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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-04-27 |
Type I interferon drives T cell responses to amyloid beta in the central nervous system
2026-Apr-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72262-6
PMID:42026067
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了APP23转基因小鼠模型中中枢神经系统淀粉样蛋白病理进展过程中,T细胞从依赖于微胶质细胞转变为介导神经炎症的免疫微环境动态变化,并发现I型干扰素驱动CD8+ T细胞对β-淀粉样蛋白的应答 | 首次在单细胞水平揭示淀粉样蛋白病理晚期T细胞显著增加及其围绕Aβ斑块的聚集现象,鉴定出表达干扰素刺激基因的CD8+ T细胞亚群,并阐明其通过CXCL10-CXCR3轴招募非ISG T细胞的机制 | 主要基于小鼠模型,人类样本验证范围有限;未深入探讨T细胞亚群的功能异质性及长期效应 | 研究中枢神经系统淀粉样蛋白病理中适应性免疫系统(特别是T细胞)的动态变化及其调控机制 | APP23转基因小鼠模型及人类中枢神经系统淀粉样蛋白病理样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | APP23转基因小鼠模型及人类中枢神经系统淀粉样蛋白病理组织样本(具体数量未在摘要中提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 622 | 2026-04-27 |
Intragraft clonal expansion of cytotoxic CD8+ and CD4+ T cells in antibody-mediated kidney transplant rejection
2026-Apr-23, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.03.012
PMID:42034201
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研究论文 | 通过多组学分析揭示了抗体介导的肾移植排斥反应中细胞毒性CD8+和CD4+ T细胞的克隆扩增现象 | 首次在抗体介导的排斥反应中系统证实CD4+和CD8+细胞毒性T细胞的克隆扩增,挑战了传统AMR与TCMR的二元分类框架 | 样本量有限(仅16例单细胞测序),且未涉及功能验证实验 | 探索抗体介导的肾移植排斥反应中T细胞的克隆性和空间组织特征 | 肾移植活检组织中的CD4+和CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肾移植排斥反应 | RNA-seq, 单细胞RNA/TCR测序, 多重免疫染色 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据, 空间蛋白组数据 | 192例批量转录组、16例单细胞RNA/TCR测序、18例和75例多重免疫染色 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 623 | 2026-04-27 |
Adversarial validation of in silico perturbation profiles for intelligence-associated genes in human prefrontal cortex
2026-Apr-21, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 基于Geneformer模型对与智力相关的21个基因在人类前额叶皮层中的计算机扰动进行对抗性验证 | 提出了一个可复现的对抗性验证框架,用于评估基础模型的计算机扰动结果,并揭示了表达水平混杂因素会显著放大原始扰动信号 | 研究在供体层面统计效力不足(n=3,估计效力约27%),推荐至少20个供体;交叉模型一致性受标记化问题限制 | 建立标准化对抗性验证框架,评估基础模型在计算机基因扰动中的可靠性,并检验智力相关基因的细胞类型特异性机制 | 人类背外侧前额叶皮层(DLPFC)单细胞RNA-seq数据中的21个智力相关基因 | 自然语言处理 | 智力相关疾病 | 单细胞RNA测序 | Geneformer, scGPT | 单细胞RNA-seq表达数据 | 3个供体的500个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 624 | 2026-04-27 |
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2026-Apr-20, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101346
PMID:41895263
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研究论文 | 本研究评估了整合单细胞和单细胞核数据集以改善批量RNA-seq反卷积的策略,并提出了最佳实践方法 | 首次系统比较了多种整合策略(包括基于主成分的潜在偏移、条件和非条件scVI以及跨模态差异表达基因过滤)在提升单细胞核RNA-seq参考数据反卷积准确性的效果,并推荐了优先使用scRNA-seq及跨模态DEG过滤的方法 | 研究仅基于四种组织类型进行基准测试,可能未涵盖所有组织类型;跨模态DEG过滤需要配对的scRNA-snRNA细胞类型信息,实际应用中可能受限于数据可用性 | 评估并改进单细胞核RNA-seq数据作为批量RNA-seq反卷积参考的准确性 | 四种组织类型(具体未列出)的scRNA-seq和snRNA-seq数据;真实的脂肪组织批量样本 | 机器学习 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | 条件/非条件scVI(单细胞变分推断) | 基因表达数据 | 四种组织的scRNA-seq和snRNA-seq数据集;真实的脂肪组织批量样本(具体数量未说明) | NA | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2026-04-27 |
Brain endothelial tmTNFα overexpression in a mouse model altered cell type-specific signaling changes linked to schizophrenia-relevant behaviors
2026-Apr-20, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106777
PMID:42019828
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研究论文 | 在小鼠模型中,脑内皮细胞tmTNFα过表达引发与精神分裂症相关行为相关的细胞类型特异性信号变化 | 首次在脑内皮细胞中通过tmTNFα过表达模型,揭示其通过TNFR2信号通路引发精神分裂症相关行为的细胞类型特异性分子机制,包括从急性星形胶质细胞和突触紊乱到慢性免疫激活、代谢失调和翻译后调控的时序演变 | 未明确提及研究局限性 | 探究脑内皮细胞中tmTNFα过表达导致精神分裂症相关行为的分子机制 | 小鼠模型(短期和长期tmTNFα表达模型)及TNFR2敲除小鼠 | 机器学习 | 精神分裂症 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 蛋白质印迹, sGC活性检测 | NA | 转录组数据, 蛋白质表达数据, 信号通路数据 | 小鼠模型(短期4周和长期28周表达模型) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 626 | 2026-04-27 |
Maternal immune activation causes sex-specific impairment of microglial function during prefrontal cortex development
2026-Apr-19, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106770
PMID:42013920
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研究论文 | 该研究揭示了孕期母体免疫激活通过性别特异性损害小胶质细胞功能,导致前额叶皮层发育异常和雄性后代行为缺陷 | 首次证明MIA通过性别特异性方式损害小胶质细胞反应性,导致雄性后代前额叶皮层突触修剪缺陷和行为异常 | 未明确小胶质细胞功能障碍与神经发育异常之间的分子机制 | 探究母体免疫激活如何通过小胶质细胞介导性别特异性神经发育异常 | 母体免疫激活小鼠模型的后代,特别是前额叶皮层中的小胶质细胞 | 机器学习 | 神经发育障碍 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | MIA诱导的雄性及雌性小鼠后代,具体数量未在摘要中明确 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 627 | 2026-04-27 |
M2 macrophage-derived exosomes deliver NGF-modified mRNA to promote comprehensive corneal repair
2026-Apr-17, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114930
PMID:42002048
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研究论文 | 利用M2巨噬细胞来源的外泌体递送NGF修饰mRNA用于促进角膜综合修复 | 首次将M2巨噬细胞外泌体与NGF修饰mRNA结合,实现多维度的角膜修复,同时促进组织再生、抑制炎症和新生血管 | 未明确提及研究限制 | 开发一种基于M2巨噬细胞外泌体和NGF修饰mRNA的创新递送平台,用于角膜损伤后的综合修复 | M2巨噬细胞来源的外泌体、NGF修饰mRNA、碱烧伤的角膜组织 | 数字病理学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 628 | 2026-04-27 |
SCTGE infers transformer-based graph embeddings to improve cell-cell interaction identification and cell identity annotations
2026-Apr-11, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | SCTGE是一种基于Transformer的图嵌入新架构,整合自适应多尺度注意力和图神经网络,用于解决单细胞转录组空间嵌入难题并提升细胞间相互作用识别与细胞身份注释性能 | 创新性地融合Transformer自注意力机制与图神经网络,引入上下文感知自适应多头注意力和APPNP增强特征传播,有效应对空间转录组学中的可扩展性和噪声挑战 | 在特定数据集上细胞身份注释性能存在例外情况 | 开发可扩展且可解释的解决方案,用于空间嵌入提取、细胞间通信分析和细胞身份注释 | 单细胞转录组数据中的空间嵌入和细胞间相互作用 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 基于Transformer的图神经网络 | 单细胞转录组数据 | 六个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 629 | 2026-04-27 |
Clonal amplification of peripheral CD4+ and CD8+ T cells is associated with clinical response to checkpoint blockade in chronic hepatitis B
2026-Apr-11, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlag020
PMID:42033764
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研究论文 | 通过单细胞测序分析,发现慢性乙型肝炎患者中外周血CD4+和CD8+ T细胞的克隆扩增与检查点阻断治疗的临床反应相关 | 首次揭示单次纳武利尤单抗治疗后,功能性治愈患者中干细胞样记忆CD8+ T细胞基线水平升高,以及T和B细胞特异性克隆的出现与阳性反应相关 | 样本量较小,仅对4名患者的血液样本进行分析 | 探究检查点阻断疗法在慢性乙型肝炎中的免疫机制 | 慢性乙型肝炎患者的血液样本,包括对纳武利尤单抗有反应和无反应的患者 | 机器学习 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 4名患者,多个时间点的血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 630 | 2026-04-27 |
Multidimensional single-cell analysis reveals immune dysfunction and inflammatory response in lymphatic malformations
2026-Apr-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf103
PMID:41273773
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research paper | 通过单细胞多组学分析揭示了淋巴管畸形中免疫功能障碍和炎症反应的细胞类型特异性机制 | 首次整合单细胞RNA测序、T细胞受体测序和B细胞受体测序对淋巴管畸形患者外周血和胸腔积液进行多维免疫图谱分析,发现促炎性单核细胞和记忆B细胞扩增、细胞毒性T细胞和自然杀伤细胞减少,并鉴定出S100A8作为潜在治疗靶点 | 未提及 | 阐明淋巴管畸形中循环细胞的免疫表型和潜在分子机制 | 淋巴管畸形患者的外周血和胸腔积液样本 | 单细胞组学 | 淋巴管畸形 | scRNA-seq, scTCR-seq, scBCR-seq | NA | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列、B细胞受体序列 | 淋巴管畸形患者样本 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell TCR-seq, single-cell BCR-seq | NA | NA |
| 631 | 2026-04-27 |
Indirubin and Retinoic Acid Show Binding Affinity to Monocyte Biomarker CSF3R in Parkinson's Disease
2026-Apr, Journal of clinical laboratory analysis
IF:2.6Q2
DOI:10.1002/jcla.70197
PMID:41845882
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研究论文 | 本研究整合多组学数据分析,识别帕金森病单核细胞相关生物标志物CSF3R和IFITM3,并预测潜在靶向药物 | 首次结合单细胞测序与hdWGCNA分析,鉴定帕金森病外周血中单核细胞相关生物标志物,并预测其靶向药物 | NA | 通过多组学数据整合分析,揭示帕金森病中单核细胞的关键分子变化,识别新型生物标志物 | 帕金森病患者外周血单核细胞 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序、芯片分析 | NA | 单细胞转录组数据、芯片数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 632 | 2026-04-27 |
Multi-Omics Profiling Uncovers Predictive Factors for Tumor-Infiltrating Lymphocyte Therapy in Ovarian Cancer
2026-Apr, Journal of clinical laboratory analysis
IF:2.6Q2
DOI:10.1002/jcla.70196
PMID:41877397
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research paper | 通过多组学分析揭示卵巢癌肿瘤浸润淋巴细胞治疗中的预测因素 | 首次对卵巢癌肿瘤样本进行多组学分析,整合全外显子组测序、bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据,系统性地识别与TIL治疗成功相关的细胞组成、代谢活性和细胞间通讯特征 | 样本量较小(仅10例患者),且主要基于回顾性分析,需要更大规模的前瞻性研究进行验证 | 识别预测卵巢癌患者肿瘤浸润淋巴细胞分离和扩增成功与否的关键因素 | 10例卵巢癌患者的肿瘤样本 | machine learning | ovarian cancer | 多组学分析 | NA | 基因组数据 | 10例卵巢癌患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 633 | 2026-04-27 |
Development of a pediatric immune cell atlas and characterization of CD4+ T cells in food allergy
2026-Apr, Pediatric allergy and immunology : official publication of the European Society of Pediatric Allergy and Immunology
IF:4.3Q1
DOI:10.1111/pai.70337
PMID:42025535
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研究论文 | 利用公开的单细胞RNA测序数据构建儿童免疫细胞图谱,并研究食物过敏中CD4+ T细胞的特征 | 首次构建了包含57名个体的儿童单细胞参考图谱,并鉴定了与食物过敏相关的细胞毒性Th2样细胞亚群 | 数据来源于多个临床研究,可能存在批次效应;样本量相对较小,需进一步验证 | 构建儿童免疫细胞参考图谱并探索食物过敏中CD4+ T细胞的异质性和功能 | 8项临床研究中外周血单核细胞样本,共57名儿童 | 单细胞测序 | 食物过敏 | scRNA-seq | 随机森林模型 | 单细胞基因表达数据 | 57名儿童的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 634 | 2026-04-27 |
Macrophage Cluster of Differentiation 163 promotes post-infarction cardiac repair and preserves left ventricular function via osteopontin
2026-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70662
PMID:42026811
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研究论文 | 本文研究了巨噬细胞分化簇163(CD163)在心肌梗死后心脏修复中的作用,发现CD163通过上调骨桥蛋白表达促进修复并保护左心室功能 | 首次揭示了CD163在心肌梗死后心脏修复中的功能作用,并阐明了其通过上调骨桥蛋白表达的分子机制 | 主要基于小鼠模型,需进一步在人类中验证;未完全阐明CD163调控骨桥蛋白的具体信号通路 | 探讨CD163在心肌梗死后心脏修复中的作用及其分子机制 | 缺血性心肌病患者、野生型和Cd163基因敲除小鼠 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床研究比较心衰患者与非心衰个体;小鼠模型使用野生型和Cd163基因敲除小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 635 | 2026-04-27 |
Comprehensive Multi-Omics Characterization of CYP2R1 as a Diagnostic and Functional Biomarker in Hepatocellular Carcinoma
2026-Apr-01, Medical sciences (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/medsci14020178
PMID:42029602
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研究论文 | 系统分析了57个CYP基因在肝细胞癌中的表达,发现CYP2R1作为诊断和功能生物标志物具有高准确性和预后价值 | 首次全面描绘CYP基因家族在肝细胞癌中的失调图谱,并鉴定CYP2R1为连接代谢、DNA修复和免疫调节的新型生物标志物 | 未提及具体局限性 | 鉴定肝细胞癌中可靠分子生物标志物并阐明其功能意义 | 肝细胞癌患者多队列转录组数据 | 数字病理学, 机器学习 | 肝癌 | 转录组测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多队列数据,具体样本量未提供 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 636 | 2026-04-25 |
Patterns of mitochondrial ATP predict tissue folding
2026-Apr-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aee6175
PMID:42018613
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研究论文 | 研究发现线粒体ATP模式可预测组织折叠 | 首次揭示化学能以空间模式驱动组织折叠,并通过多物种实验验证线粒体富集与ATP增加对组织折叠的预测能力 | NA | 探索胚胎发育中组织形状构建的化学能量模式及其调控机制 | 果蝇、鸡和小鼠胚胎中的上皮细胞 | 计算生物学 | NA | 时间延时成像、空间转录组学、氧消耗速率测量 | 计算预测模型 | 时间序列图像、空间转录组数据、代谢率数据 | 果蝇、鸡和小鼠胚胎样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 637 | 2026-04-25 |
High altitude-mediated immune remodeling accelerates aging
2026-Apr-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb5599
PMID:42018634
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研究论文 | 通过多组学分析揭示高原环境诱导的免疫重塑加速衰老进程的机制 | 首次结合人类群体数据和模拟高原缺氧的小鼠模型,利用单细胞RNA测序和空间增强分辨率组学测序,系统描绘高原免疫重塑特征,并发现其与加速肠道衰老的关联 | 研究主要基于高海拔人群和小鼠模型,可能无法完全反映其他海拔环境或长期暴露的影响 | 探究高海拔介导的免疫重塑如何加速衰老轨迹 | 青藏高原海拔3656米(拉萨)和5070米(推瓦村)的居民,以及模拟5000米缺氧条件下的小鼠 | 免疫学与衰老研究 | 高原相关病理生理过程 | 单细胞RNA测序、空间增强分辨率组学测序(Stereo-seq) | NA | 单细胞基因表达数据、空间转录组数据 | 高海拔人群队列(具体样本量未说明)和小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Stereo-seq | 10x Chromium单细胞3'测序, Stereo-seq空间转录组学 |
| 638 | 2026-04-25 |
MMP9 in macrophages: A pivotal biomarker associated with immune dysregulation in interstitial cystitis/bladder pain syndrome
2026-Apr-24, Urologia
DOI:10.1177/03915603261440236
PMID:42028601
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示MMP9在巨噬细胞中作为间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征的关键生物标志物,并与免疫失调相关 | 首次通过整合单细胞与批量转录组数据,明确MMP9在IC/BPS巨噬细胞中高表达并增强吞噬活性,筛选出潜在的靶向药物 | 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限、缺乏功能验证实验等 | 探索间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征中关键的免疫靶点和生物标志物 | IC/BPS患者来源的单细胞和批量RNA测序数据 | 机器学习 | 间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 二元分类机器学习模型(14种算法) | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量(涉及GSE164557等数据集) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 639 | 2026-04-25 |
Distinct fibrosis-associated macrophage subsets coordinate iron metabolism in pulmonary fibrosis
2026-Apr-24, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxag017
PMID:42028853
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析间质性肺病患者的支气管肺泡灌洗液,发现与纤维化相关的巨噬细胞亚群通过协调铁代谢促进肺纤维化进展 | 鉴定了SPP1和APOE表达的共同存在的巨噬细胞群体,并进一步细分为SLC40A1+和HAMP+两个亚群,揭示了它们通过铁代谢调控成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的新机制 | 研究基于样本量有限的临床数据,体外机制验证可能需更深入的动物模型在体验证 | 阐明肺纤维化中巨噬细胞与成纤维细胞相互作用的分子机制 | 间质性肺疾病患者的支气管肺泡灌洗液细胞及肺组织 | 单细胞组学 | 间质性肺疾病、特发性肺纤维化、进行性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、转录组分析、组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据、组织切片图像 | 间质性肺疾病患者的支气管肺泡灌洗液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒进行单细胞RNA测序 |
| 640 | 2026-04-25 |
Fibrotic differentiation profile of skeletal and cardiac muscle fibroadipogenic progenitors in D2-mdx mouse
2026-Apr-24, Journal of neuromuscular diseases
IF:3.2Q2
DOI:10.1177/22143602261441956
PMID:42029670
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研究论文 | 通过双报告基因小鼠模型研究D2-mdx小鼠骨骼肌和心肌纤维脂肪生成祖细胞的纤维化分化特征 | 首次利用双报告基因小鼠(PRURD2)揭示纤维脂肪生成祖细胞(FAPs)在杜氏肌营养不良症(DMD)中纤维化的动态和谱系分化机制,并通过单细胞RNA测序鉴定出与纤维化相关的CD55簇 | 文章未提供具体局限性信息,可能涉及小鼠模型与人类DMD的差异或样本量等问题 | 探究DMD中肌肉纤维化的病理机制,特别是FAPs的动态变化和谱系分化 | D2-mdx小鼠的骨骼肌(膈肌和胫骨前肌)和心肌组织 | 数字病理学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序、流式细胞术(FACS)、组织学分析 | NA | 基因表达数据 | 12月龄PRURD2和对照PRURDBA小鼠的心肌、膈肌和胫骨前肌样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于FAPs亚群分析 |