamous Cell Carcinoma Unveiled by Simultaneous Single-Cell RNA and TCR Sequencing
2026-Apr, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70912
PMID:41964419
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA和TCR测序揭示了HPV相关宫颈鳞状细胞癌中肿瘤核心与边缘区域T细胞耗竭和克隆扩增的差异 | 首次在HPV相关宫颈鳞状细胞癌中同时使用单细胞RNA和TCR测序，系统比较了肿瘤核心与边缘区域的T细胞状态，并识别出一个与压力相关的耗竭CD8 T细胞亚群 | 样本量相对较小（scRNA-seq n=13, scTCR-seq n=9），且主要聚焦于HPV相关宫颈鳞状细胞癌，其他癌症类型的验证依赖于公共数据集 | 探究肿瘤空间结构（核心与边缘）对T细胞耗竭状态和克隆性的影响，以寻找预后生物标志物和潜在治疗靶点 | HPV相关宫颈鳞状细胞癌患者的配对肿瘤核心与边缘组织样本中的T细胞 | 单细胞组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 批量RNA测序, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 批量转录组数据, 公共癌症基因组数据 | 13例患者的单细胞RNA测序样本, 9例患者的单细胞TCR测序样本, 41例患者的批量RNA测序数据, 以及来自TCGA和结直肠癌的公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2026-04-17 |
A Conserved Fibroblast-Myeloid Gene Signature in Digestive Cancers: Multi-Omics Integration Identifies DCN, COL10A1, CTHRC1, and TREM2 as Candidate Microenvironmental Markers
2026-Apr-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27073208
PMID:41977392
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，在七种消化系统癌症中鉴定出一个保守的四基因特征（DCN、COL10A1、CTHRC1、TREM2），该特征在基质相关癌症相关成纤维细胞和髓系细胞中富集，揭示了跨癌种的保守基质-髓系相互作用 | 首次在多种消化系统癌症中鉴定出保守的成纤维细胞-髓系基因特征，并系统揭示了其细胞来源、细胞间通讯网络及多组学关联 | 研究主要基于生物信息学分析，需要后续实验验证基因特征的功能机制和临床转化潜力 | 探究消化系统癌症肿瘤微环境中是否存在保守的基质-免疫相互作用 | 七种消化系统癌症的肿瘤微环境 | 生物信息学 | 消化系统癌症 | 单细胞RNA测序，多组学整合分析，细胞间通讯分析 | NA | 基因组数据，表观遗传数据，转录组数据 | 涉及七种消化系统癌症类型（具体样本数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq，多组学分析 | NA | NA |
| 626 | 2026-04-17 |
Neural signaling contributes to heart formation and growth in the invertebrate chordate, Ciona robusta
2026-Apr, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003715
PMID:41980010
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研究论文 | 本研究揭示了神经肽tachykinin与经典Wnt信号通路在调控海鞘Ciona robusta心肌祖细胞增殖中的作用 | 首次在海鞘模型中阐明了神经肽tachykinin与Wnt信号协同调控心肌祖细胞增殖的机制，并发现神经样细胞直接支配远端祖细胞 | 研究局限于无脊椎脊索动物模型，结果在脊椎动物中的普适性有待验证 | 探究神经信号在心脏发育和生长中的调控作用 | 海鞘Ciona robusta的心脏及其心肌祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CRISPR-Cas9敲低 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年海鞘心脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 627 | 2026-04-17 |
Whole-embryo spatial transcriptomics
2026-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02591-1
PMID:41986568
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 628 | 2026-04-17 |
Spatiotemporal immune dynamics in lung cancer progression and treatment
2026-Apr, Breathe (Sheffield, England)
DOI:10.1183/20734735.0335-2025
PMID:41988086
|
综述 | 本文整合空间和时间视角，提供了肺癌免疫生物学的统一视图，重点讨论了肿瘤微环境中免疫、基质和恶性细胞之间的时空动态相互作用 | 将空间组织与时间变化相结合，揭示肺癌免疫微环境的动态重塑过程，并强调新兴技术在连接时空过渡与免疫背景方面的潜力 | 作为综述文章，主要基于现有研究进行整合和讨论，未提供原始实验数据或具体模型验证 | 理解肺癌免疫微环境的时空动态，以促进分期特异性生物标志物发现、治疗优化和个性化策略 | 肺癌肿瘤微环境，特别是非小细胞肺癌（NSCLC）中的免疫、基质和恶性细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学、多重成像、功能测定 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 629 | 2026-04-15 |
DAPK2 Regulates PKM2 Phosphorylation at Threonine 45 to Facilitate Disturbed Flow-Induced Atherosclerosis
2026-Apr-14, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了死亡相关蛋白激酶2（DAPK2）通过磷酸化丙酮酸激酶M2（PKM2）的第45位苏氨酸，调控内皮细胞炎症反应，从而促进血流扰动诱导的动脉粥样硬化发生的新机制 | 首次发现DAPK2是KLF2下游的振荡剪切力敏感因子，并鉴定出PKM2是DAPK2的直接作用底物，阐明了DAPK2通过磷酸化PKM2第45位苏氨酸促进其二聚化和核转位，进而激活STAT1并上调VCAM-1和ICAM-1表达的完整信号轴 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类疾病中的完全转化意义尚需进一步验证；DAPK2-PKM2轴在其他血管病理条件下的作用未予探索 | 阐明振荡剪切力诱导动脉粥样硬化的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 内皮细胞、小鼠动脉粥样硬化模型 | 分子细胞生物学 | 心血管疾病 | 质谱分析、免疫共沉淀、邻近连接实验、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组学数据、蛋白质组学数据、单细胞转录组数据 | 利用公共数据库资源及Apoe-/-背景的EC特异性基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 630 | 2026-04-15 |
Experimental and computational methods for allelic imbalance analysis from single-nucleus RNA-seq data
2026-Apr-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04062-6
PMID:41965748
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研究论文 | 本文探讨了实验和计算方法对单细胞RNA-seq数据中等位基因特异性表达分析的影响，并开发了一套单细胞ASE计算工具 | 开发了单细胞ASE计算工具，并展示了在单核RNA-Seq中从内含子区域提取更多ASE信息，以及如何通过读长和杂交选择提高检测能力 | NA | 研究实验和计算方法如何影响基于ASE的分析能力，并开发相关计算工具 | 单核RNA-Seq数据，特别是等位基因特异性表达分析 | 自然语言处理 | 帕金森病 | 单核RNA-Seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 631 | 2026-04-15 |
RESCUE: recovery of unattributed expression patterns in spatial transcriptomics
2026-Apr-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71720-5
PMID:41963343
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RESCUE的计算方法，用于恢复空间转录组学中现有分析方法遗漏的未归属表达模式 | RESCUE方法能系统性恢复因细胞分割或细胞类型解卷积而丢失的分子表达，包括脆弱细胞类型、亚细胞结构和细胞外表达等来源 | NA | 开发一种计算工具以改善空间转录组数据分析的完整性和准确性 | 空间转录组数据，特别是来自蜜蜂大脑的MERFISH数据和其他ST数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，MERFISH | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，MERFISH | NA | NA |
| 632 | 2026-04-15 |
Molecular Markers Distinguishing Early-Stage Mycosis Fungoides From Atopic Dermatitis Skin Lesions
2026-Apr, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70240
PMID:41888970
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，比较早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变的转录组特征，揭示了两者在免疫和基质细胞中的分子差异 | 首次在单细胞水平上系统比较早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎的转录组特征，识别了恶性T细胞、角质形成细胞、成纤维细胞和髓系细胞中的特异性分子标记 | 研究样本量可能有限，且仅聚焦于早期阶段，未涵盖疾病进展或治疗响应 | 区分早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变，以改善诊断和治疗 | 早期蕈样肉芽肿和特应性皮炎患者的皮肤病变样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 633 | 2026-04-15 |
Ubiquitin-specific protease 20(USP20) mitigates doxorubicin-induced cardiotoxicity by deubiquitinating and stabilizing HuR
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151642
PMID:41921794
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研究论文 | 本研究揭示了泛素特异性蛋白酶20(USP20)通过去泛素化并稳定HuR蛋白，从而抑制铁死亡并减轻阿霉素诱导的心肌病 | 首次阐明了USP20在阿霉素诱导心肌病中的保护作用机制，并发现其通过去泛素化HuR来稳定GPX4 mRNA以抑制铁死亡 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床样本中得到验证 | 探究USP20在阿霉素诱导心肌病中的作用机制 | 心肌细胞、小鼠心脏组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、LC-MS/MS、免疫共沉淀 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 634 | 2026-04-15 |
Multi omics analysis reveals senescence associated genes in metabolic dysfunction associated steatohepatitis related liver cancer and their functional validation
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151713
PMID:41933769
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌（MRLC）中的衰老相关基因，并进行了功能验证 | 结合全球疾病负担数据库、孟德尔随机化、多机器学习方法和单细胞RNA测序，首次系统筛选并验证了MRLC中的核心衰老相关基因及其潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型，缺乏临床样本的直接验证 | 探索衰老相关基因在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌（MRLC）患者数据及C57BL/6小鼠模型 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、多机器学习方法、分子对接 | 机器学习模型（未指定具体类型）、动物模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、疾病负担数据 | 未明确指定人类样本数量，使用C57BL/6小鼠建立MRLC模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 635 | 2026-04-14 |
Chronic psychological stress disrupts liver homeostasis by dysregulating oxidative phosphorylation via the PI3K/AKT/FoxO3a axis
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115389
PMID:41971987
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研究论文 | 本研究通过慢性束缚应激小鼠模型，揭示了慢性心理应激通过PI3K/AKT/FoxO3a轴抑制氧化磷酸化，从而破坏肝脏稳态的机制 | 首次在单细胞水平上识别FoxO3a作为关键转录因子，介导心理应激诱导的氧化磷酸化抑制，并发现FoxO3a驱动的表观遗传沉默作用 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；机制细节如FoxO3a具体靶基因有待深入探索 | 探究慢性心理应激导致慢性肝病的分子机制 | 慢性束缚应激小鼠模型中的肝细胞，特别是门静脉周围肝细胞（区域1） | 单细胞组学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序，组织学分析，生化分析，电子显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据，组织图像，生化指标 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 636 | 2026-04-14 |
SpaHE-Infil: A spatial heterogeneity framework for decoding TME infiltration from H&E-stained slides
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115155
PMID:41971992
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研究论文 | 开发了一个名为SpaHE-Infil的多模态计算框架，通过整合空间转录组学和全切片图像，从H&E染色切片中解码肿瘤微环境中的免疫细胞浸润 | 结合空间转录组学和全切片图像，利用随机森林模型提取形态、纹理和密度特征，动态校准临床样本中的免疫细胞比例偏差，实现高精度的空间细胞分布预测 | 未明确提及具体局限性，但可能依赖于图像质量和样本可用性 | 解码肿瘤微环境中免疫细胞的空间分布，以预测免疫治疗反应和患者生存 | 肿瘤微环境中的12种核心细胞类型，包括免疫细胞 | 数字病理学 | 多种癌症 | 空间转录组学，全切片图像分析 | 随机森林 | 图像，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 637 | 2026-04-14 |
PEPITEM Regulates the Synovial Microenvironment During Immune-Mediated Inflammatory Arthritis to Limit Disease
2026-Apr-13, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70108
PMID:41968960
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研究论文 | 本文研究了PEPITEM在早期、未治疗类风湿关节炎和银屑病关节炎中的状态及其在临床前模型中的治疗效果 | 揭示了PEPITEM通过抑制COX-2和NF-κB信号通路，改变关节内白细胞亚群组成，从而减轻关节炎严重性 | 研究主要基于临床前动物模型，尚未在人类患者中进行大规模临床试验验证 | 探究PEPITEM在免疫介导的炎症性关节炎中的调控作用及治疗潜力 | 类风湿关节炎和银屑病关节炎患者的外周血单核细胞，以及三种不同的炎症性关节炎动物模型 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术、Western blot、单细胞RNA测序、多重分析 | NA | 流式细胞数据、蛋白质印迹数据、单细胞RNA测序数据、组织学数据 | 临床疑似关节痛和疑似炎症性关节炎患者的外周血样本，以及三种动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 638 | 2026-04-14 |
CKAP4 Regulates ERS-Induced Apoptosis in Osteoclasts Through FOXO3 in Periodontitis
2026-Apr-13, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70208
PMID:41969105
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研究论文 | 本研究揭示了CKAP4通过FOXO3调控内质网应激诱导的破骨细胞凋亡在牙周炎中的作用机制 | 首次发现CKAP4在牙周炎破骨细胞凋亡中的调控作用，并阐明其通过FOXO3介导的内质网应激通路 | 研究主要基于动物模型和测序数据分析，临床样本验证相对有限 | 探究牙周炎中破骨细胞凋亡失调的分子机制 | 破骨细胞（Osteoclasts） | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | GEO数据库中的牙周炎患者组织样本数据及Ckap4基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 639 | 2026-04-14 |
Vorinostat Potentiates Chemoimmunotherapy in Immune-Enriched Pancreatic Cancer
2026-Apr-13, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521844
PMID:41969226
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶抑制剂伏立诺他（SAHA）在免疫富集型胰腺癌中增强化疗免疫疗法效果的机制 | 通过整合体外药物筛选和计算机敏感性预测，首次识别出SAHA作为IE-PDAC中化疗免疫疗法的有效增敏剂，并揭示了其通过抑制FASN和PARP9破坏肿瘤微环境中代谢陷阱的新机制 | 研究主要基于临床前模型（如患者来源的异种移植模型和类器官共培养），尚未进行大规模临床试验验证 | 探究免疫富集型胰腺癌（IE-PDAC）的潜在机制并寻找有效疗法 | 胰腺导管腺癌（PDAC），特别是免疫富集型亚型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），体外药物筛选，计算机敏感性预测，患者来源的异种移植模型 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 640 | 2026-04-14 |
Integrating Radiomics and Computational Pathology to Predict Early Recurrence of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and Uncover Its Biological Basis in Tumor Microenvironment
2026-Apr-13, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523985
PMID:41969272
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个整合放射组学和计算病理学的模型，用于预测胰腺导管腺癌的早期复发，并揭示了其与肿瘤微环境中细胞外基质重塑相关的生物学机制 | 首次整合放射组学和计算病理学特征构建预测模型，并结合单细胞RNA测序和空间转录组学验证了预测结果与肿瘤微环境中成纤维细胞和胰腺星状细胞富集以及细胞外基质通路失调的关联 | 研究为回顾性设计，样本量有限（225例患者），且模型在外部验证中的性能略有下降 | 预测胰腺导管腺癌根治性切除后的早期复发，并阐明其生物学基础 | 胰腺导管腺癌患者 | 计算病理学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习模型（11种） | CT图像, 全切片图像 | 225例胰腺导管腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |